El rol de la phototropina 1 y 2 en la regulación y en la relación de la vía de señalización de luz azul

en (brassicaceae: Arabidopsis thaliana )

1Darwin Pava, 2Jeson Obduver Gomez, 3Yudeli Cardozo
1,2,3Estudiante de la universidad de la amazonia, Facultad de ciencias Básica, Programa de Biología

Florencia – Caquetá

2019

e-mail*: je.gomez@udla.edu.co

Resumen

La fototropina es el conjunto fotorreceptores que regulan el crecimiento de la planta como repuesta a

determinadas longitudes de onda de luz solar, en Arabidosis thaliana estos receptores son los que
codifican los genes Phot 1 y Phot 2 además de regular esta señal de luz azul especialmente. En el
presente proyecto se identificaron los genes Phot 1 y Phot 2 los cuales se encontraron asociados a
procesos de fototropina en la especie de Arabidosis thalina. Para esto se utilizo la base de datos NCBI
“National Center for Biotechnology Information, por medio de la herramienta de BLAST se pudo
identificar los domains, ORFfinder. Se conocieron los marcos abiertos de lectura para las proteínas y
Pfam, se identificaron las proteínas de PAS 9 y Pkinase que son las encargadas del proceso de la
captación luz azul por procesos intracelulares en los criptocromos como phot 1 donde este presentaba
una longitud de onda baja y mientras en phot 2 encontramos una alta cantidad de luz permitiendo
estar sincronizadas a estos genes para aprovechar los procesos fotosintéticos, de esta manera
contribuyendo a la activación de factores de trascripción.

General

Identificar los genes asociados con la fototropina en Arabidosis thaliana.

Especifico

Conocer el rol de phot1 y phot 2 en la captación de luz azul en Arabidopsis thaliana.

Caracterización de los dominios funcionales de las proteínas involucradas en el fototropismo.

Enunciar la importancia biológica del gen phot1 y phot2 en Arabidopsis thaliana.

Introducción

Arabidopsis thaliana es una planta herbácea que se conoce en el campo de la biología molecular por sus
múltiples estudios referentes a su genoma ya que es considerablemente pequeño y se encuentra
organizado en 5 cromosomas. En varias de las amplias líneas de investigación que han desarrollado
sus investigaciones en este modelo como; Genómica, Análisis de expresión, ,Transcriptomica,
Proteómica y Metabolómica las cuales han proporcionado gran parte de la información para la
fundamentación de la biología moderna(Cuesta, Candela & Cires, 2016).La función que tiene esta proteína
pho1 y pho2 en el cual ellas necesitan la luz para su estimulación ambiental es la encargada de regular
numerosos semblantes del crecimiento y desarrollo de las plantas.

El fototropismo como medio para la alineación en el crecimiento de ramos hacia la fuente de luz
direccional es muy importante ya que durante la germinación se encarga de captar la luz e interviene
en el crecimiento avanzado de las plántulas. En otras palabras, la fotomorfogénesis según los
investigadores (Christie y Murphy, 2013; Fankhauser y Christie, 2015). Las plántulas que presentan un
tipo de crecimiento negativo se le denomina crecimiento oscuro, este fenómeno ocurre debido a la poca
luz que se logra captar (etioladas) y que son útiles para estudiar el fototropismo en ambas especies
monocotiledóneas y dicotiledóneas (Christiey Murphy, 2013).

Estudios recientes realizados en Arabidopsis thaliana, demuestran que en todas las plantas con flores
que contienen dos Fototropinas (phot1 y phot2) se sobreponen en la función para regular el
fototropismo de hipocotilo. Phot1 que es receptor fototrópico mediador de curvatura baja (≤1 lmol m-
2 sec-1) y alta (>1 lmol m-2 sec-1) del mismo modo que phot2 funciona a mayores intensidades de luz
(Sakai et al., 2001). Donde la luz azul es la que le da detención a los receptores criptocromo que son los
que contribuyen a regular su capacidad de dar respuesta fototrópica en Arabidopsis (Whippo y
Hangarter, 2003). De igual manera, que el fitocromo es el encargado de modular el hipocotilo de manera
análoga a la Curvatura (Sakai y Haga, 2012; Goyal et al., 2013). Nos da un ejemplo de los pretratamientos
que tienen las plántulas etioladas desde arriba. De modo que tiene una presencia de captación de la luz
roja u azul presentando una estimulación a la luz azul que es direccional admitiendo una respuesta a la
curvatura en acción phyA (Sullivan et al., 2016a). Conjuntamente el fototropismo phot1 y phot2 que son
los encargados de controlar los rangos y dar respuestas a otros como es el foto movimiento que contiene
posicionamiento de las hojas, de forma tal que dan una reubicación a los cloroplastos y abren una
apertura de estomas (Christie et al., 2015), de tal manera que todo puede ser contribuido y de este modo
optimizar la fotosíntesis. Sin embargo, la luz que se captura es la que promueve el crecimiento en
condiciones de poca radiación (Takemiya et al., 2005).La fototropina (phot1) es una quinasa agrupada
a la membrana del plasma activada por luz azul por el contrario es Fotorreceptor.
Metodología

