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1. BIOQUIMICA COMO CIENCIA La bioqumica estudia los componentes qumicos de los seres vivos, especialmente las protenas, carbohidratos, lpidos y cidos nuclicos, adems de otras pequeas molculas presentes en las clulas. La bioqumica se basa en el concepto de que todo ser vivo contiene carbono y en general las molculas biolgicas estn compuestas principalmente de carbono, hidrgeno, oxgeno, nitrgeno, fsforo y azufre. La Bioqumica como Ciencia es la Disciplina diferenciada, con su propia identidad. Se caracteriza por su nfasis en las estructuras y las reacciones entre las biomolculas, en especial las enzimas y la catlisis biolgica; en la determinacin de las rutas metablicas y la regulacin de las mismas y por el principio qumico que las dirige. 2. PRINCIPIOS Y OBJETIVOS GENERALES 2.1. PRINCIPIOS La vida requiere energa. Los organismos vivos transforman constantemente energa en trabajo til. Crecen y se multiplican. Las reacciones bioqumicas requieren de catalizadores. Todo organismo vivo acelera sus reacciones bioqumicas por enzimas especficas. la vida depende de la informacin codificada en los genes, cuya expresin se explica por el Dogma Central de la Biologa Molecular 2.2. OBJETIVOS Comprender la qumica bsica y los principios fisicoqumicos que se aplican a los organismos vivos. Describir la estructura, organizacin y las funciones de la materia viva en trminos moleculares. Contribuir al desarrollo Biotecnolgico y Biomdico de las Ciencias aplicadas 3. BIOQUMICA COMO CIENCIA INTERDISCIPLINARIA Extrae sus principales temas de estudio de las siguientes disciplinas: a. Qumica orgnica. Describe las propiedades de las biomolculas. b. Biofsica. Aplica la Fsica al estudio de las estructuras de las biomolculas. c. Investigacin Mdica. Intenta explicar los eventos patolgicos en trminos moleculares. d. La Nutricin. Explica el metabolismo de los organismos, a travs, de la descripcin de los requerimientos alimenticios indispensables para el mantenimiento de la salud. e. La Microbiologa. Explica la participacin de algunos microorganismos en importantes rutas metablicas en algunos animales. f. La Fisiologa. Investiga los procesos de la vida a nivel tisular y del organismo. g. La Biologa Celular. Describe la divisin bioqumica del trabajo en el interior de una clula y el de su gentica. h. Gentica: Es un rea de la biologa dnde se estudia principalmente el ADN y ARN, para entender la funcin de cada una de sus partes y los procesos asociados a su conservacin.

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i.

j.

Inmunologa: rea de la biologa, la cual se interesa por la reaccin del organismo frente a organismos como las bacterias y virus. Todo esto tomando en cuenta la reaccin y funcionamiento del sistema inmune de los seres vivos. Farmacologa: rea de la qumica que estudia cmo afectan ciertas sustancias al funcionamiento celular en el organismo.

BIOELEMENTOS 1. DEFINICION El anlisis qumico de la materia viva revela que los seres vivos estn formados por una serie de elementos y compuestos qumicos. Los elementos qumicos que forman parte de la materia viva se denominan bioelementos, que, en los seres vivos, forman biomolculas, que podemos clasificar en: Inorgnicas: Agua, Sales minerales, Algunos gases: O2, CO2, N2,ETC Y Orgnicas: Glcidos, Lpidos, Protenas, cidos Nucleicos. En cualquier ser vivo se pueden encontrar alrededor de setenta elementos qumicos, pero no todos son indispensables ni comunes a todos los seres. 2. CLASIFICACION Atendiendo a su abundancia se pueden clasificar en: 2.1. Bioelementos primarios Tambin denominados Bioelementos Principales, que aparecen en una proporcin media del 96% en la materia viva, constituyendo el 95% de la masa total de todos los seres vivientes. y son carbono, oxigeno, hidrgeno, nitrgeno, fsforo y azufre. Estos elementos renen una serie de propiedades que los hacen adecuados para la vida: Forman entre ellos enlaces covalentes muy estables, compartiendo pares de electrones. El carbono, oxgeno y nitrgeno pueden formar enlaces dobles o triples. Facilitan la adaptacin de los seres vivos al campo gravitatorio terrestre, ya que son los elementos ms ligeros de la naturaleza. 2.2. Bioelementos secundarios, aparecen en una proporcin prxima al 3,3%. Son: calcio, sodio, potasio, magnesio y cloro, desempeando funciones de vital importancia en fisiologa celular. Azufre Se encuentra en dos aminocidos (cistena y metionina) , presentes en todas las protenas. Tambin en algunas sustancias como el Coenzima A Forma parte de los nucletidos, compuestos que forman los cidos nuclicos. Forman parte de coenzimas y otras molculas como fosfolpidos, sustancias fundamentales de las membranas celulares. Tambin forma parte de los fosfatos, sales minerales abundantes en los seres vivos.

Fsforo

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Forma parte de la molcula de clorofila, y en forma inica acta Magnesio como catalizador, junto con las enzimas, en muchas reacciones qumicas del organismo. Calcio Forma parte de los carbonatos de calcio de estructuras esquelticas. En forma inica interviene en la contraccin muscular, coagulacin sangunea y transmisin del impulso nervioso. Catin abundante en el medio extracelular; necesario para la conduccin nerviosa y la contraccin muscular. Catin ms abundante en el interior de las clulas; necesario para la conduccin nerviosa y la contraccin muscular. Anin ms frecuente; necesario para mantener el balance de agua en la sangre y fludo intersticial.

Sodio Potasio Cloro

2.3. Oligoelementos: microconstituyentes, o elementos vestigiales, tambin se denominan elementos traza que aparecen en la materia viva en proporcin inferior al 0,1% siendo tambin esenciales para la vida: hierro, manganeso, cobre, zinc, flor, yodo, boro, silicio, vanadio, cobalto, selenio, molibdeno y estao. An participando en cantidades infinitesimales, no por ello son menos importantes, pues su carencia puede acarrear graves trastornos para los organismos. Se han aislado unos 60 oligoelementos en los seres vivos, pero solamente 14 de ellos pueden considerarse comunes para casi todos, y estos son: hierro, manganeso, cobre, zinc, flor, iodo, boro, silicio, vanadio, cromo, cobalto, selenio, molibdeno y estao. Fundamental para la sntesis de clorofila, catalizador en reacciones qumicas y formando parte de citocromos que intervienen en la Hierro respiracin celular, y en la hemoglobina que interviene en el transporte de oxgeno. Manganeso Yodo Flor Cobalto Silicio Cromo Zinc Litio Molibdeno Interviene en la fotolisis del agua , durante el proceso de fotosntesis en las plantas. Necesario para la sntesis de la tiroxina, hormona que interviene en el metabolismo Forma parte del esmalte dentario y de los huesos. Forma parte de la vitamina B12, necesaria para la sntesis de hemoglobina . Proporciona resistencia al tejido conjuntivo, endurece tejidos vegetales como en las gramneas. Interviene junto a la insulina en la regulacin de glucosa en sangre. Acta como catalizador en muchas reacciones del organismo. Acta sobre neurotransmisores y la permeabilidad celular. Previene estados de depresiones. Forma parte de las enzimas vegetales que actan en la reduccin de los nitratos por parte de las plantas. 3

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PRINCIPIOS INMEDIATOS 1. DEFINICION: Los principios inmediatos o biomolculas son las molculas que aparecen en los seres vivos. 2. CLASIFICACION Se clasifican en simples y compuestos. Los principios inmediatos simples son los que estn formados por un solo tipo de tomos, como, por ejemplo, la molcula de oxgeno (O2), que slo tiene dos tomos del bioelemento oxgeno. Adems del oxgeno, tambin es un principio inmediato simple el nitrgeno (N2). Los principios inmediatos compuestos son los que poseen varios tipos de tomos. Se dividen en orgnicos e inorgnicos. Los orgnicos, o que poseen un elevado porcentaje de carbono, son: los glcidos o glucosa (C6H12O6), los lpidos, los prtidos y los cidos nucleicos. Los inorgnicos, o que no poseen carbono o lo poseen en un porcentaje muy bajo, son: el agua (H2O), el dixido de carbono (CO2) y las sales minerales. EL AGUA 1. DEFINICION El agua es una biomolcula inorgnica. Se trata de la biomolcula ms abundante en los seres vivos. En las medusas, puede alcanzar el 98% del volumen del animal y en la lechuga, el 97% del volumen de la planta. Estructuras como el lquido interno de animales o plantas, embriones o tejidos conjuntivos suelen contener gran cantidad de agua. Otras estructuras, como semillas, huesos, pelo, escamas o dientes poseen poca cantidad de agua en su composicin. 2. ESTRUCTURA El agua es una molcula formada por dos tomos de Hidrgeno y uno de Oxgeno. La unin de esos elementos con diferente electronegatividad proporciona unas caractersticas poco frecuentes. Estas caractersticas son: La molcula de agua forma un ngulo de 104,5. La molcula de agua es neutra. La molcula de agua, aun siendo neutra, forma un dipolo, aparece una zona con un diferencial de carga positivo en la regin de los Hidrgenos, y una zona con diferencial de carga negativo, en la regin del Oxgeno. El dipolo facilita la unin entre molculas, formando puentes de hidrgeno, que unen la parte electropositiva de una molcula con la electronegativa de otra. 3. PROPIEDADES El agua tiene propiedades especiales, derivadas de su singular estructura. Estas propiedades son: Alto calor especfico: para aumentar la temperatura del agua un grado centgrado es necesario comunicarle mucha energa para poder romper los puentes de Hidrgeno que se generan entre las molculas. 4

