Sie sind auf Seite 1von 61

Webinar Series

Racing against time: Rapid, high‐throughput discovery of antibody 
therapeutics for SARS‐CoV‐2
5 August 2020
Participating experts
Robert Carnahan, Ph.D.
Vanderbilt Vaccine Center
Nashville, TN

Pavlo Gilchuk, Ph.D.
Vanderbilt Vaccine Center
Sponsored by Nashville, TN

Brought to you by the Science/AAAS Custom Publishing Office
For Research Use Only. Not for use in diagnostic procedures. 
Agilent products are not approved, marketed, or validated for COVID‐19 testing, diagnosis, treatment, or mitigation. Agilent has not validated a product to detect the novel coronavirus or antibodies.
Webinar Series
Instructions for viewers
• To share webinar via social media:

• To share webinar via email:

• To see speaker biographies, click: View Bio under speaker name

• To ask a question, click the Ask A Question tab to the right
Sponsored by

Brought to you by the Science/AAAS Custom Publishing Office
For Research Use Only. Not for use in diagnostic procedures. 
Agilent products are not approved, marketed, or validated for COVID‐19 testing, diagnosis, treatment, or mitigation. Agilent has not validated a product to detect the novel coronavirus or antibodies.
Platforms to respond to 
emerging viruses powered 
by human antibody 
discovery
Robert Carnahan and Pavlo Gilchuk
Crowe Lab
Vanderbilt University Medical Center

For Research Use Only. Not for use in diagnostic procedures. 
Agilent products are not approved, marketed, or validated for COVID‐19 testing, diagnosis, treatment, or mitigation. Agilent has not validated a product to detect the novel coronavirus or antibodies.
Two mAb solutions to the pandemic problem
Ultra‐fast, in the moment

Pandemic Prevention Platform (P3) site

Ultra broad, ahead of time
Ultra broad, ahead of time

For Research Use Only. Not for use in diagnostic procedures. 
Agilent products are not approved, marketed, or validated for COVID‐19 testing, diagnosis, treatment, or mitigation. Agilent has not validated a product to detect the novel coronavirus or antibodies.
Pandemic Prevention Platform (P3)

Rapidly Developed z
Therapeutic Antibodies
For Research Use Only. Not for use in diagnostic procedures.  5
Agilent products are not approved, marketed, or validated for COVID‐19 testing, diagnosis, treatment, or mitigation. Agilent has not validated a product to detect the novel coronavirus or antibodies.
Pandemic Prevention Platform (P3)
Year 1 Challenge: 90 days

Zika
Rapidly Developed z
Therapeutic Antibodies
For Research Use Only. Not for use in diagnostic procedures.  6
Agilent products are not approved, marketed, or validated for COVID‐19 testing, diagnosis, treatment, or mitigation. Agilent has not validated a product to detect the novel coronavirus or antibodies.
RRADD Rapid Rational Antibody Design and Delivery

James Crowe Rob Carnahan
Antibody 
Discovery &  RNA Platform Steve Reed Neal Van Hoeven
Optimization 

Galit Alter Todd Suscovitch


In vitro & In vivo
Validation

For Research Use Only. Not for use 
in diagnostic procedures. 
Agilent products are not approved, 
marketed, or validated for COVID‐19 
testing, diagnosis, treatment, or 
mitigation. Agilent has not 
validated a product to detect the 
novel coronavirus or antibodies. Dan Barouch Peter Abbink Mike Diamond Larissa  Thackray
@vumc_vaccines
Enrichment
#vumcdarpasprint

For Research Use Only. Not for use in diagnostic procedures. 
Agilent products are not approved, marketed, or validated for COVID‐19 testing, diagnosis, treatment, or mitigation. Agilent has not validated a product to detect the novel coronavirus or antibodies.
Antibody 
Gene 
Rescue

For Research Use Only. Not for use in diagnostic procedures. 
Agilent products are not approved, marketed, or validated for COVID‐19 testing, diagnosis, treatment, or mitigation. Agilent has not validated a product to detect the novel coronavirus or antibodies.
Our Production team is already in high gear! #VUMCDARPASprint.

