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HARMONISATION
ACADEMIQUE
Domaine : SNV
مواءمة
أكاديمي
2- Partenaires de la formation *:
- autres établissements universitaires :
- Partenaires internationaux :
- Licence Biochimie
- Licence biologie moléculaire
L’étudiant en Master en biochimie, doit acquérir un savoir et maîtriser un savoir-faire lui permettant
de comprendre en profondeur et d’aborder expérimentalement toute question relative à la structure,
au fonctionnement et à l’exploitation à des fins biotechnologiques des cellules vivantes et de leurs
composants moléculaires. Il doit non seulement avoir appris, mais aussi et surtout avoir appris à
apprendre de manière autonome : en tant que biochimiste : comment sont construites, comment
fonctionnent et comment évoluent les macromolécules qui constituent le fondement moléculaire de
la structure, du fonctionnement et de la programmation du vivant.
L'objectif de ce master est de donner aux étudiants les connaissances et outils nécessaires pour
aborder des domaines de pointe de la biologie, y compris à travers une vision transversale de ces
domaines. Grâce à son intégration au sein d'une équipe de recherche au cours du mémoire, l'étudiant
apprendra également à mettre en place une démarche scientifique visant à tester l'hypothèse posée,
et à la réaliser expérimentalement. Finalement, le stage de la dernière année offrira à l'étudiant une
insertion en milieu professionnel et lui permettra ainsi de se préparer à exercer son futur métier, fort
de son bagage scientifique, tant théorique que pratique
Les finalités de cette formation sont l'acquisition par les étudiants d'une formation multidisciplinaire
de haut niveau à l'interface entre la Biologie, la Chimie et la Physique. L'enseignement dispensé
permettra de répondre aux exigences de la Recherche et du Développement en Sciences de la Vie et
de la Santé, en mettant l'accent sur les aspects industriels dans le domaine de la Recherche et du
Développement de l'industrie des Biotechnologies.
Les étudiants de cette spécialité ont pour vocation à acquérir une formation par la recherche dans
des laboratoires publics ou privés développant ou intégrant l’un des s axes suivants : · Techniques et
méthodes de la biophysique structurale. Clonages, expressions et purifications des macromolécules
biologiques. Cristallographie, résonance magnétique nucléaire, microscopie électronique,
spectroscopie de masse, méthodes physico-chimiques d’études et de caractérisations des
macromolécules biologiques. Applications au haut débit (génomique structurale). · Techniques et
méthodes de la "biologie in silico", analyse et valorisation de l’information génomique.· Techniques
et méthodes de modélisation en biologie. Applications à la conception rationnelle de médicament et
aux méthodes de simulations en biologie.
La deuxième année de la formation proposée est particulièrement orientée vers les aspects
technologiques et appliqués de la Biochimie, avec des enseignements spécifiques portant notamment
sur les développements les plus appliqués de la biochimie , sur la conception de molécules
bioactives, sur les techniques modernes en immunologie, du "design" moléculaire aux outils de
diagnostic.
Intégration d'une proportion importante des étudiants dans la filière académique de préparation à la
thèse. Les équipes d'accueil des Ecoles Doctorales “ Biochimie et Biologie moléculaire ” (B2M) et “
Biologie Biotechnologie ” (B2T) constituent un support important pour l'insertion des étudiants en
stage dès le quatrième semestre de formation (S4) au sein des laboratoires de recherche.
Ce type de master convient aux étudiants qui envisagent une carrière dans la recherche publique et
l’enseignement supérieur ou d’ingénieur de recherche ou de développement dans le secteur
industriel des biotechnologies, de l’agro-alimentaire, de la santé et industries pharmaceutiques.
Par ailleurs, une formation approfondie en biologie structurale et biotechnologie est exploitable
comme support scientifique d'une double compétence pour l'accès aux métiers "péri-scientifiques"
par exemple : aspects réglementaires en biotechnologie, propriété industrielle, financement et
gestion de l'innovation, communication scientifique.
En résumé : il y a deux finalités
La finalité approfondie prépare au métier de chercheur. Des enseignements spécialisés ouvrent des
questions qui se situent à la limite des connaissances On insiste sur la formation à la démarche
expérimentale, à la communication scientifique, écrite et orale. Le programme comprend un stage
ou une formation dans un laboratoire extérieur à l’Université de Boumerdes.
Les étudiants de cette spécialité ont pour vocation à acquérir une formation par la recherche dans
des laboratoires publics ou privés développant ou intégrant l’un des s axes suivants : · Techniques et
méthodes de la biophysique structurale. Clonages, expressions et purifications des macromolécules
biologiques. Cristallographie, résonance magnétique nucléaire, microscopie électronique,
spectroscopie de masse, méthodes physico-chimiques d’études et de caractérisations des
macromolécules biologiques. Applications au haut débit (génomique structurale). · Techniques et
méthodes de la "biologie in silico", analyse et valorisation de l’information génomique.· Techniques
et méthodes de modélisation en biologie. Applications à la conception rationnelle de médicament et
aux méthodes de simulations en biologie.
