Suplemento de innovacin, tecnologa e inveStigacin del Semanario puntoedu

Ao 2 N 18

del 5 al 18 de abril del 2010

algoritmos contra el cncer

ILUSTRACIN: AUgUSTO PATIO

BENJAMN CASTAEDA, PROFESOR DEL DEPARTAMENTO DE INGENIERA DE LA CATLICA, DESARROLL UN NOVEDOSO MTODO PARA DETECTAR NEOPLASIAS MALIGNAS.

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matemticas salvavidas

Por david PErEda

ue las matemticas pueden salvar vidas queda ms que demostrado gracias a una frmula desarrollada en la Universidad Catlica: los algoritmos diseados por el profesor Benjamn Castaeda Aphan, del Departamento de Ingeniera, anuncian un avance exponencial en la lucha contra esta enfermedad, una de las principales causas de muerte en el mundo. De hecho, segn la Organizacin de las Naciones Unidas (ONU), este ao el cncer se convertir en la principal causa de muerte en todo el planeta, superando las producidas por dolencias cardiovasculares. Las estadsticas revelan un panorama preocupante. En los hombres, las neoplasias malignas ms frecuentes atacan el estmago y la glndula prosttica. En mujeres, el cuello del tero y la mama. En el Per, cada ao mueren 15 mil personas aproximadamente a causa de este mal, segn clculos del Instituto Nacional de Enfermedades Neoplsicas (INEI). Asimismo, estima que habr alrededor de 42 mil nuevos enfermos de cncer cada ao en nuestro pas.

Futuro. La sonoelastografa CrW persigue convertirse en un mtodo no invasivo para detectar el cncer.

Sonido e imagen. En 1988, la Universidad de Rochester, en Estados Unidos, inici una investigacin para detectar neoplasias en tejidos suaves a travs de la captura de imgenes. Los avances tecnolgicos para obtenerlas de tejidos humanos entusiasmaron al profesor Kevin J. Parker, uno de los iniciadores. Los estudios en Rochester incluyeron tcnicas como la resonancia magntica, la tomografa, el ultrasonido y los rayos X.

En El PEr muErEn al ao 15 mil PErsonas aProximadamEntE a causa dEl cncEr.

En nuestro pas, Castaeda daba sus primeros pasos en el conocimiento de las ciencias. En 1995, ingresa a la Catlica para estudiar ingeniera electrnica. Siendo el benjamn de una familia de mdicos, abandona una vacante en la Facultad de Medicina de San Marcos. Quera ms aplicar la electrnica a la medicina, recuerda.

En el 2001, parte a Nueva York para seguir estudiando. Cursa una maestra en el Rochester Institute of Technology, sobre visin por computadora, y un doctorado en la Universidad de Rochester, sobre extraccin de informacin de las imgenes de sonoelastografa, una tcnica desarrollada en el laboratorio del citado profesor Parker. La sonoelastografa detecta la elasticidad y dureza en los tejidos humanos. Para esto, utiliza una tcnica que se aplica comnmente en las ecografas: sobre el tejido, se emiten ondas de ultrasonido inaudibles para el hombre que, al rebotar, generan una imagen. A esto, la sonoelastografa le agrega vibraciones inducidas desde el exterior que, al causar reac-

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Desde 1988, la Universidad de Rochester, en Nueva York, Estados Unidos, investiga cmo detectar el cncer por medio de diversas tcnicas de imgenes mdicas. Su Departamento de Ingeniera Elctrica e Informtica conform un grupo, iniciado por el profesor Kevin J. Parker (en la foto, con abrigo marrn largo), al que se uni Benjamn Castaeda (al centro, con casaca negra). Este egresado y docente de la Catlica, es tambin el jefe del Laboratorio de Imgenes Mdicas de nuestra Universidad.

