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Universidade de Caxias do Sul - UCS Centro de Cincias Exatas e Tecnolgicas CCET Departamento de Fsica e Qumica Ncleo de Apoio ao Ensino

o da Qumica - NAEQ Curso de Informtica Aplicada ao Aprendizado da Qumica Ministrante: Acadmico Emiliano Chemello

Curso de Informtica Aplicada a Aprendizagem de Qumica Mdulo 01 Desenho Molecular

Sumrio
Introduo.............................................................................................................................................................3 Instalao .............................................................................................................................................................4 Cadastramento..................................................................................................................................................4 Processo de Instalao.....................................................................................................................................7 Modos de Trabalho ............................................................................................................................................11 Modo Estrutura................................................................................................................................................11 Modo Desenho................................................................................................................................................12 Manipulando arquivos ........................................................................................................................................12 Salvando Arquivos ..........................................................................................................................................12 Exportando Arquivos.......................................................................................................................................13 Abrindo um arquivo .........................................................................................................................................13 Criando um arquivo novo ................................................................................................................................14 Imprimindo um Arquivo ...................................................................................................................................14 Desenhando Molculas......................................................................................................................................15 Barra Estrutura................................................................................................................................................15 Exerccio..........................................................................................................................................................18 Barra de tomos .............................................................................................................................................19 ACD/Name Freeware......................................................................................................................................21 Propriedades das Molculas...........................................................................................................................21 Barra de Radicais............................................................................................................................................22 Alterando formatao dos tomos e Molculas .............................................................................................23 Barra Geral......................................................................................................................................................26 Exerccios........................................................................................................................................................27 Desenhando figuras ...........................................................................................................................................28 Barra de Desenhos .........................................................................................................................................28 Barra de Edio ..............................................................................................................................................31 Exerccios........................................................................................................................................................33 Molculas em 3D................................................................................................................................................35 Barra de manipulao 3D ...............................................................................................................................35 Exerccios........................................................................................................................................................40

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Introduo
ACD/Chemsketch um software de desenvolvimento da Qumica Avanada. A empresa que o fez projetou para ser usado separadamente ou integrado com outras aplicaes. Chemsketch usado para desenhar estruturas qumicas, reaes e diagramas esquemticos. Tambm pode ser usado para projees em 3D. ACD/Chemsketch tem os seguintes mdulos e ferramentas: - Modo Estrutura para desenhar estruturas qumicas e calcular as suas propriedades. - Modo Desenho para texto e processos grficos - Clculos de Propriedades Moleculares para estimao automtica de: - Nomenclatura Oficial da IUPAC (em ingls) - Peso de frmula; - Composio de porcentagem; - Volume de molar; - ndice de refrao; - Tenso de superfcie; - Densidade; - Constante dieltrica; - Dentre outras propriedades. - Diversas outras... - Todo o software da ACDLabs trabalha com barramento 32-bits e aplicvel aos PCs com Sistemas Operacionais Microsoft Windows 95/98/NT/ME/2000. - Todo o software de ACD executado em PCs controlado por ACD/Host com o qual permitido um controle central das operaes envolvidas com os programas da ACDLabs.

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Instalao
Veremos agora os passos necessrios para ter o ACD/Chemsketch instalado em sua mquina:

Cadastramento
Abaixo, mostraremos passa a passo o processo de cadastramento junto a ACDLabs para um posterior download do software. 01) Acesse o site da ACDLabs: www.acdlabs.com

02) Na barra de links a esquerda da tela, clique em Download.

03) A prxima etapa consiste em ir at a tabela FREEWARE e clicar no link ChemSketch 5.0 Freeware

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04) Aps isso, procure e clique no link Download ChemSketch 5.0 Freeware.

05) Neste momento, voc deve entrar com seu e-mail e senha, sendo que esta ltima fornecida quando o usurio se cadastra no site. Para se cadastrar no site, clique em: Click Here to Register.

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06) Neste momento, voc deve preencher todos os campos para conseguir o cadastro na empresa ACD/Labs e assim, poder receber Newsletter e fazer o download dos produtos. Para fazer o download neste curso, use os seguintes e-mail e senha para se identificar: *************************** E-mail: naeq@ucs.br Senha: naeq *************************

07) Aps se identificar corretamente, aceite o termo de licena para o uso do ChemSketch pressione o boto: .

