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Bioqumica general
Bioqumica general
Alberto Gmez & Laura del Olmo
1 de Medicina
Bioqumica general
ndice de contenidos
Introduccin: El agua..3
Protenas
Tema 2. Aminocidos, pptidos y protenas......8 Tema 3. Ejemplos de protenas..37
Enzimas
Tema 4. Cintica enzimtica...77 Tema 5. Regulacin enzimtica.96 Tema 6. Coenzimas...106
Otras biomolculas
Tema 7. Hidratos de carbono...116 Tema 8. Lpidos..124 Tema 9. Bioenergtica...136
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Leccion 1 El agua
Importancia biolgica
El agua es la sustancia inorgnica de mayor importancia biolgica, esta importancia se debe en gran parte a sus caractersticas, que son las siguientes: Se trata, como ya ha sido mencionado, de una molcula inorgnica Constituye las 2/3 partes del organismo de media, aunque existen variaciones en el porcentaje determinadas sobre todo por la edad: El recin nacido est compuesto en un 80% de agua El individuo adulto esta cantidad disminuye al 70% de agua En el anciano, esta cantidad ronda el 60-65% de agua Al ser uno de los principales componentes del organismo, forma parte de todos los lquidos del cuerpo. Determina la estructura de numerosas macromolculas, resaltando fundamentalmente protenas y enzimas. Tiene una importante funcin disolvente, de la que se hablara mas adelante Participa activamente en la respiracin, siendo el medio en el que se lleva a cabo el intercambio de gases por disolucin de los mismos. Participa en la digestin Favorece la absorcin de nutrientes.
Estructura
El agua es un dipolo que presenta dos cargas parciales, una carga + en cada uno de los hidrgenos y una carga 2-
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Propiedades
Las propiedades que hacen del agua imprescindible para la vida son fundamentalmente las siguientes: Puede formar enlaces de hidrgeno. Debido a que es una molcula que presenta un marcado momento dipolar, el agua puede formar enlaces de hidrgeno entre s, y con otras molculas con electronegatividad de distinto signo, este enlace de enorme importancia biolgica presenta las siguientes caractersticas: Es un enlace dbil de naturaleza electrnica, pero es estable en la direccin adecuada Es un enlace cooperativo, pues favorece la formacin de otros enlaces Es un enlace dinmico debido a que se forma y se rompe con facilidad. El agua se trata del disolvente cuasi-universal, por tanto puede disolver las siguientes sustancias: Sustancias inicas, formando esferas de solvatacin con los iones. El agua tiene una elevada constante dielctrica lo que facilita la separacin de cargas con distinto signo. Sustancias polares no inicas (p.e. OH, SH, COOH, NH2). Disuelve estas sustancias empleando enlaces inicos o de hidrgeno y forma clatratos. Es en cambio incapaz de disolver sustancias apolares, pero es capaz de dispersar sustancias anfteras y anfolitos, que se disponen en micelas en un medio acuoso. El agua es altamente termorreguladora. Esto se debe a que es preciso aportar mucha energa para romper los enlaces de hidrogeno, por ello tambin el agua tiene un elevado calor de vaporizacin, y es un excelente conductor trmico. Distinta densidad en estado lquido/slido. El agua lquida es mas densa que el agua slida debido a la apertura angular que pasa de ser de 104,5 en el agua lquida, a 109,5 en el agua slida. El agua tiene una elevada tensin superficial debido al ordenamiento de sus molculas. Fisiolgicamente esto presenta un problema en la presin sangunea que debera ser muy elevada, pero el organismo soluciona esto favoreciendo el intercambio de materia clulas/sangre, con lo que aumenta el desorden molecular, y se rompe la tensin superficial.
Balance hdrico
El organismo siempre controla la concentracin de sustancias perjudiciales en exceso, como la glucosa, o el agua. El organismo ha de mantener la concentracin acuosa constante en la sangre y en el interior celular (mediante la homeostasis del H2O). Esta regulacin depende de la ingesta de slidos y lquidos (que provienen tanto de alimentos, bebida, y agua metablica). El exceso de agua se elimina a travs de orina, piel (sudor), y respiracin. En el medio celular, el intercambio de agua con el medio se realiza a travs de protenas transmembrana denominadas acuaporinas, y depende de la concentracin inica a ambos lados de la clula. Si la concentracin inica [In] en el interior de la clula [Inint] es igual a la del exterior de la clula [Ionext] y a su vez es igual al 0,9%, hablamos de un medio isotnico. En cambio si la concentracin inica exterior es mayor que la intracelular, hablamos de un medio hipertnico. Para igualar su concentracin con la del medio, la clula expulsa agua al exterior, Alberto Gmez & Laura del Olmo 4
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pudiendo producirse plasmolisis. Cuando la concentracin inica exterior es inferior a la intracelular se habla de un medio hipotnico, entrando agua al interior de la clula para compensar la diferencia, y producindose turgencia celular. Ambos fenmenos (turgencia y plasmolisis) pueden conducir a la citolisis o muerte celular.
Electrolitos y pH
El agua en s es un electrolito dbil que se ioniza segn la formula (H2O->H3O++OH-) tiene una baja constante de equilibrio Keq Normalmente en el agua pura, las concentraciones moleculares son las siguientes: [H2O]= 55,55 M [H3O+]= 10-7 M [OH-]= 10-7 Se ha definido una nueva constante, Kw, que se obtiene multiplicando [H3O+] por [OH-] y es igual a 10-14 El pH se obtiene mediante el log[H3O] (u [H+]) El pH es una medida de gran importancia biolgica que determina entre otras cosas la estructura de todas las molculas del organismo, fundamentalmente las protenas (y dentro de estas, las enzimas), que a valores fuera de parmetros biolgicos (pH= 7) se desnaturalizan. No podemos hablar de un pH fisiolgico como tal, ya que en distintas partes del organismo existen distintos pH, como por ejemplo los siguientes: pH(sangre)= 7,35 - 7,45 pH(intracelular)= 6,8 pH(gstrico)= 1,5 3 pH(pncreas)= 8 8,5
Tampones
Los tampones se tratan de sistemas encargados de mantener constante el pH. En el organismo existen tres sistemas de amortiguacin de pH: 1.) Tampones especies qumicas. En ellos coexisten en equilibrio una especie cida y una especie bsica. Segn la siguiente reaccin, extraemos una nueva constante en los tampones: pK Keq= [A-][H3O+]/[AH] Keq[AH-]=[A-][H3O+] [H+]=Keq[AH]/[A-] Alberto Gmez & Laura del Olmo 5
Bioqumica general -log[H+]=-log(Keq)+log([A-]/[AH]) pH = pK + log [ A] [ AH ]
Esta es la frmula de Henderson-Hasselbach, que determina el comportamiento de los tampones, sabiendo su pK y sus concentraciones de especie cida y bsica
[ Base] [ cido]
pH = pK + log
Los tampones cumplen las siguientes caractersticas

El pK de un tampn determina su eficacia amortiguadora con respecto al medio. sta capacidad es mxima cuando pK= pH 1 El pH de un tampn depende de la relacin entre su especie cida, y su especie bsica, y permanece invariable a la dilucin La capacidad amortiguadora de un tampn depende de su concentracin total
Los principales sistemas especie qumica en el organismo son los siguientes Medio intracelular. Tampn fosfato H3PO4 (1)- H2PO4- -(2)- HPO42- -(3)- PO43(1) pK= 1,98 (Slo neutraliza hidroxilos) (2) pK= 6,8 (3) pK= 12 (Slo neutraliza protones) Medio extracelular (sangre). Tampn bicarbonato En este tampn intervienen activamente el sistema renal, y respiratorio a pesar de ser un tampn especie qumica. CO2 (pulmones) -> CO2 + H2O (1)- H2CO3 (2)- HCO3- (Especie bicarbonato) Este tampn tiene las siguientes caractersticas:
pK= 6,1 Alta concentracin de bicarbonato (22-26 Mm) y aproximadamente 20 veces ms de bicarbonato que de dixido de carbono La especie cida es el CO2 y la bsica el HCO3-
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El dixido de carbono se elimina mediante los pulmones, si estos fallan, se produce una acidosis (bajada de pH en sangre) respiratoria al aumentar la concentracin de (especie acida) en sangre, en cambio, si se produce hiperventilacin, se produce alcalosis (subida de pH en sangre) al eliminarse demasiada especie acida El bicarbonato se elimina va renal, por ello si fallan los riones por defecto se produce una alcalosis metablica al no eliminarse suficiente bicarbonato, y si fallan por exceso de eliminacin, se producir una acidosis metablica. La acidosis es una afeccin que consiste en que el pH sanguneo baje por debajo de 7,35 La alcalosis es una afeccin que consiste en que el pH sanguneo suba por encima de 7,45
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Tema 2 AMINOCIDOS, PPTIDOS y PROTENAS

bloques constitutivos son los AMINOCIDOS
PROTENA = una de las molculas ms verstiles de nuestro organismo cuyos
Existen muchos sistemas de clasificacin de las protenas. Nosotros las clasificaremos segn 3 criterios: CRITERIO I: segn su FUNCIN 1. ESTRUCTURALES: su misin es conferir CONSISTENCIA a un orgnulo o TJ. Se pueden encontrar en la MB de las clulas, en las uas o en los cabellos, en el lquido intersticial, en el ADN (dan consistencia a los CR) 2. RECONOCIMIENTO de sustancias o molculas que se encuentran fuera de la clula. Ej.: en un diabtico la insulina acta metiendo la glucosa dentro de las clulas. Cul es la funcin concreta de la insulina? Avisar a las clulas de la existencia de glucosa en el medio que puede ser utilizada. Cmo acta? Toca un receptor al que se une, activando a los canales de glucosa (= funcionamiento de todas las hormonas). 3. ENZIMTICA: qu somos? reacciones qumicas catalizadas por enzimas. 4. TRANSPORTADORA: de O2 (aquoporinas), de lpidos apolares, de e- en la cadena respiratoria a travs de la MB. 5. HORMONAL 6. DE DEFENSA: proceso inmune. CRITERIO II: segn su COMPOSICIN 1. SIMPLES: slo por a = HOLOPROTENAS 2. CONJUGADAS: parte no proteica o grupo prosttico + parte proteica (a) = HETEROPROTENAS
Tipos de grupos prostticos (partes no proteicas): metales (citocromos), grupos hemo (hemoglobina), lpidos, glcidos
Los iones resultan esenciales para que se unan. CRITERIO III: segn su FORMA/MORFOLOGA 1. FIBROSAS: aspecto de fibra e INSOLUBLES en agua Ej.: colgeno 2. GLOBULARES: aspecto esfrico (tridimensionales) y SOLUBLES en agua As una protena se puede encajar dentro de los 3 criterios de clasificacin. Ej.: hemoglobina = - Segn su funcin - Segn su composicin transportadora heteroprotena
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Bioqumica general - Segn su forma globular
AMINOCIDOS (A) = bloques

constitutivos de las protenas Clasificacin 1. PROTEICOS = forman parte de las protenas 2. NO PROTEICOS = jams van a formar parte de las protenas como los a ornitina y citrulina, que son intermediarios en el metabolismo de algunos compuestos nitrogenados en el organismo.
1. PROTEICOS
A. COMUNES: una vez transcritos forman parte tal cual de la protena. Ej.: los 20 a comunes en las protenas B. NO COMUNES: una vez transcritos y que ya forman parte de la protena sufren una modificacin. Hay algunos a raros que forman parte de algunos tipos particulares de protenas, tales como las fibrosas. Por ejemplo, el a hidroxiprolina se encuentra casi exclusivamente en la protena llamada colgena. Hay otros a que no forman parte de ninguna protena. Estructura Constan de un grupo amino (-NH2), un grupo carboxilo (-COOH), un tomo de hidrgeno y un grupo distintivo R (cadena lateral), unidos al tomo de carbono . El grupo distintivo R o cadena lateral determinar su clasificacin.
I.
CLASIFICACIN DE LOS A COMUNES Segn la polaridad de la cadena lateral distinguimos 2 grandes grupos:
POLARES
- Sin carga neta APOLARES = carga
- Con carga neta
OJO! la Glycina es APOLAR (as lo consideramos en clase aunque en alguno sitios la consideren polar) Caractersticas a APOLARES Todas las cadenas laterales apolares estn formadas por CADENAS HIDROCARBONADAS ALIFTICAS (no se pueden ionizar) y se encuentran separadas por un C de la estructura comn 3 Excepciones: Prolina = su cadena lateral se Glycina encuentra directamente unida al C Alanina y al -amino Aparecen otros grupos que segn el giro: Grupos benceno = fenialanina Grupos indol = triptfano
Bioqumica general Caractersticas a POLARES - Todos separados - Aparecen otros grupos que se pueden ionizar: -OH, amida, tiol Casi nunca van a aparecer ionizados porque no van a tener carga en nuestro cuerpo A POLARES SIN CARGA HYSTIDINA = grupo IMIDAZOL CON CARGA Hay otros grupos que s aportan cargas: CIDOS = cadena lateral negativa
BASES = cadena lateral positiva
Existen otros grupos COO- y NH3+ en las cadenas laterales que no se deben confundir con el C Ej.: C-CH2-COO- = -carboxilo
II.
-
Segn la NATURALEZA de los GRUPOS FUNCIONALES que se encuentran dentro de las CADENAS LATERALES
Cclicos Carboxlicos Aminos Imidazol
Alifticos Aromticos = benceno Azufrados *Hidroxlicos* = los ms importantes porque permiten unir el P, lo que determina que las cadenas metablicas funcionen o no
III.
Segn su OBTENCIN
ESENCIALES: dependemos de la dieta para adquirirlos NO ESENCIALES: los sintetizamos sin ningn problema Hay a esenciales cuyo carcter esencial puede variar a lo largo de las etapas de la vida. Ejemplo.: - His = esencial en nios y jvenes - Lys = esencial en adultos - Arg = esencial en nios Estructura Los 20 tipos de cadenas laterales de los aminocidos que conforman las protenas, varan en tamao, forma, carga, capacidad de formar puentes de hidrgeno y reactividad qumica. La Alberto Gmez & Laura del Olmo 10
Bioqumica general clasificacin de aminocidos se hace con base en la estructura y polaridad de sus cadenas laterales.
Aminocidos con cadenas laterales alifticas
Glicina (Gly, G)
Alanina (Ala, A)
Valina (Val, V)
Leucina (Leu, L)
Isoleucina (Ile, I)
Prolina (Pro, P)
Aminocidos con cadenas laterales aromticas
Fenilalanina (Phe, F)
Tirosina (Tyr, Y)
Triptfano (Trp, W)
Aminocidos con cadenas laterales azufradas
Cistena (Cys, C)
Metionina (Met, M)
Aminocidos con cadenas laterales hidroxiladas
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Serina (Ser, S)
Treonina (Thr, T)
Aminocidos con cadenas laterales bsicas
Lisina (Lys, K) pKa=10.8
Arginina (Arg, R) pKa=12.5
Histidina (His, H) pKa=6.0
Aminocidos con cadenas laterales cidas y sus amidas respectivas
Aspartato (Asp, D) pKa=4.0
Glutamato (Glu, E) pKa=4.3
Asparagina (Asn, N)
Glutamina (Gln, Q)
ESTRUCTURA DE LOS A COMUNES

PROPIEDADES FSICAS
1/10/2010
Bioqumica general En todos los aminocidos, *excepto la glicina = glicocola*, el carbono-a est unido a cuatro sustituyentes/radicales diferentes: grupo amino, carboxilo, cadena lateral (R) e hidrgeno Debido a esto, el carbono-a constituye un centro quiral = sitio donde es posible tener 2 configuraciones diferentes, que son imgenes especulares no superponibles, llamadas ENANTIMEROS Los enantimeros se pueden distinguir porque rotan de manera diferente el plano de la luz polarizada. Todos los aminocidos que forman parte de las protenas son enantimeros L. Algunos Daminocidos se encuentran en pptidos sintetizados fuera de los ribosomas. La forma qumica correcta de escribir un a es colocando el grupo -carboxilo en la parte superior porque es el grupo ms oxidado.
Caractersticas del C - Es un carbono asimtrico porque posee 4 sustituyentes o radicales distintos *Excepto la glicina o glicocola porque su cadena lateral es un H, as que posee 2 sustituyentes iguales* - Debido a ello constituye un centro quiral, por lo que los a pueden existir como IMGENES ESPECULARES NO SUPERPONIBLES - Esto confiere una propiedad fsica, la ENANTIOMERA Formas en las que el grupo 3HN+ puede adquirir una orientacin concreta en el espacio Hay 2 formas de representar a los ENANTIMEROS MODELO CONVENCIONAL 2 tipos: 1. Segn a dnde desven el plano de la luz polarizada a) (+) Dextrgiro = hacia la derecha b) (-) Levgiro izquierda = hacia la
No posee ninguna trascendencia fisiolgica ya que el organismo no tiene haces de luz polarizada 2. Segn la orientacin que adopte 3HN+ con respecto a un eje imaginario CONVENCIN DE FISCHER = trascendencia fisiolgica! Gliceraldehdo primero que se descubri + Si el grupo 3HN se queda hacia la IZQUIERDA = L aminocido Gran trascendencia fisiolgica!!! Todos nuestros a son de la forma L Si el grupo 3HN+ se queda hacia la DERECHA = D aminocido C -3HN+
+ 3HN -C
Bioqumica general En humanos los D aminocidos son TXICOS; el organismo los discrimina y los elimina por la orina, por lo que no debe haber Da en nuestras protenas ya que todas las reacciones enzimticas de nuestro organismo son ESTEREOESPECFICAS, es decir, todas las reacciones qumicas son capaces de diferenciar si el grupo -amino se encuentra a la derecha o a la izquierda. Podemos encontrar Da en la pared celular de las bacterias. Cuando stas entran en nuestro organismo las atacamos rompiendo su pared. Si los acumulamos se almacenan en forma libre en nuestro organismo, por eso son txicos, porque aumenta la concentracin y el organismo no sabe qu hacer con ellos.
Derivan de su estructura; por tener un grupo amino y un grupo carboxilo = SUSTANCIAS ANFTERAS Se pueden comportar como cido o como base Por tanto los a ionizables se pueden describir a travs de equilibrios de ionizacin y poseern pK (valor del pH en el que tengo la misma cantidad de cido y de base) a) Aminocidos APOLARES Partimos de un a comn, con su grupo -amino protonado, es decir, cargado positivamente, en un medio cido (exceso de H+) + 3HN - CH COOH 1. El grupo -carboxilo perder 1 protn (y se desprender 1 H2O) dando lugar a una especie neutra capaz de captar un exceso de H+, y mantenindose constante el pH:
3HN
PROPIEDADES QUMICAS
- Hace referencia a la prdida del H+ del cido carboxlico 2. El siguiente grupo en perder 1 protn ser el -amino (y se desprender otra molcula de H2O) dando lugar a una especia cargada negativamente:
2HN
pK1 = 1.5 2.5
- CH COO
CH COO
- Hace referencia al valor aproximado del pH en el que se pierde el H+ del grupo -amino As podemos definir el PUNTO ISOELCTRICO (pI) = pH del a sin q Valor del pH al cual el a NO TIENE CARGA NETA, apareciendo la especie ZWITTERION Clculo del pI (es un pH) = en este punto el a no tiene carga Media de los valores de pH (a ambos lados) adyacentes a la especie sin carga (q) o especie ZWITTERION (q0):
pK2 = 8 9.0
Todos los aminocidos tienen por lo menos 2 grupos ionizables, y por lo tanto, su carga neta depende del pH del entorno - Los grupos carboxilo del C tienen valores de pKa entre 1.8 - 2.8
pI = pK1 + pK2 / 2 Propiedades cido-base (derivan de las propiedades qumicas = anfteros)
Bioqumica general - Los valores de pKa de los grupos -amino varan entre 8.8 - 10.6 A pH neutro, los aminocidos en disolucin se encuentran como iones dipolares (zwitteriones), es decir, el grupo amino se encuentra protonado y el grupo carboxilo disociado Los aminocidos cidos y bsicos tambin tienen grupos ionizables en su cadena lateral. Sus valores de pKa se encuentran tabulados. Para ilustrar la dependencia de la carga neta de un aminocido con respecto al pH del entorno, se considerar al aminocido histidina (curva de titulacin de la His). Adems de los grupos carboxilo y amino en el C, (valores de pKa de 1.8 y 9.2, respectivamente), la histidina tiene un anillo de imidazol en su cadena lateral con un valor de pKa de 6.0. Por lo tanto, la carga neta (la suma de las cargas positivas y negativas) cambia de +2 a -1 a medida que se incrementa el pH. A pH de 7.6, la carga neta es cero aunque la molcula contiene dos grupos casi completamente ionizados bajo estas condiciones. Al valor de pH donde la carga neta es cero, se llama punto isoelctrico.
El pI se calcular considerando los grupos imidazol (grupo R) y el grupo -amino: - El primero al ionizarse da lugar a la especie con carga neta 0 pK2 = 6.0 - El segundo al ionizarse convierte a esta especie en una con carga neta -1 As, el pKa ser (6.0 + 9.2)/2 = 7.6
pK3 = 9.2
b) Aminocidos POLARES SIN CARGA Ej.: Tyr posee un grupo OH en la cadena lateral, as que la prdida del protn se producir en el siguiente orden 1. OH C 2. OH de la cadena O lateral
OJO! Aunque tengan en una cadena lateral 1 grupo polar sin carga, NO SE IONIZA FISIOLGICAMENTE, sino que SIGUE LAS MISMAS PAUTAS que
3. -3HN
los AMINOCIDOS APOLARES

c) Aminocidos POLARES CON CARGA CIDOS (R-COOH) 1. El 1er H+ que siempre se pierde sin excepcin es el del grupo -carboxilo = pK1 El grupo -amino va a tirar del grupo -carboxilo facilitando que ste pierda su protn 2. En siguiente grupo en perder el protn ser el grupo polar cargado de la cadena lateral del a CIDO = pKR 3. Por ltimo el grupo -amino perder su protn = pK2 El rango sigue siendo el mismo que el de los a apolares sin carga: pK1 = 1.5-2.5 - pKR = ? - pK2 = 8-9
Bioqumica general
pI = pK1 + pKR / 2 Curva de Ionizacin
4-6/10/2010
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Bioqumica general Recordatorio: un aminocido es una SUSTANCIA ANFTERA - En un medio cido exceso de H+ En un a neutro (apolar o polar sin carga): - -COOH = 1 en desprotonar SIEMPRE - -NH3+ = 2 en desprotonar En un a cido (polar con q) se desprotonar primero el grupo cido de la cadena lateral (R-COOH) que el grupo -NH3+ En un a bsico (polar con q) se desprotonar primero el grupo NH3+ que el grupo bsico de la cadena lateral (R-NH3+)
pI = pK1 + pK2 / 2
pI = pK1 + pKR / 2 pI = pK2 + pKR / 2
d) Aminocidos POLARES CON CARGA BSICOS (R-NH3+) 1. El 1er H+ que siempre se pierde sin excepcin es el del grupo -carboxilo = pK1 2. El siguiente grupo en perder el protn ser el grupo -amino = pK2 3. Por ltimo el grupo polar cargado de la cadena lateral del a BSICO perder su protn = pKR
pI = pK2 + pKR / 2
Tampones orgnicos: Las protenas y aminocidos como tampn Los aminocidos y protenas son electrolitos anfteros, es decir, pueden tanto ceder protones (cidos) como captarlos (bases) y, a un determinado pH (en su pI), tener ambos comportamientos al mismo tiempo. La carga depende del pH del medio: En un medio muy bsico se cargan negativamente En un medio muy cido se cargan positivamente Desde el punto de vista fisiolgico este tipo de amortiguador resulta de especial inters a nivel tisular. Casi ningn aminocido puede comportarse como un tampn en la sangre o en el medio intracelular; s en el jugo gstrico.
A pH = 8-9 (bsico) todos los aminocidos actuarn como tampn negativamente Alberto Gmez & Laura del Olmo 17
se cargarn
Bioqumica general A pH < 7 (cido) los aminocidos se cargarn positivamente pKR = 6 Posee en su cadena lateral (R) 1 Grupo IMIDAZOL ciclado, con 2 grupos amino (captan 1 H+ de ms) Es un IMINOCIDO = molcula que contiene tanto un grupo funcional imino (>C=NH) como un carboxilo (-COOH). - 1er H+ en desprotonar -COOH - 2 H+ en desprotonar uno de los grupos amino de la cadena lateral -NH
*Excepcin*: HISTIDINA (His)
nico aminocido que en la sangre y en el medio intracelular puede actuar como acidificador (dador de protones H+)! Enorme importancia en la funcionalidad de la hemoglobina Hb (en los glbulos rojos) = transporte de O2 La histidina contiene un grupo IMIDAZOL, un anillo aromtico que tambin puede estar cargado positivamente. Con un valor de pKR cercano a 6, el grupo imidazol puede estar sin carga o cargado positivamente en las proximidades del pH neutro, dependiendo del entorno local. Por ello, la histidina se encuentra a menudo en los centros activos enzimticos, donde el anillo de imidazol puede unir y liberar protones durante las reacciones que se dan en ellos.
5 clases principales basadas en las propiedades de sus grupos R, en especial su polaridad, o tendencia a interaccionar con el agua a pH biolgico (cerca de pH = 7.0). La polaridad de los grupos R vara enormemente desde totalmente apolar o hidrofbico (insoluble en agua) a altamente polar o hidroflico (soluble en agua). Dentro de c/clase existen gradaciones de polaridad, tamao y forma de los grupos R. 1. Grupos R apolares alifticos = glicina, alanina, prolina, valina, leucina, isoleucina y metionina 2. Grupos R aromticos = fenilalanina, tirosina y triptfano 3. Grupos R polares sin carga = serina, treonina, cistena, asparagina y glutamina Son ms solubles en agua, o ms hidroflicos, que los de los a apolares, debido a que contienen grupos funcionales que forman puentes de H con el agua. Fisiolgicamente no pierden el H+ del grupo -OH *Excepciones* La serina (ser) y la cistena (cys), en el plegamiento de la protena se encuentran localizadas en el centro activo de la protena; por lo que, en condiciones adecuadas y en determinadas protenas s se puede perder ese H+ del grupo OH o tiol (-SH) Serina (ser) Su polaridad proviene de sus grupos OH Cistena (cys)
Los aminocidos se pueden clasificar segn su grupo R
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Bioqumica general Su polaridad proviene de su grupo sulfhidrilo -SH = cido dbil que puede establecer enlaces de H dbiles con el O2 o el N2 La cistena se oxida con suma facilidad formando un aminocido dimrico unido covalentemente llamado cistina, en el que 2 molculas de cistena estn unidas a travs de un enlace disulfuro. Los residuos unidos por un enlace disulfuro son fuertemente hidrofbicos o apolares. Desempean un papel esencial en la estructura de muchas protenas puesto que forman uniones covalentes entre partes de una molcula de protena o entre dos cadenas proteica diferentes 4. Grupos R cargados positivamente (bsicos) = lisina, arginina e histidina *Aunque el grupo R de la histidina se muestra sin carga, su pKR es tal que una fraccin pequea pero significativa de estos grupos est cargada positivamente a pH = 7.0 Al ser el nico aminocido comn que posee una cadena lateral ionizable con un pKR prximo a la neutralidad, la histidina tanto puede estar cargada positivamente (forma protonada) como no tener carga a pH = 7.0 Los residuos de His facilitan muchas reacciones catalizados por enzimas al servir de dadores/aceptores de protones. 5. Grupos R cargados negativamente (cidos) = aspartato y glutamato Los 2 aminocidos que tienen grupos R con una carga neta negativa a pH 7.0 son el aspartato y el glutamato, cada uno de los cuales tiene un 2 grupo carboxilo. Los aminocidos pueden absorber la luz a una longitud de onda () determinada: = 220 nm mximo de absorbancia caracterstico Los aminocidos con grupos R aromticos, debido a su estructura hexagonal, poseen un mximo de absorbancia mayor: = 280 nm Los aminocidos, debido a sus grupos COOH y NH3 son susceptibles de sufrir reacciones qumicas.
Otra propiedad: CAPACIDAD DE ABSORBANCIA DE LA LUZ
SUSCEPTIBLES DE SUFRIR REACCIONES QUMICAS A. Debidas al grupo -COOH:
1. ESTERIFICACIN: proceso por el cual se sintetiza un ster (compuesto derivado de la reaccin qumica entre un cido carboxlico y un alcohol) y se desprende 1 molcula de H2O. Es una de las formas que tienen las molculas para interaccionar con los aminocidos.
2. AMIDACIN: proceso por el cual se sintetiza una amida por sustitucin del grupo OH del cido por un grupo NH2, NHR o NRR' (llamado grupo amino) y se desprende 1 molcula de H2O. 3. DESCARBOXILACIN a AMINAS: proceso por el cual se sintetiza una AMINA mediante una reaccin qumica en la cual el grupo carboxilo es eliminado del compuesto en forma de dixido de carbono (CO2) con la prdida de 1 molcula de H2O. Ej.: histidina histamina Es una reaccin NO ESPONTNEA, catalizada por ENZIMAS del tipo DESCARBOXILASAS.
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Bioqumica general
B. Debidas al grupo -NH3:

1. Adicin de CIDOS ORGNICOS (otro aminocido R-COOH) con la formacin de un ENLACE AMIDA o PEPTDICO (O=C-N-H) y con la prdida de 1 molcula de H2O.
2. Adicin de ALDEHDOS (R-CH=O) con la formacin de una BASE de SCHIFF = grupo funcional que contiene un enlace doble carbono-nitrgeno el cual constituye un enlace fisiolgico muy fuerte; y prdida de 1 molcula de H2O.
3. DESAMINACIN OXIDATIVA (en presencia de una enzima) con prdida de 1 molcula de H2O. Consiste en una deshidrogenacin enzimtica del aminocido, el cual se hidroliza por una reaccin no enzimtica, formando el cido cetnico correspondiente y amoniaco.
C. Debido a grupos reactivos en las CADENAS LATERALES (R):