Rapid 
Expression 

Screening

For Research Use Only. Not for use in diagnostic procedures. 
Agilent products are not approved, marketed, or validated for COVID‐19 testing, diagnosis, treatment, or mitigation. Agilent has not validated a product to detect the novel coronavirus or antibodies.
PBMCs

PBMC

Lead 
PBMC PBMC
Antibodies: 
PBMC
PBMC
Synthesis, 
PBMC
Expression,
PBMC
Antibody 
Bioinformatic  Screening
Down‐selection
Single Cell  Sequence 
PBMC
Enrichment Encapsulation Rescue
‐ Plasmablasts
PBMCs ‐ Antigen‐specific 
Memory B cells

~30 days to verified anti‐viral leads
For Research Use Only. Not for use in diagnostic procedures. 
Agilent products are not approved, marketed, or validated for COVID‐19 testing, diagnosis, treatment, or mitigation. Agilent has not validated a product to detect the novel coronavirus or antibodies.
PBMCs

PBMC

Lead 
PBMC PBMC
Antibodies: 
PBMC
PBMC
Synthesis, 
PBMC
Expression,
PBMC
Antibody 
Bioinformatic  Screening
Down‐selection
Single Cell  Sequence 
PBMC
Enrichment Encapsulation Rescue
‐ Plasmablasts
PBMCs ‐ Antigen‐specific 
Memory B cells
In vivo delivery 
& Validation
For Research Use Only. Not for use in diagnostic procedures. 
Agilent products are not approved, marketed, or validated for COVID‐19 testing, diagnosis, treatment, or mitigation. Agilent has not validated a product to detect the novel coronavirus or antibodies.
Mouse protection studies 
20 lead mAbs
IgG or mRNA ZIKV mAb

6.25 µg dose = ~0.25 mg/kg, day + 1

For Research Use Only. Not for use in diagnostic procedures. 
Agilent products are not approved, marketed, or validated for COVID‐19 testing, diagnosis, treatment, or mitigation. Agilent has not validated a product to detect the novel coronavirus or antibodies.
NHP Challenge: Plasma Viral Loads

ZIKV mAb 

Subq, day ‐1 Tx

For Research Use Only. Not for use in diagnostic procedures. 
Agilent products are not approved, marketed, or validated for COVID‐19 testing, diagnosis, treatment, or mitigation. Agilent has not validated a product to detect the novel coronavirus or antibodies.
Pandemic Prevention Platform (P3)
Year 1 Challenge: 90 days 78 days

Zika
Rapidly Developed z
Therapeutic Antibodies
For Research Use Only. Not for use in diagnostic procedures.  15
Agilent products are not approved, marketed, or validated for COVID‐19 testing, diagnosis, treatment, or mitigation. Agilent has not validated a product to detect the novel coronavirus or antibodies.
Pandemic Prevention Platform (P3)
Year 2 Challenge: 90 days 78 days 60 days

Novel
Influenza Rapidly Developed z
Therapeutic Antibodies
For Research Use Only. Not for use in diagnostic procedures.  16
Agilent products are not approved, marketed, or validated for COVID‐19 testing, diagnosis, treatment, or mitigation. Agilent has not validated a product to detect the novel coronavirus or antibodies.
Actual DARPA P3 Scenario: January‐July 2020
• Jan 10th: SARS‐CoV‐2 genome published

• Jan 14th: DARPA site visit
• Discussed planned Influenza sprint
• SARS‐CoV‐2 sprint discussed but deprioritized
• ~40 reported cases, 1 death
• No reported human‐human transmission

• Jan 24th: City of Wuhan (pop. 11 million) quarantined
• 549 reported cases, 24 deaths

• Jan 26th: Sample from 1st US individual (WA‐1) arrives at lab

• August: >12 million cases >500,000 deaths


For Research Use Only. Not for use in diagnostic procedures. 
Agilent products are not approved, marketed, or validated for COVID‐19 testing, diagnosis, treatment, or mitigation. Agilent has not validated a product to detect the novel coronavirus or antibodies.
Novel / Poorly Understood Virus

