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Facultad de Medicina
Escuela Luis Razetti
Cátedra de Bioquímica
TEMA 2. Aminoácidos
Estructura y propiedades ácido base
Vanessa Miguel
@bioquitips
Noviembre 2012
Objetivos generales del Tema 2
Objetivos Contenidos
1) Reconocer la fórmula Carbono alfa, grupo amino, grupo carboxilo y
general de los aminoácidos cadena lateral (R)
2) Describir las características Cadenas alifáticas, aromáticas, ácidas y
de los tipos de cadena básicas
lateral de los aminoácidos
3) Clasificar los aminoácidos Polaridad, carga eléctrica, grupos aromáticos,
según las características de propiedades ácido-base
su cadena lateral
4) Describir las propiedades Ionización de los grupos alfa amino, alfa
ácido-base de los carboxilo y cadenas laterales
aminoácidos.
5) Definir punto isoeléctrico (pI) Carga del aminoácido
de los aminoácidos.
6) Representar la curva de Representación de pH versus equivalentes de
titulación de los aminoácidos base añadidos a soluciones de aminoácidos
monoamino-monocarboxílico, aminoácidos
diamino-monocarboxílico y aminoácidos
monoamino-dicarboxílico.
7) Interpretar la curva de Identificación de pKs y pI
titulación de los aminoácidos
8) Representar las formas Ionización de los grupos alfa amino, alfa
iónicas de los aminoácidos a carboxilo y cadenas laterales a la
diferentes pH concentración de H+
9) Calcular la carga neta de los Suma algebraica de cargas de los grupos alfa
aminoácidos a diferentes pH amino, alfa carboxilo y cadenas laterales
y el punto isoeléctrico
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Actividad de Aprendizaje
McKee, T. y McKee, J.R (2009) Bioquímica. 4ta ed. Madrid: Editorial Mc Graw
Hill.
Murray, R.; Bender, D.; Botham, K.; Kennelly, P. Rodwell, V. y Weil, P. (2010)
HARPER, Bioquímica ilustrada. 28o ed. México: McGraw Hill.
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Actividad de Aprendizaje
Los aminoácidos son los bloques constituyentes de las proteínas. Casi todas las
proteínas consisten en diversas combinaciones de los mismos 20 aminoácidos,
conocidos como aminoácidos estándar o alfa aminoácidos. Desde el punto de vista
químico, los alfa aminoácidos son compuestos que presentan, unido al mismo
átomo de carbono (conocido como carbono α), un grupo ácido débil, carboxilo (-
COOH), un grupo básico débil, amino (-NH2), y una cadena lateral (R), que define
las propiedades particulares de cada aminoácido. La estructura general de los α-
aminoácidos (a excepción de la prolina que es cíclica) es la siguiente:
Dado que ambos grupos funcionales (amino y carboxilo) son susceptibles a los
cambios de pH, ningún aminoácido se encuentra de esa forma, sino que se
encuentra ionizado. De acuerdo con la naturaleza del grupo R se pueden clasificar a
los aminoácidos en polares (con y sin carga) y aminoácidos no polares (ver Fig, 1).
Para una mejor visualización, puedes revisar el esquema de clasificación de los
aminoácidos en http://www.educaplus.org/play-47-Amino%C3%A1cidos.html
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Figura 1. Clasificación de los aminoácidos
(http://www.genomasur.com/lecturas/Guia02-2.htm)
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Propiedades ácido base
Tanto el grupo amino como el grupo carboxilo, son grupos químicos ionizables o
protonables, es decir, son grupos capaces de ceder o ganar un protón y en ese
proceso, ganar o perder una carga negativa o positiva, tal como se observa en las
siguientes ecuaciones:
Un aminoácido puede tener hasta tres grupos con carácter ácido-base: el α -amino,
el - α carboxilo y, en algunos casos, el grupo –R. Lo importante es que estos grupos
poseen un carácter ácido-base débil, lo que hace que dependiendo del pH, el
correspondiente equilibrio pueda desplazarse hacia la formación de la especie
protonada o hacia la formación de la especie desprotonada. En otras palabras, la
forma iónica predominante de los aminoácidos en soluciones acuosas depende del
pH, es decir, de la concentración de protones libres en el medio. Este aspecto es
importante, pues de ello dependen las propiedades químicas y la funcionalidad
biológica de los péptidos y las proteínas que ellos conforman. Entre otras cosas, las
propiedades ácido-base de los aminoácidos también se aprovechan para la
separación y purificación de los aminoácidos y las proteínas.