La deuxième année de la formation proposée est particulièrement orientée vers les aspects
technologiques et appliqués de la Biochimie, avec des enseignements spécifiques portant notamment
sur les développements les plus appliqués de la biochimie , sur la conception de molécules
bioactives, sur les techniques modernes en immunologie, du "design" moléculaire aux outils de
diagnostic.
Intégration d'une proportion importante des étudiants dans la filière académique de préparation à la
thèse. Les équipes d'accueil des Ecoles Doctorales “ Biochimie et Biologie moléculaire ” (B2M) et “
Biologie Biotechnologie ” (B2T) constituent un support important pour l'insertion des étudiants en
stage dès le quatrième semestre de formation (S4) au sein des laboratoires de recherche.
L’unité optionnelle permet le passage à d’autres parcours types notamment vers les autres Masters
de biotechnologie et santé, bioingénierie des biomolécules, biochimie-microbiologie appliquées,
génie pharmacologique et biochimique et protéomique et santé.
Ce diplômé Biochimiste sera aussi amené à prendre en compte l’exploitation et la protection des
ressources naturelles. Sa formation lui permet d’appréhender les processus de fabrication afin de
déterminer les sources de rejets, de mettre au point des technologies propres et d’intégrer ces
données afin d’en dégager l’impact économique et social.
Trente étudiants
B : Encadrement Externe :
Etablissement de rattachement :
Etablissement de rattachement :
Chef du laboratoire
N° Agrément du laboratoire
Date :
Chef du laboratoire
N° Agrément du laboratoire
Date :
Matière 1 : techniques
45h00 1h30 - 1h30 55h00 2 4 40% 60%
d’extraction et purification
Matière 2 : Techniques de 3 5
60h00 1h30 1h30 65h00 40% 60%
biospectroscopie 1h00
UE découverte
UED1 (O/P) ) Analyse
45h00 1h30 1h30 - 5h00 2 2 40% 60%
d’articles I
UE transversales
UET1 (O/P)
Communication 22h30 1h30 - - 2h30 1 1 40% 60%
Total Semestre 1 375h00 13h30 9h00 2h30 375h00 17 30
Etablissement : UMBB Intitulé du master : biochimie appliquée Page 20
Année universitaire : 2015/2016
2- Semestre 2 :
VHS V.H hebdomadaire Mode d'évaluation
Unité d’Enseignement Coeff Crédits
14-16 sem C TD TP Autres Continu Examen
UE fondamentales
UEF1 (O/P) Immunologie
67h30 3h00 1h30 - 82h30 3 6 40% 60%
appliquée
UEF2 (O/P) Applications
67h30 3h00 1h30 - 82h30 3 6 40% 60%
industrielles des fermentations
UEF3 (O/P) Dynamique
structurale des 67h30 3h00 1h30 - 82h30 3 6 40% 60%
macromolécules
UE méthodologie
UEM1 (O/P) Cytogénétique et
37h30 1h30 - 1h00 37h30 2 3 40% 60%
culture cellulaire
UEM(O/P) Bioinformatique
67h30 3h00 - 1h30 82h30 3 6 40% 60%
appliquée
UE découverte
UED1 (O/P) Aspects
biochimique et génétique de 45h00 1h30 1h30 - 5h00 2 2 40% 60%
l’évolution
UE transversales
UET1 (O/P) Législation 22h30 1h30 - - 2h30 1 1 40% 60%
Total Semestre 2 375h00 16h30 6h00 2h30 375h00 17 30
Domaine : SNV
Filière : biologie
Spécialité : biochimie appliquée
Objectifs de l’enseignement : Donner des notions approfondies en bioénergétique qui sont régies
par des lois de conservation de l’énergie pour la compréhension du métabolisme énergétique.
Objectifs de l’enseignement : Illustrer par des exemples précis l’interdépendance des grandes
voies métaboliques de la cellule au cours desquelles l'énergie obtenue est utilisée pour la synthèse
de métabolites et de diverses macromolécules.