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Alto calor de vaporizacin: el agua absorbe mucha energa cuando pasa de estado lquido a gaseoso. Alta tensin superficial: las molculas de agua estn muy cohesionadas por accin de los puentes de Hidrgeno. Esto produce una pelcula de agua en la zona de contacto del agua con el aire. Como las molculas de agua estn tan juntas el agua es incompresible. Capilaridad: el agua tiene capacidad de ascender por las paredes de un capilar debido a la elevada cohesin molecular. Alta constante dielctrica: la mayor parte de las molculas de agua forman un dipolo, con un diferencial de carga negativo y un diferencial de carga positivo. Bajo grado de ionizacin: la mayor parte de las molculas de agua no estn disociadas. Slo un reducido nmero de molculas sufre disociacin, generando iones positivos (H+) e iones negativos (OH-). En el agua pura, a 25C, slo una molcula de cada 10.000.000 est disociada, por lo que la concentracin de H + es de 10-7. Por esto, el pH del agua pura es igual a 7. Ionizacin del agua y escala de pH. La densidad del agua: en estado lquido, el agua es ms densa que en estado slido. Por ello, el hielo flota en el agua. Esto es debido a que los puentes de Hidrgeno formados a temperaturas bajo cero unen a las molculas de agua ocupando mayor volumen. 4. IMPORTANCIA BIOLGICA Las propiedades del agua permiten aprovechar esta molcula para algunas funciones para los seres vivos. Estas funciones son las siguientes: Disolvente polar universal: el agua, debido a su elevada constante dielctrica, es el mejor disolvente para todas aquellas molculas polares. Sin embargo, molculas apolares no se disuelven en el agua. La capacidad disolvente es la responsable de dos funciones importantes para los seres vivos: es el medio en que transcurren las mayoras de las reacciones del metabolismo, y el aporte de nutrientes y la eliminacin de desechos se realizan a travs de sistemas de transporte acuosos. Lugar donde se realizan reacciones qumicas: debido a ser un buen disolvente, por su elevada constante dielctrica, y debido a su bajo grado de ionizacin. Funcin estructural: por su elevada cohesin molecular, el agua confiere estructura, volumen y resistencia. Funcin de transporte: por ser un buen disolvente, debido a su elevada constante dielctrica, y por poder ascender por las paredes de un capilar, gracias a la elevada cohesin entre sus molculas, los seres vivos utilizan el agua como medio de transporte por su interior. Funcin amortiguadora: debido a su elevada cohesin molecular, el agua sirve como lubricante entre estructuras que friccionan y evita el rozamiento. Funcin termorreguladora: al tener un alto calor especfico y un alto calor de vaporizacin el agua es un material idneo para mantener constante la temperatura, absorbiendo el exceso de calor o cediendo energa si es necesario

SALES MINERALES 5

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1. DEFINICION Las sales minerales son biomolculas inorgnicas que aparecen en los seres vivos de forma precipitada, disuelta en forma de iones o asociada a otras molculas. 2. CLASIFICACION 2.1. Segun la solubilidad: Se pueden distinguir: 2.1.1. Sales inorgnicas insolubles en agua. Su funcin es de tipo plstico, formando estructuras de proteccin y sostn, como por ejemplo: Caparazones de crustceos y moluscos (CaCO3) y caparazones silceos de radiolarios y diatomeas. Esqueleto interno en vertebrados (fosfato, cloruro, fluoruro y carbonato de calcio) y los dientes. Determinadas clulas incorporan sales minerales, como las que se pueden encontrar en la pared de celulosa de los vegetales, o como forma de producto residual del metabolismo (cristales de oxalato clcico, que puede contribuir al desarrollo de clculos renales o biliares). El carbonato de calcio tambin se puede encontrar en el odo interno, formando los otolitos que intervienen en el mantenimiento del equilibrio interno o partculas de magnetita que, al parecer, pueden utilizar algunos animales con funcin de brjula para orientarse en sus desplazamientos. 2.1.2. Sales inorgnicas solubles en agua. La actividad biolgica que proporcionan se debe a sus iones y desempean, fundamentalmente, las siguientes funciones: Funciones catalticas. Algunos iones como Mn+2, Cu+2, Mg+2, Zn+2, etc. actan como cofactores enzimticos siendo necesarios para el desarrollo de la actividad cataltica de ciertas enzimas . El ion ferroso-frrico forma parte del grupo hemo de la hemoglobina y mioglobina, protenas encargadas del transporte de oxgeno. Tambin el ion Mg+2 forma parte de las clorofilas y participa en los procesos de la fotosntesis. El Ca +2, interviene en la contraccin muscular y en los procesos relacionados con la coagulacin de la sangre. Funciones osmticas. Intervienen en la distribucin del agua intra y extra celulares. Los iones Na+, K+, Cl-, Ca+2, participan en la generacin de gradientes electroqumicos, que son imprescindibles en el potencial de membrana y del potencial de accin en los procesos de la sinapsis neuronal, transmisin del impulso nervioso y contraccin muscular. Funcin tamponadora. Se lleva a cabo por los sistemas carbonatobicarbonato y monofosfato-bifosfto. 2.2. Asociadas a otras molculas Los iones pueden asociarse a molculas, permitiendo realizar funciones que, por s solos no podran, y que tampoco realizara la molcula a la que se asocia, si no tuviera el in. La hemoglobina es capaz de transportar oxgeno por la sangre porque est unida a un in Fe++. Los citocromos actan como transportadores de electrones porque poseen un in Fe+++. La clorofila captura energa luminosa en el proceso de fotosntesis por contener un in Mg++ en su estructura. Los seres vivos se han adaptado para utilizar qumicamente el agua en dos tipos de reacciones: 6

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a) En la fotosntesis en la que los enzimas utilizan el agua como fuente de tomos de hidrgeno. b) En las reacciones de hidrlisis, en que los enzimas hidrolticos han explotado la capacidad del agua para romper determinados enlaces hasta degradar los compuestos orgnicos en otros ms simples, durante los procesos digestivos

LAS BIOMOLCULAS

1. DEFINICION Los bioelementos se combinan entre s para formar las molculas que componen la materia viva. Estas molculas reciben el nombre de Biomolculas o Principios Inmediatos. Las biomolculas, para poder ser estudiadas, deben ser extradas de los seres vivos mediante procedimientos fsicos, nunca qumicos, ya que si as fuera, su estructura molecular se alterara. Los procedimientos fsicos son la filtracin, la dilisis, la cristalizacin, la centrifugacin, la cromatografa y la electroforesis. 2. CLASIFICACION Las biomolculas se clasifican atendiendo a su composicin. Las biomolculas inorgnicas son las que no estn formadas por cadenas de carbono, como son el agua, las sales minerales o los gases. Las molculas orgnicas estn formadas por cadenas de carbono y se denominan Glcidos, Lpidos, Prtidos y cidos nuclicos. Las biomolculas orgnicas, atendiendo a la longitud y complejidad de su cadena, se pueden clasificar como monmeros o polmeros. Los monmeros son molculas pequeas, unidades moleculares que forman parte de una molcula mayor. Los polmeros son agrupaciones de monmeros, iguales o distintos, que componen una molcula de mayor tamao. METABOLISMO 1. DEFINICION Es el conjunto de reacciones y procesos fsico-qumicos que ocurren en una clula. Estos complejos procesos interrelacionados son la base de la vida a nivel molecular, y permiten las diversas actividades de las clulas: crecer, reproducirse, mantener sus estructuras, responder a estmulos, etc. 2. DIVISION La economa que la actividad celular impone sobre sus recursos obliga a organizar estrictamente las reacciones qumicas del metabolismo en vas o rutas metablicas, donde un compuesto qumico (sustrato) es transformado en otro (producto), y este a su vez funciona como sustrato para generar otro producto, siguiendo una secuencia de reacciones bajo la intervencin de diferentes enzimas (generalmente una para cada sustrato-reaccin). Las enzimas son cruciales en el metabolismo porque agilizan las reacciones fsico-qumicas, pues hacen que posibles reacciones termodinmicas deseadas pero "desfavorables", mediante un acoplamiento, resulten en reacciones 7

