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MICROBIOLOGIA

TEMA 1.1. ANTECEDENTES 1.1.1. DESARROLLO HISTRICO,

GENERALIDADES Y DESARROLLO HISTORICO DE LA MICROBIOLOGIA Dr. Pedro F. Mateos Departamento de Microbiologa y Gentica. Facultad de Farmacia. Universidad de Salamanca DESARROLLO HISTORICO DE LA MICROBIOLOGIA Microbiologa, el estudio de los organismos microscpicos, deriva de 3 palabras griegas: mikros (pequeo), bios (vida) y logos (ciencia) que conjuntamente significan el estudio de la vida microscpica.

Para mucha gente la palabra microorganismo le trae a la mente un grupo de pequeas criaturas que no se encuadran en ninguna de las categoras de la pregunta clsica: es animal, vegetal o mineral ? Los microorganismos son diminutos seres vivos que individualmente son demasiado pequeos como para verlos a simple vista. En este grupo se incluyen las bacterias, hongos (levaduras y hongos filamentosos), virus, protozoos y algas microscpicas.

Normalmente tendemos a asociar estos pequeos organismos con infecciones, enfermedades como el SIDA, o deterioro de alimentos. Sin embargo, la mayora de los microorganismos contribuyen de una forma crucial en el bienestar de la Tierra ayudando a mantener el equilibrio de los organismos vivos y productos qumicos en nuestro medio ambiente: Los microorganismos de agua dulce y salada son la base de la cadena alimentaria en ocanos, lagos y ros; los microorganismos del suelo destruyen los productos de desecho e incorporan el gas nitrgeno del aire en compuestos orgnicos, as como reciclan los productos qumicos en el suelo, agua y aire; ciertas bacterias y algas juegan un papel importante en la fotosntesis, que es un proceso que genera nutrientes y oxgeno a partir de luz solar y CO2 siendo un proceso crtico para el mantenimiento de la vida sobre la Tierra; los hombres y algunos animales dependen de las bacterias que habitan en sus intestinos para

realizar la digestin y sntesis de algunas vitaminas como son la K y algunas del complejo B. Los microorganismos tambin tienen aplicaciones industriales ya que se utilizan en la sntesis de productos qumicos como son acetona, cidos orgnicos, enzimas, alcohol y muchos medicamentos. El proceso de produccin de acetona y butanol por bacterias fue descubierto en 1914 por Chaim Weizmann, un polaco que trabajaba en Inglaterra para Winston Churchill. Cuando estall la primera guerra mundial en agosto de ese ao, la produccin de acetona era esencial en el proceso de fabricacin de las municiones, por lo que el descubrimiento de Weizmann jug un papel determinante en el desarrollo de la guerra. Despus de la guerra, rehus todos los honores que le propuso el gobierno britnico. Sin embargo, utiliz su influencia para que el gobierno britnico ayudara a establecer el estado judo en Palestina. En 1949, Weizmann fue elegido el primer presidente de Israel. La industria alimentaria tambin usa microorganismos en la produccin de vinagre, bebidas alcohlicas, aceitunas, mantequilla, queso, yogurt y pan. Adems, las bacterias y otros microorganismos ahora pueden ser manipulados para producir sustancias que ellos normalmente no sintetizan. A travs de esta tcnica, llamada ingeniera gentica, las bacterias pueden producir importantes sustancias teraputicas como insulina, hormona de crecimiento humana e interfern.

Actualmente sabemos que los microorganismos se encuentran en todas partes; pero hace poco, antes de la invencin del microscopio, los microorganismos eran desconocidos para los cientficos. Miles de personas moran en las epidemias cuyas causas no se conocan. El deterioro de los alimentos no se poda controlar siempre y muchas familias enteras moran debido a que no existan vacunas y antibiticos disponibles para combatir las infecciones. Nosotros podemos hacernos una idea de como se han desarrollado nuestros actuales conceptos de microbiologa repasando los acontecimientos histricos que han cambiado nuestras vidas.

Aunque los microorganismos se originaron hace aproximadamente 4.000 millones de aos, la microbiologa es relativamente una ciencia joven. Los primeros microorganismos se observaron hace 300 aos y sin embargo pasaron unos 200 aos hasta que se reconoci su importancia.

Primeras observaciones microscopios)

de

los

microorganismos

(Leeuwenhoek

sus

La existencia de los microorganismos no se conoci hasta la invencin del microscopio. La primera persona en describir los microorganismos en detalle fue el holands Antony van Leeuwenhoek en 1684, a los cuales denomin animculos.

Leeuwenhoek examin el agua de lluvia, de mar, de ro, saliva y otras materias. Sin embargo, estas observaciones no condujeron a ninguna investigacin acerca de las posibles actividades de los microorganismos, ni como agentes de fermentaciones ni de enfermedades infecciosas ya que el desarrollo de la qumica y de la medicina era demasiado primitivo.

Origen

de

los

microorganismos

(Teora

de

la

generacin

espontnea)

Una vez descubiertos los microorganismos por Leeuwenhoek se empez a especular sobre el origen de estos animculos. Se formaron dos escuelas. Una de ellas admita la existencia de estas estructuras pero apoyaban la teora que provenan de la descomposicin de los tejidos de las plantas o animales (eran el resultados de la descomposicin y no la causa). Los que apoyaban esta teora crean que la vida se generaba a partir de matera no viva, proceso que se denomin abiognesis. Bsicamente era el concepto de la generacin espontnea. Del otro lado estaba la teora de la biognesis. Los animculos se originaban, como ocurre en formas de vida superiores, a partir de animculos padres. Hasta que se rechaz la idea de la generacin espontnea se tuvieron que realizar muchos experimentos que parecen simples hoy en da, pero que en aquellos momentos llev ms de 100 aos resolver dicha controversia. La idea de la generacin espontnea se remonta a la cultura griega, los cuales crean que las ranas y gusanos crecan espontneamente a partir del lodo. Incluso existan recetas: llenando una tinaja con trapos y colocndola en un sitio apartado durante semanas al final crecan ratones a partir de los trapos. En el siglo XVII el italiano Francesco Redi demostr en 1668 que los gusanos encontrados en la carne podrida eran las larvas que provenan de los huevos que previamente haban depositado en la carne las moscas y no el producto de la generacin espontnea. Sin embargo una cosa eran los huevos de moscas y otra los microorganismos que slo se podan ver con la ayuda del microscopio.

