Aula de Bioqumica Avanada

Tema:

Bioenergtica
Prof. Dr. Jlio Csar Borges
Depto. de Qumica e Fsica Molecular DQFM Instituto de Qumica de So Carlos IQSC Universidade de So Paulo USP E-mail: borgesjc@iqsc.usp.br mail:

Energia Necessria 1) Movimento 2) Transporte ativo 3) Sntese Organismos Aerbicos Anaerbicos - Obrigatrios - Falcutativos Segundo a sua fonte de energia

Fluxo energtico e de compostos

Vias Metablicas

Anabolismo:
Via Biossinttica - Utilizao de energia na forma de Trabalho - Sntese de biomolculas - Multiplicao Endergnica

Catabolismo:
Via degradativa - Extrao de energia - Simplificao das molculas a compostos comuns Exergnica

Vias Metablicas
As vias catablicas e anablicas esto relacionadas O ATP e o NADPH produzidos pela degradao de metablitos complexos so fonte de energia para reaes biossintticas e outras reaes

Vias Metablicas
- So interdependentes - So coordenadas

Mapa Metablico
- Sumariza a interdependncia e coordenao das reaes anablicas e catablicas - Mais de 1000 reaes podem ocorrer ao mesmo tempo na E. coli

- Mais de 2000 reaes conhecidas catalisadas por enzimas diferentes - So simples e de tipos comuns

Vias Anfiblicas
Conjunto de reaes que podem ser tanto Anablicas como Catablicas. Catablicas. Dependem da condio energtica da clula

Biossntese e degradao so quase sempre distintas

1- Ocorrem por vias diferentes. 2- Envolvem enzimas diferentes numa mesma via. 3- Podem ser compartimentalizadas. compartimentalizadas.

Procarioto versus Eucarioto

Procarioto versus Eucarioto

Ambos os organismos so muito bem adaptados aos seus estilos de vida

T.A. Bramley (1982) TIBS

As vias metablicas ocorrem em locais especficos das clulas

Mitocndria: ciclo do cido ctrico, fosforilao oxidativa, oxidao de cidos oxidativa, graxos, degradao de aminocidos Citosol: gliclise, via das pentoses-fosfato, biossntese de cidos graxos, Citosol: gliclise, pentosesgliconeognese Lisossomo: digesto enzimtica Ncleo: replicao e transcrio de DNA, processamento do RNA Aparelho de Golgi: processamento ps-traducional de protenas de membranas e Golgi: psprotenas secretoras, formao da membrana plasmtica e vesculas RER: sntese de protenas ligadas a membranas e protenas secretoras REL: biossntese de lipdeos de esterides Peroxissomos (glioxissomos): reaes de oxidao, catalisadas por aminocidoglioxissomos): aminocidooxidases e catalase, reaes do ciclo do glioxilato nas plantas catalase,

Termodinmica e Acoplamento de reaes

No Metabolismo, as reaes precisam se: 1) Especficas: As enzimas cuidam disto 2) Um conjunto de reaes numa via precisam ser favorveis: Termodinmica

G = G 0 + RT ln K eq

eq

[ C eq ] c [ D eq ] d [ A eq ] a [ B eq ] b

O G de uma reao depende das suas concentraes e dos reagentes (expresso na forma do G0). - Reaes cujos G so muito positivos so virtualmente irreversveis, porm podem ser revertidas por outras rotas que considerem o gasto de energia livre, ou seja, pelo acoplamento de reaes. A B A B+C D C+D G0 = + 5 kcal/mol G0 = - 8 kcal/mol G0 = - 3 kcal/mol

Termodinmica de algumas reaes bioqumicas

Reaes com valores de G prximos de ZERO podem ser facilmente revertidas pela mudana nas concentraes de produtos e de reagentes

Termodinmica de algumas reaes bioqumicas

Reaes com valores de G prximos de ZERO podem ser facilmente revertidas pela mudana nas concentraes de produtos e de reagentes Entretanto, Entretanto, certas enzimas que operam longe do equilbrio esto estrategicamente localizadas nas vias metablicas: As vias metablicas so irreversveis Cada via metablica possui uma etapa inicial limitante As vias catablicas e anablicas so distintas

1 Y

A X

G0 < 0

G0 < 0

As rotas de inter-converso independentes permitem a existncia de sistemas de intercontrole independentes.

