Energie Et Matiere

Pr.
Hatem BOULAHDOUR
Biophysique et Médecine Nucléaire
hatem.boulahdour@univ-fcomte.fr
Ouvrages de base :
1- Eléments de biophysique tome 1 et tome 2
GREMY F. et LETERRIER F.
FLAMMARION
2- BIOPHYSIQUE (collection PCEM)

A.Aurengo; T. Petitclerc; F. Grémy
Édité par F. GREMY
Flammarion – médecine Sciences
1
1ère Partie : chapitre 1 : Energie et Matière
Il s’agit ici de mes NOTES DE COURS.
Ces notes de cours peuvent comporter

des erreurs.
Je vous remercie de me les signaler.
2
PLAN DU COURS
1ére Partie
Chapitre 1
Energie et Matière
1.1 Généralités
1.2 Thermodynamique et Biophysique
2 Etats physiques de la matière
2.1 Agitation moléculaire
2.2 Etat gazeux
3. Etat liquide
3.1 Propriétés
3.2 Incompressibilité
3.3 Pression pour un liquide
3.4 Viscosité
3.5 Phénomènes de surface
3.6 Vaporisation
4. Etat solide
5. Cristaux liquides
6. Forces de cohésion
3
Physico-Chimie
1ére Partie
Chapitre 1
Energie et Matière
4
Chapitre 1
Energie et Matière
1.1 Généralités
Intrication de la physique, domaine

de l’énergie
et de la chimie, domaine de la
matière
Einstein relie ces 2 domaines

E=mc2
Energie Matière
5
Chimie
Réaménagement des atomes par
modification des forces liant les
atomes entre eux dans les
différentes structures moléculaires
Physique
Apparaît comme l’effet des forces
de liaison intermoléculaires
en relation avec la structure
de la matière
Physico-chimie étroitement liée à

la connaissance des forces inter-
atomiques et intermoléculaires et
de leurs modifications
6
1.2 Thermodynamique et Bio-
physique
Science des échanges thermiques
Caractériser les propriétés
thermiques de la matière par des
quantités aussi générales que
P, V, T
Prévoir de façon précise les

échanges d’énergie thermique et de
travail
Développement de concepts
généraux à tous les domaines où il y
a des échanges d’énergie et de
matière
7
Conçue pour étudier des systèmes en
équilibre, elle a été étendue aux
systèmes en non équilibre
Vie = processus essentiellement

dynamique incompatible
avec l’équilibre thermodynamique
Intérêts pour le biologiste
Diffusion, Pression osmotique,

phénomène de transport, Equilibre de
Donnan
1.2.1 Thermodynamique
On peut décrire la thermodynamique de

2 manières ou aspects différents :
8
l'échelle microscopique :
la description prend en compte les

particules réelles qui constituent le
système;
1 mg de cuivre c'est 1019 atomes.
on s'intéresse aux propriétés de la

matière à l'échelle microscopique ou
atomique en utilisant comme variables
les grandeurs cinétiques des atomes
ou molécules individuelles
(Pi ,Vi ,Ei ...)
(environ 1024 paramètres pour décrire

le système)
9
l'échelle macroscopique :
échelle mesurable et observable.
propriétés de la matière ou du système à

l'échelle globale ou macroscopique,
alors les propriétés sont décrites par
des variables d'état macroscopiques
telles ( P, V, T, m...)
(représente une moyenne à l'échelle
microscopique)
Cette thermodynamique obéit à un strict

déterminisme.
Les mêmes causes produisant les
mêmes effets, l'évolution peut être
prévue.
10
2 approches
Classique
La Thermodynamique Classique n'a
besoin d'aucune hypothèse sur la
structure atomique de la matière, elle
explique le comportement de la matière
ou des systèmes en fonction de leurs
variations d'énergie et d'entropie
Système macroscopique décrit par un

certain nombre d’équations d’état
Grandeurs macroscopiques
Energie interne
Enthalpie
Entropie
Energie libre
P.V.T
11
Statistique
Systèmes macroscopiques =
association d’atomes et de
molécules
Décrire l’état du système par une
approche statistique en tenant
compte de tous les états
individuels possibles de chacune
des espèces atomiques ou
moléculaires présentes
La Thermodynamique Statistique, cherche

