ANALISIS DEL GEN CLN8, QUE CODIFICA LA PROTEINA DE LIPOFUSCINOSIS NEURONAL CEROIDE

8, QUE OCASIONA LA ENFERMEDAD NEURONAL SEVERA.

PRESENTADO POR: FRANKLYN MUÑOZ

AILYN NANCLARES
BRAYAN PERAFAN

PRESENTADO A: EDNA LOURDEZ OROZCO

UNIVERSIDAD DEL CAUCA

FACULTAD DE CIENCIAS AGRARIAS

INGENIERIA AGROPECUARIA

POPAYAN-CAUCA
 19-MAYO-2018

INTRODUCCION

La mayoría de las especies animales domesticadas por el hombre presenta enfermedades, ya

sea que se encuentren en el medio donde viven o por una mutación genética, por esta razón el
hombre ha ido buscando soluciones para estas enfermedades, un caso en particular es el de los
Canis lupus familiaris, esta especie que ha sido domesticada para ayudar al hombre en sus
tareas diarias, por este motivo a tratado de identificar y solucionar muchas de las
enfermedades que dañan a esta especie, una en particular, es la enfermedad neuronal severa
que afecta a la raza de perros (Salukis), esta es causada por el gen CLN8 (lipofuscinosis
neuronal ceroide 8).

Este gen cual causa enfermedades heterogéneas hereditarias de almacenamiento lisosómico

que se han descrito en varias especies, incluidos humanos, ovejas, vacas, gatos y varias razas
diferentes de perros, incluida Salukis. La enfermedad genética en esta raza de perro en
particular. Los Salukis desarrollaron signos neurológicos progresivos (desorientación, ansiedad,
dificultades para comer, convulsiones y pérdida de la visión).

DESARROLLO DEL TEMA.

1. Link del genbank CLN8 completa

http://www.ensembl.org/Canis_familiaris/Gene/Sequence?db=core;g=ENSCAFG000000
16330;r=37:30866753-30886347;t=ENSCAFT00000025898

Se tomo una parte del gen del CLN8 el cual se tomo de 5' a 3'

5'ATTGCAGACGGATACATGAAGGTCCGAGGGGCACCTGCACCGCCTCCGCTTCCTTGGACCGGCTGCCGCGTGGGCCCAAA
GCCCGGTGTTGGCCCTGGGACGCCGTTAACGTAATAAATTGAGGACAATGACTCCTATGAGCGATGGGGGGACATCAGAAAG
CATCTTTGACCTCGACTACACGTCCTGGAAGATCCGCTCCACGCTGGCGGTGGCTGGCTTCGTCTTCTACCTGGGAGTCTTT
GTGGTCTGCCACCAGCTCTCGTCCTCCCTGAACGCCACCTACCGCTCTCTGGTGGCCAGAGAGAAGGTCTTCTGGAACCTGG
CGGCCACGCGCGCCGTCTTCGGCGTTCAGAGCACTGCTGCGGGCCTGTGGGCCTTGCTGGTGGACCCCGTGCTGCACGCTGA
CAAGGCGCGCGGCCAGCAGAACTGGTGCTGGTTTCACATCGCAACAGCAACCGGATTCTTTTTTTTTGAGAACGTAGCAGTT
CACCTGTCCAATGTGCTCTTCCGGACATTTGACTTGTTTTTGGCCATCCACCATCTCTTCGCCTTTCTGGGATTTCTTGGCT
CCGTGGTCAACCTCGGAGCCGGCCACTATCTGGCTATGAGCACGCTGCTTCTGGAGGCGAGCACTCCCTTCACCTGCATTTC
CTGGATGCTCCTAAA3'

