Estructura de los Ácidos Nucleicos

EXISTEN DOS TIPOS

 El ácido Ribonucleico (ARN)
Transmisión de la información genética
Síntesis de proteínas
 El ácido Desoxirribonucleico (ADN)

Almacenamiento de la información genética

Transmisión de la información genética

Niveles estructurales Estructura primaria

• 1er nivel • ADN: cadena polimérica de unidades
– Estructura de nucleótidos y como se unen repetitivas denominadas nucleótidos
entre si – Nucleótidos
• 2do nivel • Azúcar: pentosa
– Desoxiribosa
– Configuración tridimensional helicoidal – Ribosa
• 3er nivel • Grupo fosfato
– Las formas de empaquetamiento • Base nitrogenada
– Purinas
– Pirimidinas

Componentes monoméricos de los Ácidos Componentes monoméricos de los Ácidos

Nucleicos: Estructura y Nomenclatura Nucleicos: Estructura y Nomenclatura
Los ácidos nucléicos son polímeros de muy alto peso molecular
Los componentes monoméricos que están compuestos por nucleótidos
de los ácidos nucleicos son los
NUCLEÓTIDOS base
Nucleótido esta conformado por
tres unidades
Base nitrogenada
Azúcar pentosa
Grupo fosfato Fosfato azúcar
 Bases Nitrogenadas Bases de los ácidos nucleicos
 Son compuestos heterocíclicos, aromáticos y planos
 Se clasifican según su estructura en:
NH 2
 Bases púricas (derivadas de la purina) O
 Bases pirimidínicas (derivadas de la pirimidina) N N HN N
Purinas
N NH H2 N N NH
adenine (A) guanine (G)

NH2 O O
HN CH3
N HN
Pirimidinas
O NH O NH O NH
cytosine (C) thymine (T) uracil (U)
(DNA only) (RNA only)

Bases de los ácidos nucleicos Bases de los ácidos nucleicos

Otras Purinas y pirimidinas Otras Purinas y pirimidinas

 Es posible encontrar en el ADN y el ARN otras bases
secundarias. Purinas Pirimidina
s
 En el ADN las mas comunes son las formas metiladas de las
bases principales
 En algunos DNA víricos, ciertas bases pueden estar
hidroximetiladas o glucosiladas
N2-metilguanosina
 Las bases alteradas o pocos comunes del ADN sirven a menudo N6-metiladenosina 5-metilcitidina 5-Hidroximetilcitidina

como señales especificas para la regulación o protección de la

información genética.
5-metilcitosina, DNA animales superiores
 En el ARN y en especial el ARNt, se encuentran también bases N6-metiladenina, DNA bacteriano
secundarias de muchos tipos 5-hidroximetilcitosina, DNA bacterias infectadas por fagos
 Otras Purinas y pirimidinas Azúcar Pentosa
Algunas bases poco abundantes presentes en los
ARNt

Inosina, contiene hipoxantina

Inosina Pseudouridina
Pseudouridina, Union C-5 del
Uracilo

7-metilguanosina 4-Tiouridina

Azúcar Pentosa Grupo Fosfato

El azúcar es:
 D – Ribosa (ARN)
2´- desoxi – D – ribosa (ADN)

La numeración del azúcar comienza por el carbono unido a

la base, se enumera con apostrofe sobre el numero para
diferenciarlo de la numeración de la base (1´, 2´, 3´, 4´, 5´)

Grupo Fosfato Grupo Fosfato

 Nucleótidos del ADN Nucleósidos
 Cuando un nucleótido carece del grupo fosfato se
denomina NUCLEOSIDO
NH2
N NH 2
N
adenine (A) N
NH N
N
N N
adenosine + H 2O
HO CH 2 OH HO CH 2
O O
D-ribose
Nucleósido
OH OH OH OH

Las Purínicas se enlazan al azúcar a través del N9

La base pirimidínicas por el N1
El enlace formado es llamado enlace N-glucosídico

Nucleósidos En conclusion, los nucleótidos…..

 Se pueden encontrar otros nucleósidos en
menor cantidad en ciertas clases de ácidos
nucleicos
 1 - ribosiltimina
 5 – ribosiluracil (seudouridina)
 2 – ribosilguanina
 2´- o – metil adenosina
2´- o – metil uridina
 Son Nucleósidos fosforilados en uno de los
hidroxilos libres del azúcar, generalmente en la
posición 3´o 5´.
 El grupo fosfato se nombra por la posición del
azúcar a la que esta unido y por el numero de fosfatos
que presenta
 Algunos poseen interés Biológico
 ADP, ATP y GTP, Actúan como almacén
energético
 FAD, NAD+, NADP+, Actúan como coenzimas

Tipos de nucleotidos Estructura Química de un

Nucleótido
• Desoxiribonucleotidos ó desoxiribonucleosido
5’monofosfato
• Ribonucleotidos ó Ribonucleosido 5’monofosfato
ABREVIACIONES Y SIMBOLOS PARA BASES, NUCLEOSIDOS Y NUCLEOTIDOS AUTOEVALUACION
Familia de la Base Nucleósido Nucleótido Identifica las siguientes estructuras
Base
Adenina Adenosina Adenosina monofosfato (5´-
Ade Ado AMP)
A A Ado
Guanina Guanosina Acido adenilico
Gua Guo Guanosina monofosfato (5´- GMP)
G G Acido Guanilico
Citosina Citidina Citidina Monofosfato
Cit Cid Acido Citidilico
C C CMP o pC
Uracilo Uridina Uridina Monofosfato
Ura Urd Acido uridilico
U U UMP o pU
Timina Desoxitimidina Desoxitimidina Monofosfato
Ti dTd Acido desoxitimidilico
T dT dTMP o pdT