à expliquer l'origine et la signification des
variables macroscopiques (P,T) et des
notions de chaleur, de travail et d'entropie,
en les reliant directement au mécanisme
de l'agitation moléculaire. Ainsi, on
explique les notions de température, de
pression et de chaleur
12
Notion de température :
la température est reliée au degré
d'agitation moléculaire de la matière
Notion de pression : la pression est due

aux nombreux chocs des atomes ou
molécules sur les parois du récipient
13
1.2.2 Concepts - Principes
Systèmes thermodynamiques
Ouvert : vis-à-vis des échanges
d’énergie et de matière
Fermé: échange d'énergie avec
environnement sans échange de
matière
Isolé: il n'interagit pas avec le milieu
extérieur
En thermodynamique classique, l'état
n’est défini rigoureusement "qu'à
l'équilibre".
Certaines propriétés sont "extensives"
(E et V). Le mélange de 2 systèmes aura
un volume égal à V1 + V2.
Certaines propriétés sont "intensives".
(T, Conc, Masse Volumique). Le
mélange de 2 systèmes n'aura pas T1 +
T2 mais T3 entre T1 et T2.
Ex: Une tasse de café à un sucre plus une tasse
de café à 3 sucres = un bol à 2 sucres.
14
Energie du système
E = Energie interne
Ensemble de toutes les formes
d’énergie
E = Eelec + Etrans + Erot + Evib + collisions
W = travail
• Forme ordonnée de l’énergie
• Exemple: un piston de surface S se
déplaçant sur une distance d sous
l’effet d’une force F.
F = P.S W = F.d = P.S.d or S.d=V
Donc W = P.V
Déplacement du point d'application
d'une force.
Ex: raccourcissement ou allongement
d'une fibre musculaire à l'origine d’une
force donc d'un travail.
15
Q = chaleur
• Forme d’énergie non ordonnée
• Liée à l’agitation moléculaire
• Au niveau microscopique
chaque molécule se déplace
dans des directions différentes
qui varient dans le temps en
fonction des chocs
Résultante des énergies
cinétiques individuelles
= chaleur
• Liée à la température, cesse au
zéro absolu (3ème principe)
Différentes formes d’énergie

• Mécanique, électrique,
thermique, chimique, sonore,
radiative
• Matière E = mc2 (conservation de
la masse et de l'énergie)
16
Principes de la thermodynamique
1er principe : l’énergie interne d’un

système fermé (isolé) est constante.
Ce principe en représente l’aspect
thermique. Il y a équivalence
quantitative de l’énergie thermique
(chaleur) et des autres formes
d’énergies.
1 calorie = 4,1840 joules
Equivalent mécanique de la calorie.
Premier principe ou principe de la

conservation de l’énergie. (exemple :
équivalence chaleur-travail).
17
2ème principe :
Il fournit une information sur le
genre de processus (qui peuvent
être nombreux) qui aura
effectivement lieu.
S’il est possible de transformer
intégralement de l’énergie
mécanique, électrique, chimique en
chaleur, l’inverse n’est pas
complètement possible.
Ex: rendement d'une machine
(moteur)
Forme microscopique :
Abandonné à lui-même, un système
fermé tend vers le plus grand
désordre possible. L’entropie
(degré de désordre des atomes et
molécules) ne peut qu’augmenter et
tend vers une valeur maximale qui
est le désordre maximal.
L’entropie nulle est réalisée par
l’ordre absolu (ex : cristal parfait au
zéro absolu).
18
Equations d’état
Convention de signes : Lorsque le
système reçoit de l’ énergie, on
utilise le signe +; lorsqu’il fournit
de l’énergie, on utilise le signe -
Energie interne
∆ E = ∆Q - ∆W
∆Q) = chaleur reçue par le système

