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Apuntes bioquímica metabólica sergi.pdf


Apuntes bioquímica metabólica

2º Bioquimica Metabolica

Grado en Biotecnología

Escuela Técnica Superior de Ingeniería Agronómica y del Medio


Natural
UPV - Universitat Politècnica de València

Reservados todos los derechos. No se permite la explotación económica ni la transformación de esta obra. Queda permitida la impresión en su
totalidad.
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Sergio Roig Soucase


BIOTECNOLOGÍA 2017 - 2018

Profesor: Ismael Rodrigo Bravo


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ÍNDICE
1. INTRODUCCIÓN A LA BIOENERGÉTICA 1

¿QUÉ ES VIDA? 1
DIFERENCIA ENTRE EQUILIBRIO Y HOMEOSTASIS 1

2. TERMODINÁMICA BIOQUÍMICA 2

PRINCIPIOS DE LA TERMODINÁMICA 2
CONSECUENCIAS DE LA ENERGÍA LIBRE 3

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3. INTERMEDIARIOS ENERGÉTICOS 4

¿POR QUÉ LA HIDRÓLISIS DE ATP LIBERA TANTA ENERGÍA? ¿POR QUÉ ES RICOENERGÉTICO? 4
¿CÓMO EL ATP PROMUEVE REACCIONES ENDERGÓNICAS? 5
¿POR QUÉ ATP? 5
¿POR QUÉ ATP Y NO GTP, CTP O UTP? 6

4. PROCESOS REDOX EN METABOLISMO 7

PROCESOS REDOX EN METABOLISMO 7


POTENCIAL DE REDUCCIÓN EN BIOQUÍMICA - E (VOLTS) 8
PROCESOS BIOQUÍMICOS REDOX 10
INTERMEDIARIOS REDOX 10

5. METABOLISMO DE GLÚCIDOS 11

¿POR QUÉ GLUCOSA? 11


GLICÓLISIS 12
FERMENTACIÓN ALCOHÓLICA 15
USO DE OTROS AZÚCARES EN LA DIETA 15
CICLO DEL ÁCIDO CÍTRICO (CAC) 18
REGULACIÓN DEL CAC 21
ANABOLISMO DE LA GLUCOSA (BIOSÍNTESIS) 22
REGULACIÓN DE LA GLUCONEOGÉNESIS (Y GLICÓLISIS) 23
ALTERNATIVAS A LA GLICÓLISIS 24
RUTA DE LAS PENTOSAS FOSFATO 24
CICLO DEL GLIOXILATO 25

6. CADENA DE TRANSPORTE DE ELECTRONES (CTE) Y FOSFORILACIÓN OXIDATIVA 26

MITOCONDRIAS 26
DESCRIPCIÓN CTE 27
NADH  COMPLEJO I: NADH-Q-OXIDORREDUCTASA 28
QH2  COMPLEJO III: Q-CYT-OXIDORREDUCTASA 28

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COMPLEJO IV  CYTC-OXIDASA 29
COMPLEJO II 30
H+-ATP-SINTASA 31
NADH CITOSÓLICO 33
TRANSPORTADORES DE LA MEMBRANA INTERNA MITOCONDRIAL 34
INHIBIDORES DE LA CTE 34
DESACOPLAMIENTOS CTE/FOSFORILACIÓN ATP 35

7. METABOLISMO DE LÍPIDOS 36

GRASAS EN LA DIETA 36
CATABOLISMO DE LOS ÁCIDOS GRASOS 37
1. LIPÓLISIS Y MOVILIZACIÓN 37
2. ACTIVACIÓN Y TRANSPORTE A MITOCONDRIA 38

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3. Β-OXIDACIÓN 39
BIOSÍNTESIS DE TAG/ÁCIDOS GRASOS 41
REGULACIÓN INTEGRADA DEL METABOLISMO DE COMBUSTIBLES 45

8. METABOLISMO DEL NITRÓGENO I. AMINOÁCIDOS 46

TRANSAMINACIÓN 48
REGULACIÓN DE LA BIOSÍNTESIS DE AAS 50
CATABOLISMO DE AMINOÁCIDOS (Y PROTEÍNAS) 51
CICLO DE LA UREA 52
RECAMBIO PROTEICO (TURNOVER) 55
PROBLEMAS QUE AFECTAN AL CATABOLISMO DE AMINOÁCIDOS 56

9. METABOLISMO DEL NITRÓGENO II. NUCLEÓTIDOS 57

BIOSÍNTESIS DE PIRIMIDINA 57
CATABOLISMO DE NUCLEÓTIDOS (GENERAL) 58
CATABOLISMO DE PIRIMIDINAS 59
BIOSÍNTESIS DE PURINAS 59
DEGRADACIÓN DE PURINAS 60
NAD, FAD, COA 61
BIOSÍNTESIS DE DESOXIRRIBONUCLEÓTIDOS 62
ESTRATEGIAS ANTIVIRALES 65
EVOLUCIÓN DNARNAPROTEÍNAS 65

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BIOQUÍMICA METABÓLICA

1. INTRODUCCIÓN A LA BIOENERGÉTICA
¿Qué es vida?

 Estamos formados por los mismos elementos (C, H, O, N, P, S)

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 Formados por las mismas biomoléculas
 En disolución acuosa, unidas mediante enlaces covalentes

BIOSFERA LITOSFERA
Moléculas complejas Moléculas simples
Elevado contenido en H: reducida Oxidada
Inestables (difícil de sintetizar) Estables
Orden, estructura, información Caos
HOMEOSTASIS (tendencia a ser estable en el EQUILIBRIO (cuando el sistema llega a un punto
tiempo) muerto)

Diferencia entre equilibrio y homeostasis

Durante el estado de equilibrio el sistema está muerto y no hay producción de energía. No hay flujo de
materia ni de energía. Imaginemos dos bidones conectados, si éstos están a diferente nivel el sistema
necesitaría un aporte de recursos para obtener trabajo útil. Si este sistema perdura en el tiempo, se
encuentra en un estado de equilibrio sino en estado estacionario.

1
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BIOQUÍMICA METABÓLICA

2. TERMODINÁMICA BIOQUÍMICA
Principios de la termodinámica

 PRIMER PRINCIPIO: la energía es constante en el universo: ni se crea ni se destruye. En un proceso


AB ; ΔE=EB-EA dependerá solo del estado final e inicial: es función de estado, pues no nos explica
la dirección del proceso.
 SEGUNDO PRINCIPIO: la entropía del universo siempre es creciente: ΔS>0 en todo el universo.
 TERCER PRINCIPIO: la entropía de un cristal perfecto en 0 K es 0.

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Para ello se utiliza ΔG (energía libre de Gibbs) = ΔH – TΔS (factores entrópicos). La tendencia de todos los
procesos es llegar al equilibrio. Vendrá con el aumento de la entropía. Para que sea espontáneo ΔG<0.
Con un consumo grande de energía podemos disminuir el desorden.

En el equilibrio ΔG=0. La entropía es la fuerza motriz (impulsora) que impulsa a un sistema a alcanzar el
equilibrio, su capacidad de realizar trabajo útil será menor, pudiendo llegar a cero. ΔG es función de
estado, así que hay que definir unas condiciones:


𝛥𝐺 0 nos predice la tendencia termodinámica de los procesos:

 𝛥𝐺 0 < 0 ESPONTÁNEO / FAVORABLE / EXERGÓNICO

 𝛥𝐺 0 > 0 NO ESPONTÁNEO / DESFAVORABLE / ENDERGÓNICO

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BIOQUÍMICA METABÓLICA

En química, espontaneidad indica que el sistema tiene tendencia a


reaccionar. No por ello quiere decir que sea rápido, es decir:
termodinámica ≠ cinética.

El valor absoluto indica cómo está el sistema desplazado del


equilibrio. El signo indica dirección del proceso.

Valor absoluto muy elevado nos informa de su tendencia a



reaccionar, y liberará mucha energía. 𝛥𝐺 0 y 𝐾𝑒𝑞

nos dice cuál será el
compuesto más abundante alcanzado el equilibrio. Los seres vivos
no podemos obtener trabajo útil mediante un aumento de

temperatura o la compresión de gases. Para ello usamos 𝛥𝐺 0 .

Consecuencias de la energía libre

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𝛥𝐺 0 es función de estado, extensiva (depende de la masa del sistema y es proporcional) y aditiva (los
valores de la misma se pueden sumar)

No todas las reacciones metabólicas son espontáneas. Los procesos biosintéticos son endergónicos, ya
que generarán moléculas más complejas y estables. Estrategias para ello:

Los seres vivos conseguimos que se produzcan procesos acoplados, gracias a los catalizadores llamados
enzimas gracias a sus centros activos que se acoplan a los sustratos.

Consigue que se posicionen correctamente y la reacción se dará cuando



ambos sustratos estén en su sitio. 𝛥𝐺 0 se utilizará cambiando de forma
al enzima.

Queremos en un segundo caso reconvertir D en el compuesto C


adicionándole energía del entorno, porque lo que realmente queremos
es obtener el compuesto B. De esta manera C-D actuará como
intermediario energético o molécula “lanzadera” de energía libre (en
inglés shuttle).

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BIOQUÍMICA METABÓLICA

3. INTERMEDIARIOS ENERGÉTICOS

ATP: “moneda” universal de intercambio de energía libre


Existen procesos exergónicos tales como oxidaciones,
catabolismo, absorción de luz (fotosíntesis) y procesos
endergónicos (biosíntesis) que tomarán la energía libre de
los procesos exergónicos y usarlos en los endergónicos.

ATP es trifosfato de adenosina, cuyo azúcar es la ribosa. La


hidrólisis del fosfato γ y β (primer y segundo fosfato
comenzando por la izquierda) viene acompañado de una

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variación de energía más elevada, llamándolos “grupos ricoenergéticos”. Los enlaces son éster fosfórico
entre los fosfatos y enlace N-glicosídico entre la adenina y la ribosa.

El ATP es la que se encuentra en mayor concentración del orden de mM (lo normal es μM). La hidrólisis
de ATP tiene consigo una energía muy elevada: es muy exergónico.


Introduciendo el valor en la expresión que relaciona 𝛥𝐺 0 y 𝐾𝑒𝑞

sale una proporción 1:10.000.000, es
decir, 1 ATP por cada 10.000.000 de ADP (esto indica una tendencia muy alta a la formación de producto).

En condiciones estándar:

Una vez liberado el fosfato γ:

Hidrólisis de AMP:

En ocasiones muy concretas, el ATP puede hidrolizarse desde el fosfato β liberando pirofosfato (PPi):

El objetivo de esto es la hidrólisis del pirofosfato:

¿Por qué la hidrólisis de ATP libera tanta energía? ¿Por qué es ricoenergético?

1. Repulsión electrostática

Los grupos fosfato constan de 4 cargas negativas muy fuertes, creando una tensión de repulsión
electrostática. Los productos de la hidrólisis tendrán una estructura más “relajada”. La tendencia del ADP
a formar ATP es ridícula. No es tan espontáneo (el mismo razonamiento para ADP  AMP). SI se consigue

hidrolizar el enlace α y obtener un nucleósido, no viene acompañado de una 𝛥𝐺 0 tan grande.

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BIOQUÍMICA METABÓLICA

2. Mejor hidratación

Los productos de la hidrólisis van a ser más polares y van a atraer un mayor número de moléculas de
agua, estabilizando la estructura y haciendo más difícil que vuelvan a juntarse. Las cargas negativas
atraen el H2O.

3. Resonancia

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A mayor número de formas resonantes, mayor será la estabilidad. Cuando el fosfato se separa, se forma
el tetraedro:

La energía que se libera de la hidrólisis se libera del sistema, no de un enlace “especial”. La energía vendrá
de procesos exergónicos. No hay enlaces ricos en energía, está en toda la estructura. Decimos que la
molécula de ATP es “ricoenergética”, pero habría que decir que es un compuesto con un elevado potencial
de transferencia de fosfóricos.

¿Cómo el ATP promueve reacciones endergónicas?

La transferencia de energía sucederá de manera termodinámica. Si hidrolizamos ATP solo, no se invierte


(calienta el tubo). Si lo acoplamos a un proceso endergónico, sucede. Si el ATP promueve estos procesos,
es porque participa estequiométricamente en la reacción. No es un proceso paralelo, son el mismo.

Ahora todos los componentes forman parte de un mismo proceso. En el tubo de ensayo no sucederá- En
los seres vivos será gracias al uso de catalizadores una vez hidrolizado. Es muy normal que el fosfato se
transfiera al compuesto A, haciendo un compuesto A* muy reactivo y poder dar lugar al componente que
queremos.

¿Por qué ATP?

El ATP no es el único ricoenergético pero sí el principal. La molécula más ricoenergética en metabolismo


es el fosfoenol piruvato o PEP.

Tiene tanta tendencia a desfosforilarse que el ATP se recarga en esta hidrólisis. Razones:

1. El ATP presenta un valor ricoenergético medio. Así puede refosforilarse utilizando procesos más
exergónicos (oxidación en la mitocondria, captación de luz en la fotosíntesis y fosforilación directa

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BIOQUÍMICA METABÓLICA

– PEP). -7.3 kcal mol-1 hace que esté sintonizada con las necesidades metabólicas. Si usáramos
PEP, se desperdiciaría una gran cantidad de energía.

2. El ATP presenta una estabilidad cinética elevada. Termodinámicamente es inestable pero en


disolución acuosa no se hidroliza rápidamente (en el
tiempo). Esto tiene que ver con la energía de activación:

El sistema tiene que invertir energía para liberar la energía de

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activación y la energía libre. En ATP se ha estimado que es hasta de

unas 10 veces más que 𝛥𝐺 0 . Otros compuestos, en disolución
acuosa decaen muy rápidamente.