Grupo HIDROXILO (-OH) Grupo TIOL o Sulfhidrilo (muy reactivo): compuesto que contiene funcional formado por un tomo de azufre y un tomo de hidrgeno (-SH). el grupo
- El grupo tiol es el anlogo del azufre al grupo hidroxilo (-OH), que se encuentra en los alcoholes
CISTENA (tiol muy importante): se oxida formando un ENLACE DISULFURO. Para formarlo necesita energa, y una vez constituido cuesta mucho romperlo.
- Gran importancia fisiolgica: refuerza la estructura terciaria o cuaternaria de las protenas, adems de formar parte de centros activos enzimticos.
Cuando los grupos tiol de 2 residuos de cistena (como en monmeros o unidades constituyentes) se acercan uno al otro durante el plegamiento de protenas, una reaccin de oxidacin puede crear una unidad de cistina con un enlace disulfuro (-SS-). Importancia biolgico-fisiolgica del enlace disulfuro
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Bioqumica general - Pueden contribuir a la estructura terciaria de una protena si las csteinas forman parte de una misma cadena peptdica o contribuir a la estructura cuaternaria de protenas multimricas formando fuertes enlaces covalentes entre diferentes cadenas de pptidos. - Las cadenas pesadas y ligeras de los anticuerpos se mantienen unidas por puentes disulfuro. - Los pliegues en el pelo rizado son producto de la formacin de cistina. - Los productos qumicos utilizados en el alisamiento del cabello son reductores de puentes disulfuro de cistina a cistena con grupos sulfhidrilo libres, mientras que los productos qumicos utilizados en el cabello rizado son oxidantes que oxidan los grupos sulfhidrilo de la cistena y forman puentes disulfuro de cistina. - Los grupos sulfhidrilo en el sitio activo de una enzima pueden formar enlaces no covalentes con la enzima y el sustrato, lo que contribuye a la actividad cataltica.
Una vez transcritos y que ya forman parte de la protena sufren una modificacin. En realidad podramos hablar de a comunes que sufren una modificacin una vez incorporados a la protena. a) PROTEICOS. Sufren modificacin por: - CARBOXILACIN - HIDROXILACIN de un grupo fosfato (P) actividad enzimtica regula la
A NO COMUNES O MODIFICADOS
- FOSFORILACIN (una de las reacciones qumicas ms - ACETILACIN acetilglutmico importantes del organismo): adicin Por ej.: el a hidroxiprolina y la hidroxilisina (modificados por hidroxilacin) se encuentran casi exclusivamente en el colgeno (protena). Comentado en clase: Por qu es importante la glucosa (hgado msculo, cerebro)?
- METILACIN: adicin de un grupo metilo metilcistena, metilserina
- Proporciona energa a nuestras clulas de forma rpida - Es la nica fuente de energa del cerebro Cmo sabe la clula que tiene glucosa? - Ser necesario fosforilar esa glucosa para que la clula sepa que la tiene que degradarla b) NO PROTEICOS. No forman parte de ninguna protena.
HORMONAL. Por ej.: tiroxina
Funciones tirosina cido gamma-
NEUROTRANSMISORA. Por ej.: cido glutmico (descarboxilacin) aminobutrico (GABA) = principal neurotransmisor inhibitorio cerebral ANTIOXIDANTE Alberto Gmez & Laura del Olmo 21
Bioqumica general
Cmo se van a unir los aminocidos? ENLACES PEPTDICOS = enlace covalente fuerte y resistente que permite unir a entre s - Formacin:
Catalizado enzimticamente Hay un gasto de energa (ATP/GTP) En una zona concreta de la clula: los ribosomas Siempre interviene:
NIVELES ESTRUCTURALES DE LAS PROTENAS
-Carboxilo de un a -Amino del siguiente
= Reaccin de deshidratacin con la prdida de 1 molcula de H2O - Nomenclatura: la unin de 2 a da lugar a un DIPPTIDO; 3a = tripptido; 4a = tetrapptido Conclusin: como resultado de la unin de 2 aminocidos a travs del enlace peptdico se forman PPTIDOS - Caractersticas
1. Presenta una particularidad, es un HBRIDO DE RESONANCIA; es decir, tiene carcter de ENLACE SENCILLO y ENLACE DOBLE (oscila entre una forma sencilla-doble), lo que resulta fisiolgicamente importante.
60% = simples 40% = dobles
60 simples > 40 dobles
Esto condiciona que los elementos que forman parte del enlace peptdico se encuentren en un MISMO PLANO 2. CAPACIDAD de GIRO. Derivado de la oscilacin simple-doble, los elementos que forman parte del enlace peptdico (O=C-NH) se encuentran en un MISMO PLANO constituyendo un enlace rgido, por lo que no pueden girar.
Al no poder girar, el pptido resultante limita su capacidad de giro a los enlaces del Canomrico o C. 3. La capacidad de giro del pptido resultante se limita al C
Bioqumica general
4. El oxgeno (O) y el hidrgeno (H) que se encuentran dentro del plano adoptan una disposicin TRANS: - O a un lado del plano - H al otro lado del plano (lado opuesto al O) *CYS: en un mismo plano 5. Siempre que la protena pueda las cadenas laterales (R) de los aminocidos adyacentes se sitan a ambos lados del eje imaginario que podramos establecer. 6. Capacidad de formar enlaces de hidrgeno con otros elementos electronegativos (O, S, P)
PPTIDO: resultado de la asociacin de < de 50 a PROTENA: asociacin de > de 50 a
LMITE PPTIDO-PROTENA (convenio)
Hay excepciones. Ej.: la insulina (secuencia de 51 a) se considera un pptido
PPTIDOS. Capacidad de IONIZACIN

-amino -carboxilo
Capacidad de ionizacin debido a sus grupos: Grupos amino y carboxilo de las cadenas laterales (R) Ct
Se sintetizan siempre: Nt - Grupo amino-terminal = izquierda - Grupo carboxilo-terminal = derecha
Conclusin: la ionizacin queda limitada a estos extremos terminales y a los grupos amino y carboxilo de las cadenas laterales (R) Excepcin: grupo hidroxilo (-OH) y grupo TIOL (-SH) de la cistena
Todas las protenas tienen un pI caracterstico, determinado por los grupos que se pueden ionizar en esa protena. INSULINA: indica a las clulas de los TJ que hay glucosa en circulacin (sangre) que pueden utilizar.
2 Tejidos que si usan glucosa no la devuelven a la sangre: muscular y adiposo Alberto Gmez & Laura del Olmo 23
PROTENAS. PUNTO ISOELCTRICO (Pi)
HORMONAS = PPTIDOS
Bioqumica general En cambio, la glucosa que entra en el hgado es devuelta a la sangre por la vena porta GLUCAGN (sintetizado en el pncreas): indica los niveles de glucosa en sangre. Es complementario a la insulina, ya que indica a las clulas de los TJ que no tienen glucosa homeostasis
Insulina = hay glucosa Glucagn = no hay glucosa
Desmayo = llega poca glucosa al cerebro levantar piernas para facilitar la circulacin de la glucosa hasta el cerebro OXITOCINA (5 a): regula la contraccin uterina importante para la dilatacin cervical previa al parto. VASOPRESINA (9 a): regula la presin, y por tanto, la tensin arterial
Hormona antidiurtica (ADH), o arginina vasopresina (AVP) Liberada principalmente en respuesta a cambios en la osmolaridad srica o en el volumen sanguneo - Hace que los riones conserven agua mediante la concentracin de orina y la reduccin de su volumen, estimulando la reabsorcin de agua.
- Tambin tiene funciones en el cerebro y en los vasos sanguneos.

Curiosidad: el consumo de alcohol hace que esta hormona se inhiba y no se produzca la reabsorcin del agua. Esta agua es desechada por la orina, razn por la cual se acude tanto al servicio cuando se bebe alcohol.
Endorfinas (hormona de la alegra) Encefalinas
NEUROTRANSMISORES = PPTIDOS
Neurotransmisores opioides producidos en el Sistema Nervioso Central como moduladores del dolor, reproduccin, temperatura corporal, hambre y funciones reproductivas. Sustancia P: participa en la percepcin del dolor. AGENTES VASOACTIVOS: reguladores de la presin y tensin en el interior de venas y arterias Bradiquinina (9 a): causa vasodilatacin Angiotensina: causa vasoconstriccin
= PPTIDOS
disminuye la PA y la TA
aumenta la PA y la TA
GLUTATIN (3 a - tripptido): principal antioxidante intracelular que ayuda a proteger las clulas de especies reactivas de oxgeno (como los radicales libres o perxidos). - c. glutmico (Glu) - Cistena (Cys) Valinomicina: rompe la pared D de las bacterias
ANTIOXIDANTES = PPTIDOS
- Glicina (Gly)
ANTIBITICOS = PPTIDOS
Bioqumica general - Pptido cclico con accin antibitica que contiene aminocidos de la serie D - Es un ionforo: capaz de transportar iones potasio a travs de las MB biolgicas.
Amanita = PPTIDO TXICO 8/10/2010
Las protenas tienden a adoptar en el espacio una estructura de mxima estabilidad que guiar al resto de estructuras = ESTRUCTURA NATIVA - Caractersticas de la estructura nativa:
Estructura de mxima estabilidad de una protena Funcional Supone la disposicin final de la protena en el espacio El alcanzarla condiciona todos los niveles estructurales que tiene esa protena
NIVELES ESTRUCTURALES
Los a polares se disponen esencialmente en el exterior, y tienden a estar separados para que no aparezcan interacciones entre ellos (cargas) o con el H2O, que conduciran al plegamiento de la protena y su consecuente prdida de funcionalidad (desnaturalizacin). El pI no tiene por qu coincidir con los valores de pK de los a individuales, porque interaccionan entre ellos o con el medio, lo que hace que vare este pI: - Si un a posee un pK/pH < pI interactuar con el medio) - Si un a posee un pK/pH neta (q0)
+ (no hay carga suficiente para que la protena pueda

igual n de cargas + que por lo que no tiene carga
= pI -
- Si un a posee un pK/pH > pI
Todas las protenas alcanzan 3 niveles estructurales (hasta la estructura terciaria) pero solo algunas alcanzan un 4 nivel, la estructura cuaternaria.
A. ESTRUCTURA PRIMARIA = estructura COVALENTE de las protenas
Secuencia de a, orden en el que se encuentran colocados en la cadena peptdica. - Va a determinar indirectamente la funcin de la protena, ya que determina su forma. - Va a determinar directamente:
La forma de la protena Su vida media Su localizacin La unin de otras molculas a esa protena (glcidos, metalesgrupos prostticos o no aminoacdicos) y la presencia de modificaciones. Alberto Gmez & Laura del Olmo 25
Bioqumica general Qu a? En qu orden? Qu grupos prostticos?
Clasificacin de las protenas segn su estructura primaria
Las secuencias de a de las protenas pueden ser semejantes o no: Las protenas con una estructura primaria semejante (muy conservada) = HOMLOGAS Las protenas con una estructura primaria no semejante, que no se parece en nada (no conservada) = HETERLOGAS
Dentro de la estructura primaria puede haber a: Fundamentales para el funcionamiento de esa protena, es decir, si fueran sustituidos por otros la protena perdera su funcin = INVARIABLES No esenciales para el funcionamiento de la protena = VARIABLES Gran importancia fisiolgica: por ej., una de las teoras que se baraja acerca del origen del cncer, es la mutacin de los a invariables de la protena. Otra enfermedad debida a un cambio en 1 solo a (invariable) es la anemia falciforme o drepanoctica, ya que la mutacin en ese a hace que la hemoglobina (Hb) cambie su forma, por tanto el forma patolgica de eritrocito cambia tambin la suya (de forma normal bicncava media luna) lo que hace que se atasque, provocando obstrucciones o trombos.
Es una hemoglobinopata, enfermedad que afecta a la hemoglobina, una protena que forma parte de los glbulos rojos y se encarga del transporte de oxgeno. Es de origen gentico y se da por la sustitucin de un aminocido en su conformacin, lo que provoca que a baja tensin de oxgeno la hemoglobina se deforme y el eritrocito adquiera apariencia de una hoz o media luna. La nueva forma provoca dificultad para la circulacin de los glbulos rojos, por ello se obstruyen los vasos sanguneos y causan sntomas como dolor en las extremidades. Los glbulos rojos tambin padecen de una vida ms corta provocando anemia por no ser reemplazados a tiempo.
Clasificacin de los a que forman parte de la estructura primaria
La estructura primaria est sujeta fisiolgicamente a alteraciones/modificaciones producidas por PEPTIDASAS, que rompen la estructura cortando el enlace peptdico enzimas especficas entre bastante a Si actan en los extremos (carboxilo) de la cadena peptdica (los ms habituales) = CARBOXIPEPTIDASAS A, B y C - Carboxipeptidasa A: rompen el enlace peptdico (por el extremo carboxilo terminal) del ltimo aminocido si no es prolina (Pro), lisina (Lys) ni arginina (Arg) - Carboxipeptidasa B: exclusivamente si el ltimo aminocido es Pro, Lys o Arg Carboxipeptidasa A (complementaria) ~ de la Carboxipeptidasa B - Carboxipeptidasa C: exclusivamente si el ltimo aminocido es PROLINA, ya que se trata de un a difcil debido a su cadena lateral aliftica Las carboxipeptidasas pueden llegar a romper por completo la estructura proteica, y no se encuentran de forma libre en el organismo, sino que se sintetizan por un precursor activado por 1 seal.
Distintos tipos de peptidasas segn donde acten:
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Bioqumica general Si actan en el interior de la cadena peptdica = ENDOPEPTIDASAS c y n - Endopeptidasa c: reconoce al a que aporta el grupo carboxilo al enlace peptdico TRIPSINA y QUIMIOTRIPSINA
TRIPSINA
o A bsicos: Arg Lys

Enzima endopeptidasa c, que rompe los enlaces de las protenas mediante hidrlisis para formar pptidos de menor tamao y aminocidos. Es producida en el pncreas y secretada en el duodeno, donde es esencial para la digestin. Es una enzima especfica ya que liga al pptido en las posiciones del carboxilo de residuos Arginina (Arg) o Lisina (Lys) en la cadena, ambos aminocidos con grupos R cargados positivamente, fragmentando al pptido inicial.
QUIMIOTRIPSINA (tincin especfica)
o A aromticos: Trp Phe o A alifticos con cadenas voluminosas ramificadas: Val Leu
Facilita la rotura de enlaces peptdicos por reacciones hidrolticas El principal sustrato de la quimotripsina incluye el triptfano, tirosina, fenilalanina y metionina (cadena lateral azufrada), que son hidrolizados en el carboxilo terminal.
- Endopeptidasa n: reconoce al a que aporta el grupo amino al enlace peptdico
TERMOLISINA y PEPSINA TERMOLISINA (carcter apolar) o A hidrofbicos
Es un termoestable neutral metaloproteinasas de la enzima producida por el gramo-positivas Bacillus (bacterias). Necesita 1 in Zn para la actividad enzimtica y 4 iones Ca para la estabilidad estructural. Cataliza especficamente la hidrlisis del enlace peptdico que contiene, en el extremo amino, aminocidos hidrofbicos. Pero la termolisina es utilizada a menudo para la formacin de enlaces peptdicos por la reaccin inversa de hidrlisis.
PEPSINA o A aromticos: Phe, Tyr Trp o A alifticos voluminosos
Es una endopeptidasa n que corta a los a Phe, Tyr y al Trp en los grupos amino. Es una enzima digestiva que degrada protenas en el estmago. Las otras enzimas digestivas importantes son la tripsina y la quimiotripsina. Se produce en el estmago, acta sobre las protenas degradndolas, y proporciona pptidos y a en un ambiente muy cido. El pepsingeno es un precursor de la pepsina; cuando acta el HCl sobre el pepsingeno, ste pierde a y queda como pepsina, de forma que ya puede actuar como proteasa. Es ms activa con un pH de entre 2 y 4; y se desactiva permanentemente con un pH > 6.
PEPSINA (extremo izquierdo Nt) & QUIMIOTRIPSINA (extremo derecho Ct) = COMPLEMENTARIAS: se diferencian en la localizacin La mayor parte de las PEPTIDASAS se forman en el PNCREAS pero no se encuentran libres en el organismo, sino que se activan dentro del bolo alimenticio Pancreatitis = inflamacin del pncreas Alberto Gmez & Laura del Olmo 27
Bioqumica general - Mecanismo normal: las peptidasas se sintetizan en el pncreas en proforma (como precursoras) no activa y se liberan al intestino; solo se sintetizarn cuando hay alimento que degradar, y cuando no lo hay se autodegradan, pero todo ello ya en el intestino. - Mecanismo patolgico: si las peptidasas se activan en el pncreas irn a degradar a las protenas (molcula bsica de todo TJ), y producirn la inflamacin. Conclusin: uno de los motivos de la pancreatitis es que las peptidasas se activen en el pncreas (cuando el mecanismo normal sera que se activasen en el intestino) 14/10/2010 B. ESTRUCTURA SECUNDARIA: estructura tridimensional que adopta un segmento de la protena (un n limitado de a) en el espacio, repetitiva y ordenada. Mismo plano
Enlace : 3HN C
+
Misma cadena peptdica CARCTER PLANAR

Enlace
Est condicionada por la limitacin de giro del enlace peptdico
: C COOH
De modo que la cadena peptdica solo podr girar a travs de estos enlaces - de los extremos aminoterminal () y -carboxiloterminal () lo que condiciona el n de estructuras secundarias, mayoritariamente de 2 tipos (aunque existen ms): -HLICE LMINA Todas vienen indicadas en las representaciones tabuladas de RAMACHANDRAN (posibles variaciones en los giros de los enlaces y )
-HLICE: disposicin helicoidal que adopta un fragmento de a en el espacio,

constituido entre 11-17 a. - Dimensiones estructurales que siempre se cumplen:
Hlice dextrgira 3.6 a x vuelta aprox. (5.4 ) Dimetro (): 5
- Cmo se ESTABILIZA? A travs de ENLACES de HIDRGENO intracatenarios (se forman dentro de la cadena peptdica) = estabilizacin COOPERATIVA (efecto cremallera)
Se forman entre los elementos del enlace peptdico:
o Entre el grupo amino del enlace peptdico de un a o El grupo carboxilo de otro enlace peptdico de otro a separados el uno del otro por 4 a (i i + 4) Ej.: entre 1-5, 2-6, 3-7 Solo cuando ocurre esta distribucin se permite que los enlaces de hidrgeno estn perfectamente orientados en paralelo (alineados) al eje imaginario de esa -hlice - Las cadenas laterales (R) siempre quedan en el exterior, lo que genera impedimentos pues habr a que debido a su R no podrn adoptar una estructura en -hlice.
Bioqumica general Tipos de a que dificultan la estructura en -hlice: Cadenas laterales VOLUMINOSAS en la estructura primaria: 5 + a
Fragmentos con a muy PEQUEOS: glicina (Gly) alanina (Ala) A IONIZADOS (con q)
- NO ADOPTARN la estructura en -hlice - Dnde se encuentran las -hlice?

Mayoritariamente en las protenas FIBROSAS (> 70 %) Tambin en las protenas globulares
LMINA : fragmentos de a que adoptan una disposicin en ZIGZAG en el espacio

(dentro de una misma protena): Se asocian en el espacio con otras, y estas se pueden apilar a su vez dando lugar a 2 tipos de Lminas :
A. PARALELAS: cuando los extremos aminoterminal (Nt) y carboxiloterminal (Ct) de cada una
de esas lminas coinciden en la misma orientacin - Cmo se estabilizan? Mediante enlaces de hidrgeno de disposicin cruzada - Las cadenas laterales (R) se disponen a ambos lados del plano definido por las L (hacia arriba hacia abajo) - Unin entre las distintas L = LAZOS una estructura secundaria concreta) heterogneos (pueden tener o no tener
B. ANTIPARALELAS: cuando sus extremos aminoterminal (Nt) y carboxiloterminal (Ct) no

coinciden en la misma orientacin - Cmo se estabilizan? Mediante enlaces de hidrgeno de disposicin paralela - Unin entre las distintas L = GIROS muy concretos (formados siempre por a pequeos o con impedimento de giro: glicina -Gly- y prolina Pro-) Mucho MS ESTABLES que las L PARALELAS debido a la orientacin alineada de sus enlaces de hidrgeno
Tipos de a que dificultan la estructura en lmina : CARGADOS A A VOLUMINOSOS IONIZADOS (se repelen) Dnde se encuentran las lmina ? Mayoritariamente en las protenas GLOBULARES Alberto Gmez & Laura del Olmo 29
Bioqumica general Tambin en las protenas fibrosas Subtipos de -hlice: - Hlice 310 - Hlice
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BIOQ GENERAL
Poseen menor probabilidad de que se establezcan enlaces de hidrgeno entre los elementos del enlace peptdico de sus a por lo que disminuye su estabilidad Estructura SUPERSECUNDARIA: asociaciones repetitivas de estructura secundaria 15/10/2010 C. ESTRUCTURA TERCIARIA: plegamiento de la estructura secundaria, es decir, disposicin de toda la cadena peptdica en el espacio. - Cmo se estabiliza? Por enlaces dbiles:
Enlaces de hidrgeno Interacciones electroestticas/inicas/dipolo-dipolo/hidrofbicas Enlaces de Van der Waals
Cuando la protena alcance su conformacin nativa (de mxima estabilidad) podrn aparecen enlaces covalentes disulfuro con el objetivo de reforzar esta estructura una vez que ya est estabilizada. o Enlaces covalentes disulfuro: refuerzan la estructura terciaria, NO ESTABILIZAN - Objetivo de la estructura terciaria: esconder a los a con cadenas laterales apolares
Los a con cadenas polares se orientan hacia el exterior Los a con cadenas apolares se orientan hacia el interior
o Los a con cadenas polares sin q pueden orientarse hacia el interior No siempre ser as, ya que por ej., hay protenas fibrosas con gran n de a apolares, as que alguno de ellos estar en contacto con el agua. TODAS las protenas alcanzan una estructura terciaria; sin embargo, no todas llegan a adoptar una estructura cuaternaria.
D. ESTRUCTURA CUATERNARIA: slo en protenas con ms de 1 cadena proteica

= protena OLIGOMRICA PROTMERO = cada una de las cadenas polipeptdicas de una protena oligomrica - Cmo se estabiliza? Mediante enlaces dbiles *nunca covalentes!* Excepcionalmente, en protenas muy concretas (funcionales) es necesaria la aparicin de un enlace covalente entre los protmeros. - Objetivo de la estructura cuaternaria:
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BIOQ GENERAL
1. Facilitar la sntesis proteica en el organismo, pues es ms fcil sintetizar varios protmeros que una cadena polipeptdica larga. Ej.: 4 subunidades en vez de una cadena muy larga 2. Facilitar la solucin de daos/modificaciones o mutaciones de la protena. En el caso de que 1 protmero est daado es fcil solucionar ese dao, cambiando un protmero por otro; en cambio en una cadena larga habra que modificar toda la protena 3. Facilitar la regulacin de la actividad de estas protenas en reacciones concretas
FACTORES QUE PODRAN DESESTABILIZAR LA ESTRUCTURA NATIVA DE LA PROTENA (Agentes desnaturalizantes)

Los agentes que provocan la desnaturalizacin de una protena se llaman agentes desnaturalizantes. Se distinguen agentes fsicos (calor) y qumicos (detergentes, disolventes orgnicos, pH, fuerza inica). Como en algunos casos el fenmeno de la desnaturalizacin es reversible, es posible precipitar protenas de manera selectiva mediante cambios en: 1) TEMPERATURA: un aumento de la temperatura hace que se rompan los enlaces dbiles que mantienen la estructura terciaria, perdiendo la estructura de forma irreversible.
Formar otros enlaces dbiles (no suficientemente estables) para esconder los a apolares, para lo que se volver a plegar.
Cuando la temperatura es elevada aumenta la energa cintica de las molculas con lo que se desorganiza la envoltura acuosa de las protenas, y se desnaturalizan. Asimismo, un aumento de la temperatura destruye las interacciones dbiles y desorganiza la estructura de la protena, de forma que el interior hidrofbico interacciona con el medio acuoso y se produce la agregacin y precipitacin de la protena desnaturalizada.
Una desnaturalizacin producida por calor es siempre IRREVERSIBLE. nicamente, una protena extremadamente soluble en medio bsico (como por ej. la albmina) podra redisolverse lentamente en medio bsico.
2) pH: los cambios bruscos de pH provocan un cambio de carga, principalmente en las cadenas laterales polares (R), lo que produce un cambio de estructura:
+ + = cargas elctricas de tipo repulsivo: se repelen - + = se atraen: facilitan la agregacin intermolecular
mantienen la estructura precipitacin
- pH < pI
protenas +
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BIOQ GENERAL
- pH = pI - pH > pI
+ -
no hay carga neta (q ) protenas
Los iones H y OH del agua, adems de afectar a la envoltura acuosa de las protenas, tambin afectan a la carga elctrica de los grupos cidos y bsicos de las cadenas laterales de los aminocidos. Esta alteracin de la carga superficial de las protenas elimina las interacciones electrostticas que estabilizan la estructura terciaria y a menudo provoca su precipitacin. La solubilidad de una protena es mnima en su punto isoelctrico, ya que su carga neta es cero y desaparece cualquier fuerza de repulsin electrosttica que pudiera dificultar la formacin de agregados.
3) SALES NEUTRAS: se disuelven con el agua (disociacin) robando la esfera de solvatacin que rodea a las protenas, producindose una prdida de solubilidad drstica al aumentar la concentracin de la sal. As estos solutos compiten por el agua, rompiendo los enlaces dbiles o interacciones electroestticas y por tanto, la protena pierde su estructura (se expande) y funcin. - Redisolucin y Renaturalizacin. Seran posibles simplemente recuperando el agua (aadiendo agua) - Constituye un excelente mtodo de purificacin
4) FUERZA INICA Adicin de cidos o bases muy concentrados Un aumento de la fuerza inica del medio (por adicin de sulfato amnico, urea o hidrocloruro de guanidinio, por ejemplo) tambin provoca una disminucin en el grado de hidratacin de los grupos inicos superficiales de la protena, ya que estos solutos:
Compiten por el agua Rompen los puentes de hidrgeno o las interacciones electrostticas
de forma que las molculas proteicas se agregan y precipitan - Redisolucin y renaturalizacin. En muchos casos, la precipitacin provocada por el aumento de la fuerza inica es reversible. Mediante una simple dilisis se puede eliminar el exceso de soluto y recuperar tanto la estructura como la funcin original. A veces es una disminucin en la fuerza inica la que provoca la precipitacin. As, las protenas que se disuelven en medios salinos pueden desnaturalizarse al dializarlas frente a agua destilada, y se renaturalizan cuando se restaura la fuerza inica original - Ejemplo: tenemos 3 tubos de ensayo con una protena soluble en el agua; en 2 de ellos aadimos un cido fuerte y ambas precipitan; en otro aadimos una base fuerte (NaOH) y no precipita.
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BIOQ GENERAL
En los 2 primeros tubos la protena precipita porque se le han agregado o ha interaccionado con aniones muy voluminosos (-) su redisolucin se producir en medio bsico para que deje de tener carga + (y as no interaccionar); sin embargo la protena se hallar totalmente desnaturalizada: soluble pero inservible En el tubo con NaOH la protena no precipita porque se le ha agregado un catin poco voluminoso (Na+ = catin ligero), por lo que no se supera el producto de solubilidad. 5) SOLVENTES ORGNICOS POLARIDAD
Disminuyen la cte. dielctrica del medio = capacidad solvente oponerse a la atraccin de las molculas (q1 x q2)
capacidad de
Fuerza de interaccin (Fe) = K q1 x q2 / r2 Cuanto ms fuerte la interaccin entre las cargas (q1 x q2) menos capacidad solvente
Roban tambin la esfera de solvatacin Favorecen las interacciones entre las cadenas laterales apolares (R) del interior sacndolas al exterior = prdida de solubilidad
Casi siempre IRREVERSIBLE - Ejemplo: el agua posee una elevadsima cte. dielctrica, mucho ms elevada que la del etanol-acetona, as que al ser aadido ste, rebajamos la potencia del agua como solvente, disminuyendo la interaccin protena-disolvente las cadenas peptdicas se acercan y la protena precipita. - Redisolucin y renaturalizacin. Si se hubiera trabajado en condiciones de fro (a -20C) no se hubiera alterado su estructura, y por tanto se redisolvera en agua; por otro lado, en condiciones de fro algo superiores a la anterior (0C), se hubiera podido redisolver forzando el medio hacia cido. Sin embargo, si hubiramos necesitado forzar mucho el medio hacia cido significara que habramos producido mucho desnaturalizacin. La polaridad del disolvente disminuye cuando se le aaden sustancias menos polares que el agua como el etanol o la acetona. Con ello disminuye el grado de hidratacin de los grupos inicos superficiales de la molcula proteica, provocando la agregacin y precipitacin. Los disolventes orgnicos interaccionan con el interior hidrofbico de las protenas y desorganizan la estructura terciaria, provocando su desnaturalizacin y precipitacin. La accin de los detergentes es similar a la de los disolventes orgnicos. 6) METALES PESADOS: interaccionan con los enlaces dbiles, pudiendo llegar a:
Oxidar a cadenas laterales (R) Intercalarse en la estructura proteica de forma IRREVERSIBLE formando enlaces covalentes; adems, al ser voluminosos, pueden superar el producto de solubilidad de la protena con su consecuente precipitacin 34
BIOQ GENERAL
7) AGENTES REDUCTORES: rompen los enlaces covalentes disulfuro, que estn reforzando a la estructura proteica. - Casi ninguna estructura se recupera = IRREVERSIBLE; aunque por ej., con las sales neutras a veces se puede recuperar la estructura nativa *Recordatorio* Objetivo de la adopcin de una estructura terciaria o cuaternaria: llegar a una estructura de mxima estabilidad, la cual est proporcionada por los enlaces dbiles; si se rompen = prdida de funcin Las cadena laterales (R) se disponen separadas para que no interaccionen entre s, pero s con el agua, formndose la esfera de solvatacin, que permite el mantenimiento de esta estructura nativa o de mxima estabilidad. Todo lo que cambie esto llevar a la prdida de estructura. Aqu es donde actan los agentes reductores, robando la esfera de solvatacin a la protena, lo que provoca:
Plegamientos de la molcula proteica que hacen que los R se dispongan ms juntos y que interaccionen entre s Adems, al perder la esfera de solvatacin se condiciona que las cadenas laterales (R) de la protena pueden interaccionar con los R de otras protenas aumenta interaccin protena-protena = precipitacin
Ej.: etanol, agua oxigenada Comentado en clase Problema actual con los metales pesados: debido a la contaminacin presente en nuestros mares, cada vez son ms los peces contaminados con mercurio, plomo que son metales pesados, muy peligrosos para nuestro organismo por su interaccin con las protenas. Qu ocurre entonces? No hay manera de saber si el pescado que consumimos est contaminado o no, a no ser que provenga de piscifactora. Si lo consumimos, el mercurio y el plomo se intercalarn en la estructura nativa de nuestras protenas, y oxidarn a los aminocidos de las cadenas peptidicas, lo que impedir que la protena lleve a cabo su funcin.
Falsos mitos sobre la desinfeccin de heridas mediante soluciones orgnicas: El agua oxigenada y el alcohol son buenos desinfectantes - El agua oxigenada destruye a los tejidos (necrosis tisular). - El alcohol produce vasodilatacin.
Cmo desinfectar una herida correctamente: limpiar con agua y jabn, del centro a la periferia. Si la herida es profunda, utilizar suero fisiolgico.
"La saliva es un buen desinfectante" (base fundamental en la imitacin animal). Est compuesta por una enzima, la lisozima, que rompe las paredes celulares de las bacterias contenidas en los alimentos, protegiendo en parte a los dientes de las caries y de las
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BIOQ GENERAL
infecciones. Sin embargo, su poder bactericida es muy bajo y lo ms probable es que la aplicacin de saliva en las heridas favorezca el transporte de grmenes ms agresivos que aumenten el riesgo de infeccin de las mismas.
Todo este plegamiento (conformacin de las estructuras en el espacio) se produce en los seres vivos de forma natural, simplemente por la interaccin del agua con las cadenas polipeptidicas.
REPLEGAMIENTO DE LAS PROTENAS: CHAPERONAS

