Mat Plot Lib

9/10/2018 Jupyter Notebook Viewer
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03_visualizacion-matplotlib.ipynb (/github/Pybonacci/curso_python_alicante/tree/master/03_visualizacion-matplotlib.ipynb)
Parte 3 - Visualización con matplotlib
¿Qué es matplotlib?
Estándar de facto para visualización en Python

Pretende ser similar a las funciones de visualización de MATLAB
Diferentes formas de usarla: interfaz pyplot y orientada a objetos
Lo primero que vamos a hacer es activar el modo inline - de esta manera las figuras aparecerán automáticamente
incrustadas en el notebook.
In [1]:
%matplotlib inline
Importamos los paquetes necesarios:
In [2]:
import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt
La biblioteca matplotlib es gigantesca y es difícil hacerse una idea global de todas sus posibilidades en una primera
toma de contacto. Es recomendable tener a mano la documentación y la galería:
http://nbviewer.jupyter.org/github/Pybonacci/curso_python_alicante/blob/master/03_visualizacion-matplotlib.ipynb 1/19
In [12]:
from IPython.display import HTML

HTML('<iframe src="http://matplotlib.org/gallery.html#pylab_examples" width="800" height="600">
Out[12]:
accented_text agg_buffer
agg_buffer_to_array agg_buffer_to_array
alignment_test anchored_artists
Si hacemos clic en cualquiera de las imágenes, accedemos al código fuente que la ha generado:
In [13]:
HTML('<iframe src="http://matplotlib.org/examples/pylab_examples/annotation_demo.html" width="8
Out[13]:
home | examples | gallery | pyplot | docs » Matplotlib Examples » previous | ne

pylab_examples Examples » Depsy 10
pylab_examples example code: Travis-CI:

annotation_demo.py Related T
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Interfaz pyplot
Función plot
La interfaz pyplot proporciona una serie de funciones que operan sobre un estado global - es decir, nosotros no
especificamos sobre qué gráfica o ejes estamos actuando. Es una forma rápida y cómoda de crear gráficas pero
perdemos parte del control.
El paquete pyplot se suele importar bajo el alias plt , de modo que todas las funciones se acceden a través de
plt.<funcion> . La función más básica es la función plot :
In [3]:
plt.plot([0, 0.1, 0.2, 0.5,0.6], [1, -1, 0, 3, -1])
Out[3]:
[<matplotlib.lines.Line2D at 0x7f77925ac450>]
La función plot recibe una sola lista (si queremos especificar los valores y) o dos listas (si especificamos x e y).
Naturalmente si especificamos dos listas ambas tienen que tener la misma longitud.
La tarea más habitual a la hora de trabajar con matplotlib es representar una función. Lo que tendremos que hacer es
definir un dominio y evaluarla en dicho dominio. Por ejemplo:
2
−x
f (x) = e
In [4]:
def f(x):
return np.exp(-x ** 2)
Definimos el dominio con la función np.linspace , que crea un vector de puntos equiespaciados:
In [5]:
x = np.linspace(-1, 5, num=30)
Y representamos la función:
In [9]:
plt.plot(x, f(x), label="Función f(x)")

plt.xlabel("Eje $x$")
plt.ylabel("$f(x)$")
plt.legend()
plt.title("Función $f(x)$")
Out[9]:
<matplotlib.text.Text at 0x7f779236b210>
Notamos varias cosas:
Con diversas llamadas a funciones dentro de plt. se actualiza el gráfico actual. Esa es la forma de trabajar
con la interfaz pyplot.
Podemos añadir etiquetas, y escribir LATEX en ellas. Tan solo hay que encerrarlo entre signos de dólar $$.
Personalización
La función plot acepta una serie de argumentos para personalizar el aspecto de la función. Con una letra podemos
especificar el color, y con un símbolo el tipo de línea.
In [19]:
plt.plot(x, f(x), 'ro')

plt.plot(x, 1 - f(x), 'g--')
Out[19]:
[<matplotlib.lines.Line2D at 0x7f7792343290>]
Esto en realidad son códigos abreviados, que se corresponden con argumentos de la función plot :
In [34]:
plt.plot(x, f(x), color='red', linestyle='', marker='o')