Connaissances préalables recommandées : régulation métabolique, Bioénergétique
1.Métabolisme des glucides: digestion chimique, rappel sur les voies d‘oxydation et de mise en
réserve du glucose et la néoglucogenèse
- Formation des radicaux libres oxygénés et les réactions parasites de l’oxydation (notion de stress
oxydatif)
- Mécanismes de la régulation du métabolisme glucidique
2.Métabolisme des lipides : digestion chimique, rôleset interactions entre les principaux organes
impliqués dans le métabolisme lipidique(Rappels sur la lipogenèse/lipolyse et leur régulation)
- Métabolisme des lipoprotéines, sphingolipides et glycérophospholipides
- Métabolisme du cholestérol (synthèse et régulation, hypercholestérolémie, catabolisme et formation
des sels biliaires, synthèse de la vitamine D, synthèse des hormones stéroïdiennes)
- Voie semi-pathologique : Formation des corps cétoniques
3. Métabolisme des protéines :digestion chimique, catabolisme des acides aminés(Acides aminés
glucoformateur et cétogènes)
- Décarboxylation des acides aminés et formation des amines bioactifs
-Exemples de la synthèse de quelques dérivés d’acides aminés (gluthation, créatine……)
4.Métabolisme de certaines molécules complexes (glycosaminoglycannes, glycoprotéineset
porphyrines)
5. Interactions des voies métaboliques et régulation neuroendocrinienne du
métabolismeénergétique(axe hypothalamo-adenohypophysaire, Rôles de l’insuline, glucagon,
catécholamines, GH et les hormones thyroïdiennes dans l’état postprandial et de jeune)
6. Régulation du métabolisme phosphocalcique (calcitonine, parthormone, vit D…….)
7. Régulation de l’apport alimentaire
- À court terme (hormone du TD, ghreline, cck )
- À long terme (leptine, NPY, orexine)
Chapitre I
1. Nutrition et types trophiques
2. Croissance bactérienne (cinétique et paramètres de croissance)
Chapitre II
Le Métabolisme Microbien
1. Principe général
2. Voies métaboliques chez les microorganismes.
3. Le Catabolisme : Hydrolyse et Oxydation
4. Différents types de fermentations
Chapitre III
Propriétés des micro-organismes utilisés en biotechnologies
1. Propriétés morphologiques et physico-chimiques des micro-organismes
2. Propriétés physiologiques des micro-organismes:
2.1. Nutrition;
2.2. multiplication;
2.3. Mutations.
I- Techniques d’extraction
-Tampons
-Extractions chimiques
-Extractions enzymatiques
-Extractions mécaniques
Mode d’évaluation : Contrôle continu, examen, etc…(La pondération est laissée à l’appréciation
de l’équipe de formation)
Objectifs de l’enseignement :
Analyser les objectifs de la communication interne et externe et preé senter les meé thodologies
neé cessaires pour conduire les principales actions de communication
Objectifs de l’enseignement : Cet enseignement doit permettre aux étudiants d'acquérir les techniques
essentielles d'immunologie.
Objectifs de l’enseignement : Ce cours permet de donner aux étudiants des connaissances relatives
aux procédés de fabrications des différents métabolites primaires et secondaires par fermentations.
Objectifs de l’enseignement
Ce module aborde les connaissances approfondies sur les phénomènes dynamiques qui
entraînent ou impliquent, au moins transitoirement, une modification de la structure
interne des molécules. L’étude de la dynamique d’assemblage des macromolécules
biologiques ainsi que l’analyse de leurs structure et leurs interactions constituent les grands domaines
émergents en biologie
IV. Biocristallographie
dichroisme circulaire
Programme de TD :
- Exercices sur les structures des acides nucléiques et leur hydrolyse enzymatique
I Introduction à la Bioinformatique
IIRecherche dans les bases et les banques de données
IIAnalyse de Séquences de biomolécules
- Introduction
- Alignement de séquences
IV Structures de protéines
- Prédiction de la structure secondaire et tertiaire des protéines
- Prédiction de la structure de complexes protéiques et protéineligand
V Expression de gènes et modélisation
VI Modélisation de systèmes biochimiques
- Processus de modélisation
- Modèle différentiel
- Modélisation stochastique
II- Evolution des macromolécules (rôle fonctionnel des acides aminés et des nucléotides)
Objectifs de l’enseignement
Initier l’apprenant aux notions reé glementaire, les deé finitions et origines des textes de loi et les
connaissances des conseé quences peé nales.
Compétences visées :
o Capaciteé aà lire et comprendre un texte de loi
o Capaciteé aà appliquer une reé glementation
Contenu de la matière :
Notions geé neé rales sur le droit (introduction au droit, droit peé nal).
Preé sentation de leé gislation algeé rienne (www.joradp.dz, reé feé rences des textes).
Reà glementation geé neé rale (loi sur la protection du consommateur, hygieà ne, eé tiquetage
et information, additifs alimentaires, emballage, marque, innocuiteé , conservation).
Reà glementation speé cifique (travail personnel, exposeé s).
Organismes de controô le (DCP, CACQUE, bureau d’hygienne, ONML).
Normalisation et accreé ditation (IANOR, ALGERAC).