Luego se replico quedando de 3' a 5', y convertido a ARN mensajero y se formo una parte de la
proteína del gen CLN8
3'TAACGTCTGCCTATGTACTTCCAGGCTCCCCGTGGACGTGGCGGAGGCGAAGGAACCTGGCCGACGGCGCACCCGGGTTT
CGGGCCACAACCGGGACCCTGCGGCAATTGCATTATTTAACTCCTGTTACTGAGGATACTCGCTACCCCCCTGTAGTCTTTC
GTAGAAACTGGAGCTGATGTGCAGGACCTTCTAGGCGAGGTGCGACCGCCACCGACCGAAGCAGAAGATGGACCCTCAGAAA
CACCAGACGGTGGTCGAGAGCAGGAGGGACTTGCGGTGGATGGCGAGAGACCACCGGTCTCTCTTCCAGAAGACCTTGGACC
GCCGGTGCGCGCGGCAGAAGCCGCAAGTCTCGTGACGACGCCCGGACACCCGGAACGACCACCTGGGGCACGACGTGCGACT
GTTCCGCGCGCCGGTCGTCTTGACCACGACCAAAGTGTAGCGTTGTCGTTGGCCTAAGAAAAAAAAACTCTTGCATCGTCAA
GTGGACAGGTTACACGAGAAGGCCTGTAAACTGAACAAAAACCGGTAGGTGGTAGAGAAGCGGAAAGACCCTAAAGAACCGA
GGCACCAGTTGGAGCCTCGGCCGGTGATAGACCGATACTCGTGCGACGAAGACCTCCGCTCGTGAGGGAAGTGGACGTAAAG
GACCTACGAGGATTT5'

ARN MENSAJERO

AUU-GCA-GAC-GGA-UAC-AUG-AAG-GUC-CGA-GGG-GCA-CCU-GCA-CCG-CCU-CCG-CUU-CCU-UGG-ACC-
GGC-UGC-CGC-GUG-GGC-CCA-AAG-CCC-GGU-GUU-GGC-CCU-GGG-ACG-CCG-UUA-ACG-UAA-UAA-AUU-
GAG-GAC-AAU-GAC-UCC-UAU-GAG-CGA-UGG-GGG-GAC-AUC-AGA-AAG-CAU-CUU-UGA-CCU-CGA-CUA-
CAC-GUC-CUG-GAA-GAU-CCG-CUC-CAC-GCU-GGC-GGU-GGC-UGG-CUU-CGU-CUU-CUA-CCU-GGG-AGU-
CUU-UGU-GGU-CUG-CCA-CCA-GCU-CUC-GUC-CUC-CCU-GAA-CGC-CAC-CUA-CCG-CUC-UCU-GGU-GGC-
CAG-AGA-GAA-GGU-CUU-CUG-GAA-CCU-GGC-GGC-CAC-GCG-CGC-CGU-CUU-CGG-CGU-UCA-GAG-CAC-
UGC-UGC-GGG-CCU-GUG-GGC-CUU-GCU-GGU-GGA-CCC-CGU-GCU-GCA-CGC-UGA-CAA-GGC-GCG-CGG-
CCA-GCA-GAA-CUG-GUG-CUG-GUU-UCA-CAU-CGC-AAC-AGC-AAC-CGG-AUU-CUU-UUU-UUU-UGA-GAA-
CGU-AGC-AGU-UCA-CCU-GUC-CAA-UGU-GCU-CUU-CCG-GAC-AUU-UGA-CUU-GUU-UUU-GGC-CAU-CCA-
CCA-UCU-CUU-CGC-CUU-UCU-GGG-AUU-UCU-UGG-CUC-CGU-GGU-CAA-CCU-CGG-AGC-CGG-CCA-CUA-
UCU-GGC-UAU-GAG-CAC-GCU-GCU-UCU-GGA-GGC-GAG-CAC-UCC-CUU-CAC-CUG-CAU-UUC-CUG-GAU-
GCU-CCU-AAA

