UNIVERSIDADE FEDERAL DA PARABA

CENTRO DE CINCIAS EXATAS E DA NATUREZA

DEPARTAMENTO DE BIOLOGIA MOLECULAR Campus I - Cidade Universitria Telefones: (083) 216.7436 e 216.7495 Fax: (083) 216-7117 58059-900 - Joo Pessoa, PB, Brasil

PROFESSOR: Carlos Alberto de A. Gadelha DISCIPLINA DE BIOQUMICA ESTRUTURAL LISTA DE EXERCCIOS AMINOCIDOS, PEPTDEOS E PROTENAS

Questo 1: Que importncia tm o estudo dos aminocidos para a compreenso da estrutura protica ? Questo 2: Conceituar aminocidos ? Questo 3: Diferenciar: a) Aminocidos padro / Aminocidos especiais b) Aminocidos essenciais / Aminocidos padro Questo 4: Em que se baseia a classificao das quatro famlias principais dos aminocidos ? Quais as quatro famlias principais de aminocidos e suas principais caractersticas? Exemplificar cada uma delas. Questo 5: Dada a afirmativa: Todos os aminocidos padres encontrados nas protenas possuem um tomo de carbono alfa assimtrico e por isso, so molculas opticamente ativas, podendo ocorrer em duas formas estereoisomricas (D e L) no espao. Dizer se esta afirmativa verdadeira ou falsa e explicar por que ? Questo 6: Atualmente, em que se baseia a nomenclatura dos estereoisomeros dos aminocidos ? Qual o composto de referncia que utilizado para este fim ? Questo 7: Porque o aminocido cistena bastante comum na composio das protenas secretadas para fluidos extracelulares ? Questo 8: Cite o nome de dois aminocidos especiais e em quais protenas so encontrados ? Questo 9: Que so aminocidos essenciais ? e, Quantos e quais so os aminocidos essenciais ? Questo 10: Com relao aos aminocidos encontrados em uma protena, de que depende o valor ou qualidade nutricional desta protena ? Questo 11: Sabe-se que em solues aquosas neutras os aminocidos ocorrem como ons dipolares ou zwitterions. Na prtica, como pode ser evidenciada esta estrutura em sal dos aminocidos ? Questo 12: Por que os aminocidos so denominados de substncias anfotricas ? Questo 13: Considere os aminocidos abaixo e seus respectivos pKs: a) Glicina: pK1= 2,34 e pK2= 9,6 b) Aspartato: pK1=2,09; pK2=9,82 e pKR= 3,86 c) Histidina : pK1= 1,82; pK2= 9,17 e pKR= 6,0 Baseado nesta informao, pede-se: - Representar a titulao destes aminocidos com NaOH a partir do pH 1 ao pH 14; - Calcular o pI de cada um deles; - Em qual (is) pH pode-se utilizar cada um destes aminocidos no preparo de solues tampo ? Questo 14: Quando uma soluo de aminocido apresenta maior poder tampo ? Em seu pK ou em seu pI ? Por que ?

Questo 15: Por que o aminocido histidina bastante encontrado nas protenas plasmticas ? Questo 16: Defina: a) Peptdeo b) Ligao Peptdica Questo 17: Como so classificados os peptdeos quanto ao nmero de aminocidos integrantes ? Definir e exemplificar cada um deles. Questo 18: Como so chamadas as unidades de aminocidos em um peptdeo ? Questo 19: O aminocido localizado na ponta de um peptdeo com um grupo alfa-amino livre denominado ? Questo 20: O aminocido localizado na ponta de um peptdeo com um grupo alfa-carboxila livre denominado ? Questo 21: Cite duas enzimas digestivas que hidrolizam ligaes peptdicas de protenas alimentares? Questo 22: Cite dois importantes oligopeptdeos com atividade hormonal e fale de sua funo biolgica ? Questo 23: biolgica ? Cite dois importantes polipeptdeos com atividade hormonal e fale de sua funo

Questo 24: Desenhe o dipeptdeo formado quando a alanina reage com a glicina para formar uma ligao peptdica. Existe mais de um produto para esta reao ? Questo 25: Dado o peptdeo com a seguinte sequncia de aminocidos: Val - Met - Ser - Ile - Phe - Arg - Cys - Tyr - Leu Identificar: a) Os aminocidos polares ? b) Os aminocidos aromticos ? c) Os aminocidos que contm enxofre ? d) O aminocido N-terminal ? e) O aminocido C-terminal ? Questo 26: Quais as diferenas estruturais entre os hormnios peptdicos oxitocina e vasopressina ? Como eles diferem em funo ? Questo 27: Defina protenas ? Questo 28: O que uma protena conjugada (D exemplos) ? O que um grupo prosttico (D exemplos) ?. Questo 29: Classificar morfolgica, qumica e quanto a funo biolgica as protenas: hemoglobina, colgeno e queratina. Questo 30: Definir estrutura primria, secundria, terciria e quaternria de uma protena ? Questo 31: Discutir a seguinte afirmao: a estrutura primria de uma protena determina a sua estrutura terciria. Questo 32: Relacione quatro tipos de foras responsveis pela manuteno da estrutura terciria de uma protena. Cite exemplos de grupos nas protenas que esto envolvidos em cada tipo de interao. Questo 33: Que tipos de foras so responsveis pela manuteno da estrutura secundria de uma protena ? Questo 34: O que desnaturao de uma protena ? Pode este processo ser reversvel ? Explique.

Questo 35: Explique por que uma protena quando modificada covalentemente no pode ser renaturada ? Questo 36: A txina botulnica, uma protena de apenas uma cadeia polipeptdica, uma das toxinas de alimento mais nociva ao homem, sendo produzida ocasionalmente devido a proliferao e crescimento da bactria Clostridium botulinum em alimentos conservados inadequadamente. A ingesto da txina pode ser letal; entretanto, os alimentos contaminados por essa bactria podem ser desintoxicados mediante a sua ebulio durante 15 a 20 minutos. Explique por que este tratamento do alimento efetivo ? Questo 37: Uma mistura contendo as protenas citocromo c (pI=10,6) e mioglobina (pI=7,0) foi submetida a eletroforese, utilizando-se solues tampes com os seguintes valores de pH: 3 ; 7; 10,6 e 12. Mostrar a migrao das protenas em cada caso. Questo 38: A mobilidade eletrofortica em pH 8,6 da hemoglobina normal e de hemoglobinas anormais (que apresentam substituio de um aminocido) est representada abaixo: (-) A Normal B (+) Identificar a que posio (A, B, C ou D) corresponde cada hemoglobina anormal: HbN glutamato em lugar de lisina HbC lisina em lugar de glutamato Questo 39: Uma amostra de sangue humano foi centrifugada e, constatou-se que o sobrenadante resultante (plasma) era rico nas gamaglobulinas IgG e IgM. Sabendo-se que o peso molecular de IgG=150 KDa e de IgM=900 Kda, pergunta-se: a) Essas protenas podem ser separada numa coluna cromatogrfica de Sephadex G-200 ? b) Qual delas emerge primeiro de uma coluna de cromatografia ? Por qu ? Questo 40: Na eletroforese em gel de poliacrilamida com SDS, uma protena monomrica de 90 KDa move-se menos que uma outra protena monomrica de 40 KDa. Em contraste, a protena de 90 KDa emerge primeiro de uma coluna cromatogrfica de Sephadex G-50. Qual o motivo desta diferena ?

ATENO : Em caso de dvidas, recorrer ao Professor da disciplina e aos Monitores de Bioqumica do Depto de Biologia Molecular !