Adenosina Trifosfato
1 das 100 molculas essenciais - Metablitos primrios - para a Vida Moeda universal de Energia na Bioqumica

A hidrlise de ATP Exergnica ATP + H2O ATP + H2O ADP + Pi AMP + PPi G0 = - 7,3 kcal/mol G0 = - 10,9 kcal/mol

Adenosina Trifosfato
A hidrlise de ATP impulsiona o Metabolismo ao deslocar o equilbrio

A
25 oC a Keq ser:

G0 = + 4,0 kcal/mol

K 'eq =

[ B ]eq [ A ]eq
B

= 10
+

G 0 ' / 298 ,15 *1, 987 * 2 .303

= 0,00115

+ ATP + H2O

ADP + Pi

G0 = - 3,3 kcal/mol

G0Total= + 4,0 kcal/mol + (- 7,3 kcal/mol) = - 3,3 kcal/mol (-

K 'eq =

[ B ]eq [ A]eq

[ ADP ]eq [ Pi ]eq [ ATP ]eq

= 10

G 0 ' / 298 ,15 *1, 987 * 2 .303

= 262

O Acoplamento da hidrlise de ATP permite reverter um processo no-favorvel num nofavorvel num fator de 105 vezes em condies padro.

Adenosina Trifosfato
A G de hidrlise de ATP dentro de uma clula de 12000 cal/mol (12 kcal/mol)

O que explica o alto potencial doador de fosforila do ATP???

ATP + H2O Glicerol 3-Fosfato + H2O 3-

ADP + Pi

G0 = - 7,3 kcal/mol G0 = - 2,2 kcal/mol

Glicerol + Pi

Adenosina Trifosfato
A G de ativao da hidrlise de ATP alta e somente a hidrlise enzimtica vivel 1) Produto da hidrlise estabilizado por ressonncia

2) Repulso eletrosttica no ATP evita as estruturas de ressonncia

3) Ionizao dos produtos da hidrlise de ATP

4) Estabilizao dos produtos de hidrlise por hidratao

A ligao fosfodister NO rica em energia!!!

Oxidao de compostos Carbonados

Um ser humano tpico (70 kg) tem aproximadamente 100 g de ATP
ATP tem um alto nmero de renovao turnover number - Em repouso: 40 kg de ATP em 24 horas - Em exerccio vigoroso - Para corrida de 2 horas 500 g/min g/min 60 kg de ATP 28 g/min g/min

O Organismo est constantemente oxidando combustveis para formar ATP

Quanto mais reduzido o Carbono maior a energia extrada

Potencial doador de Fosforila

O ATP no a nica molcula na clula capaz de doar fosforilas Existem molculas com maior potencial doador de fosforila do que o ATP

So molculas formadas a partir da oxidao dos combustveis: Compostos carbonados

Potencial doador de Fosforila

O ATP no a nica molcula na clula capaz de doar fosforilas Existem molculas com maior potencial doador de fosforila do que ATP

So capazes de doar Pi para o ADP Fosforilao ao nvel do substrato Posio intermediria permite que o ATP funcione como carreador de fosforilas. fosforilas. Funcionam como Tampes de fosforilas para o ATP

Potencial doador de Fosforila

CreatinaCreatina-Fosfato um tampo de Pi na clula muscular Seu alto potencial doador de Pi permite formar ATP a partir de ADP no exerccio

A quantidade de ATP disponvel na clula muscular suficiente para apenas 1 segundo de exerccio extenuante.

Sntese de ATP
Pequena parte do ATP obtido a partir da fosforilao ao nvel do substrato fosforilao - Anaerbica Maior parte formada por uma BOMBA DE PRTONS movida por um gradiente de concentrao - Aerbica

Membrana

Extrao de Energia dos alimentos

Realizada em trs estgios

Estgio I: Degradao de macromolculas digesto

Estgio II: Simplificao a compostos comuns - Acetil-CoA (maioria) Acetil-

Estgio III: Oxidao final da Acetil-CoA nas Acetilvias finais e extrao de Energia

Temas Recorrentes do Metabolismo

Apesar do alto nmero de reaes e enzimas: O METABOLISMO REPETITIVO

Os Carreadores Ativados: Coenzimas

Facilita a compreenso da complexidade, na execuo das tarefas e em economia 1) Existem carreadores ativados de Eltrons para reaes de Oxidantes Nicotinamida adenina dinucleotdeo - Derivada da Niacina - Transporta on Hidreto H- Forma Oxidada = NAD+ - Forma reduzida = NADH