AUTOEVALUACION AUTOEVALUACION
Identifica las siguientes estructuras Identifica las siguientes estructuras

DESOXIRRIBOSA DESOXIRRIBOSA RIBOSA

AUTOEVALUACION AUTOEVALUACION
Identifica las siguientes estructuras Identifica las siguientes estructuras

DESOXIRRIBOSA RIBOSA ADENINA DESOXIRRIBOSA RIBOSA ADENINA GUANINA

 AUTOEVALUACION AUTOEVALUACION
Identifica las siguientes estructuras Identifica las siguientes estructuras

DESOXIRRIBOSA RIBOSA ADENINA GUANINA DESOXIRRIBOSA RIBOSA ADENINA GUANINA

TIMINA TIMINA CITOSINA

AUTOEVALUACION Estructura de los ácidos nucleicos

Identifica las siguientes estructuras Ángulos de torsión
 La estructura tridimensional de la molécula de ADN
depende de la rotación de los grupos de átomos en el
enlace
 La rotación de los enlaces en la molécula es
DESOXIRRIBOSA RIBOSA ADENINA GUANINA determinada por los ángulos de torsión
 La flexibilidad de los ácidos nucleicos viene dada por:
 Movimientos del anillo furanósico
 Movimientos de rotación con respecto al enlace
glucosídico
 Rotación del enlace exocílico C4`- C5`.
TIMINA CITOSINA URACILO
 Rotación de los enlaces del grupo fosfato

Ángulos de torsión Estructura Primaria de los ácidos nucleicos

 Los A.N son polímeros de nucleótidos unidos por un

enlace fosfodiester por un lado con el C3`de la pentosa y
por el otro con el C5`.
 Su estructura primaria es determinada por la
composición de bases. Siempre se nombra de 5`a 3`.
 Los A.N forman largas cadenas con un sector idéntico (el
esqueleto azúcar - fosfato) y uno variable (su secuencia de
bases)
 Los A.N pueden estar formados por 1, 2, 3 y hasta 4
cadenas de nucleótidos
 Los nucleótidos sucesivos en el ADN están unidos por enlaces fosfodiester

Estructura secundaria del ADN

Direccionalidad de los ácidos nucleicos

 Son todas helicoidales

 Una cadena sencilla puede formar una
hélice si se forma un buen apilamiento de
bases.
 Son posibles hélices intra o intercatenarias
de 2, 3 y hasta 4 cadenas estabilizadas por
puentes de hidrogeno.

Modelo de Watson y Crick Modelo de Watson y Crick

Modelo de Watson y Crick

Modelo de Watson y Crick
 Puentes de hidrógeno

2 puentes de hidrógeno 3 puentes de hidrógeno

Adenina Timidina Citosina

Guanidina

EL DNA DOBLE HEBRA CONSISTE DE AUTOEVALUACION

DOS HELICES ANTIPARALELAS

Marca el nucleósido y el nucleótido

¿Cuál nucleótido es?
¿Es una pirimidina o purina?
¿Que tipo de azúcar tiene?
¿Es parte del DNA o RNA?
¿Cuántos puentes de hidrógeno puede formar?
Marca los terminos 5’ y 3’

La hidrofobosidad interna mantiene unida las cadenas, la

acidez externa permite que se desenvuelva en un medio acuoso.
 Tipos de ADN según su estructura Clasificación del ADN

 Por Rayos X y RMN se han encontrado varias  Dos grupos

familias conformacionales del ADN  Dextrógiro
 Los cambios de conformación dependen de:
 Levógiro
 La secuencia de bases
 Tres familias
 La fuerza iónica
 A – ADN (Dextrógira)
 Humedad relativa
 B – ADN (Dextrógira)
 Modificaciones de las bases
 Z – ADN (Levógira)
 Presencia de fármacos.

Estructura tridimensional de A, B y Z - ADN

Clasificación del ADN

 Seis tipos
 A – ADN (Tipo A)
 B – ADN (Tipo B, C, D y T)
 Z – ADN (Tipo Z)

Formas dextrógiras
 La doble hélice gira en sentido dextrógiro
(hacia la derecha)
 Familia A
 Familia B
 El A – ADN presenta una hélice mas
ancha por contar con mas residuos por
vuelta de hélice
 Las bases en la familia A se encuentran
mas apiladas, esto se demuestra porque el
giro de hélice/pb pasa de 36º en la familia B a
33º en la familia A.
 Formas dextrógiras Formas dextrógiras
 La conformación de los azucares
 Familia A = C3`endo
 Familia B = C2` endo (C3`exo)
 Son destacables la características de los surcos
 Familia B = Surco mayor mas ancho y un
poco mas profundo que el surco menor
 Familia A = Surco mayor mucho mas
profundo que el surco menor, pero mas
estrecho.

