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All content following this page was uploaded by Carmen Arnaiz on 20 March 2018.
Resumen
La determinación de la biomasa es
uno de los problemas que se presenta
Determinación de la biomasa
en muchos procesos biológicos.
Existen diversos métodos, directos e
indirectos, que se han desarrollado
en procesos biológicos
usando técnicas físicas y bioquími-
cas. En este trabajo se describen algu- I. Métodos directos e indirectos
nos de ellos, destacando sus ventajas
e inconvenientes. Por: Carmen Arnáiz, Laura Isac y Julián Lebrato
Palabras clave: Grupo de Tratamiento de Aguas Residuales. Escuela Universitaria Politécnica.
Determinación de la biomasa, com- Universidad de Sevilla. C/. Virgen de África, 7. 41011 Sevilla.
ponentes celulares específicos, méto- Tel. / Fax: 954 55 28 48 / 954 28 27 77. E-mail: lebrato@cica.es
dos bioquímicos, métodos cinéticos,
métodos directos, métodos indirec-
tos, métodos de recuento, procesos
biológicos
L
a determinación de la biomasa minación de la biomasa.
Determining biomass in biological es una de las variables más im-
processes. portantes de un bioproceso, ya 2. Métodos directos de
Direct and indirect methods. que su determinación nos lleva a la determinación de la biomasa
Evaluation of biomass concentra- comprensión de la eficiencia del
tion is an important problem encoun- mismo. Se trata de una variable clave 2.1. Métodos gravimétricos
tered in many microbial and other para establecer las tasas de produc- La cantidad total de biomasa pre-
bioprocesses. Many direct and indi- ción, de consumo de nutrientes y el sente en una muestra puede medirse
rect methods have been developed
cálculo de los balances de masa de en términos de peso seco por uni-
using physical and biochemical tech-
niques. In this work various methods cualquier proceso biológico. dad de volumen, ya sea como sóli-
are discussed taking into the conside- Los métodos clásicos de deter- dos en suspensión totales (SST) o
ration their practical importance, use- minación de biomasa son métodos sólidos en suspensión volátiles
fulness and constrains in application. directos que se basan en el número (SSV). Las células se separan del lí-
de células o en el peso celular. Los quido bien por centrifugación bien
Keywords: métodos de enumeración celular por filtración.
Biochemical methods, biomass eva- son métodos de observación, basa- La principal desventaja de estas
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luation, bioprocesses, counting met- dos en propiedades físicas o en la técnicas es que su determinación in-
hods, direct methods, indirect met- actividad biológica. Actualmente cluye no sólo microorganismos ac-
hods, kinetic methods, cellular speci-
hay un gran interés en métodos al- tivos sino microorganismos muer-
fic components
ternativos de determinación de la tos, material inerte, polímeros ex-
biomasa. Estos métodos son indi- tracelulares y materia orgánica ad-
rectos y estiman algún componente sorbida. Además, no puede aplicar-
celular o alguna actividad metabó- se cuando los sustratos a degradar
lica específica. No requieren el son insolubles.
examen visual de los organismos ni Los métodos gravimétricos son
su incubación. En la Figura 1 se simples, pero consumen bastante
muestra un resumen esquemático tiempo y son poco reproducibles. 45
2.2. Métodos de tal parámetro a partir de una sola por la profundidad, obteniéndose el
espectrofotométricos medida de la turbidez. número de microorganismos por
Se basan en la existencia de una Se trata de métodos rápidos, pero unidad de volumen (número de cé-
relación directa entre el número to- de baja sensibilidad y que presentan lulas.ml–1, generalmente).
tal de microorganismos presentes problemas de calibración (tipo de El recuento de microorganismos
en una muestra y su valor de turbi- cultivo, medio de cultivo) y de inter- en cámaras no es un método muy
dez. Tras la determinación de la tur- ferencias con partículas. exacto debido a las irregularidades
bidez de la suspensión celular me- en la distribución de la muestra.
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diante espectrofotometría, el resul- 2.3. Métodos microscópicos Además, pueden confundirse las cé-
tado se expresa en unidades de ab- de recuento celular en lulas con otras formas orgánicas e
sorbancia. Sin embargo, antes de cámaras inorgánicas existentes en el medio y
utilizar la turbidez como método de Existen diversos tipos de cáma- no permite distinguir células vivas
recuento, hay que realizar una recta ras para el recuento de microorga- de células muertas.