plt.plot(x, 1 - f(x), c='g', ls='--')
Out[34]:
[<matplotlib.lines.Line2D at 0x7f77919f3890>]
La lista de posibles argumentos y abreviaturas está disponible en la documentación de la función plot

http://matplotlib.org/api/pyplot_api.html#matplotlib.pyplot.plot
(http://matplotlib.org/api/pyplot_api.html#matplotlib.pyplot.plot).
Otro tipo de gráficas
La función scatter muestra una nube de puntos, con posibilidad de variar también el tamaño y el color.
In [37]:
N = 100
x = np.random.randn(N)
y = np.random.randn(N)
plt.scatter(x, y)
Out[37]:
<matplotlib.collections.PathCollection at 0x7f7791f05750>
Con s y c podemos modificar el tamaño y el color respectivamente. Para el color, a cada valor numérico se le
asigna un color a través de un mapa de colores; ese mapa se puede cambiar con el argumento cmap . Esa
correspondencia se puede visualizar llamando a la función colorbar .
In [48]:
s = 50 + 50 * np.random.randn(N)
c = np.random.randn(N)
plt.scatter(x, y, s=s, c=c, cmap=plt.cm.Blues)

plt.colorbar()
Out[48]:
<matplotlib.colorbar.Colorbar at 0x7f77911ab590>
In [49]:
plt.scatter(x, y, s=s, c=c, cmap=plt.cm.Oranges)

plt.colorbar()
Out[49]:
<matplotlib.colorbar.Colorbar at 0x7f7791107d90>
matplotlib trae por defecto muchos mapas de colores. En las SciPy Lecture Notes dan una lista de todos ellos:
La función contour se utiliza para visualizar las curvas de nivel de funciones de dos variables y está muy ligada a
la función np.meshgrid . Veamos un ejemplo:
2
f (x) = cos x + sin y
In [50]:
def f(x, y):

return np.cos(x) + np.sin(y) ** 2
In [52]:
x = np.linspace(-2, 2)
y = np.linspace(-2, 2)
xx, yy = np.meshgrid(x, y)
plt.contour(xx, yy, f(xx, yy))

plt.colorbar()
Out[52]:
<matplotlib.colorbar.Colorbar at 0x7f7790f79410>
La función contourf es casi idéntica pero rellena el espacio entre niveles. Podemos especificar manualmente
estos niveles usando el cuarto argumento:
In [60]:
zz = f(xx, yy)
plt.contourf(xx, yy, zz, np.linspace(-0.5, 2.0))
plt.colorbar()
Out[60]:
<matplotlib.colorbar.Colorbar at 0x7f77906da910>
Para guardar las gráficas en archivos aparte podemos usar la función plt.savefig . matplotlib usará el tipo de
archivo adecuado según la extensión que especifiquemos. Veremos esto con más detalle cuando hablemos de la
interfaz orientada a objetos.
Interfaz orientada a objetos

In [24]:
Out[24]:
array([-1. , -0.79310345, -0.5862069 , -0.37931034, -0.17241379,

0.03448276, 0.24137931, 0.44827586, 0.65517241, 0.86206897,
1.06896552, 1.27586207, 1.48275862, 1.68965517, 1.89655172,
2.10344828, 2.31034483, 2.51724138, 2.72413793, 2.93103448,
3.13793103, 3.34482759, 3.55172414, 3.75862069, 3.96551724,
4.17241379, 4.37931034, 4.5862069 , 4.79310345, 5. ])
In [25]:
f(x)
Out[25]:
array([ 3.67879441e-01, 5.33117686e-01, 7.09185234e-01,

8.65994832e-01, 9.70710971e-01, 9.98811646e-01,
9.43400884e-01, 8.17952307e-01, 6.50996579e-01,
4.75607235e-01, 3.18960733e-01, 1.96356377e-01,
1.10961373e-01, 5.75595853e-02, 2.74083260e-02,
1.19802640e-02, 4.80694649e-03, 1.77048075e-03,
5.98593712e-04, 1.85777072e-04, 5.29262471e-05,
1.38410522e-05, 3.32266179e-06, 7.32187295e-07,
1.48107572e-07, 2.75011817e-08, 4.68753445e-09,
7.33426522e-10, 1.05338655e-10, 1.38879439e-11])
In [28]:
fig, axes = plt.subplots()
axes.plot(x, f(x), 'ro', label="Función F(x)")