En 1745 John Needham hirvi trozos de carne para destruir los organismos preexistentes y los coloc en un recipiente abierto. Al cabo de un tiempo observ colonias de microorganismos sobre la superficie y concluy que se generaban espontneamente a partir de la carne. En 1769, Lazzaro Spallanzani repiti el experimento pero tapando los recipientes, no apareciendo las colonias, lo que contradeca la teora de la generacin espontnea. Pero Needham argument que el aire era esencial para la vida includa la generacin espontnea de microorganismos y este aire haba sido excluido en los experimentos de Spallanzani. Unos 100 aos despus, en 1836 Franz Schulze pas el aire a travs de unas

soluciones cidas fuertes hacia el interior de un recipiente con carne hervida. Al ao siguiente Theodor Schwann pas el aire a travs de tubos calientes. Los microorganismos no aparecan en ningn caso ya que los microorganismos presentes en el aire haban sido aniquilados. Sin embargo, los que apoyaban la generacin espontnea comentaban que el cido y el calor alteraban el aire de tal manera que impeda la generacin espontnea de los microorganismos. Sin embargo fue Louis Pasteur el que zanj definitivamente la controversia en 1864 al utilizar matraces con un tubo largo y curvado llamados "cuello de cisne". El aire pasaba libremente a travs del cuello, pero los microorganismos no aparecan en la solucin ya que las partculas de polvo y microorganismos sedimentaban en el recodo del cuello. Estos experimentos de Pasteur promovieron el reconocimiento de la biognesis. Posteriormente Pasteur empez a estudiar el papel de los microorganismos en la produccin de vino y como causa de enfermedades.

La

fermentacin

como

proceso

biolgico

(Pasteur

el

vino

francs)

Sin duda desde la Prehistoria los hombres utilizan con provecho las fermentaciones. El pan fermentado se conoce desde hace varios miles de aos. Los jeroglficos egipcios, as como representaciones grficas en todo el Prximo Oriente atestiguan que el hombre recurra a la fermentacin para fabricar bebidas alcohlicas ya varios milenios antes de Jesucristo. Al preparar el pan, vino, cerveza o sake, los egipcios, sumerios y todas las personas hasta mediados del Siglo XIX, empleaban sin saberlo, y de una manera emprica, una familia de agentes biolgicos muy originales: las levaduras. Son ellas las que realizan la fermentacin alcohlica. El papel de las levaduras como agentes fermentadores no fue reconocido hasta 1856 por Luis Pasteur. Las teoras cientficas de esa poca reconocan la presencia de levaduras en la fermentacin alcohlica, pero estas levaduras eran consideradas como compuestos qumicos complejos, sin vida. Esta era la teora mecanstica liderada por los qumicos alemanes von Liebig y Whler. Luis Pasteur, qumico francs, propuso la teora vitalstica y demostr que las clulas viables de levaduras causan fermentacin en condiciones anaerbicas; durante dicha fermentacin el azcar presente en el mosto es convertido principalmente en etanol y CO2. Sus ilustraciones claramente muestran autnticas levaduras vnicas y en sus escritos l las diferenciaba claramente de otros componentes.

En el verano de 1856 M. Bigo, un fabricante de alcohol en la ciudad de Lille, en el norte de Francia, sufra repetidos fracasos en las fermentaciones de sus productos. En este proceso intervena la fermentacin de la caa de azcar para producir alcohol etlico, pero una y otra vez el contenido de las tinajas se agriaba y al final en lugar de alcohol, se obtena una sustancia que despeda un olor parecido a la leche agria.

Sucedi que el hijo de M. Bigo estudiaba en la Facultad de Ciencias cuyo decano era Pasteur. M. Bigo, a travs de su hijo, pregunt a Pasteur si estara dispuesto a investigar los fracasos que estaban ocurriendo con sus fermentaciones, a lo que Pasteur accedi iniciando el estudio en los laboratorios de la Facultad. En primer lugar someti a anlisis qumico el contenido estropeado de las tinas llegando a la conclusin de que contenan una considerable cantidad de cido lctico en lugar de etanol. El siguiente paso fue el examen de los sedimentos de las tinas en las que la fermentacin haba sido satisfactoria y el de aquellas que haban fallado. La comparacin de los dos sedimentos revel una clara diferencia: en los sedimentos procedentes de las tinas que haban producido alcohol haba levaduras; en los procedentes de las tinas productoras de cido lctico se vean "glbulos mucho ms pequeos que los de la levadura" con lo que ya dispona de pruebas de que los productos de estas dos fermentaciones estaban especficamente asociados con el crecimiento de dos microorganismos morfolgicamente distinguibles. Tom muestras de los sedimentos de los dos tipos de fermentaciones y los inocul en tubos que contenan azcar como fuente de carbono; en el caso de los "glbulos mucho ms pequeos que los de la levadura" pudo reproducir la fermentacin lctica y observar los diminutos glbulos en el sedimento que apareca en los tubos. La adicin del sedimento de las tinas en las que se haba producido alcohol, di una tpica fermentacin alcohlica apareciendo en el fondo de los tubos glbulos de levaduras. En 1866, Pasteur public la obra titulada "Estudios sobre el vino, sus enfermedades, causas que las provocan. Nuevos procedimientos para la conservacin y envejecimiento". Entre las mejoras aconsejadas haba un mtodo para aumentar la calidad de la conservacin de los vinos consistente en calentarlos a una temperatura de 68 C durante 10 minutos y despus enfriarlos rpidamente. Esta tcnica ha venido a ser conocida como pasteurizacin y es ahora ampliamente utilizada en el tratamiento de la leche. Descubrimiento de la funcin de los microorganismos como causantes de enfermedades (Koch y la bacteria del carbunco)