3. Presenta una elevada complejidad estructural para ser una molécula tan pequeña. Es necesario
que entre en el centro activo. Podemos dividir la molécula en dos partes: el azúcar y la adenina,
que tiene información, y el fosfato. Esto le confiere especificidad para ser reconocido por el centro
activo del enzima.

¿Por qué ATP y no GTP, CTP o UTP?

EL GTP se utiliza en la síntesis de proteínas, polimerización de microtúbulos, ciclo de Krebs… Las purinas
(adenina y guanina) tienen importantes papeles. Las pirimidinas (citosina y uracilo) se emplean para
activar biomoléculas (precursores). En reacciones de polimerización como en la glucosa se necesita UDP.

¿Por qué ATP y no GTP? No está claro. Sería desperdiciar recursos en utilizar ambos. La adenina no tiene
oxígeno en su estructura, siendo probablemente más estable (además el O2 apareció más tarde). La
adenina forma dos puentes de hidrógeno mientras que la guanina tres permitiéndole una mayor eficiencia
en reconocer el centro activo y salir de él.

DATOS: Adulto promedio 70 kg ATP/ persona y día Contenido total 50 g ATP/ persona

El origen de la energía será de procesos redox. Hay un flujo de electrones que causan una diferencia de
potencial: de más reducidas a más oxidadas.

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BIOQUÍMICA METABÓLICA

4. PROCESOS REDOX EN METABOLISMO


El carbono no puede ceder o captar electrones como Fe2+ ↔ Fe3+ + 1e-. El oxidante o reductor estará unido
covalentemente al carbono.

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Procesos redox en metabolismo

1. Transferencia directa de electrones

Se da en casos muy concretos como en la cadena de transporte de electrones. El par Fe/Fe2+ dona e- al
par Cu+/Cu2+.

2. Transferencia de átomos de H (H+ + e-) AH2 + B ↔ A + BH2


3. Transferencia como ion hidruro (H-)  (2 e- + 1 H+) catalizado por deshidrogenasas/NAD

El etanol ha perdido 2 electrones y el NAD+ se ha quedado con 2 e- y 1 H+, es decir, con un ion hidruro. El
anillo de nicotinamida será el responsable de los procesos redox:

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BIOQUÍMICA METABÓLICA

4. Oxidación/Hidroxilaciones

El carbono estará más oxidado debido a que el oxígeno es muy electronegativo. La presencia de un átomo
de oxígeno tirará del par de enlace. El carbono estará completamente oxidado en el CO 2 con
un estado de oxidación de +4. En el caso del metano tenemos lo contrario, siendo el
compuesto más reducido y al oxidarse liberará mucha energía.

 Mayor contenido en oxígeno  más oxidado


 Mayor contenido en hidrógeno  más reducido
 Menor contenido en hidrógeno  más oxidado

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5. Insaturaciones

Los procesos redox van del reductor al oxidante. En solución, cuando hay dos compuestos, habrá una
transferencia.

 Biomolécula muy reducida  muy energética, muy inestable


 Biomolécula poco reducida  poco energética, más estable

Potencial de reducción en bioquímica - E (Volts)

No existe un oxidante absoluto. Depende de la naturaleza del compuesto. El potencia redox es una medida
de la tendencia de un compuesto a ganar electrones (reducirse/ser oxidante). Solo tiene sentido cuando
se comparan moléculas: a mayor potencial redox, más oxidado. El sistema de referencia es:

Si ponemos en ambas cubetas lo mismo,


no habrá ningún intercambio de
electrones. Cuando ponemos otro
compuesto X que toma electrones del
electrodo, quedando un valor positivo
E0>0 (X toma electrones del H). En un
segundo caso Y, el compuesto se oxida y
el flujo de electrones será al revés. Por lo
tanto E0<0 (H2 toma electrones del Y).
Todos los valores van a ser comparables y
aditivos (pues se toma el mismo sistema de referencia). Solo nos importa la diferencia.

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BIOQUÍMICA METABÓLICA

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El hidrógeno cuando se junta con O2 es muy exergónico, pero viene asociada con un 𝐸 0 >0. Cuando
hablamos de espontaneidad:

 Queremos saber si un proceso tendrá lugar:

¿Puede el NADH reducir el piruvato a lactato?

El número más alto va a comportarse como oxidante y el más bajo como reductor. El cálculo formal sería
′ 0 ′ 0 ′
∆𝐸 0 = 𝐸𝑂𝑋𝐼𝐷𝐴𝑁𝑇𝐸 − 𝐸𝑅𝐸𝐷𝑈𝐶𝑇𝑂𝑅 = 𝑑𝑒𝑠𝑡𝑖𝑛𝑜 − 𝑜𝑟𝑖𝑔𝑒𝑛


Sí que lo hará con toda la probabilidad ya que la termodinámica lo permite (∆𝐺 0 <0). Otra manera de
estudiarlo sería: ¿NADH + PIRUVATO  LACTATO?

Veamos la relación entre la ley de acción de masas, la energía libre y el potencial de reducción:

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BIOQUÍMICA METABÓLICA

Procesos bioquímicos redox

MITOCONDRIAS CLOROPLASTOS

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En mitocondrias, ∆𝐺 0 se emplea para realizar trabajo osmótico y estos protones convertirán esta energía
potencial en un trabajo químico.

En cloroplastos, el pigmento al incidir la luz lo promueve a un estado más excitado que será secuestrado

por la cadena de transporte de electrones (CTE). ∆𝐺 0 < 0 se invierte en un bombeo de protones que
posteriormente será un trabajo químico. El pigmento, al quitarle electrones se convierte en un oxidante
enérgico, robándole electrones al O2 (fotólisis del agua). Esto sucede al final.

Intermediarios redox

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BIOQUÍMICA METABÓLICA

5. METABOLISMO DE GLÚCIDOS
La Bioquímica nació con un estudio acerca de la glicólisis en 1897 con los hermanos Büchner. Intentaban
obtener extractos libres de levadura, es decir, libre de células (estaba en auge el vitalismo donde se
pensaba que existía una fuerza vital). Si se añadía mucho azúcar al extracto, éste se preservaba. Al añadir
sacarosa a la levadura observaron unas burbujas (CO2) y etanol. Los compuestos químicos de los seres
vivos podían dirigir a la producción de alcohol, en otras palabras, existía una ciencia: la bioquímica. En
1940 se había resuelto la ruta completa de la glicólisis.

¿Por qué glucosa?

Es el combustible universal. Es una molécula pequeña, polar, soluble en agua y neutra utilizada por todos

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los seres vivos. Desde un punto de vista redox, es una molécula muy reducida para poder obtener una
gran cantidad de energía libre. Se puede sintetizar de manera espontánea en condiciones abióticas, a
partir de formaldehído. De todos los monosacáridos, es no reactivo (más estable químicamente).

Fue el primer combustible, pues estableció como la glicólisis en una época donde no había oxígeno en la
atmosfera: es anaerobia (cualquier célula en cualquier entorno puede usarla). La glicólisis es menos
eficiente que la respiración, pero es breve y muy rápida. Tiene un rendimiento de un 31%, y se considera
superior in vivo. Comparándola con la oxidación de la glucosa:

𝐺𝑙𝑢𝑐𝑜𝑠𝑎 + 6 𝑂2 → 6 𝐶𝑂2 + 6 𝐻2 𝑂 ∆𝐺 0 = −686 𝑘𝑐𝑎𝑙/𝑚𝑜𝑙
Los componentes de una ruta metabólica no se encuentran en línea recta. En el caso de la glicólisis, las
10 enzimas están disueltas en el citosol. Consta de dos fases:

Una fase preparatoria o de inversión de energía (a) y una fase de producción de energía o “pay off” (b).

Podemos considerar la glicólisis como:

 FLUJO DE CARBONOS: glucosa (6C)  2 Piruvato (3C)


 FLUJO DE ELECTRONES: 2 NAD+  2 NADH
 FLUJO DE FOSFATO INORGÁNICO (Pi): 2 ADP  2 ATP

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BIOQUÍMICA METABÓLICA

¿Por qué la glucosa se fosforila tan rápidamente y no hay glucosa libre?

Todos los intermediarios de la glicólisis están fosforilados. La glucosa suele encontrarse en menor
concentración fuera de la célula. Es una molécula que puede difundir de manera pasiva a través de la
membrana. Si se fosforila inmediatamente, la carga del fosfato hace que se quede atrapada. Otra razón
es que la glucosa es químicamente inerte. La presencia del fosfato distorsiona la molécula y la vuelve más
reactiva. La Glc-6P dirige/marca la molécula para la glicólisis.

Glicólisis

1. FASE PREPARATORIA – ACTIVACIÓN Y FRAGMENTACIÓN

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La kinasa transfiere fosfatos de ATP u otros nucleótidos energéticos. La hexoquinasa puede ser inhibida
por exceso de Glc6P.

La segunda parte de la glicólisis parte de 3PGAL. La DHAP no se va a acumular porque es la forma ALDO
y la otra es la CETO: La DHAP se isomeriza gracias a la triosafosfato isomerasa. Si el azúcar es una pentosa,
tendremos dos moléculas de 3 carbonos. SI rompiéramos la Glc6P daría un compuesto de 2 y 4 carbonos,
no pudiendo hacerse la condensación aldólica. En tubo de ensayo sería más estable que la DHAP y 3PGAL
pasara a 1,6 Fru3P. Este proceso, en condiciones celulares es de unos -0.2 kcal/mol, por tanto, es un
proceso espontáneo.

2. OBTENCIÓN DE ATP

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BIOQUÍMICA METABÓLICA

El ion arseniato es igual que el fosfato (en geometría) y puede ser reconocido
por el enzima DH, produciendo un compuesto con arseniato que no permitiría
la síntesis de ATP.

Directamente pasaría al 3PGA (by-pass). No bloquea la glicólisis, pero se


ha perdido la refosforilación de ADP. El rendimiento sería nulo, por eso, es un veneno tóxico.

El último proceso fuertemente exergónico va a compensar los anteriores endergónicos.

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Rendimiento final: ingresa 2 ATP y obtenemos 4.

𝐺𝑙𝑢𝑐𝑜𝑠𝑎 + 2 𝑁𝐴𝐷 + + 2 𝐴𝐷𝑃 + 2𝑃𝑖 → 2 𝑃𝑖𝑟𝑢𝑣𝑎𝑡𝑜 + 2 𝑁𝐴𝐷𝐻 (+2 𝐻 + ) + 2 𝐴𝑇𝑃 (+2 𝐻2 𝑂) ∆𝐺 0 ~ − 20 𝑘𝑐𝑎𝑙/𝑚𝑜𝑙

El objetivo de la glicólisis, además de obtener ATP, se obtiene poder reductor (NADPH) que se empleará
en procesos que precisan electrones. El piruvato será origen de aminoácidos así como de otros destinos:

El NAD+ y NADH son la misma molécula y tiene existencias limitadas, por tanto un aumento de NADH
causará una diminución de NAD+. El destino de NAD+/NADH será poder reductor, cadena de transporte de
electrones para producir ATP y fermentaciones.

Destinos anaerobios del NADH y del Piruvato: fermentaciones

El ácido láctico es un compuesto que es una vía muerta en


eucariotas. Es ácido (disminuye el pH). Hay bacterias que sí que
lo aprovechan (fermentación de lácteos). No solo lo producen
las bacterias lácteas. Nuestras células, ante una situación de
exceso de NADH o falta de oxígeno también recurren a la fermentación láctica (como en los músculos).

En el caso de mamíferos se deshacen del lactato eliminándolo por diferentes formas.

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BIOQUÍMICA METABÓLICA

Las células musculares (son aerobias, con muchas mitocondrias) en estado basal obtienen ATP mediante
glicólisis. Cuando uno inicia un ejercicio, la necesidad de ATP se multiplica y la renovación del NAD+ no es
total debido a la lentitud del proceso. Las fibras musculares contienen una concentración elevada de
enzimas glicolíticas. Se puede activar, y el proceso es más rápido que mediante la producción de ATP por
respiración en la mitocondria, que es más lenta.

El músculo no es anaerobio, pero no es capaz de procesar la cantidad elevada de piruvato y NADH. El


piruvato no movilizado es tóxico y sin NAD+  NADH, no se producirá á glicólisis. Es por ello que se recurre
a la fermentación láctica, en el llamado ciclo de Cori (1929).

El ácido láctico se expulsará a la sangre, que llegará al


hígado donde lo convertirá a lactato, gracias a la LDH.
EN el hígado, el lactato se reoxida a piruvato y el NADH
oxidado en la mitocondria. EL pyr será reconvertido a
glucosa gracias a la gluconeogénesis. El hígado

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consume muchos recursos (6 ATP) respecto a los 2ATP
de la glicólisis.

Mediante mediciones a tiempo real se ha comprobado


que el ácido láctico no se queda en el músculo, solo
traspasa la energía metabólica al hígado. No funciona de manera síncrona.

Deuda de O2

Es normal que al dejar de hacer ejercicio, la respiración sea elevada unos minutos después. Esto se debe
a que el hígado sigue reoxidando el lactato a glucosa, y esto necesita de oxígeno. En una media hora - dos
horas los niveles de ácido láctico se habrán estabilizado.

La cristalización de un compuesto necesita de una concentración saturante. Si se formara tanto ácido


láctico, disolvería las células. Además, necesita reposo y el músculo siempre está en movimiento. Las
agujetas por tanto NO se deben a la cristalización de ácido láctico, sino al sobreesfuerzo del músculo,
causando rotura de fibras musculares.

¿A qué se debe la espontaneidad del ciclo en el músculo y en el hígado?

