Departamento de Bioquímica y Biología Molecular Bioquímica 251.

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Seminario 3: Traducción y Control de la expresión génica

1.-¿Qué es el código genético? Explique cada una de sus características.

El código genético es el conjunto de normas por las que la información codificada
en el material genético (secuencias de ADN o ARN) se traduce en proteínas
(secuencias de aminoácidos) en las células vivas. El código define la relación
entre secuencias de tres nucleótidos, llamadas codones, y aminoácidos. Un codón
se corresponde con un aminoácido específico.

A. El código está organizado en tripletes o codones: cada tres nucleótidos

(triplete) determinan un aminoácido.

B. El código genético es degenerado: existen más tripletes o codones que

aminoácidos, de forma que un determinado aminoácido puede estar
codificado por más de un triplete.

C. El código genético es no solapado o sin superposiciones: un nucleótido

solamente pertenece a un único triplete.

D. La lectura es "sin comas": el cuadro de lectura de los tripletes se realiza de

forma continua "sin comas" o sin que existan espacios en blanco.

E. El código genético nuclear es universal: el mismo triplete en diferentes

especies codifica para el mismo aminoácido. La principal excepción a la
universalidad es el código genético mitocondrial.

2.- ¿Qué es la posición de tambaleo de un codón?

La hipótesis del “balanceo” o “tambaleo” (wobbling) fue propuesta para explicar que
un mismo anticodón puede establecer interacción con distintos codones, que se
diferencian en su tercera base.

Consiste en que las bases 3ª (3') y 2ª (central) del anticodón reconocen a las bases
respectivas, 1ª (5') y 2ª (central), del codón de forma estricta, según las reglas de
emparejamiento de Watson y Crick (A-T, C-G), mientras que la primera base del
anticodón (5') es menos selectiva y puede establecer con la 3ª base del codón (3')
un par de Watson y Crick o, mediante un pequeño desplazamiento, un par distinto.
Esto permite

● a G emparejarse con C o con U en el codón

● a U emparejarse con A o con G en el codón
● a I (inosina) emparejarse con A, C o U en el codón

3.- ¿Qué es un marco de lectura?¿Cuántos marcos de lectura posible hay en una

secuencia?

En biología molecular, un marco de lectura es una de las posibles formas en que se puede dividir una
secuencia de nucleótidos de ADN o ARN para formar un grupo de tripletes consecutivos no solapados

4.- ¿Qué son las secuencias 5’ y 3’-UTR?

Región 5’UTR: Esta región es importante para la regulación e iniciación de la

transcripción a veces se traducen a un producto de proteína producto. Este producto
puede regular la traducción del ARNm.

La región 3’UTR es la sección de un gen que sigue inmediatamente a la traducción

codón de terminación. Las regiones reguladoras de la región 3 ‘no traducida pueden
influir poliadenilación, la eficiencia de traducción, localización, y la estabilidad del ARNm.

5.- ¿Qué son las secuencias de Shine-Dalgarno?¿Dónde podemos encontrarlas?

¿Cuál es su importancia?

La secuencia Shine-Dalgarno es una secuencia de ARN mensajero propia de los transcritos de

procariotas. Se trata de una secuencia situada unos 6 o 7 nucleótidos antes del codón de inicio de la
traducción, y regula la iniciación de ésta. Posee una secuencia consenso característica: «AGGAGG»,
que es complementaria a una zona del 3' del ARN ribosomal 16S (denominada «secuencia anti-
Shine-Dalgarno» y que posee por tanto la forma «UCCUCC»). La interacción de ambas secuencias
posibilita la unión del ribosoma al 5' del ARN mensajero, lo que facilita el reconocimiento del codón de
inicio y la subsiguiente síntesis proteica.

Importancia: Estas secuencias de Shine-Delgarno se encuentran justo antes de los codones de

iniciación y "se los señalan" al ribosoma.

6.- Explique de manera sencilla el inicio de la traducción eucarionte

Iniciación ("comienzo"): en esta etapa el ribosoma se reúne con el ARNm y
el primer ARNt para que pueda comenzar la traducción.
En la iniciación, el ribosoma se ensambla alrededor del ARNm que se
leerá y el primer ARNt (que lleva el aminoácido metionina y que
corresponde al codón de iniciación AUG). Este conjunto, conocido como
complejo de iniciación, se necesita para que comience la traducción.

7.- Para la siguiente secuencia:

5’-… AUG ACA GCC GAG CCU GAC AUU UUC CUG ACA UAA… -3’

Indique el resultado de la lectura (secuencia de aminoácidos), utilizando los

marcos de lectura posibles.

¿Qué sucede con las proteínas resultantes?

8.- El mecanismo de acción de algunos antibióticos se relaciona directamente con la

traducción. Investigue los mecanismos de acción de:

A. Estreptomicina: actúa a nivel ribosomal inhibiendo la síntesis proteica en la subunidad

pequeña del ribosoma (subunidad 30S) de forma que impide que se forme el complejo de
iniciación de la síntesis proteica.
B. Cloranfenicol: Antibiótico bacteriostático de amplio espectro, interfiere en la síntesis
proteica bacteriana.
C. Cicloheximida: La cicloheximida es un inhibidor de la síntesis proteica en
organismos eucariotas, y es producida por la bacteria Streptomyces griseus.
Actúa interfiriendo la actividad peptidil transferasa del ribosoma 60S, bloqueando
la elongación traduccional.
D. Eritromicina: Interfiere en la síntesis proteica bacteriana a nivel de subunidad 50S
ribosomal.
E. Puromicina: Es un antibiótico aminonucleósido producido por Streptomyces alboniger. Actúa
sobre células procariotas, eucariotas, hongos, protozoos y amebas. Su mecanismo de acción
principal es inhibir la síntesis de proteínas, actuando sobre la transferencia de los péptidos
y consecuentemente, provocando una liberación de la cadena polipeptídica prematuramente.

