Origen del virus

Los orgenes probablemente varios de los virus se han perdido en un mar de conjeturas y especulaciones, que se debe principalmente a su naturaleza: nadie ha detectado un virus fsiles como una partcula, sino que son demasiado pequeos y, probablemente, demasiado frgil para haber resistido los tipos de procesos que condujeron a la fosilizacin, o incluso a la conservacin de tramos cortos de secuencias de cidos nucleicos en tejidos de hojas o insectos en mbar . Como resultado , estamos limitados a estudiar los virus que se encuentran aisladas en el presente, o de un material que es a lo sumo unas pocas dcadas. La nueva ciencia (o arte) de los virus de la sistemtica molecular es, sin embargo, derramando una gran cantidad de luz sobre las relaciones distantes, y en algunos casos en los presuntos orgenes de muchos grupos importantes de virus. Este es el resultado de la secuenciacin de todo o parte de los genomas de los representantes de muchas de las variedades conocidas de virus, incluyendo el ms grande (la viruela y virus del herpes) y el ms pequeo (Gemini-y otros virus ADN de cadena simple). Si el genoma viral se comparan entre s y con las secuencias celulares, los patrones de la evolucin supone / divergencia de los genomas puede ser reconstruido. Geminivirus , por ejemplo, son un grupo diverso de virus - con diferentes gneros con un nmero diferente de genes y los componentes del genoma - que, presumiblemente, tienen un origen comn - y uno que se puede rastrear hasta ms all de 200 millones de aos BP, si se tiene en cuenta geogrfica la diversidad y la divergencia gentica de los vectores y de los ejrcitos de la planta (ver Rybicki, 1994 ). La divergencia de estos virus se ilustra aqu . Potyvirus son tambin una familia supuestamente antigua de virus, con gneros que tienen diferente nmero de componentes del genoma y cuyo mapa gentico no es compartida por todos los miembros: un representante de rboles capa de protena se muestra aqu Bymoviruses tienen dos componentes del genoma y se transmiten a los hongos;. todos los dems tienen un componente nico genoma Potyvirus son

transmitidos por fidos;. rymo y triticiviruses son los caros de transmisin, y ipomoviruses se transmite la mosca blanca. Se supone que descienden de un virus de hongos, probablemente ms de 200 millones de aos atrs (AJ Gibbs, com. Pers.). Si uno tuviera que ir muy atrs en el tiempo evolutivo, un caso podra ser de la descendencia de un ancestro comn de al menos las funciones de la replicasa asociados de todos los virus con sentido positivo y negativo de sentido una sola hebra de ARN genomas, del mismo modo, las grandes virus de ADN , como la viruela y el virus del herpes y phycodnaviruses poda presumir de tener "degenerado" (si uno cree que los virus que se degeneran los organismos, que por mi parte, no ...) de los organismos celulares, ya que sus enzimas compartir ms similitud de secuencias con secuencias de las clulas que con otros virus o cualquier otra cosa. Retrovirus, pararetroviruses, retrotransposones y retroposones todos probablemente comparten un origen comn de la funcin de transcripcin inversa, que a su vez puede ser una reliquia viviente de la enzima que permiti el cambio de una gentica presumiblemente basados en el ARN al ADN basada en la herencia.

El principal mensaje que proceden de los estudios "profundo" es que la evolucin filogentica del virus a principios fue overlaytree.gif (5982 bytes) casi con toda seguridad modular, es decir, que ciertos "mdulos bsicos" que ha demostrado tener xito - como el gen pol de retrovirus, y el mdulo de picornavirus, como la proteasa-VPG-polimerasa - aparecen