YES NO

For Research Use Only. Not for use in diagnostic procedures.  18
Agilent products are not approved, marketed, or validated for COVID‐19 testing, diagnosis, treatment, or mitigation. Agilent has not validated a product to detect the novel coronavirus or antibodies.
Novel / Poorly Understood Virus

YES NO

Zika Capabilities Demonstration
2019 

For Research Use Only. Not for use in diagnostic procedures.  19
Agilent products are not approved, marketed, or validated for COVID‐19 testing, diagnosis, treatment, or mitigation. Agilent has not validated a product to detect the novel coronavirus or antibodies.
Novel / Poorly Understood Virus

YES NO

For Research Use Only. Not for use in diagnostic procedures.  20
Agilent products are not approved, marketed, or validated for COVID‐19 testing, diagnosis, treatment, or mitigation. Agilent has not validated a product to detect the novel coronavirus or antibodies.
Novel / Poorly Understood Virus

YES

Plasmablast response is not ideal (IgM dominant) If no other choice, sprint on this sample and convert to IgG

Long‐lived plasma cell

Plasmablast

Naïve B cell

Plasmablast
(short lived)

Primary Memory B cell
Plasmablast
Response

For Research Use Only. Not for use in diagnostic procedures.  21
Agilent products are not approved, marketed, or validated for COVID‐19 testing, diagnosis, treatment, or mitigation. Agilent has not validated a product to detect the novel coronavirus or antibodies.
Novel / Poorly Understood Virus

YES

Plasmablast response is not ideal (IgM dominant) If no other choice, sprint on this sample and convert to IgG

Memory B cell‐based discovery

Convalescent Donor is unavailable

For Research Use Only. Not for use in diagnostic procedures.  22
Agilent products are not approved, marketed, or validated for COVID‐19 testing, diagnosis, treatment, or mitigation. Agilent has not validated a product to detect the novel coronavirus or antibodies.
Novel / Poorly Understood Virus

YES

Plasmablast response is not ideal (IgM dominant) If no other choice, sprint on this sample and convert to IgG

Memory B cell‐based discovery

Convalescent Donor is unavailable Acquire Donor from closest related virus 

Authentic antigen(s) available?

YES NO

For Research Use Only. Not for use in diagnostic procedures.  23
Agilent products are not approved, marketed, or validated for COVID‐19 testing, diagnosis, treatment, or mitigation. Agilent has not validated a product to detect the novel coronavirus or antibodies.
Novel / Poorly Understood Virus

YES

Plasmablast response is not ideal (IgM dominant) If no other choice, sprint on this sample and convert to IgG

Memory B cell‐based discovery

Convalescent Donor is unavailable Acquire Donor from closest related virus 

Authentic antigen(s) available?

YES NO

VIR Bio
SARS2 Coronavirus
• Rapid Antigen Production
• Screen existing SARS/MERS samples

For Research Use Only. Not for use in diagnostic procedures.  24
Agilent products are not approved, marketed, or validated for COVID‐19 testing, diagnosis, treatment, or mitigation. Agilent has not validated a product to detect the novel coronavirus or antibodies.
Novel / Poorly Understood Virus

YES

Plasmablast response is not ideal (IgM dominant) If no other choice, sprint on this sample and convert to IgG

Memory B cell‐based discovery

Convalescent Donor is unavailable Acquire Donor from closest related virus 

Authentic antigen(s) available?