de calibrado que relacione medidas nismos tales como la cámara de
directas (microscópicas, por re- Neubauer, Thoma, Bürker, Türk, 2.4. Métodos microscópicos
cuento en placa o peso seco) con las Fuchs-Rosenthal, Malassez, Petroff mediante epifluorescencia
indirectas de la turbidez. Esta recta Hauser, etc. El recuento de microor- La microscopía de epifluores-
contiene datos sobre el número de ganismos se realiza en la cuadrícula cencia comenzó a emplearse a prin-
46 células, permitiendo la estimación central de la cámara y se multiplica cipios de los 70 y hoy en día se con-
sidera como uno de los mejores mé- mente inactivas, y las vivas, ya que
todos para la estimación de la bio- el ADN conserva sus propiedades La epifluorescencia
masa. La epifluorescencia es debida incluso en células muertas.
a un agente fluorocromo, a la adi- El quelato de europio, al igual
ción de algún anticuerpo marcado que el naranja de acridina o el DA- es un método
con fluorescencia (inmunofluores- PI, es un colorante específico de
cencia) o a una autofluorescencia ácidos nucleicos. Otros fluorocro-
natural debida a la existencia de al- mos como las sales de magnesio simple
gún componente celular autofluo- del ácido 1-anilino-8-naftalensul-
rescente. fónico (Mg-ANS) tiñen principal-
Cuando la epifluorescencia se mente componentes celulares co-
debe a un agente fluorocromo, el mo proteínas, lípidos o membranas y rápido
procedimiento consiste en la tinción celulares. En cambio, el comporta-
de las bacterias con dicho agente y miento de estos agentes fluorocro-
posterior recuento mediante mi- mos es el comentado anteriormen-
croscopía óptica con iluminación de te, sobrestiman el número de célu- cífica, y puede realizarse in situ.
epifluorescencia. Los sustratos las viables al no distinguir células También puede llevarse a cabo me-
fluorescentes o fluorocromos que se vivas de muertas. diante hibridación de sondas fluo-
han empleado para la observación En el segundo grupo quedarían rescentes de ADN o ARN (Fluores-
directa de bacterias se clasifican en englobados fluorocromos como el cent in situ hybridization, FISH),
dos grupos. En el primero de ellos cloruro de 5-ciano-2,3-ditolil te- cada vez más utilizadas en Ecología
quedarían englobados aquellos trazolio (CTC, Rodríguez et al., Microbiana.
fluorocromos que tras ser adsorbi- 1992) ó el 5- (y 6-) diacetato de
dos actúan específicamente sobre sulfofluoresceína (SFDA, Tsuji et 2.5 Métodos de siembra
ácidos nucleicos u otros componen- al., 1995). Ambos fluorocromos, a El recuento de microorganis-
tes celulares. El segundo incluiría a diferencia con los anteriores, dis- mos viables se fundamenta en la
todos aquellos que tras ser sustratos tinguen bacterias metabólicamen- capacidad de dichas células via-
de una determinada actividad meta- te activas de las que no lo son me- bles de desarrollar una colonia vi-
bólica, son convertidos en molécu- diante la observación microscópi- sible en un medio de cultivo apro-
las fluorescentes. ca del producto fluorescente resul- piado. En los recuentos en placa
Al primer grupo pertenecen los tado de la actividad metabólica pa- por vertido, un volumen de 0,1-1
principales fluorocromos utilizados ra la que son específicos. En el ca- ml de la suspensión microbiológi-
para la estimación de la población so del CTC la actividad metabólica ca se mezcla con el medio de culti-
total de una muestra: el naranja de es la respiratoria y en el del SFDA vo fundido y parcialmente enfria-
acridina y el 4,6-diamidino-2-feni- es la actividad esterasa. La epi- do en una placa de Petri. En los re-
lindol (DAPI). Estos fluorocromos fluorescencia basada en fluorocro- cuentos en placa por siembra en
permiten distinguir células de partí- mos como el CTC y el SFDA pon- superficie, se extiende un volumen
culas e identificar bacterias no sólo drá de manifiesto aquellos micro- de aproximadamente 0,1 ml de la
por su color, sino también por su organismos en los cuales estén suspensión sobre la superficie del
forma y tamaño. presentes dichas actividades meta- medio de cultivo. Los resultados
El naranja de acridina colorea bólicas, pero sin cuantificarlas. de los recuentos en placa se expre-
tanto el ADN como el ARN de las Salvando este obstáculo se en- san como unidades formadoras de
células emitiendo a una longitud de cuentran las medidas bioquímicas colonia (UFC) por unidad de volu-
onda aproximada de 470 nm. Los de determinación indirecta de la men de la suspensión microbioló-
ácidos nucleicos de hebra simple se biomasa, que sí cuantifican activi- gica. Para que el recuento sea esta-
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dio de cultivo líquido como es el ca- mar biomasa viva son los ácidos nu- análisis más sensibles necesitan del
so de la estimación del número más cleicos, las proteínas, los polisacári- uso de cromatografía líquida
probable (NMP). dos, los lípidos y el ATP. (HPLC) o gaseosa (GC). Todas es-
El recuento de microorganismos tas técnicas son laboriosas, muy
viables se fundamenta en el desarro- 3.1.1. Ácidos nucleicos largas y necesitan de un equipa-
llo de una colonia visible a partir de El ADN y el ARN son dos com- miento caro (Figura 2).