en una serie de contextos diferentes. As, ciertos virus animales - como los picornavirus y alfavirus - tienen parientes entre los virus de plantas que no necesariamente comparten la misma morfologa, el nmero de componentes del genoma, o incluso la organizacin del genoma o el nmero de genes s. Por ejemplo, los pequeos picornavirus esfrica (ssRNA, un componente, infectar a los animales) estn relacionados con comovirus (esfrico pequeo, de 2 componentes, de las plantas) y Potyviridae (1 filamentosas, o dos componentes del genoma, la planta), como parte de un "semejantes a los picornavirus supergrupo ". Del mismo modo, Sindbis (ssRNA, envuelto ARN esfrico, solo los animales) virus est relacionado con Bromoviridae (desnudo esfrica, 3 componentes, de las plantas) y tobamovirus (varilla desnuda, un componente de las plantas), en un Sindbis "(o alfa) del virus -como el supergrupo ". Esto se explica bien aqu . Un diagrama que ilustra una forma de ver este fenmeno se muestra aqu: muestra las relaciones filogenticas superpuestos de los diferentes componentes de algunos virus conocidos, ilustrando cmo los diferentes componentes de un grupo de virus pueden tener diferentes "los rboles de genes". En este caso, se muestra cmo los virus de persona en dos "supergrupos" de virus - se define en trminos de las afinidades de la polimerasa - tienen los rboles de genes diferentes en protenas de la cpside y las relaciones de la polimerasa se tienen en cuenta. As, por ss (+) los virus de ARN, al menos, que se remonta ms all de los resultados de cierto nivel en una grave confusin de las relaciones percibidas, as definidos por las familias de los virus parecen compartir componentes esenciales bsicos con otros bien definidos familias / rdenes (ver tambin aqu ), mientras que no tener nada en comn.

Es muy rpidamente en evidencia de los estudios de la secuencia que no puede haber sido no solo el origen de los virus como organismos. Por ejemplo, no hay ninguna manera obvia de un virus se puede relacionar el tamao y la complejidad de los Poxviridae [ADN de doble cadena lineal ,130-375 kb, 150-300 genes] con los virus como el tobamovirus [ss ARN lineal, 6-7 kb, 4 genes], o cualquiera de estos con la Geminiviridae [ss ADN

circular, 2,7 a 5,4 kb, 3-7 genes]. Por lo tanto, no puede haber una simple "rbol genealgico" de los virus, sino que su descendencia evolutiva que se asemejan a una serie de dispersos "arbustos". Los virus como una clase de organismo debe ser por lo tanto, se considera que en el origen polifiltico, es decir, tener un nmero de orgenes independientes, casi con toda seguridad en diferentes momentos, por lo general de los organismos celulares. Lo que tienen en comn es un papel como el ltimo "despojada" parsitos: organismos que slo puede someterse a un ciclo de vida dentro de las clulas de un organismo husped, utilizando por lo menos, las enzimas metablicas y vas de los ribosomas de esa mquina de producir los componentes del vibrin, que se ensamblan en partculas infecciosas.

La evolucin del virus

Un supuesto importante tiene que ser hecho, si uno est siempre en algn sentido de los tipos de relaciones que emergen de los estudios filogenticos moleculares. Esto es: Que los virus co-evolucionan con sus anfitriones, COMO CUALQUIER BUEN PARASITO. Afortunadamente, parece que hay bastante justificacin para ello, sobre todo a partir de estudios de virus como el virus del papiloma, endgenos como retrovirus-secuencias de los genomas de animales, y virus del herpes. Por ejemplo, la divergencia de los primates y de aves relacionadas con los pollos han sido localizados mediante la comparacin de los tipos y secuencias de retrovirus derivados de las secuencias de sus genomas. Tambin se ha demostrado repetidamente que los parientes ms cercanos de los tipos de virus del papiloma humano infecta ciertos tipos de tejidos (por ejemplo: tipos de verrugas cutneas, mucosas genitales tipos) son los virus que infectan el mismo tipo de tejido en otros primates, lo que indica que estas preferencias tejido se establecieron mucho antes de la divergencia de los simios humanoides de la lnea de los primates. Es muy til en este caso tener en cuenta la cronologa de la evolucin de la vida desde sus inicios en el agua, as como la lnea de tiempo de la colonizacin de tierra firme por los organismos, ya que nuestro conocimiento de los virus es muy limitada en gran parte a los infectar a los

organismos terrestres. Este proceso fue mucho ms de la siguiente manera (ver tambin aqu ):