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favorables. Las enzimas tambin se comportan como factores reguladores de las vas metablicas, modificando su funcionalidad y por ende, la actividad completa de la va metablica en respuesta al ambiente y necesidades de la clula, o segn seales de otras clulas. El metabolismo de un organismo determina qu sustancias encontrar nutritivas y cules encontrar txicas. Por ejemplo, algunas procariotas utilizan sulfuro de hidrgeno como nutriente, pero este gas es venenoso para los animales. Una caracterstica del metabolismo es la similitud de las rutas metablicas bsicas incluso entre especies muy diferentes. Por ejemplo: la secuencia de pasos qumicos en una va metablica como el ciclo de Krebs es universal entre clulas vivientes tan diversas como la bacteria unicelular Escherichia coli y organismos pluricelulares como el elefante Esta estructura metablica compartida es muy probablemente el resultado de la alta eficiencia de estas rutas, y de su temprana aparicin en la historia evolutiva. Macromolculas como el almidn, la celulosa o las protenas no pueden ser tomadas por las clulas automticamente, por lo que necesitan que se degraden en unidades ms simples antes de usarlas en el metabolismo celular. Muchas enzimas digieren estos polmeros. Estas enzimas incluyen peptidasa que digiere protenas en aminocidos, glicosil hidrolasas que digieren polisacridos en disacridos y monosacridos, y lipasas que digieren los triglicridos en cidos grasos y glicerol. Los microbios simplemente secretan enzimas digestivas en sus alrededores mientras que los animales secretan estas enzimas desde clulas especializadas al aparato digestivo. Los aminocidos, monosacridos, y triglicridos liberados por estas enzimas extracelulares son absorbidos por las clulas mediante protenas especficas de transporte. El metabolismo se divide en dos procesos conjugados: catabolismo y anabolismo., ambos son procesos acoplados que hacen al metabolismo en conjunto, puesto que cada uno depende del otro. CATABOLISMO Es el conjunto de procesos metablicos que liberan energa. Estos incluyen degradacin y oxidacin de molculas de alimento, as como reacciones que retienen la energa del Sol. El propsito de ests reacciones catablicas es proveer energa, poder reductor y componentes necesitados por reacciones anablicas. La naturaleza de estas reacciones catablicas difiere de organismo en organismo. Sin embargo, estas diferentes formas de catabolismo dependen de reacciones de reduccinoxidacin que involucran transferencia de electrones de molculas donantes (como las molculas orgnicas, agua, amonaco, sulfuro de hidrgeno e iones ferrosos), a aceptores de dichos electrones como el oxgeno, el nitrato o el sulfato. En los animales, estas reacciones conllevan la degradacin de molculas orgnicas complejas a otras ms simples, como dixido de carbono y agua. En organismos fotosintticos como plantas y cianobacteria, estas transferencias de electrones no liberan energa, pero son usadas como un medio para almacenar energa solar. El conjunto de reacciones catablicas ms comn en animales puede ser separado en tres etapas distintas. En la primera, molculas orgnicas grandes como las protenas, polisacridos o lpidos son digeridos en componentes ms pequeos fuera de las clulas. Luego, estas molculas pequeas son llevadas a las clulas y convertidas en molculas an ms pequeas, generalmente coenzima A, que libera energa. Finalmente, el grupo acetil en la molcula de acetil CoA es oxidado a agua y dixido 8

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de carbono, liberando energa que se retiene al reducir la coenzima nicotinamida adenina dinucletido (NAD+) en NADH.Las reacciones catablicas liberan energa; un ejemplo es la gluclisis, un proceso de degradacin de compuestos como la glucosa, cuya reaccin resulta en la liberacin de la energa retenida en sus enlaces qumicos

ANABOLISMO Es el conjunto de procesos metablicos constructivos en donde la energa liberada por el catabolismo es utilizada para sintetizar molculas complejas. En general, las molculas complejas que dan lugar a estructuras celulares son construidas a partir de precursores simples. El anabolismo involucra tres facetas. Primero, la produccin de precursores como aminocidos, monosacridos, isoprenoides y nucletidos; segundo, su activacin en reactivos usando energa del ATP; y tercero, el conjunto de estos precursores en molculas ms complejas como protenas, polisacridos, lpidos y cidos nuclicos. Las reacciones anablicas, en cambio, utilizan esta energa liberada para recomponer enlaces qumicos y construir componentes de las clulas como lo son las protenas y los cidos nuclicos. METABOLISMO MICROBIANO 1. DEFINICION: Es el conjunto de procesos por los cuales un microorganismo obtiene la energa y los nutrientes (carbono, por ejemplo) que necesita para vivir y reproducirse. Los microorganismos utilizan numerosos tipos de estrategias metablicas distintas y las especies pueden a menudo distinguirse en base a estas estrategias. Las caractersticas metablicas especficas de un microorganismo constituyen el principal criterio para determinar su papel ecolgico, su responsabilidad en los ciclos biogeoqumicos y su utilidad en los procesos industriales. 2. TIPOS: Los distintos tipos de metabolismo microbiano se pueden clasificar segn tres criterios distintos: Segn la Obtencin del carbono para la construccin de la masa clular Auttrofo. El carbono se obtiene del dixido de carbono (CO2). Hetertrofo. El carbono se obtiene de compuestos orgnicos. Mixtrofo. El carbono se obtiene tanto de compuestos orgnicos como fijando el dixido de carbono. 9

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Segn la Obtencin de los equivalentes reductores para la conservacin de energa o en las reacciones biosintticas: Litotrofo. Los equivalentes reductores se obtienen de compuestos inorgnicos. Organotrofo. Los equivalentes reductores se obtienen de compuestos orgnicos. Segn la obtencin de la energa para vivir y crecer: Quimiotrofo. La energa se obtiene de compuestos qumicos externos. Fototrofo. La energa se obtiene de la luz.

METABOLISMO HETERTROFO La mayora de los microorganismos son hetertrofos (o ms exactamente quimiorganohetertrofos), con compuestos orgnicos como fuentes de carbono y de energa. Los microorganismos hetertrofos viven de los alimentos que roban a anfitriones vivos (como comensales o parsitos) o de la materia orgnica muerta de todo tipo (saprfagos). Este metabolismo microbiano constituye el principal factor de descomposicin de todos los organismos despus de muerte. Muchos microorganismos eucariontes son hetertrofos por depredacin o parasitismo. La mayora de las bacterias patgenas son parsitos hetertrofos de seres humanos o de otras especies eucariontes. Los microorganismos hetertrofos son extremadamente abundantes en naturaleza y responsables de la degradacin de los polmeros orgnicos tales como celulosa, quitina o lignina que son generalmente indigeribles para los animales ms grandes. Esta degradacin, generalmente, requiere la colaboracin de varios organismos distintos, cada uno de los cuales realiza uno de los pasos de la degradacin hasta obtener dixido de carbono. Hay muchas variaciones en este tema, pues diversos organismos pueden degradar diversos polmeros y secretar diversos residuos. Algunos organismos pueden incluso degradar los compuestos ms recalcitrantes tales como pesticidas y petrleo, realizando su reciclado. Bioqumicamente, el metabolismo hetertrofo procarionte es mucho ms verstil que el de los organismos eucariontes, aunque muchos procariontes comparten los modelos metablicos ms bsicos con los eucariontes, por ejemplo, usando la glicolisis (tambin llamada ruta EMP) para el metabolismo del azcar y el ciclo del cido ctrico en la degradaccin del acetato, produciendo energa bajo la forma de ATP y reduciendo energa bajo la forma de NADH o quinona. Estas rutas metablicas bsicas estan muy extendidas porque tambin estn implicadas en la biosntesis de muchos componentes necesarios para el crecimiento de la clula (a veces en la direccin contraria). Sin embargo, muchas bacterias utilizan rutas metablicas alternatias con la excepcin de la glicolisis y del ciclo del cido ctrico. Un ejemplo bien estudiado es el metabolismo del azcar por la ruta del ceto-desoxifosfogluconato (tambin llamada ruta ED) en Pseudomonas en vez de la ruta glicoltica. Por otra parte, hay incluso una tercera ruta alternativa catablica del azcar usado por algunas bacterias, la ruta de la pentosa fosfato. FERMENTACIN La fermentacin es un tipo especfico de metabolismo hetertrofo que utiliza carbono orgnico en vez de oxgeno como receptor terminal de electrones. Esto significa que estos organismos no utilizan una cadena de transporte de electrones para oxidar NADH a NAD+ y 10

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por lo tanto deben tener un mtodo alternativo para usar esta energa reductora y mantener una fuente de NAD+ para el funcionamiento apropiado de las rutas metablicas normales (por ejemplo, la glicolisis). Puesto que no requieren oxgeno, los organismos fermentantes son anaerobios. Muchos organismos pueden utilizar fermentacin bajo ciertas condiciones anaerobias y respiracin cuando el oxgeno est presente. Estos organismos son anaerobios facultativos. Para evitar la superproduccin de NADH, los organismos fermentantes obligados generalmente no tienen un ciclo completo del cido ctrico. En vez de usar ATPasas como en la respiracin, el ATP en organismos fermentantes es producido por la fosforilacin a nivel de substrato donde un grupo fosfato se transfiere de un compuesto orgnico de gran energa al ADP para formar el ATP. Como resultado de la necesidad de producir compuestos orgnicos con fosfato de la alta energa (generalmente bajo la forma de CoA-steres) los organismos fermentantes utilizan NADH y otros cofactores para producir una gran variedad de subproductos metablicos reducidos, a menudo incluyendo hidrgeno. Estos compuestos orgnicos reducidos son generalmente cidos orgnicos cortos y alcoholes derivados del piruvato, el producto final de la glicolisis. Ejemplos incluyen el etanol, acetato, lactato y el butirato. Los organismos fermentantes son muy importantes industrialmente y se utilizan parar elaborar muchos tipos de productos alimenticios. Los productos finales metablicos producidos por cada especie bacteriana especfica son los responsables del gusto y caractersticas de cada alimento. No todos los organismos fermentantes usan fosforilacin a nivel de substrato. En su lugar, algunos organismos son capaces de acoplar directamente la oxidacin de compuestos orgnicos de poca energa con la formacin de un gradiente electroqumico para mover un protn (o sodio) y as realizar la sntesis de ATP. Estas reacciones son de rendimiento energtico extremadamente bajo. Los seres humanos y otros animales tambin utilizan la fermentacin para consumir el exceso de NADH produciendo lactato, aunque sta no es la forma principal de metabolismo como en los microorganismos fermentantes.