En ocasiones es necesario plegar protenas que han sufrido un desplegamiento parcial; Ej.: las protenas de transmembrana se han de desplegar un poco para atravesar la membrana plasmtica. Este REPLEGAMIENTO es realizado por las CHAPERONAS = cilindros ( chaperoninas). As las protenas incapaces de adoptar su estructura nativa requieren de ellas. Adems, en el RER forman parte del CONTROL de CALIDAD en la sntesis proteica. As las protenas mal plegadas son bloqueadas por chaperonas, unindose a ellas y estabilizando la protena. Las mantiene desplegadas hasta que se corrige el plegamiento.
Son un conjunto de protenas presentes en todas las clulas, muchas de las cuales son protenas de choque trmico. Funcin: ayudar al plegamiento de otras protenas recin formadas en la sntesis de protenas. No forman parte de la estructura primaria de la protena funcional, sino que slo se unen a ella para ayudar en su plegamiento, ensamblaje y transporte celular a otra parte de la clula donde la protena realiza su funcin. Los cambios de conformacin tridimensional de las protenas pueden estar afectados por un conjunto de varias chaperonas que trabajan coordinadas, dependiendo de su propia estructura y de la disponibilidad de las chaperonas.
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BIOQ GENERAL
Tema 3 EJEMPLOS DE PROTENAS
La estructura condiciona la funcin.
As como los polisacridos se reducen a ser sustancias de reserva o molculas estructurales, las protenas asumen funciones muy variadas gracias a su gran hetereogeneidad estructural (derivada de sus cadenas laterales). Describir las funciones de las protenas equivale a describir en trminos moleculares todos los fenmenos biolgicos. Podemos destacar las siguientes:

funcin enzimtica funcin hormonal funcin de reconocimiento de seales funcin de transporte funcin estructural
funcin de defensa funcin de movimiento funcin de reserva transduccin de seales funcin reguladora
*Transduccin de seales: proceso por el que una clula convierte una determinada seal o estmulo exterior, en otra seal o respuesta especfica.
Muchas protenas ejercen a la vez ms de una de las funciones enumeradas: Las protenas de membrana tienen tanto funcin estructural como enzimtica; la ferritina es una protena que transporta y, a la vez, almacena el hierro; la miosina interviene en la contraccin muscular, pero tambin funciona como un enzima capaz de hidrolizar el ATP Podemos agruparlas en 2 grandes grupos que se subdividen en otros 2 grupos:
1) FIBROSAS
MATRIZ EXTRACELULAR COLGENO ELASTINA QUERATINA CONTRCTILES ACTINA MIOSINA (componentes del citoesqueleto de las clulas del TJ muscular, huso mittico)
2) GLOBULARES
DEFENSA INMUNOGLOBULINAS UNIN AL O2 HEMOGLOBINA (transporte y almacenamiento)
1) FIBROSAS A. MATRIZ EXTRACELULAR (se hallan formando parte de ella) - Funcin = principalmente ESTRUCTURAL

ESTABILIZACIN de todas las clulas del TJ (conglomerado) DELIMITACIN CONSISTENCIA resistencia mecnica
Permite FIJAR IONES (Ca2+, Mg2+)

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BIOQ GENERAL
- Composicin:
Glcidos
o Minoritarias = lamininas y = COLGENO, Protenas proteoglicanos ELASTINA y QUERATINA que se implican entre s, por lo que es difcil establecer qu es protena y qu es glcido; no es posible delimitarlas porque ambas van a formar parte entre s. Ej. de estructura no delimitable = proteoglicanos (compuesto proteico y glucdico): los clasificamos como hidratos de carbono, ya que estos tienen mayor peso en la molcula.
COLGENO
Es una de las protenas mayoritarias del organismo (constituye ms de 1/3 del total de las protenas) Se sintetiza en las clulas del TJ CONJUNTIVO, pero no se queda dentro de las clulas, sino que se exporta a la matriz extracelular del TJ celular, en especial del TJ conjuntivo. Es el componente fundamental de: vasos sanguneos, tendones, huesos, cartlagos, crnea (TJ conjuntivo o conectivo, seo, cartilaginoso) de todas aquellas estructuras de gran elasticidad pero que precisan de una gran resistencia (por eso es una de las ms abundantes) ESTRUCTURA El colgeno propiamente dicho es una MACROESTRUCTURA formado por apilamiento de FIBRAS - Compleja y fibrosa - Elevado carcter de insolubilidad en H2O - Elevado carcter apolar a) Estructura primaria presenta una particularidad, exclusiva del colgeno, que es la que lo hace tan APOLAR = repeticiones sucesivas de 1 triplete de a que siempre ser: GLY X Y pudiendo ser X Y mayoritariamente (58-60%) = Pro OHPro Lys OHLys
Ala
La Pro y la Lys son hidroxiladas una vez sintetizada la protena dando lugar a la OHPro y la OHLys = ejemplo de a modificados dentro de una estructura proteica (a no comunes) Esta particular estructura primaria condiciona la estructura secundaria. b) Estructura secundaria = CADENA Debido principalmente a la abundancia de Pro en el triplete de a que se repite sucesivamente y a la apolaridad de los a que forman la cadena, la cadena peptdica adopta una estructura helicoidal, ya que no puede ser de otra forma: Pro giro; Pro giro Surge as un subtipo de estructura secundaria exclusiva del colgeno = CADENA Caractersticas de la CADENA muy distinta de la -hlice
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BIOQ GENERAL
Levgira -hlice dextrgira Muy estrecha, dimetro () = 3.8 -hlice = 5 3 a por vuelta -hlice 3.6 casi 4 a por vuelta NO ESTABILIZADA POR NINGN TIPO DE ENLACE -hlice estabilizada por enlaces dbiles
Por qu no se encuentra estabilizada por ningn tipo de enlace? Porque la estructura primaria del colgeno, a consecuencia de ese triplete de a caracterstico y exclusivo, no puede adoptar otro tipo de estructura; la Pro (muy abundante, casi 1 Pro c/3 a) impone el giro, es decir, el hecho de esa particular estructura primaria impone una estructura obligatoria, que es la cadena . Aunque no se estabilice por enlaces (dbiles) de hidrgeno, no significa que no los pueda formar. Puede formar enlaces de hidrgeno (que no han contribuido a su estabilizacin) Conclusin: la CADENA es estable por s misma porque es la nica estructura que puede adoptar la estructura primaria a consecuencia de los giros provocados por la abundante prolina (Pro).
Las cadenas laterales (R) de los a que forman la cadena (estructura secundaria del
colgeno) quedan en el EXTERIOR La estructura secundaria o cadena no es la estructura definitiva. c) Estructura terciaria indefinida No carece de estructura terciaria, pero no podemos aislarla del conjunto, ya que se trata de una macromolcula (las fibras de colgeno no constituyen el colgeno propiamente dicho, sino su conjunto). Conclusin: resulta difcil identificar a la estructura terciaria, ya que sta se encuentra entre la estructura secundaria (cadena peptdica o cadena ya plegada) y la estructura cuaternaria (cadena polipeptdica/oligomrica o triple asociacin de cadenas = tropocolgeno). Dnde se encuentra la separacin? No se puede saber. d) Estructura cuaternaria = TROPOCOLGENO Asociaciones triples de cadenas o cadenas peptdicas TRIPLE HLICE de cadenas = TROPOCOLGENO El tropocolgeno constituye uno de los ltimos pasos para llegar a la estructura definitiva.
esto es lo que le da La triple hlice gira a derechas = *DEXTRGIRA* la tremenda RESISTENCIA/CONSISTENCIA al colgeno
Por qu? El tropocolgeno o triple hlice tendr un sentido de giro (derecha) contrario al de las cadenas (izquierda), lo que hace que acte como una cuerda de 3 cabos; si se intenta desmontar se enrrollar an ms. Se estabiliza simplemente por su estructura: o levgiro-helicoidal ) (cadenas o tropocolgeno dextrgiro
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BIOQ GENERAL
Adems, tambin contribuyen fundamentales y necesarios:
su
estabilizacin,
resultan
totalmente
- Enlaces de hidrgeno intercatenarios: aparecen entre los elementos de los enlaces peptdicos de las 3 cadenas - Residuos de OHPro e OHLys de distintas cadenas los enlaces de hidrgeno intercatenarios permiten la formacin de
- Interacciones hidrofbicas: al tratarse de cadenas polipeptdicas apolares se dispondrn intentando repeler el agua, para lo que se juntarn y pegarn mucho entre s, intentando exponer el menor nmero de a apolares posibles al agua (aunque siempre habr algn a que contacte con el agua)
Cmo se hidroxila la Pro y la Lys?

*HIDROXILACIN: reaccin qumica en la que se introduce un grupo hidroxilo (-OH) en un compuesto reemplazando un tomo de hidrgeno, oxidando al compuesto. En la hidroxilacin de las protenas, el principal receptor del grupo hidroxilo suele ser la prolina, formndose hidroxiprolina, uno de los principales componentes del colgeno.
- Las hidroxilaciones de la cadena primaria se llevan a cabo en estructura secundaria, cuando la cadena peptdica ya ha adoptado la cadena . - Las reacciones de hidroxilacin de las protenas son facilitadas (catalizadas) por enzimas especficas:
PROLIL HIDROXILASA
LISIL HIDROXILASA
Reconocen especficamente en una cadena cuando hay un residuo de Pro o Lys ya que al aadir el grupo OH marcan a los aminocidos (si estn presentes se hidroxilarn,
recibirn el grupo -OH)
Lo nico que las diferencia es la especificidad de la enzima hidroxilasa: prolil lisil Aaden un grupo OH (la lisil hidroxilasa podr hacerlo en 2 disposiciones, pero no tendr mayor trascendencia) Ambas enzimas requerirn de unos elementos esenciales, que les ayudarn a aadir ese grupo OH, y sin los que no podrn realizar la hidroxilacin:
o -cetoglutarato (KG) o Fe2+ o O2 o *Vit. C* = propensa a la oxidacin

La Vit. C resulta FUNDAMENTAL para que la prolil o lisil hidroxilasa aada ese grupo OH a esa Pro Lys, es decir, ambas necesitarn la participacin esencial de la vitamina C (su estructura es inestable, por eso al zumo se le va la Vit. C, porque al estar en contacto con el aire se oxida y se va perdiendo progresivamente) para hidroxilar al aminocido. 22/10/2010
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*Curiosidad*: El Ciclo del cido ctrico o de los cidos tricarboxlicos recibe errneamente el nombre del Ciclo de Krebs, cuando en realidad el seor Hans Adolf Krebs dedic su trabajo al estudio del Ciclo de la Urea. Resumen: Estructura primaria COLGENO GLY-X-Y = Pro-giro
Estructura secundaria = cadena Estructura terciaria indefinida Estructura cuaternaria = tropocolgeno (triple hlice = asociacin de 3 cadenas ) - Residuos = grupos OH derivados de la prolil-lisil hidroxilasas
- Permiten la formacin de enlaces de H intercatenarios que estabilizan al tropocolgeno - A su vez estos permitirn la UNIN DE GLCIDOS al tropocolgeno
Los enlaces de hidrgeno intercatenarios (formados gracias a los grupos OH de los residuos de OHPro e OHLys) van a permitir la unin de glcidos.
UNIN DE GLCIDOS AL TROPOCOLGENO
As clasificamos al colgeno (todava no constituido completamente) dentro del grupo de las: OLIGOPROTENAS (varias cadenas polipptidicas o tropocolgenos)
HETEROPROTENAS (criterio II: segn su composicin proteica o grupo prosttico + parte proteica)
conjugadas = parte no
Las 3 cadenas (estructura secundaria) pueden ser = : - Pueden variar en su secuencia/orden de a - Pueden variar en el n de hidroxilaciones y su posicin - Pueden variar en la proporcin y en el tipo de glcidos que tengan asociados As surgen DISTINTOS TIPOS DE TROPOCOLGENO (estructura cuaternaria): - Los ms habituales se diferencian segn su secuencia u orden de los a: a) Cadenas 1 b) Cadenas 2 - Segn el n y posicin de las hidroxilaciones y la proporcin y el tipo de glcidos surgen SUBTIPOS de las cadenas 1 y 2:
1 (Tipo I), 1 (Tipo II), 1 (Tipo III) 1 (Tipo XI) 41
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2 (Tipo I), 2 (Tipo II), 2 (Tipo III) 2 (Tipo XI)
FORMACIN (propiamente dicha) del COLGENO

Existe un nivel estructural superior al tropocolgeno = FIBRAS DE COLGENO (ltimo nivel para llegar a la estructura definitiva). FIBRAS DE COLGENO = asociaciones de tropocolgeno, en concreto: - Apilamientos de distintas molculas de tropocolgeno en triples hlices - Posterior superposicin y apilamiento de las triples hlices de tropocolgeno en FIBRAS - Dando lugar a una estructura fibrilar que en su conjunto constituye el COLGENO Estabilizacin (como se encuentra en los TJs, y los TJs estn constituidos fundamentalmente de agua, se encontrar ya en un medio polar) - Enlaces de hidrgeno con los grupos OH libres - Interacciones hidrofbicas (por su tremenda apolaridad): el tropocolgeno se juntar para esconder las partes apolares, lo que le dar consistencia Al ser una protena mayoritariamente APOLAR, en un medio polar como el agua, sus molculas se juntarn para escapar (lo que contribuye a mantener su estructura estable), por lo que se producir su polimerizacin y formacin final del polmero o macromolcula. *Polimerizacin : proceso qumico por el que los reactivos, monmeros (compuestos de bajo peso molecular) se agrupan qumicamente entre s, dando lugar a una molcula de gran peso, llamada polmero, bien una cadena lineal o una macromolcula tridimensional. Pero, adems, para este nivel estructural superior necesitamos algo ms de estabilidad para que el tropocolgeno se junte an ms (para que se llegue a montar) que nos la conferirn: - Enlaces fuertes covalentes = enlaces ALDOL CRUZADOS Se forman a travs de enzimas: LISIL AMINO OXIDASAS
En ocasiones solo 1 de las 2 cadenas de tropocolgeno se convierte en AL-LISINA, la cual reaccionar con la Lys de la otra cadena de tropocolgeno, con la formacin de una BASE de SCHIFF = grupo funcional que contiene un enlace doble carbono-nitrgeno el cual constituye un enlace fisiolgico muy fuerte (CH=NH)
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BIOQ GENERAL
Si se reduce se formar un enlace de Norlisina (CHNH) no tiene ninguna trascendencia. Los enlaces covalentes de aldol cruzados aumentan con la edad por lo que la protena se vuelve rgida y por tanto ms frgil y quebradiza; Relacionado con la aparicin de arrugas y grietas en la piel OJO! Ms enlaces covalentes confieren mayor estabilidad o mayor fragilidad? El que haya ms significa que la protena se har ms rgida, y por tanto ms frgil y quebradiza.
El colgeno representa el 30% del peso total de la protena humana, siendo el responsable de la elasticidad, la firmeza, consistencia de la piel. El dficit de colgeno que aumenta progresivamente con la edad, origina entre otros fenmenos la formacin de arrugas en la piel.
Estructura del colgeno

- Podemos observar como la glicina (Gly) queda desplazada, formando un ENORME BORDE APOLAR. - Segn su localizacin y funcin, el colgeno se encuentra en mayor o menor proporcin (abundante si la zona precisa de resistencia mecnica, como en el msculo) y se dispone de forma cruzada y desordenada o en paralelo y ordenado.
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Piel = fibrillas de colgeno apiladas (cruzadas) Tendones = haces de colgeno en paralelo Crnea = fibrillas de colgeno desordenadas
BIOSNTESIS DEL COLGENO. 1. La estructura primaria se sintetiza en el RETCULO ENDOPLASMTICO RUGOSO (RER) en forma de PRE-PROCADENA (pptido precursor) - Contiene en su secuencia una secuencia seal que dirigir/orientar que la preprocadena llegue al interior del RER
2. Ya dentro del RER la pre-procadena pierde el pptido seal = PROCADENA
Los extremos -amino terminal (-NH3+, Nt) y -carboxilo terminal (-COOH, Ct) carecen de a apolares y de prolina (Pro), por lo que no girarn
3. La procadena pasa al APARATO DE GOLGI (AG)

- En el AG las procadenas se asocian =
PRO-TROPOCOLGENO - Se forma una TRIPLE HLICE en casi toda su extensin salvo en los extremos
Nt y Ct (porque carecen de Pro y por tanto no tendrn forma helicoidal)
El extremo Nt se estabiliza mediante enlaces disulfuro INTRACATENARIOS, que se forman mediante la unin a residuos de Cys de una de las cadenas El extremo Ct se estabiliza mediante enlaces disulfuro INTERCATENARIOS de otra cadena
La existencia de estos extremos a modo de pelillos y pobres en prolina (no helicoidales) impide la polimerizacin/apilamiento del pro-tropocolgeno dentro de la clula (lo que generara un aumento excesivo del volumen celular).
4. As el pro-tropocolgeno sale de la clula por EXOCITOSIS a la MATRIZ

EXTRACELULAR, donde PEPTIDASAS rompen los extremos Nt y Ct *PEPTIDASAS (antes conocidas como proteasas): enzimas que rompen los enlaces peptdicos de las protenas. Usan una molcula de agua para hacerlo y por lo tanto se clasifican como hidrolasas. 5. Ahora el pro-tropocolgeno ya se puede polimerizar/apilar formndose el
TROPOCOLGENO
25/10/2010
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BIOQ GENERAL
APLICACIONES TERAPUTICAS DEL COLGENO

lceras por presin Grandes quemaduras
- PARCHES: contienen clulas de colgeno y se aplican sobre la piel ulcerada del paciente, donde las clulas del parche continuarn reproducindose y estimulan a las del propio herido para formar tejido nuevo y sanar la lcera estimulan la regeneracin del TJ. Adems de colgeno contienen los elementos que resultan fundamentales para su formacin (minerales, Vit. C), que tambin ayudarn a que se absorba el calcio. - SBANAS DE COLGENO: cubren la quemadura del paciente formando una especie de pelcula que sirve de asentamiento para que el TJ pueda cicatrizar.
PATOLOGAS RELACIONADAS CON ALTERACIONES (metablicas o de biosntesis) DEL COLGENO OSTEOGNESIS IMPERFECTA = HUESOS DE CRISTAL
Gentica (autosmica recesiva); de padre a hijos, poco frecuente (1 caso x 50000 habitantes) - Causa: sustitucin de la glicina (Gly) en el triplete de la cadena primaria Gly-X-Y, por un a ms voluminoso - Consecuencia: la estructura secundaria (cadena ) ya no tiene las caractersticas que propician su formacin (las dimensiones adecuadas), ya que se encontraran con este impedimento (el a voluminoso); as al unirse las 3 cadenas no se podr formar bien el tropocolgeno y por tanto no se conseguir una estructura estable. No habr colgeno para rellenar la matriz sea (poco colgeno en los huesos), as que a medida que el individuo crece sus huesos se van arqueando, dando lugar a huesos huecos, y por tanto frgiles. Tpico en el colgeno Tipo I (el ms abundante en los huesos) - Riesgo: fracturas (frecuentes) - Tratamiento (conservativo): con BIFOSFONATO (frmaco) que reducir el riesgo de fracturas, aunque estas seguirn siendo muy frecuentes. Doble accin: 1. Inhibe la regeneracin del hueso, es decir, bloquea a los osteoblastos evitar la malformacin del hueso pero ste no crecer 2. Facilita la fijacin de Ca2+ se
SNDROME DE EHLERS-DANLOS (SED) o HIPERLAXITUD

Trastorno hereditario (factor de riesgo) caracterizado por articulaciones extremadamente sueltas o laxas, piel hiperelstica que presenta equimosis (moratones) con gran facilidad y vasos sanguneos que se daan fcilmente. Normalmente asintomtica. Hasta hace relativamente poco los afectados por este sndrome no acudan a diagnosticarse, simplemente haba una cierta curiosidad sobre el tema, por lo que no se buscaron tratamientos. Los mayores problemas surgan en operaciones (difcil parar el sangrado).
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- Causa: alteracin del colgeno (material que brinda estructura y fortaleza a la piel, huesos, vasos sanguneos y rganos internos) de muchos tipos (en las hidroxilaciones, glicosilaciones, en la formacin de los enlaces aldol cruzados) - Consecuencia: gran elasticidad de la piel, tendones lo que predispone a una cicatrizacin difcil (hematomas, lceras) - Riesgo: hemorragia interna - Tratamiento: no existe cura especfica. Con frecuencia se necesita fisioterapia o la evaluacin de un mdico especialista en rehabilitacin.
LATIRISMO = origen txico
- Causa: envenenamiento por el consumo de almortas (especie de fabcea leguminosa empleado habitualmente para hacer pan), que contienen un inhibidor de la LISIL OXIDASA. - Consecuencia: no se formarn los enlaces aldol cruzados que estabilizan a la estructura de colgeno, por lo que sta se ir degenerando y perdiendo consistencia, provocando la deformacin de los huesos (puede desembocar en huesos de cristal). - Tratamiento: dejar de/evitar comer este elemento (reversible, aunque el colgeno ya afectado no se recupera) Parece una cura simple, pero en pases como India o Sudamrica ha costado mucho desarraigar el consumo de la almorta, ya que es un producto de fcil obtencin, y en un pas donde al da mueren cientos de personas a causa del hambre, la futura deformacin de sus huesos es el menor de sus problemas. - Riesgo: fractura *Curiosidad*: Goya recogi en uno de sus cuadros, <<Gracia a la almorta>>, los efectos tan devastadores del consumo de esta leguminosa sobre la poblacin (personas tiradas en el suelo a causa de fracturas), durante la poca de la Independencia francesa en Espaa.
ELASTINA
- Importante en zonas que requieren una gran flexibilidad, una flexibilidad extra (adems de la del colgeno): garganta, grandes vasos circulatorios (aorta), pulmones (la elastina se encontrar en la matriz extracelular de estos Tjs) - Responsable del color amarillento tpico de la matriz extracelular en estos sitios. Similitudes con el colgeno Es sintetizada por las clulas del TJ conjuntivo o conectivo
Es excretada hacia la matriz extracelular (no acta dentro de la clula)
Diferencias con el colgeno No posee una secuencia repetida de aminocidos en su estructura primaria
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Muy rica en a apolares, en especial en valina (Val) 1 c/7 a Muy pobre en a hidroxilados (modificados o no comunes)
o Poca OHPro (apenas existente) o Carece por completo de OHLys y de glcidos unidos a su estructura (ya que al carecer de a hidroxilados no tendrn residuos de OH a los que unirse)
Carece de una estructura secundaria concreta
Estructura secundaria = forma de ovillo al azar (indefinida, amorfa, no llega a globular) Estructura cuaternaria = asociacin de los ovillos TROPOELASTINA o Los ovillos se entrelazan (estabilizan) mediante enlaces covalentes de tipo cruzado, que se forman entre 3 AL-Lys 1 Lys de distintos ovillos o cadenas peptdicas o 4 cadenas peptdicas distintas unidas o Cada una de estas cadenas cede 1 Al-Lys, y la ltima cadena (la 4) cede 1 Lys Enlace resultante = ENLACE CRUZADO DE DESMOSINA (colgeno = enlace aldol Schiff) cruzado Estructuras resultantes (tropoelastinas ~ ovillos) = amorfas, separadas entre s o ELASTINA unidas mediante los enlaces de desmosina B. CONTRCTILES - Se hallan formando parte del citoesqueleto y de las clulas motoras (msculo) - Confieren, adems de una gran resistencia a su estructura, capacidad de movimiento - Ambos se hallan formados por una gran variedad de protenas:
Citoesqueleto (delimitando la MB plasmtica)
3 estructuras mayoritarias: y
1. MICROFILAMENTOS (microvellosidades): confieren consistencia permiten movilidad. Estn formados principalmente por ACTINA.
2. FILAMENTOS INTERMEDIOS. Muchos tipos: desmosina, bimentina, protena cida de la gla
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BIOQ GENERAL
3. MICROTBULOS (cilios axonema y flagelos): tubulina.
las protenas musculares se Msculo hallan en el *CITOPLASMA* Las protenas se asocian entre s de una forma muy caracterstica, originando el SARCMERO, que se haya constituido por 2 tipos de filamentos: Gruesos = MIOSINA Delgados = ACTINA, TROPOMIOSINA, TROPONINA
El sarcmero no condiciona a las protenas, sino que son las protena las
que se organizan para que aparezca el sarcmero.
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BIOQ GENERAL
PATOLOGAS RELACIONADAS COLGENO (Continuacin) ESCORBUTO = enfermedad carencial
CON
ALTERACIONES
28/10/2010
DEL
- Causa: deficiencia de vitamina C (cido ascrbico) en la dieta (necesaria para la sntesis correcta de colgeno en los seres humanos), con lo cual no puede formarse la OHPro OHLys ya que la enzima prolil lisil hidroxilasa necesita esta vitamina como cofactor. - Consecuencia: colgeno menos estable de lo normal, lo que explica muchas de las manifestaciones clnicas de esta enfermedad. - Sntomas: debilidad general, anemia, hemorragias de piel. enfermedad de las encas (gingivitis) y
- Prevencin: con una dieta que incluya ciertos ctricos como naranjas o limones. - Tratamiento: dieta equilibrada, por lo que es completamente reversible. - Historia: fue comn en pocas pasadas entre marineros que pasaban mucho tiempo en barcos donde las frutas y verduras perecederas no podan ser almacenadas durante
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BIOQ GENERAL
mucho tiempo. - Poblacin de riesgo: personas mayores con deficiencias nutricionales. En Resumen: o Enfermedad carencial de Vit. C en la dieta, necesaria para la sntesis del colgeno, ya que resulta fundamental para que la prolil o lisil hidroxilasa aada ese grupo OH a esa Pro Lys. o Resultado = colgeno inestable nasales) hemorragias (membranas mucosas, encas,
o Afecta al colgeno de los vasos sanguneos o Verdadero problema = hemorragias internas o Se puede revertir con una dieta equilibrada (ctricos) o Afect a marineros y actualmente a personas malnutridas *Aclaracin latirismo: se puede evitar, pero el colgeno ya afectado es irrecuperable. B. CONTRCTILES (Continuacin): MIOSINA & ACTINA (protenas mayoritarias del citoesqueleto y del sarcmero) - Localizacin:
Citoesqueleto
microfilamentos + filamentos intermedios + microtbulos sarcmero
Clulas motoras (Ms. esqueltico)
Su disposicin da a las clulas su aspecto caracterstico - Funcin: conferir una gran resistencia a la estructura del citoesqueleto y de las clulas motoras, y capacidad de movimiento - Normalmente adquieren una estructura filamentosa
MIOSINA = FILAMENTOS GRUESOS del sarcmero

- Protena motora de las ms abundantes - Constituye el 60-70 % de las protenas de las clulas del msculo - 6 cadenas peptdicas organizadas en
2 pares de cadenas peptdicas LIGERAS = 4 cadenas LIGERAS

o LC1 o LC2 Iguales 2 a 2, es decir, LC1 = LC1 pero LC2; LC2 = LC2 LC1 o Peso = 20 Kda o Estructura terciaria GLOBULAR
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BIOQ GENERAL
2 cadenas PESADAS Estructura MIXTA:

Esta estructura mixta no es muy comn. Muy tpica de la MIOSINA a) 1 parte adopta una estructura terciaria GLOBULAR Se concentra en el extremo Nt (amino-terminal) b) El resto adopta una estructura terciaria FIBROSA Se concentra en el resto de la protena, en direccin al extremo Ct (carboxiloterminal) o Esta parte fibrosa adopta una estructura secundaria en -hlice DEXTRGIRA (con giro a derechas) o 1er y 4 a = APOLARES INTERACCIONES HIDROFBICAS (aversin por el agua) o El carcter apolar de esta estructura fibrosa obliga a que las 2 cadenas pesadas se asocien entre s formando una hlice LEVGIRA (con giro a izquierdas) *frente a la -hlice DEXTRGIRA (con giro a derechas) ~ COLGENO Casi todas las protenas fibrosas adoptan una estructura de este tipo (en forma de cuerda de 3 cabos). Estructura resultante: MIOSINA FINAL - 2 cadenas pesadas interaccionan entre s por su parte filamentosa - E interaccionan con las cadenas ligeras por su parte globular CADENAS LIGERAS (4) Poseen capacidad de: Unir Ca
Unir e hidrolizar ATP
Lo que permite que los filamentos de miosina participen en la CONTRACCIN/MOVILIDAD Para la hidrlisis del ATP se necesita la INTEGRIDAD de la parte globular, es decir, mantener esa estructura. CADENAS PESADAS (2) No poseen capacidad ATPasa (no hidrolizan ATP)
Permiten el apilamiento (a modo de palillos o puzle) de molculas de miosina que dan lugar a los FILAMENTOS DE MIOSINA
Se necesitan mutuamente (cadenas ligeras y pesadas)

Cmo se apilan? Por su parte FILAMENTOSA (no globular), es decir, mediante el aprovechamiento del carcter hidrofbico de la parte filamentosa de la cadena pesada Cmo se estabilizan? Simplemente mediante las INTERACCIONES HIDROFBICAS de las cadenas pesadas; no por los enlaces que pueda formar la parte globular con sustancias polares del entorno.
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BIOQ GENERAL
En Resumen: MIOSINA (egosta: 60-70% de las protenas de las clulas nicamente del msculo) = FILAMENTOS GRUESOS DEL SARCMERO
6 cadenas peptdicas - 4 ligeras (2 LC1 2 LC2) = GLOBULAR (Nt)
unen Ca e hidrolizan ATP
Forman una cabeza apolar = sitio de unin para la actina permiten apilamiento y dan interacciones hidrofbicas 1er y
- 2 pesadas = MIXTA: globular + fibrosa ( Ct) lugar a los FILAMENTOS DE MIOSINA
Estabilizacin: parte fibrosa = -hlice dextrgira 4 a apolares = hlice levgira
ACTINA = filamento DELGADO del sarcmero

- Constituye el 20-30% de las protenas de las clulas musculares - Adems, constituye un 5-10% del total de las protenas de todas las clulas (todas las clulas tienen actina porque todas las clulas tienen citoesqueleto)
A bajas [inicas] se encuentra como MONMEROS de ACTINA-G (1 sola cadena peptdica) propiedad de unir Ca y ATP *Como las cadenas ligeras de la miosina
estructuras filamentosas = ACTINA-F: A altas [inicas] la actina-G se polimeriza consiste en filamentos de actina que, empaquetadas por pares, dan lugar a una doble hlice DEXTRGIRA (con giro a derechas) Fisiolgicamente siempre se encuentra formando una doble hlice con otra Actina-F
ACTINA-G
- Globular - Pequea: 1 sola cadena polipeptdica de 375 a - Asimtrica Esta asimetra es la *causante* de que, al polimerizar la AG AF, se advierta una POLARIDAD DE FORMA = 2 POLOS distintos, es decir, distinguimos 1 extremo del otro extremo
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BIOQ GENERAL
- Se caracterizan porque 1 extremo de los filamentos se polimeriza y se rompe a ms velocidad que el otro extremo: Extremo ms rpido = Extremo + Extremo ms lento = Extremo FUNDAMENTAL EN LOS PROCESOS DE CONTRACCIN/MOVILIDAD DE LOS FILAMENTOS *NO POLARIDAD QUMICA CON EL AGUA*
Cuando la AG se polimeriza
AF el ATP se rompe: ATP
ADP + P
- La energa liberada no impulsa la polimerizacin de la actina - La que impulsa la polimerizacin de la actina es el Ca = seal que le indica a la clula muscular que tiene que moverse (activacin de las rutas metablicas energa)
Ca = activa procesos de contraccin ATP = contribuye un poco
La actina se encuentra formando: = fibras FILAMENTOS DELGADOS del sarcmero uno de los 3 componentes del citoesqueleto
= microfilamentos
FILAMENTOS DELGADOS DEL SARCMERO