Myr 4000: la vida se origin en las lagunas de mar / superficial 3500 millones de aos: las bacterias surgi de los mares para colonizar la tierra Myr 1000: plantas / hongos colonizaron lentamente hacia el interior de los mrgenes de la costa Myr 700: insectos / artrpodos sali a alimentarse de las plantas Myr 350: vertebrados adaptados a respirar el aire / de supervivencia en la tierra Los virus de casi todas las principales clases de organismos - animales, plantas, hongos y bacterias / arqueas - probablemente evolucion con sus anfitriones en el mar, dado que la mayor parte de la evolucin de la vida en este planeta que ha ocurrido all. Esto significa que los virus tambin, probablemente, emergieron de las aguas con sus anfitriones diferentes, durante las sucesivas oleadas de colonizacin del medio terrestre. Por lo tanto, Los virus de bacterias terrestres probablemente derivan de las de los colonizadores originales; mayora de los virus de las plantas terrestres son probablemente evolucion a partir de los de las algas verdes que surgieron + / - 1000 millones de aos atrs; mayora de los virus de los artrpodos terrestres derivan de los primeros fundadores; mayora de los virus de los vertebrados terrestres derivan de aquellos que llegaron a tierra con el primer aire que respiran. Esto explicara por qu los virus en los diferentes tipos generales de los ejrcitos en general, son tan diferentes: han tenido eones para adaptarse a cada "nicho de la vida" desde la divergencia del ancestro comn respectivas. Por lo tanto, las bacterias / arqueas y eucariotas comparten s ningn tipo de virus, ya que se han divergido tanto tiempo. Sin embargo, hay algunas similitudes notables entre los virus que infectan las plantas y los vertebrados infeccin (ver aqu), y ms an entre los artrpodos infectantes y los de los vertebrados. Un punto de referencia para este tipo de comparaciones es el rbol de la Vida Pgina Principal, en particular, su

16S ribosomal ARN del gen de rboles , o bien la simple rbol de aqu. Por lo tanto, como se puede observar que a medida que metazoos (todos los animales) son mucho ms similares entre s que con los Viridaeplantae (todas las plantas verdes), es razonable suponer que sus virus sera ms similares entre s, as. Tambin es interesante destacar que el rbol de la Vida no incluye rboles de virus / arbustos sin embargo, un factor que complica el panorama de los virus de co-evolucin con sus anfitriones durante miles de aos es el hecho de que los virus pueden parecer - y, obviamente, hacer - hacer grandes saltos en los ejrcitos de vez en cuando. Parece obvio, por ejemplo, que los artrpodos es casi seguro que la fuente original de una serie de familias de virus infectar insectos y mamferos - como la Flaviviridae - y probablemente tambin de los virus que infectan a los insectos y otros animales y plantas - como el Rhabdoviridae y Reoviridae - as (ver tambin aqu ). Por ejemplo, los picornavirus de los mamferos son muy similares estructuralmente y genticamente a un gran nmero de pequeos virus de ARN de los insectos y al menos dos virus de las plantas, y - como el virus de insectos son ms diversos que los virus de mamferos - probablemente tuvo su origen en algunos insectos que se adaptaron a alimentarse de mamferos (o plantas) en un punto distante en el tiempo evolutivo.

Pistas sobre cmo sucede esto se da por el hecho de que acuden virus casa - un pequeo virus desnudos RNA isomtrica de los insectos - puede replicar en las plantas cuando se introducen en las hojas, pero slo en el