YES NO

1‐3 months acquire survivor samples
For Research Use Only. Not for use in diagnostic procedures. 
Agilent products are not approved, marketed, or validated for COVID‐19 testing, diagnosis, treatment, or mitigation.  25
Begin discovery efforts Agilent has not validated a product to detect the novel coronavirus or antibodies.
Novel / Poorly Understood Virus

YES NO

Antibody Sequence Rescue

Functional Screening

Midi‐scale mAb Production

Small Animal Down‐selection

For Research Use Only. Not for use in diagnostic procedures. 
Large Animal Validation 26
Agilent products are not approved, marketed, or validated for COVID‐19 testing, diagnosis, treatment, or mitigation. Agilent has not validated a product to detect the novel coronavirus or antibodies.
Pandemic Delivery TPP
• Dose
• Minimally protective dose may be completely or partially unknown

• Resource environment
• Drug stability
• Cold chain
• Infusion equipment
• Delivery time 

• Tolerance for Unknown Safety
• Tolerance for new/unproven modes will likely vary 
• Impact / Size 
• Available options

For Research Use Only. Not for use in diagnostic procedures.  27
Agilent products are not approved, marketed, or validated for COVID‐19 testing, diagnosis, treatment, or mitigation. Agilent has not validated a product to detect the novel coronavirus or antibodies.
Webinar Series
Racing against time: Rapid, high‐throughput discovery of antibody 
therapeutics for SARS‐CoV‐2
5 August 2020
Participating experts
Robert Carnahan, Ph.D.
Vanderbilt Vaccine Center
Nashville, TN

Pavlo Gilchuk, Ph.D.
Vanderbilt Vaccine Center
Sponsored by Nashville, TN

Brought to you by the Science/AAAS Custom Publishing Office
For Research Use Only. Not for use in diagnostic procedures. 
Agilent products are not approved, marketed, or validated for COVID‐19 testing, diagnosis, treatment, or mitigation. Agilent has not validated a product to detect the novel coronavirus or antibodies.
Accelerated discovery of potent human
monoclonal antibodies against SARS-CoV-2

Pavlo Gilchuk, PhD

For Research Use Only. Not for use in diagnostic procedures.  29
Agilent products are not approved, marketed, or validated for COVID‐19 testing, diagnosis, treatment, or mitigation. Agilent has not validated a product to detect the novel coronavirus or antibodies.
Human SARS-CoV-2 antibody discovery reports
1. Rogers TF, Zhao F, […] Burton DR. Science. 2020
2. Robbiani DF, Gaebler C, […] Nussenzweig MC. Nature (2020).
3. Zost SJ, Gilchuk P, […] Crowe JEJr. Nat. Med. (2020)
4. Zost SJ, Gilchuk P, […] Crowe JEJr. Nature (2020).
5. Seydoux E, Homad LJ, […] Stamatatos L. Immunity. 2020;53(1):98-105
6. Cao Y, Su B, […] Xie XS. Cell. 2020;182(1):73-84.
7. Wec AZ, Wrapp D, […] Walker LM. Science. 2020;eabc7424.
8. Wang C, Li W, […] Bosch BJ. Nat. Commun. 2020;11(1):2251.
9. Wu Y, Wang F, […] Liu L. Science. 2020;368(6496):1274-1278.
10.Baum A, Fulton BO, […] Kyratsous CA. Science. 2020; eabd0831.
11. Li L, Wang P, […] Ho DD. Nature (2020)

For Research Use Only. Not for use in diagnostic procedures.  30
Agilent products are not approved, marketed, or validated for COVID‐19 testing, diagnosis, treatment, or mitigation. Agilent has not validated a product to detect the novel coronavirus or antibodies.
Example 1:
Rapid survey of single cell
antibody-secreting B cells

For Research Use Only. Not for use in diagnostic procedures.  31
Agilent products are not approved, marketed, or validated for COVID‐19 testing, diagnosis, treatment, or mitigation. Agilent has not validated a product to detect the novel coronavirus or antibodies.
Antibody discovery using the Beacon® optofluidic system (Berkley Lights)

Chip

Pens

Cells export
and PCR

For Research Use Only. Not for use in diagnostic procedures.  32
Agilent products are not approved, marketed, or validated for COVID‐19 testing, diagnosis, treatment, or mitigation. Agilent has not validated a product to detect the novel coronavirus or antibodies.
Antigen-specific antibody frequency in plasmablasts from H3N2
influenza A virus infection