ACTINA: G y F
TROPONINA TROPOMIOSINA
Permiten la INTERACCIN ACTINA-MIOSINA
TROPOMIOSINA
Estructura: FILAMENTOSA Localizacin: surco de la doble hlice de AF Funcin: - A bajas [Ca] bloquea el sitio de unin con la miosina Los filamentos GRUESOS de MIOSINA poseen una cabeza apolar (2 cabezas globulares formadas por el enrollamiento de las cadenas ligeras) que acta a modo de
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BIOQ GENERAL
anclaje para que los filamentos de actina se puedan deslizar e interacten ~ unin fsica.
- A altas [Ca] se separa de los sitios de unin actina-miosina con ayuda de la TROPONINA-T TROPONINA = complejo de 3 protenas GLOBULARES
T I C
interacciona con la tropomiosina subunidad inhibidora une Ca
*Rigor mortis (el ATP no se puede consumir y el Ca no se puede utilizar): la troponina cambia de lugar movida
por los iones de Ca , y mueve a su vez a la tropomiosina; as quedan libres los sitios de unin para la actina, unindose la miosina. Cuando se acaba el ATP (al no haber ms glucgeno) la miosina queda fijada, sin poder soltarse.
++
En Resumen: ACTINA (altruista: 20-30% de las protenas de las clulas del msculo & 5-10% del total de las protenas de todas las clulas) = FILAMENTO DELGADO DEL SARCMERO/ Microfilamentos del citoesqueleto
- A bajas [iones] = ACTINA-G: asimtrica
confiere POLARIDAD DE FORMA
- A altas [iones] = ACTINA-F: 1 polo + (polimeriza ms rpido) y un polo fundamental en la CONTRACCIN
Por qu se distinguen 2 polos en la AF? Porque la AG es asimtrica.
Ca = activador de la contraccin (polimerizador de la AG)
FILAMENTOS DELGADOS DEL SARCMERO
TROPOMIOSINA (surco AF): a bajas [Ca] bloquea sitio de unin con la miosina y altas [Ca] se separa con ayuda de la troponina-T TROPONINA T-I-C = une Ca
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BIOQ GENERAL
29/10/2010 2) GLOBULARES Las protenas globulares se encuentran en el medio circulatorio y en el citoplasma, por tanto son altamente solubles y ricas en a polares. Suelen tener una funcin dinmica, como por ejemplo enzimas de transporte. Vamos a tratar 2 ejemplos: inmunoglobulinas & hemoglobina. A. DEFENSA INMUNOGLOBULINAS
Son glicoprotenas (poseen glcidos unidos en su regin FC por ser la ms conservada) Conjunto de protenas con funcin defensiva. Son sintetizadas por linfocitos de tipo B. Estn formadas por 2 pares de cadenas peptdicas (4):
- 2 llamadas cadenas L LIGERAS Las dos cadenas ligeras son iguales, y existen 2 tipos diferentes (las 2 cadenas L son de un tipo o de otro) 1. Tipo 2. Tipo
- 2 llamadas cadenas H PESADAS En las cadenas pesadas existen X tipos, los cuales marcan el ISOTIPO de la inmunoglobulina, y por tanto su funcin caracterstica. 1. Cadenas , que dan lugar a las IgM 2. Cadenas , que dan lugar a las IgG 3. Cadenas , que dan lugar a las IgA 4. Cadenas , que dan lugar a la IgE 5. Cadenas , que dan lugar a las IgD
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BIOQ GENERAL
*ISOTIPO: uno de los 5 tipos de anticuerpos, determinado por una de las 5 formas distintas de cadena pesada que los constituyen.
Los isotipos de anticuerpos son IgM, IgG, IgD, IgA y IgE y cada uno de ellos ejecuta un grupo diferente de funciones efectoras. Subtipos distintos de IgG e IgA se caracterizan por variaciones estructurales adicionales.
DOMINIOS
En todas las cadenas, tanto ligeras como pesadas, podemos distinguir (en estructura terciaria) la existencia de dominios (variables y constantes), concretamente:
Cadenas ligeras = 2 dominios Cadenas pesadas = 4 dominios Las cadenas ligeras y pesadas interaccionan entre s para dar la estructura de la inmunoglobulina (Ig): Cadenas ligeras (L) = interaccin completa puesto que el tamao de estas es aproximadamente entre 1/2 y 2/3 del tamao de las cadenas pesadas (H); por ello hay una zona de las cadenas H que no interacciona con las ligeras, en la cual las 2 cadenas H interaccionan entre s Estabilizacin (estructura cuaternaria): Por las interacciones entre cadenas L y H Por interacciones dbiles que aparecen entre las 2 cadenas pesadas (H) Por enlaces disulfuro entre las 4 cadenas polipeptdicas 2 regiones o fragmentos separados en la zona bisagra: REGIN FAB: fragmento en el cual se encuentran las cadenas L junto con las H
Se encarga de reconocer al antgeno Zona de reconocimiento del antgeno = la ms amino-terminal de la regin FAB Son unos pocos aminocidos (14-20) los cuales se encargan de reconocer el antgeno A esta zona implicada en el reconocimiento del antgeno se la denomina ZONA VARIABLE El resto de la Ig se denomina ZONA CONSTANTE (*a pesar de no ser cte.)
REGIN FC: fragmento encuentran las cadenas H
donde
nicamente
se
Se encarga de unir glcidos (porque es la zona ms conservada), que participan tambin en la reaccin de especificidad y contribuyen al isotipo
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BIOQ GENERAL
La separacin entre ambas zonas = ZONA DE BISAGRA: altamente reforzada con enlaces disulfuro.
Resto de dominios de las Ig: 2 Dominios variables de la cadena H 2 Dominios variables de la cadena L 2 Dominios constantes de la cadena L Funciones de las Ig de las cadenas pesadas (H): IgM: primeras Ig que se sintetizan en una infeccin. Su sntesis da tiempo a la sntesis de las IgG. Muy corta vida (permanecen en sangre entre 2-5 das). IgG: mayoritarias en el suero. Tienen un reconocimiento altamente especfico del antgeno debido a la mutabilidad de su zona variable. Son ms resistentes que las IgM, ya que duran hasta 1 mes en la circulacin. Son capaces de atravesar la placenta, proporcionando inmunidad al feto. IgA: se encuentran en mltiples fluidos corporales y se encargan de conferir inmunidad al neonato. Muy corta vida. IgE: se encargan de dar hipersensibilidad. Muy corta vida (10 das aproximadamente). IgD: no se conoce concretamente su funcin ya que participa en todas las anteriores, salvo en las de atravesar la placenta y dar inmunidad al neonato. 2 Dominios constantes de la cadena H
4/11/2010 B. UNIN AL O2 = MIOGLOBINA & HEMOGLOBINA Se caracterizan por tener la propiedad de unir O2 y cederlo despus. Estructura bsica de las protenas de unin al O2: protena globular conjugada = parte proteica (bolsillo hidrofbico) & parte no proteica (grupo Hemo) a) PARTE PROTEICA
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BIOQ GENERAL
- Se caracteriza porque el 75 % de sus a adoptan una estructura secundaria en hlice, lo cual es altamente anormal, y le proporciona a la protena su funcin de unin al O2.
Se distinguen 8 SEGMENTOS, que se unen con el resto de la cadena por las zonas que no adoptan ninguna estructura, es decir, que carecen de una estructura concreta.
Podemos observar una secuencia fundamental para la estructura de estas protenas, donde se une el grupo hemo o parte no proteica: - BOLSILLO HIDROFBICO. Alta densidad de a apolares = ambiente hidrofbico *Muy importante porque sin l no se podra unir el O2, ya que el BH es el que incorpora el grupo hemo* Funciones del BH: 1. Permite ENCAJAR el GRUPO HEMO 2. Impide que el Fe2+ (ferroso) se oxide a Fe3+ (frrico): Fe2+
Fe3+
Si esto sucede aparecer una forma patolgica de globina = METGLOBINA une el O2 de forma irreversible (ya no podr soltarlo), es decir, queda unido sin poder desprenderse = provocara la imposibilidad de la protena de ceder O2
Comentado en clase: existe una cierta controversia en este punto. En la revista NEJM se presenta el caso clnico de un nio que haba adquirido metglobina por una intoxicacin debida a un metal presente en las caeras de su casa. Se plantea su tratamiento. 3. Impide que el O2 pueda oxidar a los a de la protena, es decir, impide la oxidacin de otros elementos. 4. Dificulta la entrada de otros gases, como CO o derivados del N. Explicacin - El O2 tiene que entrar con una orientacin concreta: en una disposicin oblicua, la cual no constituye un problema para el O2 pues es su disposicin estable. - Sin embargo, el CO (que posee mucha afinidad por el Fe), al ser obligado a entrar en una disposicin oblicua no lo har en su forma ms estable, con lo que disminuye mucho su probabilidad de unin al Fe. Esta es la razn de que la intoxicacin con CO solo sea posible a altas concentraciones, ya que l % que logra entrar y unirse al Fe es pequeo. Si el CO acabara entrando y unindose al Fe, lo hara de forma IRREVERSIBLE.
b) PARTE NO PROTEICA
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BIOQ GENERAL
- Se caracteriza porque aporta el GRUPO HEMO, formado por:
Un ANILLO de TETRAPIRRLICO
TETRAPORFIRINA
disposicin
en
ANILLO
o Tiene unidos 4 METILOS, 4 ETILOS y 2 PROPIONILOS
Un ion de Fe2+ = que se tiene que encontrar como in FERROSO, es decir, en su estado REDUCIDO (*si se oxida metglobina)
UNIN DE LA PARTE PROTEICA (BH) --- PARTE NO PROTEICA (grupo HEMO) A travs de un ENLACE COVALENTE que se establece entre:
1 HISTIDINA (HIS) del BH = parte proteica El in Fe2+ del grupo hemo = parte no proteica
*Recordatorio: la His es el nico a que se encuentra cargado a pH fisiolgico, es decir, el nico que puede actuar como tampn en la sangre y en el medio intracelular; el ion Fe se caracteriza por ser un in muy voluminoso con capacidad de establecer hasta 6 enlaces.
HISTIDINA 1 Resulta muy importante, por lo que se encuentra completamente localizada en la -hlice: o Segmento F8 o Posicin 93 de la cadena peptdica *Cada -hlice se denomina con una letra. UNIN DEL O2 --- PROTENA = enlace ESTABLE NO COVALENTE Al Fe le queda un ENLACE LIBRE, despus de haberse unido a la protena = ENLACE QUE
PERMITE LA UNIN DEL O2
- Este enlace queda orientado muy cerca (aunque lo suficientemente lejos) y en perpendicular de otra His, lo que provoca que el elemento que quiera unirse al Fe lo deba hacer en una disposicin oblicua.
HISTIDINA 2 o Segmento E7 Objetivo: 1. Facilitar la entrada del O2 hasta el tomo de Fe, ya que obliga al O2 a adoptar una disposicin oblicua, que es su orientacin estable.
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o Posicin 64
BIOQ GENERAL
2. A su vez y por el mismo motivo, dificultar la entrada de otros gases (como el CO), ya que la disposicin oblicua no es su forma estable; con ello se evita que se cuele CO y se una al enlace. Conclusin: el bolsillo hidrofbico resulta POLAR, ya que posee 2 A POLARES BSICOS, es decir, cargados positivamente (NH+):
His F8, 93 = une la parte proteica (BH) al grupo hemo, unindose al Fe de ste His E7, 64 = se sita cerca del enlace libre de unin al Fe que se forma, una vez
unido el grupo hemo a la parte proteica, con lo que obliga a que el elemento que quiera unirse al Fe lo haga en una disposicin oblicua = la estable del O2 pero no del CO y de otros gases
MIOGLOBINA (Mb)
- Funcin:
Almacn de O2 en los TJs Facilitar la difusin del O2 desde los capilares hasta el interior de las clulas (mitocondrias)
- Abunda en el interior de las clulas musculares (de ah el prefijo mio), constituyendo su RESERVA de O2 - 1 sola cadena peptdica = 1 solo grupo hemo = solo capta 1 molcula de O2 - 153 a conforman la globina, cuya estructura bsica sigue el esquema bsico que siguen todas las protenas de unin al O2: o 75% a en -hlice o 8 segmentos o bolsillo hidrofbicogrupo hemo
- Posee una *alta afinidad por el O2* Esta afinidad se debe a que debe de capturar el O2 desde los capilares hasta la clula, ya que ste no es depositado en el interior de la clula, sino que es dejado a la puerta. Explicacin: Los pulmones filtran el O2 y una protena lo transporta, pero no hasta el interior de las clulas, sino que lo suelta en la ntima arterial (capilares) debajo de las clulas, donde estar la MIOGLOBINA - y all el O2 (al ser un gas) difunde un escaso espacio y se introduce en el interior de las clulas del TJ (mitocondrias), donde es captado ya por la Mb. - NO SALE DE LA CLULA
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BIOQ GENERAL
CONSTANTE DE EQUILIBRIO La unin del O2 a la Mb se puede describir como un equilibrio simple donde:
Mb + O2 MbO2
Como todo equilibrio qumico podemos calcular una constante de equilibro (tambin llamada constante de asociacin o afinidad), que vendr dada por la expresin:
FRACCIN DE SATURACIN (
depende de la PRESIN PARCIAL DE O2 (PO2)
Dado que la Mb posee un nico sitio de unin al O2, el n de sitios totales es proporcional a la suma de [MbO2] + [Mb], y por tanto: concentracin de Mb que se encuentra unida al O2 con respecto al total de Mb que tienen en total las clulas
Como el oxgeno es un gas resulta ms fcil medir la presin parcial del mismo que su concentracin, por lo que la expresin anterior se puede expresar como: relacin de la presin parcial de O2 con respecto a la PO2 a la cual la mitad de los sitios de unin de la Mb estn ocupados con O2 o lo que viene a ser lo mismo: PO2 a la cual la mitad de las molculas de Mb estn unidas a O2 = 50% de Mb unido al O2
donde P50 es la presin parcial de O2 a la cual la mitad de los sitios de unin de la mioglobina estn ocupados, es decir, a la cual la Mb presenta un 50% de saturacin.
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BIOQ GENERAL
NO ES APLICABLE AL CUERPO ya que la Mb tiene O2 o no lo tiene, ya que al haber 1 solo grupo hemo solo podr captar 1 molcula de O2 y nunca podr tener de O2, es decir, 0 1 molculas de O2, no 0.5.
En realidad estas ecuaciones no dejan de ser simples expresiones matemticas. Esta ltima sera la que ms se acerca a la realidad.
CINTICA DE UNIN AL O2 DE LA Mb = HIPERBLICA A un pH neutro la oxigenacin de la mioglobina sigue una curva hiperblica. A la PO2 en las clulas (20-40 mmHg) casi toda la Mb se encuentra unida al O2 = 90% La Mb ya no suelta ese O2, solo cuando la PO2 en la clula sea casi inexistente:
PO2 ~ 4 mmHg
Comportamiento de la Mb Nos interesa realmente? S, ya que una parte del O2 se emplea para la obtencin de energa en la mitocondria. Funcionalidad? Sirve como reserva de O2 (Ej.: liberacin en hipoxia- submarinistas) Mecanismo Cuando el O2 es depositado en los capilares difunde hacia el interior de la clula, atrado por la Mb (afinidad). - De ese O2 que entra en la clula, un % ir destinado al proceso de obtencin de energa en la mitocondria (fosforilacin oxidativa) - Y otro % se almacenar en la Mb a modo de reserva, y se emplear cuando no le est llegando O2 a las clulas. Conclusin Mb = ALMACENADORA DE O2
La Mb acta como un almacn de O2 en el msculo, es decir, solo suelta el O2 cuando la PO2 en las clulas sea aproximadamente de 4 mmHg o inferior.
Comentado en clase: en el 2000 se han descubierto 2 protenas similares a la Mb: la NEUROGLOBINA y la CITOGLOBINA.
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BIOQ GENERAL
Caractersticas: Poseen un 20% de homologa con la Mb, es decir 20% de a iguales o parecidos (BH-O2) Doble misin: 1. Actuar como la Mb (como almacn de O2), pero adems de en el msculo, en otros TJs dependientes de O2: retina, hipfisis y cpsulas suprarrenales. 2. Adems, actuar como agentes detoxificantes de O2, es decir, impedir el efecto nocivo del O2 radicales libres, que son los causantes de la diabetes, el cncer, el Alzheimer, ateromas creacin de
5/11/2010
HEMOGLOBINA (Hb) = protena oligomrica con 4 cadenas peptdicas:

2 cadenas de tipo 2 cadenas de tipo con la Mb c/una de ellas posee 141 a ~ gran homologa con la Mb algo ms larga, c/una de ellas posee 146 a ~ tb presenta analoga
Estructura: al igual que la Mb adopta la estructura bsica propia de las protenas globulares, con un BH que encaja el grupo hemo Interacciones: 1. Las 2 cadenas y las 2 cadenas interaccionan entre ellas mediante interacciones dbiles (enlaces de hidrgeno), inicas e hidrofbicas. 1 --- 2 1 --- 2
2. Los 2 protmeros y entre s, siendo estas interacciones entre las distintas cadenas ms numerosas que las que hay entre las subunidades y .
1 --- 1
Conclusin: - >> numerosas Dmero de heterodmeros
2 --- 2
Esto lleva a decir que la Hb es un DMERO de HETERODMEROS: 2[], porque los protmeros = tienen muchos ms enlaces dbiles entre ellos (en comparacin con las subunidades = =), de forma que si uno se mueve, el otro tambin se mover. Distintos tipos de Hb
1. Hb A: la que encontramos en la sangre normalmente = 2 y 2 2. Hb A2: posee tambin 4 cadenas peptdicas = 2 cadenas y 2 cadenas (delta)
- Su % en sangre es bajo = 2-5 %
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BIOQ GENERAL
- Se encuentra elevado en pacientes con TALASEMIA : no pueden sintetizar las cadenas , as que sintetizan las cadenas , pero en realidad tienen las mismas propiedades a nivel de transporte de O2 (asintomtico), es decir, pueden transportar el O2 perfectamente (aunque hay otras consecuencias, como la anemia)
*TALASEMIA: trastorno sanguneo que se transmite de padres a hijos (hereditario) en el cual el cuerpo produce una forma anormal de Hb (% elevado de Hb A2). Este trastorno ocasiona destruccin excesiva de los glbulos rojos, lo cual lleva a que se presente anemia. Existen dos tipos principales de talasemia: La talasemia alfa ocurre cuando un gen o los genes relacionados con la protena globina alfa faltan o han cambiado (mutado). Poblacin de riesgo: personas del sudeste asitico, Medio Oriente, China y en aquellas de ascendencia africana.
La talasemia beta ocurre cuando defectos genticos similares afectan la produccin de la protena globina beta. Poblacin de riesgo: personas de origen mediterrneo, y en menor grado, los chinos, otros asiticos y afroamericanos.
Hay muchas formas de talasemia y cada tipo tiene muchos subtipos diferentes. Tanto la talasemia alfa como la beta abarcan las siguientes dos formas: Talasemia mayor Talasemia menor
3. Hb F FETAL = 2 cadenas y 2 cadenas (gamma)

- Constituye en el feto el 100% de la Hb - A medida que se acerca el parto, el gen que sintetiza las cadenas deja de estar activado y se estimula el gen que sintetiza las cadenas . - En el adulto la Hb F constituye un 1-2% de la Hb en sangre. - En la DREPANOCITOSIS (o anemia falciforme), el % de Hb F se eleva hasta el 20% de la Hbtotal en sangre. En este caso es debido a un mecanismo de adaptacin que est relacionado con la malaria.
LA Hb POSEE 4 GRUPOS HEMO
4 MOLCULAS DE O2
Debido a esta estructura con 4 protmeros (oligomrica) = 4 grupos hemo, la Hb puede llegar a captar hasta 4 molculas de O2. OJO! Podr tener 1, 2, 3 4 molculas de O2 unidas, es decir, tiene la posibilidad de unir hasta 4O2, pero no siempre llevar las 4. 64
BIOQ GENERAL
Llevar unidas 4 molculas de O2 cuando salga de los pulmones, pero a medida que fluye hacia los TJs las ir perdiendo. Misin: TRANSPORTE DE O2 DESDE LOS PULMONES HASTA LOS *TJS*
OJO! NO ENTRA EN LA CLULA, sino que descarga el O2 en el lmite de los capilares (ntima arterial), y ste difunde hasta el interior de la clula atrado por la Mb. CONSTANTE DE EQUILIBRIO ~ anloga a la Mb Para estudiar la unin del O2 a la Hb Hill consider el siguiente equilibrio:
Hb + n O2 Hb(O2)n
Este equilibrio qumico corresponde a una cooperatividad mxima, es decir, se considera que la Hb slo est en 2 estados, completamente desoxigenada o completamente oxigenada.
Siendo n el coeficiente de Hill: afinidad que la Hb tiene por el O2 (no se emplea mucho). n(Hb) = 2,7 ~ la Hb transporta de media 3 molculas de O2. FRACCIN DE SATURACIN ()
CINTICA DE UNIN AL O2 DE LA Hb muy distinta a la de la Mb = SIGMOIDE Permite la CAPTACIN & CESIN de O2 Permite la saturacin casi completa de la protena transportadora a PO2 como las existentes en los pulmones (100%), y una liberacin importante del O2 transportado cuando la PO2 es equivalente a la de los tejidos. Este comportamiento se consigue con diferencias en la afinidad por el O2 de los distintos sitios de unin de la protena en funcin de la unin anterior a otros lugares. La unin de una molcula de O2 a un 1er sitio en la Hb produce cambios conformacionales que facilitan la unin de las siguientes molculas de O2. 65
BIOQ GENERAL
En los pulmones la Hb se encuentra cargada con 4 molculas de O2 (todos sus sitios de unin ocupados). A medida que se aleja de los pulmones las va perdiendo y descargando en los distintos Tjs. Por qu se va descargando? Porque de retorno a los pulmones tiene que llevarse el CO2, que es incompatible con el O2.
Explicacin del COMPORTAMIENTO SIGMOIDE = 2 MECANISMOS 1. Mecanismo HOMOTRPICO ~ DE COOPERATIVIDAD: nos explica la unin del O2 a la Hb, de tipo cooperativo 2. Mecanismo HETEROTRPICO: nos explica la liberacin del O2 que se realiza por medio de seales moleculares (2,3 BFG)
1. MECANISMO HOMOTRPICO O COOPERATIVO Cuando se une 1 molcula de O2 a cualquiera de los protmeros, este O2 tiene que romper muchas interacciones dbiles existentes en el bolsillo hidrofbico (estructura terciaria = interacciones dbiles). Conclusin: la entrada de O2 al BH es difcil - Cuando ya ha entrado y el O2 se une al Fe2+, el O2 desplaza al Fe, y ste se sita en el plano del anillo tetrapirrlico del grupo hemo. - Como no cabe se situar por encima del plano. - Es decir, al unirse el O2 al Fe, tira de ste de forma que se encaja en este plano del anillo tetrapirrlico. - Entonces el Fe arrastra/desplaza la protena a la que est unido. Consecuencia: CAMBIA LA ESTRUCTURA DEL PROTMERO Conclusin final: la unin es DIFCIL, CUESTA, pero es un COSTE MECNICO, por adaptacin de cargas, es decir, NO CONSUME ENERGA.
El cambio de estructura de 1 protmero afecta a las interacciones que este protmero establece con los protmeros adyacentes. - Por qu? Porque los protmeros y se encuentran unidos por un gran n de interacciones dbiles, as que el cambio en uno de los protmeros afectar al siguiente. 66
BIOQ GENERAL
- Para recuperar su estructura nativa (de mxima estabilidad) la Hb tendr que volver a reorganizarse, para volver a ser estable. - El cambio en 1 protmero rompe las interacciones dbiles del 2 protmero (algunas afectan al BH). Consecuencia: LA UNIN DE LA 2 MOLCULA DE O2 SER MS FCIL porque ya se ha modificado la estructura, es decir, ya se han roto los enlaces dbiles. Adems su unin al Fe supondr los mismos cambios estructurales.
COOPERATIVIDAD
Segn el grado de dificultad de unin del O2 a la Hb (de > a < grado de dificultad): 1er O2 > 2 O2 > 3er O2 > 4 O2 Conclusin final: la unin del 1er O2 es la ms difcil ya que es la que rompe la multitud de enlaces dbiles intactos; por eso llamamos a la unin cooperativa, porque prepara el terreno al resto de molculas de O2, cuya unin va siendo cada vez ms fcil. HEMOGLOBINA RELAJADA o TENSA Como consecuencia de que la Hb pueda encontrarse en 2 estados (con sin O2) aparecen 2 formas: RELAJADA (HbR): con O2 - oxigenada = oxi-Hb tanto menos estable TENSA (HbT): sin l - desoxigenada = desoxi-Hb ms estable menos interacciones dbiles por ms interacciones dbiles por tanto
INTERACCIONES QUE SE ROMPEN. Entre muchas de las interacciones que se rompen entre los 4 protmeros podemos destacar: 1. Enlaces dbiles entre el grupo carboxilo (COO-) y el grupo amino (NH3+) de los extremos de cada cadena. 2. Enlace entre el a histidina (His - NH+) y el a aspartato (Asp - COO-) de cada una de las cadenas 3. Enlace entre el a lisina (Lys NH3+) de una cadena y el grupo carboxilo (COO-) de una cadena 4. Enlace entre el a arginina (Arg NH2+) y el a aspartato (Asp COO-) de cada una de las cadenas
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BIOQ GENERAL
2. MECANISMO HETEROTRPICO de LIBERACIN del O2 La Hb libera el O2 a travs de interacciones heterotrpicas, es decir, en base a la unin a determinadas molculas o elementos seal (que se unen a la Hb). Por tanto, la Hb necesita una seal para saber que no hay O2 en la clula o en el TJ. Estas molculas o elementos seal son: a) PROTONES b) CO2 c) 2,3 BISFOSFOGLICERATO (2,3 BFG) molcula orgnica resultante del metabolismo de la glucosa Funcin: Avisan a la Hb de que no hay O2 en la clula REDUCEN LA AFINIDAD QUE LA Hb SIENTE POR EL O2 8/11/2010
a) EFECTO DE LOS PROTONES. La Hb es muy sensible a los cambios de pH.

Un aumento de los H+ en el medio, supondra una gran protonacin de los a de la Hb, en especial de sus a bsicos (lisina, arginina e histidina), ya que el pI de la Hb se sita en torno al 8.3, lo que significa que posee alta densidad de a bsicos; en conclusin, este incremento de los H+ afectar mucho a la Hb. Al aumentar la protonacin de esos grupos amino (de las R de los a bsicos), va aumentar el n de cargas+ presentes en la protena, y por tanto tambin aumentar el n de enlaces inicos que aparezcan en la protena. A su pH normal, los a de la Hb no estn ionizados (-NH2), pero si el pH desciende hacia cido (aumenta el n de H+) los grupos bsicos antes no protonados pasarn a estarlo: NH2 NH3+
Adems, al aumentar el n de enlaces inicos, la Hb va a ser desplazada hacia su forma TENSA, es decir, se va a estabilizar, ya que cuantos ms enlaces ms estable (forma tensa). Consecuencia: PRDIDA DE AFINIDAD POR EL O2 el O2 se libera de la Hb, o dicho de otro modo, la Hb cede el O2 a los tejidos, que ahora lo estn necesitando. Tiene sentido fisiolgico? S. Todas las clulas activas, metablicamente hablando, y que estn en movimiento, aumentan la liberacin de H+. Es decir, una clula activa: 68
Genera H
BIOQ GENERAL
Necesita O2 Este aumento de H+ lleva implcito una demanda de O2
Los H+ le dirn a la Hb que tiene que soltar O2, NO QUE NO TIENEN. Conclusin: el aumento de protones (H+) o el desplazamiento del pH hacia cido (< 8.3) - Estabiliza la forma TENSA y estable de la Hb - Reduce la afinidad de la Hb por el O2 Todo ello desde un punto de vista fisiolgico: el aumento de H+ es una seal de las clulas y tejidos que se estn moviendo (msculo) y que estn respirando metablicamente, para que la Hb les mande O2. Comentando en clase: las agujetas, bioqumicamente hablando, no son producidas por la cristalizacin de lactato (c. lctico) entre las fibras musculares. El lactato, para que no se acumule en la clula muscular, sale a la sangre. Si se sita cerca de H+, la probabilidad de cristalizar es grande (ya que la cristalizacin se produce a bajo pH), pero sta sera una situacin ideal, pues la sangre no est quieta, fluye por los vasos sanguneos, de manera que estos H+ son desplazados y desaparecen. La probabilidad de cristalizacin ser muy pequea. Concluyendo, es imposible que se produzca cristalizacin de lactato en el cuerpo humano, porque este proceso solo es posible a pH bajo (no fisiolgico) y a T tampoco fisiolgica. Entre muchas de las teoras que se sostienen, destaca la que atribuye la aparicin de las agujetas a una mala formacin del riego sanguneo (estar en mala forma fsica); los H+ permaneceran ms tiempo de lo normal en circulacin, aumentndose la probabilidad de cristalizacin.
*El lactato se produce constantemente durante el metabolismo y sobre todo durante el ejercicio.
Cunto ha de disminuir el pH para que se produzca la liberacin de H+?. A un pH de 7.3 ya hay liberacin, y < 7.3, mucha ms liberacin. Si se diera una alcalosis sangunea, la Hb no podra liberar el O2 problemas respiratorios
Es muy raro que haya alcalosis sangunea (aumento de OH-) ya que el agua es un electrolito muy dbil (Keq muy baja casi toda en forma molecular, es decir, pocos iones); si la hubiera no sera posible la liberacin de O2 por la Hb, generndose un problema respiratorio.
EFECTO BOHR (de los H+, y del CO2)

La liberacin de O2 es producida cuando disminuye el pH (7.3, hacia cido con respecto al pI de la Hb 8.3), es decir, cuando aumenta la [H+] o cuando la presin del CO2 se incrementa; ambos factores ocasionan que la Hb disminuya su afinidad por el O2.
2
Dicho de otro modo, a un pH menor (ms cido), la Hb se unir al O con menos afinidad, por lo que tender a + cederlo. Puesto que el CO2 est directamente relacionado con la [H ] en la sangre, un aumento de los niveles de CO2 lleva a una disminucin del pH, lo que conduce finalmente a una disminucin de la afinidad por el oxgeno de la Hb.
Curva cintica (de disociacin) sigmoidea de la Hb. La lnea roja punteada corresponde al desplazamiento hacia la derecha causado por el efecto Bohr.
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BIOQ GENERAL
b) Efecto del CO2. Comportamiento similar a la Hb.