El paso contrario en el hígado tiene un balance NAD+/NADH desplazado hacia el NAD+, así como el
piruvato está muy desplazado para la gluconeogénesis, empujando el lactato a la reoxidación a piruvato.
En reposo también se obtiene ATP por la vía fermentativa, debido a su rapidez. Los músculos no son los
únicos productores de ácido láctico:

 Los glóbulos rojos/eritrocitos, que no tienen núcleo ni mitocondrias, su metabolismo es anaerobio,


están produciendo ácido láctico continuamente, difundiéndose a la sangre donde llegará al hígado y
lo transformará en glucosa.
 Las células tumorales que crecen a gran velocidad, son mayores a los vasos sanguíneos que las irrigan
siendo, por tanto, la irrigación deficiente. Como están en continua división y necesitan gran
requerimiento de glucosa, producen ácido láctico.
Cuando un cáncer está en estado terminal en fase gluconeogénica, obtiene glucosa a través de
lactato, fenómeno llamado caquexia. Los pacientes están esqueléticos. Se han desarrollado técnicas
como Positron Emission Tomography, que consiste en inyectar glucosa marcada radiactivamente,
aprovechado por las células tumorales. Combinándolo con el TAC (Computered Axial Tomography) se
detectan los tumores.
 Células de cualquier tejido en condiciones de hipoxia.

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BIOQUÍMICA METABÓLICA

Fermentación alcohólica

El etanol es un compuesto muy volátil así como el dióxido de carbono. Si confinamos levaduras en
recipientes cerrados, fermentarán. Las levaduras viven cerca de frutas porque oxidan glucosa, así como
bajo la superficie de la piel de las frutas, creando una zona antibacteriana (nicho) alrededor de la levadura.
Son moderadamente resistentes al alcohol. Hay otros organismos que extraen energía del etanol, como
las bacterias del vinagre.

Reservados todos los derechos. No se permite la explotación económica ni la transformación de esta obra. Queda permitida la impresión en su totalidad.
Uso de otros azúcares en la dieta

La absorción de nutrientes se produce en la primera parte del intestino delgado, en las células epiteliales
que lo tapizan (enterocitos). Estas células tienen que absorber de manera masiva, de ahí las
microvellosidades. Son muy ricas en glicoproteínas y glicolípidos: llamado glicocálix. Contienen enzimas
hidrolíticos que hidrolizan nutrientes.

SACAROSA α-D-glucopiranosil (12) β-D-Fructofuranósido

ENZIMA: sacarasa. Cuando han sido obtenidas en el exterior,


pueden ser transportadas. La glucosa podrá ser utilizada por
cualquiera. La fructosa será procesada en el hígado y
adipocitos, que tendrá que ser fosforilada por la fructokinasa. La Fru1P se va a romper en DAP
(dihidroxiacetonafosfato) y gliceraldehído sin fosforilar. Solo se produce en el hígado y la fructokinasa no
se regula (no como la hexoquinasa por exceso de glucosa). Un exceso de fructosa causa un exceso de
intermediarios que se traduce en grasas.

LACTOSA β-D-galactopiranosil (14) α-D-glucopiranosa

Ningún mamífero en existencia sobrevive sin lactasa (ENZIMA).


La galactosa irá al hígado, necesitando de una complicada ruta
metabólica (ver esquema de la siguiente página) para
transformarse a glucosa, siendo por ello de difícil asimilación. Hay enfermedades como la galactosemia
(en bebés) que dificultan la utilización de galactosa.

La lactasa solo se expresa durante la lactancia. La intolerancia a la lactosa implica que no se produzca la
lactasa, aumentando el número de bacterias intestinales. La ingesta de leche depende de la cultura,
habiéndose producido mutaciones en la expresión de la lactasa. Hay tribus esencialmente intolerantes.
Los alimentos lácteos son beneficiosos ya que alimentan a las bacterias lácticas  Probióticos.

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BIOQUÍMICA METABÓLICA

Ruta metabólica de la degradación de la lactosa

Reservados todos los derechos. No se permite la explotación económica ni la transformación de esta obra. Queda permitida la impresión en su totalidad.
MALTOSA 2x α-D-glucosa (14) No se encuentra de forma natural en nuestra dieta. El enzima es la
maltasa (α-D-glucosidasa). Viene de la digestión del almidón.

ALMIDÓN formado por amilosa (α-D-glucosa (14)) y amilopectina (amilosa + ramificaciones α(16))

Cuando pasa a través del intestino será hidrolizado por α-amilasas fragmentándolo en glucosa libre,
formando dímeros de glucosa (maltosa). Las ramificaciones α(16) son hidrolizados por enzimas
desramificadoras.

GLUCÓGENO Similar a la amilopectina pero más ramificado. Si


nuestra dieta incluye carne, el glucógeno ha de ser hidrolizado
(como el almidón). Si el glucógeno está en músculo o hígado, será
para uso propio. La glucogenina construye las α(14) y las
ramificaciones α(16). Estas estructuras tan ramificadas tienen
un extremo reductor, así como muchos extremos no reductores.

El glucógeno es muy compacto (muchas unidades de glucosa en


poco espacio) empaquetado, muy ramificado e insoluble. La
ramificación hace que se pueda movilizar a una gran velocidad. Los
enzimas que liberan la glucosa lo hacen en el extremo no reductor.
Si se hidrolizara en el hígado o músculo, tendríamos una elevada
concentración de glucosa y se escaparía. Es por ello que en vez de
entrar agua (hidrólisis) entra un fosfato (fosforólisis, enzima fosforilasa).

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BIOQUÍMICA METABÓLICA

Reservados todos los derechos. No se permite la explotación económica ni la transformación de esta obra. Queda permitida la impresión en su totalidad.
La Glc1P va a quedar retenida debido a la carga negativa del grupo fosfato. Es una glucosa para uso
interno. Además, no consume ATP, dirigida directamente a la glicólisis. Existe una actividad llamada
fosfoglucomutasa, ya que el inicio de la glicólisis es la Glc6P y no la Glc1P de la fosforólisis. No implica
mucha energía.

La fosforólisis tiene poca tendencia a producirse en condiciones estándar. En hígado y músculo


[Pi]>>>10x[Glc] y el fosfato desplaza el equilibrio a la liberación de Glc por los extremos no reductores.

Músculos Glc6P  glicólisis  ATP


Hígado (para su exportación) Glc6P (fosfatasa)  Glc (sangre) + Pi

La acción de las fosforilasas se detiene 4 residuos antes de llegar a una ramificación. Cuando esto ocurre,
los 3 últimos residuos de una ramificación son transferidos al extremo no reductor mediante las
transferasas. Después actúa una α(16)glucosidasa que hace que se vaya el residuo que ha quedado
en la ramificación.

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BIOQUÍMICA METABÓLICA

Ciclo del ácido cítrico


(CAC)

En seres vivos aeróbicos, bacterias


aerobias y algunas bacterias
anaerobias. Los precursores del
acetil coenzima A son el piruvato de la
glicólisis, lípidos y aminoácidos.

El piruvato primero tendrá que entrar


en la mitocondria. La membrana
externa es relativamente permeable,
pero la interna no, por ello, en el

Reservados todos los derechos. No se permite la explotación económica ni la transformación de esta obra. Queda permitida la impresión en su totalidad.
espacio intermembrana se produce
un antiporte; entra piruvato y sale OH- (ambos de carga negativa). De esta manera ya podrá iniciarse el
ciclo. Antes, el piruvato ha de descarboxilarse:


∆𝐺 0 = - 8 kcal/mol

La piruvato deshidrogenasa es una unidad muy grande que presenta tres actividades. Tiene una masa de
7 MDa. Este enzima es sensible a muchos metabolitos. Necesita 5 cofactores distintos:

 TPP (tiamina pirofosfato o vitamina B1)


 Ácido lipoico
 FAD
 NAD+
 CoA-SH (presenta un grupo sulfhidrilo – tiol libre)

TPP, ácido lipoico y FAD forman parte estructural de la piruvato


deshidrogenasa. NAD+ y CoA-SH son cofactores estequiométricos.

Los primeros se recuperan al finalizar la catálisis. Los segundos son


externos al enzima y como consecuencia de la catálisis se modifican (NADH
y acetilCoA).

La descarboxilación del piruvato viene con una energía muy negativa. AcetilCoA es muy inestable con un
contenido energético muy elevado, siendo un compuesto ricoenergético con un elevado nivel de
transferencia de acetilos.

Es un proceso irreversible. No hay probabilidad de volver atrás. Además se produce CO2 gaseoso. Volver
a añadirlo sería dificilísimo. En el interior de la mitocondria, el NADH va a ser utilizado en la respiración.

Las fases detalladas del ciclo del ácido cítrico se describen a continuación:

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BIOQUÍMICA METABÓLICA


1. Condensación del acetilo (2C) con OAA (4C)  citrato (6C). Enzima: citrato sintasa. ∆𝐺 0 =
−7.7 𝑘𝑐𝑎𝑙/𝑚𝑜𝑙. Se libera CoA y entra agua.
2. Isomerización a isocitrato (vía cis-aconitato – 2a y 2b). Enzima: acomutasa.
3. Descarboxilación isocitrato  α-cetoglutarato (α-oxoglutarato / α-OG). Enzima isocitrato

deshidrogenasa. ∆𝐺 0 = −5 𝑘𝑐𝑎𝑙/𝑚𝑜𝑙
4. 2ª descarboxilación α-OG  CO2 + NADH + succinil-CoA. Enzima α-cetoglutaril deshidrogenasa.

∆𝐺 0 = −8 𝑘𝑐𝑎𝑙/𝑚𝑜𝑙

5. Fosforilación de GDP a nivel de sustrato. Enzima: succinil CoA sintetasa. ∆𝐺 0 = −0.7 𝑘𝑐𝑎𝑙/𝑚𝑜𝑙.

Este GTP puede ser intercambiado GTP + ADP ↔ GDP + ATP ∆𝐺 0 = 0 𝑘𝑐𝑎𝑙/𝑚𝑜𝑙.
6. Succinato  fumarato. Enzima: Succinato deshidrogenasa. Mediante insaturación. Se utiliza

como oxidante el FAD. ∆𝐺 0 ~ 0 𝑘𝑐𝑎𝑙/𝑚𝑜𝑙

7. Fumarato  Malato. Enzima: fumarasa. Es una hidratación. ∆𝐺 0 ≅ −1 𝑘𝑐𝑎𝑙/𝑚𝑜𝑙

Reservados todos los derechos. No se permite la explotación económica ni la transformación de esta obra. Queda permitida la impresión en su totalidad.

8. Oxidación malato  oxalacetato (OAA). Enzima: malato deshidrogenasa. ∆𝐺 0 = 7.1 𝑘𝑐𝑎𝑙/𝑚𝑜𝑙.

Es un proceso fuertemente endergónico. En tubo de ensayo su tendencia es a reducir el oxalacetato a


malato. El proceso, al desaparecer el producto de la reacción, tirará del equilibrio. La primera reacción del
ciclo de Krebs es muy exergónica.

La [OAA]=10-6 M, está implicado en muchas rutas biosintéticas (aminoácidos, glucosa y ciclo de Krebs).
Es por ello que su concentración ha de ser muy baja, siendo menor que la constante de equilibrio.

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BIOQUÍMICA METABÓLICA

BALANCE FINAL:

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 Acetil CoA + 3 NAD+ + FAD + GDP + Pi  2 CO2 + 3 NADH + FADH2 + GTP (↔ ATP)
 Piruvato  Acetil CoA + CO2 + NADH
 Glucosa  2 piruvato + 2 ATP + 2 NADH

Rendimiento total desde la glucosa hasta el CO2:

Glucosa + 10 NAD+ + 2 FAD+ + 4 ADP + 4 Pi  6 CO2 + 10 NADH + 2 FADH2 + 4 ATP

Oxidación completa de la glucosa: ATP ≅ 30-32 ATP

La glicólisis y la oxidación completa de la glucosa presentan un rendimiento similar (34%).

¿Por qué es tan complicada la oxidación de acetilo?

Esto presupone que el ciclo de Krebs solo oxida acetilos,


pero no es así. Hace muchas más cosas: se ha convertido
en el punto central del metabolismo. Los C4, C5 y acetilos
ingresan en el CAC teniendo un papel catabólico. La mayoría
de las moléculas del CAC son precursores para la biosíntesis
de otras moléculas; tienen un carácter anabólico.

El CAC en otros seres vivos es diferente al de las


mitocondrias, como sucede en bacterias anaerobias.
Existen los dos procesos como rutas separadas,
estableciéndose mucho antes que hubiera O2 en la
atmósfera y la fotosíntesis. Las dos ramas se utilizan para la
biosíntesis (anabolismo).

Al desaparecer el NADH (por la cadena de transporte


electrónica) obligamos a que se forme el ciclo de Krebs en
eucariotas. En seres anaerobios la desaparición de NADH no
se lleva a cabo y se puede utilizar para la biosíntesis.

La malato deshidrogenasa se considera como un retoque evolutivo de la lactato deshidrogenasa. Es un


proceso desplazado hacia la formación de reactivos. Es por ello que el CAC no es ni anabólico ni catabólico,
sino ANFIBÓLICO. Es el conector central: final del catabolismo e inicio del anabolismo. Tiene que existir la
manera de reponer los precursores del CAC, mediante las llamadas reacciones anapleróticas.

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BIOQUÍMICA METABÓLICA

Reacciones anapleróticas
Basta con reponer un solo componente para permitir la formación de los demás. El principal será la
reposición del oxalacetato.

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Regulación del CAC
Los enzimas reguladores suelen estar al principio de las
rutas metabólicas. Muchas subunidades de la piruvato
deshidrogenasa son reguladoras. Es sensible a la
concentración de los productos de la reacción: CO2, NADH
y acetil CoA. Será bloqueada si hay mucha cantidad de
NADH y acetil CoA, así como de ATP. Que haya poco NADH
quiere decir que hay mucho NAD+.