sitio de la infeccin. Esto le da una ventaja de supervivencia sobre otros virus similares que no se puede replicar en las plantas, ya que estos ya no son un pasivo, sino un depsito de activos para la re-infeccin de insectos. Por ejemplo, el virus de saltahojas y Rhopalosiphum padi [pulgn] virus son bastante estables y se inyecta a las plantas a una concentracin suficiente de sus anfitriones, para que las plantas en "circulatoria no propagativo" vectores de los virus. La adicin de una funcin de movimiento - un "mdulo" peculiar s planta viruse - hara virus rebao casa en un virus de la planta de pleno derecho, as, la prdida de la capacidad de infectar a los insectos se limitara a las plantas. Es obvio que varios de estos cruzamientos se han producido: hay reovirus que slo infectan a las plantas, los flavivirus, que slo infecta a los humanos, los picornavirus que slo infectan a animales o plantas, y as sucesivamente. Un interesante "virus emergentes" es Tomato Spotted Wilt Virus - Tospovirus gnero, familia Bunyaviridae - que se postula que hace relativamente poco tiempo adquiri la capacidad de infectar a las plantas, as como su insecto vector trips, as como la obtencin de una funcin de movimiento, y ahora es un importante patgeno de una amplia gama de especies de plantas. Otra de las consecuencias de considerar evolucin del organismo celular como un marcador de la evolucin del virus es que la piscina de genes de virus terrestres deben constituir slo un subconjunto de los linajes del virus en la actualidad presente en los ocanos: si todas las lneas principales de los organismos terrestres son descendientes de los subconjuntos de paralelas -el desarrollo de los linajes en los ocanos, la reserva terrestre gen ancestral es menor que la del ocano. Asumiendo la diversidad virus paralelos diversidad de acogida, por lo tanto, la ancestral piscinas terrestres gen del virus son ms pequeos que sus equivalentes ocenicas. Hallazgos recientes de que una sorprendente diversidad (as como la cantidad) de los virus existe en el agua de mar puede apoyar esta conclusin: se ha propuesto que los virus tambin puede ser uno de los principales factores limitantes para el crecimiento microbiano y plancton en el mar, dado que contiene cada mililitro muchas partculas virales. El

hallazgo de que slo el 10% de las bacterias del agua del mar (representada por poblaciones clonales de PCR generados 16S ribosomal fragmentos de genes de ARN) en realidad se parece a ningn taxn conocido de bacterias, tambin refuerza la idea de que slo puede haber descubierto una pequea proporcin de los virus en este planeta. Si se considera que las plantas verdes representan slo una pequea proporcin de la reserva gentica de las algas eucariotas, y que sabemos de cientos de virus de las plantas terrestres, mientras que slo hay un grupo bien caracterizado de virus a partir de algas (Phycodnaviridae) , entonces la diversidad de posibilidades an por descubrir debe ser enorme.

Universidad Tcnica de Babahoyo Facultad Ciencias de la Salud Escuela de Tecnologa Mdica Carrera de Laboratorio Clnico Asignatura: Virologa

Profesor: Dr. Cesar Noboa Aquino Estudiante: Karen Constante Reyes Curso: 3
ero

Laboratorio Clnico

Tarea: N 1 Tema: Clasificacin de los Virus de ADN y ARN Referencia:

http://www.mcb.uct.ac.za/tutorial/virorig.html

Universidad Tcnica de Babahoyo Facultad Ciencias de la Salud Escuela de Tecnologa Mdica Carrera de Laboratorio Clnico Asignatura: Virologa

Profesor: Dr. Cesar Noboa Aquino Estudiante: Karen Constante Reyes Curso: 3ero Laboratorio Clnico Trabajo de Investigacin: N 1 Tema: Origen de los Virus Referencia:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK8174/

Clasificacin de los virus

Los virus se clasifican en funcin de la morfologa, composicin qumica, y el modo de reproduccin. Los virus que infectan a los seres humanos estn actualmente agrupados en 21 familias, lo que refleja slo una pequea parte del espectro de la multitud de virus diferentes, cuya sede rangos se extienden desde los vertebrados a los protozoos y los de las plantas y los hongos a las bacterias.