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CICLO DE KREBS
El ciclo de Krebs (tambin llamado ciclo del cido ctrico o ciclo de los cidos tricarboxlicos) es una serie de reacciones qumicas que forman parte de la respiracin celular en todas las clulas aerobias, es decir que utilizan oxgeno. En organismos aerbicos, el ciclo de Krebs es parte de la va catablica que realiza la oxidacin de hidratos de carbono, cidos grasos y aminocidos hasta producir CO2, liberando energa en forma utilizable (poder reductor y GTP). El metabolismo oxidativo de glcidos, grasas y protenas frecuentemente se divide en tres etapas, de las cuales el ciclo de Krebs supone la segunda. En la primera etapa los carbonos de estas macromolculas dan lugar a molculas de acetil-CoA de dos carbonos, e incluye las vas catablicas de aminocidos (p. ej. desanimacin oxidativa), la beta oxidacin de cidos grasos y la glucolisis. La tercera etapa es la fosforilacin oxidativa, en la cual el poder reductor (NADH y FADH2) generado se emplea para la sntesis de ATP segn la teora del acoplamiento quimiosmtico.El ciclo de Krebs tambin proporciona precursores para muchas biomolculas, como ciertos aminocidos. Por ello se considera una va anfiblica, es decir, catablica y anablica al mismo tiempo.

REACCIONES El ciclo de Krebs tiene lugar en la matriz mitocondrial en eucariotas y en el citoplasma de procariotas. Las reacciones son:
Molcula I. Citrato II. cis-Aconitato III. Isocitrato IV. Oxalosuccinato V. -cetoglutarato Enzima 1. Aconitasa 2. Aconitasa 3.Isocitrato deshidrogenasa 4.Isocitrato deshidrogenasa 5.-cetoglutarato deshidrogenasa 6. Succinil-CoA sintetasa 7.Succinato deshidrogenasa 8. Fumarato Hidratasa 9. Malato deshidrogenasa 10. Citrato sintasa Tipo de reaccin Deshidratacin Hidratacin Oxidacin Descarboxilacin Descarboxilacin oxidativa NAD
+

Reactivos/

Productos/

Coenzimas Coenzima H2O H2O NAD


+

NADH + H

+ NADH + H + CO2 GTP CoA-SH FADH2

CoA-SH GDP + Pi FAD H2O NAD


+

VI. Succinil-CoA VII. Succinato VIII. Fumarato IX. L-Malato X. Oxaloacetato

Hidrlisis Oxidacin Adicin (H2O) Oxidacin Condensacin

NADH + H

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Visin simplificada del proceso El acetil-CoA es el principal precursor del ciclo. El cido ctrico (6 carbonos) o citrato se regenera en cada ciclo por condensacin de un acetil-CoA (2 carbonos) con una molcula de oxaloacetato (4 carbonos). El citrato produce en cada ciclo una molcula de oxaloacetato y dos CO2, por lo que el balance neto del ciclo es: Acetil-CoA + 3 NAD+ + FAD + GDP + Pi + 3 H2O CoA-SH + 3 (NADH + H+) + FADH2 + GTP + 2 CO2 + 3 H+ Los dos carbonos del Acetil-CoA son oxidados a CO2, y la energa que estaba acumulada es liberada en forma de energa qumica: GTP y poder reductor (electrones de alto potencial): NADH y FADH2. NADH y FADH2 son coenzimas (molculas capaces de unirse a enzimas) capaces de acumular la energa en forma de poder reductor para su conversin en energa qumica en la fosforilacin oxidativa. El proceso comienza con la oxidacin del piruvato, produciendo un acetil-CoA y un CO2. El acetil-CoA reacciona con una molcula de oxaloacetato (4 carbonos) para formar citrato (6 carbonos), mediante una reaccin de condensacin. A travs de una serie de reacciones el citrato se convierte de nuevo en oxaloacetato. El ciclo consume netamente 1 acetil-CoA y produce 2 CO2. Tambin consume 2 NAD+ y 1 FAD, produciendo 3 NADH y 3 H+ y 1 FADH+. . El resultado de un ciclo es (por cada molcula de piruvato): 1 GTP, 3 NADH, 1 FADH2, 2CO2 . Cada molcula de glucosa produce (va gluclisis) dos molculas de piruvato, que a su vez producen dos acetil-CoA, por lo que por cada molcula de glucosa en el ciclo de Krebs se produce: 2 GTP, 6 NADH, 2 FADH2, 4CO2.

Fosforilacin oxidativa El ciclo de Krebs siempre es seguido por la fosforilacin oxidativa. Este proceso extrae la energa en forma de electrones de alto potencial de las molculas de NADH y FADH2, regenerando NAD+ and FAD, gracias a lo cual el ciclo de Krebs puede continuar. Los electrones son transferidos a molculas de O2, rindiendo H2O. Pero esta transferencia se realiza a travs de una cadena transportadora de electrones capaz de aprovechar la energa potencial de los electrones para bombear protones al espacio intermembrana de la mitocondria. Esto genera un gradiente electroqumico de H+, que es utilizado para la sntesis de ATP mediante la enzima ATP sintetasa. De este modo el ciclo de Krebs no utiliza directamente O2, pero lo requiere al estar acoplado a la fosforilacin oxidativa. Por cada molcula de glucosa la energa obtenida mediante el metabolismo oxidativo, es decir, glucolisis seguida del ciclo de Krebs, equivale a 30/32 molculas de ATP dependiendo del tipo de lanzadera para introducir el poder reductor dentro de la mitocondria, si es la lanzadera de malato-aspartato son 32 y si es la de glicerol 3 fosfato, son 30. En la fosforilacin oxidativa, los electrones liberados de molculas de alimento en rutas como el ciclo de Krebs son transferidas con oxgeno, y la energa es liberada para sintetizar adenosn trifosfato. Esto se da en las clulas eucariotas por una serie de protenas en las membranas de la mitocondria llamadas cadena de transporte de electrones. En las clulas procariotas, estas protenas se encuentran en la membrana interna. Estas protenas utilizan la energa liberada de la oxidacin del electrn que lleva la coenzima NADH para bombear protones a lo largo de la membrana Los protones bombeados fuera de la mitocondria crean una diferencia de concentracin a lo largo de la membrana, lo que genera un gradiente electroqumico.Esta fuerza hace que vuelvan a la mitocondria a travs de una subunidad de la ATP-sintetasa. El flujo de protones 13

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hace que la subunidad menor gire, lo que produce que el sitio activo fosforile al adenosn difosfato (ADP) y lo convierta en ATP

REGULACIN Muchas de las enzimas del ciclo de Krebs son reguladas por retroalimentacin negativa, por unin alostrica del ATP, que es un producto de la va y un indicador del nivel energtico de la clula. Entre estas enzimas se incluye el complejo de la piruvato deshidrogenasa que sintetiza el acetil-CoA necesario para la primera reaccin del ciclo a partir de piruvato, procedente de la gluclisis o del catabolismo de aminocidos. Tambin las enzimas citrato sintasa, isocitrato deshidrogenasa y -cetoglutarato deshidrogenasa, que catalizan las tres primeras reacciones del ciclo de Krebs, son inhibidas por altas concentraciones de ATP. Esta regulacin frena este ciclo degradativo cuando el nivel energtico de la clula es bueno. Algunas enzimas son tambin reguladas negativamente cuando el nivel de poder reductor de la clula es elevado. El mecanismo de esta inhibicin es una inhibicin competitiva por producto (por NADH) de las enzimas que emplean NAD+ como sustrato. As se regulan, entre otros, los complejos piruvato deshidrogenasa y citrato sintasa. PRINCIPALES VAS QUE CONVERGEN EN EL CICLO DE KREBS La mayora de las vas catablicas convergen en el ciclo de Krebs. Las reacciones que forman intermediarios del ciclo se conocen como reacciones anaplerticas. En el catabolismo de protenas, Los enlaces peptdicos de las protenas son degradados por accin de enzimas proteasas en el tubo digestivo liberando sus constituyentes aminoacdicos. Estos aminocidos penetran en las clulas, donde pueden ser empleados para la sntesis de protenas o ser degradados para producir energa en el ciclo de Krebs. Para su entrada al ciclo deben eliminarse sus grupos amino (terminales y laterales) por accin de enzimas aminotransferasas y desaminasas, principalmente. En el catabolismo de lpidos, Los triglicridos son hidrolizados liberando cidos grasos y glicerol. En el hgado el glicerol puede ser convertido en glucosa va dihidroxiacetona fosfato y gliceraldehdo-3-fosfato, por la gluconeognesis (ruta anablica). En muy diversos tejidos, especialmente en msculo cardaco, los cidos grasos son degradados en la matriz mitocondrial mediante sucesivos ciclos de beta oxidacin que liberan unidades de acetil-CoA, que pueden incorporarse al ciclo de Krebs. En ocasiones, el ciclo de Krebs puede rendir propionil-CoA (3 carbonos), que puede emplearse para la sntesis de glucosa en la gluconeognesis heptica.