↑ NAD+  activa deshidrogenasa  ↑ [ATP] y ↑ [NADH]


 inhibición del CAC

Los procesos IRREVERSIBLES de la glicólisiis son aquellos


en los que participan las enzimas:

 Hexokinasa (HK)
 Fosfofructokinasa (PFK)
 Piruvato kinasa

El punto más
importante es el
regulado por PFK, porque es un enzima complejo con múltiples sitios
de unión sensibles a diferentes efectores fuera del centro activo. El
ATP es sustrato y modulador de la actividad: ↑ [ATP]  inhibe. Cuando
hay altas concentraciones de ATP se une en un centro alostérico,
inhibiendo la actividad de la enzima, inhibiendo la glicólisis. La pyr
kinasa es sensible al acetil CoA.

La glicólisis y el CAC son procesos encadenados y es por ello que


tienen que interregularse. Una sobreacumulación de acetil CoA causa
una sobreacumulación de citrato. El citrato en exceso escapa al citosol
y se une a un sitio alostérico de la PFK, inhibiéndola.

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BIOQUÍMICA METABÓLICA

Anabolismo de la glucosa (biosíntesis)

La fotosíntesis es exclusivo de plantas, bacterias, etc. Los animales tenemos la capacidad de sintetizar
glucosa gracias a la gluconeogénesis: síntesis de glucosa a través de intermediarios no glicídicos.

Para un humano adulto las necesidades diarias de glucosa serían de 160 g/día. Es el combustible
universal pero hay tejidos que solo pueden utilizar glucosa, como es el caso del cerebro (120 g/día). Los
músculos, en ausencia de glucosa utilizan ácidos grasos. En cualquier momento, los niveles de glucosa
es de unos 20 gramos circulantes.

¿Cómo se encarga el hígado de recuperar la glucosa?

Gracias al glucógeno (190 g). Cualquier alteración puede verse afectada en las necesidades de glucosa.
Nuestros músculos están produciendo niveles altos de lactato, así como de glóbulos rojos. El glicerol es

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un producto de la hidrólisis de las grasas. Los aminoácidos pueden convertirse en glucosa. Todo esto
sucede en el hígado (y riñón). Los aminoácidos pueden estar en exceso por la dieta o por el recambio de
proteínas. Glicólisis y gluconeogénesis comparten los enzimas de procesos reversibles.

Tenemos que invertir 6 ATPs por cada unidad de glucosa resintetizada. El paso de Pyr a PEP se hace en
dos pasos e implica el oxalacetato. EL piruvato se recupera gracias a la LDH. Diferentes esqueletos
aminoacídicos se introducen como piruvato u OAA. EL glicerol es precursor de DHAP (menos costoso). La
carboxilación del pyr a OAA es una reacción anaplerótica, así como la carboxilación del PEP a OAA. Ambas
reacciones sirven para la gluconeogénesis. Si la concentración de ATP es elevada, se dirigen a la
gluconeogénesis. Si hay necesidad energética, se comportan como anapleróticos  CAC:

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BIOQUÍMICA METABÓLICA

El OAA se encuentra en baja concentración y está implicado en muchas reacciones, por eso no debe salir
de la mitocondria. Para ello se recurre a un sistema lanzadera: procesos metabólicos que permiten a un
compuesto pasar membranas. De esta forma, no sale directamente. Este proceso puede ser inverso si se
necesita OAA en la mitocondria.

Regulación de la gluconeogénesis (y glicólisis)

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Un nivel alto de AMP (↓ ATP) activa la fosfofructokinasa. Esto es lógico ya que la glicólisis se usa para
obtener ATP. Y un elevado nivel de citrato inhibe la glicólisis.

En el caso de la gluconeogénesis una elevada concentración de ADP o ATP (↓ AMP) activará la


gluconeogénesis, aumentando la concentración de citrato.

Regulación hormonal:

 La insulina reduce niveles de glucosa en sangre, por tanto activa la glicólisis e inhibe la
gluconeogénesis. Otra forma de controlar los niveles de azúcar en sangre es activando la síntesis
de glucógeno.
 Antagónicamente, el glucagón aumenta los niveles de glucosa en sangre, así que inhibe la glicólisis
y aumenta la gluconeogénesis o moviliza el glucógeno.
 Hay hormonas como la adrenalina y el cortisol que tienen efectos similares a los del glucagón en
cuanto a la regulación de glucosa, pero son sintetizadas en situaciones de estrés, ejercicio súbito
y por ello necesitan de mucha glucosa circulante.

No debe haber insulina y glucagón en la misma célula, ya que la glicólisis y gluconeogénesis han de tener
lugar en diferentes órganos.

No es que sean procesos inversos: catalizan reacciones distintas


y lo único que obtenemos es una hidrólisis neta de ATP, que no
promueve ningún proceso, cuya energía se disipa en forma de
calor. Se utiliza para aumentar la temperatura de forma rápida.

Por tanto, ambos procesos han de estar muy regulados. Algunos seres vivos utilizan estos llamados ciclos
fútiles (inútiles) o ciclos de sustrato. También son utilizados en los músculos de las alas de los abejorros.
Los insectos necesitan alta temperatura para alzar el vuelo. Los abejorros en invierno pueden alzar el
vuelo activando glicólisis y gluconeogénesis, subiendo rápidamente la temperatura.

Los humanos, el hígado está continuamente regulando la homeostasis del azúcar, por tanto ha de cambiar
de glicólisis a gluconeogénesis en poco tiempo. Posee los enzimas específicos para los dos procesos de
forma activa. Existe un nivel basal de glicólisis cuando hay gluconeogénesis, y viceversa. Este nivel basal
hace que en el hígado se pierda ATP. No es extraño que el hígado tenga la temperatura más alta (entre
39-40ºC).

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BIOQUÍMICA METABÓLICA

Alternativas a la glicólisis

Ruta de las pentosas fosfato

Transcurre en paralelo a la glicólisis y en el mismo compartimento celular (citosol). Es oxidativa y produce


una descarboxilación de la Glc6P.

El NADP+ es un poco más reductor y con funciones distintas, empleado en procesos biosintéticos de tipo
reductivos así como en procesos de detoxificación. Los animales recurrimos a esta ruta para obtener
NADPH. Este azúcar de 5 carbonos se isomeriza en
ribosa-5P, única fuente de ribosa de los nucleótidos,

Reservados todos los derechos. No se permite la explotación económica ni la transformación de esta obra. Queda permitida la impresión en su totalidad.
así como ATP, FAD+… En estado normal, hay mucha
más necesidad de NADPH. La ribulosa-5P depende del
estado catabólico de la célula como en la mitosis.
Existe un mecanismo para reciclar la ribulosa 5P y
sintetizar productos de la glicólisis. Tradicionalmente
se divide en dos fases:

1. Fase oxidativa
2. Fase no oxidativa, llamado “sugar shuffle”

Participan azúcares de 3 a 7 carbonos. Existe un


paralelismo entre el ciclo de Calvin y esta fase,
teniendo un origen común. Comparten gran número de
metabolitos. Las enzimas que transfieren grupos ceto
se denominan transcetolasas.

En el caso que haya una necesidad de pentosas y no


haya NADPH, se puede sintetizar ribulosa-5P con
fructosa-6P y con gliceraldehído de la glicólisis.

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BIOQUÍMICA METABÓLICA

Ciclo del glioxilato

Consiste en la síntesis de glucosa a partir de grasas en plantas, hongos, protozoos… pero no animales.
Cuando un organismo moviliza sus grasas se producen dos componentes: glicerol y ácidos grasos. El
glicerol mediante gluconeogénesis puede dar algo de glucosa y los ácidos grasos sufrirán la β-oxidación,
que dará lugar a acetil CoA que irá al CAC.

Reservados todos los derechos. No se permite la explotación económica ni la transformación de esta obra. Queda permitida la impresión en su totalidad.
No es posible la recarboxilación del pyr. Si hubiera vuelta tras podríamos obtener glucosa, pero no puede
revertirse a acetil CoA.

Las semillas oleaginosas pueden reconvertir su acetil CoA. Tienen unos orgánulos especiales
denominados glioxisomas. El glioxisoma tiene una especie de CAC que no sufre descarboxilaciones.

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BIOQUÍMICA METABÓLICA

6. CADENA DE TRANSPORTE DE ELECTRONES (CTE) Y


FOSFORILACIÓN OXIDATIVA
Para que continúe la glicólisis y el ciclo del ácido cítrico ha de recuperarse los niveles de NAD +. SI el NADH
se oxida utilizando oxígeno:

Da lugar a una variación de energía muy elevada, dando ventaja a los seres vivos aerobios. Dicha variación
no puede darse de un solo paso, pues se desperdiciaría y no se sintetizaría todo el ATP. Los electrones
serán transferidos a un complejo de componentes redox, con pequeñas variaciones de potenciales de
reducción. Esto es gracias a un sistema de membranas estancas, con diferente polarización. La cadena

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de transporte electrónico consta de:

 4 complejos de membrana  1 conexión física con el CAC


 3 bombas de H+  2 conectores

Origen:

 Antigüedad de la Tierra ~4600 millones de años  No O2


 Primeras formas de vida ~4000 millones de años  primeros fósiles bacterianos
 Biomasa/generación de nutrientes ~3500 millones de años  reducción nutrientes, primeros organismos
fotosintéticos
 3000 millones de años  fotosíntesis cloroplástica  producción de O2  radiación ultravioleta, aparición
capa de ozono
 2000 millones de años  primeras bacterias aeróbicas
 1000 millones de años  endosimbiosis (primeros eucariotas)
 500 millones de años  primeros eucariotas multicelulares

Mitocondrias

Las mitocondrias son semi-autónomas (con DNA


propio bacteriano). Debido a la endosimbiosis
han intercambiado DNA. Poseen una doble
membrana. La composición lipídica de la
membrana externa es similar a la de eucariotas
(membrana plasmática). En cambio, la interna
es similar a membranas bacterianas.

En la membrana interna se darán lugar los


diferentes procesos. El 70% de proteínas está
integrado por el complejo CTE, H+-ATP sintasa,
Debido al hecho que la membrana externa es
muy permeable a la mayor parte de metabolitos,
al espacio intermembrana se le denomina lado
citosólico. Como consecuencia de los procesos redox se produce un bombeo de protones hacia el espacio
intermembrana, produciéndose una polarización. A la matriz mitocondrial se le llama espacio “N” y al lado
citosólico espacio “P”.

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BIOQUÍMICA METABÓLICA

Descripción CTE

Los electrones que empiezan del NADH y acaban el O2 pasan por una serie
de complejos redox, dando una variación de energía muy importante. Los
diferentes complejos han sido ordenados aunque realmente están
inmersos en la membrana lipídica y flotan libremente.

Reservados todos los derechos. No se permite la explotación económica ni la transformación de esta obra. Queda permitida la impresión en su totalidad.
El aceptor de electrones de I y II es una molécula de tipo quinona. Es una molécula apolar oxidada, llamada
como coenzima Q o ubiquinona. Es un polifenol oxidado. Si tiene 10 unidades de isopreno se denomina
como CoQ10. Puede ser un oxidante.

La forma oxidada aceptaría electrones, pero en su forma reducida acepta 2 electrones y dos protones,
llamada CoQH2, Q(H2) o ubiquinol. Si solo recibe un electrón puede producirse una semiquinona radical
libre, muy peligroso.

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BIOQUÍMICA METABÓLICA

NADH  COMPLEJO I: NADH-Q-OXIDORREDUCTASA

El complejo I tiene una masa de medio millón de


Daltons, formado por unas 30 proteínas.

La parte que está de forma integral es una bomba de


protones. Dentro del complejo I existe una pequeña
cadena de transporte de electrones.

El primer aceptor es un FMN, que los cede


inmediatamente a unos intermediarios redox que son
los centros de
Fe-S. El hierro está unido a cuatro azufres de grupos cisteína. El
hierro se comporta igual que en un grupo hemo.

Reservados todos los derechos. No se permite la explotación económica ni la transformación de esta obra. Queda permitida la impresión en su totalidad.
Estos pequeños saltos de electrones vienen asociados a una
variación de energía libre que causa el bombeo de protones
(cuatro protones). La reacción completa será:
+ +
𝑁𝐴𝐷𝐻 (+𝐻 + ) + 𝑄 + 4 𝐻𝑚𝑎𝑡𝑟𝑖𝑧 → 𝑁𝐴𝐷 + + 𝑄𝐻2 + 4 𝐻𝑐𝑖𝑡𝑜𝑠𝑜𝑙

QH2  COMPLEJO III: Q-CYT-OXIDORREDUCTASA

Es un dímero con 11 proteínas en cada subunidad. Contiene hierro y centros Fe-S. La transferencia de
2+ 3+
electrones presenta un problema: transporta dos electrones el coenzima Q (𝐹𝑒𝑟𝑒𝑑 𝐹𝑒𝑜𝑥𝑖𝑑 ) y el citocromo
C solo transfiere un electrón. Serán por tanto dos proteínas distintas las que reciben los electrones.

Se forman radicales libres que son muy inestables. Un electrón lo cede al Cyt-c y el otro se quedará en el
complejo III, en una subunidad del coenzima Q oxidado que, cuando se reduce, forma un Q radical libre,
pero que está seguro dentro del complejo III no reaccionando con nada.

En una segunda fase, otro electrón lo lleva a otro Cyt-c y el segundo electrón pasa al coenzima Q del
complejo III, formándose un coenzima QH2.