El CO2 que se libera a los tejidos y a las clulas sale a la sangre; all puede tener 2 efectos sobre la Hb: directo e indirecto
- DIRECTO: el CO2 se une a la parte proteica de la Hb, concretamente a los grupos amino-terminal de los 4 protmeros, siempre que estos no estn protonados = Hb CARBAMILADA CARBAMINOHb
Hb-NH2 + CO2 Hb-NH-COO-
Consecuencia: aparecen nuevos grupos ionizados (COO-), por lo que aparecen nuevos enlaces inicos, producindose la estabilizacin de la forma TENSA de la Hb.
Conclusin. La unin CO2-Hb (Hb Carbamilada) da lugar a la: APORTA UNA CARGA (interacciones inicas) Aparicin de nuevos enlaces inicos Nueva formacin tensa (T) Disminucin de la afinidad de la Hb por el O2
DIRECTAMENTE POCO EFECTO SOBRE LA Hb (15%)

Este mtodo directo solo explica en un 15% el proceso de la prdida de afinidad de la Hb por el O2 a causa de un aumento de la [CO2] en sangre, pues en condiciones normales solo el 15% de los grupos amino-terminal de la Hb se encuentran no protonados; as que este mtodo no explica todo el proceso.
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BIOQ GENERAL A pesar de ello, este mtodo directo es el mecanismo de transporte de CO2 que normalmente conocemos, y que se da en el mecanismo de la respiracin: durante la inspiracin aumenta la [O2] en los pulmones, por competicin el O2 se une a la Hb y activa la forma R = oxiHb (relajada poco estable, menos enlaces inicos); en la exhalacin aumenta [CO2] que por competicin desplaza al O2 (se suelta) y activa la forma T = desoxiHb (tensa estable, ms enlaces inicos). De nuevo aparece la forma R, compensndose las interacciones dbiles (efecto cooperativo), con lo que se produce la prdida del CO2 (se libera), y vuelve a comenzar el proceso.
- *INDIRECTO* (el ms importante): el CO2 (formado normalmente en las reacciones metablicas) en sangre se disuelve dando lugar a BICARBONATO, que aporta protones H+ que potenciarn el EFECTO BOHR, dando lugar a la HbT (forma tensa), con su consecuente prdida de afinidad y cesin de O2. CO2 + H2O H2CO2 HCO3-
As las clulas activas se aseguran de que la Hb suelte el O2. En la curva cintica sigmoidea se podr observar como disminuye la pendiente y aumenta la P50 (aumenta la PO2 a la cual la mitad de los sitios de unin a la Hb estn ocupados) al igual que antes. Para empezar, cabe destacar que la sangre venosa ser rica en CO2 HCO3- y la sangre arterial en O2.
Comentado en clase. La sangre venosa que lleva, CO2 HCO3-?
Lleva ambos, ya que se encuentran en un continuo equilibrio y formacin. Casi todo el CO2 que se elimina es de esta forma: CO2 + H20 HCO3-; pero como es un gas de baja solubilidad necesita estar en forma de bicarbonato (HCO3-) en la sangre.
Existe otro factor que asegura que la Hb libere todo el O2 si la clula lo necesita: Es una molcula orgnica que se produce a partir de la glucolisis (intermediario de la glucolisis). Este intercambio se realiza en el interior del eritrocito.
c) Efecto del 2,3-BFG
El ERITROCITO o GLBULO ROJO (Hb en su interior) se caracteriza por ser la nica clula que no tiene mitocondrias (o que posee un % nfimo), por lo que su nica forma de obtencin de energa, su nica ruta metablica es la GLUCOLISIS, razn de que se encuentre MUY ACTIVA. Consecuencia: produccin de 2,3-BFG
Esta molcula tiene un gran n de cargas (-) porque tiene 2 P unidos Encaja en el hueco que queda entre los 4 protmeros de la Hb Al encajar estabiliza la forma tensa de la Hb 71
BIOQ GENERAL
La 2,3-BFG cabr perfectamente en este hueco que queda despus de que la Hb haya adoptado la posicin tensa (desoxi-Hb). Conclusin: REFUERZA EL EFECTO DE LOS H+ Y DEL CO2 Estos a su vez han sido los que han hecho que la Hb adoptase la forma tensa, propiciando una entrada ms efectiva. Si la Hb se hubiera encontrado en un su forma R (oxiHb) no hubiese sido impedimento de encaje, pero ste hubiera tardado ms, y por tanto no hubiese sido tan efectivo.
Definicin (2,3-BFG): molcula formada a partir de un intermediario de la gliclisis anaerbica, que al encontrarse en alta concentracin en los eritrocitos (por la ausencia de mitocondrias) , provoca la reduccin de la afinidad de la hemoglobina por el oxgeno. *ALOSTERA: modo de regulacin de las enzimas por el cual la fijacin de una molcula en una ubicacin (sitio cataltico) modifica las condiciones de fijacin de otra molcula, en otra ubicacin distante de la enzima. La Hb posee propiedades alostricas = cooperatividad o efecto homotrpico.
La 2,3-BFG es muy importante en 2 situaciones: - HbF (fetal)
En Resumen: PROTENAS GLOBULARES
Globulares Medio circulatorio y citoplasma Muy solubles y ricas en a polares
Funcin dinmica Inmunoglobulinas & Hemoglobina
DEFENSA: INMUNOGLOBULINAS = glicoprotenas (glcidos
regin FC)
2 pares de cadenas peptdicas que interaccionan entre s y dan la Ig: (2)Cadenas L: LIGERAS 2 tipos: y [2 DOMINIOS variables y constantes]
(2)Cadenas H: PESADAS 5 tipos: (IgM), (IgG), (IgA), (IgE) y (IgD) = marcan el ISOTIPO [4 DOMINIOS] IgM sintetizadas cuando hay infeccin (las 1as). Corta vida (2-5 das en sangre) (mutabilidad zona variable). 72
IgG (sueros) reconocimiento muy especfico Proporcionan inmunidad al feto. 1 mes en sangre.
BIOQ GENERAL
IgA (fluidos corporales) IgE
inmunidad al neonato. Corta vida.
hipersensibilidad. Corta vida (10 das).
IgD participa en las dems salvo en la inmunidad del feto y del neonato (no se conoce concretamente su funcin). Estabilizacin: (1) simple interaccin entre las cadenas, (2) interacciones dbiles entre las cadenas pesadas y (3) enlaces disulfuro entre las 4 cadenas polipeptdicas 2 regiones (fab & fc) separadas por la zona de bisagra (enlaces disulfuro): Regin FAB (cadenas L y H) reconocimiento del antgeno en su zona ms amino-terminal (14-20 a) = ZONA VARIABLE Regin FC (solo cadenas H) une glcidos que contribuyen a la especificidad y al isotipo = ZONA CONSTANTE
DE UNIN AL O2: MIOGLOBINA & HEMOGLOBINA Estructura bsica (protena globular conjugada) Parte proteica = alto contenido en -hlice (75%) con 8 SEGMENTOS - Propiedad de unin al O2 - Bolsillo hidrofbico (polar x tener 2 His): Unin con el grupo hemo Impide la oxidacin del Fe2+ y por tanto su consecuente formacin de metglobina e imposibilidad de ceder el O2 Impide tb la oxidacin de otros elementos y la entrada de otros gases al O2 como el CO Parte no proteica - Aporta el grupo HEMO (anillo de tetraporfirina 9 + Fe2+) o Unin de la parte proteica con la no proteica a travs de la His F8, posicin 93 = enlace covalente o Unin del O2 a travs del Fe (ya unido a la protena) = enlace estable no covalente La His E7, 64 (situada cerca del enlace libre de Fe) obliga a que el elemento que quiera unirse al Fe lo haga en una disposicin oblicua = la estable del O2 pero no del CO MIOGLOBINA
-
1 cadena peptdica de 153 a con 1 solo grupo hemo por lo que solo capta 1 O2 73
BIOQ GENERAL -
Abunda en clulas musculares Almacena el O2 y facilita la difusin del O2 de los capilares (mitocondrias) interior de las clulas
Alta afinidad por el O2, el cual debe captar desde los capilares, pues la Mb NO SALE DE LA CLULA, y el O2 no es transportado hasta dentro. MbO2
Equilibrio: Mb + O2
Fraccin de saturacin: PO2 a la cual la mitad de las molculas de Mb estn unidas a O2 Cintica = curva hiperblica La Mb suelta el O2 cuando la clula se est quedando sin l (cuando la PO2 a nivel celular sea 4 mmHg), es decir, acta a modo de reserva.
HEMOGLOBINA = oligomrica con 4 cadenas peptdicas: 2 = 141 a c/una 2 = 146 a c/una 4 grupos hemo interaccionan entre s: = interaccionan entre s: =
posibilidad de unir hasta 4 molculas de O2 (a nivel de los pulmones) DMERO de HETERODMEROS 2[] = si uno se mueve
Interacciones: - ms numerosas el otro tb Tipos de Hb: 1. A (2 y 2) = la habitual
2. A2 (2 y 2) = bajo % en sangre; si el % fuera alto = talasemia: no afecta al transporte de O2 3. F (2 y 2) = 100% en el feto; 1-2% en el adulto; 20% en drepanocitosis Objetivo: transporte de O2 desde los pulmones hasta la ntima arterial (capilares)
Equilibrio de Hill: Hb + n O2 Hb(O2)n
n (coeficiente de Hill afinidad por el O2) = 2,7
Cintica = comportamiento SIGMOIDE permite la captacin y cesin de O2 (la unin del 1er O2 facilita las uniones posteriores por cambios de conformacin) para llevarse el CO2 (incompatible con el O2) en su retorno a los pulmones 2 formas de Hb: Tensa (HbT): desoxi-Hb = + interacciones dbiles Relajada (HbR): oxi-Hb = - interacciones dbiles
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BIOQ GENERAL
Explicacin del comportamiento SIGMOIDE por 2 mecanismos: 1) HOMOTRPICO o COOPERATIVO = unin cooperativa del O2 a la Hb La entrada de O2 al BH es difcil, ya que tiene que romper muchos enlaces dbiles; adems, cuando ya ha entrado y se une al Fe2+, lo arrastra, encajndolo en el plano del anillo tetrapirrlico cambio de estructura Conclusin: unin difcil COOPERATIVIDAD = el cambio estructural afecta a las interacciones =, rompindose los enlaces dbiles del 2 protmero, lo que facilita la unin del 2 O2 al BH (al estar ya rotos los enlaces) y tambin su posterior unin al Fe, que supondr los mismos cambios estructurales. Conclusin final: el 3er y 4 O2 sern unidos de forma todava ms fcil. INTERACCIONES QUE SE ROMPEN 1. COO- --- NH3+ (extremos) 2. His+ --- Asp3. Lys+ --- COO4. Arg+ --- Asp-
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BIOQ GENERAL
2) HETEROTRPICO = cesin del O2 por seales moleculares que avisan a la Hb de que no hay O2 en la clula y reducen su afinidad: protones, CO2 y 2,3-BFG
a) Efecto de los PROTONES (H+)
pIHb = 8.3 (gran densidad a bsicos) aumento de H+ en el medio (pH hacia cido 7.3) protonacin a bsicos aumento del n de cargas+ aumento del n de enlaces inicos en la protena forma tensa (estable) prdida de afinidad por el O2 liberacin de O2 Conclusin: los H+ son una seal que avisa a la Hb de que las clulas y TJs activos (metablicamente y en movimiento msculo) requieren O2 Efecto Bohr la liberacin de O2 de la Hb se produce cuando: - Aumenta [H+] - Aumenta la PCO2
Ambos conducen a una prdida de afinidad por el O2 Curva cintica sigmoidea: disminuye la pendiente y aumenta la P50
b) Efecto del CO2 - Directo (explica un 15% el proceso de la prdida de afinidad porque en CN solo este % de los grupos amino-t de la Hb se encuentran no protonados): CO2 + parte proteica Hb (amino-t de los 4 protmeros) = Hb CARBAMILADA CARBOAMINOHb nuevos grupos ionizados (COO-) nuevos enlaces inicos forma TENSA = desoxiHb T disminuye afinidad de la Hb por el O2
Conclusin: directamente efecto discreto sobre la Hb (15%)
- Indirecto: explica de forma importante el efecto del CO2 sobre la Hb. CO2 en sangre bicarbonato aporta H+ potenciacin del efecto Bohr O2 liberacin prdida de afinidad por el
c) Efecto del 2,3-BGF (producto de la glucolisis) ERITROCITO ( de mitocondrias) glucolisis muy activa porque es su nica posibilidad de obtencin de energa produccin de 2,3-BFG
2,3-BFG gran n de cargas negativas (2P unidos) encaja en el hueco entre los 4 protmeros, ms fcilmente si se encuentra en su forma tensa (favorecida anteriormente por los H+ y el CO2) REFUERZA LA FORMA T Y POR TANTO EL EFECTO DE LOS H+ Y DEL CO2 76
BIOQ GENERAL
TEMA 4 ENZIMAS. CINTICA ENZIMTICA

ENZIMOLOGA
Somos reacciones qumicas fisiolgicas, por lo que stas tienen que cumplir una serie de caractersticas de acuerdo con la fisiologa humana: 1. Compatibles: condiciones de pH y temperatura suave. 2. Velocidad adecuada: rpida o lenta (depende). 3. Nunca alcanzan el equilibrio: lo buscan, estn al borde del equilibrio; pero el equilibrio absoluto equivale a la muerte. 4. No producen reacciones secundarias: en las cuales se pierdan metabolitos o energa. 5. Coordinadas Todas las reacciones qumicas en los seres vivos estn catalizadas por la participacin de enzimas (E) protenas globulares - que unen sustratos (S). Algunas reacciones (en vez de estar catalizadas por enzimas) son catalizadas por molculas de ARN.
CARACTERSTICAS
Las reacciones qumicas en el organismo cumplen una serie de condiciones. stas se logran gracias a los catalizadores enzimticos, cuyas caractersticas son las siguientes: Comunes a todos los catalizadores (enzimticos y qumicos) Trabajan a baja concentracin; no es necesaria una elevada [ ] (a veces s). No se consumen en el transcurso de la reaccin (a veces s) pero al ser protenas tienen una vida media. No modifican las caractersticas termodinmicas de la reaccin que catalizan. Propias de enzimas y distintas de otros catalizadores qumicos Pueden trabajar, catalizar las reacciones en condiciones fisiolgicas (pH y T suaves). Son especficas. Poseen un elevado poder cataltico respecto al catalizador qumico (pueden llegar a aumentar la velocidad de una reaccin qumica en 107 veces ms que un catalizador qumico o sin catalizador). Reguladas*: no todas van a estar reguladas pero todas podran estar sujetas a regulacin. *Importante ya que existirn frmacos que afecten a la regulacin enzimtica.
CLASIFICACIN. En 6 grupos segn el tipo de funcin que catalizan:

) (*Nota: aunque se indiquen como tal, no todas son reversibles : enlace simple; = : enlace doble 1. OXIDORREDUCTASAS catalizan reacciones de oxidorreduccin, es decir, transferencia de protones (H+) o electrones (e-) de un sustrato a otro, segn la reaccin general: AH + B Ared + Box A- + BH Aox + Bred
2. TRANSFERASAS catalizan la transferencia de un grupo qumico ( del H) de un sustrato a otro, segn la reaccin: AX + B A + BX (rompiendo y formando enlaces) *Todas las reacciones implican esto. 77
BIOQ GENERAL 3. HIDROLASAS agua): catalizan las reacciones de hidrlisis (ruptura de enlaces con participacin de
AB + H2O
AH + BOH
4. LIASAS catalizan reacciones de ruptura o soldadura de sustratos, es decir, acciones de prdida de una parte de la molcula pero sin la participacin de agua y energa, y con la formacin de dobles enlaces o estructuras cclicas: AX + BY AB A=B + XY A+B *SINTASA: no requiere gasto de energa. 5. ISOMERASAS catalizan la interconversin de ismeros, es decir, cambian la posicin de un grupo pero dentro de la misma molcula: A A
6. LIGASAS catalizan la formacin de enlaces con participacin de molculas ricas en energa, es decir, la unin de 2 S con hidrlisis simultnea de un nucletido trifosfato (ATP, GTP, etc.): A + B + XTP AB + XDP + Pi *SINTETASA: requiere gasto de energa (ATP, GTP)
BASES DE LA ACCIN ENZIMTICA (Cmo funcionan las enzimas)

Catlisis qumica: cualquier reaccin qumica consiste en la transformacin de un sustrato (S) en un producto (P). SP Para que cualquier reaccin sea favorable (no necesario para que se lleve a cabo) los sustratos tienen que tener ms energa que los productos.
Trabajo mecnico = contraccin pulmones, corazn, msculos Trabajo osmtico = bomba Na+/K+ Trabajo qumico = formacin de sustancias o descomposicin (normalmente la formacin necesita energa)
A veces la energa se pierde en forma de calor (energa NO til qumicamente aunque fisiolgicamente s es til como mecanismo de defensa ante infecciones). En el transcurso de una reaccin qumica los sustratos adquieren un nivel de energa superior al inicial y ah es donde se llevan a cabo las transformaciones qumicas del sustrato; en ese momento de mxima energa la molcula S se encuentra en un estado intermedio o de TRANSICIN X(ya no es tal sustrato) para dar lugar al producto. 78
BIOQ GENERAL La energa que hay que suministrar para esa transformacin es la ENERGA DE ACTIVACIN y procede de: - Cambios de pH - Cambios de T - Aumentos de presin (comprimindola se rompen enlaces y se facilita su transformacin) Catlisis enzimtica (~ catlisis qumica fisiolgica) La catlisis qumica en el ser humano difiere en ciertos aspectos, y se convierte en catlisis enzimtica, ya que todas las reacciones qumicas estn catalizadas, gobernadas por enzimas. La funcin de las enzimas en nuestro cuerpo es la de disminuir la energa de activacin. Esto se consigue a travs de la formacin de una serie de complejos intermedios: Unin de enzima al sustrato formacin complejo ES Formacin enzima intermediario EI Formacin enzima producto EP Finalmente liberar un producto reciclando la enzima para que vuelva a funcionar E + S ES EI (S transformndose en P) EP P + E La eficacia de la catlisis enzimtica se basa en la formacin de un complejo ES (E pueda unirse a S). Esta unin depende de la estructura de la enzima (E). Estructura de la enzima (condiciona la eficacia de la catlisis) Normalmente su estructura es GLOBULAR (99,9%). REGIN (15%): se encuentran las cadenas laterales (R) de los aminocidos de la enzima, que van a poder unirse a grupos concretos del S. Si S tiene grupos bsicos, en la regin de la E habr grupos cidos y viceversa. En esta regin tambin hay R de aminocidos que participan en orientar correctamente al S para que interaccionen con la E. Estos aminocidos, los que unen y orientan al sustrato, se llaman SITIO DE UNIN AL SUSTRATO. En la estructura terciaria de estas enzimas existen R de aminocidos que llevan a cabo la accin cataltica, la transformacin del S. Este sitio se llama CENTRO CATALTICO (y puede coincidir con el sitio de unin al sustrato). El conjunto del sitio de unin al sustrato y el centro cataltico es el CENTRO ACTIVO.
MODELOS ENZIMTICOS
La unin enzimasustrato (E
S = ES) se lleva a cabo por 2 modelos:
1. MODELO DE FISCHER (no fisiolgico)

Impone que el Centro de Unin al Sustrato (CUS) ha de poseer una forma EXACTA a la forma del Sustrato (S): CUS = S Esto implica que la protena NO es FLEXIBLE, por lo que el Centro Cataltico (CC) no podr disponerse en un sitio distinto al CUS (como ocurre realmente en nuestro organismo): CUS = CC
Incompatibilidades fisiolgicas: La estructura de las protenas (enzimas) posee un cierto grado de FLEXIBILIDAD 79
BIOQ GENERAL Esto implica que en ocasiones el CUS y el CC se encuentran en sitios distintos: CC CUS 2. MODELO DE KOSHLAND o DE COMPATIBILIDAD (fisiolgico) Este modelo es el ms aceptado debido a que explica la actividad fisiolgica enzimtica. El CUS es COMPATIBLE al S, es decir, posee una forma aproximadamente igual a la forma del S. Esto explica las caractersticas enzimticas: - Que en el CUS haya a que orienten al S para su correcta unin con la enzima (E) - La FLEXIBILIDAD proteica - La EFECTIVIDAD de las enzimas (la formacin de ES aumenta la probabilidad de choque) - La creacin de TENSIN (aumentar la capacidad del ES para romper el S y crear ese P) - La disminucin de la cantidad de energa que hay que suministrar para que S P (como consecuencia de las 2 anteriores) - La ESPECIFICIDAD ENZIMTICA ([1] por sustrato o absoluta y [2] de funcin o de grupo) - Que puedan trabajar en condiciones fisiolgicas de pH y T suaves (CA) - La REGULACIN (fundamento de la accin farmacutica, medicamentos) Es compatible con: La separacin fsica entre el CUS y el CC: CUS CC Explicacin Cuando el sustrato (S) se une a la enzima (E), esta encaja perfectamente con el S, adaptndose a su forma (flexibilidad). A medida que encaja la E, sta sufrir un cambio en su estructura que acerca los a del CC al CUS (zona en la que est unido el S a la E). La cadena lateral (R) de los a ralentiza el movimiento del S y lo orienta, dando tiempo a que la E se adapte a la forma del S (los a se acercan: catlisis), simplemente por interacciones dbiles (enlaces de hidrgeno) ya que sern interacciones rpidas (debido a su debilidad se rompen/forman muy rpido), que es lo que no interesa (si fuera por interacciones covalentes ocurrira de una forma mucho ms lenta). Este modelo de unin/interaccin ES, explica todas las caractersticas que son propias de las enzimas como catalizadoras, es decir, explica la EFECTIVIDAD de las enzimas, ya que, al formarse el complejo ES, se aumenta la proximidad entre el sustrato y los a (que tienen que transformar ese sustrato), y como una reaccin qumica se da como resultado de la probabilidad de choque con formacin de productos, concluimos que la interaccin E S aumenta la probabilidad de choque y por tanto la efectividad. Adems la formacin del complejo ES crea TENSIN, lo que facilita la transformacin del S P; as, cuanto mayor sea la tensin de la molcula, ms capacidad tendr el complejo ES para romper ese S en 2 P (P1 y P2), ya que reducir la energa necesaria para que se lleve a cabo la reaccin. (E-S P1 + P2) Por ltimo, como consecuencia de los 2 anteriores (proximidad/efectividad + tensin), DISMINUYE LA CANTIDAD DE ENERGA que hay que suministrar al S para que se transforme en P. Este modelo explica asimismo la ESPECIFICIDAD ENZIMTICA. Hay 2 tipos, siendo los 2 igual de habituales: 1) POR SUSTRATO, o especificidad ABSOLUTA Una enzima solo va a poder reconocer UN sustrato y transformarlo en UN producto. Va a ser el centro de unin al sustrato (CUS) el encargado de reconocer al sustrato y unirlo. 80
BIOQ GENERAL As pues, se puede decir que est basada o es debida al CUS. Ej.: glucosa-6-fosfatasa E1 + S1 2) P1
DE FUNCIN, o especificidad DE GRUPO Una enzima va a poder reconocer un GRUPO, o un ENLACE o una PARTE CONCRETA DEL SUSTRATO, sobre la que acta. Viene determinada por el centro cataltico (CC).
Podemos encontrar en este caso que distintos sustratos se unen a una misma enzima para formar distintos productos, es decir, dependiendo del sustrato darn un producto u otro. Ej.: peptidasas, que reconocen enlaces peptdicos especficos, escindindolos.
O tambin podemos encontrar que un mismo sustrato es reconocido por distintas enzimas para dar lugar a distintos productos.
El modelo de ajuste inducido de Koshland (formacin del complejo ES) tambin explica que las enzimas acten/trabajen en condiciones fisiolgicas de pH y temperatura suaves, debido a que el centro activo aporta el medio adecuado para que se lleve a cabo la catlisis. Tambin explica el hecho de que las enzimas sean REGULABLES, ya que cualquier factor (por ej. frmacos) que altere la formacin del complejo enzimasustrato (ES)*, altera la formacin del producto, y por tanto va a afectar a la reaccin de catlisis. *Aqu es donde se requerir una implicacin clnica, mediante el uso de distintos frmacos (inhibicin, activacin).
MECANISMOS DE CATLISIS
Una vez formado el complejo ES, habr 3 mecanismos habituales de catlisis: 1) Catlisis CIDO-BASE (*la ms habitual porque es la ms rpida*)
El sustrato se une a la enzima donde se realizan reacciones red/ox (de oxidorreduccin) llevadas a cabo (catalizadas) por aminocidos del centro cataltico. Consiste en la transferencia de protones (H+) o en la transformacin de enlaces, de forma lenta, es decir, paso a paso para no perder energa en forma de calor. 2) Catlisis INICA
La transformacin de los sustratos se lleva a cabo por iones* como Mg2+, Mn2+, Cu2+ (cationes divalentes especialmente). *Se requerirn en poca cantidad pues si no se acumularn en el hgado. Se forma un complejo ternario en forma de complejo enzimaionsustrato. 3) Catlisis COVALENTE
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BIOQ GENERAL La transformacin del sustrato se realiza mediante la creacin de enlaces covalentes con el centro cataltico de la enzima. Esta unin covalente es transitoria, y est reservada a reacciones que tienen que transcurrir ms lentamente (a una velocidad ms lenta), es decir, cuando el organismo necesita disminuir la velocidad de sus reacciones.
LA CATLISIS ENZIMTICA
Nos va a permitir estudiar: La velocidad a la que se lleva a cabo una reaccin Los factores que pueden alterar a esa velocidad
Adems, el objetivo del estudio de la catlisis enzimtica es de inters clnico, es decir, este se realiza para conocer: La NATURALEZA de la reaccin, es decir, la propia reaccin, y cmo se DESARROLLA La concentracin fisiolgica de sustrato [S] que puede haber en el organismo La concentracin fisiolgica de las enzimas [E] Esto es, la afinidad entre enzimasustrato* *Gran implicacin clnica, pues puede ser necesario modificar esto para curar o retrasar la enfermedad. Cul es el paso limitante de una ruta metablica (las reacciones qumicas se hallan agrupadas en rutas metablicas futura aplicacin de frmacos)
Para el estudio de la cintica enzimtica, necesitamos: Disponer de todos los parte de la reaccin: Tener las condiciones temperatura a las funcional Una herramienta que desaparicin gradual de aparicin de los reaccin qumica identifique elementos que forman enzima y sustratos ptimas de pH y cuales la enzima es nos permita ver la los sustratos, o ver la productos; esto es una especfica que caractersticamente el 82
BIOQ GENERAL sustrato o el producto, para comprobar la variacin de sus concentraciones. La velocidad de una reaccin enzimtica responde pues a las siguientes ecuaciones:
V =
d [S ] d [ P] t t
FACTORES QUE AFECTAN A LA CINTICA ENZIMTICA

A. Factores INTRNSECOS Son aquellos que forman parte de la propia reaccin, es decir, los que participan en ella: [S] = la que ms afecta a la velocidad de la reaccin [E] = solo afectar en situacin saturante
El organismo se pone en marcha o se para segn haya o no sustrato; por ej., el colesterol es esencial para mantener la estructura celular ~ sustrato. B. Factores EXTRNSECOS Son aquellos que no forman parte de la propia reaccin, es decir, que son externos a ella. Explican cmo las condiciones del medio (pH, temperatura, presencia de alguna molcula distinta al sustrato, etc.) afectan a la cintica enzimtica o velocidad de la reaccin. Es importante no confundir estos factores ya que modifican la velocidad, pero no la propia enzima. A. Factores INTRNSECOS INFLUENCIA DE LA CONCENTRACIN DE SUSTRATO [S] (*la ms relevante*) Si representamos cmo vara la velocidad de la reaccin en funcin de la concentracin de sustrato, encontramos unas cinticas de tipo HIPERBLICO. En esta reaccin distinguimos 3 partes bien diferenciadas: 1. En esta primera parte, el sustrato condiciona la velocidad de la reaccin enzimtica. Se trata de una cintica de primer orden en la cual la velocidad de la reaccin qumica es totalmente proporcional a la concentracin de sustrato.
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BIOQ GENERAL 2. Aqu tenemos un orden mixto. Parece que al aumentar la concentracin de sustrato aumenta la velocidad, pero esta tendencia no se mantiene en toda la franja; as concluimos que la velocidad de la reaccin no depende totalmente de la concentracin de sustrato. 3. La tercera parte de esta grfica hiperblica indica que la velocidad es totalmente independiente de la concentracin de sustrato. En esta tercera parte se dice que la cintica es de orden 0. En estas reacciones se asume que la concentracin de enzimas siempre va a ser menor que la de sustrato, incluso en condiciones de baja concentracin de sustrato: [E] <<< [S] Explicacin E + S ES EX EP E + P ES = Enzima-sustrato (*Todos los pasos se resumen en este*) EX = Enzima-producto intermedio EP = Enzima-producto En cuanto aumentamos la concentracin de sustrato comienza la reaccin en la que no todas las enzimas estn ocupadas, siendo as su velocidad ptima; por tanto, en la parte 1 siempre habr enzima disponible para interactuar con el producto (a pesar de que [S] siempre es mayor que [E], ya que, debido a la velocidad de la cintica enzimtica, siempre quedar una enzima libre dispuesta a interactuar con el sustrato). En la zona de orden 0 (3) la concentracin de enzima libre es prcticamente nula. Toda ella se encuentra en forma de complejo ES. As, en cuanto una enzima se queda libre, pasa a ser ocupada por una molcula de sustrato debido a la elevadsima concentracin [S]. En estos casos se afirma que la enzima est saturada de sustrato. Aunque en ocasiones significa que la velocidad de la reaccin es mxima debido a que se ha agotado el sustrato, y la velocidad no puede ser mayor.
Una ecuacin que defina este comportamiento cintico hiperblico se deduce por las siguientes consideraciones: La concentracin de sustrato siempre ser mayor que la de enzima: [S] >>> [E] Las reacciones son monosustrato, es decir, solo interviene un sustrato. La formacin de complejos ES a partir de los productos no se lleva a cabo. Se considera a la reaccin irreversible.
OJO! Esto fisiolgicamente no siempre es as, ya que la reaccin puede ser reversible.
Se considerar la reaccin tal que as:

K3 E + S K 1 K 2 ES E + P
Y por tanto la ecuacin cintica tendra los siguientes elementos:
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BIOQ GENERAL V0 = K3 [ES] e incluira los conceptos de [S] y de [E]
HIPTESIS DEL EQUILIBRIO RPIDO DE MICHAELIS-MENTEN

Los primeros que estudiaron la cintica enzimtica fueron Michaelis-Menten. Consideraron que para estudiar la formacin del complejo enzima-sustrato (ES) se haba de tener en cuenta que la enzima y el sustrato se encontraban en un equilibrio, y que rpidamente daban lugar al complejo ES, el cual se descompona mucho ms lentamente hacia la generacin del producto que la velocidad de formacin enzima-sustrato. Por tanto, en la reaccin antes expuesta se despreci K3 (ya que K3 <<< K1). Esto se conoce como hiptesis del equilibrio rpido. As, la velocidad de formacin enzima-sustrato dependa de la velocidad de descomposicin de ES hacia las condiciones iniciales (E + S). De esta forma deducimos esta ecuacin:
K1 [ E ][S ] = K 2 [ ES ]
En resumen: fisiolgicamente un efecto de la [S] en nuestras clulas (1) variar/modificar la velocidad a la cual se llevan a cabo las reacciones enzimticas/qumicas y (2) dar lugar a una tpica cintica hiperblica (con 3 pasos) que se deber o se explicar por la interaccin E-S segn la siguiente reaccin y su ecuacin de velocidad inicial:
Vo = K3 [ES]
As nos es posible establecer una serie de deducciones: 1. [S] >>> [E], la concentracin de enzima deber ser fisiolgicamente inferior a la concentracin de sustrato 2. [ET] = [E]libre + [S] MICHAELIS-MENTEN. Hiptesis del equilibrio rpido La velocidad de formacin del complejo enzima-sustrato (ES) es igual a la velocidad de desaparicin de este complejo: V.form [ES] = V.desap [ES] K3 << K2
[E] [S] = K2/K1 [ES]
K1 [E] [S] = K2 [ES]
Cte. de afinidad
Segn Michaelis-Menten, la velocidad de formacin del producto (P) es mucho ms lenta que la velocidad de formacin del complejo ES, por tanto, al ser la cte. de esta reaccin (K3) mucho ms inferior a K2, se debe de despreciar. 85
BIOQ GENERAL Pronto veremos que esta teora no tendr un sentido muy lgico, ya que aunque se forme de forma lenta, no se puede desprecia la formacin de productos. BRIGGS-HALDANE En su bsqueda de una ecuacin que explicara la cintica enzimtica hiperblica, hicieron una correccin de la anterior hiptesis, y dijeron lo siguiente: la velocidad de formacin del complejo ES es igual a la velocidad de desaparicin de este complejo con la formacin de producto: V.form [ES] = V.desap [ES] P Correccin de la hiptesis del equilibrio rpido de Michaelis-Menten: hay que considerar la formacin de los productos, es decir, no se debe de despreciar K3, ya que llegar un momento en el que la velocidad de desaparicin del complejo ES no ser tan lenta porque se estar formando producto (P). As, a la ecuacin anterior habr que aadir la participacin de K3:
K1 [E] [S] = K2 [ES] + K3 [ES] [E] [S] = (K2 + K3/ K1) [ES]
Conclusin: la relacin resultante entre las ctes. de Briggs-Haldane es similar a la que anteriormente haban propuesto Michaelis-Menten (K2/ K1), con la nica diferencia de que la de stos ltimos solo era aplicable en un momento dado de la reaccin (ya que no consideraban la formacin de productos), mientras que la de Briggs-Haldane era aplicable a toda la reaccin, pues considera todas las ctes. del equilibrio. As llegan a definir Km, a la que denominan cte. de Michaelis-Menten por su parecido tan prximo a la relacin de ctes. propuesta anteriormente: Km = K2 + K3/ K1
[E] [S] = Km [ES]