axes.set_xlim(-2, 4)
axes.set_ylim(-1, 2)
fig.savefig("grafica1.png")
In [35]:
fig, axes = plt.subplots(1, 2, sharey=True)
axes[0].plot(x, f(x), color="blue")

axes[0].set_xlabel("Eje x")
axes[1].plot(x, -f(x), 'r')

axes[1].set_xlabel("Eje x de la gráfica derecha")
Out[35]:
<matplotlib.text.Text at 0x7f70c765f750>
In [40]:
x = np.random.randn(100)
y = np.random.randn(100)
s = 200 * np.random.randn(100)
c = np.random.randn(100)
plt.scatter(x, y, s, c, cmap=plt.cm.BrBG_r)
Out[40]:
<matplotlib.collections.PathCollection at 0x7f70c7338b50>
2
g(x, y) = cos(x) + sin(y)
In [45]:
x = np.linspace(-2, 2)
y = np.linspace(-2, 2)
xx, yy = np.meshgrid(x, y)
In [47]:
def g(x, y):

return np.cos(x) + np.sin(y) ** 2
In [48]:
zz = g(xx, yy)
In [55]:
axes.contourf(xx, yy, zz, np.linspace(-1, 1), cmap=plt.cm.autumn)
Out[55]:
<matplotlib.contour.QuadContourSet at 0x7f70c6dc52d0>
fig, axes = plt.subplots