Os Carreadores: coenzimas
1) Existem carreadores ativados de Eltrons para reaes Oxidantes Flavina Adenina Nucleotdeo Flavina Mononucleotdeo FMN (em azul) - Forma oxidada: FAD - Forma reduzida: FADH2 - O2 o receptor final de eltrons

Anel iso-aloxazina iso-

Os Carreadores: coenzimas
2) Existem carreadores ativados de Eltrons para reaes Biosinttica Redutoras Nicotinamida adenina dinucleotdeo Fosfato: NADPH - Derivada da Niacina - Transporta on Hidreto H- Forma Oxidada = NADP+ - Forma reduzida = NADPH - Localizado preferencialmente no citoplasma - O Pi uma etiqueta e marca para biossntese - NADPH formado na via das pentoses

R = H ou Pi

Os Carreadores: coenzimas
3) Existe um carreador ativado de fragmentos de 2 Carbonos Coenzima A - CoA - Desempenha papel central no metabolismo - Transporta unidades de acilas - No catabolismo: oxidao de glicose, de cidos graxos e de AA - No Anabolismo: biossntese de cidos graxos - Grupo funcional: Sulfidrila - Ligao Tioster hidrlise mostra G0= -7,5 kcal/mol

- Reao lenta na ausncia de catalisador

Os Carreadores Ativados
Nmero reduzido de carreadores unifica o Metabolismo perante a temas comuns: Reaes Principais carreadores ativados universais

As Reaes Recorrentes do Metabolismo

As reaes qumicas que ocorrem no metabolismo so repetitivas 1) Reaes de Oxido reduo (Oxido-redutases) (Oxido-redutases) Oxidao: perda de eeReduo: ganho de eedoador de eeaceptor de eeReao NADH Etanol (12 e-) NAD+ + H+ + 2e- (Meia reao de oxidao) Acetaldedo (10 e-) + 2H+ + 2e- (Meia reao de oxidao) eser oxidado (agente redutor) ser reduzido (agente oxidante)

Na mistura destes reagentes, poder ocorrer transferncia de eltrons, produzindo etanol e NAD+ devido tendncia termodinmica do processo.

As Reaes Recorrentes do Metabolismo

1) Reaes de xido reduo (xido-redutases) (xido-redutases) - Envolve retirada (ou doao) de eltrons dos metablitos - Participao direta dos carreadores de eltrons: NAD+, NADP+ e FAD

As Reaes Recorrentes do Metabolismo

2) Reaes de Ligao (Ligases) (Ligases) - Unio de molculas custas da energia livre da clivagem de ATP

3) Reaes de Isomerizao (Isomerases) (Isomerases) - Reaes de rearranjo molecular Prepara a molcula para reaes subsequentes

As Reaes Recorrentes do Metabolismo

4) Reaes de transferncia (Transferases) (Transferases) - Muito variveis - Grupo fosforila transferido do ATP para outra molcula - Ativao de substrato

As Reaes Recorrentes do Metabolismo

5) Reaes de Hidrlise (Hidrolases) (Hidrolases) - A gua quebra uma ligao quebra de macromolculas

6) Reaes de formao ou quebra de Ligaes duplas (Liases) (Liases) - Grupos funcionais podem ser adicionados a ligaes duplas - Grupos funcionais podem ser removidos formando ligaes duplas

Controle do fluxo metablico

1. Controle alostrico regulao por retroalimentao

2. Modificaes covalentes inter-converso enzimtica inter-

Controle do fluxo metablico

3. Ciclos de substrato duas reaes opostas de no-equilbrio e catalisadas por noenzimas diferentes

4. Controle Gentico Sntese de protenas em resposta s necessidades metablicas Efeito dos Hormnios

5. Status Energtico As vias metablicas no controladas pela [ATP] e [ADP] O Balano energtico tamponado!!!

[ ATP ] + 1 [ ADP ] 2 Carga Energtica = [ ATP ] + [ ADP ] + [ AMP ]

Inibe vias Catablicas Estimula vias Catablicas