Para esta investigación se realizo mediante la plataforma de NCBI para determinar las secuencias de las
proteínas involucradas en los procesos que intervienen en los fotorreceptores de la luz azul de la planta
Arabidopsis Thaliana, en primera medida se determinó el Marco de Lectura Abierto para obtener la
proteína codificada finalmente, por medio de la herramienta Pfam se caracterizó las estructuras
primarias de las proteínas en dominios funcionales.

Resultados y discusión

Figura 1. El fasta de phot 1

>ArthPHOT1
ATCAATCATGAAACCTAAATAGTTTTTTAATCTTTCTAGAATCTCTTCTTATCAAAAAATTTCCTTATTT
GTATAAAAAGCCTCGGGAAAGTTAACTTCTCATCCCAAACTCATTCCTCAGTTTATCTCTCGACTAGAGA
GTGAAGGAAAAATCGAAGGATAATCTGTTTCTTCCAGCACAAGTTAACTTGCAAGAGAGAGCTCAAAGAT
GGAACCAACAGAAAAACCATCGACCAAACCATCTTCTCGGACTCTACCTAGAGACACTCGTGGCTCTCTC
GAAGTATTCAACCCGTCAACTCAGCTGACCCGACCCGATAACCCGGTGTTCCGTCCTGAACCACCAGCGT
GGCAAAACTTGAGTGATCCACGTGGCACCAGTCCTCAACCCCGACCACAACAAGAACCAGCTCCATCCAA
CCCTGTTCGGTCTGATCAAGAAATCGCTGTCACGACCTCATGGATGGCTCTGAAAGACCCATCACCGGAG
ACAATCTCCAAGAAGACGATCACCGCCGAGAAACCACAGAAGTCGGCGGTGGCGGCTGAGCAGAGAGCGG
CAGAGTGGGGATTGGTTTTGAAGACCGATACAAAGACGGGAAAGCCACAAGGAGTAGGCGTGAGGAACTC
TGGTGGAACTGAGAATGATCCTAACGGGAAAAAGACTACATCGCAGAGAAACTCGCAAAACTCTTGCCGG
AGCTCCGGTGAGATGTCGGACGGAGATGTTCCCGGCGGGAGGAGTGGGATTCCAAGAGTATCGGAAGATC
TAAAAGATGCGTTGTCGACGTTTCAACAAACGTTTGTGGTCTCAGATGCTACAAAACCTGATTATCCGAT
TATGTATGCAAGTGCTGGTTTCTTCAATATGACTGGTTACACTTCCAAAGAAGTCGTCGGCAGAAACTGC
CGATTTTTACAAGGATCAGGTACAGATGCAGATGAGTTAGCAAAGATAAGAGAGACATTAGCTGCTGGTA
ACAATTATTGTGGGCGTATATTGAATTACAAGAAAGATGGGACCTCTTTTTGGAATCTTCTCACGATTGC
TCCCATTAAAGACGAGAGTGGCAAAGTCCTCAAATTTATCGGAATGCAAGTGGAGGTGAGCAAGCACACT
GAAGGGGCCAAAGAAAAGGCTTTGAGGCCCAATGGGCTTCCGGAATCTCTGATTCGATACGATGCCCGCC
AAAAAGATATGGCGACAAACTCAGTGACAGAGCTAGTAGAGGCGGTGAAGAGACCTCGGGCACTAAGCGA
ATCGACGAATCTCCATCCCTTCATGACAAAATCGGAGAGCGATGAACTTCCGAAAAAACCAGCTCGGCGA
ATGTCCGAAAATGTTGTTCCGTCAGGCCGAAGAAACTCTGGCGGCGGAAGAAGAAACTCGATGCAGCGAA
TCAACGAAATTCCCGAGAAAAAATCTAGAAAATCTTCCCTTTCCTTCATGGGGATCAAGAAGAAGAGCGA
ATCTTTGGATGAATCTATAGACGATGGATTTATAGAGTATGGAGAAGAAGACGATGAGATTAGTGATAGG