elequipo

ciones distintas, revelan diversos grados de elasticidad y dureza. Al definir distintos grados de dureza, se podran identificar los tumores cancergenos de un modo efectivo y que no es invasivo como los mtodos actuales, explica Castaeda. En efecto, actualmente la deteccin del cncer supone procesos que desgastan al paciente y cuyos resultados no son definitivos, como las pruebas de sangre y las biopsias, que consisten en la extraccin de muestras del tejido para su evaluacin. Para el cncer de prstata, se aplica el tacto en el recto, que solo puede percibir ndulos superficiales. Sin embargo, las investigaciones en Rochester, en las que particip Castaeda como estudiante de doctorado, solo desarrollaron un modelo. No fue probado en muestras humanas, sino en material de simulacin como la gelatina. Su aplicacin exitosa en tejidos reales requera un proceso de algoritmos que mostrara la imagen con precisin. De hecho, las diversas caractersticas de un tejido suponen muchas interferencias. Para una definicin ms precisa de la imagen, se analiz matemticamente

HecHo en per. De vuelta en nuesBenjamn Castaeda, liwei an, shuang wu, laurie l . Baxter, jorge l. Yao, jean v. joseph, Kenneth Hoyt, john strang, deborah j. rubens y el profesor parker elaboraron la investigacin deteccin de cncer de prstata utilizando Crawling wave so nelastography que financi el national institutes of Health (niH), homlogo de nuestro ministerio de salud.

el comportamiento de las ondas que se generaban. As surgi la sonoelastografa Crawling Wave (CrW), que estima la velocidad de las ondas de ultrasonido al atravesar el tejido. Calculada esta velocidad, se obtiene una imagen mejor definida salvando interferencias.

tro pas, Castaeda se reincorpor a la Catlica como docente del Departamento de Ingeniera. En el 2006, dict el curso Formacin y Procesamiento de Imgenes Mdicas. Fue la semilla del actual Laboratorio de Imgenes Mdicas (LIM), que naci en agosto del ao pasado en la seccin de Electricidad y Electrnica. Como jefe del LIM, Castaeda promovi un acuerdo entre nuestra Universidad y la estadounidense para continuar sus investigaciones. Los avances del grupo de Rochester relacionados a la deteccin de cncer de prstata, entre otros trabajos cientficos, requeran perfeccionamiento. La Catlica aprob la iniciativa de su entusiasta profesor. Con este respaldo, desarroll los algoritmos entre frecuencias, curvas, senos y cosenos para generar una aplicacin exitosa de la tcnica del CrW. El ao pasado, con otros investigadores de Rochester y de la Universidad de Alabama, evalu esta tcnica para detectar cncer en glndulas de prstata reales. Asimismo, estim las propiedades de viscosidad y elasticidad en el tejido normal y en el tejido canceroso.

eldato

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Se consiguieron resultados de quince glndulas de prstata extradas despus de ciruga. En cada una se tomaron imgenes de sonoelastografa Crawling Wave proveniente de tres secciones. Luego, estas imgenes fueron comparadas con pruebas del tejido en fsico o histologa de las mismas secciones. El trabajo demostr una buena correspondencia entre sonoelastografa CrW y la histologa, con una exactitud de 80%. Lo obtenido sugiere que la sonoelastografa CrW puede ser utilizada para la deteccin del cncer con una exactitud mejor que la obtenida por ultrasonido, aunque necesita ser mejorada para reemplazar a la biopsia. Como una aplicacin ms inmediata, puede aprovecharse para guiar la toma de muestras para biopsias, explica Castaeda. No solo puede aplicarse a la prstata sino a cualquier tejido suave, como la mama, el hgado o la tiroides, agrega. Se exceptan otras versiones de cncer como la leucemia. La investigacin fue publicada en la revista especializada Proceedings of SPIE con el ttulo Deteccin de cncer de prstata utilizando Crawling Wave Sonelastography. Por este trabajo, Castaeda fue uno de los ganadores del Premio a la Investigacin PUCP 2009 en la categora Docentes-Trabajos Publicados. El futuro incluye el estudio en mayor nmero de glndulas extradas tras la ciruga y experimentos en pacientes. Si las pruebas replican lo que Castaeda encontr, habra un mtodo de deteccin de cncer efectivo y no invasivo. Ms an, se implementara con facilidad en ecgrafos comerciales como los que hay en el Per. Cuntas vidas se salvaran!