(∆
(- ∆W) = travail fourni par le système
Si le système est isolé

∆Q = 0 et, ∆E = 0
Si ∆W = P ∆V avec P (énergie
mécanique)
∆E = ∆Q - P ∆V
si V cst, tte variation d’E se fait par

échange de chaleur
19
Si on ajoute un travail de forces
électriques
∆E = ∆Q - P ∆V - ∆W’
si V cst ∆E = ∆Q - ∆W’
c.a.d. E. électrique se transforme en

chaleur (Loi de Joule) et E.calorifique
en électricité (effet thermoélectrique)
Si V et P varient
∆E + V ∆P = ∆Q - P ∆V - ∆W’ + V ∆P
∆E + V ∆P + P ∆V = ∆Q - ∆W’ + V ∆P
20
Enthalpie
H = E + PV
∆H = ∆E + P ∆V + V ∆P
On peut écrire :
∆H = ∆Q - ∆W’ + V ∆P
Si ∆P = 0 alors ∆H = ∆Q - ∆W’
Si système isolé, alors ∆Q = 0 et
∆H = - ∆W’ , l’enthalpie correspond à
toute l’E. disponible par le système.
Si pas de travail, ∆H = ∆Q (tout se
transforme en chaleur).
Entropie (2ième principe)

• Caractérise la « qualité » de la
chaleur par T (température)
• Notée S
Ex : Cuisson de l’œuf dans une
baignoire à 37°c/casserole à 100°c
∆S = ∆Q
T 21
Energie libre (de Gibbs)
(enthalpie libre)
∆H = T ∆S - ∆W’ + V ∆P
∆H - T ∆S - S ∆T = V ∆P - ∆W’ - S ∆T
Équation d’état : G = H – TS
∆G = ∆H - T ∆S - S ∆T
donc ∆G = V ∆P - S ∆T - ∆W’
Si P = constante, si T = constante
∆ G = - ∆ W’
L’énergie libre représente le

travail que peut fournir le
système (ex: énergie chimique d’une
réaction d’oxydoréduction)
22
Remarque
E. calorifique ne peut jamais être
entièrement transformée en E.
mécanique d’où :
Définition statistique de l’entropie
(Boltzmann)
S = K Ln Ω
K= constante de boltzmann
Ω = nombre de complexions (nombre

maximal d’états possibles (coordonnées
spatiales et quantité de mouvement) que
peuvent prendre les molécules)
S = caractérise le désordre
S = prend spontanément une valeur
maximale
(Ex : molécules de gaz dans un

récipient)
23
2. Etats physiques de la matière
2.1 Agitation moléculaire
Mouvement incessant des

molécules
dite agitation thermique
E = Etrans + Erot + Evib + Ee
Etude du mouvement Brownien
Mouvement de fines particules dans

un liquide
Mouvement Brownien (BROWN
1827)
÷ à la température
1
÷ à la viscosité
1
à la taille de la
÷
particule
24
Mouvement désordonné indéfini qui
ne cesse qu’au zéro absolu
Exprime la tendance des molécules à
s’éloigner les unes des autres
Diffusion, pression, conduction
Remarque
• Energie mécanique Température

• Contradiction avec le principe de
Carnot
Agitation moléculaire
+ liaisons intermoléculaires (forces)
Etats de la matière
Etat gazeux
Liquide
Solide
25
2.2 Etat gazeux
Etat dispersé : dépourvu de toute
structure
Grande distance entre les molécules
forces intermoléculaires négligeables
Les gaz occupent tout le volume
2.2.1 Gaz parfaits

