1 R.

Karuwal
Levels
of Biological
organisation
•Atom
•Molekul
•Sel
•Jaringan
•Organ
•Sistem organ
•Individu
•Population
•Community The Biosphere is
•Ecosystem a total of all of
Earth’s
•Biosphere
Tim Dosen Pengampu MK BioEcosystems
Sel & Mol 2009 F. Bio UGM 2020/3/29 2 2
3
 DNA adalah materi genetik
 Fungsi DNA dalam pewarisan sifat, pertama
dipecahkan melalui penelitian bakteri dan
virus yang menginfeksinya

4
  Frederick Griffith mempelajari tentang
Streptococcus pneumoniae, bakteri penyebab
pneumonia pada mamalia
 Digunakan 2 strain bakteri, yaitu strain
patogenik dan nonpatogenik

5
6
  Griffithconcluded that the living R bacteria
had been transformed into pathogenic S
bacteria by an unknown, heritable substance
from the dead S cells.

7
8
Bukti final yang menunjukkan DNA adalah materi genetik,
dengan mempelajari virus penginfeksi bakteri.

9
 EXPERIMENT In their famous 1952 experiment, Alfred Hershey and Martha Chase used radioactive sulfur
and phosphorus to trace the fates of the protein and DNA, respectively, of T2 phages that infected bacterial cells.

1 Mixed radioactively 2 Agitated in a blender to 3 Centrifuged the mixture 4 Measured the

labeled phages with separate phages outside so that bacteria formed radioactivity in
bacteria. The phages the bacteria from the a pellet at the bottom of the pellet and
infected the bacterial cells. bacterial cells. the test tube. the liquid

Radioactive Empty Radioactivity

Phage protein protein shell (phage protein)
in liquid
Bacterial cell

Batch 1: Phages were DNA

grown with radioactive Phage
sulfur (35S), which was DNA
incorporated into phage Centrifuge
protein (pink).
Radioactive
DNA Pellet (bacterial
cells and contents)

Batch 2: Phages were

grown with radioactive
phosphorus (32P), which
was incorporated into
phage DNA (blue). Centrifuge
Radioactivity
(phage DNA)
Pellet
in pellet
RESULTS Phage proteins remained outside the bacterial cells during infection, while phage DNA entered the cells.
When cultured, bacterial cells with radioactive phage DNA released new phages with some radioactive phosphorus.
CONCLUSION
Hershey and Chase concluded that DNA, not protein, functions as the T2 phage’s genetic material. 10
 Watson dan Crick G C

(1953), menunjukkan A

T
T

bahwa bentuk molekul 1 nm

DNA double helix. C G

G C
3.4 nm

 Ukuran bervariasi, A T

misal: C G

Manusia, panjang DNA ± T A

1 juta µm T A

Lalat Drosophila A T

T
melanogaster ± 16.000
A

µm G C
0.34 nm

Bakteri Eschericia coli ± A

(a) Key features of DNA structure

T

(c) Space-filling model

1100 µm.

11
 Sugar-phosphate Nitrogenous

DNA merupakan
backbone bases

 5 end
CH3
O–

polinukleotida,
5
O P O CH2 H O
O 1
O– 4 H N N
H

masing-masing
H
H H
3 2 O
H
Thymine (T)

nukleotida terdiri O
O

P O CH2
H
N
H

tiga komponen,
O N
O– H H N H
H H N
N

yaitu:
H
H
Adenine (A)

basa nitrogen
O H H

O P O CH2 H N
O H

gula deoksiribosa
O– H H N N
H H
H O
Cytosine (C)

gugus fosfat O
5
O P O CH2 H N
O 1 O
O– 4 H H N
Phosphate H
H N
3 2 N H DNA nucleotide
OH H
Sugar (deoxyribose) N H
H
3 end
Guanine (G)

12
 STRUKTUR ASAM NUKLEAT
Gula pentosa
5’

OH CH2 OH
O

4’
H H 1’
H
H

3’ 2’
OH H
Deoksiribosa

13
 5’

OH CH2 OH
O

4’
H H 1’
H
H

3’ 2’
OH OH

Ribosa

14
 Basa nitrogen dibedakan atas H

kelompok pirimidin yang N N H O CH3

terdiri dari basa sitosin (C)

N
dan timin (T) dan kelompok N H N
Sugar
purin yang terdiri dari basa N N

adenin (A) dan guanin (G) Adenine (A)

O Sugar
Thymine (T)
Masing-masing pasangan basa H
membentuk jumlah ikatan N O H N
hidrogen yang berbeda, yaitu:
Adenin dan timin (2 ikatan N N H N
hidrogen), Sitosin dan guanin Sugar N N
(3 ikatan hidrogen) N H O Sugar
H
Guanine (G) Cytosine (C)