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08) Clique em Chemsk50.exe (conforme indicado na imagem). 09) Salve o executvel de instalao do software em algum diretrio do seu HD. Para fazer o download do mdulo ChemBasic e os manuais dos softwares, repita os passos comentados acima.

Processo de Instalao
Aps o cadastro no site da ACDLabs e o procedimento de download do programa, iremos agora ver como instalar o ACD/ChemsKetch na sua mquina. Executando o instalador chemsk50 no diretrio em que foi gravado, veremos a seguinte seqncia de telas para a instalao:

Essa a primeira tela que aparecer aps a execuo do aplicativo de instalao. Trata-se de um Tutorial de Instalao. Para seguir a instalao, pressione o boto: Next >.

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Nesta tela mostrado o acordo de licena do programa. Como se trata de um programa Freeware1, no h a necessidade de maiores detalhes nesta tela. Para quem desejar aprofundar-se nas restries quanto utilizao do software pode ler o acordo de licena do software. Logo aps, pressione o boto Yes.

Esta tela mostra em que diretrio o programa ser instalado. Por padro, utilizase o seguinte diretrio: C:\ACDFREE5. Logo aps, pressione o boto Next >.

Freeware: Software que pode ser instalado sem haver a necessidade de uma licena paga.

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Nesta opo, temos que marcar as caixas de seleo correspondentes aos componentes que sero instalados. Como faremos uso de todos esse componente no curso, caso no estejam marcadas todas as caixas de seleo, pressione o boto Select All e, aps, pressione o boto Next >.

Este opo permite determinar onde ser colocado o atalho para os programas no menu iniciar. Por padro, utiliza-se esta configurao ao lado. Aps isso, pressione o boto Next >.

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Este opo apenas informa o que ser instalado no momento seguinte do Tutorial. Pressione o boto Next >

Esta opo informa que os programas foram instalados com sucesso. Basta ento, pressionar o boto Finish.

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Modos de Trabalho
Iremos ver agora os modos de trabalho do programa Chemsketch e suas principais caractersticas. Para alternar entre os modos de trabalho, basta utilizar o par de botes abaixo, localizados no software no canto superior esquerdo da tela.

Modo Estrutura
O Modo estrutura permite que o usurio desenhe as estruturas e reaes alm dos diversos sinais taquigrficos prprios da linguagem qumica. Abaixo, analisamos as barras que compem o modo estrutura.

Barra de Ttulo: Mostra o nome do programa e o nome arquivo atualmente aberto. Menu: Contm uma srie de palavras. Cada palavra une a uma lista de comandos relacionados para trabalhar na janela do Chemsketch no modo Estrutura. Barra Geral: Localizada abaixo da barra de menu, inclui ferramentas que esto presente em ambos modos de trabalho e o ajudar com tarefas pertinente para ambos os modos como: abrindo e fechando arquivos, operaes de recortar e colar, aumentando e diminuindo zoom, dente outros diversos comandos. Barra de ChemBasic: Localizada abaixo do Barra Geral uma barra opcional e contm diversas outras aplicaes muito teis para o trabalho no modo estrutura. Porm, essa barra de ferramenta s ir aparecer caso o mdulo ChemBasic foi instalado. Barra estrutura: A barra contm ferramentas para desenhar e manipular estruturas qumicas. Barra de tomos: Exibida verticalmente esquerda da tela, contm botes que representam tomos, como tambm ferramentas para propriedades variveis de tomos (valncia, radicais, etc.).

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Curso de Informtica Aplicada a Aprendizagem de Qumica Mdulo 01 Desenho Molecular Barra de Radicais: Colocada direita da janela, contm a relao de radicais j utilizados alm do boto para acessar a tabela de radicais .

rea de Trabalho: Grande rea branca localizada no meio da tela, local onde as estruturas so desenhadas. Paleta de Cores: Permitem colorir tomos e ligaes rapidamente. Barra de Status: Esta barra contm informaes que podem ser teis para o momento atual: nome do arquivo SK2 que voc est trabalhando, nmero de pgina no arquivo de SK2, nmero de fragmentos na rea de trabalho e frmula molecular das estrutura selecionadas.

Modo Desenho
O modo desenho permite ao usurio trabalhar com as diversas ferramentas de desenho para auxiliar nos diagramas e reaes que se deseja fazer com o Chemsketch. Abaixo, analisamos as barras que compem o modo desenho.