Conditions
• molécules = points immatériels
• sans interaction mutuelle (forces
nulles)
• Seul l’E. de translation existe après
un choc
• E1 + E2 avant le choc = E’1 + E’2
après le choc (correspond aux
forces de répulsion)
• Ni vibration, ni rotation
Equation d’état
Loi de Boyle-Marriotte PV = n RT
26
P=?
V=?
n=?
R=?
P Branches d’hyperboles
Portions d'isothermes
T3
T2
T1
V
Remarque : l’expérience montre PV =cste

ou V = C/P
À une température donnée, ce qui
intervient c’est uniquement le nombre de
molécules et non leur qualité
CNTP
À 0°C et à 760 mmHg 1 mole occupe 22.4 l
27
Cette loi est donc valable pour tous les
gaz ou mélange gazeux
autres formulations
Loi de Boyle (1627-1691)
PV = Cste si T = cste
Transformation isotherme
Loi de Charles (J.Charles et J.Gay-

Lussac)
si P = cste
V
= Cste Transformation isobare
T
Si dans un récipient à piston mobile, c'est
à dire à pression constante, on double la
température (en Kelvin), le volume aura
alors doublé.
T1 / V1 = T2 / V2
28
V P = Cste
Extrapolation:
Tk = Tc + 273
PV = aTc + b Tc°c
- 273°c
à partir de a et b et de Tk = Tc + 273°
PV = nRt
29
Constante des gaz parfaits
Le nombre de molécules étant
habituellement grand, on travaille sur
des moles.
Sous la pression atmosphérique, une
mole occupe à 0°C un volume de 22,4
litres (conditions normales de T et de P) :
PV (1atm)
x (22,4 litres)
R= =
nT (273 K) x (1 mole)
x mole−1
atm
= 0,082 l x
degré.K
1 litre = 10-3 m3 1 Pa = 1 N.m-2
1 atm = 1,013 105 N.m-² = 760 mm Hg
= 760 Torr = 1 Bar
R = 8,3 joule.degré.K-1.mole-1
Si P en Pa et V en m3
30
Mélange gazeux : loi de Dalton
•Soit 2 enceintes contenant 2 gaz

différents
1) 2)
V2 V1
n2 n1
P P
T T
•Communication
Chaque gaz occupe V1 + V2

P (V1 + V2) = (n1 + n2) RT
31
Fraction molaire d’un gaz
C’est le rapport du nombre de moles de
chaque gaz au nombre total de moles du
mélange.
xi = ni = ni
Impossible d’afficher l’image.
n1 + n2 + .... ∑ni
Pourcentage en volume du gaz considéré :
V = V1 + V2 .... = ∑ Vi
Vi ×100
V
pV1 = n1RT
pV2 = n2RT
Et pV = (n1 + n2 + …)RT
Vi = ni
V ∑ni
32
Pression partielle
Définition
Pression partielle d’un constituant d’un
mélange gazeux est égale à la pression
qu’aurait ce constituant s'il était seul
dans le volume
n1 RT n2 RT
P= +
V1+V2 V1+V2
n1 RT
Ppartielle(1)=
V1+V2
P = PP(1) + PP(2)
Loi de Dalton
La pression d’un mélange de plusieurs
gaz est égale à la somme des pressions
partielles des différents gaz occupant
tout le volume
33
p = p1 + p2 + …
pV = (n1 + n2 + …)RT = nRT
p1 n1 p2 n2
= , = ....
p n p n
soit p1 = p = x1 p
n1
p2 = x2 p
n
La pression partielle d’un gaz dans
un mélange est égale à la fraction
molaire multipliée par la pression
totale
Concentration molaire :
À un instant donné, pour une
température donnée
ni
V 34
Remarque
Va Va
Pa = P = P.
VT Va + Vb
Va
= fraction volumique
VT
Et Pa/P = na/n Fraction molaire
Exemple : P = 760 mmHg
Air F02 = 21% P02 = 160

inspiré mmHg
sec FN2 = 79 % PN2 = 600
mmHg
FC02 = 0%
Air F02 = 17% P02 = 130
expiré mmHg
FN2 = 79% PN2 = 600
mmHg
FC02 = 4 % Pc02 = 30
mmHg
35
GAZ REELS
Comportement s’éloigne de celui des
gaz parfaits.
On peut écrire : PV = RT+ bP+ cP² …
b et c sont des coefficients correctifs.
Ceci veut dire que les volumes des
molécules ne sont plus négligeables /
volume du gaz et qu’elles interagissent
entre elles.
Équation de Van der Walls:
(P + π ) x (V – b) = RT
π Pression interne (expression des
liaisons intermoléculaires)
b = covolume (expression du volume
propre des molécules).
(Le comportement des gaz réels s’écarte
d’autant plus des gaz parfaits que la T. diminue
et que la P. augmente cad que l’on se rapproche
des conditions de changements d’état).
36
3. Etat liquide
Le liquide est un fluide, il ne diffère de