Ya en 1546 Girolano Fracastoro haba sugerido que las enfermedades podan deberse a organismos tan pequeos que no podan verse y que eran transmitidos de una persona a otra. Sin embargo, el descubrimiento de que las bacterias pueden actuar como agentes especficos de las enfermedades infecciosas en los animales fue realizado a travs del estudio del carbunco, infeccin grave de los animales domsticos que es transmisible al hombre. La demostracin concluyente de la causa bacteriana o etiologa del carbunco la proporcion en 1876 Robert Koch, un mdico rural alemn. Kosch empez a estudiar el mundo microbiano despus de que su mujer le regalara por su 28 cumpleaos un microscopio. Seis aos despus Koch anunci al mundo que haba encontrado la bacteria del carbunco (Bacillus anthracis).

Posteriormente l y sus colaboradores descubrieron las bacterias que causan la tuberculosis y el clera. Esta serie de experimentos se ajustaban a los criterios necesarios para poder establecer la relacin causal entre un organismo especfico y una enfermedad especfica. Estos criterios se conocen como los POSTULADOS DE KOCH: 1.- El microorganismo debe estar presente en todos los casos de la enfermedad. 2.- El microorganismo debe ser aislado del hospedador enfermo y obtenerse en cultivo puro en el laboratorio. 3.- La enfermedad especfica debe reproducirse cuando un cultivo puro del microorganismo se inocula a un hospedador susceptible sano. 4.- El microorganismo debe ser recuperable de nuevo a partir del hospedador inyectado experimentalmente. El descubrimiento posterior de los virus (Dimitri Ivanovski en 1892; el virus del mosaico del tabaco pasaba los filtros que retenan a las bacterias), agentes que no crecen en medios artificiales en el laboratorio como lo hacen las bacterias, han permitido realizar algunas modificaciones en los postulados de Koch. Este trabajo sobre el carbunco condujo rpidamente a la edad de oro de la bacteriologa. En 25 aos la mayora de los agentes bacterianos de las principales enfermedades humanas haban sido descubiertos y descritos. Desarrollo en la prevencin de enfermedades (Lister y el fenol; Pasteur y las gallinas; Fleming y el hongo contaminante)

Actualmente es difcil comprender la magnitud de la miseria y devastacin causada por los microorganismos antes de 1950. En Europa, durante el perodo de 1347-1350 ocurri una epidemia de peste bubnica, conocida como la "muerte negra" y causada por una bacteria (Yersinia pestis). A causa de esta enfermedad en Francia murieron de un tercio a la mitad de la poblacin y se estim que en toda Europa murieron 25 millones de personas. Con el conocimiento de que los microorganismos causaban enfermedades, los cientficos se dedicaron a investigar la prevencin y el tratamiento. Los hospitales adoptaron la antisepsia, la cual previene la diseminacin de las enfermedades infecciosas mediante la inhibicin o destruccin de los agentes causantes. Tambin se descubri la inmunizacin, un proceso que estimula las defensas del cuerpo frente a la infeccin. Se empez a aplicar la quimioterapia, tratamiento de las enfermedades con una sustancia qumica, a medida que los

investigadores encontraban medicamentos ms efectivos. Tambin influy la sanidad pblica, sobre todo la higiene relacionada con los alimentos y aguas.

1.1.2. CONCEPTOS BSICOS Microbiologa: ciencia que estudia los organismos de tamao microscpico, entre los que se incluyen las bacterias, los protozoos y los virus, as como ciertos hongos (levaduras) y algas unicelulares de pequeo tamao. La microbiologa comprende un conjunto de disciplinas relacionadas, entre las que destacan la bacteriologa, la virologa y la parasitologa. Estudia, no slo la morfologa de los microorganismos, sino tambin su modo de vida, su metabolismo, su estructura molecular, sus propiedades patognicas y sus caractersticas antignicas (aquellas que pueden provocar una respuesta del sistema inmunolgico).

Antisepsia: Hacia 1860 un cirujano ingls llamado Joseph Lister investigaba la forma de eliminar los microorganismos de las incisiones realizadas en las operaciones quirrgicas. Por esa poca, las muertes por infeccin despus de una operacin quirrgica eran muy frecuentes. El propio Lister tena anotado en su cuaderno de notas que el 45% de sus pacientes moran a causa de las infecciones quirrgicas. Para evitarlo utiliz una solucin diluda de fenol (que ya se saba que mataba a las bacterias) para lavar las ropas de los cirujanos y todo el material quirrgico, as como en spray en el quirfano durante la operacin. Estos experimentos fueron el origen de la tcnica asptica. Inmunizacin: En 1880 Pasteur utiliz las tcnicas de Koch para aislar y cultivar la bacteria que causa el clera en gallinas. Para probar su descubrimiento convoc una demostracin pblica del experimento que haba sido un xito repetidas veces en el laboratorio. Inyect un cultivo puro de la bacteria del clera en gallinas sanas y esper a que desarrollaran los sntomas y murieran. Per para su desgracia, las gallinas siguieron vivas. Revisando el experimento fallido descubri que haba utilizado cultivos viejos en lugar de cultivos frescos preparados especialmente para la demostracin. Algunas semanas ms tarde repiti el experimento usando dos grupos de gallinas: uno con gallinas inoculadas en el experimento anterior con el cultivo viejo y otro con gallinas nunca inoculadas. Ahora inyect en ambos grupos cultivos frescos. En este experimento las gallinas del segundo grupo murieron, pero las del primero permanecan vivas. Estos resultados intrigantes pronto encontraron una explicacin para Pasteur. El haba descubierto que la bacteria, si se dejaba crecer durante largo tiempo, poda volverse avirulenta. Pero esta bacteria avirulenta estimulaba algo en el hospedador, en este caso las gallinas, que resistan infecciones posteriores hacindoles inmunes a esa enfermedad. Pasteur aplic este principio de inmunizacin en la prevencin del carbunco en animales y funcion. A estos cultivos avirulentos los llam vacunas (del latn vacca). Usando este trmino Pasteur reconoci el trabajo de Edward Jenner que en 1798 vacun con xito a un nio (James Phipps) de viruela,

vacuna

que

obtuvo

de

las

pstulas

de

una

vaca

con

viruela.