Barra de Desenhos: Localizada a esquerda da tela, possui diversas ferramentas para desenho, desde ciclos, quadrados, setas alm de inmeras outras possibilidades. Barra de Edio: A barra de Edio permite manipular e alterar os desenhos no que diz respeito posio, tamanho, ordem, etc.

Manipulando arquivos
Salvando Arquivos
Para guardarmos os trabalhos feitos devemos salvar o arquivo em alguma unidade de gravao (disquete ou disco rgido, por exemplo). O ChemSketch permite a gravao dos arquivos em diversos formados. Abaixo, os passos para salvar um arquivo: NAEQ - Ncleo de Apoio ao Ensino da Qumica Pgina 12

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Utilize o boto

na barra de geral ou utilize os seguintes passos abaixo: 1) Clique no menu File e aps na opo Save As... 2) No campo Salvar em: determine o local onde o arquivo ser gravado. Em Nome do arquivo crie um nome para o arquivo. Aps isso, pressione o boto Salvar. Obs: O formato padro do ChemSketch sk2. Para salvar o arquivo em outro formato, devemos proceder com uma exportao de arquivo.

Exportando Arquivos
O ChemSketch possui uma interface com outros programas como ISISDraw, MDL entre outros. Essa caracterstica permite que sejam abertos arquivos gerados com formatos de outros programas. Alm disso, caso desejamos salvar o arquivo com outro formato, devemos efetuar os seguintes passos: 1) Clique no menu File e aps na opo Export... 2) As opes de salvamento so as mesmas para esse procedimento. O que difere apenas o formato desejado. Os formatos que o ChemSketch suporta exportar so: Imagens .bmp; .gif ; .tif; Formatos de outros programas .mol; .skc; .chm; Obs: O formato .pdf est disponvel apenas na verso comercial.

Abrindo um arquivo
Para abrir um arquivo do ChemSketch j salvo em alguma unidade de disco (Hard Disk ou disquete), siga os passos abaixo:

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Utilize o boto

na barra de geral ou utilize os seguintes passos abaixo: 1) Em Examinar, selecione o local onde o arquivo est gravado. 2) Em Nome do arquivo, digite, caso necessrio, o nome do arquivo. Obs: a) Utilize os sinais * para busca b) O ChemSketch abre somente arquivos no formato sk2.

Criando um arquivo novo


Caso voc deseja criar um arquivo novo no ChemSketch, siga os passos abaixo: Utilize o boto na barra de geral ou utilize os seguintes passos abaixo: 1) Clique no menu File e aps na opo New. 2) Pode-se utilizar os atalhos do teclado para efetuar vrias funes. Por exemplo, para criar um arquivo novo, basta clicar <Ctrl>+F3.

Imprimindo um Arquivo
Para imprimir um arquivo no ChemSketch, basta abri-lo primeiramente e, aps isso, seguir os passos abaixo: 1) Clique no menu File e aps na opo Print.... ou ento pressione <Ctrl+P>. 2) Mude as opes desejadas e pressione o boto Ok. Obs: Antes de imprimir um arquivo, verifique as configuraes da pgina. Para isso, clique no menu File e aps na opo Page Setup.

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Desenhando Molculas
Iremos trabalhar agora com as diversas ferramentas para o desenho de molculas orgnicas de estrutura plana.

Barra Estrutura

1 Seleciona/Move: Este boto permite selecionar ou mover qualquer objeto presente na rea de trabalho. Seu modo de seleo consiste em abrir um retngulo sobre o que se quer selecionar. 2 Seleciona/Rotao: 3 Rotao 3D: Este boto permite a rotao de 360 do objeto selecionado em 2D.

Este boto permite dar rotao em um ambiente 3D.(x, y, z).

Este boto permite a seleo especfica de algo na rea de trabalho laando o objeto 4 Lao: desenhando-se ao redor do mesmo. 5 Draw Normal: abaixo: Este boto permite o desenho de uma estrutura orgnica simples como o exemplo

H3C

CH3

Obs: no esquea que antes de desenhar a molcula voc deve selecionar o tomo na barra de tomos.

6 Draw Contnuo: Este boto permite o desenho de uma estrutura orgnica contnua de modo que se determinam os pontos e a molcula vai se completando automaticamente, conforme o exemplo abaixo:

CH3

CH3

Obs: para corrigir possveis imperfeies na molcula construda com esse boto, basta selecionar e arrastar os vrtices da molcula.