l’état gazeux que par une agitation
thermique plus faible
Distance entre les molécules 1000 fois

plus petite (à la pression normale)
Les forces intermoléculaires deviennent

très importantes
Cohésion
incompressibilité
Certain degré d’organisation
37
3.1 Propriétés
• Fluide → obéit à l’équation de Van der

Waals
• Condensé → distance IM petites
Absence d’expansion
Une masse de liquide a un volume
défini, les molécules s’attirent
suffisamment pour rester voisines
Absence de forme définie

Cohésion insuffisante pour empêcher
les molécules de glisser les unes par
rapport aux autres
Le liquide prend la forme du récipient
38
3.2 Incompressibilité
Forces dans les liquides
Forces électrostatiques
F Répulsion
Forces de Pauli
r
r0 résultante
Attraction
Forces de Van Der
Walls
r distance entre les charges
39
f attractives : Electrostatiques car le
centre de gravité des charges + et des
charges – ne coïncide pas: les
molécules sont des dipôles.
f(1/r7)
F répulsion : Très faible rayon d’action
Interaction électrostatique des 2 noyaux
et interpénétration des nuages
électroniques. Le principe de Pauli
interdit l’introduction de nouveaux
électrons sur les couches internes déjà
saturées des atomes.
f( 1/r13) mais très intenses
Equilibre en r0
r
r0
40
3.3 Pression pour un liquide
P=F = 1N =1Pa
S 1m ²
S
h
Liquide incompressible
F1 = poids de la colonne
d’eau
h= hauteur de
la colonne
ρ= masse
volumique
g= accélération
pesanteur
41
F=Vρg=Shρg
F
P = = hρg
S
P = h ρg
g = 9,8 m/s² P en Pa
h en m ρ en Kg/m3
Unités
1 Pa = 1 N / m²
1 atm = 760 mm Hg
= 1.013 105 Pa ≈ 105 Pa ≈ 10 m d’eau
≈ 1 Bar
42
3.4 Viscosité
Les molécules d’un liquide peuvent

subir des mouvements d’ensemble
sous des influences diverses
(pesanteur … forme du récipient)
• Mais dans ces mouvements toutes

les molécules ne se déplacent pas à
la même vitesse
• L’huile paraît plus épaisse, plus

visqueuse, que l’eau
La résistance à l’écoulement traduit

l’existence de frottements internes,
expression des forces cohésion IM qui
s’opposent aux mouvements relatifs
des molécules
43
Solide : forces de cohésion très
fortes. Absence de glissement
Gaz parfaits :
molécules sont indépendantes,
viscosité nulle
Coefficient de viscosité (gaz, liquides)

(en régime laminaire)
44
F dv
v =η
Plan mobile v max
S dx
dv
gradient de vitesse
dx
dv
Plan fixe v=0 F = ηS
x dx
Profil de vitesse de v = 0 à v = max
S = surface F = force de frottement

η = coefficient de viscosité [M][L]-1[T]-1
Unités : MKSA → 1 Poiseuille = 1 kg m-1 s-1 = 1 Pa.s
CGS → 1 Poise (le)
1 poiseuille (un) = 10 poises = 1 Pa.s
45
Variation avec la température
T augmente, η
η
diminue
L’augmentation de T°
diminue les forces de
cohésion, donc η
θ
Loi de Stokes
• module dans un liquide soumis à
une force motrice cste (en mouvement)