GACGAGAGACCTGAGAGTGTGGATGATAAAGTGAGACAAAAGGAAATGAGAAAGGGTATTGATCTAGCTA
CTACACTCGAACGTATCGAGAAGAATTTCGTCATCACTGATCCTAGGCTTCCCGATAATCCCATTATTTT
TGCATCTGATAGTTTCTTGGAGCTCACGGAATATAGCCGTGAAGAAATTCTTGGAAGAAATTGCAGGTTT
CTACAAGGTCCAGAGACTGATCTAACCACAGTGAAGAAGATTCGAAATGCTATTGATAACCAAACCGAAG
TGACAGTTCAGCTCATCAACTACACCAAGAGCGGAAAGAAGTTCTGGAACATTTTCCACTTGCAACCTAT
GCGTGATCAGAAGGGAGAAGTACAATACTTTATTGGAGTTCAACTAGACGGGAGCAAGCACGTAGAACCA
GTTCGCAATGTCATTGAAGAAACCGCAGTGAAAGAGGGAGAAGACCTGGTGAAAAAAACAGCTGTGAATA
TCGATGAAGCGGTTCGAGAACTTCCTGATGCCAACATGACACCAGAGGATTTATGGGCAAACCACTCAAA
GGTTGTTCATTGTAAGCCTCACAGGAAAGATTCACCACCATGGATAGCTATCCAAAAGGTGTTGGAAAGT
GGTGAACCGATTGGTTTGAAGCATTTCAAACCGGTGAAACCTTTGGGTTCTGGTGACACAGGAAGTGTGC
ATCTAGTGGAACTCGTTGGAACAGATCAGTTGTTTGCAATGAAAGCAATGGACAAGGCTGTTATGCTTAA
CCGAAACAAAGTACATAGAGCTAGAGCTGAGAGAGAGATCCTAGATTTGCTTGACCATCCTTTTCTTCCT
GCACTCTACGCTTCTTTTCAGACAAAAACACATATATGTCTTATAACAGATTACTATCCAGGAGGAGAAC
TCTTCATGCTCCTAGATCGACAACCTAGGAAGGTTCTCAAAGAAGATGCTGTAAGATTCTATGCTGCTCA
AGTTGTCGTTGCACTCGAGTATCTTCACTGTCAAGGAATAATTTACCGAGACTTGAAACCGGAAAACGTT
TTAATCCAAGGCAATGGCGATATCTCTTTGTCGGATTTTGATCTGTCTTGCTTGACATCTTGCAAACCTC
AGCTGTTGATTCCGAGTATAGACGAGAAGAAGAAGAAAAAGCAACAAAAGAGTCAACAAACTCCAATCTT
CATGGCTGAACCAATGCGTGCATCAAACTCATTTGTTGGCACTGAAGAGTACATTGCTCCGGAAATTATA
TCCGGAGCAGGACATACGAGTGCAGTAGACTGGTGGGCTCTTGGTATACTTATGTATGAAATGTTATACG
GATACACTCCTTTTAGAGGAAAAACAAGACAGAAGACTTTCACCAATGTTCTTCAAAAAGATCTCAAGTT
TCCAGCTAGCATTCCTGCAAGTCTTCAAGTGAAACAGCTGATTTTTAGGCTGTTACAACGAGATCCGAAG
AAAAGACTAGGTTGTTTTGAAGGAGCAAATGAAGTCAAGCAACATTCTTTCTTCAAAGGCATAAATTGGG
CTCTGATTCGATGCACGAACCCTCCAGAGCTCGAGACTCCGATATTTTCTGGTGAAGCTGAAAACGGAGA
GAAAGTTGTTGATCCTGAGCTAGAAGATCTGCAAACAAATGTTTTTTGAGATTTGGACTAAACGTTTATC
GTTTTCTTTTCAAGAATTGTTTGAAACTCTTTGTTCTCCAAAAATCTCGTTTTTAATTATTTTCATTTTA
CCATTATCTTTATTTATTTATAATGCCAAGTGTTTCTAATAATTTGTGTGAGTTTCTTAAGAATATGTTT
TTTATATATGTCAATAAAATTAATCAAGTTTTGCATATGTTTTTGTTTGTTTCATTAATCAAGTTATTAT
AATGCGAATTCATGTGATT

Se conoce la secuencia de nucleótidos para phot 1 con el codón de inicio AGA y terminación en TGA.