Formas dextrógiras
Formas dextrógiras

 La familia B se distingue porque los pares

de base están perpendiculares al eje de la
hélice
El A – ADN es menos compacto y los pares
de base presentan una inclinación con
respecto al eje de la hélice.
 La familia B es mucho mas flexible y la
conformación concreta depende de la
secuencia, todo lo contrario de A – ADN que
es rígida

Familia B Familia B

 Forma mas habitual del ADN  D y T, un surco menor

 Es la forma clásica de Watson y profundo pero muy estrecho
Crick
 Estas formas aparecen en
 Presenta los tipos B, C, D y T ADN sintético, ADN naturales,
 Las características prototípicas de la en diversas condiciones de
familia B la presenta el tipo B – ADN, humedad relativa (C-ADN) y en
que es mas habitual in vivo determinados fagos (T- ADN)
 El C – ADN es mas ligeramente [sales]
B - ADN C - ADN
delgado con surcos mas estrechos Polietilenglicol
 Familia A Familia A

 Cuenta con un solo tipo el A - ADN  A nivel Biológico el A-ADN se ha

 Es la segunda forma mas detectable del observado en bacterias Gram. (-) en
ADN esporulación y en condiciones de estrés
ambiental
 Se presenta en secuencias ricas en
purinas
En condiciones de humedad relativa baja  In Vitro A – ADN resiste a la luz U.V, el
HR= 75 % paso de B-ADN a A–ADN inhibe la
B - ADN A- ADN formación de puentes entre pirimidina

 Adoptada por ARNds y hibridos ADN - ARN

Formas Levógira (familia Z)

Formas Levógira (familia Z)
 La forma Z-ADN puede ínterconvertirse
 La doble hélice de ADN gira hacia la espontáneamente en:
izquierda
 Presenta una estructura mas larga y  B – ADN en presencia de fármacos o cambios
delgada que la familia A y B del medio
 Su esqueleto de fosfato presenta forma de
 Un aumento en la fuerza iónica produce un
Zig-Zag
 Se ha detectado In Vivo cambio reversible de B a Z – ADN.
 En Secuencias alternadas de purina y
[sales]
B - ADN Z - ADN
pirimidinas, PP/ C y G ó 5-metil-C y G.
 En secuencias en las que se han  La posible función biológica del Z-ADN es su
modificado bases por metilación o estabilidad a altas concentraciones de sales lo que
bromación, especialmente citosina hace pensar que pueda existir in vivo en ciertas
circunstancias

Características más representativas de A, B y Z-ADN

Estructura tridimencional de A, B y Z - ADN
 El ADN puede adoptar estructuras no El ADN puede adoptar estructuras no
habituales habituales
Variaciones dependientes de la secuencia
Cuatro o mas adeninas ✁
Curvatura del ADN, unión de algunas
Estructuras con tres y 4 hebras de ADN por apareamiento
HOOGSTEEN
proteínas al ADN
Palíndromo
Lugares donde comienzan importantes procesos del metabolismo del
ADN
(Replicación, recombinación, transcripción)
Los triplex se forman en largas secuencias que contengan solo
Repetición especular pirimidinas o solo purinas en una de las hebras

Posiciones Watson y Crick Posicion de Hoogsteen

Cruciforme
Horquilla

El ADN puede adoptar estructuras no El ADN puede adoptar estructuras no

habituales habituales

Los tetraplex solo se forman en secuencias del ADN que contengan una
El ADN H, se halla en regiones de
alta proporción de residuos de guanosina
polipurina o polipirimidina que
incorpore una repetición especular

Un fragmento largo de residuos de T

y C alternados genera un DNA H,
donde dos de las hebras del DNA H
contienen pirimidinas y la tercera
purinas.

Tetraplex de Guanosina
(Tetrapleex G)

El ADN puede adoptar estructuras no

habituales

En el ADN celular los sitios de reconocimiento de muchas

proteinas que se unen a secuencias especificas tienen
secuencias palindromicas.

En regiones del ADN implicadas en la regulación de la

expresión de algunos eucarióticos se encuentran
secuencias de polipurinas y polipirimidinas
On line Biology Books:
http://www2.estrellamountain.edu/faculty/farabee/biobk/biobooktoc.html
 La paradoja
• La resolución a la paradoja vino con el
• Que fue primero el huevo o la gallina?
• Que fue primero los ácidos nucleicos o las
proteínas?
– Si los ácidos nucleicos llevan la información
como se originaron las proteínas sin estos?
– Si los ácidos nucleicos son incapaces de
copiarse a si mismos como se originaron sin las
proteínas?
Tetrahymena thermophila
• Existen diferencias entre el ARN y ADN a
Hebra de ARN
La solución
descubrimiento del ARN catalítico o ribozimas
por parte de T Cech en 1981 en Tetrahymena
thermophila
– Estas moléculas aparecieron de 3.5 a 4 billones
de años, primero como autoreplicantes
– Importantes porque llevan información y son
catalíticas
• Posteriormente dieron origen a
riboproteinas, que remplazaron al ARN, que
almacenó información y luego fue sustituido
por el ADN
Paralelo
nivel de:
– Azúcar:
• La presencia de OH en 2’ hace que ARN sea degradado
por alcali
– Bases nitrogenadas:
• Cambio de timina por uracilo
– Estructura
• ARN generalmente es de una sola hebra
• Algunas regiones de doble hebra (hairpin loop) (A-U, G-
C, G-U)
– Diversidad estructural vrs diversidad funcional
 Tipos

El proceso Trascripción: definición

• Todo el ARN celular se sintetiza a partir • Síntesis de ARN con el ADN como molde
de ADN – 1er paso de transferencia de información de
• Del molde de ADN solamente se copian genotipo a fenotipo
determinados segmentos para – Este es el proceso que enlaza la información
almacenada en el núcleo en forma de ADN y su
transcripción, para replicación se copia
utilización para la formación de moléculas
todo complejas como las proteínas con sus diferentes
– No todos los genes se utilizan versiones
simultáneamente en la misma célula – El ARN es la molécula intermediaria
• Transcripción proceso altamente selectivo

¿Cómo es el RNAm? ¿Cuál es la función del RNAm?