Morfologa
La simetra helicoidal En la replicacin de los virus con simetra helicoidal, las subunidades idnticas de protenas (protmeros) se auto-ensamblan en una matriz helicoidal que rodea el cido nucleico, que sigue una trayectoria en espiral similar. Nucleocpsidas tal forma barras rgidas, muy alargadas o filamentos flexibles, en cualquier caso, los detalles de la estructura de la cpside a menudo son perceptibles con el microscopio electrnico. Adems de la clasificacin como flexible o rgido y tan desnudos o envueltos, nucleocpside helicoidal se caracterizan por su longitud, anchura, paso de la hlice, y el nmero de protmeros por vuelta helicoidal. Muchas de las caractersticas estructurales importantes de este virus de plantas han sido detectados por estudios de difraccin de rayos-x. La estructura helicoidal del virus de la varilla de tabaco rgida mosaico. Alrededor del 5 por ciento de la longitud del vibrin es representado. Simetra icosadrica Un icosaedro es un poliedro con 20 caras triangulares equilteros y los vrtices 12 . Lneas a travs de vrtices opuestos definir ejes de simetra de rotacin cinco veces: todas las caractersticas estructurales de la repeticin del poliedro cinco veces en cada uno de 360 de rotacin alrededor de cualquiera de los ejes por cinco. Lneas a travs de los centros de caras opuestas forma triangular ejes de simetra de rotacin triple, doble ejes de simetra de rotacin son formados por las lneas a travs de los puntos medios de aristas opuestas. Un icosaheron (polidrica

o esfrica) con cinco veces, tres veces, y los ejes de simetra rotacional doble se define como tener 532 simetra (se lee como 5,3,2). Los virus se encontr por primera vez a tener 532 simetra por estudios de difraccin de rayos X y posteriormente con el microscopio electrnico con las tcnicas de tincin negativa. En la mayora de los virus icosadricos, el protmeros, es decir, las cadenas de polipptidos estructurales, se organizan en grupos llamados oligmeros capsmeros, que son fcilmente delineados por microscopa electrnica de tincin negativa y la forma cerrada cpside . La disposicin de los capsmeros en una cscara icosadrica permite la clasificacin de los virus como por el nmero de capsomere y el patrn. Esto requiere la identificacin de los ms cercanos par de capsmeros vrtice (llamados Penton: aquellos por los que los ejes de simetra cinco veces pasan) y la distribucin de los capsmeros entre ellos. En el modelo de adenovirus en uno de los capsmeros pentn se le asigna arbitrariamente los ndices h = 0, k = 0 (el origen), donde h y k son los ejes indicados de la inclinacin (60 ) neto de capsmeros. Los ejes de red estn formados por las lneas de los capsmeros ms llena de vecinos. En los adenovirus, la hora y ejes k tambin coinciden con los bordes de las caras triangulares. Cualquier momento capsomere vrtice vecinos tiene ndices h = 5, k = 0 (o h = 0, k = 5). El nmero capsomere (C) se puede determinar que 252 de los ndices H y K y la ecuacin: C = 10 (h 2 + hk + k 2) + 2. Esta simetra y el nmero de capsmeros es tpico de todos los miembros de la familia de los adenovirus.

Virus Estructura Central

Excepto en nucleocpside helicoidal, poco se sabe sobre el embalaje o la organizacin del genoma viral en el ncleo. Viriones pequeas son simples nucleocpside contiene de 1 a 2 especies de protenas. Los virus ms grandes tienen un ncleo en el genoma de cido nucleico complejado con protenas bsicas (s) y protegido por una o dos capas de la cpside (que consta de ms de una especie de protena) . Diagrama de dos dimensiones del VIH-1 la correlacin (inmuno-) los hallazgos microscpicos de electrones con la nomenclatura de los ltimos de los componentes

estructurales de un cdigo de dos letras y con los pesos moleculares de los virus estructurales (glico) protenas.