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Veamos por qué esto es así:
El grupo α-carboxilo presenta dos formas posibles, una protonada y sin carga (-
COOH), y otra desprotonada y cargada negativamente (-COO-), según el equilibrio
anteriormente presentado en la ecuación (1). Si el pH de la solución aumentase
(disminución de la concentración de protones libres), el equilibrio se desplazaría
hacia la derecha (predominando en la solución la forma con carga -1) y si el pH
disminuyese (aumento de la concentración de protones libres), el equilibrio se
desplazaría hacia la izquierda (predominando en la solución la forma con carga 0).
De igual manera, con el grupo α-amino ocurriría algo similar. El grupo α-amino
presenta dos formas posibles, una protonada y cargada positivamente (-NH3+), y
otra desprotonada y sin carga (-NH2), según el equilibrio anteriormente presentado
en la ecuación (2). Si el pH de la solución aumentase, el equilibrio se desplazaría
hacia la derecha (predominando en la solución la forma con carga 0) y si el pH
disminuyese, el equilibrio se desplazaría hacia la izquierda (predominando en la
solución la forma con carga +1). De modo que en función del pH, la proporción de
forma protonada o forma desprotonada de cualquiera de estos dos grupos variará,
con predominio de una forma u otra (Ver Fig. 2)
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Supongamos que la solución se encuentra a pH 1. Bajo estas condiciones
tendríamos un exceso de protones en el medio y ambos equilibrios estarían
desplazados hacia las formas protonadas. Si aumentamos el pH los equilibrios
comenzarían a desplazarse hacia la derecha hasta llegar a un pH muy básico, en el
cual, las formas predominantes serían las desprotonadas.
ya que para que el pH sea igual al pKa, se debe cumplir que las concentraciones del
ácido y de la base conjugada sean iguales:
pH = pKa
Por su parte el grupo α -carboxilo tiene un pKa cercano a 2, por lo que el 50% de
este grupo estará protonado cuando el pH del medio sea igual a 2.
En general,
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carga 0. Por su parte, el grup α-amino también estaría protonado, aunque en este
caso la carga del grupo sería +1, como se observa en la Fig. 2
(http://jano-coach.blogspot.com/2011/09/propiedades-acido-base-de-los.html)
A pH= 2, tendríamos que este valor de pH sería igual al pKa del grupo α-COOH, por
lo que un 50% del mismo estaría protonado y un 50% estaría desprotonado. Por lo
tanto la mitad del grupo - α COOH estaría cargado negativamente y la otra mitad no
tendría carga. A este pH el grupo a-COOH seguiría protonado y con carga 0, puesto
que se cumpliría que pH<pKa. Lo mismo le ocurriría al grupo α -amino, cuya carga
sería de +1.
A pH= 4, el pH coincide con el pKa del grupo R-COOH que estaría protonado en un
50%. El α-COOH estaría desprotonado y el α-amino estaría protonado. A pH=7 los
dos grupo -COOH estarían desprotonados y el de grupo amino seguiría igual, hasta
llegar a pH= 9, donde el α- amino estaría desprotonado en un 50%. Visto esto,
podemos concluir que la carga total de un aminoácido depende del pH de la
solución en la que se encuentre. Los amino son excelentes amortiguadores, gracias
a la capacidad de disociación del grupo carboxilo, del grupo amino y de otros grupos
ionizables de sus cadenas laterales (carboxilo, amino, imidazol, fenol, guanidino,
etc).
pI = (pKa1 + pKa2) / 2
Por ejemplo, para la glicina (pK1=2,22 y pK2=9,86, el pI es 6,04. A pH=6,04 las
moléculas de glicina estarán en forma de iones zwitterión y no se desplazan hacia
ningún polo al aplicarles un campo eléctrico.