Globalmente: 𝑄 + 2 𝑄𝐻2 → 2 𝑄 + 𝑄𝐻2 (saliendo 2 Cyt c); quedando: 𝑄𝐻2 → 𝑄 + 2 𝐶𝑦𝑡 𝑐

Los electrones de QH2 finalmente han pasado a 2 unidades del citocromo c. Los protones del coenzima Q
reducido, al oxidarse, salen.
+ +
𝑄𝐻2 + 2 𝐶𝑦𝑡 𝑐𝑜𝑥 + 2 𝐻𝑚𝑎𝑡𝑟𝑖𝑧 → 𝑄 + 2 𝐶𝑦𝑡 𝑐𝑟𝑒𝑑 + 4 𝐻𝑐𝑖𝑡𝑜𝑠𝑜𝑙

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BIOQUÍMICA METABÓLICA

COMPLEJO IV  CYTC-OXIDASA

Está formado por 13 subunidades con una cadena de transporte de electrones de Cu y Fe (hemo).

Reservados todos los derechos. No se permite la explotación económica ni la transformación de esta obra. Queda permitida la impresión en su totalidad.
Solo es posible a través del complejo IV tomar cuatro unidades de electrones. El hierro hemo a3 y cuB están
muy juntos. Es por ello que el oxígeno forma entre ambos un puente peróxido, ganando estabilidad.

La primera entrada del electrón hace que se forme grupos OH (estructura transitoria) y después entran
otros dos protones formándose dos moléculas de agua. El propio complejo IV es una bomba de protones
(4 protones). Además, 4 H+ químicos desaparecen de la matriz (al H2O). Entonces bombea 4 H+ y pierde 8
H+. Globalmente:
+ +
4 𝐶𝑦𝑡 𝑐𝑟𝑒𝑑 + 𝑂2 + 8 𝐻𝑚𝑎𝑡𝑟𝑖𝑧 → 4 𝐶𝑦𝑡 𝑐𝑜𝑥 + 2 𝐻2 𝑂 + 4 𝐻𝑐𝑖𝑡𝑜𝑠𝑜𝑙
Los electrones del NADH (2) hacen que se bombeen 4 H+ en el complejo I y III. Por tanto, si consideramos
2 electrones en vez de 4 electrones, se bombearán 2H+ en el complejo IV. Por la misma razón, se escribe
½ de O2 + H+ en vez de 02 + 4H+. EL rendimiento total de protones, por tanto, será 10.

El empleo de oxígeno ha supuesto un gran cambio en la evolución, pero también hay que tener mucho
cuidado con él, por eso, el complejo IV va reduciéndolo poco a poco. Como consecuencia inevitable del
uso de oxígeno se van a formar una cantidad de
compuestos tóxicos ROS (reactive oxygen species).

 Radical libre hidroxilo: mutagénico en el DNA


 Peróxido de hidrógeno: oxidante muy enérgico,
lesiones celulares en los ácidos grasos de membrana
 Radical superóxido: más oxidante que el propio
oxígeno.

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BIOQUÍMICA METABÓLICA

Se calcula que en cualquier ser aerobio el 2% del oxígeno consumido da lugar a ROS. La neutralización de
ROS es gracias a enzimas como catalasas, peroxidasas y superóxido dismutasas (en gran cantidad). Su
eficiencia es muy grande, próxima al límite teórico. Las catalasas actúan ante el agua oxigenada
produciendo burbujas. Una sola molécula de catalasa puede destruir 40 millones de H 2O2 por segundo.
Además, producimos una gran cantidad de antioxidante como la vitamina C, vitamina E, glutatión, ácido
cítrico, coenzima QH2 (también neutraliza radicales libres de la CTE).

COMPLEJO II

Con actividad enzimática en el lado de la matriz mitocondrial, se


encarga de la oxidación del succinato a fumarato. La succinato
deshidrogenasa está unida a la membrana mitocondrial.

Los electrones del succinato los toma el FADH2, que los transferirá a

Reservados todos los derechos. No se permite la explotación económica ni la transformación de esta obra. Queda permitida la impresión en su totalidad.
Q a través de una pequeña cadena de transporte de electrones Fe-S.
En este complejo no se bombean protones. Por tanto:

 NADH  10 H+
 FADH2  6 H+

La CTE ha transformado una fuerza electromotriz en fuerza protonmotriz. Un potencial redox se convierte
en potencial osmótico, que será encargado de refosforilar el ATP.

En 1961, P. MITCHELL propuso un modelo. En el espacio intermembrana ΔpH= -1.4 unidades, es decir,
hay 25 veces más protones en el lado P. Existe un potencial de membrana negativo en la matriz
mitocondrial de -0.14 V. Además, la membrana interna debe estar intacta (sin poros). Si la membrana está
rota no habrá separación de pH, aunque la CTE sería funcional-

Propuso entonces la hipótesis quimiosmótica: la separación de pH puede acumular la energía de los


procesos redox en un potencial osmótico. La síntesis de ATP no la predijo. Se hipotetizaba que los protones
pasaban a través de la ATP sintasa y la entrada de protones a favor de gradiente, que es la que conduce
a la fosforilación de ATP.

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BIOQUÍMICA METABÓLICA

H+-ATP-SINTASA

Se pudo comprobar que el lado interno de la membrana interna estaba compuesto de pequeñas esferas
con actividad ATPasa. Según los estudios iban ganando resolución, se permitió conocer mejor su
estructura.

Tradicionalmente se describieron 2 partículas: una F0 y F1, la última con actividad ATPasa. Más tarde se
comprobó que F1 está formada por 6 subunidades: 3 unidades α y 3 unidades β. En el centro hay una
proteína alargada llamada γ. F0 es una estructura en forma de barril entre 10-14 unidades alargadas,
comúnmente llamadas proteínas c, que en conjunto forman el anillo c. Además, existe un estabilizador al
lado del anillo y un brazo que se adhiere a F1. Se distingue una parte estática: α, β y estabilizador y una
móvil, con capacidad de rotación: γ, ε y anillo c, accionada por la presión de los protones.

Reservados todos los derechos. No se permite la explotación económica ni la transformación de esta obra. Queda permitida la impresión en su totalidad.
Unos investigadores japoneses en 1997
aislaron F1 con la partícula γ, a la que
añadieron fluoresceína y observaron que al
añadir ATP, lo hidrolizaba (gracias a la ATPasa)
y además, daba vueltas como un rotor. Cada
una de las unidades ATPasa cambia de
conformación. Cada F1 tiene 3 ATPasas (β) de
manera coordinada:

1. Recibe ATP
2. El ADP y Pi esá dentro del enzima
3. Se expulsan los productos de la hidrólisis: ADP + Pi

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BIOQUÍMICA METABÓLICA

El ATP no entra de forma simultánea en las 3. Las 3 subunidades pasan por 3 estados diferentes con
conformaciones diferentes. Este cambio de forma hace que el hueco interior (donde está γ) cambie de
forma dando vueltas. La cola de actinas que marcaron fluorescentemente giraba en 3 posiciones bien
definidas.

Reservados todos los derechos. No se permite la explotación económica ni la transformación de esta obra. Queda permitida la impresión en su totalidad.
Si forzamos a que los cambios conformaciones sean al revés (γ gira del revés) obligaremos a que se libere
ATP capturando ADP + Pi, juntándolo y liberándolo, necesitando para ello la energía mecánica. El anillo
será quien fuerce a γ, haciendo que la ATPasa trabaje como ATP sintasa.

En la CTE, el potencial redox se traduce en potencial quimiosmótico y en síntesis de ATP.

La transferencia de protones se puede utilizar, por ejemplo, en flagelos bacterianos. Bacterias aerobias
expulsan H+ al exterior para que posteriormente entren por la H+-ATP-sintasa. Tiene que entrar 1000 H+
por cada rotación del flagelo. Además, puede girar en cualquier dirección.

Una vuelta completa de la ATP sintasa supondría la entrada de 12 H +. Cada vuelta completa sintetiza 3
unidades de ATP. Cada unidad de ATP necesita 4 H+.

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BIOQUÍMICA METABÓLICA

NADH citosólico

Las existencias de NADH citosólico y mitocondrial no deben mezclarse. La relación citosólica NADH/NAD +
regulará la glicólisis. En la mitocondria regulará la respiración, ya que se quiere que entren los dos
electrones y mantener esta relación. Es por ello que se utilizan sistemas lanzadera:

LANZADERA GLICEROL-3P

Reservados todos los derechos. No se permite la explotación económica ni la transformación de esta obra. Queda permitida la impresión en su totalidad.
Existe una actividad de la glicerol-3P-DH en el
citosol. La DHAP se reduce a glicerol3P, llevando
los electrones del NADH.

En la membrana mitocondrial existe otro flicerol-


3P-DH en el lado citosólico que toma los electrones
del glicerol3P y se los cede al FADH2, que cederá a
su vez estos electrones a CoQ, complejo III…

De esta manera las existencias de NAD+ no se


modifican. Hay una pérdida de rendimiento (1 ATP
menos) pero permite que no se mezcle el NAD+
citosólico con el mitocondrial. Este sistema
predomina en músculo y cerebro, con alta
demanda energética. Es muy sensible a pequeñas
concentraciones de NADH, además es irreversible,
no permitiendo que escapen electrones de la
mitocondria al citosol.

LANZADERA MALATO/ASPARTATO

En riñones, hígado, tejido cardiaco. No se dedica exclusivamente a intercambiar electrones, sino que
también intercambia aspartato, malato, α-cetoglutarato y otros. Permite además la entrada de NADH.

Es menos eficiente que el glicerol-3P porque el intercambio de metabolitos supone la pérdida de NADH.

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BIOQUÍMICA METABÓLICA

Transportadores de la membrana interna mitocondrial

La CTE al oxidar NADH y FADH2 produce un bombeo de protones al espacio intermembrana que se emplea
para la configuración de ATP. Hay más funciones como la mecánica (flagelos). Además, ha de existir la
forma para que entre ADP3- y salga ATP4-. Este antiporte es espontáneo (van en sentidos contrarios) ya
que se aprovecha el transporte de protones.

También existe un antiporte de entrada de fosfato, intercambiando iones hidroxilo por fosfato. No genera
cambio de potencial eléctrico de la membrana, pero los OH- tienen mucha tendencia a salir. Otro simporte
que sí aprovecha la entrada de protones es el fosfato. Otro ejemplo es la entrada de piruvato, que utiliza
la salida de OH-.

Reservados todos los derechos. No se permite la explotación económica ni la transformación de esta obra. Queda permitida la impresión en su totalidad.
Inhibidores de la CTE

Existen antibióticos dirigidos a interferir en la respiración aerobia. Son sustancias producidas


naturalmente. El uso de estas sustancias ha permitido desentrañar la ordenación de la CTE:

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BIOQUÍMICA METABÓLICA

 Rotenona/amital: bloquea el complejo I produciendo acumulación de NADH (↓NAD+), ↓ bombeo de


H+ y se pierde el gradiente electroquímico, frenando el CAC. Si a las mitocondrias (aisladas) les
añadiéramos succinato se rescataría el sistema.
 Antimicina A: bloquea el complejo III. EL complejo I seguirá oxidando pero los electrones del CoQ
van a hacer que se saturen, porque no trabaja el complejo III. ↑NADH impidiendo el bombeo de H+
y no se produce el CAC. Si añadiésemos Cytc oxidado podríamos reestablecer el flujo (imposible
experimentalmente).
 CO, CN- (cianuro), N3- (azida): no son antibióticos, son pequeñas moléculas reactivas que se unen
al grupo hemo de forma reversible (en la hemoglobina y los citocromos). El CN- lo utilizan las
plantas para evitar ser comidas. Bloquea el complejo IV.
 Oligomicina: impide que los protones pasen a través de la H+ ATP sintasa. Se acumularán protones
en el espacio intermembrana impidiendo que se bombeen más protones, dejando de trabajar los
complejos. Un aumento de NADH detiene el ciclo de Krebs.

Reservados todos los derechos. No se permite la explotación económica ni la transformación de esta obra. Queda permitida la impresión en su totalidad.
 Atractilósido: glucósido de plantas. Inhibe la salida de ATP.
 Ácido bongkrékiko: en bacterias inhibe la entrada de ADP. ↓ATP  ↑ciclo de Krebs ↑NADH ↑H+ (no
dejando entrar a los protones).
 Ionóforos: no afectan a la CTE, CAC, ATP H+ sintasa… lo que hacen es generar canales que permiten
el paso de iones, alterando el potencial de membrana. Por ejemplo, la valinomicina (péptido
circular con un hueco para el potasio) disipa la distribución de cargas, deteniendo la síntesis de
ATP y aumentando la respiración.

Desacoplamientos CTE/fosforilación ATP

Para que se sintetice ATP la membrana ha de estar


intacta para una buena polarización. Si lesionamos la
membrana, los protones van a entrar masivamente.
No se sintetizará ATP pero la CTE sigue intentando
bombearlos, oxidando continuamente y
disminuyendo en NADH, acelerando el CAC. Existen
canales que permiten el paso controlado de protones como la UCP-1 (proteína de desacoplamiento I)
regulable. Si permitimos la entrada de H+, no habrá síntesis de ATP, la energía potencial se disipa,
incrementando la temperatura del sistema. Este mecanismo se utiliza para la regulación de la
temperatura, característico de los animales que hibernan, pues movilizan sus grasas dando lugar a ácidos
grasos (lipólisis), los cuales se oxidarán por β-oxidación formándose acetil CoA, destinado al CAC. El CAC
dará lugar a poder reductor, el cual generará el gradiente de protones en la CTE.

Este sistema se encuentra en el tejido adiposo de color pardo. Este color es debido a la gran cantidad de
mitocondrias y al hierro de los grupos hemo de los citocromos. Los bebés humanos y de muchas especies
no pueden regular su temperatura correctamente. Para solucionar esto, poseen también tejido adiposo
pardo, aumentando su temperatura en lugar de obtener ATP.