Figura 2. Marco abierto de lectura del gen phot1

Se evidencia que la figura 1 el ORF3 de la secuencia con los nucleótidos se encuentran la hebra + con el
frame 2 con un transcrito que inicia en el nucleótido 209 y termina en el 3199 nucleótido a si mismo la
longitud de la secuencia del gen phot 1 es de 2946 nucleótidos, finalmente este codifica una proteína
con 996 aminoácidos.

Figura 3. Fasta de la proteína

>ArthPHOT1
MEPTEKPSTKPSSRTLPRDTRGSLEVFNPSTQLTRPDNPVFRPEPPAWQNLSDPRGTSPQPRPQQEPAPSNPRSDQEIAVTTS
WMALKDPSPETISKKTITAEKPQKSAVAAEQRAAEWGLVLKTDTKTGKPQGVGVRNSGGTENDPNGKKTTSQRNSQNSCRSSG
EMSDGDVPGGRSGIPRVSEDLKDALSTFQQTFVVSDATKPDYPIMYASAGFFSKEVVGRNCRFLQGSGTDADELAKIRETLAA
GNNYCGRILNYKKDGTSFWNLLTIAPIKDESGKVLKFIGMQVEVSKHTEGAKEKALRPNGLPESLIRYDARQKDMATNSVTEL
VEAVKRPRALSESTNLHPFMTKSESDELPKKEPSGRRNSGGGRRNSMQRINEIPEKKSRKSSLSFMGIKKKSESLDESIDDGF
IEYGEEDDEISDRDERPESVDDKVRQKEMRKGIDLATTLERIEKNFVITDPRLPDNPIIFASDSFLELTEYSREEILGRNCRF
LQGPETDLTTVKKIRNAIDNQTEVTVQLINYTKSGKKFWNIFHLQPMRDQKGEVQYFIGVQLDGSKHVEPVRNVIEETAVKEG
EDLVKKTAVNIDEAVRELPDANMTPEDLWANHSKVVHCKPHRKDSPPWIAIQKVLESGEPIGLKHFKPVKPLGSGDTGSVHLV
ELVGTDQLFAMKAMDKAVMLNRNKVHRARAEREILDLLDHPFLPALYASFQTKTHICLITDYYPGGELFMLLDRQPRKVLKED
AVRFYAAQVVVALEYLHCQGIIYRDLKPENVLIQGNGDISLSDFDLSCLTSCKPQLLIPSIDEKKKKKQQKSQQTPIFMAEPM
RASNSFVGTEEYIAPEIISGAGHTSAVDWWALGILMYEMLYGYTPFRGKTRQKTFTNVLQKDLKFPASIPASLQVKQLIFRLL
QRDPKKRLGCFEGANEVKQHSFFKGINWALIRCTNPPELETPIFSGEAENGEKVVDPELEDLQTNVF

Encontramos las dos secuencias de la proteína PAS 9 con una coloración resaltada en amarillo y verde, en la otra
en rojo que es la Pkinasa describiendo como se encuentra esta proteína dentro de un gen codificadas
Figura 4. estructura primaria de la proteína que codifica el gen phot1

En la figura 2 se analizó que la posición de los dominios funcionales de la proteína que codifica para
gen Phot 1 se localizan en el recuadro naranja que se observa los dos dominios PAS 9 , y en azul el
dominio Pkinase; en la parte inferior de esto recuadro se muestra la longitud de cada dominio y esta
proteína mide 996 aminoácidos.