>1,000 recombinant monoclonal antibodies

1%

11% HA
NA
25% NP
59%
M1
Unknown
1%
Failed
3%

For Research Use Only. Not for use in diagnostic procedures.  33
Agilent products are not approved, marketed, or validated for COVID‐19 testing, diagnosis, treatment, or mitigation. Agilent has not validated a product to detect the novel coronavirus or antibodies.
Robust plasmablasts response from an individual with COVID-19 (~35 days post onset)

Enriched B cells Singletons

FSC-H
BSC-A

FSC-A FSC-A BSC-W


Enriched B cells B cells
Plasmablasts
Events

CD27
CD27

For Research Use Only. Not for use in diagnostic 
procedures. Agilent products are not approved, marketed, 
or validated for COVID‐19 testing, diagnosis, treatment, 
or mitigation. Agilent has not validated a product to 
detect the novel coronavirus or antibodies.

34
DAPI CD19 CD38
Survey of individual B cells from two B cell isolation approaches

Plasmablasts: Antigen-sorted memory B cells:


<0.5% SARS-CoV-2 S-specific ~55% SARS-CoV-2 S-specific

S protein
binding

For Research Use Only. Not for use in diagnostic procedures.  35
Agilent products are not approved, marketed, or validated for COVID‐19 testing, diagnosis, treatment, or mitigation. Agilent has not validated a product to detect the novel coronavirus or antibodies.
Example 2:
Single cell functional analysis of
antibody secreting cells

For Research Use Only. Not for use in diagnostic procedures.  36
Agilent products are not approved, marketed, or validated for COVID‐19 testing, diagnosis, treatment, or mitigation. Agilent has not validated a product to detect the novel coronavirus or antibodies.
B cell screening: SARS-CoV-2 RBD-specific antibodies
that do not block human ACE2

For Research Use Only. Not for use in diagnostic procedures.  37
Agilent products are not approved, marketed, or validated for COVID‐19 testing, diagnosis, treatment, or mitigation. Agilent has not validated a product to detect the novel coronavirus or antibodies.
B cell screening: SARS-CoV-2 RBD-specific antibodies
that do not block human ACE2

In-channel binding In-pen blocking


assay assay

For Research Use Only. Not for use in diagnostic procedures.  38
Agilent products are not approved, marketed, or validated for COVID‐19 testing, diagnosis, treatment, or mitigation. Agilent has not validated a product to detect the novel coronavirus or antibodies.
Example 3:
High-throughput neutralization screening

For Research Use Only. Not for use in diagnostic procedures.  39
Agilent products are not approved, marketed, or validated for COVID‐19 testing, diagnosis, treatment, or mitigation. Agilent has not validated a product to detect the novel coronavirus or antibodies.
Microscale format for recombinant antibody expression
and analysis
761 recombinant
antibodies

mAb yield (g)


LOD

For Research Use Only. Not for use in diagnostic procedures.  40
Agilent products are not approved, marketed, or validated for COVID‐19 testing, diagnosis, treatment, or mitigation. Agilent has not validated a product to detect the novel coronavirus or antibodies.
Rapid functional screening for potent
neutralizing mAbs

RTCA assay

o Rapid
o Quantitative
o High-throughput
o Real-time CPE monitoring
Impeded
current
Principle of Detection –
flow
Cellular Impedance

For Research Use Only. Not for use in diagnostic procedures.  41
Agilent products are not approved, marketed, or validated for COVID‐19 testing, diagnosis, treatment, or mitigation. Agilent has not validated a product to detect the novel coronavirus or antibodies.
Rapid functional screening for potent
neutralizing mAbs

761 mAbs 761 × 4=3,044 reactions

8 × 384 well E‐plates, 
4 dilutions of each mAb
8 × 96 well mAb plates xCELLigence® RTCA HT

For Research Use Only. Not for use in diagnostic procedures.  42
Agilent products are not approved, marketed, or validated for COVID‐19 testing, diagnosis, treatment, or mitigation. Agilent has not validated a product to detect the novel coronavirus or antibodies.
Rapid functional screening for potent
neutralizing mAbs
Vero-furin cells
added
Endpoint
Virus + mAb added
Normalized cell index