Diferencias de conceptos
Ejemplo con datos reales
In [57]:
!cat temperaturas.csv
STATION,DATE,TMAX,TMIN
GHCND:USW00094728,20130101,44,-33
GHCND:USW00094728,20130102,6,-56
GHCND:USW00094728,20130103,0,-44
GHCND:USW00094728,20130104,28,-11
GHCND:USW00094728,20130105,56,0
GHCND:USW00094728,20130106,78,11
GHCND:USW00094728,20130107,72,28
GHCND:USW00094728,20130108,89,17
GHCND:USW00094728,20130109,94,39
GHCND:USW00094728,20130110,83,44
GHCND:USW00094728,20130111,78,28
GHCND:USW00094728,20130112,83,56
GHCND:USW00094728,20130113,100,61
GHCND:USW00094728,20130114,133,33
GHCND:USW00094728,20130115,33,17
GHCND:USW00094728,20130116,28,0
GHCND:USW00094728,20130117,61,17
GHCND:USW00094728,20130118,17,-39
GHCND:USW00094728,20130119,106,-11
GHCND:USW00094728,20130120,117,-11
GHCND:USW00094728,20130121,0,-33
GHCND:USW00094728,20130122,-28,-106
GHCND:USW00094728,20130123,-67,-117
GHCND:USW00094728,20130124,-56,-111
GHCND:USW00094728,20130125,-44,-106
GHCND:USW00094728,20130126,-28,-94
GHCND:USW00094728,20130127,11,-72
GHCND:USW00094728,20130128,22,-17
GHCND:USW00094728,20130129,94,22
GHCND:USW00094728,20130130,150,39
GHCND:USW00094728,20130131,161,-11
GHCND:USW00094728,20130201,-6,-44
GHCND:USW00094728,20130202,-17,-72
GHCND:USW00094728,20130203,-11,-44
GHCND:USW00094728,20130204,-11,-50
GHCND:USW00094728,20130205,0,-22
GHCND:USW00094728,20130206,39,-17
GHCND:USW00094728,20130207,0,-33
GHCND:USW00094728,20130208,11,-28
GHCND:USW00094728,20130209,0,-61
GHCND:USW00094728,20130210,22,-78
GHCND:USW00094728,20130211,72,11
GHCND:USW00094728,20130212,67,22
GHCND:USW00094728,20130213,67,6
GHCND:USW00094728,20130214,78,6
GHCND:USW00094728,20130215,128,28
GHCND:USW00094728,20130216,50,-6
GHCND:USW00094728,20130217,0,-78
GHCND:USW00094728,20130218,17,-83
GHCND:USW00094728,20130219,94,6
GHCND:USW00094728,20130220,33,-39
GHCND:USW00094728,20130221,11,-44
GHCND:USW00094728,20130222,33,-39
GHCND:USW00094728,20130223,56,22
GHCND:USW00094728,20130224,83,11
GHCND:USW00094728,20130225,72,0
GHCND:USW00094728,20130226,67,17
GHCND:USW00094728,20130227,83,22
GHCND:USW00094728,20130228,106,39
GHCND:USW00094728,20130301,72,22
GHCND:USW00094728,20130302,44,-6
GHCND:USW00094728,20130303,44,-17
GHCND:USW00094728,20130304,56,-28
GHCND:USW00094728,20130305,94,-6
GHCND:USW00094728,20130306,56,33
GHCND:USW00094728,20130307,33,6
GHCND:USW00094728,20130308,56,-6
GHCND:USW00094728,20130309,128,17
GHCND:USW00094728,20130310,100,22
GHCND:USW00094728,20130311,122,44
GHCND:USW00094728,20130312,139,61
GHCND:USW00094728,20130313,111,33
GHCND:USW00094728,20130314,50,-17
GHCND:USW00094728,20130315,83,-11
GHCND:USW00094728,20130316,50,0
GHCND:USW00094728,20130317,33,-17
GHCND:USW00094728,20130318,17,-22
GHCND:USW00094728,20130319,61,6
GHCND:USW00094728,20130320,72,0
GHCND:USW00094728,20130321,44,-11
GHCND:USW00094728,20130322,50,-22
GHCND:USW00094728,20130323,78,0
GHCND:USW00094728,20130324,83,6
GHCND:USW00094728,20130325,44,22
GHCND:USW00094728,20130326,117,28
GHCND:USW00094728,20130327,117,22
GHCND:USW00094728,20130328,106,28
GHCND:USW00094728,20130329,128,44
GHCND:USW00094728,20130330,150,44
GHCND:USW00094728,20130331,122,67
GHCND:USW00094728,20130401,167,28
GHCND:USW00094728,20130402,61,6
GHCND:USW00094728,20130403,78,6
GHCND:USW00094728,20130404,117,6
GHCND:USW00094728,20130405,178,50
GHCND:USW00094728,20130406,111,17
GHCND:USW00094728,20130407,128,44
GHCND:USW00094728,20130408,228,106
GHCND:USW00094728,20130409,278,106
GHCND:USW00094728,20130410,233,128
GHCND:USW00094728,20130411,156,83
GHCND:USW00094728,20130412,83,50
GHCND:USW00094728,20130413,144,50
GHCND:USW00094728,20130414,139,78
GHCND:USW00094728,20130415,150,67
GHCND:USW00094728,20130416,172,83
GHCND:USW00094728,20130417,217,128
GHCND:USW00094728,20130418,150,106
GHCND:USW00094728,20130419,217,128
GHCND:USW00094728,20130420,156,61
GHCND:USW00094728,20130421,128,28
GHCND:USW00094728,20130422,128,50
GHCND:USW00094728,20130423,117,50
GHCND:USW00094728,20130424,206,67
GHCND:USW00094728,20130425,189,78
GHCND:USW00094728,20130426,194,100
GHCND:USW00094728,20130427,217,89
GHCND:USW00094728,20130428,206,106
GHCND:USW00094728,20130429,139,111
GHCND:USW00094728,20130430,200,106
GHCND:USW00094728,20130501,206,83
GHCND:USW00094728,20130502,222,94
GHCND:USW00094728,20130503,189,94
GHCND:USW00094728,20130504,206,89
GHCND:USW00094728,20130505,178,78
GHCND:USW00094728,20130506,206,78
GHCND:USW00094728,20130507,233,111
GHCND:USW00094728,20130508,172,128
