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Objetivos
General:
Analizar una estrategia estructural u operacional para mejorar la actividad enzimática en una aplicación
específica
Terminales:
Específicos
UNIDAD 1: Estructura-Función
Distinguir los diferentes niveles de organización estructural y los principales motivos enzimáticos o
patrones de secuencia
Analizar las características fisicoquímicas de enzimas puras a partir de datos experimentales
Calcular el efecto de los diferentes tipos de inhibición reversible en los parámetros cinéticos de las
enzimas
Describir las estrategias operacionales que se pueden emplear para superar los retos en la aplicación de
enzimas
Al terminar el curso cada estudiante habrá tenido la oportunidad de reflexionar sobre los siguientes
valores, así como de desarrollar estas capacidades:
Unidad 1: Estructura-Función
Estructura primaria, secundaria, terciaria, cuaternaria - Motivos: Rossman fold, Zinc fingers, etc -
PDBViewer/ PyMol
Electroforesis 1-D, Electroforesis 2-D, Cromatografía iónica, aniónica, afinidad, ultrafiltración, DSC,
Espectrometría de masas, ZETASIZER
Constante de inhibición
Inhibición por producto, inhibición por sustrato, solubilidad de sustrato y producto, equilibrio de la
reacción, velocidad de reacción, cofactores
In situ product removal, two-phase reactors, immobilization, continuos fed batch, coupled reactions,
cofactor recycling, etc
Error-prone PCR, evolución dirigida, gene shuffling, Uso de AutoDock Vina en ingeniería de proteínas
Metodología
Los temas se desarrollaran durante el semestre siguiendo la metodología del aprendizaje activo. Tal
como está planificado en el programa del curso, al final de la clase el profesor asigna las lecturas y tareas
que el estudiante debe preparar para la clase siguiente. Al comienzo de la clase el estudiante presentará
una comprobación de lectura corta o entregará la tarea que le haya sido asignada.
Antes de la clase:
El estudiante deberá preparar los temas asignados por el profesor, lo que incluye:
Estudiar el material asignado en la programación del curso, tanto para la clase teórica como para
el laboratorio.
Buscar información sobre los cuidados que se deban tener con los reactivos, equipos,
instrumentos y procedimientos involucrados en las prácticas de laboratorio.
Resolver las tareas, preguntas y ejercicios contenidos en el material del curso (teoría y
laboratorio) y lo asignado adicionalmente por el profesor durante el semestre.
De ninguna manera se considera que se ha preparado la clase solamente leyendo el material a la
carrera, poco antes de entrar al salón o al laboratorio.
Durante la clase:
Después de la clase:
El estudiante deberá:
Establecer las relaciones entre los temas tratados en la clase y el conocimiento previamente
adquirido.
Analizar los resultados obtenidos en la práctica de laboratorio e integrarlos con los conceptos
adquiridos en la clase teórica.
Realizar las tareas definidas en la clase, incluyendo el desarrollo de ejercicios, consultas y otras
actividades asignadas.
Realizar el informe de laboratorio, después de la práctica realizada, según los lineamientos y
requerimientos dados por el profesor.
Evaluación
EVALUACION PORCENTAJE
Parcial I : Estructura-Función 15%
Informe de purificación y caracterización 10%
Parcial II: Cinética enzimática 15%
Informe de trabajo computacional 10%
Seminario 15%
Trabajo en Clase 15%
Trabajo Final en mejoramiento operacional 20%
Bibliografía
Brändén, C., & Tooze, J. (1999). Introduction to protein structure. New York: Garland.
Lesk, A. M. (2004). Introduction to protein science: Architecture, function, and genomics. Oxford:
Oxford University Press.
Nelson, D. L., Nelson, D. L., Lehninger, A. L., & Cox, M. M. (2008). Lehninger principles of
biochemistry. New York: W.H. Freeman.
Stryer, L., Berg, J. M., & Tymoczko, J. L. (2015). Bioquímica con aplicaciones clínicas: Séptima
edición. Barcelona: Reverté.
Horario
Semana Sesión Inicio Fin Temas (Contenido) Fecha
Introducción al curso de
Enzimologia
Estructura 3D de enzimas
1 1 16 19 Monday, 29 July 19
Conceptos básicos
Estructura: primaria, secundaria,
cuaternaria
Principales Motivos
Uso de PDViewer y PyMol -
1 2 16 19 Tuesday, 30 July 19
Alineamiento de patrones
Caracterización de enzimas y
métodos de separacion y
2 3 16 19 purificación (Electroforesis 1D- Monday, 5 August 19
2D, Cromatografía, ZETASIZER -
Espectrometria)
Caracterización de enzimas y
métodos de separacion y
2 4 16 19 purificación (Electroforesis 1D- Tuesday, 6 August 19
2D, Cromatografía, ZETASIZER -
Espectrometria)
3 LAB 16 19 Electroforesis 1D Monday, 12 August 19