Seguimos desarrollando la ecuacin: [E]libre* = [ET] [ES] *Sustituimos en [E]libre en la ecuacin anterior: [E] [S] = Km [ES] ( [ET] [ES] ) [S] = Km [ES] [ET] [S] [ES] [S] = Km [ES] [ET] [S] = *Km [ES] + [ES] [S] *Sacamos factor comn [ES] [ET] [S] = [ES] ( Km + [S] ) [ET] [S]/ Km + [S] = [ES]* Vo = K3 [ET]* [S]/ Km + [S] *ET *Sustituimos en la ecuacin de la velocidad inicial: Vo = K3 [ES] [ET] = [E]libre + [ES]
Vmx: no habr enzima libre porque toda ella estar trabajando para que se forme el producto, es decir, se encontrar en su expresin mxima de velocidad.
Vo = Vmx [S]/ Km + [S]

(define la influencia de [S] en una reaccin enzimtica) SIGNIFICACIN FISIOLGICA DE LA ECUACIN DE MICHAELIS-MENTEN
ECUACIN DE MICHAELIS-MENTEN
Vo = Vmx [S]/ Km + [S]

De esta ecuacin, fisiolgicamente deducimos 3 cosas: 86
BIOQ GENERAL 1. Un parmetro, Km Cte. de Michaelis: constante de afinidad que siente una enzima por un sustrato concreto. Esta es caracterstica para cada enzima (por un sustrato concreto).
Km puede variar, es decir, la podemos modificar* cambiando la afinidad que la enzima siente por un sustrato concreto. *Aqu habr actuacin clnica: si una enzima va mal, se intentar modificar su afinidad, es decir, la Km. Si Km aumenta indicar que la enzima tiene una afinidad disminuida por el sustrato (S). aumenta Km = disminuye afinidad Si Km disminuye indicar que la enzima tiene una afinidad aumentada por el sustrato (S). disminuye Km = aumenta afinidad Conclusin: Km y afinidad enzimtica son inversamente proporcionales Cul nos conviene ms? Dependiendo fisiolgicamente de la situacin necesitaremos una u otra (que aumente o disminuya Km). Ej.: en el hgado tiene lugar el metabolismo de la glucosa; en una breve descripcin de la entrada de glucosa en el hgado decimos que ste quiere coger toda la glucosa que hay en sangre; as habr una enzima (la quinasa) que dar la bienvenida a la glucosa fosforilandola. La Km aumentar y por tanto disminuir la afinidad de la enzima por la glucosa. Esto constituye una estrategia contra la saturacin, ya que as podr entrar toda la glucosa dentro del hgado sin que la enzima se sature. En cambio en el msculo ocurrir lo contrario; la Km disminuye de manera que la afinidad por la glucosa aumenta para que as el msculo pueda captarla.
Adems, Km es una medida de la [S] a la cual la reaccin adquiere la mitad de la velocidad mxima (V.mx): Km = [S] Vmx cte. adimensional que adquirir las unidades de concentracin de sustrato
2. Podemos deducir indirectamente la concentracin intracelular de sustrato [S]intracelular a partir de Km: Por qu? Si la [S] fuera inferior a Km (si [S] << Km) no estaramos aprovechando todo el poder cataltico de la enzima, es decir, sta estara trabajando a una velocidad inferior la reaccin se producira a una velocidad mucho menor de la que es capaz de realizar la enzima. Si la [S] fuera superior a Km (si [S] >> Km) la reaccin sera independiente de la [S], lo que resulta fisiolgicamente imposible (no tendra sentido fisiolgico). 3. A partir de la ecuacin de Michaelis-Menten podemos comprobar las aproximaciones empricas, es decir, entender el comportamiento de la cintica hiperblica.
[S]intracelular Km
Decamos que haba 3 zonas (1) de 1er orden, (2) de orden mixto y (3) de orden 0, en la que en realidad se distinguan solamente 2, la 1 y la 3; ya que la 2, al ser de orden mixto, no se puede expresar en la ecuacin: Una en la que la velocidad era dependiente de la concentracin de sustrato: V [S] Otra en la que la velocidad era independiente de la concentracin de sustrato: V [S]
87
BIOQ GENERAL En la cintica de 1er Orden [1], la Vo depende de la [S]; si en este caso consideramos que la [S] << Km, podemos despreciar [S]: Vo = Vmx [S]/ Km + [S] Vo = Vmx [S]/ Km = cte.
Vo * [S]
*Proporcional.
En la cintica de orden 0 [3], la Vo se hace independiente de la [S]; si en este caso consideramos que la [S] >> Km, podemos despreciar Km, llegando a la conclusin de que la enzima se halla saturada, por lo que alcanza a su velocidad mxima: Vo = Vmx [S]/ Km + [S] Vo = Vmx
Vo = Vmx
INFLUENCIA DE LA CONCENTRACIN DE ENZIMA [E] (mucho menos relevante que [S]) Solamente contribuye a reaccin enzimtica si una situacin solo se modificar la enzima se encuentra En esta situacin la [E] aumentar la Comentado en importancia actualidad ya frmacos que por ej., la antidiabtico oral) que inhibe un gen r/c la [glucosa]. Solo veramos su efecto cuando la reaccin qumica ha alcanzado su mxima velocidad. FORMAS DE EXPRESAR LA [E] o velocidad de una reaccin en funcin de la [E] a) Como ACTIVIDAD ENZIMTICA = concentracin de enzima [E] necesaria para llevar a cabo una reaccin enzimtica Las UNIDADES DE CONCENTRACIN pueden ser de 2 tipos: 1. En unidades internacionales: cantidad de enzima que necesitamos para transformar -3 1mol sustrato/ 1 min 1 mol = 0,001 milimol = 1 10 milimol 2. En katales: cantidad de enzima necesaria para transformar 1 mol sustrato/ 1 seg 88 la velocidad de una esa reaccin est en SATURANTE, es decir, velocidad cuando la saturada. saturante, si aumenta velocidad. clase: tiene su porque en la existen aumenta la [E], metformina (un
BIOQ GENERAL b) Como ACTIVIDAD ESPECFICA = actividad enzimtica expresada en funcin del total de protenas/enzima (en miligramos) que tenemos en la clula, TJ Ventajas Es la ms exacta Es la empleada en los *frmacos* Unidades de concentracin de la A.esp: 1. UI/ mg protena 2. Katal/ mg protena c) A travs de la CTE. CATALTICA
K cat =
Vmax [ ET ]
KCAT = V.mx (de la reaccin)/ [ET] (concentracin total de enzima) Ventajas Es la forma ms intuitiva para ver la eficacia de la enzima: Si aumenta la KCAT mayor transformacin de productos P Si disminuye la KCAT menor transformacin de productos P Es la empleada en *investigacin* Nota introductoria a factores extrnsecos: LINEALIZACIN DE LA EC DE VELOCIDAD DE MICHAELIS-MENTEN Ec original: Vo = Vmx x [S]/ Km + [S] Realmente es difcil aplicar esta ecuacin, por lo que es necesario LINEALIZARLA con el objetivo de: (1) hacerla ms operativa/til y (2) calcular con muchsima ms precisin/exactitud la V.mx o la Km, cometiendo el mnimo error Consiste en la transformacin de esa ecuacin hiperblica en la ecuacin de una recta: y = mx + n Para ello aplicaremos dobles inversos: 1/ Vo = Km/ Vmx x [S] + [S]/ Vmx x [S]
Km 1 [S ] = + V0 Vmax [ S ] Vmax [ S ]
y =m x
K 1 1 1 = m + V0 Vmax [ S ] Vmax
+ n
1/ Vo = Km/ Vmx x 1/ [S] + 1/Vmx
Linealizacin de LINEWEAVER-BURK La grfica de velocidad frente a [S] mostrada anteriormente no es lineal. Aunque a bajas concentraciones de sustrato se mantenga lineal, se va curvando a medida que aumenta la concentracin de sustrato. Antes de la llegada de los ordenadores, que permiten ajustar regresiones no lineales de forma sencilla, poda llegar a ser realmente difcil estimar los valores de la Km y la Vmx en las grficas no lineales. Esto dio lugar a que varios investigadores concentraran sus esfuerzos en desarrollar linealizaciones de la ecuacin de Michaelis-Menten, dando como resultado la grfica de Lineweaver-Burke o el diagrama de Eadie-Hofstee (*solo desarrollaremos la de Lineweaver*). La grfica de Lineweaver-Burk o representacin de doble recproco es la forma ms comn de mostrar los datos cinticos. Para ello, se toman los valores inversos a ambos lados de la ecuacin de Michaelis-Menten. El resultado de este tipo de representacin es una lnea recta cuya ecuacin es y = mx + n, siendo n el punto de corte entre la recta y el eje de ordenadas equivalente a 1/Vmx, y el punto de corte entre la recta y el eje de abscisas equivalente a -1/Km. 89
BIOQ GENERAL
Obviamente, no se pueden tomar valores negativos para 1/[S]; el mnimo valor posible es 1/[S] = 0, que correspondera a una concentracin infinita de sustrato, donde 1/v = 1/Vmx.
B. Factores EXTRNSECOS: no forman parte de la ecuacin E + S

pH (*no siempre desnaturalizante*) T (fisiolgicamente poco destacado)
ES
E+P
Inhibidores
1. pH: una variacin de pH produce un cambio en la ionizacin de las cadenas laterales (R) de los
a de esa protena, pudiendo afectar a 2 sitios: (efecto muy destacado fisiolgicamente) Al centro de unin al sustrato (CUS) E no se une a S por lo que no se forma el complejo ES y por tanto no hay reaccin enzimtica CUS E no se podr unir al S = no reaccin Al centro cataltico (CC) la E se podr unir al S, pero el complejo ES no dar lugar aP CC ES no P El efecto del pH no tiene porqu producir la desnaturalizacin de las enzimas; aunque habr veces que s, en ocasiones una variacin de los valores del pH simplemente acta como una seal que avisa a la enzima para que comience a funcionar Ej.: En el estmago existen enzimas en estado inactivado que no se activarn hasta que alcancen su pH ptimo (es decir, cuando le llegan los alimentos). As, todas las enzimas tienen un pH ptimo de funcin, por encima o por debajo del cual no funcionan porque los a del CUS del CC no estn correctamente posicionados (inoperativos). An as mantienen su estructura nativa, es decir, no tienen porque perder su conformacin espacial y desnaturalizarse. Ej.: el metabolismo de las protenas funciona mediante la activacin o inhibicin por cambios de pH.
2. TEMPERATURA:
un incremento de la T afectar a los enlaces dbiles que mantienen la estructura nativa de un enzima. (Efecto poco destacado fisiolgicamente)
Comportamiento general (el efecto ser muy variable dependiendo de la enzima) Casi todas las enzimas aumentan su actividad (la velocidad de la reaccin) a medida que aumentan su T, hasta llegar a un punto en el cul la velocidad de la reaccin cae en picado. Por qu ocurre esta drstica cada? Este punto de inflexin es debido a que llegada a una determinada T (50-60C) la protena se desnaturaliza. Cabe apuntar que esto va a ocurrir siempre en los seres humanos y en la mayora de seres vivos, pero no en bacterias, levaduras 90
BIOQ GENERAL Adems, fisiolgicamente nunca llegamos a esa T a causa de procesos infecciosos; a lo mejor de forma local en algn TJ se podra llegar, pero globalmente este efecto de la T no es tan marcado.
3. INHIBIDORES
= frmacos: sustancias que unidas a la enzima van a provocar (1) un cambio en su Km (cte. de Michaelis)o (2) en su Vmx, o incluso (3) en ambos parmetros.
A grandes rasgos los clasificamos en 2 grupos: (A) irreversibles o (B) reversibles. A. IRREVERSIBLES: aquellos que al unirse a la enzima producen un cambio irreversible en esa enzima, de modo que la enzima no se puede recuperar para seguir llevando a cabo la accin enzimtica. El cambio en la estructura de la enzima impide su reciclado. Actan de 2 formas: 1) El inhibidor se une covalentemente a la enzima, impidiendo que la enzima pueda reaccionar con 1 sustrato, y por tanto, impidiendo la accin cataltica. Sitios de unin del inhibidor = mltiples: En el centro de unin al sustrato (CUS): E En el centro cataltico (CC): ES no P no une S
A cualquier sitio de la enzima que suponga un cambio conformacional de sta que bloquee al CUS al CC o incluso a ambos. 2) El inhibidor se una a la enzima produciendo la modificacin de algn aminocido del CUS o del CC que sea esencial para la unin al S o para la actividad cataltica, inhabilitando a la enzima, y luego soltndose de ella. Por ej.: la enzima requiere a la lisina en su CUS para la unin del sustrato o el CC posee serina que es indispensable para la transformacin; si el inhibidor las destruyera la enzima ya no se unir al sustrato y el CC quedar inhabilitado al perder su capacidad de cambio conformacional, es decir, perder su capacidad de adaptacin.
De cualquier de las 2 formas, la enzima queda inactivada de forma permanente (irreversiblemente).