Este mecanismo se llama termogénesis. EL 2,4 DNP puede tomar protones y


transportarlos a la matriz mitocondrial (es un desacoplante químico de la matriz
mitocondrial). Las mitocondrias desacopladas aceleran la respiración al máximo.
Se consumirá mucho NADH, lo cual acelerará también el CAC. El funcionamiento de
los canales UCP-1 puede controlar esta aceleración, mientras que el uso de
componentes químicos como el 2,4 DNP acelera la termogénesis, aumentando la temperatura corporal
desmesuradamente, pudiendo llegar a provocar un colapso en el organismo que lo toma.

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BIOQUÍMICA METABÓLICA

7. METABOLISMO DE LÍPIDOS
Las grasas son las moléculas elegidas para el almacenamiento de energía a largo plazo. Contienen 9
kcal/g, un contenido energético más elevado que el de los glúcidos o proteínas (4 kcal/g). Además, las
grasas son hidrofóbicas, por lo que no tienen agua, al contrario del glucógeno (2 g H 2O/g). Las grasas, al
ser anhidras y más calóricas, almacenan 6 veces más energía que el glucógeno hidratado. Razones por
las que las grasas son más energéticas:

 Están fuertemente reducidas, dando


mayor liberación de energía por oxidación
 Son apolares
 Son más ligeras que el agua, siendo
almacenes eficientes de energía

Reservados todos los derechos. No se permite la explotación económica ni la transformación de esta obra. Queda permitida la impresión en su totalidad.
El contenido calórico de un humano (adulto 70 kg
sin sobrepeso) es de 40 kcal de glucosa, 600 kcal
de glucógeno, 25000 kcal de proteína y 100 kcal
de grasa. Todos nuestros tejidos, excepto el
cerebro, pueden consumir, en ausencia de
glucosa, ácidos grasos. Solo se usarán cuando no
haya glúcidos presentes.

Las fuentes de grasas serán de la dieta, de


adipocitos (almacenamiento) o por biosíntesis de
novo en el hígado.

Grasas en la dieta

Las grasas que provienen de la dieta se van a emulsionar con sales biliares (esteroles) producidas por el
hígado a partir de colesterol. Son moléculas alargadas con una parte polar y otra apolar. Las grasas van a
emulsionarse con estas sales formando micelas. Las sales biliares engloban las grasas por la parte apolar,
mientras que la parte polar se queda en el exterior. De este modo las grasas pueden ser transportadas.
Cuando pasen por el intestino, la lipasa pancreática las divide en glicerol y ácidos grasos. De esta manera,
estas pueden ser incorporadas por los enterocitos del intestino delgado.

Una vez absorbidas se vuelven a ensamblar y se empaquetan en unas vesículas, junto con otros
nutrientes, que se llaman quilomicrones. Los otros nutrientes pueden ser colesterol, vitaminas u otros.
Los quilomicrones contienen proteínas (apolipoproteínas) que les indican dónde deben ir. En conclusión,

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BIOQUÍMICA METABÓLICA

los quilomicrones son vesículas complejas que transportan las grases a través de la sangre. Los tejidos
diana de las grasas serán las de los músculos, corazón y tejido adiposo. Para entrar en estos tejidos, las
grasas tendrán que volver a desensamblarse.

Reservados todos los derechos. No se permite la explotación económica ni la transformación de esta obra. Queda permitida la impresión en su totalidad.
Las grasas se usan como combustible solamente cuando no hay glucosa- Cuando esto sucede, hay una
situación de estrés, produciéndose glucagón, cortisol y adrenalina. Estas señales van a estimular el tejido
adiposo haciendo que se movilicen las grasas.

Catabolismo de los ácidos grasos

1. LIPÓLISIS Y MOVILIZACIÓN

Los triglicéridos se separan en glicerol y ácidos grasos y ambos


pasan a la sangre. El glicerol va al hígado y se convierte en un
intermediario de la glicólisis y gluconeogénesis (DHAP). Por otra
parte, los ácidos grasos viajan por la sangre asociados a las
albúminas séricas, ya que estas son muy apolares (hidrofóbicas)
hasta las células diana.

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BIOQUÍMICA METABÓLICA

2. ACTIVACIÓN Y TRANSPORTE A MITOCONDRIA

Los ácidos grasos son fácilmente incorporados al citosol. El ácido carboxílico es reactivo pero el resto de
la molécula es inerte, por tanto al grupo acilo se le añade CoA para que sea ricoenergético (elevado
potencial de transferencia de acilos). La activación sucede gracias a la acil-CoA-sintetasa.

Reservados todos los derechos. No se permite la explotación económica ni la transformación de esta obra. Queda permitida la impresión en su totalidad.
Es muy endergónico y por ello necesita ATP. El ATP provoca la liberación de AMP y PPi que se hidroliza en
2 Pi. Se necesita el equivalente de 2 ATP para condensar la molécula. Esto hace que el equilibrio quede
desplazado hacia la formación del compuesto.

El CoA no puede ser transportado libremente por membranas ya que las existencias del CoA citosólico y
mitocondrial son reducidas y participa en muchas reacciones. El CoA mitocondrial es usado en
catabolismo y el citosólico en anabolismo (biosíntesis). Es por ello que se usa una lanzadera que permitirá,
sin mezclar los CoA, el traspaso del acilo. Participa un
intermediario denominado carnitina.

Es un γ-aminoácido sintetizado por el hígado a partir de lisina,


metionina y vitamina C. Va a intercambiar de forma
transitoria el acilo del citosol a la mitocondria. Se encuentra
en tejidos animales.

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BIOQUÍMICA METABÓLICA

El transportador permite el intercambio de carnitina y de acil-carnitina. En el espacio intermembrana


tendremos CoA-SH y acil carnitina gracias al intercambio entre Acil CoA y carnitina. En el lado mitocondrial
tendremos lo contrario. De esta manera gracias a un transportador de carnitina el acil-CoA ha pasado del
citosol a la mitocondria. La carnitina es vendida como “Fat Burner”, lo que pasa que de por sí solo
transporta y no se gasta, necesitando de ácidos grasos para su movilización (y actividad física).
Determinadas patologías se asocian a un descenso de los niveles de carnitina. En este último caso podría
usarse como fármaco.

3. β-OXIDACIÓN

Se fragmentará el acil CoA en unidades de 2 carbonos (acetil CoA).

Atacará al enlace entre el carbono α y β. Atacar un enlace con dos carbonos inactivados es muy difícil, por
ello lo primero que hay que hacer es insaturarlo:

Reservados todos los derechos. No se permite la explotación económica ni la transformación de esta obra. Queda permitida la impresión en su totalidad.
1. Insaturación en β mediante un acil CoA DH 2. Hidratación del doble enlace

3 Oxidación del C-OH  C≡0 mediante NAD+ 4. Tiólisis (ruptura grupo tiol CoA-SH)

En 1 solo ciclo de β-oxidación obtenemos:

 1 FADH2  CTE  Q  III


 1 NADH  CTE  I
 1 ACETIL CoA  CAC  3 NADH y 1 FADH2
 1 ACIL COA (n-2)

El FADH2 será entregado finalmente a una proteína de


membrana que lo cede a Q gracias a una deshidrogenasa.

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BIOQUÍMICA METABÓLICA

¿Qué sucede si los ácidos grasos tienen un número impar de carbonos?

Se añade un carboxilo extra y mediante un aporte de energía obtendremos succinil CoA. En eucariotas es
mitocondrial. También existen mecanismos oxidativos en el citosol que empiezan por el carbono ω.

En el caso de tener un doble enlace en γ, la actividad se detiene pero hay enzimas que lo isomerizan
poniéndolo en β. Es decir, si el enlace se encuentra en posición inapropiada, se isomeriza.

Si hay dos dobles enlaces cerca, se reduce con NADPH el más alejado y el otro se isomeriza.

Reservados todos los derechos. No se permite la explotación económica ni la transformación de esta obra. Queda permitida la impresión en su totalidad.
La β-oxidación dará lugar a una gran cantidad de acetil CoA y poder reductor utilizados en el CAC y la CTE.
Los ácidos grasos son moléculas fuertemente reducidas. Si la β-oxidación es demasiado intensa, dará
lugar a cuerpos cetónicos.

 En situaciones donde hay un bajo nivel de glucosa.


A lo largo del día se producen fluctuaciones de niveles
de glucosa a los que estamos adaptados. Cuando no
hay glucosa, se movilizan las grasas.
 En el caso de dietas extremas o desequilibradas (sin
glúcidos)
 En caso de ejercicio extremo: al cabo de media hora
todas las reservas de glucógeno han desaparecido del
músculo e hígado, movilizando posteriormente las
grasas.
 Embarazo
 Situaciones patológicas. En el caso de la diabetes
hay glucosa en sangre pero las células no son capaces
de sintetizarlas.

La señalización hormonal dispara la movilización de


las grasas. La mayor parte de los tejidos utilizan ácidos
grasos como combustible, excepto el cerebro,
utilizando la gluconeogénesis. El hígado tendrá que
usar el glicerol. Si la situación es extrema usará las
proteínas o el ácido láctico de los músculos.

¿Qué implica que el hígado participe en la


gluconeogénesis?

En situación normal los ácidos grasos dan acetil CoA


que van al CAC. El hígado tendrá que reconvertir
esqueletos carbonados para sintetizar oxalacetato,
deteniendo su CAC mediante gluconeogénesis, no
aceptando grupos acetilo. El hígado moviliza el acetil
CoA, reconvirtiéndola en moléculas de tipo cetónico.

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BIOQUÍMICA METABÓLICA

Esos cuerpos cetónicos los produce el hígado y los tira al torrente sanguíneo. Allí se rompe de manera
espontánea el acetoacetato en acetona y CO2. Esta acetona es eliminada por la respiración pulmonar o
por la orina. El acetoacetato y β-hidroxibutirato, en situaciones de ayuno extremo el cerebro puede
emplearlos como combustible. Cuando hay poca cantidad de glucosa tenemos una mayor cantidad de
ácidos grasos en sangre y a su vez una concentración mayor de cuerpos cetónicos. Los cuerpos cetónicos
tienen carácter ácido, bajando el pH de la sangre. La presencia de estos en sangre se denomina cetosis.
Cuando entre algo de azúcar en el sistema volverá el hígado a sus niveles basales, corrigiendo el pH.

Reservados todos los derechos. No se permite la explotación económica ni la transformación de esta obra. Queda permitida la impresión en su totalidad.
La cetosis viene acompañada de una bajada de tensión, sudores, nervios, debilidad (síntomas comunes
de pasar hambre). Cuando uno quiere hacer ayuno o “dietas milagro” la sensación de hambre y bajadas
de tensión se normalizan. La dieta Dukan quita todos los azúcares de la dieta, tomando grasa y proteínas,
disparando la producción de cuerpos cetónicos y movilización de las grasas. Esta acetona al expelerse por
la respiración provoca una halitosis muy acusada. La cetosis es un mecanismo de adaptación, buscado
por este tipo de “dietas milagro”. Produce un estrés al hígado y al riñón importante.

Biosíntesis de TAG/ácidos grasos

La degradación de ácidos grasos a sucede en mitocondria por β-oxidación dando acetil CoA y acil CoA. En
eucariotas la síntesis de ácidos grasos se realiza en el citosol por la ácido graso sintasa (complejo sistema
enzimático). El real precursor de la biosíntesis de ácidos grasos es:

El ensamblaje de unidades de CoA va a realizarse mediante un proceso recurrente de 4 casos:

 Condensación (malonil CoA, pierde CO2)


 Reducción (NADPH)  2 electrones
 Deshidratación
 Reducción (NADPH)  2 electrones

Recuerda a un proceso inverso a la β-oxidación, pero no lo es. Se invertirán 4 electrones en cada


ensamblaje de 2 carbonos. El NADPH tiene un fosfato en el segundo carbono, empleado en biosíntesis,
ligeramente más reductor.

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BIOQUÍMICA METABÓLICA

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Ácido graso sintasa

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BIOQUÍMICA METABÓLICA

Hay 2 loci distintos con grupo sufhidrilo. El coenzima A se une al acilo mediante un enlace tioéster. En el
dominio KS se adicionan las unidades de acetil CoA para que se elongue la cadena. El dominio ACP es
donde entra las unidades del precursor (malonil CoA). Para empezar el proceso, el sitio KS necesita estar
cebado con una unidad de acetilo y el ACP aceptará el malonilo.

El grupo acetilo se inserta en la cabeza, en el inicio del sitio KS. Entraría otro malonilo (reducción NADPH,
pérdida de CO2) uniéndose a la cabeza. Este proceso solo
se repite 7 veces. A la séptima, el ácido graso se libera del
enzima. Tendremos C16:Ø o también llamado palmítico.
Hay más ácidos grasos que mediante maquinaria
enzimática se producirán utilizando como precursor el
palmítico.

Nuestra maquinaria enzimática no nos permite desaturar


más allá del carbono 9. En cambio, nuestras membranas

Reservados todos los derechos. No se permite la explotación económica ni la transformación de esta obra. Queda permitida la impresión en su totalidad.
están formadas por ácidos grasos poliinsaturados, sacados
de la dieta.

A partir del oleico las plantas pueden introducir


Insaturaciones: linoleico y linolénico. Ambos forman parte
de muchas membranas y de su fluidez, denominándolos
como ácidos grasos esenciales.

Son precursores de unos intermediarios señalizadores:


prostaglandinas, troboxanos y leucotrienos.

Los salmones son ricos en ácidos grasos debido al


fitoplancton para evitar así ser rígidos.

Síntesis de ácidos grasos (hígado, tejido adiposo)

La molécula de glicerol es glicerol 3P. Los ácidos grasos normalmente están activados en forma de acil
CoA, que tienen una gran tendencia a transferir el grupo acilo.