El reconocimiento internacional de Pasteur le supuso un nuevo reto ya que le encargaron que encontrara una vacuna contra la rabia. En aquel momento no se conoca el agente causante de la rabia pero Pasteur crea que era un microorganismo. Hoy sabemos que es un virus. Finalmente obtuvo una vacuna frente a la rabia que funcionaba en perros, lo cual es diferente a humanos. En Julio de 1885, un nio llamado Joseph Meister fu mordido por un lobo rabioso, la familia del nio persuadi a Pasteur para que utilizara la vacuna en el nio (la enfermedad era mortal) que result un xito. Posteriormente esta vacuna salv a un grupo de campesinos rusos que haban sido mordidos por otro lobo rabioso. Como agradecimiento, el zar de Rusia envi a Pasteur 100.000 francos que utiliz para construir el Instituto Pasteur de Pars. Quimioterapia: El tratamiento de las enfermedades mediante compuestos qumicos no es nuevo. En 1495 ya se utilizaban sales de mercurio para tratar la sfilis, aunque este tratamiento hizo bueno el axioma: Graviora quaedum sunt remedia periculus, es decir "Es peor el remedio que la enfermedad" ya que determinados tratamientos, como es el caso del mercurio, son txicos para las clulas animales y humanas. Para que un agente quimioterpico sea efectivo en el tratamiento de una enfermedad infecciosa no slo debe de matar o inhibir al microorganismo causante de la infeccin sino que adems debe ser relativamente inocuo para las clulas humanas al exhibir toxicidad selectiva. El primer gran descubrimiento en este sentido fue hecho por Paul Ehrlich a principios del siglo XX. Este mdico alemn crea que era posible obtener un compuesto qumico que pudiera curar especficamente la sfilis sin daar al paciente. El conoca que el arsnico inhiba al microorganismo causante de la sfilis (Treponema pallidum) pero que tambin era txico para las clulas humanas. Ehrlich trabaj en la idea de que el arsnico poda incorporarse dentro de compuestos orgnicos de tal manera que perdiera su toxicidad para las clulas humanas manteniendo sus propiedades antimicrobianas. Despus de ensayar 605 sustancias con estas caractersticas encontr un compuesto, el 606, que cumpla estos requisitos. A esta sustancia la llam Salvarsan y fue el primer compuesto qumico sintetizado en laboratorio que poda curar una enfermedad sin ser txico para el paciente. Gracias a este descubrimiento le concedieron el premio Nobel en 1908. Hoy en da ya no se utiliza salvarsan para tratar la sfilis ya que ha sido reemplazado por un producto mucho ms efectivo, el antibitico penicilina. Hasta 1935 no se realiz ningn nuevo avance en quimioterapia. En ese ao Gerhard Domagk trabajando en la Bayer realiz un descubrimiento importante. Despus de llevar a cabo experimentos con ms de 1000 colorantes sintticos para comprobar si alguno de ellos poda curar las infecciones causadas por estreptococos en ratones sin daar a los animales, descubri que un colorante rojo llamado Prontosil era efectivo. Este descubrimiento le vali el premio Nobel en 1939. Curiosamente, este colorante no era capaz de inhibir el crecimiento de las bacterias crecidas en laboratorio; slamente era efectivo cuando las bacterias crecan dentro del cuerpo del animal. Esta aparente contradiccin fue resuelta en el mismo ao por un qumico francs Jacques Trfoul al observar que el prontosil era transformado en el cuerpo en un

compuesto incoloro diferente que s tena actividad especfica frente a bacterias. Esta nueva sustancia era la sulfonamida. En un corto perodo de tiempo se determin su estructura siendo posible sintetizarla en gran escala y desarrollar nuevos compuestos que se denominaron sulfamidas que an hoy en da se siguen utilizando. El salvarsan y las sulfamidas son ejemplos de agentes quimioteraputicos sintticos obtenidos mediante sntesis qumica en un laboratorio. Sin embargo, existe una segunda categora: agentes quimioteraputicos naturales, llamados antibiticos. Un antibitico es una sustancia producida por un microorganismo que es inhibitoria para otros microorganismos en muy pequea cantidad. En 1928 el microbilogo ingls Alexander Fleming observ que en una placa de agar inoculada con Staphylococcus aureus que estaba contaminada con el hongo Penicillium notatum, las colonias de Staphylococcus eran destrudas por alguna actividad de las colonias del hongo. A partir de este hongo realiz la extraccin de un compuesto que era el responsable del efecto inhibitorio al que llam Penicilina. Si bien Fleming reconoci el enorme potencial teraputico de la penicilina, encontr serios problemas para aislarla y purificarla. El primer ensayo clnico con una preparacin cruda de penicilina se llev a cabo el 12 de Febrero de 1941. El paciente era un polica de Oxford que se estaba muriendo por una infeccin con Staphylococcus (septicemia). Al administrarle penicilina se observ un mejoramiento espectacular, pero 5 das despus, cuando se les acab la penicilina, la infeccin volvi a emerger y el paciente muri. Este ensayo clnico fall debido a que no se poda obtener una produccin a gran escala de penicilina. En este punto (1940-1941) los britnicos estaban inmersos en la II guerra mundial. Los americanos se interesaron por la penicilina y la fundacin Rockefeller invit al ingls Florey para que investigara la produccin a gran escala de la penicilina junto con universidades e industrias farmacuticas americanas. Esta cooperacin hizo posible que un ao despus estuvieran disponibles grandes cantidades de penicilina. Muy pocos descubrimientos cientficos han tenido tanto efecto en el campo de la medicina como el descubrimiento de los antibiticos. Microbiologa y gentica (Neumococos, doble hlice e ingeniera gentica) Antes de 1940 el conocimiento del fenmeno gentico provena de las investigaciones sobre plantas y animales, pero no se saba si estos resultados se podan aplicar a los microorganismos. En 1944 Oswald Avery, Colin MacLeod y MacLyn McCarty descubrieron el papel del DNA en la gentica bacteriana. Encontraron que el material de DNA de un tipo de neumococos puede transferir una caracterstica hereditaria a otro tipo de neumococos. Posteriormente, en 1953 Watson, Crick y Wilkins descubrieron la estructura molecular del DNA. Estos descubrimientos, junto con otros, establecieron que la informacin gentica de todos los organismos est codificada en el DNA. Esto hizo de los microorganismos un modelo muy atractivo para la investigacin gentica. Actualmente y utilizando la tecnologa del DNA recombinante o ingeniera gentica se pueden transferir fragmentos de DNA de un organismo a otro.