SECUENCIA DE AMINOACIDOS CONCEGUIDA

LLE-ALA-ASP-GLI-TYR-MET-LYS-VAL-ARG-GLY-ALA-PRO-ALA-PRO-PRO-PRO-LEU-PRO-TRP-THR-GLY-CYS-ALA-VAL-GLY-PRO-
LYS-PRO-GLY-VAL-GLY-PRO-GLY-THR-PRO-LEU-THR-STOP-STOP-LLE-GLU-ASP-ASN-ASP-SER-TYR-GLU-ARG-TRP-GLY-ASP-
LLE-ARG-LYS-HIS-LEU-STOP-PRO-ARG-LEU-HIS-VAL-LEU-GLU-ASP-PRO-LEU-HIS-ALA-GLY-TRP-LEU-ARG-LEU-LEU-PRO-GLY-
SER-LEU-CYS-GLY-LEU-PRO-PRO-ALA-LEU-PRO-GLU-ARG-HIS-LEU-PRO-LEU-SER-GLY-GLY-GLN-ARG-GLU-GLY-LEU-LEU-
GLU-PRO-GLY-GLY-HIS-ALA-ARG-ARG-LEU.ARG-ARG-SER-GLU-HIS-CYS-CYS-GLY-PRO-VAL-GLY-LEU-ALA-GLY-GLY-PRO-
ARG-ALA-ALA-ARG-STPS-GLN-GLY-ALA-ARG-PRO-ALA-GLU-LEU-VAL-LEU-VAL-SER-HIS-ARG-ASN-SER-ASN-ARG-LLE-LEU-
PHE-PHE-STOP-GLU-ARG-SER-SER-SER-PRO-VAL-GLN-CYS-ALA-LEU-PRO-ASP-LLE-VAL-PHE-GLY-HIS-PRO-PRO-SER-LEU-
ARG-LEU-SER-GLY-LE-SER-TRP-LEU-ARG-GLY-GLN-PRO-ARG-SER-ARG-PRO-LEU-SER-GLY-TYR-GLU-HIS-ALA-ALA-SER-GLY-
GLY-GLU-HIS-SER-LEU-HIS-LEU-HIS-PHE-LEU-ASP-ALA-PRO-LYS

UBIACION DEL GEN

El gen se encuentra en el punto (c.349dupT) en el exón 2, que introduce un codón de parada inmediato
(p.Glu117 *)

FUNCION DEL GEN.

  El efecto de este gen es que en los perros desarrolla signos neurológicos progresivos,
incluyendo desorientación, ansiedad, dificultades para comer, convulsiones y pérdida de
la visión,encontrado en neuronas de varias regiones del cerebro y también en la retina.

 Realiza una acumulación de un material anormal llamado lipopigmentos, En estos

lipopigmentos encontramos las llamadas lipofuscinas y ceroides (la lipofuscina es el
resultado de la descomposición y absorción de glóbulos sanguíneos que estan dañados; y
se conoce como pigmentos del envejecimiento o desgaste). Esto es un trastorno causado
por la oxidación de residuos lipídicos y proteínas del cerebro, y con un problema de
incapacidad del cerebro para eliminar y reciclar proteínas. El resultado es una
acumulación de lipofuscina en el cerebro y esta acumulación mata a las células
cerebrales, las neuronas, una importante área encargada del control motor.

 Muestran los síntomas al año de edad. No suelen sobrevivir más de dos años. Y no hay
tratamiento para la enfermedad.

TIPO DE HERENCIA QUE SE OBSERVA EN EL RANGO

El pedigrí extendido indica un potencial ancestro común para ambos padres de la camada
afectada que pudo haber sido la fuente de la infección. Los padres de los casos en Australia
también se remontaban a estos mismos perros, y otro sospechoso (en Suecia) también
aparentemente tenía el mismo linaje. Por lo tanto, los pedigríes respaldan la teoría de que una
sola variante se ha propagado a todos los perros afectados. El ancestro común más joven de los
perros afectados nació en 1972. Debido al frecuente intercambio de perros reproductores.

CONCLUSION

El estudio de este gen muestra los inconvenientes de querer mejorar el pedigrí de una raza con
fines lucrativos, sin tener en cuenta que este tipo de acciones tienes efectos secundario en la parte
génica del individuo, en este caso los canis lupus familiaris (soluki) se vieron claramente
afectados con la enfermedad neuronal severa, se puede decir que esta problemática fue causada
por la falta de investigación o información de las personas encargadas de los criaderos de esta .
BIBLIOGRAFIA

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/29446145
http://www.bordercolliegardelcan.com/ncl-lipofuscinosis-neuronal-
ceroide.html
http://www.bordercolliegardelcan.com/ncl-lipofuscinosis-neuronal-
ceroide.
http://www.ensembl.org/Canis_familiaris/Gene/Sequence?db=core;g=
ENSCAFG00000016330;r=37:30866753-
30886347;t=ENSCAFT00000025898

ANEXO : CUADRO DE PROGENITORES Y DESCENDIENTES