El término mensajero fue acuñado por Francois Jacob y Jacques Monod
en 1960. Copia el mensaje del DNA y lo lleva desde el núcleo hasta el lugar de
Sol Spiegelman demostró que el RNAm es una copia del DNA, en un código la síntesis de proteínas, los ribosomas.
de bases complementarias.

Se sintetiza en el interior del núcleo a partir de la cadena 3’ – 5’ del DNA.

 ¿Cuál es la función del RNAr? ¿Cuál es la función del RNAr?
El RNA ribosomal se sintetiza en el nucleolo y constituye el 80% del RNA
celular.
Es importante porque forma parte de la estructura del ribosoma y
participa en la formación del enlace peptídico.
Subunidad grande RNAr 23S = 3200 nucleótidos
o 50S RNAr 5S = 120 nucleótidos
Subunidad grande RNAr 28S = 5400 nucleótidos
o 60S RNAr 5.8S= 158 nucleótidos
RNAr 5S = 120 nucleótidos

Subunidad pequeña
o 30S RNAr 16S = 1540 nucleótidos

Subunidad pequeña RNAr 18S = 2100 nucleótidos

o 40S
Ribosoma procariótico
Ribosoma eucariótico

¿Cuál es la función del RNAt? En uno de los extremos del RNA t

se encuentra un triplete que
El RNA de transferencia se sintetiza siempre es CCA, leído en dirección
en el núcleo celular. 5’-3’.
Es el lugar donde se fija el
Son pequeños ya que tienen unos 70- aminoácido para después
80 nucleótidos. trasladarlo al interior del
Parece una hoja de trébol con cuatro ribosoma.
zonas de doble hélice.
Existe al menos un RNAt por cada
Su función es llevar a los amino- tipo de amino- ácido, por lo tanto,
ácidos desde el citoplasma hasta el debe- mos esperar mínimo unos 20
interior del ribosoma, durante la RNAt diferentes.
síntesis de proteínas.
En una de las asas tiene un triplete
llamado anticodón, el cual le permite En el tema relacionado a la síntesis
reconocer el sitio donde deberá pegar de proteínas, se describirá con
al aminoácido. detalle el funcionamiento de cada
uno de los tipos de RNA t.
Este RNA es el único que puede
contener timina en alguna de las asas.

Estructura del ARN

Estructura del ARN En el ARN no existe una estructura regular y simple que
sirva de referencia para la estructura del ARN

El producto de la trascripción del ADN es

siempre un RNA de cadena sencilla La estructura tridimensional de muchos RNA, al igual que
las proteínas son complejas y únicas

Las monohebras tienden adoptar una

conformación helicoidal dextrógira por Las interacciones débiles, en especial los apilamientos de
apilamiento de bases bases tienen un papel importante en la estabilización de la
estructura

Los apilamientos son mas fuertes entre

purinas que entre una purina y una Donde hay secuencias complementarias la estructura en
pirimidina o entre dos pirimidinas doble hebra es la equivalente a la doble hélice dextrógira en
forma A.
 Estructura del ARN Estructura del ARN
Cualquier secuencia autocomplementaria
Son frecuentes las interrupciones en la doble hélice a causa de bases no
de la moléculas de ARN dará lugar a apareadas
estructuras mas complejas horquilla

abultamiento
Las moléculas de ARN pueden plegarse Hebras
Horquilla
Bucle
para formar regiones en doble hélice por sencillas interno
Protuberancias
apareamiento de bases similar a las del
ADN, Puede darse G=U

lazo

Estructura del ARN Estructura del ARN

Horquilla (Hairpins) Bulge Loops (Protuberancias)
Al menos 4 bases libres para evitar el impedimento Ocurre cuando las bases de un lado de la estructura no
estérico con las bases que forman el tallo. pueden aparearse.

Estructura del ARN Estructura del ARN

Interior Loops (Bucle interno) (Multiloops)
Ocurren cuando a ambos lados de la estructura, Dos o más regiones de doble cadena convergen para
quedan bases libres. formar una estructura cerrada.
 Estructura del ARN Estructura del ARN
Interacciones Terciarias
Pseudoknots
Kissing Hairpins

Bases desapareadas de dos hairpin loops separados

entre sí por apareamiento formando pares de bases.

Estructura del ARN

Interacciones Hairpin-Bulge Estructura s

M1 compone
Rnasa P de E

Estructura del ARN

Estructura del ARN
Apareamiento de bases diferentes a lo planteado por
Watson y Crick es más habitual en el ARN
 Estructura del ARN Estructura del ARN
Diez apareamientos de bases purinas pirimidinas posibles en el RNA Diez apareamientos de bases purinas pirimidinas posibles en el RNA

Estructura del ARN Estructura del ARN

Diez apareamientos de bases purinas pirimidinas posibles en el RNA

Apareamiento de bases no convencional en triple hélice

Estructura del ARN

Estructura del ARN
Los ARNds muestran dos conformaciones estructurales similares,  92 % de HR adopta A’- RNA y a 75 % de HR
dependiendo de la concentración sales. cambia a A – RNA.