cada organismo viable. El principal ponentes de las bacterias cuya sínte-
problema de este método es que no sis es proporcional a la tasa de creci- 3.1.4. Lípidos
todas las bacterias presentes en una miento. Mientras que las concentra- Los lípidos son un componente
muestra pueden crecer en el medio y ciones de ARN varían considerable- fundamental de las membranas ce-
las condiciones de cultivo seleccio- mente con el estado fisiológico ce- lulares. Su determinación para la es-
nado. Suelen ser, por tanto, métodos lular, la cantidad de ADN es relati- timación de la biomasa de una po-
infraestimativos y estadísticamente vamente más constante. blación bacteriana ofrece muchas
cuestionables (Lazarova y Manem, La cantidad de ADN se determi- ventajas sobre otros métodos. La
1995). na mediante espectrofotometría, principal ventaja es su alto conteni-
tras su extracción y purificación. do específico y que se encuentran en
3. Métodos indirectos de Existen diversas técnicas, si bien cantidades relativamente constan-
determinación de la presentan la desventaja de que los tes. Otra ventaja muy importante es
biomasa procedimientos de purificación son que los lípidos no forman parte de
Estos métodos se basan funda- complejos, con diversas interferen- las reservas celulares y se degradan
mentalmente en la determinación cias y bastante costosos. rápidamente durante la lisis bacte-
de algún componente celular espe- riana. Aproximadamente, entre un
cífico, en la cuantificación de algu- 3.1.2. Proteínas 90-98% de los lípidos de las mem-
na actividad enzimática (métodos Existen varias técnicas para el branas celulares está en forma de
bioquímicos) o en la medida de análisis de proteínas totales de una fosfolípidos (Lazarova y Manem,
consumo de sustrato o de la forma- muestra biológica. Algunos están 1995).
ción de algún producto (métodos muy extendidos y se caracterizan Las técnicas de análisis se basan,
cinéticos). También se incluyen en por su sensibilidad, rapidez y sim- fundamentalmente, en la extracción
este apartado algunos métodos fisi- plicidad. Es el caso de las técnicas celular de los fosfolípidos con un di-
coquímicos. de Lowry et al. (1951) y Bradford solvente orgánico, su posterior hi-
Los métodos bioquímicos y ciné- (1976). drólisis ácida para liberar el fosfato
ticos determinan, más que la viabili- La principal desventaja de la de- y, por último, la determinación co-
dad de las bacterias la actividad ya terminación de proteínas es que su lorimétrica de éste. Son técnicas re-
que dependen más del estado meta- cantidad en las células está sujeta a lativamente sencillas, reproducibles
bólico de los microorganismos que fuertes variaciones debido, funda- y sensibles (de 0,1 a 1 nmol de fos-
del número de individuos. mentalmente, a cambios en las con- fato; Findlay et al., 1989).
diciones fisicoquímicas y al estado
3.1. Componentes celulares fisiológico celular. 3.1.5. Trifosfato de
específicos adenosina o ATP
Cualquier componente celular 3.1.3. Polisacáridos El ATP presenta las ventajas de
seleccionado para la estimación de La mayoría de las células proca- ser un componente bioquímico cen-
la biomasa viva de una muestra de- riotas contienen ácido murámico tral presente en todos los microor-
be responder a tres criterios funda- (un peptidoglicano) como compo- ganismos y específico de los micro-
mentales: nente de la pared celular. Existen organismos vivos, circunstancias
• Estar presente únicamente en cé- varias técnicas para la determina- ambas que permiten relacionarlo
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lulas vivas. ción del ácido murámico en mues- con la biomasa viva.