GHCND:USW00094728,20130509,200,122
GHCND:USW00094728,20130510,261,150
GHCND:USW00094728,20130511,211,161
GHCND:USW00094728,20130512,211,106
GHCND:USW00094728,20130513,144,72
GHCND:USW00094728,20130514,161,56
GHCND:USW00094728,20130515,206,111
GHCND:USW00094728,20130516,261,167
GHCND:USW00094728,20130517,222,144
GHCND:USW00094728,20130518,183,133
GHCND:USW00094728,20130519,150,128
GHCND:USW00094728,20130520,261,144
GHCND:USW00094728,20130521,300,200
GHCND:USW00094728,20130522,256,150
GHCND:USW00094728,20130523,267,178
GHCND:USW00094728,20130524,183,72
GHCND:USW00094728,20130525,122,72
GHCND:USW00094728,20130526,189,89
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GHCND:USW00094728,20130806,278,178
GHCND:USW00094728,20130807,267,211
GHCND:USW00094728,20130808,272,211
GHCND:USW00094728,20130809,294,233
GHCND:USW00094728,20130810,283,211
GHCND:USW00094728,20130811,272,183
GHCND:USW00094728,20130812,278,211
GHCND:USW00094728,20130813,250,200
GHCND:USW00094728,20130814,233,161
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GHCND:USW00094728,20130817,289,178
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GHCND:USW00094728,20130820,311,200
GHCND:USW00094728,20130821,322,222
GHCND:USW00094728,20130822,256,217
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GHCND:USW00094728,20131008,194,122
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GHCND:USW00094728,20131010,183,122
GHCND:USW00094728,20131011,200,156
GHCND:USW00094728,20131012,222,156
GHCND:USW00094728,20131013,183,133
GHCND:USW00094728,20131014,189,111
GHCND:USW00094728,20131015,222,117
GHCND:USW00094728,20131016,194,133
GHCND:USW00094728,20131017,228,161
GHCND:USW00094728,20131018,200,128
GHCND:USW00094728,20131019,178,111
GHCND:USW00094728,20131020,172,100
GHCND:USW00094728,20131021,189,100
GHCND:USW00094728,20131022,194,106
GHCND:USW00094728,20131023,128,72
GHCND:USW00094728,20131024,122,50
GHCND:USW00094728,20131025,117,44
GHCND:USW00094728,20131026,128,50
GHCND:USW00094728,20131027,144,78
GHCND:USW00094728,20131028,161,61
GHCND:USW00094728,20131029,133,67
GHCND:USW00094728,20131030,156,83
GHCND:USW00094728,20131031,189,117
GHCND:USW00094728,20131101,211,150
GHCND:USW00094728,20131102,200,128
GHCND:USW00094728,20131103,128,28
GHCND:USW00094728,20131104,78,17
GHCND:USW00094728,20131105,128,50
GHCND:USW00094728,20131106,161,94
GHCND:USW00094728,20131107,178,67
GHCND:USW00094728,20131108,100,44
GHCND:USW00094728,20131109,100,33
GHCND:USW00094728,20131110,161,67
GHCND:USW00094728,20131111,117,61
GHCND:USW00094728,20131112,111,-5
GHCND:USW00094728,20131113,39,-16
GHCND:USW00094728,20131114,111,6
GHCND:USW00094728,20131115,139,67
GHCND:USW00094728,20131116,156,72
GHCND:USW00094728,20131117,156,106
GHCND:USW00094728,20131118,183,106
GHCND:USW00094728,20131119,106,22
GHCND:USW00094728,20131120,67,0
GHCND:USW00094728,20131121,111,17
GHCND:USW00094728,20131122,139,106
GHCND:USW00094728,20131123,122,-5
GHCND:USW00094728,20131124,-10,-49
GHCND:USW00094728,20131125,17,-49
GHCND:USW00094728,20131126,83,6
GHCND:USW00094728,20131127,167,17
GHCND:USW00094728,20131128,17,-10
GHCND:USW00094728,20131129,39,-16
GHCND:USW00094728,20131130,39,-38
GHCND:USW00094728,20131201,94,22
GHCND:USW00094728,20131202,94,50
GHCND:USW00094728,20131203,117,33
GHCND:USW00094728,20131204,111,50
GHCND:USW00094728,20131205,156,89
GHCND:USW00094728,20131206,167,28
GHCND:USW00094728,20131207,50,0
GHCND:USW00094728,20131208,6,-16
GHCND:USW00094728,20131209,39,-5
GHCND:USW00094728,20131210,28,-10
GHCND:USW00094728,20131211,6,-27
GHCND:USW00094728,20131212,-10,-49
GHCND:USW00094728,20131213,17,-49
GHCND:USW00094728,20131214,11,-55
GHCND:USW00094728,20131215,44,-10
GHCND:USW00094728,20131216,6,-38
GHCND:USW00094728,20131217,0,-43
GHCND:USW00094728,20131218,28,-49
GHCND:USW00094728,20131219,83,-10
GHCND:USW00094728,20131220,117,50
GHCND:USW00094728,20131221,183,106
GHCND:USW00094728,20131222,217,161
GHCND:USW00094728,20131223,178,56
GHCND:USW00094728,20131224,56,-32
GHCND:USW00094728,20131225,-5,-71
GHCND:USW00094728,20131226,22,-10
GHCND:USW00094728,20131227,44,-5
GHCND:USW00094728,20131228,128,22
GHCND:USW00094728,20131229,89,50
GHCND:USW00094728,20131230,72,-49
GHCND:USW00094728,20131231,0,-60
GHCND:USW00094728,20140101,6,-43
In [61]:
datos = np.loadtxt("temperaturas.csv", usecols=(1, 2, 3), skiprows=1, delimiter=',')
In [65]:
x = np.arange(len(datos[:, 1]))
temp_media = (datos[:, 1] + datos[:, 2]) / 2
axes.plot(x, datos[:, 1], 'r')