15
 Basa nitrogen

NH2
O
H
6 N 6 N
N N
1 5 7 1 5 7
8 8
2 4 9 2 4 9
3 N NH2 3 N
N N
H H

Adenin Purin Guanin

16
 NH2 O

H
4 4 CH3
N N
3 5 3 5

2 2 6
6
1 1
O O
N N

H
H

Sitosin Pirimidin Thymin

17
 O

H
4 H
N
3 5

2 6
1
O
N

Urasil

18
 • Nukleosida adalah struktur yang terbentuk
oleh adanya ikatan antara gula pentosa dan
basa nitrogen dengan ikatan glikosidik
• Basa akan selalu terikat pada posisi 1’ dari
pentosa
• Titik ikatan pada basa adalah
posisi-1 (N-1) pada Pirimidin
dan posisi-9 (N9) pada Purin

19
• DNA: adalah sebuah polinukleotida
• Terbentuk ketika 5’ fosfat dari satu
nukleotida berikatan dengan 3’ -OH dari
nukleotida yang lain, dengan cara
menghilangkan gugus -OH dari posisi 3’
• Ikatan 3’ - 5’ disebut ikatan posphodiester

20
 NH2

4
5 N
3
-O
6 2
5’ 1
-O P
O
O CH2 N
O NH2
O
4’
H H
H
H N 6
N
3’ 7 5 1
2’
O H 8
5’ 2
-O 9 4
P O CH2 N 3
O N
O
4’
H H
H
H

3’ 2’
OH H
21
 Each DNA strand has a polarity, or
directionality, like a chain of circus
elephants linked trunk to tail. In this
analogy, each elephant corresponds to one
nucleotide along the DNA strand. The
polarity is determined by the direction in
which the nucleotides are pointing. The
"trunk" end of the strand is called the 5' end
of the strand, and the "tail" end is called
the 3' end. In double-stranded DNA, the
paired strands are oriented in opposite
directions, the 5' end of one strand aligned
with the 3' end of the other.
22
 5 end

O
OH
P Hydrogen bond
–O 3 end
O
OH
H2C O
T A

O O CH2
O
P
–O O
O O–
P
O
H2C O
G C O

O O CH2
O
P
–O O
O–
O
P
H2C O
O O
C G

O O CH2
O
P O
–O O–
O P
H2C O
O O
A T

O CH2
OH
3 end O
O–
P
O
O
(b) Partial chemical structure
5 end

23
 Merupakan molekul sangat besar, sangat panjang
 Tersusun dari 4 jenis molekul NUKLEOTIDA
 Nukleotida selalu terdiri dari 3 komponen: Fosfat,
Gula Pentosa , dan Basa Nitrogen
• Basa nitrogen terdiri dari 2 kelompok & 4 jenis

Kelompok Purin : Adenin (A) dan Guanin (G)

Kelompok Pirimidin : Citosin (C) dan Timin (T)

24
 STRUKTUR DNA
• terdiri dari dua sulur/rantai Polinukleotida yang bersifat
Antiparalel (5’P - 3’OH // 3’OH - 5’P)
• antar sulur nukleotida berikatan pada basa-N secara
Komplementer (A=T) dan (G=C)

25
 Adenin (A) berpasangan dengan Timin (T) dengan dua ikatan
hidrogen, dan

Guanin (G) berpasangan dengan Citosin (C) dengan tiga ikatan

hidrogen

26
27
 DNA kromosom Nukleus
Genom

Asam Nukleat ekstrakromosom Mitokondria

Kloroplas
Plasmid

RNA heterogeneous RNA (hn RNA) mRNA

transfer RNA (tRNA)
ribosomal RNA (rRNA)

Nukleoprotein Histone (H1, H2A, H2B, H3, H4)

Non-histone protein

28
Eucaryotic genome

29
30
31
32
 Purin
Materi
DNA
genetik
adalah
Pirimi Asam
din
Nukleat:
DNA dan
RNA RNA

33
Urutan mukleotida dari 5’ 3’
34
35
 Promoter
Sekuen Regulator Aktivator
Operator
GEN

Exon
DNA GENOM Unit Transkripsi Intron
Sisi 5’ & 3’

Sekuen berulang (repeated sequences)

DNA ‘sampah’ (Junk DNA)
NON GEN Urutan penyisip (Inserted sequences)
Transposon

Genom: totalitas gen/DNA dalam suatu sel atau organisme

Gen: Segmen DNA atau RNA yang mengandung unit informasi yang diturunkan
36
 Gen :
urutan nukleotida atau fragmen DNA tertentu
yang mengkode protein penentu karakter
suatu organisme
Sekuen regulator Unit transkripsi

37
38
39
Regulasi genetik di dalam sel
Prokariotik dan Eukariotik

40
  Bedakan struktur dan organisasi gen pada
organisme prokariotik dan eukariotik
 Mekanisme pengemasan DNA pada organisme
prokariotik dan eukariotik

41
42