7 Draw Cadeia Zigue-Zague: Este boto permite o desenho de uma estrutura orgnica contnua de modo que os tomos assumem uma posio em relao ao outro em forma de v conforme o exemplo abaixo: H3C CH3
Obs: Esse boto muito til para cadeias muito extensas. Para saber o nmero de tomos de carbono na cadeia basta olhar o nmero logo acima do ponteiro do mouse.

8 Up Stereo Bonds: Este boto permite que seja aplicada a ligao entre tomos uma representao que significa que o tomo que possui a ponta mais grossa est para fora do plano da rea de trabalho. Veja o exemplo abaixo:

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CH3

CH3

H3C

CH3

H3C

CH3

CH3 antes depois

CH3

Obs: Uma forma de desfazer a aplicao deste tipo de propriedade clicando no meu Edit e aps na opo undo (ltima ao) ou ento pressionar <alt> + <backspace>.

9 Dow Stereo Bonds: Este boto permite que seja aplicada a ligao entre tomos uma representao que o tomo que possui a ponta mais grossa estaria para dentro do plano da rea de trabalho. Veja o exemplo abaixo: CH3 CH3

H3C

CH3

H3C

CH3

CH3 antes
10 Coordenando Ligaes: dativa. Veja o exemplo abaixo:

CH3 depois

Este boto permite que se consiga representar uma ligao coordenada

H O N

O
11 Indefinidas Ligaes: Este boto permite representar um composto que o nmero de elementos entre os vrtices da molcula indefinido. Veja o exemplo abaixo:

H3C
12 Reaction Plus: Veja exemplo abaixo:

CH3

Este boto permite a insero do sinal de mais muito comum em reaes orgnicas.

O H3C OH

esterificao H3C OH hidrlise H3C

+
O CH3

H2O

13 Seta de Reao: Este boto permite escolher dentre as diversas setas que as reaes possam a necessitar. Veja exemplo das setas abaixo: NAEQ - Ncleo de Apoio ao Ensino da Qumica Pgina 16

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Obs: O triangulo branco localizado no canto inferior direito do boto permite a escolha dentre as diversas formas de setas.

14 Chance Position: Este boto permite mudar a posio dos tomos ligados ao tomo principal. Veja o exemplo com o gs metano: H4 C H4C CH4 C H4

forma 1

forma 2

forma 3

forma 4

Obs: para alternar entre uma forma e outra basta clicar na molcula.

15 Alinhamento horizontal: abaixo:

Este boto permite alinhar a molcula na horizontal. Veja o exemplo

H3C H3C CH3 antes depois CH3

16 Alinhamento Vertical:

Este boto permite alinhar a molcula na vertical. Veja o exemplo abaixo:

CH3 H3C CH3 antes CH3 depois

17 Flip on bond: exemplo abaixo:

Este boto permite que giramos a molcula a partir de um referencial ou ligao. Veja

CH3 H Cl antes Br H Br

CH3

Cl

depois

18 Limpe a estrutura: Este boto permite que a estrutura desenhada possua uma melhor proporcionalidade entre as ligaes. Veja o exemplo abaixo:

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Cl I Br antes Cl Br F I F

depois

19 Verificar formas Tautomricas: Este boto permite visualizar as formas tautomricas (provenientes da isomeria de tautomeria) do composto. Veja exemplo abaixo para o etilenol (funo enol)

Obs: clicando no boto Replace podemos aplicar na estrutura analisada o tautmero indicado.

20 Otimizao 3D: Veja exemplo abaixo:

Este boto possibilita a adequao da formula estrutura para uma conformao 3D.

H H CH3 H3C antes H H H H H depois

H H H

Obs: Com o boto Rotao 3D voc pode girar a molcula e comprovar que ela est na conformao correta dos tomos pelo efeito da repulso de cargas.

Exerccio
Desenhar as 6 estruturas tautomricas do seguinte composto abaixo:

HN

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Barra de tomos
01 Tabela Peridica dos Elementos: Este boto permite que seja escolhido o elemento com o qual se deseja trabalhar.
Obs: Outra forma de acessar a Tabela Peridica pressionando a tecla F7 do seu teclado de funes.

