DAFTAR PUSTAKA

[1] Wallace, D.C., 1997: Mitochondrial DNA in Again Disease. Scientific American.
22-29.
[2] Marks, D.B., Marks, A.D, Smith,C.M. 1996. Basic Medical Biochemistry.
William & Wilkins Baltimore.
[3] Gumilar, G.G, Supriyanti, F. M.T., Siti, H.H. (2008). Bioteknologi. Bandung :
Jurusan Pendidikan Kimia FPMIPA UPI.
[4] Purnamasari, Yunita, 2013. Varian Genetika Daerah Hipervariabel I (HV1) DNA
Mitokondria pada 4 Generasi Dengan Riwayat Diabetes Melitus Tipe 2.
Bandung: Universitas Pendidikan Indonesia.
[5] American Heart Association (AHA). Cardiovascular Disiase and Diabetes
(diunduh 24 November 2018) Tersedia dari: URL: HYPERLINK
http://www.heart.org/HEARTORG/Conditions/More/Diabetes/WhyDiabetesMatt
ers/Cardiovascular-DisiaseDiabetes_UCM_313865_Article.jsp..
[6] Aris. T. W., 2000. Inverse Polimerase Chain Reaction. Jurnal Hayati. Vol 7 (4):
121-123.
[7] Lehninger, Albert L. 1982. Dasar-dasar Biokimia. Jakarta: Erlangga.

[8] Marguillis, L., 1981. Symbiosis In Cell Evolution. New York: W.H. Freman.

[9] Perpustakaan.2012.StrukturSelEukariot.[Online].Tersedia:https://Perpustakaancy
ber.blogspot.co.id/2012/11/struktur-sel-eukariot-fungsi.html. [05 Maret 2016].
[10] Wikipedia. 2014.http://id.wikipedia. Org/wiki/. diakses tanggal 18 November
2018, 21.30 WIB.
[11] Poedjiadji, Anna dan Supriyanti F.M.T. (2006). Dasar-dasar Biokimia. Jakarta :
Universitas Indonesia Press.
[12] Stanfield, William D., Jaime S. Colome., Raul J. Cano. 2003. Shaum's Easy
Outlines: Molecular and Cell Biology. USA : McGraw-Hill Companies, Inc.
[13] Purves, William K., David Sadava., Gordan H.Orians., and Craig Heller. 2004.
Life ; The Science Of Biology. Edisi Ketujuh. United Staties of America: Sinauer
Associates and W. H. Freeman.
[14] Gaffar, Shabrani, M.Si. 2007. Buku Ajar Bioteknologi Molekul. Bandung:
FMIPA Universitas Padjajaran.
[15] Yuwono, Tribowo. 2009. Biology Molekular. Jakarta: Erlangga.

[16] Faatih, M. 2009: Isolasi dan Digesti DNA. Jurnal Penelitian Sains dan
Teknologi, 10(1): 61-67.
[17] Anderson, S. et al. (1981). "Sequence and Organization of the Cambridge
Reference Sequence for Human Mitochondrial DNA" . Nat Genet. 23, 147.

26
[18] Giles, R.E., Blanc. H., Cann H.M., dan Wallace, D.C. 1980. " Maternal
Inheritance of Human Mitochondrial DNA". Proc. Natl. Acad. SCI. USA. 77,
(11), 6715-6719.
[19] Bogrnhagen, Daniel F. 1999. DNA REPAIR'99 Repair of mtDNA in Vertebrates.
Am. J. Hum. Genet. 64, 1276-1281.
[20] Wallace, D.C., 1992: Diseases of the mitochondrial DNA, Annu Rev Biochem,
61, 1175-1212.
[21] Innis, M.A., Gelfan, D.H. (1990), Optimation of PCRs, PCR protocols :a guide to
Methods and Aplications, Academic Press, Inc, California, 3-12.
[22] Zyskind, J. W. and S. I. Bemstain. 1992. Recombinant DNA Manual. Academic
Press., Inc. California.
[23] Westenmeier, 2004. Electrophoresis in Practice : A Guide to Theory and
Practice. New-Jersey: John Wiley & Sons inc.
[24] Sambrook, J., Fritsc, E.F., and Maniatis, T., (1989), Molecular Cloning, A
Laboratory Manual 2nd, Cold Spring Harbor Laboratory Press, New York.
[25] Puspitasari, Dea.(2007). Urutan Nukleotida Daerah HVS1 DNA Mitokondria
Manusia Poli-C. Skripsi Program Studi ITB Bandung: Tidak diterbitkan.
[26] Qiagen.(2006).Genomic DNA Purification. [Online]. Tersedia : http: //www.
qiagen.com/literature brochurs /index. [5 Oktober 2017].
[27] Ratnayani, K., et al (2007). " Analisis Variasi Nukleotida Daerah D-Loop DNA
Mitokondria Pada Satu Individu Suku Bali Normal " Jurnal Kimia 7-14.