 Tanto A-RNA como A’-RNA muestran

apareamiento Watson y Crick
 < conc iónica = A-ARN (11pb/Giro)
Tipos de ARN  Las cadenas se disponen de forma antiparalela
De doble hélice  conc iónica > 20% = A - ARN  Surco mayor profundo
(X [sales])
 Surco menor poco profundo
A’ - ARN
La principal diferencia son la longitud del ARN y
(12pb/Giro) el grado de inclinación de las bases. A’-ARN > A-
ARN
 Estructura del ARN Estructura del ARN
RNA Triple hélice
Características A - ARN A’ - ARN
 Presenta apareamiento W & C y Hoogsteen simultáneamente
1. Altura hélice/giro 30 Å 36 Å

11 12  Se ha observado en el Homopolímero sintético poli

2. Pares de bases/giro
(A).Poli(U) al aumentar las concentraciones de sales.
3. Altura hélice/bp 2.73 Å - 2.81 Å 3.0 Å

4. Inclinación de las bases

16 - 19º 10º W&C Hoogsteen
respecto al eje de la hélice
5. Conformación del Azúcar C3’ endo C3’ endo 2 Poli(A).Poli(U) Poli(U).Poli(A).Poli(U) +
Poli(A)

Estructura del ARN Estructura del ARN

RNA Triple hélice
 La doble hélice antiparalela (Apareamiento
W & C)
 La hebra de Poli(U) extra se acomoda en el
surco mayor de esta doble hélice e involucra
apareamiento tipo Hoogsteen.
 Las dos cadenas de Poli(A).Poli(U) en el
apareamiento Hoogsteen corren de forma
paralela.
RNA doble hélice paralela
 Es posible si el apareamiento W & C es prevenida estéricamente
 El impedimento estérico es posible si la posición 2 de la adenina es
sustituida por grupos metilo, metiltio y dimetilamino.
 El duplex con apareamiento tipo Hoogsteen son
termodinámicamente menos estable.
 El duplex paralelo presenta el azúcar en conformación C3endo
para Poli(2-metiltio A) y C3endo-C2exo para Poli(U).

 En la triple hélice la altura de eje por pb  Clasifica el duplex como miembro de la familia A
aumenta a mas de 3A abriéndose mas la cavidad
del surco mayor y permitiendo acomodar la
cadena extra.

Estructura del ARN Semejanzas y diferencias entre ADN y ARN

RNA doble hélice paralela
Características
1. Altura hélice/giro
2. Pares de bases/giro
3. Inclinación de las bases respecto
al eje de la hélice
 Los A.N. son en general polímeros lineales de nucleótidos unidos por
enlaces fosfatos en las posiciones (C) 3’ y 5’ de los residuos sucesivos del
ARN duplex paralelo azúcar (pentosa).
31.6 Å  Los grupos fosfodiester de estos polinucleotidos son de tipo ácido, de
10 tal forma que a pH fisiológico, los A.N. están cargados negativamente y
se comportan como polianiones.
10º  ADN tiene igual número de residuos de A y T e igual nº de residuos
guanina y citosina.

A = T, G = C } Ley Chargaff
 Semejanzas y diferencias entre ADN y ARN Semejanzas y diferencias entre ADN y ARN

 La composición de ADN varía ampliamente entre diferentes  Contrariamente, ADNss (en algunos virus) no obedece las leyes de
organismos pero es mas o menos constante entre especies cercanas Chargaff. Solo después de penetrar el huésped, éste ADN es replicado
(relacionadas). para formar ADNds que obedece las leyes de Chargaff.

Ejm.  25 – 75% G+C (en  sp de bacteria)  Los A.N. pueden modificarse. Algunos ADN’s contienen bases que
son derivadas de las normales.

Ejm.  39-46% G+C (en mamíferos).

Ejm. dA y dC son parcialmente reemplazadas por N 6 metil-dA y 5’-
metil-dC
 El ARNds (ARN de doble cadena), el cual forma parte, en general, del
material genético de varios virus, obedece a las “Leyes de Chargaff”.
Estas siguen la Ley Chargaff’, similar pasa en ARN (+ARN).

Semejanzas y diferencias entre ADN y ARN Hidrólisis alcalina de la molécula de ARN

 El ARN, pero no ADN es susceptible de hidrólisis de bases. La
hidrólisis ARN genera una mezcla de nucleótidos 2’ y 3’.

 Esto es llamado también “hidrólisis alcalina – suave” en ARN (0.3 M

NaOH al 37ºC)

 Por el contrario, el ADN que carece de 2’-OH, es resistente a la

hidrólisis de bases, siendo químicamente mucho más estable que el ARN
(Una de las razones por las cuales ADN es el archivo genético y no el
ARN).

 Para romper los enlaces fosfodiester del ADN se necesitan ácidos

fuertes (calientes) (12 M ácido perclórico a 100ºC o ácido formica del 98%
a 170ºC).

