Cellular

 Respiration  
The  Principle  of  Energy  Harvest  –  two  types;  fermentation  and  cellular  respiration  

Glycolysis  –  simply  put,  oxidizing  glucose  molecules  to  make  two  pyruvate  molecules,  a  net  of  2  
ATP,  and  2  NADH.  

o Energy  Investment  Phase:    Use  2  ATP  to  reduce  Glucose  into  two  
Glyceraldehydes  -­‐3-­‐phosphate.  (G3P)  
o Energy  Payoff  Phase:  2  NAD+  ,  serving  as  oxidizing  agent,  causes  (G3P)  to  be  
oxidized.  The  2  NAD+    get  reduced  into  NADH.  G3P  then  becomes  3-­‐
Biphosphoglycerate.    3-­‐Biphosphoglyerate  is  further  reduced  into  pyruvate,  
yielding  4  ATP.    

Glycolysis  is  called  substrate  phosphorylation  because  does  not  use  the  electron  
transport  chain  or  oxygen;  just  the  substrate  Sugar  and  enzyme  to  reduce/oxidize  it.  Net  
yield  is  2ATP  (make  4,  but  used  2  in  investment),  2  NADH,  and  2  Pyruvate.    

The  Figure  below  gives  more  details  about  the  glycolysis  steps;  should  familiarize,  but  
not  necessary  memorize.  Know  the  bullets  above  though.  

S  

S  

Fermentation  –  when  can’t  further  oxidize  neither  pyruvate  nor  NADH.  A  continuation  of  
substrate  phosphorylation.  Since  need  NAD+  to  be  electron  acceptor,  must  
regenerate  it  as  it  becomes  NADH.  
 o Alcohol  fermentation  –  Two  steps.  1.  Pyruvate  releases  CO2,  becoming  Acetaldehyde.  
NADH  reduces  acetaldehyde,  making  ethanol  and    NAD+.  
o Lactic  acid  fermentation  –  One  step.  Pyruvate  is  directly  reduced  by  NADH  into  Lactate.  
Lactate  is  more  toxic  than  ethanol.  

Cellular  respiration  –  Glycolysis  Citric  acid  cycle    Electron  Transport  Chain  

• Citric  acid  cycle  –  converts  pyruvate  into  1  FADH2,  3  NADH,  and  1  ATP.  PDC  yields  1  NADH  
*There  are  two  molecules  of  pyruvate  in  glucose,  so  yield  double.  The  cycle  takes  place  in  the  
mitochondria.    
o Pyruvate  must  be  converted  into  Acetyl  CoA  before  entering  the  Kreb’s  cycle.  This  is  
called  the  Pyruvate  Dehydrogenase  Complex  (PDC),  series  of  enzymes  and  reaction  that  
converts  pyruvate  into  Acetyl  CoA.  
1. Pyruvate  enters  the  mitochondria  from  the  cytosol  via  active  transport  by  
protein.  Upon  entries,  the,  the  PDC  causes  Pyruvate  to  lose  CO2  
2. The  remaining  two  carbon  fragment  is  oxidized,  with  NAD+  as  the  oxidizing  
agent.  The  result  is  NADH  and  acetate.  
3.  Coenzyme  A  attached  to  the  acetate  to  make  acetyl  CoA.  
o 8  steps.  Step  1.  Acetyl  CoA  binds  to  Oxaloacetate  to  make  Citrate.  Next  7  steps  is  the  
decomposition  of  citrate  back  into  Oxaloacetate.  Will  yield  3  NADH,  1  FADH,  and  1ATP  
per  molecule  of  pyruvate.    (GTP  is  actually  made,  but  is  then  converted  to  ATP  *step  5)  
o Releases  CO2  as  byproducts.  
Still  substrate  phosphorylation.  No  oxygen  is  used.  
 • Oxidative  Phosphorylation;  Electron  Transport  Chain.  Converting  NADH  and  FADH  into  
electronegative  gradient  to  make  ATP.  
o Electron  Transport  Chain  –  series  of  I-­‐IV  protein  complexes  embedded  into  membrane  
of  mitochondria.    
 Each  complexes  have  electron  carrier  that  passes  the  electron  into  a  lower  
energy  complex.  
 Example  of  complex  I.  NADH  oxidizes,  reducing  a  prosthetic  group  called  flavin  
mononucleotide  (FMN).  It  then  oxidizes,  passing  the  electron  to  an  iron-­‐sulfur  
protein  (Fe.  S),  also  known  as  a  heme  group.  This  then  passes  the  electron  into  
ubiquinone,  an  electron  carrier  that  is  not  actually  bound  to  the  chain.  Then  
passes  electron  to  complex  II,  to  III,  to  IV.  After  complex  I,  the  carriers  are  called  
cytochrome.  At  the  end  of  the  chain,  oxygen  receives  the  electron.    
• FADH  passes  electron  into  complex  II,  which  is  why  generate  1/3  less  
ATP  than  NADH.  

Electron  Transport  chain  do  not  generate  ATP.  Instead,  sets  up  an  electronegative  gradient.  As  
electron  flows  down  the  electron  transport  chain,  it  pumps  proton  from  the  matrix  into  the  
mitochondria  intermembrane  space.  The  gradient  causes  the  proton  to  want  to  move  back  into  
the  mitochondrial  matrix.  It  passes  through  a  protein  called  ATP  Synthase,  turning  the  internal  
rod  that  causes  Phosporous  to  bind  to  ADP,  yielding  ATP.    

Where  is  ATP  synthase  found?  In  the  inner  membrane  of  the  mitochondrion.  

 
Terms  to  know:  
 
• Cytochrome  –  electron  carrier  
 
• ATP  Sythase  
• Rotor  
• Stator  
• Internal  Rod  
Accounting  for  ATP  

Per  molecule  of  glucose  

Process   Molecules  Formed/Used   ATP  Equivalents  

Glycolysis   -­‐2ATP   -­‐2ATP  
   
4ATP   4ATP  
   
2  NADH   3  ATP  in  eukaryotes  
5  ATP  in  Prokaryotes  
Pyruvate  Dehydrogenase   2  NADH   5  ATP  
Complex    
*1  for  each  pyruvate  molecule  
Kreb  Cycle   6  NADH     *3  for  each  pyruvate   15  ATP  
molecule  
     
2  FADH2   *1  for  each  pyruvate   3  ATP  
molecule  
   
*1  for  each  pyruvate  
2  GTP   molecule   2  ATP  
Total     30  ATP  Eukaryotes  
32  ATP  Prokariotes  
 1  NADH  =  2.5  ATP  when  produced  by  Kreb  cycle  
1  NADH  =  1.5  ATP  when  produced  in  cytosol.  (Through  glycolysis)*  Why?  NADH  in  cytosol  must  be  moved  to  
mitochondria,  and  they  are  shuttled  by  glycerol  phosphate  shuttle,  which  transports  NADH  into  complex  II.  It  does  
the  same  for  FADH.  Which  is  why  only  yield  1.5  ATP  
1  FADH  =  1.5  ATP