02 Ferramentas de tomo

03 Ferramentas de Ligao

04 Estes botes so colocados automaticamente em funo do seu uso. Os mais usados permanecem listados. 05 Edit Atom Label: Permite alteraes e incluses de novos textos em qualquer lugar na rea de Trabalho do Chemsketch. 06 Radical Label: Permite substituir um tomo ou criar um tomo com o rtulo de radical.

07 Atribuies de carga e radical

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Curso de Informtica Aplicada a Aprendizagem de Qumica Mdulo 01 Desenho Molecular 08 Ferramentas diversas

Exemplos:

H3C
6

CH2
5

CH2 CH2
4 3

OH
1

CH2HC
2

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ACD/Name Freeware
Iremos agora ver como utilizar o servio de nomenclatura freeware do ChemSketch. Clique no boto ou siga os passos abaixo: 1) Selecione a molcula a qual deseja-se dar o nome. 2) Clique no menu Tools e aps na opo Generate Name from Structure. Obs: Nomes para estruturas com mais de 50 tomos (sendo que os disponveis so: H, C, N, P, O, S, F, Cl, Br, eu, Li, Na, K) ou mais de 3 ciclos so s disponveis na verso comercial do ChemSketch. Exemplo:

H3C

CH2

CH2

CH2

CH3

pentane

1,4-dihydrophenanthrene

Propriedades das Molculas


O ChemSketch permite adicionarmos algumas propriedades da entidades qumicas desenhadas na rea de trabalho. Para adicionar essas propriedades, siga os passos abaixo:

1) Clique no menu Tools, aponte para calculate e selecione a propriedade desejada. 2) Caso queira copiar a propriedade para a rea de trabalho, clique no boto Copy to Editor.

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Curso de Informtica Aplicada a Aprendizagem de Qumica Mdulo 01 Desenho Molecular As propriedades disponveis so:

Barra de Radicais
Para acessar a tabela de radicais, basta clicar no atalha na barra de radicais:

Na tabela de radicais temos uma relao restrita, porm muito usual de radicais orgnicos simples e complexos. Para selecionar um radical, basta clicar nele e adicionar no local desejado na rea de trabalho.

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Alterando formatao dos tomos e Molculas


Para alterarmos qualquer formato (cor, tamanho, etc), utilizamos a opo propriedades das estruturas. Para acessar essas opo, siga os passos abaixo: 1) Clique no menu Tools e aps na opo Structure Properties. 2) Altere as opes desejadas e clique no boto Apply. Obs: Para acessar as propriedades da estrutura, clique duas vezes sobre a entidade qumica (on, tomo ou molcula).

Abaixo analisaremos cada guia com detalhe: Dica: para obter ajuda nas caixa de propriedades do ChemSketch, utilize o boto ajuda superior direto da caixa. Guia Common no canto

: A opo All, quando marcada, faz com que sejam mostrados os carbonos na molcula. J a opo Terminal faz com que somente os tomos dos vrtices da molcula so mostrados.

H3C

CH3

H3C

CH2

CH2

CH3

Opo terminal Marcada

Opo All marcada

Obs: Caso queira que as prximas molculas fiquem da mesma forma, pressione antes do boto Apply o boto Set Default.

: Esta opo quando marcada esconde o nox 0 das entidades qumicas. Caso a opo esteja desmarcada, o nox 0 passa a ser colocado automaticamente.

: Esta opo d autonomia para que o ChemSketch risque as estruturas inviveis desenhadas. Exemplo:

NH HP N
2+

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Curso de Informtica Aplicada a Aprendizagem de Qumica Mdulo 01 Desenho Molecular A opo desmarcada faz com que no seja possvel desenhar tal estrutura invivel. Aconselhasse a deixar marcada a opo por padro.

: Este conjunto de opo permite determinarmos o tamanho da fonte que ser usada para desenhar os tomos e tambm o comprimento da ligao. Deixando a opo Auto marcada, deixamos por conta do programa calcular a proporo do comprimento da ligao em funo da fonte utilizada.

CH3 H2C CH2 H3C

CH3 H2C CH2 H3C

CH3 H2 C CH2 H3 C

: Este conjunto de opes permite determinarmos a formao da fonte utilizada. Exemplos:

CH3 H2C CH2 H3C


H3C H2C

CH3 H2C CH2 H3C

CH3

CH2

: Este conjunto de opes permite determinarmos o estilo das ligaes entre os tomos.