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Valores de pK de algunos aminoácidos
Actividad de Aprendizaje
Actividad de Práctica
Trata cada uno por separado: R-NH3+y R-COOH. En este caso R es todo el resto
del aminoácido.
R-NH3+ +
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1.3 ¿Qué sucede si aumenta la concentración de H+?
1.4 ¿Qué sucede si disminuye la concentración de H+?
R-COOH +
Todos los grupos R-COOH en los aminoácidos tienen valores semejantes entre sí
(cercanos a 2) e igualmente ocurre con los grupos R-NH3+ (cercanos a 9).
Recuerde que la ionización de un grupo comienza aproximadamente a un valor pH
cercano a 2 unidades de por debajo de su pK y alcanza un 100% de ionización
aproximadamente a 2 unidades de pH por encima de su pK.
pK1= 2,35
pK2= 9,78
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Si se comienza a agregar una base como NaOH, la cual es una base fuerte que se
disocia completamente según la reacción:
-
NaOH Na+ + OH
2.2. Representa las formas iónicas del aminoácido glicina a un pH igual al pK del
grupo carboxilo.
2.4 Si aumenta más el pH, llega el momento en el cual todos los grupos carboxilos
estarán disociados (habrán perdido un protón cada uno). Dibuja la forma iónica
molecular en la cual se encuentra la glicina a un pH 7, el cual es aproximadamente
intermedio entre los valores de pK de los grupos carboxilo y amino.
2.5 ¿Cuál es la carga neta que a este pH tendrán las moléculas de glicina?
2.9 ¿Cuál es la carga neta que a este pH tendrán las moléculas de glicina?
Debes poder dibujar las formas moleculares a pH muy bajo, muy alto, igual a cada
uno de los pK y al punto isoeléctrico del aminoácido.
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pK1= 2,19
pKR= 4,28
pK2= 9,66
El cual, para simplificar vamos a representar así, sólo tomando en cuenta los grupos
disociables:
pK1= 2,17
pK2= 9,04
pKR= 12,48
El cual vamos a representar así, tomando en cuenta solo los grupos disociables:
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a disociar primero.
4.1Dibuja la forma en la cual se encuentra la arginina a pH 1:
4.2 Dibuja las formas a pH igual al pK1 y calcula la carga neta.
4.3 Dibuja las formas a pH igual al pK2 y calcula la carga neta.
4.4 Dibuja las formas a pH igual al pKR y calcula la carga neta.
4.5 Identifica un intervalo de pH al cual la arginina no tenga carga neta.
4.6 Los dos pK más cercanos al punto en el cual el aa no tiene carga son los que se
tomarán en cuenta para calcular el pI. Calcúlalo.
5. Identifica las cadenas laterales de los aminoácidos que pueden interactuar con el
agua (polares). Dibuja algunas de esas interacciones.
6. Identifica las cadenas laterales de los aminoácidos que no pueden interactuar con
el agua (no polares).
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Actividad de Laboratorio
Titulación de Aminoácidos
Objetivo General:
Introducción
Materiales
Medidor de pH con su electrodo (pHmetro).
Pipetas.
Fiola o vaso de precipitado.
Agitador magnético.
Barra magnética.
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Soluciones
- Solución preparada con 1,5 g de Glicina, diluidos en agua hasta un volumen
de 400 mL y ajustada a pH 1,7
- Solución preparada con 0,8 g de NaOH, diluidos en agua hasta un volumen
de 400 mL.
Procedimiento
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4. Completa la siguiente tabla:
NaOH añadido pH
mL moles
Solución de glicina
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
17
18
6. Identifica en el gráfico los rangos de amortiguación ¿Cuáles son los valores?
¿Cuál corresponde al grupo carboxilo y cuál al grupo amino?
7. Completa el siguiente cuadro:
pKa1 =
pKa2 =
pI =
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c) Identifica las formas moleculares de los aminoácidos a valores de pH igual
al pKa de sus grupos ionizables.
d) Identifica el punto isoeléctrico (pI) de los aminoácidos
Investiga en línea
Respuesta
21