GLUCONEOGNESIS Es una ruta metablica anablica que permite la sntesis de glucosa a partir de precursores no glucdicos (los cuales ni provienen ni son glucosa). Est incluye la utilizacin de varios aminocidos, lactato, piruvato, glicerol y cualquiera de los intermediarios del Ciclo de los cidos Tricarboxlicos (o Ciclo de Krebs) como fuentes de carbono para la via, todos los aminocidos, excepto leucina y lisina, pueden suministrar carbono para la sntesis neta de 14

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glucosa. Ocurre casi exclusivamente en el Hgado (10% en los riones). Es un proceso muy importante, ya que en estados metablicos como el ayuno los organismos superiores son capaces de sintetizar glucosa a partir de otras sustancias. REACCIONES Las enzimas que participan en la via glucoltica participan tambin en la gluconeognesis, se diferencian por tres reacciones irreversibles que utilizan enzimas especificas de este proceso y que condicionan los dos rodeos metablicos de esta via. Estas reacciones son: De glucosa a glucosa-6-(P). De fructosa-6-(P) a fructosa-1,6-bisfosfato. De fosfoenolpirvico a cido pirvico. Reaccin Global 2 cido pirvico + 4 ATP + 2 GTP + 2 NADH + 6 H2O ---------> Glucosa + 4ADP + 2GDP + 6Pi + 2NAD + 2H+ GLUCOGNESIS La glucognesis es la ruta anablica por la que tiene lugar la sntesis de glucgeno (tambin llamado glicgeno) a partir de un precursor ms simple, la glucosa. Se lleva a cabo principalmente en el hgado, y en menor medida en el msculo. La glucognesis es estimulada por la hormona insulina, secretada por las clulas (beta) de los islotes de Langerhans del pncreas y es inhibida por su contrarreguladora, la hormona glucagn, secretada por las clulas (alfa) de los islotes de Langerhans del pncreas, que estmula la ruta catablica llamada glucogenlisis para degradar el glucgeno almacenado y transformarlo en glucosa y as aumentar la glicemia (azcar en sangre). REACCION: El proceso de Glucognesis, tambin conocido como combustion de glucosa, se lleva a cabo en la matriz extracelular del tejido epitelial. La ecuacin extrafundamental es: 2 ac. piruvico + 4 ATTP + 2 GHTP + 9 NADH + 7 H + 3 H2O --> Glucosa + 4 ADP + 2 GDP + 6 P + 2 NAD+

RUTA DE LA PENTOSA FOSFATO Es una ruta metablica, en la cual se sintetizan pentosas (monosacridos de 5 carbonos) y se genera poder reductor en forma de NADPH. La ruta puede dividirse en dos fases, la fase oxidativa, en que se genera NADPH, y la fase no oxidativa en que se sintetizan pentosasfosfato (y otros monosacridos-fosfato). Esta ruta es una de las tres principales vas en que se crea poder reductor (aproximadamente un 10% en humanos).

FASES 1.-Fase oxidativa En esta fase, dos molculas de NADP+ son reducidas a NADPH utilizando la energa de la conversin de glucosa-6-fosfato en ribulosa-5-fosfato, segn la reaccin:

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El NADPH que es usado en la sntesis de cidos grasos y colesterol, reacciones de hidroxilacin de neurotransmisores, detoxificacin de perxidos de hidrgeno, as como en el mantenimiento del glutation en su forma reducida. 2. Fase no oxidativa A partir de la ribulosa-5-fosfato se sintetiza xilulosa-5-fosfato y ribosa-5-fosfato monosacrido imprescindible para la sntesis de nucletidos, nucletidos y por ende de cidos nuclicos. El resto de monosacridos pueden tener diferentes usos, tanto biosintticos como energticos (gluclisis). LOS LPIDOS Los lpidos son biomolculas orgnicas formadas por Carbono, Hidrgeno y Oxgeno, que pueden aparecer en algunos compuestos el Fsforo y el Nitrgeno. Constituyen un grupo de molculas con composicin, estructura y funciones muy diversas, pero todos ellos tienen en comn varias caractersticas: No se disuelven en agua, formando estructuras denominadas micelas. Se disuelven en disolventes orgnicos, tales como cloroformo, benceno, aguarrs o acetona. Son menos densos que el agua, por lo que flotan sobre ella. CLASIFICACION : Los lpidos se ordenan en los siguientes grupos moleculares Acidos grasos: Son molculas formadas por cadenas de carbono que poseen un grupo carboxilo como grupo funcional. El nmero de carbonos habitualmente es de nmero par. Los tipos de cidos grasos ms abundantes en la Naturaleza estn formados por cadenas de 16 a 22 tomos de carbono. La parte que contiene el grupo carboxilo manifiesta carga negativa en contacto con el agua, por lo que presenta carcter cido. El resto de la molcula

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no presenta polaridad (apolar) y es una estructura hidrfoba. Como la cadena apolar es mucho ms grande que la parte con carga (polar), la molcula no se disuelve en agua. Los cidos grasos se clasifican en saturados e insaturados. Saturados: Los enlaces entre los carbonos son enlaces simples, con la misma distancia entre ellos y el mismo ngulo (110). Esta circunstancia permite la unin entre varias molculas mediante fuerzas de Van der Waals. Cuanto mayor sea la cadena (ms carbonos), mayor es la posibilidad de formacin de estas interacciones dbiles. Por ello, a temperatura ambiente, los cidos grasos saturados suelen encontrarse en estado slido. Insaturados: En ellos pueden aparecer enlaces dobles o triples entre los carbonos de la cadena. La distancia entre los carbonos no es la misma que la que hay en los dems enlaces de la molcula, ni tampoco los ngulos de enlace (123 para enlace doble, 110 para enlace simple). Esto origina que las molculas tengan ms problemas para formar uniones mediante fuerzas de Van der Waals entre ellas. Por ello, a temperatura ambiente, los cidos grasos insaturados suelen encontrarse en estado lquido. Los cidos grasos se clasifican atendiendo al estado que presentan a temperatura ambiente. Los slidos se denominan sebos, y estn formados por cidos grasos saturados. Los lquidos se llaman aceites, y estn formados por cidos grasos insaturados y saturados. Acil-glicridos: Los cidos grasos forman parte de otros compuestos lipdicos. Todos aquellos lpidos que tienen cidos grasos en su estructura tienen la capacidad de realizar la reaccin de saponificacin, y por ello se llaman lpidos saponificables. Los acil-glcridos estn formados por cidos grasos, por lo que son lpidos saponificables. Son molculas formadas por la unin de uno, dos o tres cidos grasos, con una glicerina. La unin se da entre los grupos -OH de cada molcula. Se libera una molcula de agua. El enlace recibe el nombre de ster. Si la glicerina se une a un cido graso, se forma un monoacilglicrido. Si se une a dos cidos grasos se forma un diacilglicrido. Si se une a tres cidos grasos se forma un triacilglicrido o, simplemente, triglicrido. 2.1. Funciones de los acil-glicridos La importancia de los acil-glicridos radica en que: Actan como combustible energtico. Son molculas muy reducidas que, al oxidarse totalmente, liberan mucha energa (9 Kcal/g). Funcionan como reserva energtica. Acumulan mucha energa en poco peso. Comparada con los glcidos, su combustin produce ms del doble de energa. Los animales utilizan los lpidos como reserva energtica para poder desplazarse mejor. Aguantaran nuestras articulaciones el peso del cuerpo si acumulsemos la energa en forma de glcidos? Sirven como aislantes trmicos. Conducen mal el calor. Los animales de zonas fras presentan, a veces, una gran capa de tejido adiposo. Son buenos amortiguadores mecnicos. Absorben la energa de los golpes y, por ello, protegen estructuras sensibles o estructuras que sufren continuo rozamiento. 2.2. Fuentes de triacilglicridos Dieta:; El 90% de los lpidos son triacilgliceroles (TG), otros fosfolpidos (PL), otros colesterol (C) y steres del colesterol (EC). Hay que hidrolizarlos antes de que entren en 17

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el intestino. Si las grasas son insolubles y el enzima es soluble hay un problema. Para que el enzima pueda actuar han de estar en forma de emulsin,lo que se consigue con sales biliares y movimientos peristlticos del intestino. El enzima que hidroliza los lpidos es una lipasa del intestino, segregada por el pncreas en forma de precursor inactivo llamado prolipasa. El precursor se activa en presencia de una protena producida en la pared intestinal llamada colipasa. La lipasa digiere las grasas hidrolizando el enlace ster y liberando los cidos grasos. Normalmente libera los de los extremos dando 2.monoacilglicerol. Una vez dentro del intestino se vuelven a unir formando el triacilglicerol. Se han de romper para poder pasar. Una vez resintetizado va por el torrente sanguneo a todo el organismo. Como la sangre es acuosa al sintetizarlos en la mucosa se unen a lpidos polares (PL, E, EC) y con protenas (lipoprotenas). Las lipoprotenas hacen que sean solubles. Hay varios tipos segn su composicin, aunque la estructura es muy parecida en todas. La de la mucosa intestinal es la quilomicrn. Porcentaje de TG muy alto, hasta el 95%, con lo que son muy poco densas. Pasan a la sangre transportando TG por el sistema linftico. Una vez en la sangre son usados por 2 tipos de clulas, las hepticas y los adipocitos. En la clula slo entran los cidos grasos, por lo que una la lipoprotenlipasa los separa. Los cidos grasos pueden ir libres por la sangre unidos a la protena albmina de la sangre (seroalbmina). Tejido adiposo: En el tejido adiposo los cidos grasos se pueden almacenar en forma de TG. Estos se hidrolizan y sintetizan continuamente, por lo que cuando falta glucosa los cidos grasos salen a la sangre y se usan como sustrato energtico. La lipasa est controlada hormonalmente, existe en dos formas segn est fosforilada (activa) o no por la protenquinasa A. Hormonas como el glucagn producen un aumento del nivel de AMP que activa PKA que a su vez activa a la lipasa. Si el nivel de glucosa sube se secreta insulina que bloquea la lipasa. Clulas hepticas: Los cidos grasos se almacenan en forma de TG que se sintetizan e hidrolizan continuamente. El hgado es un sitio muy importante se sntesis de cidos grasos a partir de otras molculas. A partir de sustratos sobrantes sintetiza cidos grasos que por esterificacin dan TG, que son enviados al tejido adiposo unidas a protenas en lipoprotenas distintas a los quilomicrones. Estas son sintetizadas por el hgado,tienen distinta proporcin de componentes. Tienen muy poca densidad, las VLDL (Very Low Density Level). Su funcin es transportar los cidos grasos sintetizados por exceso de hidratos de carbono. Para recogerlos el adipocito se necesita un enzima igual al anterior que los hidrolice. La lipoprotena suelta parte de los TG y pasa a LDL, ms densa y especialmente rica en colesterol, que manda a tejidos perifricos. La HDL es ms densa, el colesterol en esta forma no es malo porque se transporta de vuelta al hgado para ser metabolizado. El tejido adiposo no puede degradar el glicerol porque no puede fosforilarlo. El hgado s puede (glicolisis, gluconeognesis).