Figura 5. Fasta de phot 2

>ArthPHOT2
GTTGCAGCTGATAAAGCTACTCTGGTTGGTATATATATATTTTTCATTTATTTTATCTACTTCACCTTCTTTAACGTGTTTTG
TTGATTTGCTTCTAAAGACTTTTAATGGCATTTATTACTTTGTTTCTCGAACCTACAGTTGTGTCTGCCTCTTCTTTCTATCT
AACTTGTCTATGTGGTGTCTGGTTTTGATTTGCAGACTATTCATTACTCTGTTTCGCCATAAGAAAGAGAATAAAGAAACGTT
ATGGAGAGGCCAAGAGCCCCTCCATCTCCTTTGAATGATGCGGAGTCATTAAGTGAACGTAGATCTCTTGAGATTTTCAACCC
TTCGAGTGGAAAAGAGACACATGGATCAACTTCTTCTTCTTCAAAGCCTCCTCTTGATGGCAACAACAAAGGTAGTAGTAGTA
AGTGGATGGAGTTTCAAGATTCGCTAAGATTACAGAAAGAACCGCTGAATGGGGATTGTCAGCTGTTAAGCCGGATTCGGGAG
ACGATGGCATTAGTTTCAAGCTGTCCAGTGAAGTGGAACGAAGCAAGAACATGTCTAGGAGGTCATCCGAAGAATCTACATCT
TCTGAATCAGGGGCCTTCCCTAGAGTATCCCAGGAGCTCAAAACTGCTCTATCCACGTTGCAGCAGACTTTTGTTGTCTCTGA
CGCTACACAGCCTCACTGTCCCATAGTCTATGCCAGCAGTGGATTCTTTACCATGACTGGTTATTCTTCCAAGGAAATTGTTG
GAAGAAACTGCCGGTTTCTGCAAGGGCCAGACACCGACAAGAATGAGGTTGCCAAAATCAGAGATTGTGTCAAGAATGGAAAA
AGTTACTGTGGAAGGCTGTTAAACTACAAAAAGGACGGAACTCCCTTCTGGAATCTTCTCACAGTCACTCCTATCAAGGACGA
CCAGGGCAATACCATCAAGTTCATTGGGATGCAGGTTGAAGTTAGCAAATACACAGAAGGGGTAAATGATAAAGCATTGAGGC
CTAATGGACTCTCCAAATCCTTGATTCGATATGATGCTCGCCAGAAGGAGAAAGCTTTGGATTCCATCACAGAGGTTGTGCAA
ACTATAAGACATCGTAAGTCTCAAGTTCAGGAATCCGTGAGCAATGACACTATGGTAAAGCCTGATAGTTCTACTACACCTAC
ACCTGGTAGACAAACAAGACAGTCAGATGAGGCTTCAAAGTCTTTCAGGACACCTGGACGTGTTTCTACTCCAACGGGGTCAA
AGCTCAAAAGCTCGAATAACAGGCATGAAGATCTTTTACGTATGGAACCCGAAGAATTGATGTTGAGCACAGAAGTAATAGGG
CAGAGGGACAGTTGGGACCTATCGGATAGAGAAAGGGATATACGCCAAGGGATTGATCTAGCTACCACTCTTGAGCGCATAGA
GAAGAATTTCGTCATCAGTGATCCTCGTCTCCCTGATAATCCCATTATCTTTGCATCAGACAGCTTTCTTGAATTGACAGAGT
ATTCACGCGAGGAAATATTGGGGAGAAATTGTCGGTTTCTTCAGGGGCCAGAGACAGATCAAGCGACTGTCCAGAAGATAAGA
GACGCAATTAGAGATCAGAGGGAGATTACTGTGCAGTTGATAAACTACACTAAAAGCGGAAAGAAATTCTGGAACTTATTCCA
CTTGCAACCTATGCGTGATCAGAAGGGAGAGCTTCAATACTTCATCGGTGTGCAGCTTGATGGAAGTGATCATGTAGAGCCCC
TCCAAAATCGTTTGTCTGAGAGAACAGAGATGCAGAGTTCGAAATTGGTGAAAGCTACGGCAACAAATGTAGATGAAGCTGTC
AGAGAGCTTCCAGATGCTAATACGCGGCCCGAAGACCTGTGGGCTGCACACTCGAAGCCTGTCTATCCTCTGCCTCACAATAA
GGAGAGTACGTCCTGGAAAGCAATAAAAAAGATCCAAGCGAGTGGAGAAACAGTGGGACTACATCATTTCAAACCAATAAAAC