ms all de lo evidente

El ExpErimEnto dEl profEsor BEnjamn CastaEda Com la EfECtividad dE la innovadora tCniCa dEl Crawling tEjido Extirpado. En quinCE glndulas dE prstata, dE tumorEs dE CnCEr al dEfinir imgEnEs Con EfECtos m El siguiEntE paso sEr apliCarlo a tEjidos sin Extirpa

1
Extraccin de tejido afectado

2
ultrasonido

tejid

cubo gelat

Las glndulas de prstata fueron extradas en ciruga. Correspondan a quince pacientes con cncer de prstata de los Estados Unidos. Las muestras fueron tomadas para aplicar una novedosa tcnica de reproduccin de imgenes mdicas, la sonoelastografa crawling Wave (crW), y contraponer sus resultados a la evidencia en fsico.

En cada glndula se aplic la que detecta la elasticidad y utilizando ondas sonoras. Pr n la glndula en un cubo de el tejido circundante en un cu se aplicaron ondas de ultras y vibracin generada desde

sonoelastografa:
elaStografa por vibracin. Tcnica para detectar la elasticidad en los tejidos generando vibracin. Las investigaciones tuvieron financiamiento de general Electric.

TECNOLOgAS USADAS EN ESTA MEgAINvESTIgACIN

elaStografa por comprenSin. Tcnica para detectar la elasticidad en los tejidos aplicando comprensin. Fue desarrollada por la empresa de sistemas mdicos Hitachi. elaStografa de reSonancia magntica (mre). Reproduccin de la propagacin de ondas mecnicas utilizando resonancia magntica. Tcnica desarrollada por Phillips.

fuerza de impulSo acStica (arfi). Utili una radiacin acstica (o para generar imgenes d mecnicas del tejido. Las fueron impulsadas por la tecnologa Siemens.

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mproB g wavE En EtECt mECniCos. ar.

Al rebotar, las ondas de ultrasonido generan una imagen de la glndula de prstata. Las distintas reacciones mecnicas producidas por las vibraciones revelan diversos grados de elasticidad y dureza. Las caractersticas del tejido reproducen mltiples interferencias, que configuran una imagen no muy precisa.

imagen sin refinar del sonoelastgrafo

do

Fuente externa de vibracin

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Luego de aplicar el CrW, se obtiene una imagen ms definida. Esta tcnica efecta un anlisis matemtico de las ondas que se forman en el tejido por la sonoelastografa. Los algoritmos eliminan interferencias. Se demostr una exactitud de 80% al compararla con la evidencia en fsico.

o de tina

imagen luego del procesamiento

de radiacin iza la fuerza de ondas sonoras) de las propiedades s investigaciones a empresa de

elaStografa de tranSicin. Tecnologa no invasiva que utiliza una vibracin de baja frecuencia y ultrasonidos para medir la elasticidad. Fue desarrollada por la firma Sonoscan.

crawling wave. Anlisis matemtico que estima la velocidad de las ondas de ultrasonido al atravesar el tejido. Fue desarrollada por la Universidad de Rochester.

fuerza de radiacin de ultraSonido eSpacialmente modulada (Smurf). Tcnica que usa la fuerza de la radiacin acstica, tambin desarrollada en la Universidad de Rochester.
FUENTE: UNIvERSIDAD DE ROCHESTER

ILUSTRACIONES: AUgUSTO PATIO

a sonoelastografa, y dureza en el tejido reviamente, se intere gelatina para simular uerpo humano. Luego sonido contra el tejido dos fuentes externas.