Fosfoglicridos y esfingolpidos Los fosfoglicridos y los esfingolpidos son molculas que aparecen formando parte de la estructura de las membranas celulares. Estas molculas presentan una parte polar (cabeza polar) y una parte apolar (colas apolares). Por este motivo, se dice que son anfipticos. Fosfoglicridos: Los fosfoglicridos pertenecen al grupo de los fosfolpidos. La estructura de la molcula es un cido fosfatdico. El cido fosfatdico est compuesto por dos cidos grasos, uno saturado y otro, generalmente insaturado, una glicerina y un cido ortofosfrico. La unin entre estas molculas se realiza mediante enlaces de tipo ster. 18

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El cido fosfatdico se puede unir a un aminoalcohol, como la Serina, la Etanolamina o la Colina, y formar un Fosfoaminolpidido. Tambin puede unirse a un alcohol, como el Inositol 2.3. Esfingolpidos: Los esfingolpidos estn formados por una molcula denominada ceramida. La ceramida est constituida por un cido graso y una esfingosina. Dependiendo de la molcula que enlace con la ceramida, podemos encontrar fosfoesfingolpidos o glucoesfingolpidos. Las esfingomielinas estn compuestas por la ceramida, un cido ortofosfrico y una molcula con grupo alcohol, como un aminoalcohol. Los glucoesfingolpidos estn compuestos por la ceramida unida a un glcido. Son molculas abundantes en las membranas de las neuronas. 2.4. Esteroides, isoprenoides y prostaglandinas Los esteroides, los isoprenoides y las prostaglandinas son lpidos que no realizan la reaccin de saponificacin. 2.4.1. Esteroides: Los esteroides son derivados del cilopentano perhidrofenantreno. Esta molcula origina molculas tales como colesterol, estradiol, progesterona, testosterona, aldosterona o corticosterona. Todas ellas son esenciales para el funcionamiento de nuestro metabolismo 2.4.2. Isoprenoides: Los isoprenoides o terpenos se forman por la unin de molculas de isopreno. Las estructuras que se originan pueden ser lineales o cclicas. En este tipo de molculas aparecen enlaces conjugados. Estos enlaces pueden ser excitados por la luz o la temperatura. Al cambiar su posicin emiten una seal. Por ello, estas molculas estn relacionadas con la recepcin de estmulos lumnicos o qumicos.

CLASIFICACIN DE LOS TERPENOS Nombre n de isoprenos que componen Funcin la molcula Aromas y esencias. Ejemplo Geraniol, mentol.

Monoterpenos 2 Sesquiterpenos 3 Ditepenos Triterpenos 4 6

Intermediario en la sntesis del Farnesol. colesterol. Forman pigmentos y vitaminas. Fitol, vitamina A, E, K.

Intermediario en la sntesis del Escualeno. colesterol. Pigmentos vegetales. Aislantes. Carotenos, xantofilas. Ltex, caucho.

Tetraterpenos 8 Politerpenos n

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2.4.3. Prostaglandinas : Las prostaglandinas son lpidos formados a partir de un cido graso, llamado cido araquidnico. Su nombre proviene de la prstata, pues fue en el primer lugar de donde se aisl una prostaglandina. Sin embargo, se han encontrado prostaglandinas en gran cantidad de tejidos. Cumplen diversas funciones relacionadas generalmente con procesos inflamatorios, con dolor, fiebre, edemas y enrojecimiento. Su produccin se inhibe con la presencia de cido acetil saliclico. Algunas funcionan como vasodilatadores, regulando la presin sangunea. Promueven la contraccin de la musculatura lisa. Intervienen en la coagulacin sangunea.

METABOLISMO DE LIPIDOS Los lpidos son molculas con grandes diferencias estructurales de unas a otras. Tienen caractersticas comunes de insolubilidad en agua. Tienen 2 funciones preferentes: - Componentes esenciales de membrana (fosfolpidos). - Depsito de energa ms importante de la clula (triglicridos). Los triacilgliceroles son los principales sustratos energticos, almacenados en el citosol de las clulas del tejido adiposo. El hgado es muy importante en el metabolismo de lpidos y sntesis de cidos grasos. Cuando sobra energa sintetiza lpidos.

1. METABOLISMO DE ACIDOS GRASOS Los cidos grasos suelen tener un nmero par de tomos de C. Se diferencian en la longitud de la cadena y el nmero de insaturaciones.

SINTESIS: En la sntesis de una grasa se une 1 glicerol con 3 cidos grasos para dar triacilglicerol: CH2O HCOH CH2O glicerol esterificacin CH2O - CH2 - CH2 - COOHCO - CH2 - CH2 - COOCH2O - CH2 - CH2 - COOtriacilglicerol

RUPTURA: La ruptura es por hidrlisis mediante una lipasa. Los cidos grasos se degradarn dando C2 que es el acetil-CoA que entrar en el C.A.C. dando CO2. El glicerol mediante glicolisis da piruvato y ste acetil-CoA que sigue el mismo proceso. El glicerol viene de la glucosa por medio de la ruta glicoltica. Para sintetizar grasas hacen falta hidratos de carbono porque la glucosa es necesaria para formar C3. Tambin a partir de acetil-CoA. Las grasas son un buen almacn de energa, mejor que el glucgeno porque los componentes de los triacilgliceroles estn muy reducidos, se obtiene ms energa al oxidarlos. Las grasas son insolubles en agua y el glucgeno es soluble, por lo que puede estar en forma hidratada. Esto es importante a la hora de almacenar porque con el mismo pero 20

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del glucgeno se obtiene menos energa porque est menos reducido y parte es agua. Obtenemos 6 veces ms energa de la grasa. DEGRADACIN : Presenta las Siguientes Etapas: Primera etapa: activacin. La degradacin de cidos grasos ocurre en la mitocondria y la lipasa est en el citosol. Para poder entrar en la mitocondria ha de activarse. En el citosol se une al CoA. Este es un punto de control importante. Se activa por medio del ATP. La reaccin transcurre en 2 etapas:

Se activa unindose al nucletido. La Se cede el grupo al CoA. El PPi se hidroliza con parte del nucletido forma un derivado pirofosfatasa, lo que desplaza la reaccin a la activado. derecha. Esta es una reaccin previa al metabolismo de cidos grasos. Entra 1 ATP y sale 1 AMP. Siempre que esto ocurre es como si se gastaran 2 ATP. Segunda etapa: transporte dentro de la mitocondria: El CoA no tiene transportador. El grupo acilo entra transfirindose a una molcula de la membrana de la mitocondria que la transporta (translocasa). El nico modo de que entre es por medio de la carnitina que recoge el cido graso y lo mete dentro en forma de acilcarnitina (ambos).

La transferasa da el acilo y deja el CoA en el citosol. Est localizada en la membrana interna de la mitocondria mirando al citosol. Dentro de la mitocondria hay otro enzima igual que cumple la funcin inversa (carnitina aciltransferasa II). La CAT1 es el punto de control ms importante. Tercera etapa: -oxidacin. Se oxida el C del cido graso separando C2 en forma de acetil-CoA. Los 4 enzimas de la mitocondria no estn dispuestos formando un complejo. Consta de 4 etapas:

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Balance: si el cido graso tiene nmero par de tomos de C slo quedar acetil-CoA. Si hubiera sido el palmitato (16 C): Palmtico: 8 acetil-CoA, 7 NADH y 7 ATP Degradacin del acetil-CoA en el ciclo del cido ctrico. Se darn 8 vueltas del Ciclo: 16 CO2, 24 NADH, 8 FADH2 y 8 GTP. O lo que es lo mismo, a 12 ATP por vuelta, 96 ATP. Los NADH y FADH2 de la -oxidacin dan 35 ATP ms. Total ATP: 131 ATP de la degradacin 1 molcula de palmtico. Balance de la oxidacin del palmitato: 16 CO2 y 131 ATP de los que se deben restar 2 porque se forma palmitoilCoA con gasto de ATP. Balance neto: 129 ATP. 16 C + 129 ADP + 129 Pi 16 CO2 + 129 ATP La degradacin slo ocurre en presencia de O2 porque es necesario para regenerar los coenzimas. Todo el metabolismo dentro de la mitocondria es aerobio. Como cada vez que pasan 2 e- por la cadena de transporte electrnico se forma H2O, de lo que resultan 146 molculas de H2O. Las grasa son fuente de energa y de agua. Un cido graso est ms reducido que un hidrato de carbono, por lo que se obtiene ms energa: cido graso: 129 ATP/16 C = 8.1 ATP/C glucosa: 36 ATP/6 C = 6 ATP/C DESTINOS DE LOS CIDOS GRASOS Normalmente no se hallan libres, se incorporan en forma de fosfolpidos de membrana o triacilglicridos (TG) como depsito de energa. Han de esterificar al 22