CGTTGGGCTCTGGTGATACTGGCAGTGTCCATTTGGTTGAGCTGAAGGGCACGGGTGAACTATATGCCATGAAAGCAATGGAG
AAAACAATGATGTTGAATCGTAACAAGGCTCACCGAGCGTGCATCGAAAGGGAAATCATTTCCCTTCTGGATCATCCATTCCT
TCCTACTCTCTACGCTTCTTTTCAGACCTCTACGCACGTCTGTTTGATTACAGACTTCTGCCCAGGTGGAGAGTTGTTTGCAC
TACTTGACAGACAACCTATGAAAATATTGACAGAAGACTCTGCAAGGTTCTATGCAGCAGAGGTTGTTATCGGCTTAGAATAT
CTTCACTGCTTAGGAATTGTATATCGAGACCTGAAGCCTGAGAATATACTGCTCAAGAAGGATGGACACATAGTATTGGCTGA
CTTTGATTTATCATTCATGACGACCTGCACACCCCAGCTTATTATTCCAGCTGCACCTAGCAAACGAAGGAGATCCAAAAGTC
AACCACTACCCACATTTGTTGCAGAACCAAGTACCCAGTCAAACTCGTTCGTAGGAACTGAAGAATACATTGCGCCTGAGATA
ATCACGGGTGCTGGTCATACAAGTGCTATTGATTGGTGGGCACTGGGTATCTTGTTGTATGAGATGCTTTATGGTCGCACACC
TTTCAGGGGTAAGAATAGGCAAAAGACATTTGCCAACATCTTGCACAAAGATCTCACTTTCCCCAGCAGTATCCCTGTGAGTC
TTGTAGGTAGACAGTTGATCAACACGTTGTTAAATAGAGATCCGAGCAGTCGGTTAGGATCCAAAGGTGGGGCAAATGAGATA
AAGCAGCATGCTTTCTTTCGCGGGATCAATTGGCCTCTCATACGAGAGTCCTCCACCACTGGATGCACCGTTGAGCATAATCG
AAAAAGATCCGAATGCCAAAGATATAAAGTGGGAAGATGATGGAGTGCTTGTGAATTCTACGGACTTGGACATTGACCTCTTC
TAATCCTATTCTTCCTCCTCTGCCTTTGATTCTCAAATTATGCAAAACTCTTCTTCTCAATAAAAGCCAAGGTGTTGTTGTAC
TTGTAGTTGCTTAAATATAAACGGCTCTTTTCATGTTTTTCCATTTCTTCTAATCAACAACAATAAACATACAAACTTAAGAG
CCATGTTAATATTCATGTTAAGTGTGATAAGCCCATTATGAGGCCCATAACTAGCCCACTAGTAGTTGGGAGAAATGTCTTTG
AGAAGTCCAACCACCTGCTGCATCGTAGGTCGCTTCCATGGCAGATCGGCGGTACACAAGTACCCTATCTTCACCGCCTCCGC
GATTTCATCCTCCGGAACTGTCTCTTGCATCGTCGGATCAATGGCTCTCAATCCTTGTCCCTGCCTCACCAACCCTCTCACCC
AATTCACCAAGTCACCCTCCGGCTTCTTCCCACTCACGAGCTCAAGCAAAACAACTCCAAAGCTATACACATCGGATTCTAAT
GTCGGAGAAGCATTTCGCTCCTGTTCCGGTGGTGTGTACCCGTCTAAACTTTCGGAACCGGGAAATTGCTCGTCCAAGAGTTT
AACTAAACCAAAGTCTGCTAAGCGTGGCTCCTGGCTAGAGTCTAACAAGATTGTTGCAGCCTTCACTTCTCCGTGGACCATTG
GAGGAATGCAGCCATGGTGAAGGAAAGCTAATGCCCTCGCTGTCCCCAAAGCTATCTTATGCCGAAGTCTCCAAGGTGCAGAA
TCATCTCCGTTGTTATGGAGTAGACTTTGCAAATTAACCATGTCTAAGTCCTCGTAGATTGCAATTCTTTGCTCTGTCGCTAT
ACAGTATCCACAGAGCGGGAAAAGATTTGGGTGATTGATCCTAGCGAGACGTTCAAATGCAATCGAGACTTCAGTATCAGTCA
ATGTGGTTCCACTTGGGATAACTTTTAGAGCTGCTCTGAATCCACCGGGTAAGACTGCTCCGTAAGTAGGACCAGACTTGCCT
TCCCACAACATTGTGCCTCTGTCGAAGTTGAAAGTCGCAGCCTTTAGGTCTGCAAGCGTCATTTTCATTAATGGCTTGTCGAT
