Tipos Celulares Bsicos y BioMolculas

Manuel J. Gmez Laboratorio de Bioinformtica Centro de Astrobiologa INTA-CSIC

Organismos acelulares Virus Viroides Organismos celulares, super-reinos: Eucaryota Bacteria (eubacterias) Archaea (arquebacterias)

Clula Procariota Bacteria y Archaea Escherichia coli, E. coli, Eco Membrana, Citoplasma

Clula Eucariota Membrana, Citoplasma Nucleo, Orgnulos

Golgi, RE Mitocondria, Cloroplasto Teora endosimbitica

Virus Capside, Protenas ADN, ARN Parsitos

Biomolculas
H2O / Sales minerales
Molculas MONOSACARIDOS ACIDOS GRASOS AMINOACIDOS NUCLEOTIDOS Macromolculas POLISACARIDOS GRASAS/LIPIDOS PROTEINAS ACIDOS NUCLEICOS

La molecula de AGUA es DIPOLAR. Por eso, diferentes molculas pueden unirse por PUENTES DE HIDROGENO. Los ngulos de enlace se explican por los orbitales atmicos del oxigeno.

Biomolculas
H2O / Sales minerales
Molculas MONOSACARIDOS ACIDOS GRASOS AMINOACIDOS NUCLEOTIDOS Macromolculas POLISACARIDOS GRASAS/LIPIDOS PROTEINAS ACIDOS NUCLEICOS

D-Glucosa

Glicerol

HIDRATOS DE CARBONO (CH2O)n. Molculas lineales o ciclicas. Monosacridos Disacridos Polisacridos Uno puede encontrar glcidos en:Almidn, Celulosa, Glucgeno, Quitina, ADN, ARN, Protenas.

Glucgeno

Quitina

Sacarosa

Celulosa

Biomolculas
H2O / Sales minerales
Molculas MONOSACARIDOS ACIDOS GRASOS AMINOACIDOS NUCLEOTIDOS Macromolculas POLISACARIDOS GRASAS/LIPIDOS PROTEINAS ACIDOS NUCLEICOS

Lpidos Fosfolpidos Membranas

Los FOSFOLIPIDOS son una clase muy comn de lpidos. Son los principales constituyentes de las membranas biolgicas. Tienen una cabeza polar y una cola hidrofbica, por lo que se dice que tienen caracter ANFIPATICO.

Fosfolpidos Acidos Grasos Hidrofbico = apolar Hidroflico = polar Anfipticos

Fosfolpidos en una bicapa lipdica, como las que forman parte de las membranas celulares.

Lpidos Anfipticos Monocapa lipdica Micelas Detergentes

Colesterol

Membrana biolgica Bicapa lipdica Lpidos anfipticos, Protenas integrales y perifricas Separacin Espacio Extracelular : Citoplasma Barrera de permeabilidad Transportadores y Poros

Membranas, donde: Citoplsmica Nuclear Mitocondrias Cloroplastos Golgi Retculo endoplsmico Vesiculas

Biomolculas
H2O / Sales minerales
Molculas MONOSACARIDOS ACIDOS GRASOS AMINOACIDOS NUCLEOTIDOS Macromolculas POLISACARIDOS GRASAS/LIPIDOS PROTEINAS ACIDOS NUCLEICOS

Las PROTEINAS estn hechas de aminocidos. Todos los aminocidos tienen un grupo AMINO (NH2), un grupo ACIDO (COOH) y una cadena lateral (R) que es diferente en cada uno de los 20 tipos de aminocidos.

20 aminocidos Cadenas laterales Apolares Polares Acidos Bsicos

Enlace peptdico Pptidos Protenas Extremo amino Extremo carboxilo

Enlace peptdico Formas resonantes

Ejemplo de protena formada por cuatro aminocidos. La secuencia de aminocidos puede representarse como una cadena de letras en un codigo de tres caracteres o un caracter.