http://edicion-micro.usal.es/web/educativo/micro2/tema01.html

1.1.3 RELACIN CON OTRAS CIENCIAS Y APLICACIONES

APLICACIONES Existen numerosos campos de aplicacin de la microbiologa: la industria alimentaria, la agricultura, el medio ambiente o la medicina, entre otros. De este modo, resultan de gran utilidad las fermentaciones que realizan algunos microorganismos, como la fermentacin alcohlica que realizan algunas levaduras; o la fermentacin lctica, que llevan a cabo las bacterias del cido lctico. Adems, los microorganismos se han utilizado en la obtencin de diferentes enzimas o por su capacidad de degradar o descomponer sustancias contaminantes, como el petrleo y otros hidrocarburos, presentes en la naturaleza. En general, la biotecnologa (empleo de organismos vivos para la obtencin de productos tiles) ha experimentado un gran avance en las ltimas dcadas. En medicina, la microbiologa estudia los mecanismos de infeccin, desarrollo y supervivencia de los agentes patgenos. Un conocimiento profundo de la estructura y fisiologa de estos microorganismos permite, en la prctica, una lucha eficaz contra numerosas enfermedades. Desde que en 1928 Alexander Fleming descubriera la penicilina, derivada del hongo Penicillium notatum, se han obtenido gran variedad de antibiticos a partir de otros microorganismos. Las distintas tcnicas empleadas en ingeniera gentica han permitido programar microorganismos con objeto de obtener distintos compuestos tiles como la insulina, la hormona del crecimiento, el interfern o determinadas vacunas. Adems, las investigaciones basadas en los microorganismos han sido cruciales para comprender muchos procesos vitales comunes a todos los seres vivos, como la replicacin del cido desoxirribonucleico (ADN) o la expresin del material gentico. Biblioteca de Consulta Microsoft Encarta 2004. 1993-2003 Microsoft Corporation. Reservados todos los derechos.

CAMPOS DE APLICACIN DE LA MICROBIOLOGA

Los microbilogos suelen especializarse en el estudio de determinados grupos de microorganismos. Hablando con propiedad, la bacteriologa es el estudio de las bacterias, si bien con frecuencia este trmino se usa como sinnimo de Microbiologa. La protozoologa es una rama de la parasitologa que se ocupa solamente del estudio de los protozoos. La parasitologa abarca el estudio de los protozoos y de otros micro y macroorganismos parsitos. La micologa es una rama de la microbiologa que trata de hongos como son las levaduras y los mohos. La virologa es la ciencia que se refiere a los virus. La ficologa se refiere, a las algas. No es raro que exista mayor especializacin en algunos aspectos biolgicos de un grupo especfico de microorganismos, como por ejemplo la gentica bacteriana, la fisiologa de las algas y la citologa bacteriana. Hay muchos campos de aplicacin de la Microbiologa, algunos de los cuales se comentan aqu para dar a entender la variedad y significacin de las actividades microbianas. MICROBIOLOGA MDICA Los microorganismos son mejor conocidos popularmente por las enfermedades que causan en los seres humanos, en otros animales y en las plantas. La rama de la Microbiologa que trata sobre los microorganismos productores de enfermedad en el hombre se conoce como Microbiologia mdica y los microbios causantes de enfermedad como patgenos, algunos de los cuales requieren un husped susceptible u rganos y tejidos especficos en donde puedan proliferar cuando no pueden desarrollarse en medios artificiales o sintticos de laboratorio.

A la Microbiologa mdica tambin le concierne prevenir y controlar las enfermedades. Algunos de los aspectos que abarca la Medicina preventiva son la antibiosis, la quimioterapia, la inmunizacin, la epidemiologa y los procedimientos de diagnstico. La importancia de los diversos tipos de microorganismos causantes de enfermedad se aclara conforme vamos estudiando este importante campo.

MICROBIOLOGA ACUTICA El microbilogo tambin se interesa en el estudio de las formas que se encuentran en un medio concreto. Este estudio a veces abre caminos por los cuales la Microbiologa puede aplicarse con provecho a los problemas industriales o de salud. Los microorganismos que se hallan en ambiente marino, en los estuarios, o en el agua dulce, con frecuencia son de los mismos que encontrarnos en el suelo y en el aire y los que dan calidad sanitaria al agua; pero su localizacin y actividades especializadas merecen considerarse por separado. La flora microbiana del mar representa un componente vital del proceso cclico que suministra material nutritivo para la vida en ese medio.