axes.plot(x, datos[:, 2], 'b')
axes.plot(x, temp_media, 'k')
Out[65]:
[<matplotlib.lines.Line2D at 0x7f70c6b449d0>]
Referencias
Documentación pyplot http://matplotlib.org/api/pyplot_api.html (http://matplotlib.org/api/pyplot_api.html)

Tutorial de matplotlib en español http://pybonacci.wordpress.com/tag/tutorial-matplotlib-pyplot/
(http://pybonacci.wordpress.com/tag/tutorial-matplotlib-pyplot/)
Referencia rápida de matplotlib http://scipy-lectures.github.io/intro/matplotlib/matplotlib.html#quick-references
(http://scipy-lectures.github.io/intro/matplotlib/matplotlib.html#quick-references)

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9/10/2018 Jupyter Notebook Viewer

Parte 3 - Visualización con matplotlib

Estándar de facto para visualización en Python

Importamos los paquetes necesarios:

from IPython.display import HTML

HTML('<iframe src="http://matplotlib.org/examples/pylab_examples/annotation_demo.html" width="8

home | examples | gallery | pyplot | docs » Matplotlib Examples » previous | ne

pylab_examples example code: Travis-CI:

plt.plot([0, 0.1, 0.2, 0.5,0.6], [1, -1, 0, 3, -1])

plt.plot(x, f(x), label="Función f(x)")

Notamos varias cosas:

plt.plot(x, f(x), 'ro')

plt.plot(x, f(x), color='red', linestyle='', marker='o')

La lista de posibles argumentos y abreviaturas está disponible en la documentación de la función plot

Otro tipo de gráficas

plt.scatter(x, y, s=s, c=c, cmap=plt.cm.Blues)

plt.scatter(x, y, s=s, c=c, cmap=plt.cm.Oranges)

def f(x, y):

plt.contour(xx, yy, f(xx, yy))

Interfaz orientada a objetos

array([-1. , -0.79310345, -0.5862069 , -0.37931034, -0.17241379,

array([ 3.67879441e-01, 5.33117686e-01, 7.09185234e-01,

fig, axes = plt.subplots()

axes.plot(x, f(x), 'ro', label="Función F(x)")

fig, axes = plt.subplots(1, 2, sharey=True)

axes[0].plot(x, f(x), color="blue")

axes[1].plot(x, -f(x), 'r')

def g(x, y):

fig, axes = plt.subplots()

axes.contourf(xx, yy, zz, np.linspace(-1, 1), cmap=plt.cm.autumn)

fig, axes = plt.subplots

Ejemplo con datos reales

datos = np.loadtxt("temperaturas.csv", usecols=(1, 2, 3), skiprows=1, delimiter=',')

fig, axes = plt.subplots()

temp_media = (datos[:, 1] + datos[:, 2]) / 2

axes.plot(x, datos[:, 1], 'r')

Documentación pyplot http://matplotlib.org/api/pyplot_api.html (http://matplotlib.org/api/pyplot_api.html)

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