Estructura: Primaria, Secundaria Terciaria y Cuaternaria -helices, -sheet, turns, loops Dominios

-hlice Puentes de Hidrgeno 3.6 aa por vuelta

-hlice, ribbon Cadenas laterales orientadas hacia afuera

-sheet -strand Paralelas Anti-paralelas Cadenas laterales alternando lado

Estructuras

Protenas, donde y qu: solubles, de membrana, transportadores, enzimas, estructurales, contrctiles

Enzimas, Binding site, Centro activo

Electroforesis, SDS PAGE Gel de Poliacrilamida SDS Migracin Campo elctrico Separacin por tamao (peso molecular, MW, dalton) Tincin Marcaje radioactivo

2D electrophoresis Electroforesis bidimensional, Separacin por: 1-punto Isoelectrico, pI (IEF) 2-tamao (SDS PAGE) Detergentes neutros Anfolitos

Determinacin Estructural Cristalografa de Rayos X Resonancia magntica nuclear

Biomolculas
H2O / Sales minerales
Molculas MONOSACARIDOS ACIDOS GRASOS AMINOACIDOS NUCLEOTIDOS Macromolculas POLISACARIDOS GRASAS/LIPIDOS PROTEINAS ACIDOS NUCLEICOS

Acidos Nuclicos
El experimento de Griffith (1920), demostr la existencia de una sustancia transformante que poda cambiar el fenotipo de un organismo.

ADN Y ARN !!
Los Acidos Nuclecos estn hechos de NUCLEOTIDOS.

Los Nucletidos estn compuestos de: Fosfato Azucar Deoxiribosa (ADN) Ribosa (ARN) Bases Nitrogenadas Purinas Adenina, A Guanina, C Pirimidinas Citosina, G Timina, T (ADN) Uracilo, U (ARN) Habeis visto GATTACA?

EJEMPLO: Desoxi - Guanidin Mono Fosfato, dGMP, G

Fosfato Guanina Deoxi-ribosa

Bases nitrogenadas

Fosfato

Azucar

ADN

El Acido Deoxiribonucleico (ADN, DNA) est formado por una doble cadena de nucletidos. Se dice que las cadenas son COMPLEMENTARIAS, porque las bases nitrogenadas estn enfrentadas (apareadas) segn unas reglas fijas: A con T y C con G. Las cadenas tienen direccin (extremos 5' y 3') y son antiparalelas. Longitud en nucletidos o en bp, Kb

Apareamiento de bases nitrogenadas Pu - Pi G-C A - T (en DNA) A - U (en RNA)

Las dos cadenas estn enrolladas una sobre la otra, formando una doble hlice. La estructura del ADN fu descubierta pr Watson y Crick en 1953, por lo que les dieron el premio Nobel en 1962. Usaron datos de Rosalind Franklin, que injustamente no fu premiada.

DNA Surco mayor Surco menor

El genoma, o material gentico, en bacterifagos (virus come-bacterias)

El genoma, o material gentico, en clulas procariotas

Muchos procariotas tienen un cromosoma circular y plsmidos, que son otras molculas circulares de ADN, mucho ms pequeas (flechas blancas en la foto de la derecha).

El genoma, o material gentico, en clulas eucariotas Eucariotas: Cromosomas DNA mitocondrial DNA cloroplastos

Cromosoma mittico descompactado de forma artificial

ARN
El Acido Ribonucleco (ARN, RNA) est formado por una nica cadena de nucletidos. Hay tres tipos de ARN: mRNA, mensajero rRNA, ribosomal tRNA, de transferencia Son muy importantes para los procesos de: TRANSCRIPCION TRADUCCION

Electroforesis en geles de agarosa, poliacrilamida (secuenciacin)

El material grfico proviene de:

Horton et al, Principles of Biochemistry, Prentice Hall Lewin, Genes VII, Oxford University Press Access Excellence Graphics Gallery, (www.accessexcellence.org) www.bact.wisc.edu/Bact303/Bacteriology