CATTACCACAGGGATTTGCGTTGCTTGCTTGATATCAGTGGTTGAGTCGTGTTGGTCTGGGGAGTTGGGTTCTGTGTTGTTTA
TGGCTAGCTTTGTTGCCCAAGTTCTTGATTTTCTTCTAACTCTCAAGGCTACAAGTATGAGCAGTAGTCCTATAAGTAAGAAC
GCCATGGAGATTGCTAACCCCAAACCAATCTTAAGCCCTGTATTCTTCTTGTTGACTTTCTTTCCTTTTGTAATAATTGGCTT
TGCAGCGAAGGGGCAGTTGTTTCTAATATTAATGAAGGATCTCTGGATTGTTTCTTGGGAGAAGTTGGGGTTGCAAAAGGTTA
GATTGTTGAAAGAGAAGTTAAACCTTTGCATCATGGCGAGTTTCTCCAAAAGCGGCCTTGGGATATCTCCGTCTAGCTTATTC
AACGAGAGATCAAGTACTTCAATGTTCTTGACGCTCAGCATAGGCACGTGGCCAGTGAGATTATTGGAGGAGAGATCAAGAAC
CTTCAGATGACTCAGCCGCGAGATTTCACGCGGAATGATATTAGTGAGATTGGTCCTTGATAGATTCAGATAATGTAGCGCAG
AAAGCTTGCCGATTTCTGGGAACTCTTGTGCCCTGAATCGATTGCACGCGAGGTTAAGGTGTCCCAGCTTGTGAGCTGAACTC
AAACCATTGAATATATGGCCGACAAAGCTATTATCGGACAAGTCAAGATGAATCAGACTAGACCAGTTGTGTTTGTGGCCGGG
TATTAACTGCAAGATATGCCCATCAAATCGGTTTTCACTGAGATCAACTGTTTCCACGTTTTCATGCAAGACTCCTATCAATG
AACCCTGAAACAGATTTCGTGAAAGGTTCAAGCTTTTTAGTAGTGGGAAAGCTGAACCAAAACCGACAGGCAGAGACTCGTTG
AGGCGGTTGGATGAGAGGTCGATGGAGAGTAGAGATCGGCAATGGACAAGTTCTGGAGGGACGCCAAACTGAAAGTCATTGTT
GTGGAGCTTGAGAGTTGTTAGATTGACAAGGTTGCTTATTGCGGCAGGGATTTTGCCAGAGATGCTGTTGAAAGAAAGATCAA
GGGTGTGAAGCGACATGAAATTGCCGATGTTGCTGGGAAGAGGCTCAGAAATCCGGTTGGAGGAGAGATTGAGACTCTCAAGC
AAGCTGAGACTCCACAAATCCGAGGGGAGAGACGTAATCTTGTTTCCACTGAGATCTAAAGTTTGGAGCTTACTCATTTTGCC
AATAGTGTTGTCGGGGATCGAACCAGACAGGTCCAACCCAGAAGCCGAAATATGCAACACATTCTCACTAGAGTCACAGACGA
CCACTCCTGGCCATGAACACAAGGAAGAAAACGTATGAGCTTGGGGAGAATTGGGTAATCTCATTGCGGAGAAGAAGCTAGAG
AGATGATAAGCGTCGGTGTTGGGATCTAGGCTCGTCAGATGCTTGACGAAGAAGGAGAAGAACAGGAGAGATCCCCATAGAGA
CAACCTCATAACTTGGTGGTGTCTGGGACTGGAGAAAGTTGGATGGGAAAGCTCAGAAAGAAGACAGACTGTGTGAAAAGAAG
AAAAGACATAATGGAATCACGGGGCATAGAGGTGATGATAGTTTAGAATACATTGAAATCCCTTTCACGTGCACAGCTTCAAA
AAAAATCAGAACTTTTAGTCAGAAAGCTATGAAATTTCAGAAGAAGAAGATAAGAGTTGAATAGTTTGGGGGAGTTCCGGAGT
TGAGAGTTGAGTTTTTGGTTGTATCGTATATGGACACTGGAGAAAGTGGGAAGAGAAGAGAGAGTCGTTGAAAGTCAAAAAAA
GGGATATGTGGAGATTATAATTAGGTAAAGTATTTCGCTAGTGAGTTATAAGAAAAATATGATAAATGGAATCTGTCTCAGAC
CTTTTGTGAATTTTTCCAAATCCCAAAGTTGTCAATGGATTTGGTGAGTGGAGGAGTGGGTGGTTGTTGTGGTTTCTCATTTC
AGTAGTGTTTTGGTTATTAATGTAAAAATTCACTTTTTTAGGGGTTTTC