MICROBIOLOGA DEL AGUA Y DRENAJES DOMSTICOS El agua para uso domstico proviene de una de dos principales fuentes: de la superficie, como lagos o ros, o agua subterrnea como la de los pozos. El origen del agua de una u otra de estas fuentes es el mismo, la precipitacin pluvial. Al caer de la atmsfera, el agua pluvial arrastra los microorganismos transportados por el aire y puede acarrear los del suelo cuando corre. Ninguna de estas contaminaciones es muy importante por su gran dilucin en grandes masas o corrientes de agua y por su

filtracin a travs del suelo para llegar a los depsitos subterrneos. Estas defensas naturales no protegen al agua de la contaminacin microbiana por desperdicios humanos, domsticos, o industriales. Por lo tanto, el agua para uso humano debe ser filtrada, tratada qumicamente o someterla a ambos procesos para asegurar su inocuidad. Es indispensable que tambin los desperdicios sean tratados para eliminar microorganismos que producen enfermedades o malos olores. Esto se realiza mediante procedimientos qumicos y por microorganismos cuyo desarrollo se estimula en las instalaciones del drenaje, en donde digieren y oxidan el material orgnico y destruyen a los patgenos. El tratamiento adecuado, que varia segn el origen de los desperdicios, evita riesgos para la salud y aparta compuestos dainos para los peces y otras formas de vida acutica.

MICROBIOLOGA DE LA LECHE La leche es un alimento excelente para el hombre y los microbios. En la ubre de un animal sano est ms o menos libre de microorganismos pero llega a contaminarse durante las manipulaciones. Si no se guarda y refrigera adecuadamente, los microorganismos proliferan descomponindola, y si aumenta el nmero de patgenos, la hacen peligrosa para el consumo humano. Por la pasterizacin el contenido bacteriano de la leche se reduce en gran parte y las bacterias patgenas son destruidas. Algunos microorganismos intervienen en la produccin de queso, mantequilla y otros productos lcteos. Los microorganismos tienen tambin una funcin importante en la nutricin de las vacas lecheras e indirectamente participan en la produccin de leche. Vacas, ovejas, venados y camellos, son rumiantes con estmago multicavitado.

La primera cmara, la panza u omaso, almacena el forraje y en sta los microorganismos proliferan profusamente, digieren la celulosa, sintetizan protenas y vitaminas y modifican las grasas, todo lo cual contribuye a los requerimientos nutritivos del animal.

MICROBIOLOGA DE LOS ALIMENTOS Muchos alimentos sirven de igual manera para nutrir a los microorganismos y a los seres humanos. Para asegurarse que el alimento es inocuo para el consumo humano debe ser cuidadosamente tratado, guardado y preparado. Las enfermedades que se transmiten mediante los alimentos son infecciones o intoxicaciones. Las infecciones son causadas por diferentes organismos entre los cuales las salmonelas son muy comunes. Entre los microorganismos que causan intoxicaciones alimentarias figuran los estafilococos y los clostridios. Los peligros de infeccin por alimentos o la intoxicacin alimentaria, se reducen por la inspeccin de la carne y las materias primas que intervienen en los alimentos preparados, el aseo en las plantas de preparacin, la imposicin de reglamentos sanitarios a los manipuladores y preparadores de alimentos, la refrigeracin y el apego estricto a esas medidas sanitarias por los manipuladores de alimentos, y la imposicin de leyes de salubridad federales, estatales y locales. Muchos microorganismos son tambin benficos para los seres humanos ya que, al fermentar originan bebidas alcohlicas, queso, pan y otros productos importantes.

MICROBIOLOGA INDUSTRIAL Sustancias medicinales, bebidas alcohlicas, enzimas y cidos orgnicos son algunos ejemplos de lo que, a escala comercial, producen los microorganismos. Las actividades qumicas tiles de las bacterias, levaduras, mohos y algas, son explotadas para obtener de estos microorganismos productos de valor, despus de haberlos cultivado en un medio relativamente poco costosos.

MICROBIOLOGA DE LOS INSECTOS Muchas enfermedades de las plantas y de los animales son transmitidas por insectos portadores, los cuales es esencial combatir para evitar muchas

enfermedades importantes como el paludismo y la fiebre amarilla. Los insecticidas qumicos han sido muy eficaces para este fin; sin embargo, su extenso uso ha creado otros problemas, principalmente ecolgicos. Para evitar el uso de sustancias qumicas se ha intentado destruir los insectos dainos por infecciones a las que no son susceptibles los insectos tiles. Se necesita una mayor investigacin de los mtodos para el control biolgico de los insectos indeseables sin poner en peligro a los animales y plantas tiles.

1.2. IMPORTANCIA 1.2.1. EN LA INDUSTRIA

IMPORTANCIA INDUSTRIAL La microbiologa industrial est dedicada a la utilizacin comercial de microorganismos e incluye procesos que tienen gran importancia econmica,

ambiental y social. Tradicionalmente se ha utilizado la palabra fermentacin en microbiologa industrial para describir los procesos de cultivo de microorganismos con propsitos industriales. Sin embargo, no hay que confundir esta utilizacin del trmico con el proceso bioqumico de fermentacin consistente en la regeneracin del poder reductor (NADH) por un procedimiento no oxidativo (estos procesos se estudiarn ms adelante en el curso). La fermentacin que tiene lugar en la produccin del vino, en este sentido, comprende ambos significados: por un lado, se trata

bioqumicamente de un proceso de fermentacin (produccin de alcohol a partir de glucosa en condiciones anaerobias) y es una fermentacin industrial en el sentido de que se trata de un proceso industrial llevado a cabo por microorganismos. El desarrollo de una fermentacin industrial incluye dos tipos de procesos denominados, por sus nombres en ingls, procesos upstream y procesos downnstream. Los procesos upstream comprenden la seleccin y preparacin del microorganismo, la preparacin del medio de cultivo y de las condiciones de fermentacin (cultivo). Los procesos downstream incluyen la purificacin del producto y el tratamiento de los residuos de la fermentacin. En el proceso de fermentacin del mosto de uva para producir vino, podemos distinguir los procesos upstream de la seleccin y preparacin de cepas de levadura, tratamiento del mosto y acondicionamiento de loas condiciones de fermentacin. Los procesos downstream comprenden, en este caso, el tratamiento del vino para su clarificacin y el de los residuos del proceso.