Los ácidos grasos sintetizados en el citosol darán en última instancia grasas, que serán almacenadas. La
síntesis está regulada hormonalmente. Nuestro metabolismo reconvierte cualquier exceso de acetil CoA.
El exceso de acetil CoA de la dieta ingresará en el ciclo de Krebs, que escapará en forma de citrato que
saldrá al citosol. El citrato, además de formar parte de la glicólisis, se desdobla en acetil CoA y OAA. El
oxalacetato tiene diversas funciones y el acetil CoA se empleará en la síntesis de ácidos grasos.

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BIOQUÍMICA METABÓLICA

Reservados todos los derechos. No se permite la explotación económica ni la transformación de esta obra. Queda permitida la impresión en su totalidad.
El carbono que forma parte de los ácidos grasos no es biosintético y no se reconvierte en otra molécula.
Se utilizará como biocombustible, de ahí la dificultad de la movilización de las grasas. Da la impresión que
la grasa de los adipocitos es constante, pero hay una continua lipólisis y reesterificación. Son células con
un metabolismo activo.

Ciclo TAG/ácidos grasos

Las gotas de grasa van acompañadas de enzimas. El 75% de las grasas del tejido adiposo están en
continua renovación. Parte de lo que sucede en la lipólisis se exporta a la sangre. Si los niveles de azúcar
son bajos, los ácidos grasos podrán ser reutilizados. Si hay glucosa, los ácidos grasos continúan circulando
hasta el hígado y los reensambla. Después vuelven de nuevo en forma de vesículas y serán captados por
los adipocitos. Antes de entrar serán hidrolizados y reensamblados. Si los niveles de glucosa caen, podrá
haber un uso inmediato de los ácidos grasos. Esto permite un nivel basal de ácidos grasos tal para
sobrevivir.

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BIOQUÍMICA METABÓLICA

Regulación integrada del metabolismo de combustibles

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BIOQUÍMICA METABÓLICA

8. METABOLISMO DEL NITRÓGENO I. AMINOÁCIDOS


El nitrógeno solo se encuentra disponible en los seres vivos. Las rocas no contienen N. La gran mayoría
de N se encuentra en forma de gas. Tiene una reactividad muy variada y con muchos estados de oxidación:

NO3- +5 Nitrato (más oxidado)


N N2 0
NH4+ -3 En biomoléculas (más reducido)
Los seres vivos trabajamos con amonio (NH4+). Cualquier especie del nitrógeno ha de ser reducido a
amonio. El problema es fijar el nitrógeno atmosférico N≡N (225 kcal/mol) ya que es muy poco reactivo.
Utilizar N2 gaseoso es muy difícil debido a la alta energía. Una vez se hace reactivo, la versatilidad es muy
extrema. La biosfera tiene que estar incorporando permanentemente nitrógeno. La forma de entrar es
mediante la fijación, por bacterias (cianobacterias) mediante la nitrogenasa. El nitrógeno procede de

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procariotas o de abonos (fijado industrialmente). Se fija N2 en NH4+. Después viene la asimilación, que
lo convertirá en biomoléculas.

La nitrogenasa es una enzima grande y compleja que se halla en procariotas y se encarga de reducir el
nitrógeno en amonio. Las bacterias fijadoras fijarán el nitrógeno si hay en el suelo. Es un proceso inhibido
por el O2. La fijación es muy anterior a la aparición de O2 en la atmósfera (proceso anaerobio).

Hay una parte de la nitrogenasa que se encarga de captar los electrones de la ferredoxina reducida y
transportarlos (reductasa). Otra reducirá el nitrógeno (nitrogenasa). Existe una cadena de transporte
electrónico Fe-S muy sofisticado, donde el N queda unido
mediante 6 enlaces de coordinación por 6 núcleos de Fe,
manteniendo sujeto al N2 y debilitando su doble enlace,
quedando como dentro de una jaula.

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BIOQUÍMICA METABÓLICA

Reservados todos los derechos. No se permite la explotación económica ni la transformación de esta obra. Queda permitida la impresión en su totalidad.
Cualquier ser vivo tiene la capacidad de asimilar el
amonio en forma de glutámico y glutamina. La primera
molécula que va a aceptar el amonio es el α-OG de
CAC.

La enzima responsable es la glutamato


deshidrogenasa.

Característico de seres con capacidad biosintética


(bacterias, plantas).

Los animales la hacemos trabajar al revés, ya que es


un proceso reversible.

L-GLU es el punto de entrada del nitrógeno en el metabolismo a partir del α-OG. Los aminoácidos son
todos L pero el carbono 2 y la base de Schiff es asimétrico, dando una mezcla racémica de glutámico,
pero la GLU-DH obliga a que el NAD(P)H ataque por una parte concreta, manteniendo la estereoquímica.
La glutamina (GLN) es el siguiente aminoácido,
derivado del glutámico, aceptando un amonio:

Ha de activarse el carboxilo lateral e introducir el


amonio

 L-GLU  precursor de aas


 L-GLN  moléculas nitrogenadas

Enzima: glutamina sintetasa

SINTASA: enzima genérico de síntesis de cualquier compuesto

SINTETASA: utiliza ATP en su operación de síntesis.

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BIOQUÍMICA METABÓLICA

La GLN-sintetasa tiene centros alostéricos, presentando regulación


por feedback acumulativo. La sobreacumulación de productos
nitrogenados ha de ser igual para inhibir su actividad, solo uno no lo
inhibe totalmente.

El glutámico donará el nitrógeno α y la glutamina dará el nitrógeno de


la cadena lateral.

EN la biosíntesis de aminoácidos se va a utilizar precursores de la


glicólisis y del CAC. Hay 6 familias biosintéticas de aminoácidos: a
partir del OAA, Pyr, Ribosa 5P, PEP…

Transaminación

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Consiste en la transferencia de amonio. La naturaleza de los productos y de los reactivos es la misma, por
eso es un proceso TOTALMENTE reversible (Keq=1). Este proceso se regirá por las necesidades celulares.

Si en la R ponemos un metilo, el α-cetoácido resultante será piruvato, obteniendo el aminoácido L-alanina.


La transaminasa específica es la GPT (glutamato-piruvato-transaminasa).

Si la R es COO-, tendremos oxalacetato como α-cetoácido


y L-aspártico como aminoácido. La transaminasa es la
GOT (glutamato-oxalacetato-transaminasa).

Mediante transaminación se puede obtener una gran


cantidad de aminoácidos. La quiralidad importa ya que
hay que obtener L-aas. La fuerza la da la propia actividad
enzimática. La transaminación no es fuente de todos los
aminoácidos. En el caso de la treonina y lisina (complejos
y esenciales) no poseemos transaminasas para
producirlos, teniendo que tomarlos por la dieta, debido a
la incapacidad de sintetizar la cadena lateral. Hay 10
aminoácidos que su biosíntesis es imposible para los
humanos (aminoácidos esenciales). Phe, Tyr y Trp poseen
anillos aromáticos. Val, Leu con cadenas laterales
grandes. Aunque vengan de fuera, poseemos
transaminasas específicas.

Un ejemplo de enfermedad que no permite la eliminación de aminoácidos es la fenilcetonuria. No


podemos catabolizar la fenilalanina y de normal aunque tengamos aminoácidos en exceso los eliminamos.
Para tratar la fenicetonuria se utiliza terapia de restricción: eliminar Phe de la dieta y se proporciona el α-
cetoácido correspondiente.

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BIOQUÍMICA METABÓLICA

Conjugación entre transaminasas y Glu-DH

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El glutámico se desamina dando piruvato (α-cetoácido), poder reductor y amonio libre, que será eliminado.
Si el piruvato está en exceso, entrará en el CAC e irá a citrato y grasas. Un exceso de proteínas puede
convertirse en grasas. Esta suma de procesos es útil en caso de ayuno, ya que el cerebro necesita obtener
glucosa a partir de esqueletos carbonados. Durante el ayuno, los aminoácidos darán lugar a azúcar gracias
a la gluconeogénesis. Este tipo de enzimas están en el hígado, músculo y corazón, con elevada
concentración de proteínas o metabolismo muy intenso.

En cambio, el suero sanguíneo no debe llevar transaminasas porque no debe haber metabolismo. Si en
un análisis de sangre hay presencia importante de transaminasas es porque han muerto células (necrosis)
de músculo, hígado o corazón. Las transaminasas de las analíticas son SGOT y SGPT (S de suero). Una
persona con fallo hepático, fibrosis, etc. tendrá un nivel alto de transaminasas así como en la fase aguda
de un infarto de miocardio. Si la persona responde al tratamiento, las transaminasas de origen cardiaco
descenderán. Gran parte de medicamentos son asimilados en el hígado, como el alcohol, aumentando la
transaminasas. Muchas veces puede provocar fallo hepático, como las estatinas para tratar el colesterol.

El aspártico formado a partir de glucosa y oxalacetato puede recibir NH4+ de la GLN y dar lugar a ASN. Este
metilo queda retenido por otro intermediario y después se utilizará en otro proceso (página 63).

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BIOQUÍMICA METABÓLICA

Regulación de la biosíntesis de aas

Se trata de una regulación por feed-back (retroalimentación). Acumulación de X inhibirá al enzima que
cataliza la primera reacción. En el caso de la síntesis de aminoácidos, tenemos muchas rutas ramificadas,
teniendo por tanto un feedback ramificado.

También por la existencia de isoformas de las actividades enzimáticas de algunos pasos de la biosíntesis
de aminoácidos.

Reservados todos los derechos. No se permite la explotación económica ni la transformación de esta obra. Queda permitida la impresión en su totalidad.
En el caso de la glutamina, existe un feedback acumulativo. Los aminoácidos los tomamos de fuera. Esta
regulación es propia de plantas. Los aas son precursores de muchas estructuras nitrogenadas:

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BIOQUÍMICA METABÓLICA

Catabolismo de aminoácidos (y proteínas)

Cuando hay exceso de aminoácidos, los animales no podemos almacenarlos. No tenemos forma de
determinar el contenido y composición de aas, por ello la situación normal es tener un excedente. Los aas
en exceso van a tener que ser desaminados y el esqueleto carbonado sí que será integrado en el
metabolismo. El amonio o bien se recicla o se elimina. Los aas en animales procederán (los no esenciales)
de biosíntesis, dieta y recambio de proteínas. Las proteínas tienen una vida media que han de ser
recambiadas.

Reservados todos los derechos. No se permite la explotación económica ni la transformación de esta obra. Queda permitida la impresión en su totalidad.
Balance de N

Un adulto de peso normal sintetiza unos 400 g de proteína al día y la degradación de 400 g se calcula que
¾ partes se reciclan y ¼ parte va a ser eliminado, que habrá que reponerla con la dieta. Si de forma
continuada no ingerimos los aas necesarios los sacaremos de nosotros mismos.

Las proteínas de la dieta se van a desnaturalizar en el estómago gracias a la pepsina (a pH=2)


fragmentando en péptidos. A lo largo del intestino delgado se encontrará con enzimas hidrolíticas como
tripsina y quimotripsina (enzimas pancreáticos a pH básico) obteniendo oligopéptidos y aas libres. Estos
ya serán absorbidos por los enterocitos. Estos aas serán absorbidos por los que los necesiten.

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BIOQUÍMICA METABÓLICA

El amonio no se puede eliminar y además es tóxico.

De una manera u otra, los aas darán su correspondiente α-cetoácido y amonio. El α-cetoácido se integrará-
El amonio no se puede mantener ni enviarse a la sangre. EL hígado es el encargado de detoxificar. En la
mayor parte de las células el amonio se incorporará a la glutamato sintetasa y dará glutamina. Esta
glutamina perderá el amonio gracias a la glutaminasa en el hígado. El amonio en el hígado se transformará
en urea (riñón).

En el caso de los músculo, el exceso de amonio será incluido con α-OG y el piruvato se transaminará a
alanina. La alanina en el hígado se transaminará a glutamato, proceso donde se formará urea.

Se denomina ciclo de la glucosa-alanina. Este piruvato va a ser indistinguible del de la producción de


lactato. Esta glucosa de la gluconeogénesis también podrá utilizarse para deshacerse del amonio.

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Ciclo de la urea

De forma continua nuestros excedentes de N tiene que ser eliminados: ciclo de la urea
(Krebs, 1932 – 5 años más tarde sacó el CAC). Es una molécula pequeña, soluble, neutra y no es tóxica.
La formación de la urea es un complejo conjunto de procesos que se da entre la mitocondria y el citosol
en el hígado. El CO2 en disolución está en forma de bicarbonato. El amonio tiene carácter básico. Para unir
covalentemente el HCO3- se activará para dar lugar a carboxifosfato. Aquí es donde el amonio se desplaza
obteniendo ácido carbónico. Luego se obtendrá:

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BIOQUÍMICA METABÓLICA

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La entrada del segundo amonio va a ser compleja. Carbamoil fosfato va a condensar un aminoácido
llamado ornitina. Ambos compuestos darán lugar a citrulina. En el citosol va a condensar con aspartato
que dará arginino-succinato. Esta compleja molécula va a escindirse en fumarato y arginina (en su cadena
lateral contiene una unidad de urea, que químicamente se llama guanidinio). La arginina va a perder una
unidad de urea, teniendo urea y ornitina.

En mamíferos no hay alternativa en eliminar la urea pues causaría la muerte. Si hay alguna mutación que
haga no eliminar la urea el feto muere. Una hiperamonemia (fallo hepático) causa la muerte. Los pacientes
con esta patología congénita presentan un fallo en la enzima que cataboliza arg-succinato  arg. Los
bebés mueren al nacer. Se puede diseñar un tratamiento introduciendo en la dieta altos niveles de
arginina (terapia de sustitución). El N que expulsan en forma de urea no es su propio amonio, pero se ha
reestablecido la citrulina. El arginino-succinato es filtrado por los riñones.