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glicerol en los dos casos que ha de estar fosforilado (glicerol 3P). El glicerol 3P viene de: - PDHA que a su vez viene de la glucosa, se consume 1 NADH actuando la glicerol 3 P deshidrogenasa. - Directamente del glicerol por medio de la glicerol 3P quinasa. Este glicerol viene de las grasa hidrolizadas. Se esterifica con cidos grasos activados (acil-CoA): 2 acil-CoA pueden esterificar los OH del glicerol 3P: CH2 - O - CO - R1 CH2 - O - CO - R2 cido fosfatdico, precursor de fosfolpidos y triacilgliceroles. CH2 - O - P Para formar el triacilglicerol se sustituye P por medio de una fosfatasa. Luego se aade acil-CoA para dar TG (CH2 - O - CO - R3). 2. REGULACIN La conversin de TG a cidos grasos + glicerol ocurre continuamente en el tejido adiposo. Cuando sobra energa se sintetizan TG con cidos grasos y glicerol. La glucosa aporta el Gd3P necesario, por lo que slo se esterificar cuando sobren hidratos de carbono. Cuando hay poca glucosa se degradan grasas. La lipasa est regulada por hormonas, cuando est fosforilada es activa. La activacin la desencadena el glucagn que a travs de la cascada enzimtica pone en marcha la PKA que fosforila la lipasa. Cuando la concentracin de glucosa es alta se secreta insulina que favorece la esterificacin. Se sintetizan cidos grasos a partir de acetil-CoA y su degradacin da la misma molcula. La sntesis a partir de acetil-CoA se da cuando la carga energtica es alta y hay hidratos de carbono (para sacar acetil-CoA con OAA). No deben haber cidos grasos. Puntos de regulacin. - Sntesis: punto de control es el enzima que modifica el acetil-CoA, la acetil-CoA carboxilasa. - Degradacin: enzima que activa acetil-CoA para entrar cidos grasos e mitocondria transfirindolos a la carnitina, la carnitina aciltransferasa I. Regulacin de la sntesis: acetil-CoA carboxilasa. - Regulada a nivel hormonal por glucagn (inhibe) e insulina (activa). - Regulado tambin alostricamente: Modulador +: citrato, que favorece la conformacin ms activa adems de sacar el acetilCoA. Modulador -: palmitoil-CoA, que es el producto de la reaccin. Tambin la carga energtica, concretamente el AMP. - Regulado covalentemente Fosforilada es inactiva. Si la quinasa est favorecida bloquea la sntesis de cidos grasos y si lo es la fosfatasa activa el enzima. La insulina favorece la fosfatasa y el glucagn la quinasa. -Regulacin a largo plazo: el enzima puede variar su concentracin, se puede inducir su sntesis. El ayuno prolongado y luego una dieta rica en hidratos de carbono y pobre en grasa aumenta mucho la concentracin del enzima. Regulacin de la degradacin: carnitina aciltransferasa 1. Es modulador - el malonil-CoA que es el producto de la acetil-CoA carboxilasa. Si sube su concentracin es porque sobra energa y hay hidratos de carbono y al estar inhibido el enzima no pueden entrar los acetil-CoA en la mitocondria 23

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3. CUERPOS CETNICOS. Acetoacetato: (CH3) - (CO) - (CH2) - (COO-) Hidroxibutirato: (CH3) - (CHOH) - (CH2) - (COO-) Acetona: (CH3) - (CO) - (CH3) Al degradar cidos grasos se obtiene acetil-CoA que puede ir al C.A.C. si hace falta energa, pero hace falta OAA. Si faltan hidratos de carbono el acetil-CoA no puede entrar en el C.A.C. porque el OAA forma glucosa. Si no hay hidratos de carbono los niveles de OAA estn comprometidos y no podemos degradar acetil-CoA. Cuando se ayuna y en la diabetes (enfermedad en la que no se usan bien los hidratos de carbono y es como si no hubiera glucosa) se degradan muchos cidos grasos. Aumenta mucho la concentracin de acetil-CoA que no puede ir al C.A.C. por lo que forma complejos cetnicos, de los cuales se puede obtener energa. Formacin: Se forman sobre todo en el hgado dentro de las mitocondrias por condensacin:

El otro cuerpo cetnico se convierte en hidroxibutirato por medio de una deshidrogenasa y la acetona se obtiene del acetoacetato por medio de una descarboxilacin. El acetoacetato se usa convirtindolo en acetoacil-CoA recibiendo una molcula de HSCoA del succinil-CoA

Todos los tejidos menos el heptico puede usar los cuerpos cetnicos como sustrato energtico porque tienen la transferasa. Si la concentracin de cuerpos cetnicos es muy alta disminuye el pH de la sangre, el enfermo hace olor a acetona y puede llegar al coma 24

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diabtico. El cerebro puede acostumbrarse a usar cuerpos cetnicos en condiciones de ayuno prolongado, lo que evita tener que degradar protenas.

PRTEINAS

Los Prtidos son biomolculas orgnicas. Estn formados por Carbono, Hidrgeno, Oxgeno y Nitrgeno. En ocasiones aparecen Fsforo y Azufre. 1. CLASIFICACION Este grupo est compuesto por tres tipos de molculas, que se clasifican atendiendo a su tamao. Son los aminocidos, los pptidos y las protenas. AMINOCIDOS Definicin: Son molculas pequeas, monmeros de los pptidos y las protenas. Son cristalinos, casi todos dulces y presentan isomera, ya que poseen un carbono unido a cuatro radicales distintos (excepto en el caso de la Glicocola). Por ello, es un carbono asimtrico. Uno de esos radicales siempre es un grupo cido (carboxilo) y el otro es bsico (amina). El tercer grupo es un Hidrgeno y el cuarto es un radical, caracterstico de cada aminocido. Los radicales confieren al aminocido unas caractersticas propias. Por ello, estos radicales se utilizan como criterio de clasificacin de los aminocidos. Clasificacin: Formando parte de las protenas existen 20 aminocidos, que son Alfaaminocidos. Existen otros muchos tipos de aminocidos, pero no se asocian formando macromolculas. Propiedades Isomera: Al poseer un carbono asimtrico, los aminocidos poseen isomeras. Existe una forma D y otra forma L. Los ismeros D poseen en proyeccin lineal, el grupo amina (-NH2) hacia la derecha del carbono asimtrico, mientras que la isomera L presenta el grupo amina (-NH2) a la izquierda del carbono asimtrico. Existen ismeros pticos. Las molculas que desvan la luz polarizada a la derecha se denominan dextrgiras y se representan con el signo (+). Las molculas que desvan la luz polarizada a la izquierda se denominan levgiras y se representan con el signo (-). Propiedades qumicas: Los aminocidos presentan cargas. Los aminocidos pueden captar o ceder protones al medio, dependiendo del pH de la disolucin en la que se encuentren. Si la disolucin es cida, los aminocidos captan protones y se comportan como una base. Si la disolucin es bsica, ceden protones y se comportan como un cido. Por tener este comportamiento, se dice que los aminocidos son anfteros. El punto isoelctrico es el valor de pH al que el aminocido presenta una carga neta igual al cero. LOS PPTIDOS Se forman por la unin de aminocidos, mediante un enlace llamado enlace peptdico. Este enlace se establece entre el grupo carboxilo (-COOH) del primer aminocido y el grupo amina (-NH2) del segundo aminocido. La caracterstica principal de este enlace radica en que no permite el giro de los elementos unidos por l, por lo que es un enlace 25

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rgido. La rigidez de este enlace se debe a que los electrones del doble enlace, que posee el carbono del grupo carboxilo con el oxgeno, se moviliza hacia la unin entre el carbono carboxilo y el nitrgeno del grupo amina. Los pptidos son molculas formadas por aminocidos unidos por enlace peptdico. El nmero de aminocidos puede oscilar entre dos y cien; ms de cien aminocidos se considera una protena. Incluso, si el nmero de aminocidos es menor que cien, pero el peso molecular es mayor que 5.000 Daltons, la molcula sera una protena. Ejemplos de pptidos metablicamente importantes son la insulina, el glucagn, la oxitocina o la vasopresina.

PROTENAS Definicin: Las protenas son molculas formadas por aminocidos unidos por enlace peptdico. El nmero de aminocidos suele ser mayor que cien y el peso molecular excede de los 5.000 Daltons. La alternancia entre los enlaces rgidos (enlaces peptdicos) y los enlaces mviles (enlaces intraaminocido) hace que estas molculas adquieran una estructura bastante compleja. Estas molculas cumplen muchas y variadas funciones en los seres vivos. Estructura: Las protenas adquieren una estructura que, a veces, resulta muy compleja. Esto es debido a las cargas que tienen los radicales de los aminocidos y a la rigidez del enlace peptdico. Las cargas que posean esos radicales generan unas propiedades en las protenas. La estructura de las protenas nos sirve para confeccionar una clasificacin de estas complejas molculas. Tambin, la estructura es la responsable de generar determinadas funciones que son esenciales para los seres vivos.