Composicin qumica y modo de replicacin Genomas del virus de ARN

Los virus de ARN, que comprende el 70% de todos los virus, varan notablemente en la estructura del genoma ( Fig.. 41-6 ). Debido a la tasa de error de las enzimas implicadas en la replicacin del ARN, estos virus generalmente muestran unas tasas de mutacin mayor que los virus de ADN. Las tasas de mutacin de 10 -4 conducir a la generacin continua de las variantes del virus que muestran gran capacidad de adaptacin a nuevos huspedes. El ARN viral puede ser de cadena sencilla (ss) o de doble cadena (ds), y el genoma puede ocupar un solo segmento de ARN o se distribuirn en dos o ms segmentos por separado (genomas segmentados). Adems, la cadena de ARN del genoma de una sola cadena puede ser una cadena con sentido (cadena positiva), que puede funcionar como ARN mensajero (ARNm), o una cadena antisentido (captulo menos), que es complementaria a la cadena con sentido y no puede funcionar como la traduccin de ARNm de la protena . ARN viral sentido por s solo puede replicarse si se inyecta en las clulas, ya que puede funcionar como ARNm y empezar la traduccin de los virus de las protenas codificadas. El ARN antisentido, por otra parte, no tiene una funcin de traduccin y no puede por s producir componentes virales. Virus dsRNA, por ejemplo, los miembros de la familia de los reovirus, contienen segmentos de 10, 11 o 12 por separado del genoma que codifican tres enzimas implicadas en la replicacin del ARN, tres protenas de la cpside mayor y una serie de pequeas protenas estructurales. Cada segmento se compone de un sentido complementario y cadena antisentido que es hidrgeno enlazado a una molcula lineal ds. La replicacin de estos virus es compleja, y slo el sentido de cadenas de ARN son liberados de la virin infectante para iniciar la replicacin. El genoma del retrovirus se compone de dos idnticas, adems de las molculas de ssRNA sentido, cada monmero 11.7 kb de tamao, que

estn ligados covalentemente sobre una regin terminal de corto plazo. Los retrovirus contienen dos protenas de la envoltura codificada por el gen env-, 4-6 protenas del core no glucosilada y tres protenas no estructurales, funcionales (la transcriptasa inversa, integrasa, la proteasa: RT, IN, PR) especificado por el gag-gen . La RT transcribe el ssRNA viral en doble cadena de ADN proviral circular. Este ADN, mediada por la integrasa viral, se convierte en enlaces covalentes en el ADN de la clula husped para hacer posible la transcripcin posterior de las hebras de sentido que dieron origen a una progenie de retrovirus. Despus del montaje y en ciernes, los retrovirus mostrar la maduracin estructural y funcional. En viriones inmaduros las protenas estructurales del ncleo se presentan como una cscara de la protena precursora de gran tamao. Despus de procesamiento proteoltico por la proteasa viral de las protenas del virin maduro se reorganizan y la forma isomtrica denso o en forma de cono central tpica del virin maduro, y la partcula se convierte en infecciosa.

Genomas de ADN de virus

La mayora de los virus de ADN contienen un genoma de ADN de doble cadena lineal. Los papovavirus, que comprende el polioma y del papiloma, sin embargo, tienen genomas de ADN circular, alrededor de 5,1 y 7,8 kb de tamao pares. DsDNA sirve como una plantilla, tanto para el mRNA y de auto-transcripcin. Tres o dos protenas estructurales constituyen la cpside papovavirus: adems, 5-6 protenas no estructurales son codificadas que son funcionales en la transcripcin del virus, la replicacin del ADN y la transformacin celular. ADN de cadena sencilla lineal, 4-6 kb de tamao, se encuentra con los miembros de la familia de parvovirus que comprende el parvo, la eritromicina y la dependoviruses. El virin contiene 2.4 especies de protenas estructurales que se derivan de forma diferente el producto del gen mismo (vase cap. 64 ). El virus adeno-asociados (AAV, un Dependovirus) es incapaz de producir progenie de viriones, excepto en la presencia de virus de ayuda (adenovirus o herpesvirus). Por lo tanto, dice que la replicacin defectuosa.

Circular de una sola cadena de ADN de slo 1,7 a 2,3 kb se encuentra en los miembros de la familia Circovirus que comprenden los ms pequeos de forma autnoma propagan virus. La cpside isomtrica mide 17 nm y se compone de dos especies de protena solamente.