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laentrevista

BEnJamn castaEda Jefe del Laboratorio de Imgenes Mdicas de la Catlica

Quise unir la electrnica y la medicina

usted viene de una familia de mdicos. As es. Mi padre trabaj en el Hospital Rebagliati y ahora dirige el Instituto de Investigacin de la Facultad de Medicina de la Universidad de San Martn. Es cirujano y en la parte de docencia se ha desarrollado en farmacologa. Estudia plantas medicinales, cuantifica su efecto y por qu funcionan. Mi madre es geriatra de San Marcos, ya se retir. Mi hermano es cirujano y actualmente trabaja en el Rebagliati. no quiso seguir esa tradicin familiar? Ingres a Medicina en San Marcos, pero decid quedarme en la Catlica, en Ingeniera Electrnica. Cuando fui admitido en el doctorado de la Universidad de Rochester, fue para estudiar el procesamiento de imgenes mdicas. Una doctora que me conoca desde la adolescencia se puso muy contenta y me dijo: Qu bueno que hayas conseguido alcanzar tu sueo, porque cuando recin la conoc pregunt qu era lo que quera hacer y yo le respond que deseaba juntar la electrnica con la medicina. Es popular el campo de las imgenes mdicas en la electrnica? La electrnica es un medio para. Puede ser aplicada en todo. Hoy creo que, por ejemplo, no hay actividad que no utilice una computadora, y eso es parte de la electrnica. En la electrnica, hay un buen nmero interesado en la parte de medicina. Otro buen nmero est relacionado con la parte de control. Antes de en cmo utilizar mejor la tecnologa. Se habla mucho de sistemas de manejo de informacin de imgenes. Es como una palabra de moda o un producto que todo el mundo comienza a comprar pero realmente no le saca el mejor provecho. Falta capacitacin en el uso de la tecnologa. Y en investigacin? No la hay de este tipo. En la Universidad Cayetano Heredia hay una investigacin en tuberculosis que utiliza procesamiento de imgenes, pero no son imgenes mdicas, sino biomdicas, imgenes microscpicas. Nosotros tambin hacemos una sobre el mismo tema en el Laboratorio de Imgenes Mdicas de la Catlica. Justamente este laboratorio apunta a la investigacin. Nuestra visin es convertirnos en un grupo de investigacin, innovacin y desarrollo que en cinco aos sea el referente a nivel nacional en temas relacionados a imgenes mdicas e ingeniera biomdica. Actualmente, desarrollamos proyectos de ultrasonido con el Radio Observatorio de Jicamarca, medicin de leishmaniasis, deteccin de tuberculosis, entre otros, que han generado temas de tesis en pregrado y posgrado.

Buscamos sEr, En cinco aos, El rEFErEntE a nivEl nacional En imGEnEs mdicas E inGEniEra Biomdica.
que se dividiera la seccin, la especialidad ms popular era Telecomunicaciones, que ahora tiene su propia seccin. cmo est el Per en tecnologa de imgenes mdicas? En el pas no desarrollamos tecnologa, sino consumimos. Ahora se anuncia mucha inversin en la adquisicin de equipos para hacer tomografas o resonancia magntica. Pero falta mucho entendimiento

laficha

Benjamn Castaeda es ingeniero electrnico de la Catlica y doctor especializado en extraccin de informacin de las imgenes sonoelastogrficas. Es profesor en el Departamento de Ingeniera y dirige el Laboratorio de Imgenes Mdicas de la PUCP.

Una resea del trabajo de Castaeda en la Universidad de Rochester aparece en: www.ece.rochester.edu/projects/ sonoelasticity/sonoelasticity/use_ cancer_detection.html

laweb

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FRANZ KRAJNIK

cmo han respondido los alumnos al trabajo del laboratorio? Hay mucho inters en el tema de imgenes mdicas. El laboratorio se cre a iniciativa nuestra. En el 2006, vine de Estados Unidos a dictar un curso. Se form un grupo de inters en estos temas y empezamos a trabajar. Tenemos diecisiete miembros entre alumnos de pregrado y posgrado, ingenieros y graduados de varias especialidades. Nuestro trabajo es publicado en revistas especializadas y reconocido en congresos internacionales. Adems, este ao la Universidad Catlica ha iniciado la Maestra