Qu habr que hacer para recuperar esa enzima, o ms bien, para crear una nueva? Activar al gen que codifica a la protena/enzima, es decir, si la clula siguiera dividindose tendr que sintetizar nuevas. Ejemplo de inhibidores irreversibles: PENICILINA Venenos (insecticidas) Agentes oncolgicos
B. REVERSIBLES: tambin modifican la Km y la Vmx de una reaccin enzimtica. La nica diferencia con respecto a los irreversibles es, evidentemente, que una vez que desaparece el inhibidor (una vez que se ha soltado) la enzima puede volver a llevar a cabo la reaccin, es decir, la enzima sigue siendo funcional.
91
BIOQ GENERAL Esto ocurre en la mayora de los casos, pero no siempre es as. Mediante la experiencia y desde un punto de vista fisiolgico sabemos que la enzima, aunque haya sido afectada de forma reversible, ya no volver a llevar a cabo la reaccin de la misma forma ni con la misma eficacia. Cabe apuntar que la interaccin inhibidor-enzima no es de 1-1, es decir, un inhibidor actuar sobre el global de un conjunto de enzimas.
En conclusin, los inhibidores reversibles son molculas que quedan unidas a la enzima reversiblemente, de modo que en un momento determinado podrn modificar la Km la Vmx de la reaccin enzimtica o incluso ambas a la vez, pero siempre la enzima se vuelve a reciclar. En una visin global, 1 molcula de inhibidor reacciona con un global de enzimas.
Existen 3 tipos de inhibidores reversibles: (1) competitivos, (2) no competitivos y (3) acompetitivos o mixtos 1) COMPETITIVOS = anlogo estructural del sustrato (es decir, el inhibidor [I] se parece al S, por lo que se unirn a la E exactamente igual que lo hara ste)
As el (I) competir con el sustrato para unirse a la enzima, debido a este parecido estructural con el sustrato. Se unir al CUS e impedir la formacin del complejo ES Se formar el complejo EI por lo que no se producirn productos P
Efecto sobre la reaccin enzimtica (ser observable en concentraciones saturantes - Vmx) Aumentarn la Km de la enzima Apenas modifican la Vmx
Cmo se revierte/neutraliza su efecto? Simplemente aumentando la concentracin de sustrato, ya que por la ley de probabilidad habr ms sustrato que compita por unirse a la enzima 2) NO COMPETITIVOS = no son anlogos estructurales del sustrato (es decir, no compiten con el sustrato por unirse al enzima en el CUS)
Poseen un propio sitio de unin al enzima denominado SITIO DE UNIN AL INHIBIDOR (CUI) El inhibidor siempre se une al complejo ES, ya que es necesario que la enzima est unida al sustrato para que quede libre el sitio al que se unir el inhibidor: E + S ES + I EIS Esto se explica por la sencilla razn de que la unin y formacin del complejo ES supone un cambio conformacional del enzima que facilitar la posterior unin del inhibidor no competitivo. OJO! El inhibidor no se unir al enzima libre, sino que ser requerimiento que la enzima se encuentre formando ya el complejo ES, es decir, ya unida al sustrato, para que el inhibidor pueda unirse.
Efecto sobre la reaccin enzimtica
Disminuirn la Vmx de la reaccin 92
BIOQ GENERAL Apenas modifican la Km (como no hay competicin la afinidad no se ve modificada)
93
3)
BIOQ GENERAL ACOMPETITIVOS o MIXTOS = tampoco son anlogos estructurales del sustrato ni se unen al CUS, pero pueden unirse tanto al enzima libre como al complejo ES
Al igual que los inhibidores no competitivos, poseen un propio sitio especfico de unin al enzima (CUI) distinto al CUS, con la diferencia de que ste estar *accesible en cualquier momento*, y no solo cuando se halla formado el complejo ES.
Efecto sobre la reaccin enzimtica Disminuirn la Km y la Vmx Son los inhibidores ms frecuentes tanto en rutas metablicas (RM) como en no metablicas. Existen otros 2 tipos de inhibicin que se dan exclusivamente en enzimas que forman parte de RUTAS METABLICAS: (1) inhibicin por sustrato e (2) inhibicin por producto 1) POR SUSTRATO: la inhibicin por sustrato es muy infrecuente (mecanismo poco habitual) porque para que una enzima pueda inhibirse por sustrato ha de presentar 2 centros de unin al sustrato (CUS) distintos: (1) activo de alta afinidad y (2) inactivo de baja afinidad
Uno de ellos funcional, completo y un centro normal, es decir, que se une al centro cataltico (CUS + CC) constituyendo un verdadero centro activo (CA), as que, catalticamente se encuentra activo (cuando el sustrato se une al enzima en este centro de unin se facilita la accin de los a catalticos y la consecuente formacin de producto). Adems se dice que es un CENTRO DE UNIN DE ALTA AFINIDAD ya que, en condiciones normales bajas [S] , ser el sitio al que se dirigir el sustrato. Del otro se dice que es un CENTRO DE UNIN DE BAJA AFINIDAD, ya que, cuando aumenta la concentracin de sustrato y solo cuando ello ocurra, ser el sitio al que se dirigir el sustrato (es unicamente un sitio de unin al sustrato). Es un centro incompleto e inactivo, ya que no se une al CC por lo que no forma el CA y carece de a catalticos, por lo que tampoco podrn transformar el sustrato en productos. No obstante, puede ralentizar la actividad cataltica del otro centro activo de alta afinidad, ya que secuestra una parte del sustrato que iba dirigida a l, y al unirse el sustrato a este 2 centro puede producir un cambio conformacional del enzima, que podra modificar estructuralmente al 1er centro, producindose el bloqueo de la reaccin por el bloqueo de la generacin de productos. As, podemos decir que el centro inactivo de unin de baja afinidad inhibe la actuacin del centro de unin activo de alta afinidad. En conclusin, no ser una inhibicin muy til o prctica, ya que requerir de una gran regulacin.
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BIOQ GENERAL
2)
P O R P R O D U C T O : m e c a
nismo habitual (debido a su sencillez) que emplea la clula para detener la formacin de productos, es decir, para bloquear la reaccin enzimtica y regular la velocidad de las enzimas que participan en rutas metablicas. Adems, su regulacin es tambin muy sencilla. Cuando la clula detecta un cierto aumento en la [P] ste no se suelta del complejo EP, sino que se queda unido al enzima, y por tanto impide el paso a nuevas molculas de sustrato: E+S ES EX EP E (libre para iniciar una nueva ruta metablica) + P*1
Es decir, *1este producto (P) se quedar unido al enzima, no se soltar, impidiendo el acceso a nuevas molculas de sustrato (S) que seguiran transformando producto (P), por lo que se bloquea su formacin. La enzima recibir una seal que le indicar que no suelte ese producto (P).
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BIOQ GENERAL
TEMA 5 REGULACIN ENZIMTICA
Introduccin Hasta ahora hemos visto mecanismos a travs de los cuales podemos modificar o regular la velocidad de las reacciones catalizadas por enzimas o enzimticas. Nos introducimos pues en un tema cuyo objeto de estudio es la propia actividad de la enzima. Por qu queremos regular la velocidad del enzima? En los seres vivos, y en concreto en los seres humanos, la mayor parte de las reacciones forman parte de rutas metablicas, y el producto (P) resultante de la reaccin se convierte en el sustrato (S) de la reaccin siguiente. Para degradar un sustrato hasta el producto final de la ruta metablica, es necesaria la actuacin de mltiples enzimas cuya misin ser ir obteniendo poco a poco la energa acumulada en el sustrato inicial. En estas rutas metablicas siempre habr una enzima/reaccin/etapa concreta que va a ser LIMITANTE* (clave en el funcionamiento de los frmacos y del organismo). REACCIN LIMITANTE (RL) S P1 P 2 P3 P 4
E 2 E 4
Misin: obtener energa en cantidades discretas (si se pretendiese hacerlo en cantidades ms grandes, mucha energa se perdera en forma de calor, situacin que no conviene a nuestras clulas). Esta enzima o reaccin es LIMITANTE en los siguientes aspectos: De la velocidad global de la ruta metablica Del sentido/direccin global de la RM (va a determinarlo) Adems: Suele ser irreversible = punto de NO retorno Siempre est controlada por un enzima que pueda ser regulable (no todas lo son) Ventaja que ofrece la RL: Permite el control de la ruta metablica, o bien en sus inicios (con el ahorro celular energtico que eso conlleva), o bien al final; es decir, controlando 1 sola reaccin podr ejercer un control sobre la RM en conjunto. Solo en rutas metablicas que son clave (fundamentales) para el organismo puede existir ms de una reaccin limitante. Por ej., en la glucolisis existen 3 reacciones limitantes: (1) una al principio que controla el destino direccin de la glucosa fosfatada; (2) otra al final por si fuera necesario dar marcha atrs y volver a los inicios, conservando intermediarios y volviendo a sintetizar la glucosa; y una (3) hacia la mitad de la RM. Cuanto ms importante es la ruta metablica o segn su relevancia dentro del metabolismo, ms reacciones limitantes tendr: RM* + RL En resumen, caractersticas de las RL: Son irreversibles Deben cumplir las ley de la termodinmica o principio de conservacin de la energa Son catalizadas por enzimas susceptibles de regulacin (no todas lo son) 96
BIOQ GENERAL
MECANISMOS DE REGULACIN DE LA ACTIVIDAD ENZIMTICA: (1) Regulacin alostrica y (2) Regulacin covalente, que a su vez se divide en reversible* (la ms comn que siguen las enzimas reguladas covalentemente) o irreversible (la menos comn). Antes de desarrollar cada uno de los mecanismos, cabe aclarar que un enzima puede sufrir regulacin alostrica y covalente a la vez, siempre que la covalente sea de tipo reversible, es decir, no son incompatibles sino todo lo contrario, son compatibles; en cambio, la regulacin alosterica s que ser incompatible con la covalente irreversible*. 1) Regulacin ALOSTRICA Solo la pueden sufrir enzimas formadas por ms de 1 cadena proteica, es decir, protenas oligomricas (ms de 1 subunidad). Es reversible, una de las razones por las que es la ms corriente en rutas enzimticas, ya que ser fcilmente reversible e inmediata. Cada subunidad podr disponerse de 3 formas distintas: (1) con un CA y un centro alostrico (*lo ms habitual*), (2) solo con un centro activo y (3) solo con un centro alostrico Puede ocurrir que las enzimas que la sufran, en cada una de las subunidades de esa enzima existan 2 centros: un centro activo (CA = CUS + CC) y un centro independiente de ese CA, denominado centro alostrico. Lo que ocurre ms habitualmente, o lo ms normal, es que en cada subunidad haya (1) un centro activo y (2) un centro alostrico [enzima 1] Pero tambin puede ocurrir que haya subunidades que solo tengan el CA o subunidades que solo tengan el centro alostrico [enzima 2]. En este caso estas enzimas se caracterizarn porque el CA siempre va a estar oculto (protegido) por las subunidades que contienen el centro alostrico. As, las subunidades que contienen el CA reciben el nombre de subunidades catalticas, mientras que las que contienen el centro alostrico son las subunidades reguladoras. La REGULACIN ALOSTRICA se basa en 2 tipos de interacciones (bsicamente en ambos casos subunidades con 2 centros o subunidades con 1 solo centro el mecanismo ser el mismo): (1) homotrpicas o de cooperatividad y (2) heterotrpicas. Este comportamiento homotrpico nos recuerda al comportamiento que sufra la hemoglobina; no obstante, el punto clave para afirmar que la hemoglobina no posee una regulacin alostrica es que sta no tiene especificidad, es decir, no tiene un sitio especfico de unin al sustrato donde pueda unirse el O2 (ste se une a la Hg porque sta tendr Fe, que ser el condicionante de la afinidad). As que concluimos que, aunque el mecanismo sea similar o equiparable, la Hb no ser una protena alostrica por su carcter inespecfico de unin al sustrato (adems ni si 97
*La Hemoglobina no es una enzima alostrica*
BIOQ GENERAL
quiera es un enzima ya que no realiza catlisis). 1. HOMOTRPICAS: son debidas a la unin del sustrato (S) a su centro de unin al enzima (CUS) S E -. La unin del sustrato a una de las subunidades del enzima provocar en esta subunidad una serie de cambios estructuras que facilitarn la unin del sustrato a la siguiente subunidad. Fundamentos de este comportamiento Esto est basado en que, por lo general, estas enzimas solo tienen una subunidad que posea el CUS accesible, y en el resto de las subunidades ese CUS estar poco o no totalmente accesible a ese sustrato. As, cuando se produce la unin del sustrato a su CUS accesible, se produce un cambio de morfologa que permite (abre) el acceso a otro centro de otra subunidad (antes oculto), y as sucesivamente. De esta manera aunque disminuya la concentracin de sustrato, ste se seguir uniendo al CUS accesible, provocando el consiguiente cambio estructural que har ms accesible al CUS de la siguiente subunidad. Representacin grfica: SIGMOIDE Este comportamiento homotrpico que siguen las enzimas alostricas se puede representar grficamente: velocidad (eje y) frente a la concentracin del sustrato (eje x). o La cintica de unin al sustrato resultar pues de tipo sigmoidea, en la que se observa que a bajas [S] la enzima apenas tiene poder cataltico. o As, el S se unir a las subunidades en las cuales el CUS se encuentre accesible (pero no al resto). o Otra cosa que podemos observar mediante esta grfica es que, a altas velocidades todas las enzimas tendrn el sustrato unido; la enzima posee su mximo poder cataltico. La enzima se puede encontrar en 2 estados: tenso (T) o relajado (R) Este comportamiento sigmoide implica que la enzima puede estar en 2 estados: TENSO (T): en el que existe interaccin mxima entre las distintas subunidades (ms estable y por tanto baja afinidad) RELAJADO (R): de alta afinidad por el sustrato, en el que todas las subunidades llevan unido sustrato (las interacciones entre las distintas subunidades se han roto al producirse la unin del sustrato a causa del cambio conformacional, as que son mnimas; menos estable y por tanto alta afinidad por el sustrato)
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BIOQ GENERAL
Forma T (Tensa) = + interacciones dbiles/ enlaces inicos, + estable, menos afinidad Forma R (Relajada) = - interacciones dbiles/enlaces inicos, - estable, ms afinidad Explicacin de la transicin estructural entre las distintas subunidades en base a 2 modelos: (1) de Monod y (2) de Koshland (el fisiolgico) I. Modelo de MONOD o modelo de todo o nada: la unin de un sustrato a una subunidad implica un cambio estructural automtico del resto de subunidades. As que, segn Monod, la enzima solo se poda encontrar en 2 estados: (1) normal o (2) cambiado. II. Modelo fisiolgico de KOSHLAND (contrario al de Monod): la unin de una molcula de sustrato a una subunidad no implica el cambio estructural automtico del resto de enzima o subunidades, sino que este cambio estructural se producir de forma paulatina/progresiva (subunidad por subunidad).
As que, segn Koshland, la enzima va pasando por distintos estados (segn el > < tiempo de reaccin) Este modelo explica mejor el comportamiento enzimtico alostrico homotrpico, pues ste no se produce de una forma tan brusca como expone Monod. 2. HETEROTRPICAS: son debidas a la unin de un modulador (cualquier molcula del sustrato) al centro alostrico de las enzimas (sitio al CUS). Estos modulares se conocen como REGULADORES: molculas que se unen al centro alostrico con la misma especificidad que lo hace el sustrato a su CUS. Conclusin: un centro alostrico es especfico para su modulador o regulador, ser el nico sitio del enzima al que se pueda unir el modulador (*lo que no ocurra en la Hb, pues sta no posea un sitio especfico) y un modulador alostrico puede actuar sobre distintas enzimas 2 tipos de moduladores: (1) positivos o efectores alostricos y (2) negativos o inhibidores alostricos Existen 2 tipos de molculas (moduladores o reguladores) que se pueden unir al centro alostrico: I. Reguladores que potencian/aumentan la capacidad cataltica de la enzima = EFECTORES ALOSTRICOS o MODULADORES/REGULADORES POSITIVOS Se unen al enzima estabilizando la forma R o de alta afinidad por el sustrato o mximo poder cataltico del enzima. II. Reguladores que disminuyen la actividad del enzima = INHIBIDORES* ALOSTRICOS o MODULARES/REGUL ADORES NEGATIVOS
*No es una denominacin muy 99
BIOQ GENERAL
correcta porque no llegan a bloquear por completo al enzima. Se unen al enzima estabilizando la forma T de baja afinidad por el sustrato o de mnimo poder cataltico del enzima. Todas las enzimas clave del metabolismo tienen un mecanismo de regulacin alostrico.
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BIOQ GENERAL
En resumen: REGULACIN ALOSTRICA ENZIMAS ALOSTRICAS = oligomricas Poseen 2 tipos de subunidades: (1) catalticas o (2) reguladoras su actividad cataltica va a depender siempre de la unin de 1 modulador alostrico a las subunidades reguladoras (*la enzima jams va a poder unirse al sustrato si no hemos hecho antes accesibles sus centros de unin). Se basa en 2 tipos de interacciones: Homotrpicas: unin del sustrato a su CUS afinidad cambio estructural modifica la
Heterotrpicas: unin del modulador o regulador (+ -) al centro alostrico estabilizacin de la forma T o de la forma R de alta afinidad por el S o mx. poder cataltico del enzima
2) Regulacin COVALENTE Junto a la regulacin alostrica constituye una de las regulaciones ms habituales que se dan en el metabolismo. Caractersticas generales Tpica de enzimas que pueden existir en 2 formas estructurales distintas, a saber: (1) una forma se encontrar en su estado activo (2) otra forma en su estado inactivo Pudiendo ser cualquier de los 2 su estado natural o de mxima estabilidad (estructura nativa). As, segn lo que nos convenga, podremos activar o inhibir cualquiera de las 2 formas. En conclusin, una enzima, sea cual sea su estructura proteica* puede adoptar una 2 forma estructural: en una de las estructuras la enzima ser ms activa y en la otra ser menos activa. *Siempre estar en su forma nativa o de mxima estabilidad, que puede estar activa o inactiva. Por tanto, la regulacin covalente consiste en una MODIFICACIN QUMICA de esta enzima que estabiliza una de sus dos estructuras.
Semejanza con la RA: ambas se dan en enzimas que pueden encontrarse en 2 estados formas T R. alostrica y R (de menos y de ms afinidad por el sustrato) R. covalente activa e ms y de actividad formas inactiva (de menos cataltica) 101
BIOQ GENERAL
Diferencia con la RA: sta NO implicaba un cambio qumico R. alostrica que la enzima se encuentre en una forma u otra se deba a un cambio exclusivamente morfolgico R. covalente que la enzima se encuentra en una forma u otra se debe a un cambio qumico Hay 2 tipos de regulacin covalente: 1. Reversible (la ms comn que siguen las enzimas reguladas covalentemente) 1. Regulacin covalente REVERSIBLE Cuando la modificacin qumica consiste en la formacin de un enlace covalente reversible (se forma/rompe de forma rpida). Muy habitual en el organismo (metabolismo). Implica la participacin obligatoria de una 2 enzima que tiene que modificar qumicamente a la enzima que va a sufrir la regulacin covalente. Comnmente la formacin de este enlace covalente implica la unin de un grupo a la enzima, que principalmente puede ser de 3 tipos: (1) fosfato, (2) metilo y (3) adenilo (normalmente AMP). o Independientemente del grupo que se una a la enzima, ste aportar cargas q (lo que generar interacciones inicas en la enzima), que son las responsables de la estabilizacin de esa estructura enzimtica (activa o menos activa). o Por regla habitual ese grupo se suele unir a un a que se encuentra en el CA de la enzima, con el fin de modificar (bloquear/potenciar) su actividad cataltica; aunque tambin lo podr hacer, de forma mucho menos habitual, a cualquier a del enzima. o En resumen: Este mecanismo (unin de un grupo al enzima) ser el que nos encontremos habitualmente en la regulacin covalente, con el nico requisito de que la enzima pueda sufrir un cambio en su estructura a travs de la adicin de uno de estos grupos mediante un enzima covalente, que estabilizarn bien la forma ms activa o bien la forma menos activa (ya que aportan cargas). Conclusin: estos grupos activarn o no al enzima. El nico requisito que debe de tener un enzima para covalentemente debe ser el de tener ms de una estructura, es decir, implica la participacin obligatoria de una 2 enzima que aada (o que quite) ese grupo = + de 1 enzima Este hecho de que una enzima modifique a otra enzima, que a su vez pueda modificar a otra, y as sucesivamente (participacin de 2s enzimas que aadan o quiten esos grupos), es muy habitual, y se denomina CASCADA DE REGULACIN COVALENTE. poderse regular 2. Irreversible (la menos comn)
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BIOQ GENERAL
Regulacin covalente reversible POR FOSFATO (es la ms habitual) Nexos de unin para el fosfato Cuando el grupo fosfato se une a una enzima regulada covalentemente, normalmente lo hace a un residuo grupo hidroxilo (-OH) de su cadena lateral R - de SERINA (en el 90% de los casos), que se encuentra en el centro activo (en el CUS en el CC) de esa enzima. Tambin puede aparecer unido a residuos de tirosina (menos habitual) y de forma mucho menos frecuente a residuos de histidina o treonina. En resumen: La mayora de las veces al grupo OH de la SERINA (polar sin carga) A veces al grupo OH de la tirosina (apolar aromtico) Casi nunca al grupo OH de la treonina (polar sin carga) o a residuos de histidina
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BIOQ GENERAL
Enzimas que catalizan la unin de fosfato (P): QUINASAS Mecanismo general de accin: sacan el grupo (P) de la ruptura/hidrlisis del ATP, molcula rica en energa por poseer 3 grupos fosfato P en su estructura; as con esta ruptura se generar energa en forma de ADP y se liberar fosfato libre, fundamental para el organismo. Objetivo: A travs de estas quinasas una enzima que no tena 1 grupo fosfato unido, lo podr aadir para que as pueda sufrir la regulacin covalente. Cmo aadimos el grupo fosfato P a una enzima? Siempre a travs de la enzima quinasa. Cascada de regulacin covalente: stas, a su vez, pueden estar reguladas covalentemente Esta quinasa estar a su vez regulada covalentemente por otra quinasa, que le aadir ese grupo fosfato, y sta a su vez estar regulada por otra CASCADA DE quinasa, etc. = REGULACIN COVALENTE As es cmo funcionan el 90% de las hormonas (transmisin de seales al interior de la clula) Mecanismo de eliminacin de fosfato desfosforilacin o (P): FOSFATASAS
Al igual que existe el mecanismo expuesto de fosforilacin, existe un mecanismo de defosforilacin o eliminacin de ese fosfato (P), llevado a cabo por fosfatasas, que a su vez tambin pueden estar reguladas en cascada. En resumen: tantos las QUINASAS (fosforilacin) como las FOSFATASAS (desfosforilacin) son susceptibles de sufrir una regulacin covalente en cascada, pero no obligatoriamente ocurre siempre as; en ocasiones podr darse la actuacin de una sola quinasa o una sola fosfatasa.
OJO! Estamos suponiendo que la forma fosforilada es la forma activa de la enzima, pero no tiene porque ser siempre as. 2. Regulacin covalente IRREVERSIBLE Consiste en la transformacin de una protena/enzima mediante la eliminacin irreversible de una de sus partes que hace que sea funcional. Es tpica de los ZIMGENOS = protenas/enzimas que con una estructura concreta no son funcionales por lo que necesitarn perder parte de su estructura para volverse funcionales. Esta prdida de una parte de la estructura proteica se producir de forma irreversible, y as se quedarn activados para siempre o hasta que les llegue una seal que las cese. 104
BIOQ GENERAL
La sufren habitualmente enzimas que participan en la digestin o en la cascada de coagulacin sangunea.
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BIOQ GENERAL
TEMA 6 COENZIMAS
Introduccin Hay enzimas que para ser funcionales necesitan de la participacin de una molcula que les aportar ese ltimo detalle que les falta para serlo, es decir, requieren llevar una molcula unida, o bien: Un grupo necesario para la catlisis Una molcula que estabilice al centro cataltico (CC) de la enzima Estas molculas necesarias para que la enzima lleve a cabo su actividad cataltica o para que se haga funcional se unen a ella, y reciben el nombre de COFACTORES. En general, independientemente del tipo de cofactor: o Cuando ste se encuentre unido fuertemente a la protena o enzima recibir el nombre de GRUPO PROSTTICO o Cuando ste se encuentre unido de forma normal, dbil, a la protena o enzima constituir el COFACTOR propiamente dicho Los cofactores se encuentra unidos a la enzima de forma ms dbil de la que se encuentra el grupo prosttico. Existen 2 tipos de cofactores: 1. METLICOS u INORGNICOS = iones. Entre los ms abundantes destacamos: Fe2+, Mg2+ y Cu+. Pueden actuar: (1) En la catlisis propia (2) De puente entre la enzima y el sustrato (3) Estabilizando la estructura de la enzima
Dentro de los cofactores metlicos u inorgnicos, dependiendo de la unin de ese cofactor metal (in) a la enzima distinguimos 2 tipos de complejos enzimticos: METALOENZIMAS: si la unin del cofactor metlico (in) a la enzima es fuerte o En este caso los iones metlicos u inorgnicos se conocen como grupos prostticos ENZIMAS ACTIVADAS POR UN METAL: si la unin del cofactor metlico (in) a la enzima es dbil o En este caso los iones metlicos u inorgnicos no seran grupos prostticos sino cofactores metlicos propiamente dichos. 2. NO METLICOS u ORGNICOS, tambin conocidos con el nombre de COENZIMAS Actan transfiriendo o bien GRUPOS o bien ELECTRONES entre: 2 sustratos = *lo ms habitual* 106
BIOQ GENERAL
S1X + S2 S1 + S2X Siendo X = un grupo un electrn La enzima transferasa (cataliza la transferencia de un grupo qumico) no reconocera al sustrato si no fuera por la presencia de la coenzima, es decir, si la coenzima no se uniera a la enzima no se producira la transferencia de grupo o de electrn de un sustrato a otro. Un sustrato y una enzima: S E
Cabe apuntar que todos los cofactores (incluyendo los metlicos), para que se lleve a cabo la reaccin, van a implicar a 2 sustratos, es decir, sta sera la reaccin clsica o la forma ms habitual, aunque tambin se pueda dar entre sustrato y enzima. Caractersticas: Las coenzimas, a diferencia de las enzimas son TERMOESTABLES. Se pueden transformar qumicamente en el transcurso de la reaccin, pero lo harn de forma REVERSIBLE (la transformacin no es irreversible), es decir, se regeneran al finalizar la reaccin. Son INESPECFICAS, no participan en la especificidad de la reaccin, es decir, una misma coenzima puede actuar con distintas enzimas, siendo el grupo/funcin que transfiere siempre el mismo; las que determinan la especificidad de la reaccin son las enzimas. REGENERACIN Las coenzimas sufren un cambio qumico y se regeneran al final de la reaccin. Esta regeneracin qumica de las coenzimas puede llevarse a cabo de 2 formas: (1) forma directa y (2) forma indirecta 1) Regeneracin DIRECTA: Una enzima libre trabaja con una coenzima libre y ambas se unen formando el complejo E1-CoE para actuar sobre el S1, que tiene un grupo o electrn X que transferir. Resultado: el grupo o electrn X queda aadido al complejo E1-CoEX gracias su unin al CoE. La misin concreta de la CoE ser transportar el grupo o electrn X, ya que la E solo podr unir esta X si se encuentra unida al CoE. El complejo E1-CoEX acta o cataliza al S2 y le aade el grupo o electrn X. La E1 y la CoE quedan libres. Entonces la CoE sufre una transformacin qumica y ambas, enzima y coenzima, se regeneran.
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BIOQ GENERAL
La y la
enzima
coenzima se encuentran por separado; cuando es necesario llevar a cabo su actividad cataltica se unen en un complejo enzimacoenzima (E-CoE). La enzima reconoce dos sustratos, un sustrato primero (S1) que va unido al grupo que es preciso transferir, y con el que la coenzima lleva a cabo la siguiente reaccin:
E1 CoE + S1 E1 CoE + P1
Acto seguido, la enzima, cuyo cofactor ya va unido al grupo a transferir, reconoce un segundo sustrato (S2), al que une el grupo a transferir segn la siguiente reaccin:
E1 CoE + S 2 E1 CoE + P2
Despus de este paso, enzima y coenzima se desunen, y vuelven a su estado inicial.
2) Regeneracin INDIRECTA 108
BIOQ GENERAL
Un enzima (E1) reacciona con una coenzima (CoE) dando lugar al complejo E1-CoE, con el objetivo de poder transferir un grupo o electrn X de un sustrato a otro. As el complejo reacciona con S1X y el grupo o electrn X se queda aadido al complejo, con la consiguiente liberacin de producto (P1). Este complejo (E1-CoEX) reacciona con una segunda enzima (E2), liberndose E1 (vuelve a su estado inicial) y quedando la coenzima y el grupo o electrn X aadidos a E2 (E2-CoEX). As este complejo reacciona con S2, al cual cede el grupo o electrn X, con la consiguiente liberacin de producto (P2). Por fin la E2 y la CoE quedan libres. Entonces la CoE sufre una transformacin qumica; entonces la enzima volver a su estado inicial y la coenzima se regenera tal cual estaba al inicio. Esta regeneracin se realiza PARA SUSTRATOS TOTALMENTE DIFERENTES, es decir, para cuando el sustrato al que se retira el grupo a transferir (X), y el sustrato al que se transfiere el grupo son muy diferentes entre s, y por tanto requieren una enzima con distinta especificidad. En conclusin: E1 pierde la CoEX al reaccionar con S1 porque otra enzima E2 se la arrebata CoEX pierde el grupo o electrn X cuando reacciona con el segundo sustrato S2 ya que ste queda aadido a l (S2X)
La
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BIOQ GENERAL
primera reaccin se lleva a cabo de manera muy semejante a la regeneracin directa: se constituye el grupo E1-CoE, que es especfico para un sustrato 1 (S1) al que se le retira el grupo a transferir
E1 CoE + S1 E1 CoE + P1
Despus, el complejo coenzima + grupo a transferir se separa de la enzima 1 que queda libre, y se une a otra enzima (E2) especfica para el sustrato 2 (S2) al que se le transfiere el grupo
E 2 CoE + S 2 E 2 CoE + P2
Despus de este paso se desune el complejo E2-CoE, siendo posible la unin de la coenzima a la E1 para volver a llevar a cabo la reaccin. OJO! En la regeneracin indirecta el CoE reacciona con una segunda enzima (E2), que ser a la que se una el complejo CoEX y, a continuacin, este complejo E2CoEX reaccionar con el S2, que ser al que ceda el grupo.
Conclusin final: sin la unin de la coenzima a la enzima el grupo o electrn X no se podra transferir.
Estructura de las coenzimas: PARTE VITAMNICA Normalmente las CoE poseen dentro de su estructura un componente vitamnico de naturaleza hidrosoluble, lo que condiciona el resto de sus caractersticas: Al ser hidrosolubles son, evidentemente, solubles en agua (es decir, polares, no inicas) De fcil absorcin intestinal y eliminacin No txicas porque no se almacenan en los humanos A diferencia de las vitaminas de naturaleza liposoluble: No se absorben fcilmente y se Insolubles en agua eliminan con dificultad Transportan lipoprotenas 110
BIOQ GENERAL
Son txicas por ingesta excesiva porque se almacenan en el hgado y en el TJ adiposo patolgico
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BIOQ GENERAL
Las vitaminas son indispensables para el organismo, pero como ste no las puede sintetizar, por eso resulta fundamental su ingesta. Tipos de CoE Debido a la posibilidad de que exista un complejo vitamnico en su estructura, las CoE se clasifican segn este criterio, es decir, segn lo posean o no lo posean: (1) Vitamnicas o (2) No vitamnicas. Adems, esto determinar su capacidad de transferir grupos qumicos o electrones. (1) CoE CON PARTE VITAMNICA (que los humanos solo podemos adquirir a travs de la alimentacin) Estas CoE vitamnicas no las podremos sintetizar sin la presencia de vitamina en el organismo, por lo que su ausencia (al contrario que su exceso, muy habitual) generar enfermedad o patologa.
Coenzima
Parte vitamnica
Grupo que transfiere
Patologa asociada por carencia Beriberi
VITAMNICAS TRANSPORTADORES DE GRUPO Pirofosfato de Vit.B1 = Tiamina Tiamina (TPP) cido Vit.B9 = cido Tetrahidroflico flico
Aldehdos Fragmentos monocarbonados
Anemia macroctica Espina bfida Deficiencia poco habitual: [1] presentes en muchos alimentos, [2] el organismo las requiere en pocas cantidades y [3] son sintetizadas en el intestino por bacterias (para ellas no son necesarias) CoE A (CoA) Vit.B5 = cido Acilo c. grasos Difcil que se pantotnico produzca Piridoxal Fosfato Vit.B6 = Piridoxal Amino Difcil que se (PLP) produzca Biocitina Biotinil Vit.B8 = Biotina Carboxilo Difcil que se Enzima produzca Adenosil Metil Vit.B12 = Metilo, alquilo Difcil que se Cobalamina Cobalamina produzca TRANSPORTADORES DE ELECTRONES Esenciales para el metabolismo Nucletidos de Vit.B2 = Electrones Difcil que se Flavina (FMN, Riboflavina produzca Puede aceptar FAD) Se asocia con 2H+ y 2e- gracias otra molcula: a su anillo de Si es fosfato (P) isoaloxacina = FMN
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BIOQ GENERAL
Si es adenina = FAD
nitrogenado (se carga en las reacciones red/ox que sufre al transferir e- y H+)
Caractersticas de algunos CoE vitamnicos Transportadores de grupo Pirofosfato de tiamina (TPP) ~ Vit.B1 Tiamina La Tiamina o Vit.B1 ser necesaria para completar la estructura de la coenzima TPP, es decir, si no adquirimos mediante la dieta esta vitamina, no seremos capaces de forma la TPP; s que podemos sintetizar una parte de ella, pero la sntesis completa se produce con la adquisicin de la Vit. B1. As, la enfermedad carencial resultante es el Beriberi. As, al resto de CoE vitamnicas les suceder igual, que requerirn de su parte vitamnica ingerida en la dieta para poder completar su estructura, y si sta ingesta fuese insuficiente se generarn patologas. CoE A (CoA) ~ Vit.B5 cido Pantotnico La CoA resulta esencial para el metabolismo de los lpidos o cidos grasos. Su misin consiste en marcar a los lpidos o cidos grasos mediante su unin a ellos; si no la clula no sabr que puede sintetizarlos, es decir, no sabe de su existencia en el organismo por lo que no los podr degradar. Por qu el marcaje de los azcares o hidratos de carbono es distinto, y se realiza aadiendo un grupo fosfato en vez de la CoA? Esto se debe a 2 razones: (1) para distinguir el metabolismo y (2) para garantizar algo de degradacin (mecanismo de supervivencia), ya que si tuvieran el mismo marcaje y ste fallara, nos quedaramos sin poder degradar nada, y si en nuestro organismo no hay flujo de energa se dar lugar a un equilibrio de vida. Por tanto, la CoA se une a los acilos o cidos grasos (cadenas hidrocarbonadas) y permite su metabolizacin. cido Tetrahidroflico ~ Vit.B9 cido Flico Participa en el metabolismo de cidos nucleicos. Su carencia implica una grave repercusin patolgica, ya que supone la aparicin de anemia macroctica, que es la incapacidad de la mdula espinal para sintetizar el grupo hemo de la hemoglobina (Hb). La consecuencia de esta carencia deriva en otra patologa, y es que impide durante el desarrollo prenatal (intrauterino) el cierre correcto del tubo neural (conformador del futuro sistema nervioso). La mdula espinal se cierra por un vaina en los primeros meses de gestacin, por lo que una carencia de cido flico impedir este cierre, producindose la espina bfida. Por esta razn se les recomienda a las mujeres embarazadas un incremento en el consumo de alimentos que contengan cido flico, especialmente antes y durante los primeros das de embarazo o gestacin (24-28), pues resultar esencial para la correcta formacin del tubo neural. La espina bfida consiste en que la mdula espinal se queda abierta o mal cerrada, lo que conlleva un alto riesgo de infeccin. En los casos ms graves de espina bfida, el cierre del tubo
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BIOQ GENERAL
neural ha fracasado totalmente, y es entonces cuando se observa un bulto en la columna vertebral del recin nacido, correspondiente a la salida de la mdula espinal hacia fuera (en ambas partes o solo en una de las partes). En realidad al cido flico es abundante en muchos alimentos (cualquier tipo de vegetal verduras , carnes rojas hgado, morcilla, chorizo-) y adems tambin es sintetizado en nuestro intestino por bacterias, por lo que si se sigue una dieta adecuada, no tendra que haber ningn problema de dficit de esta vitamina.
Transportadores de electrones Nucletidos de Flavina (FMN, FAD) ~ Vit.B2 Riboflavina Van a transportar electrones gracias a que los nucletidos de Flavina tienen un anillo de isoaloxacina, el cul posee dos nitrgenos que pueden actuar como aceptores/dadores de 2 electrones (e-) y 2 protones (H+). Esto resulta fundamental para la transferencia de e-. o Cuando el anillo tiene H+ - estado reducido o Cuando el anillo no tiene H+ ya que lo ha perdido estado oxidado Participa en reacciones mediadas por deshidrogenasas (localizadas fundamentalmente en las mitocondrias). o La enzima clave que acta con el nucletido de flavina es el succinildeshidrogenasa (vital en el metabolismo central energtico). Constituyen el ejemplo tpico de una unin fuerte a la enzima (es decir, prcticamente no se separan de ella) grupos prostticos FAD+ (en estado oxidado porque ha cedido e-) FADH2 (en estado reducido porque ha ganado e ) *El + significa que ese N podr captar o no electrones, no que su carga sea positiva, pues al tener ncleos fosfato el FAD tiene carga negativa. Oxidacin = prdida de electrones Reduccin = ganancia de electrones
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BIOQ GENERAL
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BIOQ GENERAL
TEMA 7: GLCIDOS (azcares) o CARBOHIDRATOS (hidratos de carbono)

Introduccin
Los Carbohidratos no poseen una funcin tan caracterstica o especfica como la de las protenas, por eso estudiaremos ms a fondo su metabolismo que su forma estructural.
Clasificacin. En 2 grandes grupos, ampliamente ramificados:

(1) OSAS MONOSACRIDOS (2) SIDOS Holsidos (solo azcares) Oligosacridos [3-12 monosacridos] Polisacridos o Heterosacridos [> 12 monosacridos] o Homopolisacridos (repeticin del mismo azcar) o Heteropolisacridos (repeticin de distintos azcares) Hetersidos (azcar + molcula no glucdica = protena o lpido)
1) OSAS MONOSACRIDOS
Son las unidades estructurales bsicas de todos los hidratos de carbono, es decir, no se pueden descomponer en unidades ms sencillas. Se caracterizan porque estn formadas por un carbono carbonilo y otros carbonos que portan una funcin alcohol (grupos hidroxilo -OH). El grupo carbonilo puede ser: Aldehdo = se encontrar en los extremos (normalmente en el C1) Cetona = se encontrar entre medias, nunca en los extremos (normalmente en el C2)
Clasificacin. Se pueden clasificar segn 2 criterios:

a) Segn el grupo carbonilo: (1) ALDOSAS = un grupo aldehdo en su estructura (2) CETOSAS = un grupo cetona en su estructura b) Segn el nmero de carbonos que los constituyen: Triosas (3 tomos de carbono) o Aldotriosas Ej.: *Gliceraldehdo* (clave en el metabolismo, G3P, esencial intermediario en la gluclisis o respiracin celular) o Cetotriosas Ej.: *Dihidroxiacetona* (clave en el metabolismo, DHAP, tambin esencial intermediario en la gluclisis, que se transforma en G3P) Tetrosas (4 tomos de carbono) o Aldotetrosas 116
BIOQ GENERAL o Cetotetrosas Pentosas (5 tomos de carbono) o Aldopentosas Ej.: Ribosa, Desoxirribosa o Cetopentosas Ej.: Ribulosa Hexosas (6 tomos de carbono) o Aldohexosas Ej.: Glucosa, Galactosa, Manosa o Cetohexosas Ej.: Fructosa (no olvidar que dentro del metabolismo sintetiza glucosa)
Caractersticas (derivadas de su estructura)

Todos son hidrosolubles, es decir, se pueden disolver en agua, lo que no quiere decir que se ionicen. Su enorme solubilidad se debe simplemente a la abundancia de grupos hidroxilo OH, por lo que podrn reaccionar con el H2O mediante interacciones dbiles. Todos poseen al menos un tomo de carbono asimtrico (con los 4 radicales o sustituyentes esto tambin lo vimos en protenas distintos) Excepcin!: la DIHIDROXIACETONA (DHA) no posee ningn carbono asimtrico, ya que no posee un carbono con los 4 sustituyentes . La existencia de este Casimtrico hace que existan ismeros segn la posicin que adopte el grupo OH del Casimtrico: Grupo OH a la derecha = forma D Grupo OH a la izquierd a = forma L Son imgenes especulares la una de la otra. Si el monosocrido tuviera ms de 1 Casimtrico, cul de estos carbonos tomaramos como punto de referencia para clasificarlo en la forma D o en la forma L? El Casimtrico ms alejado del grupo carbonilo. Los monosacridos ms frecuentes en humanos (no en otras especies) son los D-monosacridos 99,9% - (grupo OH del Casimtrico a la derecha). Adems, a diferencia de lo que ocurra en protenas (La los comunes y D-a txicos), los L-monosocridos no son txicos, lo nico que ocurre es que son menos frecuentes porque son reconocidos por pocas enzimas. Esto va a tener una gran implicacin clnica. Adems poseen la capacidad de poder desviar el plano de la luz polarizada (lo que no tiene nada que ver con las formas D y L). Esto significa que si hacemos incidir un rayo de luz polarizado con una longitud de onda determinada () podemos distinguir 2 formas: Si la desvan a la derecha = (+) 117
BIOQ GENERAL Si la desvan a la izquierda = (-) Esto no va a tener trascendencia clnica. Ningn monosacrido va a ser esencial para los humanos pues los sintetizamos de forma endgena. Excepcin!: la Vit.C cido Ascrbico. Es una osa con funcin vitamnica y constituir el nico azcar que los humanos no podemos sintetizar. Los monosacridos dentro las clulas o de la sangre (fisiolgicamente) no se encuentran en forma lineal, si no en forma ciclada. Esta ciclacin se produce por la reaccin del grupo carbonilo con el grupo OH del Casimtrico ms alejado de este grupo carbonilo. Por tanto, lo ms habitual es encontrarse a los monosacridos en su forma ciclada.
Una vez ciclado el carbono carbonilo pierde su funcin, pasando a llamarse carbono ANOMRICO (mismo carbono pero sin su funcin carbonilo). Este Canomrico poseer 2 formas ismeras, dependiendo de la posicin de su grupo hidroxilo OH. o Si su grupo OH se sita en el mismo plano que el O que ha dado lugar al ciclo = forma o Si su grupo OH se sita en plano que el O = forma Por tanto, aparece un nuevo Canomrico: o -OH parte de arriba = o -OH parte de abajo = Esto ser importante fisiolgicamente hablando pues en el cuerpo se van a dar reacciones esteroespecficas (enzimticas), es decir, que reconocern si el grupo OH del Canomrico se sita o no en ese plano. Reconocern nicamente a la forma (si cambia a se producirn patologas comunes). Segn la estructura sea en hexgono o en pentgono, ser una furanosa o una piranosa. El enlace ser hemiacetal en caso de que el carbonilo sea aldehdo, o hemicetal, en caso de que el carbonilo sea una cetona. 2)
SIDOS. Asociaciones de monosacridos dan lugar a hidratos de carbono (sidos) ms complejos.
Funciones en humanos
1. ENERGTICA. Poseen bsicamente una funcin energtica (aunque no es la nica funcin que tienen). Proporcionan energa de forma rpida, por lo que su degradacin es vital cuando el metabolismo requiere energa de forma urgente (por eso la glucolisis es una de las rutas metablicas ms importantes, porque se activa rpidamente antes la demanda). No obstante, la energa que proporcionan no es muy abundante. 118
BIOQ GENERAL Constituyen la nica fuente de energa en condiciones anaerobias (en de oxgeno), por eso los carbohidratos resultan tan fundamentales y se encuentran tan regulados.
2. ESTRUCTURAL. Se hallan formando parte de estructuras rgidas o unidos a protenas (formando grupos prostticos). 3. SEALIZADORES CELULARES. Sirven para identificar clulas (glucoclix, sistema ABO, etc.) 4. FORMAN PARTE DE MACROMOLCULAS. No solo forman parte de protenas y lpidos, sino tambin de cidos nucleicos (ADN, ARN).
DISACRIDOS = sidos ms sencillos, formados por asociaciones de 2 osas monosacridos a travs
de un enlace O-glucosdico, el cual consiste en la interaccin de 2 monosacridos = a travs de 2 de sus grupos alcohol (-OH), dando lugar a una reaccin de deshidratacin (liberacin de 1 molcula de H2O). En la formacin del enlace O-glucosdico: Si participan los 2 hidroxilos de los 2 carbonos anomricos, el enlace ser dicarbonlico, y el disacrido carecer de poder reductor Si reacciona slo 1 de los carbonos anomricos con otro -OH cualquiera, el enlace ser monocarbonlico, y el disacrido tendr poder reductor.
Ejemplos de disacridos comunes:

Sacarosa = Glucosa + Fructosa Maltosa = Glucosa + Glucosa glucosa Lactosa = Glucosa + Galactosa Celobiosa lo que en principio parece una desventaja, y es que no la podemos digerir, se convierte en una ventaja fisiolgica, pues nos proporciona fibra, la cual tiene un efecto de proteccin en cncer de colon. Disacrido no reductor esencial para el almacenaje de
Concepto de EPMEROS: 2 monosacridos son epmeros entre s cuando se diferencian en un solo sustituyente de un solo carbono.
Cabe apuntar que tanto aldohexosas/cetohexosas pueden dar lugar a cualquiera de las 2 estructuras cclicas: furano = pentgono, o pirano = hexgono
REACCIONES GLUCDICAS (solo hay que saberse 3: mutarrotacin, esterificacin y sustitucin)
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BIOQ GENERAL 1. CAPACIDAD DE MUTARROTACIN: a diferencia de los aminocidos los azucares van a estar mutando, es decir, todos los monosacridos mutan entre (1) su forma lineal D L, (2) su forma cclica pirano furano Esta capacidad va a afectar normalmente al azcar ciclado. As, cuando un azcar se cicla, el 60% se mantendr en esa forma ciclada (por ej.: ) frente a un 30% que se mantendr en la otra forma posible (por ej.: ); un 9% se encontrar como anillo de pirano frente a un 1% que se encontrar como anillo de fuerano El organismo emplea este fenmeno de la mutarrotacin para regular las rutas metablicas. 2. OXIDACIN: su importancia no radica a nivel del metabolismo si no a nivel alimentario (de la dieta). Por ej.: el cido glucurnico (cido carboxlico similar a la glucosa pero que presenta un grupo carboxilo en el C6, por lo que es muy hidrosoluble) no se metaboliza, si no que se mantiene en su forma oxidada formando parte de la matriz extracelular. 3. ESTERIFICACIN: unin/reaccin del grupo fosfato P o sulfato S a un grupo hidroxilo OH del azcar. As, todos los azcares para poder ser metabolizados, sufren esterificacin. La reaccin clave fisiolgica es con fosfato, que se suele unir al grupo OH en el C1 o al C6. Esta reaccin es metablicamente fundamental, ya que es el marcaje de glcidos. 4. SUSTITUCIN: en un grupo hidroxilo OH de un carbono se aade un grupo metilo o amino.
POLISACRIDOS (> de 12 monosacridos)

a) Si el monosacrido que se asocia es siempre el mismo = HOMOPOLISACRIDOS ALMACENAMIENTO/RESERVA ENERGTICA = Glucgeno ESTRUCTURALES (poco presentes en humanos) = Quitina
b) Si el monosacrido que se asocia no es siempre el mismo, es decir, si se unen distintos tipos de monosacridos = HETEROPOLISACRIDOS NITROGENADOS = cido hialurnico, Sulfato de condroitina y Queratn sulfato NO NITROGENADOS
a) HOMOPOLISACRIDOS 120
BIOQ GENERAL Principales HOMOPOLISACRIDOS De ALMACENAMIENTO o RESERVA ENERGTICA ESTRUCTURALES
En animales (fisiolgico) En vegetales
*GLUCGENO* ALMIDN Anlogo vegetal del glucgeno, formado tambin por repeticiones de glucosa aunque con menos ramificaciones y nuestra principal fuente de glucosa.
QUITINA (uas, pelo) CELULOSA
GLUCGENO: principal homopolisacrido de reserva o almacenamiento energtico en humanos Se trata de asociaciones de -glucosas mediante enlaces 1 4 entre el grupo OH del C1 y el grupo OH del C4 de la siguiente glucosa. Si esta asociacin es lineal, la molcula se denomina AMILOSA, la cual posee un extremo no reductor y un extremo reductor (no qumicamente activo). Si esta asociacin es ramificada (c/ 8-10 molculas de glucosa aparece una ramificacin), es decir, una serie de molculas de glucosa se enganchan a otra serie de molculas (que a su vez pueden estar ramificadas) mediante enlaces 1 6, la molcula se denomina AMILOPECTINA, la cual estar muy ramificada, y por tanto, poseer muchos extremos no reductores.
En resumen, el glucgeno tendr: Cadenas de AMILOSA (1 4) no ramificadas
Cadenas de AMILOPECTINA (1 6) muy ramificadas c/ 8-10 molculas de glucosa
Importancia fisiolgica Lo que nos convendr fisiolgicamente es tener muchos extremos no reductores, porque es el lugar por donde se degrada el glucgeno (el extremo reductor no estar qumicamente activo, es decir, no tendr enzimas que lo reconozcan), y al ser estos muchos, la degradacin de glucosa podr dar comienzo en muchos lugares a la vez. Y, por tanto, este gran n de ramificaciones y extremos no reductores es el que permite que el glucgeno acte como tal, de almacn energtico. Por ej.: en un momento determinado en el que aparezca mucha glucosa en sangre que guardar (como despus de 1 comida) el mayor nmero de ramificaciones y en consecuencia de extremos no reductores permitir un/a almacenamiento/captacin de glucosa muy rpido. Almacenamiento En el citoplasma celular en forma de grnulos sin membrana. Principalmente en el *hgado* En el msculo (esqueltico y cardaco) 121
BIOQ GENERAL Como en unidades de superficie hay ms msculo que hgado, se dice que el almacenamiento de glucgeno es mayor en el msculo. Sin embargo, el hgado almacena mucho ms glucgeno por gramos que el msculo. Adems del citoplasma, el hgado y el msculo esqueltico, existen otros rganos que tambin almacenan glucgeno: TJ adiposo, cerebro y Ms cardiaco, aunque no es mucha proporcin. Por qu es ms abundante en % de glucgeno en el hgado que en el msculo, es decir, por qu el hgado constituye el principal almacn del glucgeno? Porque la funcin del glucgeno en el hgado es vital para la vida, ya que garantiza que la glucosa llegue correctamente al cerebro y a los glbulos rojos. Misin del glucgeno del hgado
Mantener la homeostasis de glucosa en sangre, es decir, mantener siempre una [glucosa] constante en sangre, lo que resulta vital para la vida, pues la glucosa es la fuente principal de energa de todos los rganos, y en especial del cerebro y de los glbulos rojos o eritrocitos, ya que constituye su nica fuente de energa. El glucgeno del hgado se rompe en situacin de ayuno ( de glucosa en sangre) expresin de su funcin de reserva de energa. Misin del glucgeno del msculo
En cambio el glucgeno del musculo no proporciona glucosa a las clulas ni a la circulacin sangunea, lo emplear para consumo propio, es decir, el glucgeno que entra en el msculo no volver a salir de l, no se recupera. El glucgeno del msculo se rompe en situacin de ejercicio. b) HETEROPOLISACRIDOS NITROGENADOS o GLUCOSAMINOGLUCANOS (GAG) - *inters fisiolgico* - : forman parte de la matriz extracelular, confiriendo resistencia a la misma. Son azcares constituidos por un azcar urnico (grupo cido), del que deriva el cido hialurnico (otro componente de la matriz extracelular) y un aminoazcar (grupo amino). Principales heteropolisacridos nitrogenados de la matriz extracelular: cido Hialurnico ( cido urnico)
Sulfato de condroitina Queratn sulfato
Poseen un elevado nmero de cargas negativas o aniones (-), lo que les permite captar cationes (+) como Ca2+, Mg2+ necesarios para la conformacin de la matriz, y fijarlos en su estructura. Adems poseen muchos grupos OH lo que significa que estn altamente hidratados, por lo que confieren fluidez.
HETERSIDOS (nivel superior de estructura): molculas formadas por azcares y otra

macromolcula (protena o lpido) GLUCOLPIDOS. En Mb celulares. Poseen mayor componente lipdico que glucdico. GLUCOPROTENAS
122
BIOQ GENERAL Proteoglucanos: mayor componente glucdico que proteico azcares que en su estructura llevan adicionados protenas. Conforman una parte importante de la matriz extracelular. Glicoprotenas: mayor componente proteico que glucdico. Ej.: inmunoglobulinas, colgeno protenas que en su estructura llevan adicionados azcares.
123
BIOQ GENERAL
TEMA 8: LPIDOS o GRASAS