27
 LAMPIRAN A
(DIAGRAM ALIR PROSEDUR PENELITIAN)

1. Lisis sampel akar rambut

Sampel akar rambut

 Dipotong pada bagian akarnya (± 1 cm)

 Dimasukkan ke dalam tabung
mikro
 Ditambahkan 170 µL ddH2O
 Ditambahkan 20 µL bufer lisis
 Ditambahkan 10 µL enzim
proteinase-K

Larutan campuran

 Dibungkus dengan parafilm

 Diinkubasi pada suhu 55 oC
selama 1 jam
 Deaktivasi enzim proteinase-K
pada suhu 95 oC selama 10 menit
 Disentrifugasi dengan kecepatan
maksimal 30 detik

Supernatan

 Diambil sebanyak 150 µL

 Dimasukkan ke dalam tabung
mikro 1500 µL

Templat PCR

28
2. Lisis sampel epitel mulut

Sel epitel mulut

 Dimasukkan ke dalam tabung mikro

 Ditambahkan 170 µL ddH2O
 Ditambahkan 20 µL buffer lisis
 Ditambahkan 10 µL enzim
proteinase-K

Larutan Campuran

 Dibungkus dengan parafilm

 Diinkubasi pada T 50 oC selama 1
jam
 Deaktivasi enzim proteinase-K
pada T 95 oC selama 10 menit
 Disentrifugasi dengan kecepatan
maksimal 30 detik

Supernatan

 Diambil sebanyak 150 µL

 Dimasukkan ke dalam tabung
mikro 1500 µL

Templat PCR

29
3. Amplifikasi fragmen DNA mitokondria dengan PCR

Campuran reaksi PCR

 Dimasukkan ke dalam tabung mikro

 Proses PCR dilakukan dengan mesin
PCR sebanyak 30 siklus. Melalui tahap
denaturasi, annealing dan extension

DNA hasil PCR

4. Analisis hasil PCR dengan elektroforesis gel agarosa

Hasil PCR

 Dianalisis dengan gel agarosa dibuat

dengan melarutkan 0,40 gram agarosa
dalam 40 mL buffer TAE 1 x

Larutan

 Dipanaskan hingga agarosa larut

sempurna
 Didinginkan hingga suhu larutan 60
o
C

Gel agarosa

 Masing-masing gel dimasukkan 5

µL sampel hasil PCR yang telah
dicampurkan dengan 2 µL loading
buffer
 Dilakukan proses elektroforesi

Pita PCR 

30
 LAMPIRAN B
RENCANA ANGGARAN BIAYA

A. Anggaran Biaya Bahan dan Alat

Nama Kebutuhan Harga Harga bahan yang
dibutuhkan/instrumen
Bahan/Instrumen
yang digunakan
ddH2O 2 Liter Rp 6.500/1 liter Rp 13.000/2 liter
KCl 5 gram Rp 10.400/1 gram Rp 52.000/5 gram
Bubuk Agarosa 5 gram Rp 96.000/1 gram Rp 480.000/5 gram
Buffer Tris-HCl 10 mL Rp 96.500/100 mL Rp 9.650/10 mL
EDTA 5 gram Rp 12.000/1 gram Rp 60.000/5 gram
Asam Asetat Glasial 60 mL Rp 1.700/1 mL Rp 102.000/60 mL
Marker DNA 10 mL Rp 6000/1 µL Rp 60.000/10 µL
Buffer TAE 10 mL Rp 240.000/100 mL Rp 24.000/10 mL
HCl 10 mL Rp 39.000/1 liter Rp 390/10 mL
Enzim proteinase-K 10 µL Rp 1.000/ 1 µL Rp 10.000/10 µL
Buffer TAE 5 mL Rp 3.150.000/L Rp 15.750/5 mL
Tween-20 10 mL Rp 5.900/ 1 mL Rp 59.000/ 10 mL
DreamTaq green 2 react Rp 11.000/react Rp 22.000/2 react
PCR Master mix
Tabung eppendorf 20 pcs Rp 500/1 pcs Rp 10.000/20 pcs
Para film 1 box Rp 22.500/1 box Rp 22.500/1 box
Loading buffer 10 mL Rp 176.000/100 mL Rp 17.600/ 10 mL
Sentrifugasi Rp 30.000 Rp 30.000
Instrumen PCR Rp 540.000 Rp 540.000/ running
Elektroforesis DNA Rp 250.000 Rp 250.000/ running
Sekuensing Rp 300.000 Rp 1.200.000/ 4 koloni
Total Biaya Rp 2.977.890

31
 B. Anggaran Biaya Sewa Laboratorium
Jenis Sewa Harga Jumlah Hari Harga total
sewa/Hari
Laboratorim dan alat Rp 75.000 15 Hari Rp 1.125.000
gelas
Mikropipet Rp 10.000 3 Hari Rp 30.000
Total Biaya Rp 1.155.000

C. Anggaran Biaya Total

Total biaya alat Total sewa Jumlah total
dan bahan laboratorium
Rp 2.977.890 Rp 1.155.000 Rp 4.132.890

32
 LAMPIRAN C
RENCANA JADWAL KEGIATAN DI LABORATORIUM

Desember Januari Februari Maret April Mei

Minggu Minggu Minggu Minggu Minggu Minggu
No Tahapan Kegiatan ke-
ke- ke- ke- Ke- Ke-
1 2 3 4 1 2 3 4 1 2 3 4 1 2 3 4 1 2 3 4 1 2 3 4
1 Seminar Proposal

2 Persiapan alat bahan

3 Pengumpulan sampel

4 Lisis sampel akar rambut

5 Lisis sampel epitel mulut

6 Amplifikasi fragmen DNA

mitokondria dengan PCR

7 Analisis hasil PCR dengan

elektroforesis gel agarosa,
Proses sekuensing

8 Penulisan skripsi

9 Ujian komprehensif

10 Sidang kolokium

11 Sidang munaqosah

33