Partial
CPE
Full
CPE

For Research Use Only. Not for use in diagnostic procedures.  43
Agilent products are not approved, marketed, or validated for COVID‐19 testing, diagnosis, treatment, or mitigation. Agilent has not validated a product to detect the novel coronavirus or antibodies.
Most of the neutralizing antibodies (67/70) mapped to the RBD

RBD NTD Other antigenic sites of S

Strain-specific Broad Strain-specific Broad


1 111 178 221 291 389
Yes
SARS-CoV S
NTD
SARS-CoV2 RBD
S
Antigen binding
No

SARS-CoV-2 neutralization Full


Partial

For Research Use Only. Not for use in diagnostic procedures.  44
Agilent products are not approved, marketed, or validated for COVID‐19 testing, diagnosis, treatment, or mitigation. Agilent has not validated a product to detect the novel coronavirus or antibodies.
Rapid functional screening for potent
neutralizing mAbs
mAb fold‐dilution

20 100

500 2,500

70 neutralizing antibodies

For Research Use Only. Not for use in diagnostic procedures.  45
Agilent products are not approved, marketed, or validated for COVID‐19 testing, diagnosis, treatment, or mitigation. Agilent has not validated a product to detect the novel coronavirus or antibodies.
Potent antibodies identified by rapid functional screening

Antibody IC50, ng/mL


COV2‐2381 COV2‐2072
RTCA FRNT
100
(wt) (wt) rVSV/eGFP
SARS-CoV-2 neutralization (%)

75
COV2-2381 <37 42 98
50
COV2-2072 79 26 38
25
COV2-2832 <81 70 42
0
1 2 3 4 COV2-2196 <60 15 37
CR3022 — — —
COV2‐2832 COV2‐2196
100
75
50
25
0
1 2 3 4 5

mAb concentration (log10ng/mL)

For Research Use Only. Not for use in diagnostic procedures.  46
Agilent products are not approved, marketed, or validated for COVID‐19 testing, diagnosis, treatment, or mitigation. Agilent has not validated a product to detect the novel coronavirus or antibodies.
Correlation analysis of RTCA and eGFP reporter neutralization
assays

44 antibodies
4
VSV-SARS-CoV-2-S
3
R2=0.85
2 P=0.0001

0
0 1 2 3 4
50

For Research Use Only. Not for use in diagnostic procedures.  47
Agilent products are not approved, marketed, or validated for COVID‐19 testing, diagnosis, treatment, or mitigation. Agilent has not validated a product to detect the novel coronavirus or antibodies.
For more method details

1. Gilchuk P, Murin CD, […] Crowe JEJr. Immunity 52, (2020).


2. Zost SJ, Gilchuk P, […] Crowe JEJr. Nat. Med. (2020)
3. Zost S.J., Gilchuk P, […] Crowe JEJr. Nature (2020).
4. Gilchuk P, Bombardi RG […] Carnahan R. Nat. Biomed. Eng. (2020).
In press

For Research Use Only. Not for use in diagnostic procedures.  48
Agilent products are not approved, marketed, or validated for COVID‐19 testing, diagnosis, treatment, or mitigation. Agilent has not validated a product to detect the novel coronavirus or antibodies.
Acknowledgements
Vanderbilt:
J. Crowe A. Trivette
WUSTL: M. Diamond, S. Whelan, L. Thackray, R.
R. Carnahan J. Reidy
Chen., J. Case
S. Zost T. Jones
Emory: F. Eun-Hyung Lee
N. Suryadevara P. Gilchuk
Berkeley Lights, Inc: J. Didier, K. MacRenaris,
R. Nargi
V. Pai
R. Sutton
StemCell Techologies: A. Mayhew
Twist Bioscience, Corp.