• viscosité → F (frottement)
[F ] = 6πηrv mobile sphérique

Rayon r et vitesse de déplacement v
Sédimentation
Centrifugation
Electrophorèse
46
3.5 Phénomènes de surface
Essentiels dans les tissus vivants

Conséquence directe de l’existence des
FIM
Tension superficielle
Les forces intermoléculaires sont aussi
responsables de la tension superficielle
des liquides. En absence des forces de
gravité, les liquides formeront des
sphères, car dans cet arrangement le
nombre moyen de voisins des molécules
est le plus élevé et l'énergie de
l'ensemble est la plus basse. Les gouttes
tombant d'un robinet s'approchent à
cette géométrie (la gravité est
responsable de la déviation de la
sphère).
47
3.6 Vaporisation : conséquence
de l’agitation moléculaire
A t°donnée
≡ Équilibre = Pvap est max.

n moles = n moles
de 1 → 2 2→1
≡ Pvap max = Pression de vapeur

saturante
• Les molécules ont des

vitesses diverses
• Certaines ont une
énergie suffisante pour
quitter la phase liquide
La pression de vapeur = pression des

molécules qui sont passées dans phase
gazeuse
48
4. Etat solide
Structure cristalline :
disposition régulière en 3 D
exemple : cristal de NaCl
Etat ordonné
Place des molécules définie
Cristallographie. 14 dispositions
(forme cubique (sel), hexagonale
(glace) …)
Seul facteur de désordre

• La vibration
• Rotation partielle
49
Si on élève la T° → pâteuse →
liquide (évolution progressive)
Liquide ou solide ?
5. Cristaux liquides
à T°donnée phase inter-

médiaire entre l’état liquide et
l’état solide
présentent à la fois certaines
caractéristiques de l’état cris-
tallin et de l’état liquide
Mesure de température
Affichage
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2- BIOPHYSIQUE (collection PCEM)

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Intrication de la physique, domaine

Einstein relie ces 2 domaines

Physico-chimie étroitement liée à

Prévoir de façon précise les

Vie = processus essentiellement

Intérêts pour le biologiste

Diffusion, Pression osmotique,

On peut décrire la thermodynamique de

la description prend en compte les

on s'intéresse aux propriétés de la

(environ 1024 paramètres pour décrire

échelle mesurable et observable.

propriétés de la matière ou du système à

Cette thermodynamique obéit à un strict

Système macroscopique décrit par un

La Thermodynamique Statistique, cherche

Notion de pression : la pression est due

Différentes formes d’énergie

1er principe : l’énergie interne d’un

Premier principe ou principe de la

∆Q) = chaleur reçue par le système

Si le système est isolé

si V cst, tte variation d’E se fait par

c.a.d. E. électrique se transforme en

Entropie (2ième principe)

L’énergie libre représente le

Ω = nombre de complexions (nombre

(Ex : molécules de gaz dans un

2.1 Agitation moléculaire

Mouvement incessant des

Etude du mouvement Brownien

Mouvement de fines particules dans

• Energie mécanique Température

2.2.1 Gaz parfaits

Remarque : l’expérience montre PV =cste

Loi de Charles (J.Charles et J.Gay-

•Soit 2 enceintes contenant 2 gaz

Chaque gaz occupe V1 + V2

Et Pa/P = na/n Fraction molaire

Exemple : P = 760 mmHg

Air F02 = 21% P02 = 160

Le liquide est un fluide, il ne diffère de

Distance entre les molécules 1000 fois

Les forces intermoléculaires deviennent

• Fluide → obéit à l’équation de Van der

 Absence de forme définie

Le liquide prend la forme du récipient

r distance entre les charges

Les molécules d’un liquide peuvent

• Mais dans ces mouvements toutes

• L’huile paraît plus épaisse, plus

La résistance à l’écoulement traduit

Coefficient de viscosité (gaz, liquides)

S = surface F = force de frottement

[F ] = 6πηrv mobile sphérique

Essentiels dans les tissus vivants

≡ Équilibre = Pvap est max.

≡ Pvap max = Pression de vapeur

• Les molécules ont des

Absence de forme définie