en Procesamiento de Seales e Imgenes Digitales. cmo llega a estudiar en rochester? Cuando estudiaba en la Catlica fui presidente de la rama estudiantil del IEEE (Institute of Electrical and Electronics Engineers). Organizamos una charla a la que vino un profesor de Florida que estaba buscando estudiantes. En el 2001, cuando decid ir a estudiar en el extranjero, lo contact y descubr que se haba trasladado a Rochester. Me fui all a estudiar una maestra en el Rochester Institute of Technology y posteriormente

inici un doctorado en la Universidad de Rochester, donde me involucr en la sonoelastografa. Ha ganado varios premios y es uno de los profesores ms activos. As parece (risas). Soy uno de los ganadores del Concurso Anual de Proyectos de Investigacin PUCP 2010, en el que present uno sobre diagnstico automatizado de tuberculosis. Tambin del Fondo Concursable 2009, con un sistema para administrar informacin mdica en zonas rurales, desarrollado con la profesora Layla Hirsh.

sobre procesamiento de imgenes: digital image processing rafael c. Gonzlez y richard E. Woods Upper Saddle River, NJ: Pearson Education, 2008 Cdigo: TA 1632 g71 2008 (B. de Ingeniera)

ellibro

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neocampus
INFOPUC

Por: diEGo Grimaldo dgrimaldo@pucp.edu.pe

twit o no twit
Apenas twitter cumpli cuatro aos en el ciberespacio, el 21 de marzo pasado, la pgina web britnica Mashable efectu una interesante encuesta entre los usuarios del microblogging. El estudio arroj las razones ms comunes por las que las personas usan dicho servicio. Las respuestas ms populares fueron: para encontrar amor, para ser famoso en Internet, para estar actualizado con los acontecimientos recientes, para seguir a celebridades, entre otras.

seminarios a la medida
EI Instituto de Informtica (InfoPUC) ofrece una serie de cursos y seminarios prcticos orientados a actualizar el trabajo profesional de sus participantes, al brindarles los criterios necesarios para alcanzar la sistematizacin exigida en el manejo de la informacin en la actividad empresarial. En esa lnea, desde este jueves desarrollar el seminario Microsoft Project, una herramienta de gestin que ayuda a la planificacin y el diseo de proyectos. El viernes arrancan los seminarios grficos y Tablas Dinmicas en Excel, y Ms visio Aplicado a la Mejora de Procesos. Y el domingo comienza el de MATLAB Essential, un lenguaje matrices y vectores ampliamente usado en diversas disciplinas como ingeniera, fsica, matemticas aplicadas, finanzas y economa.

visita la PGina WEB dE inFoPuc, www.infopuc.pucp. edu.pe, Y oBtn maYorEs dEtallEs soBrE sus sEminarios Y cursos.

140
razones por las cuales la gente ama Twitter obtuvo en total la encuesta de Mashable.

culturacin
Quieres saber cmo mejorar el desempeo de tu PC? No tienes la ms mnima idea de lo que es un cdec o deseas perfeccionar tu manejo al detalle de Microsoft Word? Te recomendamos dar un paseo por el blog de artculos tecnolgicos educativos Culturacin (www.culturacion.com). A la larga, te volvers un monstruo en computacin con tan solo unos clics.

la catlica en tu celular
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ojo al curso
Ya estn abiertas las inscripciones para el curso terico-prctico Qumica analtica y validacin de mtodos de Ensayo, dirigido principalmente a jefes de laboratorios de qumica, profesionales qumicos, ingenieros qumicos y analistas. Informes e inscripciones en el Instituto de Corrosin y Proteccin de la Catlica: telfono 626-2000 anexos 2510 y 3071. Comenzar el 19 de abril.

loltimo

Si no ests satisfecho con la memoria que tiene tu celular, la compaa SanDisk te va a alegrar el da: recientemente lanz al mercado su tarjeta MicroSDHC de 32 gigas. Provecho.