Los productos fabricados por fermentaciones industriales pueden agruparse grosso modo en dos clases:

(1) Los productos de gran volumen y bajo valor (en este grupo se incluyen

los productos alimenticios, bebidas, aditivos alimentarios y algunos productos qumicos producidos por fermentacin) y (2) Los productos de bajo volumen y alto valor (los frmacos, por ejemplo).

Por otro lado, hay que sealar que tienen origen en fermentaciones industriales un gran nmero de productos de uso cotidiano que pertenecen a diferentes grupos: (1) Alimentos (derivados lcteos y de vegetales fermentados), bebidas (vino,

cerveza, etc.), aditivos alimentarios (vinagre, cido ctrico, carotenos, etc.). (2) Productos farmacuticos: antibiticos B-lactmicos (penicilinas y

cefalosporinas), antibiticos aminoglicsidos y tetraciclinas; compuestos antitumorales y otros frmacos (lovastatina, por ejemplo, utilizada para controlar la produccin de colesterol). (3) Enzimas microbianas tales como proteasas, amilasas, etc. (4) Productos qumicos tales como alcoholes, polisacridos, disolventes (acetona), lpidos, productos base para la produccin de plsticos, etc. (5) Productos recombinantes diseados por ingeniera gentica.

Adems de estas utilidades, los microorganismos se usan industrialmente en

ciertos procesos de microbiologa ambiental tales como el tratamiento de residuos slidos y lquidos y en biorremediacin. Estos aspectos sern tratados ms adelante en este curso. No todos los microorganismos presentes en los alimentos son dainos ni deterioran la comida. Uno de los primeros usos de la biotecnologa fue su aplicacin a los alimentos para la obtencin de productos fermentados. Estos son alimentos en los que microorganismos, como las bacterias del cido lctico o algunas levaduras y mohos, se aaden a los alimentos o se favorece su crecimiento en ellos con el fin de que sus enzimas los modifiquen y den lugar a nuevos productos y sabores. Los ejemplos ms conocidos son: el vino, elaborado por la accin de levaduras sobre el jugo de uva, el yogur y algunos quesos, que se elaboran por fermentacin de la leche gracias a la accin de las bacterias del cido lctico, y los mohos, empleados en algunos quesos curados, como el Camembert. Fermentacin, cambios qumicos en las sustancias orgnicas producidos por la accin de las enzimas. Esta definicin general incluye prcticamente todas las reacciones qumicas de importancia fisiolgica. Actualmente, los cientficos suelen reservar dicha denominacin para la accin de ciertas enzimas especficas, llamadas fermentos, producidas por organismos diminutos tales como el moho, las bacterias y la levadura. Por ejemplo, la lactasa, un fermento producido por una bacteria que se encuentra generalmente en la leche, hace que sta se agrie, transformando la lactosa (azcar de la leche) en cido lctico. El tipo de fermentacin ms importante es la fermentacin alcohlica, en donde la accin de la cimasa segregada por la levadura convierte los azcares simples, como la glucosa y la fructosa, en alcohol etlico y

dixido de carbono. Hay otros muchos tipos de fermentacin que se producen de forma natural, como la formacin de cido butanoico cuando la mantequilla se vuelve rancia, y de cido etanoico (actico) cuando el vino se convierte en vinagre. Generalmente, la fermentacin produce la descomposicin de sustancias orgnicas complejas en otras simples, gracias a una accin catalizada. Por ejemplo, debido a la accin de la diastasa, la cimasa y la invertasa, el almidn se descompone (hidroliza) en azcares complejos, luego en azcares simples y finalmente en alcohol. La glicerina, la propanona, el butanol y el cido butrico se producen actualmente a escala comercial por procesos especiales de fermentacin. Varios productos de fermentacin de la leche como la lactobacilina, el kfir y el yogur se consumen abundantemente debido a sus propiedades nutritivas. La accin de ciertas bacterias sobre los carbohidratos no digeridos produce la fermentacin en el intestino humano. Desde la antigedad, el etanol se ha obtenido por fermentacin de azcares. Todas las bebidas con etanol y casi la mitad del etanol industrial an se fabrican mediante este proceso. El almidn de la patata (papa), del maz y de otros cereales constituye una excelente materia prima. La enzima de la levadura, la cimasa, transforma el azcar simple en dixido de carbono. La reaccin de la fermentacin, representada por la ecuacin: C6H12O6 2C2 H5OH + 2CO2

Es realmente compleja, ya que los cultivos impuros de levaduras producen una amplia gama de otras sustancias, como el aceite de fusel, la glicerina y diversos cidos orgnicos.

Ciertos microorganismos, tanto determinados hongos como algunas bacterias, producen sustancias qumicas que resultan txicas para algunas bacterias especficas. Estas sustancias, entre las que se incluyen la penicilina y la estreptomicina, son los denominados antibiticos; producen la muerte de las bacterias o impiden su crecimiento o reproduccin. En la actualidad, los antibiticos estn desempeando un papel cada vez ms importante dentro de la medicina para controlar las enfermedades bacterianas. Los virus son tiles como sistemas modelo para estudiar los mecanismos que controlan la informacin gentica, ya que en esencia son pequeas piezas de esta informacin. Esto permite a los cientficos estudiar sistemas de replicacin ms simples y manejables. Estas algas son importantes en la formacin de los arrecifes de coral, al producir material nuevo y sedimentarse junto a otros organismos. Las paredes celulares de ciertas algas rojas son la nica fuente de donde se extraen dos carbohidratos polisacridos de gran importancia econmica: el agar y el carragun. Ambas sustancias estn qumicamente relacionadas y tienen propiedades suspensivas, emulsionantes, estabilizantes y gelidificantes. El agar es conocido por su uso en la preparacin de los medios de cultivo para los microorganismos; el carragun por su empleo en la fabricacin de productos lcteos, aunque tambin se usa en la industria textil, en cosmtica, en farmacia y en tipografa. Varias algas rojas, de las cuales la ms conocida es el nori, son importantes en la dieta de algunos pueblos, especialmente en Japn. El alginato, un polisacrido que se obtiene de los feofitos, se usa y comercializa del mismo modo que el agar o el carragun. Las algas pardas son tambin fuente de