ACEA Biosciences, Inc

Funding: DARPA P3 Program, NIH B


Cell Supplement, Dolly Parton COVID
Fund

For Research Use Only. Not for use in diagnostic procedures.  49
Agilent products are not approved, marketed, or validated for COVID‐19 testing, diagnosis, treatment, or mitigation. Agilent has not validated a product to detect the novel coronavirus or antibodies.
SARS‐CoV‐2 mAb Goals
Therapeutic
• Multiple antibodies in GMP production
• Trials to begin this month

Diagnostic
• Many mAbs already available for research and diagnostic use through Leinco
• Validated mAbs for IHC and pathology studies
• Working with diagnostic companies across numerous platforms

Supporting Vaccines
• 3 of the leading vaccine manufacturers will utilize these mAbs for vaccine lot release

For Research Use Only. Not for use in diagnostic procedures.  50
Agilent products are not approved, marketed, or validated for COVID‐19 testing, diagnosis, treatment, or mitigation. Agilent has not validated a product to detect the novel coronavirus or antibodies.
Two mAb solutions to the pandemic problem
Ultra‐fast, in the moment

Pandemic Prevention Platform (P3) site

An ounce of prevention is worth a pound of cure.
― Benjamin Franklin

For Research Use Only. Not for use in diagnostic procedures. 
Agilent products are not approved, marketed, or validated for COVID‐19 testing, diagnosis, treatment, or mitigation. Agilent has not validated a product to detect the novel coronavirus or antibodies.
Two mAb solutions to the pandemic problem
Ultra‐fast, in the moment

Pandemic Prevention Platform (P3) site

Ultra broad, ahead of time
Ultra broad, ahead of time

For Research Use Only. Not for use in diagnostic procedures. 
Agilent products are not approved, marketed, or validated for COVID‐19 testing, diagnosis, treatment, or mitigation. Agilent has not validated a product to detect the novel coronavirus or antibodies.
mAbs in hand
Targets for human mAbs
Dengue viruses 1-4
Influenza HA and NA Ongoing Planned targets
Respiratory syncytial virus Hantavirus, Madariaga virus Lassa virus
Metapneumovirus Heartland virus Spondweni virus
Chikungunya virus O'nyong'nyong virus Barmah Forest virus
Rotavirus Yellow fever virus TBE virus
Noroviruses Usutu virus Junin virus
Marburg/Ebola viruses Powassan virus Shuni virus
Poxviruses Sosuga virus Assorted snake toxins
Rift Valley fever virus Enterovirus A71 Brown recluse toxin
CCHF virus Rhinoviruses (SMAseD)
Pertussis toxins C difficile toxin and surface Black widow spider toxin
MRSA Luk A/B toxins. IsdA, B SARS virus, HKU1, OC43
RSV, MPV Autoimmune Ab to CNS
West Nile virus Hendra and Nipah viruses VEE, WEE viruses
JE virus Rabies virus MERS virus
EEE virus Mayaro virus
Ross River virus Enterovirus D68
Zika virus HIV

SARS-CoV-2
For Research Use Only. Not for use in diagnostic procedures. 
Agilent products are not approved, marketed, or validated for COVID‐19 testing, diagnosis, treatment, or mitigation. Agilent has not validated a product to detect the novel coronavirus or antibodies.
1918 H1N1 1957 H2N2 H3N2 H5N1 H7N9
Ab-Ag Ω Ω Ω

complexes
for recently
discovered Ω
Ω
Ω
Ω

human mAbs Ω
Ω
RSV HMPV Marburg Ebola Pox
Flu NA HepC
Ω
Ω

Ω
Ω
Zika Dengue Chikungunya Ross River Henipaviruses
Rotavirus Norovirus
Ω

For Research Use Only. Not for use in diagnostic procedures. 
Agilent products are not approved, marketed, or validated for COVID‐19 testing, diagnosis, treatment, or mitigation. Agilent has not validated a product to detect the novel coronavirus or antibodies.
A role for rapid antibody discovery in 
AHEAD100
• Allows for iteration of discovery approach