Propiedades 26

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Las propiedades que manifiestan las protenas dependen de los grupos radicales de los aminocidos que las componen. Solubilidad: los radicales de los aminocidos permiten a las protenas interaccionar con el agua. Si abundan radicales hidrfobos, la protena ser poco o nada soluble en agua. Si predominan los radicales hidrfilos, la protena ser soluble en agua. Especificidad: aparece como consecuencia de la estructura tridimensional de la protena. La especificidad puede ser de funcin, si la funcin que desempea depende de esta estructura, o de especie, que hace referencia a la sntesis de protenas exclusivas de cada especie. Desnaturalizacin: la conformacin de una protena depende del pH y de la temperatura de la disolucin en la que se encuentre. Cambiando estas condiciones, tambin puede cambiar la estructura de la protena. Esta prdida de la conformacin estructural natural se denomina desnaturalizacin. El cambio de pH produce cambios en las interacciones electrostticas entre las cargas de los radicales de los aminocidos. La modificacin de la temperatura puede romper puentes de Hidrgeno o facilitar su formacin. Si el cambio de estructura es reversible, el proceso se llama renaturalizacin. Funciones Funcin estructural: forman estructuras capaces de soportar gran tensin continuada, como un tendn o el armazn proteico de un hueso o un cartlago. Tambin pueden soportar tensin de forma intermitente, como la elastina de la piel o de un pulmn. Adems, forman estructuras celulares, como la membrana plasmtica o los ribosomas. Movimiento y contraccin: la actina y la miosina forman estructuras que producen movimiento. Mueven los msculos estriados y lisos. La actina genera movimiento de contraccin en muchos tipos de clulas animales. Transporte: algunas protenas tienen la capacidad de transportar sustancias, como oxgeno o lpidos, o electrones. Reserva energtica: protenas grandes, generalmente con grupos fosfato, sirven para acumular y producir energa, si se necesita. Funcin homeosttica: consiste en regular las constantes del medio interno, tales como pH o cantidad de agua. Funcin defensiva: las inmunoglobulinas son protenas producidas por linfocitos B, e implicadas en la defensa del organismo. Funcin hormonal: algunas protenas funcionan como mensajeros de seales hormonales, generando una respuesta en los rganos blanco. Funcin enzimtica: las enzimas funcionan como biocatalizadores, ya que controlan las reacciones metablicas, disminuyendo la energa de activacin de estas reacciones. SNTESIS PROTEICA La sntesis de protenas o traduccin del ARN es el proceso anablico mediante el cual se forman las protenas a partir de los aminocidos. Es el paso siguiente a la transcripcin del ADN a ARN. Como existen 20 aminocidos diferentes y slo hay cuatro nucletidos en el ARN (Adenina, Uracilo, Citosina y Guanina), es evidente que la relacin no puede ser un aminocido por cada nucletido, ni tampoco por cada dos nucletidos, ya que los cuatro tomados de dos en dos, slo dan diecisis posibilidades. La colinearidad debe 27

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establecerse como mnimo entre cada aminocido y tripletes de nucletidos. Como hay sesenta y cuatro tripletes diferentes (combinacin de cuatro elementos o nucletidos tomados de tres en tres con repeticin), es obvio que algunos aminocidos deben tener correspondencia con varios tripletes diferentes. Los tripletes que codifican aminocidos se denominan codones. 1. BIOSNTESIS: La sntesis de protenas o traduccin tiene lugar en los ribosomas del citoplasma celular. Los aminocidos son transportados por el ARN de transferencia (ARNt), especfico para cada uno de ellos, y son llevados hasta el ARN mensajero (ARNm), donde se aparean el codn de ste y el anticodn del ARN de transferencia, por complementariedad de bases, y de sta forma se sitan en la posicin que les corresponde. Una vez finalizada la sntesis de una protena, el ARN mensajero queda libre y puede ser ledo de nuevo. De hecho, es muy frecuente que antes de que finalice una protena ya est comenzando otra, con lo cual, una misma molcula de ARN mensajero, est siendo utilizada por varios ribosomas simultneamente. Se pueden distinguir las siguientes etapas: 2.1. Activacin de los aminocidos. Los aminocidos en presencia de la enzima aminoacil-ARNt-sintetasa y de ATP son capaces de unirse a un ARN de transferencia especfico y dan lugar a un aminoacilARNt, liberndose AMP, fosfato y quedando libre la enzima, que vuelve a actuar. 2.2. Traduccin 2.2.1. Iniciacin de la sntesis. Es la primera etapa de la traduccin o sntesis de protenas. El ARNm se une a la subunidad menor de los ribosomas. A stos se asocia el aminoacil-ARNt, gracias a que el ARNt tiene en una de sus asas un triplete de nucletidos denominado anticodn, que se asocia al primer triplete codn del ARNm segn la complementariedad de las bases. A este grupo de molculas se une la subunidad ribosmica mayor, formndose el complejo ribosomal o complejo activo. Todos estos procesos estn catalizados por los llamados factores de iniciacin (FI). El primer triplete o codn que se traduce es generalmente el AUG, que corresponde con el aminocido metionina en eucariotas. En procariotas es la fenilmetionina. 2.2.2. Elongacin de la cadena polipeptdica. El complejo ribosomal posee dos sitios de unin o centros. El centro peptidil o centro P, donde se sita el primero aminoacil-ARNt y el centro aceptor de nuevos aminoacil-ARNt o centro A. El radical carboxilo (-COOH) del aminocido iniciado se une con el radical amino (NH2) del aminocido siguiente mediante enlace peptdico. Esta unin es catalizada por la enzima peptidil-transferasa. El centro P queda pues ocupado por un ARNt sin aminocido. El ARNt sin aminocido sale del ribosoma. Se produce la translocacin ribosomal. El dipeptil-ARNt queda ahora en el centro P. Todo ello es catalizado por los factores de elongacin (FE) y precisa GTP. Segn la terminacin del tercer codn, aparece el tercer aminoacil-ARNt y ocupa el centro A. Luego se forma el tripptido en A y posteriormente el ribosoma 28

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realiza su segunda translocacin. Estos pasos se pueden repetir mltiples veces, hasta cientos de veces, segn el nmero de aminocidos que contenga el polipptido. 2.2.3. Terminacin de la sntesis de la cadena polipeptdica El final de la sntesis se presenta por los llamados tripletes sin sentido, tambin denominados codones stop. Son tres: UAA, UAG y UGA. No existe ningn ARNt cuyo anticodn sea complementario de ellos y, por lo tanto, la biosntesis del polipptido se interrumpe. Indican que la cadena polipeptdica ya ha terminado. Este proceso viene regulado por los factores R. Un ARNm, si es lo suficientemente largo, puede ser ledo o traducido, por varios ribosomas a la vez, uno detrs de otro. Al microscopio electrnico, se observa como un rosario de ribosomas, que se denomina polirribosoma o polisoma. 2.3. Asociacin de varias cadenas polipeptdicas y a veces de grupos prostsicos para constituir las protenas. METABOLISMO DEGRADATIVO PROTENAS Las protenas EXOGENAS se degradan en el tubo digestivo, por la accin de potentes enzimas hidroliticos, para que se transformen en oligopeptidos y aminocidos libres. Estos atraviesan el epitelio intestinal (utilizando distintos sistemas de transporte activo) y a travs de la sangre se distribuyen a las clulas del organismo. Por otro lado las protenas ENGOGENAS sufren constante procesos de de destruccin para liberar aminocidos constituyentes como pueden apreciar en el esquema de abajo.Este proceso de degradacin se inicia al etiquetar (marcar) a las protenas que se van a destruir con la UBIQUITINA, una pequea protena universal en los eucariotas. La unin entre la ubiquitina y la protena se realiza entre la GLICINA CARBOXILO-TERMINAL de aquella y el GRUPO e-AMINO de las LISINAS de esta. El tipo de enlace se denomina ISOPEPTIDICO. El periodo de semidesintegracion de las proteinas endogenas esta vinculado a la naturaleza del aminoacido N-terminal de cada una de ellas. Asi por ejemplo: la METIONINA y SERINA son aminoacidos estabilizadors, en cambio la ARGININA y el ASPARTATO desestabilizadores de su porpie proteina.

CICLO DE LA UREA El exceso de nitrgeno el no utilizado proveniente de la degradacin de aminocidos, lo excreta el organismo en la forma de urea y cido rico. el cido rico no es un producto final directo el metabolismo de aminocidos, sino que se origina a partir de la degradacin de PURINAS. La inclusin de del cido rico como una forma excretoria del metabolismo de los aminocidos, se basa en el hecho de que el NITRGENO de las purinas se origina a partir de los aminocidos. Aunque siendo la urea un producto final, varia de un organismo a otro, por ejemplo: la mayora de las bacterias, las plantas y los peces excretan AMONIACO, mientras que los pjaros y la mayora de los invertebrados excretan CIDO RICO. En la mayora de los 29

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mamferos, incluyendo al hombre el producto principal es la UREA. en los mamferos estas enzimas estn localizadas en el hgado.A partir del hgado la urea pasa a la circulacin sangunea, la cual es eventualmente dializada en los riones, resultando en la perdida de urea de bajo peso molecular que pasa a la orina. La urea se excreta a la orina donde representa el 80 a 90% del nitrgeno urinario total. Para el hombre el promedio diario de excrecin en urea es de 30 gramos.

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