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Las bases tercera y segunda del anticodón forman puentes de hidrógeno con las bases
primera y segunda del codón, lo que determina la especificidad de la interacción
codón/anticodón.
La primera base del anticodón puede orientarse o girarse de formas ligeramente
distintas para interaccionar con distintas bases en la posición tercera del codón. Estas
uniones presentan enlaces de hidrógeno diferentes a los observados en las bases
tercera y segunda. Debido a esto, la interacción codón/anticodón es más débil.