¿Por qué Timina en el ADN y Uracilo en el

ARN?
 La C se desamina espontáneamente
formando U
Las enzimas reparadoras reconocen
estas “mutaciones” y remplazan U por
C
 Si no hubiera T (5-metil-U), ¿como
distinguir los U normales de los
provenientes de una desanimación?

¿Por qué 2’-didesoxi en el

ADN?
 Dos grupos OH en el ARN lo hacen
mas susceptible a hidrólisis.
 El ADN sin OH en 2’ es mas estable
a la hidrólisis.
 fago T2
Organización del material genético

La gran cantidad de DNA en las

células …
Plantea algunos problemas:
Como se organiza toda la
La transcripción selectiva:
La compactación: Es necesario
una compactación para que • Sólo se transcribe una
información genética en los
los ADN cromosomicos pequeña fracción de
puedan estar contenidos en DNA (5-10%). organismos
las celulas • Regulación: control
estricto de las DNA y
Ej. El ADN diploide de una RNA polimerasas
célula humana tiene ~ 8x
109 pb (3 m) que debe ser
empaquetado dentro del
núcleo (diam= 10✁m).

Tipo y tamaño del genoma de

Cromosomas
algunos organismos
Material genético organizado
que varia en la escala
evolutiva, pasando de
moléculas de ácido nucleico
lineal o circular encerradas en
cápsides de virus, largas
moléculas de ADN doble hélice
circular prácticamente
desnudas y organizadas en
dominios como en las
bacterias, o enormes moléculas
de ADN que interaccionan con
proteínas histónicas y no
histónicas como en los
eucariontes.
 El genoma viral
 A menudo las partículas víricas consisten de un
genoma (ARN o ADN) rodeado por una envoltura
proteica
 Prácticamente todos los virus vegetales y algunos
virus bacterianos y animales contienen ARN. Estos
genomas son generalmente muy pequeños
 Muchos DNA víricos son circulares durante al
menos una parte de su ciclo vital.
 Los ADN lineales víricos suelen circularizarse y
todos los monocatenarios se convierten en doble
cadena.
Organización del ADN
En eucariotas el material genético (ADN) esta distribuido
en cromosomas, cada cromosoma es una única molécula de
ADN lineal (Núcleo)
 Las mitocondrias y los cloroplastos de las células
eucariotas también contienen ADN circular tipo plásmido.
Superenrollamiento de la doble hélice
Organización del ADN
 Los procariotes contiene una única molécula de ADN
circular de doble hebra.
 Muchas bacterias contienen una o mas pequeñas
moléculas de ADN circular libres en el citoplasma
(Plásmidos)
Superenrollamiento de la doble hélice
 El superenrollamiento es una forma de
compactación del ADN
 Se refiere al enrollamiento del eje de la hélice
de ADN sobre si mismo.
El superenrollamiento ocurre cuando la
doble hélice cruza sobre ella misma alrededor
de su propio eje.
Superenrollamiento de la doble hélice
 El superenrollamiento puede ocurrir solo en
estructuras cerradas porque una molécula abierta
puede liberar la torsión simplemente con un giro
invertido
 Los genomas circulares y las formas cerradas de
la molécula de ADN que asemejan un circulo
(loops), pueden sufrir SUPERENROLLAMIENTO.
La doble hélice representa al ADN como una
molécula lineal, pero el ADN in vivo generalmente
presenta estructuras cerradas.
 Superenrollamiento de la doble hélice Superenrollamiento de la doble hélice

 El superenrollamiento es manifestación de una

tención o perturbación estructural de la molécula de
ADN (Topoisomerasas)

Superenrollamiento de la doble hélice Superenrollamiento de la doble hélice

El superenrollamiento puede ser:

 En genomas bacterianos y  Negativo: Giro del ADN alrededor de su eje en

eucarióticos el ADN puede
formar grandes loops o bucles
que asemejan a un circulo
Una molécula cerrada puede
perder su superenrollamiento
con el rompimiento de una de
las hebras de la molécula de
ADN circular.
la dirección opuesta a las manecillas del reloj
 Positivo: Giro a favor de las manecillas del
reloj.
 La nomenclatura actual para describir el
superenrollamiento es basado en el concepto de
número linking (Lk)
 Lk: Numero de veces que las dos hebras del ADN
Cruza la una sobre la otra.
Lk = Tw + Wr

Superenrollamiento de la doble hélice

Superenrollamiento de la doble hélice

Tw: numero total de

giros del duplex,
determinado por el
numero de pares de
base por giro de hélice
Wr: numero de giros
del eje del duplex en el
espacio.
En una molécula
relajada Wr = 0
 Superenrollamiento de la doble hélice Superenrollamiento de la doble hélice

 El cambio en Lk viene dado por la ecuacion:

Lk = Tw + Wr
 Un decrecimiento en Lk corresponde a
superenrollamiento negativo
 Un aumento en Lk corresponde a la
disminución de súper enrollamientos negativos
 Lk es invariable en cualquier molécula de ADN
cerrada, excepto que haya rompimiento y
reasociación de las hebras
Estructura terciaria del ADN

Superenrollamiento de la doble hélice

Superenrollamiento de la doble hélice

 Esta operación puede ser realizada por unas

enzimas, las topoisomerasas.