Los lpidos son molculas muy heterogneas y, debido a ello, se clasifican segn diversos criterios. Nuestra clasificacin se basar en la presencia o no de un cido graso (AG) en la estructura del lpido desde su conformacin o inicio.
Clasificacin
1) LPIDOS SIMPLES No AG en su estructura inicial (aunque posteriormente los podrn adquirir) No saponificables (trmino poco correcto, pues todos los lpidos en un momento determinado se podrn saponificar). TERPENOS ESTEROIDES PROSTAGLANDINAS 2) LPIDOS COMPLEJOS AG unido a una molcula en su estructura inicial 3 grupos mayoritarios en humanos: ACILGLICRIDOS FOSFOGLICRIDOS o FOSFOACILGLICRIDOS (denominados errneamente fosfolpidos, pues existen ms lpidos capaces de unir el grupo fosfato P) ESFINGOLPIDOS o ESFINGOACILGLICRIDOS CERAS (asociacin de AG unidos a molculas de gran peso molecular y apolares, con una funcin defensiva/estructural y no fundamentales para el ser humano, si no en animales inferiores)
3)
LIPOPROTENAS
apoprotenas: protenas de las lipoprotenas
QUILOMICRONES VLDL (lipoprotena de muy baja densidad) LDL (lipoprotena de baja densidad) HDL (lipoprotena de alta densidad)
1)
LPIDOS SIMPLES: no tienen el AG inicialmente en su estructura TERPENOS: constituidos por una unidad estructural bsica de 5 tomos de carbono (dC), el
ISOPRENO. Segn el n de isoprenos surgen distintos tipos de terpenos: 124
BIOQ GENERAL MONOTERPENOS = condensacin de 2 isoprenos (10 dC) - Existen pocos fisiolgicamente y predominan en el reino vegetal (aceites con olor caracterstico) DITERPENOS = asociacin de 4 isoprenos (20 dC) - Tampoco existen muchos fisiolgicamente (fitol) *TRITERPENOS* (el ms importante de los terpenos fisiolgicamente hablando) = asociacin de 6 isoprenos (30 dC) - El representante de los triterpenos es el ESCUALENO, y de l derivan los esteroides. TERPENOS SUPERIORES: ms de 6 molculas de isopreno en su estructura. Son importantes debido a que darn lugar a las VITAMINAS LIPOSOLUBLES ([1] difcil absorcin y eliminacin, [2] almacenamiento en hgado y TJ adiposo, [3] txicas por exceso) Ejemplos de Vit. liposolubles: - Vit. E -TOCOFEROL Funcin antioxidante (reducen el riesgo de los radicales libres, neutralizndolos), especialmente en su forma ismera -tocoferol (el -tocoferol es el que ingerimos normalmente) Se encuentra de forma natural en semillas (pipas, nueces, cacahuetes) y en el aceite de oliva y de girasol *No es recomendable adquirir la Vit. E o -tocoferol a travs de suplementos vitamnicos, porque se estar tomando un solo tipo de antioxidante, as que, por s solo, actuar como radical libre, potencindose el efecto oxidante. Su dficit provoca una alteracin o mal funcionamiento celular, pues se destruirn las Mb celulares - Vit. A RETINOL Pequeo poder antioxidante, aunque su funcin principal es hormonal, es decir, regula la divisin celular (cncer). Adems, tambin constituye un pigmento que participa en la visin Se encuentra de forma natural en frutas y verduras rojas (fresas, tomates) Su dficit provoca ceguera nocturna - Vit. K Participa en los procesos de coagulacin - Vit. D. Participa haciendo posible la absorcin del Ca2+ Se sintetiza a partir de un precursor tpico (de la piel) anlogo al colesterol, por lo que no necesitamos administrarlo de forma exgena. Su dficit provoca raquitismo en nios y osteomalacia en adultos Su dficit inhibe la cascada de coagulacin sangunea (hemorragias)
125
BIOQ GENERAL
ESTEROIDES: derivan del triterpeno ESCUALENO

COLESTEROL: esteroide ms importante fisiolgicamente. nico metabolito o macromolcula que no podemos degradar/oxidar hasta CO2 o H2O, por lo que, para poder metabolizarlo, hay que transformarlo en otras molculas que s se puedan degradar. As van aparecer molculas derivadas del colesterol ( productos derivados de su degradacin) que harn posible su eliminacin: - cidos biliares: facilitan la emulsin de los lpidos o grasas (la emulsin permite la formacin de micelas, sin las cuales no podramos metabolizar las grasas)
- Hormonas esteroideas: dependiendo del sitio fsico en el que se hayan sintetizado Glucocorticoides (cortisol y corticosterona): regulan directamente el metabolismo de hidratos de carbono o glcidos, e indirectamente el metabolismo de los lpidos, por estar su metabolismo ntimamente ligado al primero. *No administrar en diabticos pues se producir un peligroso incremento de glucosa en sangre. Adems, se debe tener un sumo cuidado en su administracin, que debe ser lenta y progresiva, al igual que su retirada. Mineralocorticoides (derivan de la corticosterona): se sintetizan en las cpsulas suprarrenales, por lo que regulan el metabolismo de los iones a nivel renal fundamentalmente. Hormonas sexuales (andrgenos y estrgenos)
PROSTAGLANDINAS. Derivan de un AG, el CIDO ARAQUIDNICO, cuyas funciones estn

relacionadas con procesos inflamatorios.
2) LPIDOS COMPLEJOS = tienen un AG inicialmente en su estructura cidos grasos

Constituyentes de los lpidos complejos. Los vamos a clasificar a parte de los lpidos simples o complejos. Estructura Estn formados por un grupo carboxilo (-COOH) y una cadena hidrocarbonada (CH3)n Caractersticas (derivadas de su estructura) - Qumicamente son molculas anfipticas. El carcter polar se lo aporta el grupo COOH y el carcter apolar las cadenas hidrocarbonadas. 126
BIOQ GENERAL
*Especficamente, es decir, fisiolgicamente hablando, no lo son, pues el grupo COOH nunca va a estar ionizado, y debido a la longitud de las cadenas hidrocarbonadas (> 16 tomos de C) o zona apolar, predomina el carcter apolar en la molcula, por lo que apenas habr AG libres (trazas) en circulacin o en las clulas.
- Los AG se van a encontrar siempre unidos a molculas, o bien a (1) protenas (mayoritariamente albmina), que se encargan de trasportarlos por la sangre, es decir, constituyen su medio de transporte mayoritario en sangre; o bien a (2) estructuras ms complejas como las lipoprotenas, constituyendo ste su medio de transporte minoritario.
Clasificacin. Dependiendo de la longitud de la cadena hidrocarbonada (se consideran largas a aquellas que estn conformadas por ms de 16 tomos de carbono, y en ellas predominar el carcter apolar), y de que tenga o no insaturaciones (dobles enlaces), tenemos distintos tipos de AG. En humanos los AG ms abundantes son lo que tienen un n par de tomos de carbono (entre 16-18) - Si la cadena hidrocarbonada del AG no presenta insaturaciones o dobles enlaces = AG SATURADOS Consecuencia por exceso de AG en dieta: imprimen rigidez a la Mb, con lo que se dificulta el intercambio de sustancias a travs de las Mb y los receptores hormonales (protenas) no podrn transmitir correctamente las seales una de las causas que origina la diabetes - Si la cadena hidrocarbonada del AG presenta alguna insaturacin o doble enlace = AG INSATURADOS
- El aumento del n de tomos de carbono: o Incrementa el carcter apolar del AG o Incrementa los puntos de fusin y de ebullicin del AG (lo que hace por ejemplo, que los AG saturados a t ambiente sean slidos) - La presencia de insaturaciones o dobles enlaces, en igual n de tomos de carbono, hace que disminuyan los puntos de fusin y de ebullicin del AG - En humanos, las insaturaciones o dobles enlaces de los AG insaturados siempre se encuentran en posicin -CIS, lo cual crea un quiebro en el AG que disminuye la rigidez del mismo, y se dan entre el C9 y el C10.
*La presencia de una insaturacin de un AG insaturado en posicin TRANS confiere rigidez a la Mb.
No debemos de mantener las insaturaciones de los AG insaturados en posicin trans porque aumentan la rigidez de la Mb, y por tanto, dificultan el intercambio de sustancias y la transmisin de seales hormonales. El problema es que la mayora de AG insaturados que ingerimos poseen sus insaturaciones en posicin trans, pues proceden de un proceso de desoxigenacin industrial, y al ingerirlas se incorporan a la Mb inmediatamente. Como ya hemos dicho anteriormente, este aumento de la rigidez de las Mb se relaciona con la aparicin de diabetes. 127
BIOQ GENERAL
Acilglicrido cis
Acilglicrido trans
cidos grasos importantes a nivel fisiolgico - Saturados: no dobles enlaces o insaturaciones en sus cadenas hidrocarbonadas. Su formula responde a X: 0* *Siendo el 1er dgito en n de tomos de carbono, y el 2 el n de insaturaciones, en este caso 0; si las tuviera llevar un superndice que indicar el lugar en el que se encuentran las insaturaciones. CIDO PALMTICO (16:0). Uno de los pocos AG que podemos sintetizar de forma endgena. o A partir de l se sintetiza el cido esterico y el cido palmitoleico
CIDO ESTERICO (18:0). Sntesis a partir del cido palmtico. 128
BIOQ GENERAL
- Insaturados: dobles enlaces o insaturaciones en sus cadenas hidrocarbonadas. Su formula responde a X:Z (n del C que presente la insaturacin, empezando a contar desde el grupo carboxilo COOH) Monoinsaturados (abundantes en la dieta) CIDO PALMITOLEICO (16:1 9). Sntesis a partir del cido palmtico.
A partir de cualquiera de los dos cidos anteriores, esterico o palmitoleico (derivados del palmtico), se sintetiza: CIDO OLEICO (18:1 9). Sntesis a partir del cido esterico o del cido palmitoleico.
Poliinsaturados. No los podemos sintetizar, por lo que son AG esenciales, es decir, los debemos adquirir por la dieta. CIDO LINOLEICO (18:29, 12) CIDO -LINOLNICO (18:39, 12, 15) A partir de ellos (cido linoleico y -linolnico) se sintetiza otro AG: CIDO ARAQUIDNICO (20:45, 8, 11, 14). Sntesis a partir del cido linoleico y el -linolnico. Los dobles enlaces o insaturaciones de los AG poliinsaturados no se encuentran nunca de forma conjugada o en forma de dieno, si no que siempre estn separados/as por un grupo metilo.
Clasificacin de los AG en familias Omega (,
doble enlace en la cadena hidrocarbonada, pero empezando a contar desde el final de la cadena del AG (no desde el grupo COOH), es decir, desde el extremo metilo (CH3-).
). Segn la posicin de la 1 insaturacin o el 1er
Por ejemplo, segn esta clasificacin: cido oleico (18:1 9) = Omega 9 extremo metilo 1 insaturacin en el C9, empezando a contar desde el final o
cido linoleico (18:29, 12) = Omega 6 1 insaturacin en el C6, empezando a contar desde el final o extremo metilo C12 empezando a contar desde el grupo COOH
cido -linolnico (18:39, 12, 15) = Omega 3 1 insaturacin en el C3, empezando a contar desde el final o extremo metilo C15 empezando a contar desde el grupo COOH
cido araquidnico (20:45, 8, 11, 14) = Omega 6
1 insaturacin 129
en el C6 empezando a contar desde el final o extremo metilo C14 grupo -COOH
BIOQ GENERAL empezando a contar desde el
OJO! Los humanos no podemos incorporar ninguna insaturacin o doble enlace por detrs del C9, es decir, podemos incluir dobles enlaces del C9 C18, pero del C1 C8 no podremos. Por tanto, el cido linoleico (6) y el -linolnico (3) no son intercambiables, es decir, no podremos sintetizarlos si previamente no hemos adquirido sus precursores, por lo que son esenciales. Sin embargo, el cido araquidnico (6) ser un AG no esencial porque lo podremos sintetizar a partir del cido linolnico o -linolnico.
Dnde se encuentran estas familias de AG? Familia Omega 3 = pescados; aunque ellos tampoco pueden sintetizar AG 3, comen algas, que son las que les proporcionan estos AG. Los AG 3 disminuyen los niveles de triacilglicridos en la sangre (aunque para ello es preciso gran cantidad de ellos).
*Problema actual de las leches ricas en 3: la gente que tiene problemas r/c los niveles de triacilglicridos y que se encuentran en tratamiento, debido a los mltiples anuncios que hablan de las milagrosas leches ricas en Omega 3, captan mal el mensaje y pretenden sustituir su tratamiento farmacolgico por un consumo de estas leches. Familia Omega 6 = semillas, aceites de girasol
Tipos de lpidos complejos

Una vez descritos los AG (constituyentes fundamentales e iniciales de los lpidos complejos), es preciso describir los tipos de lpidos complejos que existen segn la molcula a la que se unan. Decimos que *en humanos encontramos 3 grupos mayoritarios* de lpidos complejos:
ACILGLICRIDOS = asociacin de glicerol + AG (3 como mx.) a travs de un enlace STER.

Clasificacin. Dependiendo del n de AG que estn esterificando al glicerol: Monoacilglicridos (MAG) = 1AG unido o esterificando a la molcula de glicerol Diacilglicridos (DAG) = 2AG unidos Triacilglicridos (TAG) triglicridos = 3AG unidos
130
BIOQ GENERAL Formacin de un diacilglicrido. Se observa la formacin del enlace ster, que libera una molcula de agua. Propiedades. Vienen determinadas por el tipo de AG que esterifica (o se encuentra unido) al glicerol, por tanto, derivan de las propiedades de estos: Su polaridad* (deriva de los AG) depende del nmero de AG que se encuentren esterificando el glicerol: cuantos ms AG haya, ms apolar ser el acilglicrido.
*A pesar de que se afirma que los lpidos son apolares, esta apolaridad es relativa.
De mayor a menor polaridad: MAG (el ms polar) > DAG > TAG (el ms apolar de todos los lpidos)
Los lpidos ms apolares que existen son los TRIACILGLICRIDOS, seguidos del COLESTEROL.
Funcin Principalmente de ALMACN ENERGTICO: almacenan AG que se van a depositar en el TJ adiposo de forma especfica* (existiendo el peligro de que se expanda en la cavidad abdominal ocupando sitios que no debera, pero todos los rganos necesitan una cubierta de grasa)
*A diferencia de lo que ocurre con la glucosa, pues sta no posee un TJ especfico de almacenamiento; se almacena en el MS o en el hgado, pero no siendo esta su misin caracterstica.
Se almacenan en forma anhidra (sin agua) y como triacilglicridos, lo que permite que en un volumen determinado quepa ms cantidad de AG como TAG que como AG libres. Adems se encontrarn en gotas de grasa y con ellos se almacenarn las enzimas necesarias para su hidrlisis/metabolizacin (rompen los enlaces ster de los MAG, DAG y TAG), las LIPASAS. Mayoritariamente los AG no se almacenan de forma libre, sino en forma de gotculas anhidradas y como triacilglicridos (pues esto permitir que se puedan almacenar un mayor n de ellos) y con las enzimas lipasas precisas para su hidrlisis.
FOSFOGLICRIDOS = asociacin de glicerol-3-fosfato + AG (2 como mx. y generalmente 2)

unidos a sus OH (o esterificndolos) mediante un enlace ster. Caracterstica (derivada de su estructura) El grupo fosfato P en la posicin 3 de la molcula de glicerol les confiere polaridad, y por tanto, hace que los fosfoglicridos sean ms polares que los acilglicridos. 131
BIOQ GENERAL
Molcula de cido fosfatdico (su radical unido al fosfato es un hidrgeno). Conferir polaridad a la toda la estructura lipdica.
cido fosfatdico (forma trans)
cido fosfatidico cis
Clasificacin Al grupo fosfato P de cabeza se le pueden unir otras molculas distintas al fosfoacilglicrido por su otro radical libre, dando lugar a los distintos tipos de fosfoacilglicridos, segn sea el radical al que se una el grupo fosfato P: Unin de un hidrgeno H (lo ms sencillo) = CIDO FOSFATDICO (unidad bsica de todos los fosfoglicridos) Unin de serina = Fosfatidilserina Unin de colina = Fosfatidilcolina (tambin llamada lecitina) Unin de etanolamina Fosfatidiletanolamina Unin de inositol = Fosfatidilinositol =
Funcin (deriva de su estructura, por poseer ese grupo P que en las clulas se encuentra ionizado contribuyendo a dar cargas (-) a las Mb celulares) ESTRUCTURAL: todos los fosfoglicridos tienen una funcin estructural, formando parte de todas las membranas celulares (Mb de cualquier orgnulo, no solo de la Mb plasmtica).
Cmo se degradan/rompen? Tambin mediante la accin de las lipasas, conocidas como FOSFOLIPASAS (para diferenciarlas del resto de lipasas que actan en otro tipo de lpidos). 132
BIOQ GENERAL Existen 4 tipos de fosfolipasas, segn su zona de actuacin: 1. Fosfolipasa A1 2. Fosfolipasa A2 3. Fosfolipasa C 4. Fosfolipasa D libres) rompe el enlace ster que une al AG con el OH del C1 del glicerol rompe el enlace ster que une al AG con el OH del C2 del glicerol rompe el enlace que une el fosfato con la molcula de glicerol (P libre) rompe el enlace que une a la molcula radical con el fosfato (serina, colina
ESFINGOLPIDOS = asociacin de un aminoalcohol (normalmente esfingosina) + 1AG unido

mediante un enlace amida. Clasificacin. Segn la molcula que se le una a la esfingosina aparecen distintos tipos de esfingolpidos. Un ejemplo de molcula de unin a los esfingolpidos son los glcidos, que al unirse a los esfingolpidos por la esfingosina, constituiran glucoesfingolpidos, que a su vez pueden ser (segn la naturaleza inica del azcar): Azcar no ionizable Glucoesfingolpidos neutros Azcar ionizable cidos Glucoesfingolpidos
Funcin: ESTRUCTURAL Se encuentran fundamentalmente en las MB del TJ nervioso, y su acumulacin sobre clulas de estos tejidos es responsable de algunas patologas.
3) LIPOPROTENAS (forma que adoptan los lpidos para poder viajar en la circulacin, debido a su carcter apolar)
No muy polares o apolares en medio acuoso (normalmente carcter apolar no absoluto) por tanto, se impide que las grasas sean solubles en solventes polares, es decir, son insolventes en medios polares (citosol, sangre), por lo que, para entrar y poder viajar en estos medios, requerirn de una unin a protenas (lpidos + protenas = lipoprotenas)
*Cabe apuntar que los lpidos se pueden encontrar dentro de la clula de 2 formas distintas (dentro de la clula no en forma de lipoprotenas): (1) no completamente esterificados o (2) unidas a protenas especficas (lpido protena lipoprotena)
Tipos. Existen 4 tipos de lipoprotenas mayoritarios (cada uno de ellos englobando a un conjunto): 1. QUILIMICRONES: primeras lipoprotenas que aparecen en el intestino tras la alimentacin (inicio de la digestin). Composicin: TAG + apoprotenas En general son ricos en lpidos (tienen todos los que hemos ingerido), pero mayoritariamente son ricos en TAG (por ser estos los lpidos ms abundantes en nuestra dieta). 133
BIOQ GENERAL Adems contienen muchas protenas, conocidas como apoprotenas (protenas de los lpidos), mayoritariamente: Apo CII Apo B48
Al llegar al hgado dan lugar a otras lipoprotenas: 2. VLDL (lipoprotenas de muy baja densidad): transportan mayoritariamente TAG de sntesis endgena y su protena mayoritaria es la Apo B100. Salen a la circulacin, y a medida que se van empobreciendo (perdiendo TAG) se transforman en: 3. LDL (lipoprotenas de baja densidad) derivan de las VLDL - : transportan mayoritariamente COLESTEROL heptico (endgeno) y su protena mayoritaria es la Apo B10. Van cediendo colesterol a los TJs (se van empobreciendo) hasta que se transforman en: 4. HDL (lipoprotenas de alta densidad): transportan mayoritariamente COLESTEROL extraheptico (van recogiendo el colesterol sobrante de los TJs) y su protena mayoritaria es la Apo A.
Diferencias entre las distintas lipoprotenas: A nivel de componente lipdico mayoritario que se transporta: Quilomicrones = TAG en general VLDL = TAG de sntesis endgena LDL = colesterol heptico HDL = colesterol extraheptico
A nivel de componente proteico (apoprotena) mayoritario: Quilomicrones = Apo CII y Apo B48 VLDL = Apo B100 LDL = Apo B10 HDL = Apo A
134
BIOQ GENERAL Adems, a medida que se metabolizan disminuyen en tamao pero aumentan en densidad (ms contenido proteico)
En *clnica* se denomina (no muy correctamente): Colesterol bueno = al colesterol extraheptico de las HDL (porque captan colesterol de los TJs con lo que se favorece su eliminacin) Colesterol malo = al colesterol heptico de las LDL (porque ceden colesterol a los TJs con lo que se favorece su almacenamiento)
135
BIOQ GENERAL
TEMA 9 BIOENERGTICA
Introduccin al metabolismo
Cuando hablamos de metabolismo nos referimos al conjunto de reacciones a travs de las cuales el organismo lleva a cabo la degradacin/descomposicin de los nutrientes o macromolculas, que sintetiza con el fin de obtener energa que se destinar a distintos fines: Trabajo osmtico: para transportar molculas a travs de la Mb. Trabajo mecnico: para mover los msculos Trabajo qumico: para la ruptura de enlaces, alterar molculas (proseguir la obtencin de energa).
Clasificacin. Los procesos metablicos se engloban en las rutas metablicas, las cuales vamos a
clasificar siguiendo 2 criterios I. Segn la ruta sea comn o especfica de los seres vivos o su finalidad sea o no energtica: Metabolismo primario: rutas comunes a todos los seres vivos. Metabolismo secundario: rutas propias/especficas de un ser vivo. Por ej. la fotosntesis es exclusiva de las plantas. Metabolismo energtico (metabolismo intermediario): conjunto de rutas metablicas que tienen (todas ellas) una finalidad energtica. Por ej. el metabolismo de cidos nucleicos no se podra clasificar dentro de este grupo pues su finalidad no es la obtencin de energa. Sin embargo la forma ms habitual de clasificar las rutas energticas es en: CATABOLISMO (degradativas) ANABOLISMO constructivas) (de sntesis o
II.
CATABOLISMO: rutas de descomposicin/degradacin en las que *siempre* se obtiene energa, que obtenemos de 2 formas mayoritarias: 1. En forma de ATP 2. En forma de poder reductor: NADH + H+ y FADH2 (de forma mayoritaria) NADPH + H+ (de forma minoritaria)
136
BIOQ GENERAL
Son rutas convergentes en las que a partir de varias macromolculas obtenemos muy pocos productos finales, y se suelen dar ante una demanda energtica (situacin de ejercicio), o en situacin de alimentacin (macronutrientes). ANABOLISMO: rutas de sntesis/consumicin de energa (no producen) de la generada en las rutas catablicas. Son rutas divergentes en las que a partir de pocos productos podemos formar/obtener gran cantidad de macromolculas, y se suelen llevar a cabo cuando existe energa o cuando la clula carece de macromolculas (situacin de ayuno).
Todas las reacciones qumicas que se llevan a cabo de manera espontnea en nuestro organismo, desprenden energa, pero tambin hay reacciones que se llevan a cabo en nuestro organismo que requieren energa para llevarse a cabo. Para que una reaccin anablica o de sntesis se pueda producir, es preciso acoplarla a otra reaccin catablica o de descomposicin y que por tanto desprenda energa. Esta es la base del metabolismo. A la energa que fluye en cualquier reaccin qumica se denomina ENERGA LIBRE ( G) Cuando sta es negativa (-) ( G < 0) reaccin exergnica la reaccin desprende energa = la reaccin
Cuando la variacin de energa es positiva (+) ( G > 0) absorbe/capta energa = reaccin endergnica
Las reacciones endergnicas requiere la energa que desprenden las reacciones exergnicas.
137
BIOQ GENERAL
En resumen: En el metabolismo catablico todos los componentes que han de ser degradados convergen en una molcula: el Acetil-CoA, el cual se introduce en el ciclo de los cidos tricarboxilicos para dar lugar a energa en forma de poder reductor CO2 y GTP = proceso convergente En el metabolismo anablico ocurre al contrario, pues partimos nicamente de CO2 (pocas macromolculas) para sintetizar muchos tipos de productos (lpidos, glcidos, protenas) =proceso divergente
138

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Bioqumica general

Alberto Gmez & Laura del Olmo

Alberto Gmez & Laura del Olmo

Alberto Gmez & Laura del Olmo

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Bioqumica general -log[H+]=-log(Keq)+log([A-]/[AH]) pH = pK + log [ A] [ AH ]

Los tampones cumplen las siguientes caractersticas

Alberto Gmez & Laura del Olmo

Alberto Gmez & Laura del Olmo

Tema 2 AMINOCIDOS, PPTIDOS y PROTENAS

PROTENA = una de las molculas ms verstiles de nuestro organismo cuyos

Bioqumica general - Segn su forma globular

AMINOCIDOS (A) = bloques

- Sin carga neta APOLARES = carga

- Con carga neta

Aminocidos con cadenas laterales alifticas

Aminocidos con cadenas laterales aromticas

Aminocidos con cadenas laterales azufradas

Aminocidos con cadenas laterales hidroxiladas

Alberto Gmez & Laura del Olmo

Aminocidos con cadenas laterales bsicas

Lisina (Lys, K) pKa=10.8

Arginina (Arg, R) pKa=12.5

Histidina (His, H) pKa=6.0

Aminocidos con cadenas laterales cidas y sus amidas respectivas

Aspartato (Asp, D) pKa=4.0

Glutamato (Glu, E) pKa=4.3

ESTRUCTURA DE LOS A COMUNES

pK1 = 1.5 2.5

pI = pK1 + pK2 / 2 Propiedades cido-base (derivan de las propiedades qumicas = anfteros)

los AMINOCIDOS APOLARES

pI = pK1 + pKR / 2 Curva de Ionizacin

Alberto Gmez & Laura del Olmo

pI = pK1 + pKR / 2 pI = pK2 + pKR / 2

*Excepcin*: HISTIDINA (His)

Los aminocidos se pueden clasificar segn su grupo R

Alberto Gmez & Laura del Olmo

Otra propiedad: CAPACIDAD DE ABSORBANCIA DE LA LUZ

SUSCEPTIBLES DE SUFRIR REACCIONES QUMICAS A. Debidas al grupo -COOH:

Alberto Gmez & Laura del Olmo

B. Debidas al grupo -NH3:

C. Debido a grupos reactivos en las CADENAS LATERALES (R):

Alberto Gmez & Laura del Olmo

- METILACIN: adicin de un grupo metilo metilcistena, metilserina

Funciones tirosina cido gamma-

NIVELES ESTRUCTURALES DE LAS PROTENAS

-Carboxilo de un a -Amino del siguiente

60 simples > 40 dobles

PPTIDO: resultado de la asociacin de < de 50 a PROTENA: asociacin de > de 50 a

LMITE PPTIDO-PROTENA (convenio)

Hay excepciones. Ej.: la insulina (secuencia de 51 a) se considera un pptido

PPTIDOS. Capacidad de IONIZACIN

Se sintetizan siempre: Nt - Grupo amino-terminal = izquierda - Grupo carboxilo-terminal = derecha

PROTENAS. PUNTO ISOELCTRICO (Pi)

- Tambin tiene funciones en el cerebro y en los vasos sanguneos.

Endorfinas (hormona de la alegra) Encefalinas

Amanita = PPTIDO TXICO 8/10/2010

+ (no hay carga suficiente para que la protena pueda

- Si un a posee un pK/pH > pI

A. ESTRUCTURA PRIMARIA = estructura COVALENTE de las protenas

Bioqumica general Qu a? En qu orden? Qu grupos prostticos?

Clasificacin de las protenas segn su estructura primaria

Clasificacin de los a que forman parte de la estructura primaria

Excepcin: HISTIDINA (His)

o -cetoglutarato (KG) o Fe2+ o O2 o Vit. C = propensa a la oxidacin