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BIOQUÍMICA METABÓLICA

Balance final:

Según la fisiología, hay 3 tipos de animales según como se deshacen del amonio:

 Organismos pequeños acuáticos que lo difunden a través del agua:


amoniotélicos. Peces, larvas de anfibios y crustáceos.
 Ureotélicos: emplean el ciclo de la urea. Mamíferos y muchos vertebrados
terrestres.
 Uricotélicos: eliminan por ácido úrico (cristales insolubles). Aves y reptiles.

Una vez que hemos eliminado el amonio, las cadenas carbonadas de la


desaminación van a ser recicladas en el CAC y glicólisis en forma de:

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BIOQUÍMICA METABÓLICA

Recambio proteico (turnover)

Las proteínas se renuevan constantemente, no son


permanentes. Durante la biosíntesis de proteínas se producen
errores debido al mal plegamiento, que no adquirirá su
conformación tridimensional y habrá que hidrolizar. Muchas
proteínas tienen vidas medias muy cortas como las encargadas
del ciclo celular. SI se mantuvieran más tiempo darían células
cancerosas.

Muchas pueden sufrir modificaciones químicas (daño


estructural). Todas están sujetas a recambios. Una renovación
constante mantiene a las células en estado óptimo. Hay proteínas que viven minutos. La hemoglobina vive

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tanto como los glóbulos rojos y las proteínas del cristalino viven durante toda la vida.

Toda proteína tiene un reloj molecular interno codificado en su estructura. Hay residuos que estando en
el N-terminal van a recortar su duración. Las del ciclo celular tienen una secuencia PEST (prolina,
glutámico, serina y treonina) que acorta la duración de las proteínas. Hay tipos de cánceres que se deben
a un marcaje incorrecto haciendo que la célula esté en continuas mitosis.

La ubiquitina se unirá covalentemente mediante enlace peptídico a la proteína que será eliminada. Es una
proteína pequeña que se unirá a la lisina de la proteína (al grupo amino lateral de lys por enlace peptídico).
Para evitar la hidrólisis accidental de proteínas, es un enlace γ-peptídico o isopeptídico, no reconocido por
las proteasas (que no tienen este enlace). Puede ser ubiquitinizada en varios sitios y se puede encadenar.

La proteína marcada será dirigida al proteasoma (muy grande) en forma de barril hueco lleno de actividad
hidrolítica. Está cubierto por unas estructuras llamadas CAP que reconocen la ubiquitina. Empleando ATP
obligará a que la proteína entre en el interior. La estructura CAP tiene isopeptidasas que van a recuperar
la ubiquitina. Dentro, se fragmentará la proteína en aas (por exceso de aas, por ejemplo).

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BIOQUÍMICA METABÓLICA

Problemas que afectan al catabolismo de aminoácidos

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BIOQUÍMICA METABÓLICA

9. METABOLISMO DEL NITRÓGENO II. NUCLEÓTIDOS


Hay nucleótido con un papel clave en metabolismo: ATP, GTP. También son importantes como activadores
e intermediarios NAD, FAD, CoA, regulación hormonal (cAMP)… También el RNA. Todos son
ribonucleótidos: rATP, rGTP, rCTP, rUTP. Para el DNA, parte de los ribonucleótidos se reconvierten en
desoxiribonucleótidos: dNTPS.

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Las purinas y pirimidinas se sintetizan a partir de aminoácidos. Biosíntesis:

 De novo (a partir de cero): ribosa activada, aas, ATP, CO2 (tendríamos nucleótidos)
 Vía del “rescate” (se parte de ribosa activada y base nitrogenada. De forma directa o reciclado
nucleótidos.

Biosíntesis de pirimidina

1. Síntesis del anillo a partir de carbamoil fosfato y aspártico


2. Anillo de orotato
3. Se añade ribosa activada a las pentosas fosfato  orotidín monofosfato
4. Descarboxilación  uridil monofosfato UMP
5. UMP + 2 ATP  UTP

La regulación de la biosíntesis es por feedback. Exceso de CTP inhibirá UTP y el primer enzima.

Las purinas actúan como activadores. La presencia de bases púricas activará la síntesis de UTP y CTP.

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BIOQUÍMICA METABÓLICA

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Catabolismo de nucleótidos (general)

La ribosa-1P sufrirá un cambio de P mediante una mutasa, obteniendo PRPP. La ribosa puede provenir
del reciclaje o de la ruta de las pentosas fosfato.

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BIOQUÍMICA METABÓLICA

Catabolismo de pirimidinas

Se condensa citosina con uracilo dando dihibrouracilo. Al final se obtendrá


CO2, amonio (que irá al hígado pasando a urea) y β-alanina (esquema de la
derecha).

La β-alanina no es proteico por ser β pero participa en la biosíntesis de CoA o


carnosina (dipéptido en músculos) con propiedades protectoras y
antioxidantes (β-Ala-His).

Biosíntesis de purinas

Se montan sobre la ribosa. En pirimidinas primero se monta el anillo y luego

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se le une la ribosa. Tras sucesivas metilaciones y alguna acilación dará lugar
al ácido inosídico (IMP) [reacciones detalladas debajo].

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BIOQUÍMICA METABÓLICA

A partir de IMP tenemos 2 rutas paralelas dando guanina y adenina. Las bases nitrogenadas se tienen
que sintetizar en cantidades equivalentes. Se necesita ATP para sintetizar GMP y hace falta GTP para
sintetizar AMP, garantizando esta misma proporción. La biosíntesis de bases púricas activan a las bases
pirimidínicas.

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Degradación de purinas

Los humanos, junto a primates superiores, nos quedamos en el ácido úrico. Otros animales pasan por
otros componentes como alantoína. El ácido úrico es muy poco soluble (insoluble), su saturación se

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BIOQUÍMICA METABÓLICA

encuentra en torno a 68 mg/L o 420 μM. Presentamos una mutación (desde hace 8-20 millones de años)
en la actividad enzimática entre ácido úrico y alantoína.

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Esa mutación se ha mantenido. Los primates inferiores presentan una actividad enzimática normal. Los
primates superiores se parecen ya que son más grandes y longevos que los primates inferiores, así como
una mayor capacidad craneal.

Los niveles de ácido úrico en nuestros fluidos se encuentra entre 200-400 μM teniendo concentraciones
saturantes (420 μM). La presencia de una concentración saturante puede cristalizar en las articulaciones
provocando problemas reumáticos, artritis y gota. Se debe a un exceso de purinas como en marisco,
carnes rojas (sus músculos tienen células grandes y plurinucleadas, rico en DNA  bases púricas). Un
consumo excesivo de carne animal supone un problema para deshacerse de las purinas. La supuesta
ventaja es que el ácido úrico es un antioxidante comparable con la vitamina C y nos
protege frente a procesos oxidativos como cáncer o envejecimiento. Esta mutación
en seres omnívoros no supuso un problema. En el tratamiento de la gota y procesos
reumáticos se usa un medicamento llamado alopurinol. Fue la primera medicina que
se sintetizó de manera racional, dándole al enzima un análogo estructural,
bloqueando la actividad enzimática (xantina oxidasa). El tratamiento consiste en un
cambio de dieta y los cristales de ácido úrico se irán disolviendo poco a poco.

A modo de síntesis:

 Amoniotélicos (acuáticos): difunden NH4+


 Ureotélicos: urea (soluble), degradación de aa, ácidos nucleicos/purinas en ácido úrico (en
primates superiores)
 Uricotélicos: Aves y reptiles. Todo el amonio lo canalizan como ácido úrico, insoluble (cristales).
Los primates superiores también eliminan las purinas mediante ácido úrico.

NAD, FAD, CoA

 NAD: en procesos de detoxificación. Es un dinucleótido de adenina y nicontinamida. La


nicotinamida proviene del ácido nicotínico, vitamina B3, vitamina PP. Es esencial, mediante la
dieta. La vitamina podemos añadirla a un nucleótido de adenina.
 FAD: favín adenín dinucleótido (adenina + riboflavina). La riboflavina (vitamina B2 es un nucleósido
(base nitrogenada rara + azúcar reducido linealizado). El FMN tiene solo riboflavina.
 Coenzima A: basado en adenina fosforilada con una cadena de ácido pantoténico (vitamina B5)
formado por cisteína (donde se une el acilo correspondiente), β-alanina, ácido pantoténico,
fosfatos, ribosa y adenina.

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BIOQUÍMICA METABÓLICA

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Biosíntesis de desoxirribonucleótidos

La necesidad de ribonucleótidos es muy elevada en las


células, mientras que los desoxirribonucleótidos solo se
necesitan en determinados momentos. Cuando estos son
necesarios, se sintetizan modificando los ribonucleótidos.
Las diferencias entre desoxi- y ribonucleótidos reside en la
desoxirribosa 2’ y en la timina en vez de uracilo.

1. Reducción del C2-OH en C2-H

Es difícil porque el C2-OH no está activado. Solo será


posible gracias a una actividad enzimática. Es un enzima
único porque es complejo, formado por 2 subunidades
compuesto por pares de monómeros. En su centro activo
encajan todos los ribonucleótidos. Se llama ribonucleótido
reductasa o ribonucleótido difosfato reductasa o rNDP
reductasa. El ribonucleótido oxidad tiene que estar en
forma difosfato. dATP, dGTP y dCTP puede formar parte del
DNA pero dUTP tiene que ser convertido a dTTP.

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BIOQUÍMICA METABÓLICA

Enzima rNDP-reductasa

Presenta muchos sitios de unión con otros


efectores. Cargado con aminoácidos de grupo
reductor como cisteínas. Para atacar al
carbono, se utiliza un mecanismo de radicales
libres.

Existe un residuo tirosilo radical libre (Tyr ·) que


no está cerca del centro activo. Este tirosilo es
estable, estabilizado por Fe3+-O-Fe3+. Como el
tirosilo está lejos, polarizará un residuo de
cisteína que sí está en el centro activo, dando
un radical libre tiilo (Cys ·) que atacará a la
ribosa.

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Ataca al carbono 3’, haciendo más accesible al
carbono 2’. El resultado final es que como en
el centro activo encajan todos los
ribonucleótidos, obtenemos los
desoxirribonucleótidos.

Una producción irregular de


desoxirribonucleótidos causará la aparición de
mutaciones en el DNA. La falta de un solo
desoxirribonucleótidos es letal. No hay ningún
DNA donde falte un dNTP. Para ello, el enzima
posee sitios de regulación por feedback.

2. Uracilo  Timina

De manera espontánea, la citosina muta a uracilo (amina). En el DNA hay una maquinaria que reconoce
uracilos mutados y los convierte en citosina.

El metilo perdido de la serina (página 49) va a ser encajado en la metilación de UTP. Los grupos metilos y
acetilos vienen por un transportador (tetrahidrofolato – del ácido fólico) que transporta unidades de
carbono. El metilo irá enganchado a 2 nitrógenos (5 y 10) convirtiéndose en N5-N10-metil-THF.

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BIOQUÍMICA METABÓLICA

La timidilato sintasa actúa sobre la dUMP. No se recupera como la forma original, sino como dihidroxifolato
ya que además del metilo pierde electrones. El dihidroxifolato tiene que reducirse, empleando NADPH.

Este proceso solo se utiliza para generar dTMP, es una vía muerta porque no afecta al metabolismo, solo
afecta a la división celular (mitosis). En una persona con cáncer, parte de los tratamientos de la
quimioterapia se basan en detener la mitosis. Como el fluorouracilo, el halógeno se une a la timidilato
sintasa y la inactiva, no pudiéndose dividir al no sintetizar la timina. Aquellas células que estén
autorreplicándose morirán, entrando en apoptosis. Un agente quimioterapéutico es parecido a THF. En
enfermedades autoinmunes se suministra ese agente para que decrezca la síntesis de células
sanguíneas.

Reservados todos los derechos. No se permite la explotación económica ni la transformación de esta obra. Queda permitida la impresión en su totalidad.

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BIOQUÍMICA METABÓLICA

Estrategias antivirales

Los retrovirus (RNADNA) tienen una tasa de mutación elevada, ya que el


RNA muta a elevada velocidad y las transcriptasas reversas no corrigen
errores. EN el caso del virus del herpes (contagioso) se trata con Aciclovir.
Las polimerasas del herpes lo reconocen como si fuera guanina pero no es

Reservados todos los derechos. No se permite la explotación económica ni la transformación de esta obra. Queda permitida la impresión en su totalidad.
reconocido por nuestras polimerasas.

En los 80-90, la azidotimidina (AZT) fue el primer medicamento para tratar el título
del SIDA. Es un análogo estructural de la timidina, con un grupo azida en el C3-OH
que engaña a la transcriptasa inversa del HIV, sin efecto en nuestras células.
Debido a la alta tasa de mutación, hay que tener elevadas cantidades. En la actualidad
existen tratamientos combinados.

Evolución DNARNAProteínas

La estructura de DNA es mucho más estable y mucho menos reactivo que la del RNA, que hay mucha
cantidad de este último con funciones muy diversas. El RNA fue la primera molécula con características
similares a un ser vivo. El RNA se basta por sí solo para replicarse, mutar y codificar proteínas. Los
polímeros basados en DNA son de doble cadena, con T, lo cual los hace mucho menos reactivos.

Hay datos bioquímicos reales que demuestran que los dNTPs son los últimos en aparecer. Por ejemplo,
son una vía muerta en el metabolismo, solo sirven para llevar el material genético. Otra prueba sería la
actividad que cataliza la degradación de la ribosa, que tiene que venir dada por una proteína. Por tanto,
las proteínas aparecieron antes que el DNA.

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