 Topoisomerasa I, relaja el ADN

ATP
Topoisomerasa II Superhelicoides
Mg2+

Superenrollamiento de la doble hélice Superenrollamiento de la doble hélice

Topoisomerasas Topoisomerasa clase II

• Esta se une al ADN
Enzimas que cambian el numero linking
• Crea un corte en la doble
• Topoisomerasas clase I cadena
• Topoisomerasas clase II • Pasa una cadena no
cortada a traves de la
La DNA Girasa es una topoisomerasa que puede abertura
introducir superhelicoides • Posteriormente sella de
nuevo la doble hélice
• Requiere ATP
 Superenrollamiento de la doble hélice Superenrollamiento de la doble hélice

Topoisomerasa clase I a. Las topoisomerasa tipo II pueden

encadenar o desencadenar un
• Esta se une al ADN ADN covalentemente cerrado
b. Las topoisomerasas tipo I pueden
• Crea un corte en una solo encadenar y desencadenar
sola hebra del duplex moléculas de una hebra de ADN
que tengan una abertura, porque
• Pasa la hebra no esta enzima corta solo una hebra de
cortada a traves de la ADN.
abertura c. Moléculas de ADN lineal y de gran
longitud, Ej. Durante la replicación
• Posteriormente sella de del cromosoma eucariótico, puede
nuevo la hebra cortada ser desenrollado por una
Topoisomerasa II.
• El proceso incrementa
d. El ADN en forma de lazo puede ser
el numero Linking en +1. desanudado por la acción de
topoisomerasas
• No requiere ATP

Superenrollamiento de la doble hélice Superenrollamiento de la doble hélice

Mecanismo de acción de las Topoisomerasas Mecanismo de acción de las Topoisomerasas

a. Diagrama esquemático de la reacción de

clivaje y reasociación mostrado en una sola
hebra. El mismo mecanismo es utilizado por la
topoisomerasa II, aunque se requieren dos
subunidades de la enzima, las topoisomerasas
algunas veces corta en el extremo 5’ y otras
veces en el 3’.
b. Intermediario covalente de fosfotirosina.

Superenrollamiento de la doble hélice Superenrollamiento de la doble hélice

Mecanismo de acción de las Topoisomerasas

Los topoisómeros
pueden ser separados
por electroforesis
Estructura “cuaternaria”: unión a proteínas

cromosoma bacteriano

Cromatina
• Material filamentoso de los cromosomas
eucariotas, formado por DNA con las histonas y
las otras proteínas asociadas.

• Durante la interfase se dispersa y ocupa la >

parte del núcleo.
• Durante la división nuclear se condensa para
formar los cromosomas compactos.

Corpúsculo de Barr

✂ (Murray Barr 1949) ✄ 40

 Empaquetamiento del DNA

Doble hélice

Nucleosoma (Octámero de Histonas)

Solenoide (Histona H1)

Composición del Cromosoma

(Cromatina)

Proteínas : básicas -> histonas
ácidas -> no histonas (~30%)

DNA

RNA (1%)
Tasa de empaquetamiento: 1:50.000-100.000

Organización estructural del cromosoma Organización estructural del cromosoma

Histonas
Histonas
 Están presentes en una cantidad ~ de 1 gramo/
 Se encuentran 5 tipos de histonas: H1, H2A, H2B, H3, y H4 gramo de DNA.
 Son ricas en aminoácidos básicos cargados positivamente (Lys,  Las histonas H2A, H2B, H3 y H4 siempre están en
Arg) , las cuales interactúan con las cargas negativas de los grupos cantidades equimolares.
fosfatos del ADN.
 Son los bloques de construcción básica de la estructura de la
cromatina
 La secuencia de aminoácidos de las histonas en especies distantes
es muy similar lo que demuestra que son altamente conservadas.
 La secuencia de H1 varia mas de organismo a organismo
 Se ha observado que H1 en algunos tejidos es remplazada por
histonas especiales.

Organización estructural del cromosoma

 Organización estructural del cromosoma Organización estructural del cromosoma

Cromatina: extendida Estructura del nucleosoma

 En la forma extendida la cadena de ADN esta compuesta por un

ADN libre (ADN linker) que conecta a las estructuras llamadas
nucleosomas (Asociación ADN e Histonas).
 El ADN que esta asociado a las histonas, es menos susceptible a
degradación con nucleasas que el ADN linker ubicado entre ellos.
Degradación con
nucleasa

Organización estructural del cromosoma Organización estructural del cromosoma

Estructura del nucleosoma
 En la parte superior se muestra la Estructura del nucleosoma
estructura extendida de una fibra de
cromatina.  El nucleosoma es la
unidad estructural de
 La digestion ligera con nucleasa libera primer orden para el
mononucleosomas y oligonucleosomas. empaquetamiento del
DNA en la cromatina.
 Al digerirse el DNA ligador se liberan  Está formado por 146 pb
las proteínas no histonas y la H1 para de DNA que envuelven
dar lugar a la partícula central. 1.75 veces un núcleo de
proteínas histonas.