Normes internationales (ISO, codex alimentarius, NA, AFNOR)
Objectifs de l’enseignement : L'objectif est de donner une formation générale dans le domaine
choisi mais également d'approfondir les connaissances et le savoir-faire des étudiants dans un
domaine plus spécialisé soit dans le domaine des Industries alimentaires, soit dans le domaine des
Industries biochimiques, soit dans le domaine de la Biotechnologie pharmaceutique.
Objectifs de l’enseignement. Offrir aux étudiants une solide connaissance des propriétés
structurales et fonctionnelles des macromolécules biologiques avec l’approche génomique : Le
génome, sa structure et son environnement cellulaire, Centromères et télomères
I- La génomique structurale
- Rappels et définitions des principaux types de gènes
- Les marqueurs génétiques
- Les éléments génétiques mobiles
- Identification et cartographie de tous les gènes d’un génome par séquençage
- Le projet du génome Humain (PGH)
- Le séquençage à haut débit
- Annotation de la séquence
II- Les objectifs de la génomique
III- La génomique fonctionnelle
- Classement des gènes et identification de leurs fonctions
- La stratégie pour attribuer une fonction a un gène inconnu.
- Manipulation génétique chez les organismes models
- La génétique classique
- La génétique inverse
- Les ARN interférents
IV - La génomique comparative
- La découverte de nouveaux gènes par la génomique comparative
- La génomique comparative et les organismes modèles
- La génomique comparative des récepteurs nucléaires et le développement d'agents
thérapeutiques
IV- Les différentes approches méthodologiques en génomique fonctionnelles
- Développement d’approches systématique pour l’analyse fonctionnelle de familles de gènes
Le TD : exercices : sur la génomique structurale et fonctionnelle.
Etudier les articles qui traites des problématiques sur la génomique structurale et fonctionnelle.
Objectifs de l’enseignement : Offrir aux étudiants une solide connaissance des propriétés
structurales et fonctionnelles des macromolécules biologiques avec l’approche protéomique :
Méthodes d’études des complexes multiprotéiques impliqués dans l’expression des gènes.
Formation approfondie dans l'utilisation de l'approche protéomique pour l'identification des
interactions entre protéines, la recherche de marqueurs précoces dans le domaine de la santé. Ou
l'annotation des génomes.
Programme TD :
- Exercices sur les séquences des protéines
- Exercices sur les méthodes de purification des protéines
- Exercices sur l’électrophorèse 2D-PAGE et 2D-DIGE
- Exercices sur la spectrométrie de masse et sur la quantification des protéines (technique
V- Phénomènes interfaciaux
Objectifs de l’enseignement :
Pouvoir décrire les principales caractéristiques d'une matrice de données multivariées, d'en définir
de façon pertinente des grands groupes, d'analyser de tels matrices ou tableaux de données et de
décrire les relations entre ces variables à l'aide de modèles linéaires et non linéaires (exponentiels,
Bêta, Gamma par exemple) adaptés aux besoins des généticiens, des immunologistes et des
biologistes.
Objectifs de l’enseignement
: familiariser l’étudiant à analyser un article s c i e n t i f i q u e ;
d’avoir la capacité de synthétiser l’essentiel d’un travail et se
familiariser à la recherche au niveau international, tant au niveau
de l’écrit que de l’oral, afin de fournir des bases suffisantes pour
permettre une progression autonome aux étudiants
Objectifs de l’enseignement
Initier l’apprenant au montage de projet, son lancement, son suivi et sa reé alisation.
Compétences visées :
o Compreé hension de l’organisation et de fonctionnement d’une entreprise
o Capaciteé aà monter un projet de creé ation d’entreprise
Oui
(Si oui, transmettre les accords et/ou les conventions dans le dossier papier
de la formation)
- Donnant son point de vue dans l’élaboration et à la mise à jour des programmes
d’enseignement,
- Participant à des séminaires organisés à cet effet,
- En participant aux jurys de soutenance,
- En œuvrant à la mutualisation des moyens humains et matériels.
FONCTION :
Date :
Dispensé à :
Etablissement : UMBB Intitulé du master : biochimie appliquée Page 55
Année universitaire : 2015/2016
Par la présente, l’entreprise déclare sa volonté de
manifester son accompagnement à cette formation en qualité d’utilisateur potentiel du
produit.
A cet effet, nous confirmons notre adhésion à ce projet et notre rôle consistera à :
- Donner notre point de vue dans l’élaboration et à la mise à jour des programmes
d’enseignement,
- Participer à des séminaires organisés à cet effet,
- Participer aux jurys de soutenance,
- Faciliter autant que possible l’accueil de stagiaires soit dans le cadre de mémoires
de fin d’études, soit dans le cadre de projets tuteurés.
Les moyens nécessaires à l’exécution des tâches qui nous incombent pour la réalisation
de ces objectifs seront mis en œuvre sur le plan matériel et humain.
FONCTION :
Date :