En la figura 5 se conoce la secuencia de nucleótido para phot 2 con el codón de inicio ATG y
terminación en TGA.
Figura 6. Marco abierto de lectura del gen phot2

En la fig 3. Se observa el ORF1 de la secuencia de nucleótidos que se ubica en la hebra + en el frame 1,

transcrito inicia en el nucleótido 250 y termina en el nucleótido 2946, la longitud de la secuencia del gen
phot2 es de 2946 nucleótidos y este codifica para una proteína de 898 aminoácidos.

Figura 7. Fasta de la proteína

>ArthPHOT2
MERPRAPPSPLNDAESLSERRSLEIFNPSSGKETHGSTSSSSKPPLDGNNKGSSSKWMEFQDSAKITERTAEWGLSAVKPDSG
DDGISFKLSSEVERSKNMSRRSSEESTSSESGAFPRVSQELKTALSTLQQTFVVSDATQPHCPIVYASSGFFTMTGYSSKEIV
GRNCRFLQGPDTDKNEVAKIRDCVKNGKSYCGRLLNYKKDGTPFWNLLTVTPIKDDQGNTIKFIGMQVEVSKYTEGVNDKALR
PNGLSKSLIRYDARQKEKALDSITEVVQTIRHRKSQVQESVSNDTMVKPDSSTTPTPGRQTRQSDEASKSFRTPGRVSTPTGS
KLKSSNNRHEDLLRMEPEELMLSTEVIGQRDSWDLSDRERDIRQGIDLATTLERIEKNFVISDPRLPDNPIIFASDSFLELTE
YSREEILGRNCRFLQGPETDQATVQKIRDAIRDQREITVQLINYTKSGKKFWNLFHLQPMRDQKGELQYFIGVQLDGSDHVEP
LQNRLSERTEMQSSKLVKATATNVDEAVRELPDANTRPEDLWAAHSKPVYPLPHNKESTSWKAIKKIQASGETVGLHHFKPIK
PLGSGDTGSVHLVELKGTGELYAMKAMEKTMMLNRNKAHRACIEREIISLLDHPFLPTLYASFQTSTHVCLITDFCPGGELFA
LLDRQPMKILTEDSARFYAAEVVIGLEYLHCLGIVYRDLKPENILLKKDGHIVLADFDLSFMTTCTPQLIIPAAPSKRRRSKS
QPLPTFVAEPSTQSNSFVGTEEYIAPEIITGAGHTSAIDWWALGILLYEMLYGRTPFRGKNRQKTFANILHKDLTFPSSIPVS
LVGRQLINTLLNRDPSSRLGSKGGANEIKQHAFFRGINWPLIRESSTTGCTVEHNRKRSECQRYKVGR

En la figura 7 se conoce la secuencia para la proteína con los aminoácidos codificados para su
funcionalidad

Figura 8. Estructura primaria de la proteína que codifica el gen phot2

En la fig 8. Se analiza la ubicación de los dos dominios funcionales de la proteína que codifica el gen
phot2. En el recuadro naranja se observa el dominio PAS9 , y en azul el dominio Pkinase; en la parte
inferior de cada recuadro se muestra la longitud de cada dominio. Esta proteína mide 898 aminoacidos.
En este presente trabajo se realizó un análisis bioinformático del gen phot 1 y phot 2 en Arabidopsis
tahliana en cual se encuentra involucrado en la fototropina. El análisis de la estructura de la proteína
PAS9 y Pkinase se observaron que están localizadas en tres regiones organizadas entre aminoácidos
para Phot 1: PAS 9 205-301, PAS 9 475-577 y Pkinase 665-952 que tiene como funcionalidad en planta de
la apertura de las estomas, la acumulación de los cloroplastos y la fosforilación de la serina se encuentra
ubicado en la membrana plasmática en él citosol. Ahora para la Phot 2: PAS 9 141-237, PAS 9 399-491)
y Pkinase 579-864. Sirve para detección de oxígeno, inhibidor de quinasa en la oscuridad, actúa como
un fotoactivación y su ubicación en el aparato de Golgi bajo la inducción de la luz azul. A si se conoce
detallada mente la función molecular en esta proteína que sirve para el desarrollo del crecimiento
también se encontró que phot 1 en el contexto genómico se encuentra en el cromosoma 3 con el recuento
de 21 exones y para phot 2 en el cromosoma 5 con 24 exones. Estas estructuras mencionadas inicialmente
se obtuvieron con las herramientas de la NCBI “National Center for Biotechnology Information”.

Conclusión

Las proteínas PAS 9 Y Pkinase en Arabidosis thaliana son importante para regulación estomática en la
planta para su crecimiento en estos fotorreceptores le permite el intercambio de gases con el medio y la
regulación de nutrientes disuelto en el suelo para cumplir su fisionomía. Estas proteínas son claves para
la regulación de señalización celular como respuesta exclusiva mente para la luz azul.

Bibliografía

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