Organización estructural del cromosoma Organización estructural del cromosoma

Estructura del nucleosoma Estructura del nucleosoma

 La longitud del DNA entre los nucleosomas puede variar
El núcleo es un octámero que contiene dos copias de
entre 20 pb y + de 100 pb.
cada una de las proteínas H2A, H2B, H3, y H4.
 El DNA ligador: internucleosómico está ocupado por las
histonas H1 y por proteínas no histonas.
 Organización estructural del cromosoma Organización estructural del cromosoma

La cromatina forma una estructura de orden superior La cromatina forma una estructura de orden superior
 En este plegamiento los
 La formación de nucleosomas son
nucleosomas es una parte de empaquetados en una espiral
la compactación del DNA. irregular o solenoide.
 El siguiente paso es el
la histona H1 la
plegamiento de la fibra con
cuentas en una fibra más encontramos haciendo parte
gruesa. del solenoide, una molécula
 Estas fibras tienen unos 30 H1 se asocia a cada
nm de diámetro y pueden núcleosoma.
plegarse aun más sobre sí
mismas.
6 nucleosomas por giro

solenoide 30 nm
Organización estructural del cromosoma

La cromatina forma una estructura de orden superior

 Parte del núcleo

tiene fibras de
cromatina
parcialmente
condensadas.
 Fibra de
cromatina en la
que parte está
condensada y
parte está abierta
para la
transcripción.

Organización estructural del cromosoma

Organización estructural del cromosoma eucariota
La cromatina forma una estructura de orden superior La cromatina forma una estructura de orden superior

 Aunque las histonas son las proteínas predominantes en los

cromosoma, ciertas proteínas no histonicas están involucradas
en la organización de la estructura del cromosoma.
 El ADN se asocia a un andamio cromosomal (scaffold)
compuesto de proteínas no histónicas.
 El andamio presenta la misma forma de los cromosomas en
metafase y persiste cuando el ADN es degradado con nucleasas.
Bucles de
cromatina
 Organización estructural del cromosoma Organización estructural del cromosoma

La cromatina forma una estructura de orden superior La cromatina forma una estructura de orden superior
 Las cadenas de DNA
aparecen como bucles  Algunos dominios de bucles que corresponden a los genes
enormes que salen de un no transcritos de una célula, pueden estar superenrollados
andamiaje de proteínas permanentemente en fibras de 30 nm (Heterocromatina).
unidas.
 Regiones de cromatina más abiertas, corresponden a
 En un cromosoma promedio dominios relajados en los que puede producirse la
existen ~ 1000 bucles transcripción (Eucromatina).
 Andamiaje nuclear o matriz  Las topoisomerasas pueden producir cambios del
nuclear: se da en interfase. superenrollamiento de un bucle determinado, estos
 - Incluye la envoltura cambios pueden intervenir en la condensacion del
cromosoma y son esenciales durante la replicación y la
laminar de la parte interna transcripción.
de la membrana nuclear
junto con una red de fibras
finas.

Organización estructural del cromosoma

Organización estructural del cromosoma

Regiones de fijación a la matriz (MAR) Estabilidad de la estructura condensada de los cromosomas

Intervienen varias proteínas:
 Fragmentos específicos 1. Histonas
de DNA pegados a la 2. Topoisomerasa
matriz nuclear que
contienen MAR. 3. Proteínas SMC (structural maintenance of
chromosomes):
 Contienen grupos de a) Cohesinas: ligamiento de las cromátidas después de
genes individuales que se la replicación, las mantienen unidas hasta la
expresan de manera condensación de los cromosomas
coordinada. b) Condensinas: esenciales para la condensación de los
cromosomas hasta que la célula entra en mitosis.

Organización estructural del cromosoma Organización estructural del cromosoma

Cambios en la estructura cromosómica durante el ciclo
Proteínas SMC
celular en células eucariotas

Modelo del efecto de las  Fase G1:la célula contiene 2 copias de

c/cromosoma (estado diploide
condensinas en el normal)
superenrollamiento del  Fase S: el DNA se replica
DNA  Fase G2: tiene un contenido de DNA
4 veces la cantidad haploide.
Estructura de las proteinas SMC  Mitosis: división de la célula.
a) Los dominios de la estructura
primaria: N y C denotan los  - Profase: condensación del DNA
dominios amino terminal y (cromátidas)
carboxil terminal
respectivamente  Metafase: se forma el huso mitótico
b) Cada polipéptido es plegado de
manera que los dos dominios  Anafase: las cromátidas se separan
superenrollados se envuelven uno
a otro
 Compactación del DNA en un cromosoma eucariota
Organización estructural del cromosoma
Formación de
1 cromatina 2
Formación de un bucle y de la
superestructura de la cromatina  Cada cromosoma posee una molécula de ADN lineal
(30 nm) empaquetada en nucleosomas y plegada en fibras de
cromatina de 30 nm, la cual esta unida a un andamio de
proteínas en sitios específicos.
Andamiaje nuclear, Formación de dos
formación de bucles y cromátidas hermanas  Un plegamiento adicional del andamio (Scaffold),
superenrollamiento
compacta la estructura en una forma condensada
superior de los cromosomas en metafase.

3 4

Compactación del ADN

en un cromosoma

Organización del DNA

DNA procariota DNA eucariota

Un solo cromosoma
En una molécula grande de DNA
circular, con una pequeña fracción
de plásmidos.
Está superenrollado
 Forma complejos con proteínas
Se denomina nucleoide bacteriano
Se encuentra libre en el citosol
La > parte son haploides
La transcripción y traducción se
acoplan de manera directa
Genoma dividido en varios
cromosomas.
c/u contiene una molécula de DNA
lineal muy grande
Forman complejos con proteínas
(histonas)
Se encuentran dentro del núcleo
celular (no están en división)
La > parte son diploides, algunas
son poliploides (cromosomas
politénicos)
La transcripción y traducción NO
se acoplan de manera directa