vitaminas y

minerales y se utilizan como fertilizantes. Algunas especies (como el

kobu) constituyen un aporte alimenticio importante, especialmente en la comida japonesa contribuyendo de forma significativa a la cadena alimentaria de los habitis acuticos. Sus paredes celulares estn impregnadas con slice y se fosilizan dando lugar a la formacin de rocas denominadas tierra de diatomeas, que se usa como abrasivo y filtrante. Hoy se cultiva y comercializa como suplemento diettico rico en protenas. Junto con las bacterias, los hongos son los causantes de la putrefaccin y descomposicin de toda la materia orgnica. Universidad estatal de Washington, y por otro la obtencin de las primeras plantas transgnicas de tabaco en 1983 mediante la utilizacin de Agrobacterium tumefaciens por M. D. Chilton, del mismo departamento, sealaron el inicio de la era de obtencin de plantas transgnicas resistentes a insectos. 1.2.2. EN EL AMBIENTE MICROBIOLOGA DEL AIRE La clase y nmero de microorganismos del aire vara segn el medio. Los microorganismos del aire libre estn influenciados por las condiciones meteorolgicas y por el tipo de terreno. Las partculas inertes y microbianas que flotan en el aire son llevadas a grandes distancias por los vientos. En los grandes depsitos de agua, las olas dispersan las partculas que contienen microorganismos pues al levantarse con el agua son transportados muchos kilmetros. La supervivencia de estos microorganismos en el agua depende de diversos factores entre los cuales figuran las ondas de luz ultravioleta y, posiblemente, otras microbicidas de la luz solar. Si bien

por lo regular, hay muchas clases de microorganismos en el aire, su nmero no aumenta porque carecen de sustancias nutritivas adecuadas. En el aire de las habitaciones existe la posibilidad de encontrar

microorganismos productores de enfermedades bastante mayor que en el air libre puesto que estn mucho menos esparcidos. Adems, el aire de una habitacin est contaminado por sus ocupantes que emiten partculas al respirar, toser, o por la conversacin. El aire puede ser saneado por procedimientos mecnicos y qumicos.

1.2.3 EN LA PRODUCCIN AGROPECUARIA MICROBIOLOGA DEL SUELO Hay microorganismos que mejoran la fertilidad del suelo al fijar el nitrgeno atmosfrico en compuestos nitrogenados utilizados por las plantas para sintetizar protenas; convierten en el suelo sustancias orgnicas en compuestos inorgnicos hacindolos disponibles para las plantas. Damos por supuesto que los

microorganismos descomponen plantas y animales muertos; pero por lo general no nos damos cuenta de las reacciones bioqumicas que efectan para hacer el suelo frtil, proporcionando materias nutritivas para el desarrollo de las plantas. Es ste un proceso muy complejo en el que participan muchos microorganismos. Se calcula que un pie/acre de tierra frtil contiene cerca de 500 kilogramos de bacterias y tal vez una cantidad igual de hongos, protozoos y algas. En trminos generales es correcta la afirmacin en el sentido de que cuantos ms organismos hay en el suelo ste es ms productivo.

Compostaje. El compostaje es un proceso de fermentacin slida espontnea basado en el aumento de la temperatura producido por la actividad de los microorganismos. El material a comportar es el medio de cultivo, la fuente de nutrientes, el inculo, la fuente de agua y el producto final. El propio material retiene el calor producido por los microorganismos y esto causa el aumento en la temperatura del proceso. Para esto es necesario que la cantidad de material a comportar supere un mnimo crtico. Generacin de calor durante el compostaie. El aumento de la temperatura durante el proceso de compostaje se debe al catabolismo aerobio del material compostable por los microorganismos que forman su flora natural. Como consecuencia de este metabolismo aerobio se utilizan los carbohidratos, lpidos y protenas del substrato como fuente de carbono y de energa por los microorganismos quimioheterotrofos; estos nutrientes son metabolizados por rutas diferentes que convergen en ciclos productores de gran cantidad de energa (ciclo de Krebs o de los cidos tricarboxlicos) tanto directamente utilizable (una molcula de ATP por ciclo completo) como obtenible mediante la cadena transportadora de electrones (cadena respiratoria, 2 molculas de NADH+H +, una de NADPH+H+ y una de FADH2 por vuelta de ciclo). Parte de esta energa la disipan los microorganismos como calor, necesario para elevar la temperatura ambiental de forma que puedan funcionar metablicamente de forma ms eficiente. Cuando, debido al apilamiento de material compostable, parte del calor producido queda

atrapado en el mismo material en proceso de compostaje, se produce un efecto de retroalimentacin de la generacin de calor. Procesos de lodos activados Descripcin del sistema bsico: Tratamiento iniciado en Inglaterra a principios de este siglo y que se ha difundido mucho, consiste en un tratamiento aerobio que oxida la materia orgnica a CO2 y agua y NH4+ y nueva biomasa. El aire necesario para el tratamiento se proporciona mediante difusin o por tratamiento mecnico. Durante el tratamiento los microorganismos forman flculos que, posteriormente, se dejan sedimentar en un tanque ad hoc denominado tanque de clarificacin. El sistema bsico comprende, pues, un tanque de aireacin y un tanque de clarificacin por los que se hace pasar los lodos varias veces. Los dos objetivos principales del sistema de lodos activados son (1) La oxidacin de la materia biodegradable en el tanque de aireacin y (2) La floculacin que permite la separacin de la biomasa nueva del efluente tratado.

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