• These approaches can be diversified
• Focusing on particular epitopes

• Blocking sites with known binders/neutralizing antibodies

• Looking for breadth across related viruses

For Research Use Only. Not for use in diagnostic procedures.  55
Agilent products are not approved, marketed, or validated for COVID‐19 testing, diagnosis, treatment, or mitigation. Agilent has not validated a product to detect the novel coronavirus or antibodies.
Summary
• Active Trader : Fast and Focused on “hot” targets

Emerging
Altered
Pathogens

For Research Use Only. Not for use in diagnostic procedures. 
Agilent products are not approved, marketed, or validated for COVID‐19 testing, diagnosis, treatment, or mitigation. Agilent has not validated a product to detect the novel coronavirus or antibodies.
Summary
• Active Trader : Fast and Focused on “hot” targets
• Mutual Fund: Prepared Ahead and Long‐term Committed

Emerging Known
Altered Pandemic
Pathogens Pathogens

For Research Use Only. Not for use in diagnostic procedures. 
Agilent products are not approved, marketed, or validated for COVID‐19 testing, diagnosis, treatment, or mitigation. Agilent has not validated a product to detect the novel coronavirus or antibodies.
Summary
• Active Trader : Fast and Focused on “hot” targets
• Mutual Fund: Prepared Ahead and Long‐term Committed
• Disruptive Innovations are happening: Rapid Discovery, 
mRNA delivery, etc.
Emerging
Known
Altered
Pathogens
Pathogens

For Research Use Only. Not for use in diagnostic procedures. 
Agilent products are not approved, marketed, or validated for COVID‐19 testing, diagnosis, treatment, or mitigation. Agilent has not validated a product to detect the novel coronavirus or antibodies.
Thanks!
James Crowe
Pavlo Gilchuk
Naveen Suryadevara
Andrew Trivette
Joseph Reidy
Rachel Nargi Berkeley Lights, Inc: J. Didier, V. Pai, K. MacRenaris
Rachel Sutton WUSTL: M. Diamond, L. Thackray, B. Case, R. Chen
Elad Binshtein IDRI: S. Reed, N. van Hoven
Ragon: G. Alter, T. Suscovitch
BIDMC: D. Barouch, P. Abbink
Funding:  Emory: E. Lee
DARPA P3 Program
NIH B Cell Contract (HHSN272201400024C) 
Dolly Parton COVID‐19 Research Fund at Vanderbilt 
J.E.C. is the recipient of the 2019 Future Insight Prize from Merck KGaA, Darmstadt Germany, which 
supported this research with a research grant
For Research Use Only. Not for use in diagnostic procedures. 
Agilent products are not approved, marketed, or validated for COVID‐19 testing, diagnosis, treatment, or mitigation. Agilent has not validated a product to detect the novel coronavirus or antibodies.
Webinar Series
Racing against time: Rapid, high‐throughput discovery of antibody 
therapeutics for SARS‐CoV‐2
5 August 2020
Robert Carnahan, Ph.D.
Vanderbilt Vaccine Center
Nashville, TN
Q&A
Pavlo Gilchuk, Ph.D.
Vanderbilt Vaccine Center To ask a question, click 
Nashville, TN the Ask a Question tab 
on the right
Sponsored by

Brought to you by the Science/AAAS Custom Publishing Office
For Research Use Only. Not for use in diagnostic procedures. 
Agilent products are not approved, marketed, or validated for COVID‐19 testing, diagnosis, treatment, or mitigation. Agilent has not validated a product to detect the novel coronavirus or antibodies.
Webinar Series
Racing against time: Rapid, high‐throughput discovery of antibody 
therapeutics for SARS‐CoV‐2
5 August 2020
Look out for more webinars in the series at:
webinar.sciencemag.org

To provide feedback on this webinar, please email
your comments to webinar@aaas.org
For related information on this webinar topic, go to:
https://www.aceabio.com/resources/virology‐vaccine‐research‐resources
Sponsored by

Brought to you by the Science/AAAS Custom Publishing Office
For Research Use Only. Not for use in diagnostic procedures. 
Agilent products are not approved, marketed, or validated for COVID‐19 testing, diagnosis, treatment, or mitigation. Agilent has not validated a product to detect the novel coronavirus or antibodies.