• Ser rápidamente degradado tras que contengan microorganis- Una de las técnicas más utiliza-
cuando las células mueran. mos. Todas ellas se basan en la con- das para medir ATP se basa en la re-
• Ser relativamente constante en versión del ácido murámico a lac- acción luciferina-luciferasa, proce-
concentración respecto a cam- tato, seguida del análisis enzimáti- so responsable de la luz emitida por
bios en el estado fisiológico celu- co o químico de la concentración las luciérnagas y que ha sido am-
lar y entre distintas especies. de lactato. El ácido murámico se pliamente estudiado. En este meca-
Hasta el momento, no existe nin- extrae de las células mediante una nismo de luminiscencia se sabe que
gún componente celular que cumpla hidrólisis alcalina y se purifica intervienen luciferina (fenol hetero-
estos tres requerimientos. Sin em- posteriormente mediante cromato- cíclico, LH2), luciferasa (enzima,
48 bargo, los más adecuados para esti- grafía de intercambio iónico. Otros E), ATP, cationes de magnesio y
de luciferina oxidada
se emite un cuanto
de luz
relación puede duplicarse en sólo las distintas medidas de actividad cies presentes en el suelo son sensi-
unos segundos. Algunos autores su- enzimática cabe destacar la activi- bles a esta técnica, ya sea porque el
gieren que la carga energética es un dad esterasa y la actividad deshidro- FDA no penetra adecuadamente en
valor mucho más preciso que el genasa. las células o porque no es bien rete-
contenido absoluto de ATP ya que la nido. Tratando de minimizar estos
composición celular de desoxirribu- 3.2.1 Actividad esterasa problemas, en el campo de la epi-
nucleótidos varía con el estado fi- El diacetato de fluoresceína fluorescencia se han utilizado deri-
siológico de los microorganismos: (FDA) es un compuesto que puede vados del FDA como el diacetato de
durante el crecimiento bacteriano el ser hidrolizado por enzimas tales 6-carboxifluoresceína (CFDA) y el
pool energético disminuye, al dis- como proteasas, lipasas y estera- diacetato de 5- (y 6-) sulfofluores-
minuir la concentración de ATP y sas, siendo el producto de dicha ceína (SFDA), este último mencio- 49
3.2.2. Actividad
deshidrogenasa (DHA)
En una muestra biológica, la de-
terminación de la actividad del sis-
tema de transporte electrónico pue-
de realizarse por medida de la acti-
vidad deshidrogenasa. Todos los
microorganismos aerobios poseen
un sistema de transporte de electro-
nes activo, en el que el más impor-
tante aceptor terminal de electrones
es el oxígeno. En la corriente princi-
pal de este transporte electrónico
Figura I.3 Visión al microscopio óptico (1000x) de una muestra de fango activo tratada según el protocolo de la
participan, entre otras, las deshidro- INT-deshidrogenasa.
genasas piridín-dependientes que
necesitan NAD o NADP como co-
enzima y las deshidrogenasas fla- la cuantificación de la actividad res- tes en la muestra metabolizan la ma-
vín-dependientes que contienen fla- piratoria de la muestra. teria orgánica con la consecuente
vín-adenín-dinucleótido (FAD) ó El TTC presenta el inconvenien- disminución del nivel de oxígeno,
flavín mononucleótido (FMN) co- te de su elevada sensibilidad al oxí- que es consumido, y el aumento de
mo grupo prostético. Las deshidro- geno (Chung y Neethling, 1989). El la concentración de CO2, que es pro-
genasas son enzimas de oxido-re- INT no tiene esta limitación y su uso ducido. El dióxido de carbono es ad-
ducción que participan en el trans- está cada vez más extendido. Sin sorbido en una solución de potasa,
porte de electrones desde un sustra- embargo, su precisión y correlación por lo que la disminución de la pre-
to orgánico a un aceptor final de con la cantidad de biomasa viva no sión en este sistema cerrado es debi-
electrones mediante la transferencia está suficientemente demostrada da al volumen de oxígeno consumi-
de hidrógeno. La determinación de (Singh et al., 1994). do por los microorganismos, lo cual
la actividad deshidrogenasa puede puede ser medido mediante un sen-
hacerse midiendo la capacidad de 3.3. Métodos cinéticos sor de presión y registrado. La re-
los microorganismos para reducir La base de estos métodos es la presentación en el tiempo del oxíge-
un indicador o colorante redox. En- medida del consumo de sustrato o no disuelto (mg.l –1) informa del
tre estos colorantes se encuentran de la formación de producto en en- consumo de oxígeno, siendo la pen-
sales de tetrazolio tales como el clo- sayos en discontinuo. El ejemplo diente de la recta de ajuste óptimo la
ruro de 2,3,5-trifeniltetrazolio más típico en microorganismos ae- tasa de consumo de oxígeno (OUR)
(TTC) o el cloruro de 2-(p-iodofe- robios es la determinación de la en mg O2. l–1.h–1.
nil)-3-(p-nitrofenil)-5-feniltetrazo- DBO, que indica la biodegradabili- Una adaptación del respirómetro
lio (INT). Ambas se caracterizan dad de un sustrato en disolución a de Warburg para medir el biogás
por ser solubles en agua en su forma través del consumo de oxígeno del producido en procesos anaerobios
oxidada y por formar depósitos ce- medio. puede encontrarse en James et al.
lulares insolubles de TTC-formazán (1990).
e INT-formazán (Figura 3), respec- 3.3.1. Adaptaciones del
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La respiración
endógena es
directamente
proporcional a la
concentración de
microorganismos