9.- ¿Qué es un operón?¿Cómo se encuentra estructurado?

Definición: Zona del DNA que constituye una unidad de expresión génica en procariotas
compuesto por varios genes y por secuencias promotoras y reguladoras que comparten.
Estructura:
Un operón es una unidad del cromosoma bacteriano formado por los siguientes
componentes:

1. Un gen regulador
El gen regulador codifica una proteína reguladora, el represor. El represor
lac, codificado por el gen lacI, es la proteína reguladora del operón lac.

2. Un operador
El operador es la región de DNA en el operón a la que se une la proteína
reguladora.

3. Un promotor
El promotor es la secuencia de DNA en el operón reconocida por la RNA
polimerasa dependiente del DNA. El lugar de iniciación para la síntesis del
RNA está situado inmediatamente tras el promotor. El gen de la RNA
polimerasa dependiente de DNA no es parte del operón, ya que la
RNA polimerasa transcribe todos los operones bacterianos.

4. Genes estructurales
El operón contiene uno o más genes que codifican enzimas inducibles. El
operón lactosa codifica las enzimas necesarias para el metabolismo de la
lactosa, incluyendo ß-galactosidasa, ß-galactósido permeasa y ß-
galactósido transacetilasa.

10.- Investigue el funcionamiento del operón del triptófano.

● El operón trp , que se encuentra en la bacteria E. coli, es un grupo de genes que
codifican enzimas biosintéticas para el aminoácido triptófano.
● El operón trp se expresa (enciende) cuando los niveles de triptófano son bajos y se
 reprime (apaga) cuando son altos.
● El operón trp es regulado por el represor trp. Cuando se une a triptófano, el represor
trp bloquea la expresión del operón.

● La biosíntesis del triptófano también está regulada por la atenuación (un mecanismo
basado en el acoplamiento de transcripción y traducción)

11.- Investigue el rol de la proteína aconitasa en la regulación del metabolismo del hierro.

La aconitasa es una proteína que pertenece a la familia de las hidrolasas dependientes de un

centro ferro-sulfurado que se encargan de la catálisis de la reacción de isomerización de β-
hidroxiácidos.

En concreto, la aconitasa cataliza la isomerización del citrato en isocitrato a través de una

deshidratación y una hidratación sucesivas, formándose un intermediario, el cis-aconitato, entre
ambos procesos.

Figura 3. Esquema de la
reacción catalizada por la aconitasa

El sustrato se estabiliza en el centro activo de la enzima gracias a interacciones electrostáticas con

el centro ferro-sulfurado, que además lo ayuda a colocarse en la posición correcta para interactuar
con los residuos catalíticos. Este cluster de Fe-S (en color naranja) se une a la proteína por medio
de los residuos Cys437, Cys503 y Cys506 (en color azul oscuro).

Por otro lado, residuos de los cuatro dominios que conforman la proteína forman parte del centro
activo. Algunos de estos aminoácidos son histidinas (en color morado), asparaginas (en color azul
claro) y serinas (en color rosa). La presencia de estos aminoácidos en el centro activo es importante,
pues permite crear un microentorno especializado en el que suceda la reacción.
Centro activo de la aconitasa.

Por tanto, en el centro activo del enzima existen aminoácidos responsables de la unión y el anclaje
del sustrato al enzima, a lo que también contribuye el centro ferro-sulfurado, y, por otro lado,
tenemos aminoácidos encargados de llevar a cabo la catálisis propiamente dicha.

La Ser642 es capaz de aceptar el protón que cede el sustrato actuando como base, gracias al
entorno químico en que se encuentra. Por otro lado, la His101 actúa como un ácido donando su
protón para la reacción.

En primer lugar, ocurre una deshidratación: la His101 proporciona un H+ que formará H2O con un
OH- del C3 del sustrato. Después, la Ser642 actuará como base y captará un H+ del C2 del sustrato,
incorporándolo a su cadena lateral. Así se forma el intermediario cis-aconitato, con un doble enlace
entre el C2 y el C3.
Los residuos Ser642 e His101 son importantes para el mecanismo catalítico.

A continuación, el cis-aconitato sufre un giro de 180º y comienza la reacción correspondiente de

hidratación. La His101 vuelve a captar un átomo de H+, de la molécula de H2O generada
anteriormente, y el OH- restante se vuelve a unir al sustrato, aunque esta vez en una posición
distinta. La Ser642 cede el H+ de vuelta al sustrato y este se libera en forma ya de isocitrato,
completándose la reacción.

12.- Explique brevemente:

A. Código de histonas:
B. Función de secuencias enhancers y silenciadores
C. Splicing alternativo
D. Diferencias entre siRNA y miRNA
E. Uniquitina y proteosoma

Dra Tamara Castro Lezano 2-2019