CH3 H2C CH2 H3C


Botes:

CH3 H2C CH2 H3C H3C H2C

CH3 vermelha azul CH2 verde

: Aplica as alteraes feitas na seleo de alguma entidade qumica. : Grava as alteraes feitas de modo que as modificaes feitas sejam aplicadas nas prximas entidades qumicas a serem desenhadas. : Permite copiar formatao de uma entidade qumica e aplica-la em outra. : Permite restaurar as configuraes padro do ChemSketch.

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Curso de Informtica Aplicada a Aprendizagem de Qumica Mdulo 01 Desenho Molecular Guia Atom : Este conjunto de opes permite alterar a formatao da entidade qumica selecionada.
Obs: selecione a entidade qumica a qual voc deseja alterar.

1 Escolha o tomo principal de sua entidade qumica e altere a sua formatao. 2 Altera as configuraes dos tomos de hidrognio presentes nas entidades qumicas.

3 Determina a posio, na vertical, que ficar o nmero que indica a quantidade de hidrognios na entidade qumica. 4 Indica a carga da entidade qumica desenha. 5 Determina a valncia do tomo selecionado.
Obs: No esquea de selecionar o tomo (referncia 1) antes de alterar a valncia do tomo.

6 Permite explicitar qual istopo estamos usando na entidade qumica. 7 Permite determinar a numerao e sua posio nos eixos X e Y da entidade qumica selecionada. Guia Bond : Este conjunto de opes permite definirmos a densidade das ligaes entre as entidades como tambm sua cor. Obs:

Estas opes permitem configurar as ligaes entre as entidades qumicas: 1 Define as configuraes de ligaes do tiplo simples. 2 Define as configuraes de ligaes do tipo dupla. 3 Define as configuraes de ligaes do tipo tripla. 4 Define as configuraes de ligaes com representao fora do plano (tela). 5 Define as configuraes de ligaes com representao para dentro do plano (tela). 6 Define as configuraes de ligaes do tipo coordenada. 7 Define as configuraes de ligaes do tipo indefinidas.

H H3C CH3 H2C CH2 HC CH Cl C C

H H3C Cl CH3 Cl

O S Cl

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Barra Geral
A barra geral, alm dos botes que gerenciam a criao, salvamento e abertura de arquivos, possui botes que auxiliam no processo de desenho das molculas. O boto undo quando pressionado, volta uma ao realizada no ChemSketch. Seu atalho no teclado : <ctrl>+Z. O boto redo quando pressionado, realiza a ao anteriormente realizada. Obs: Esses comandos esto localizados no menu Edit. O boto delete permite voc apagar tomos ou conjunto de tomos especficos nas molculas. Veja o exemplo abaixo:

NH2

grupo de tomos a ser deletado

Antes

Depois

O boto recorta permite remover um ou um grupo de tomos selecionados. Este boto usado quando desejamos mover algum objeto na rea de trabalho do ChemSketch. O boto copiar permite fazer cpias de um ou um grupo de tomos selecionados. usado em conjunto com o boto colar. O boto colar permite inserir um ou um grupo de tomos copiados ou recortados anteriormente.

A ferramenta zoom indispensvel para dimensionar a rea de trabalho conforme a situao necessitar. Para termos uma idia do que realmente sair impresso, devemos utilizar a zoom 100%.

O boto windows Templates permite abrir a coleo de modelos de inmeras estruturas j prontas para serem usadas. Iremos trabalhar com alguns desses modelos abaixo: Atividade: Inserindo a D - Glucose, na projeo de Fisher: 1) Precione o boto Template Window na barra geral, pressione a tecla F5 ou ento clique no menu Template e aps na opo Template Window para abrir a janela de modelos. 2) Clique na guia Carbohydrates e selecione a D- Glucose conforme indicado na figura ao lado. 3) Mova o cursor at o colar onde voc deseja colar a molcula e clique uma vez sobre o local.

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Curso de Informtica Aplicada a Aprendizagem de Qumica Mdulo 01 Desenho Molecular Obs: Utilize os botes para alternar nas pginas de uma mesma guia de modelos.

Exerccios
01) Procure e cole na rea de trabalho do ChemSketch as seguintes vitaminas: A, C e D2.
H3C CH3 CH3 CH3 OH CH3
HO O HO O

Vitamin A

HO

OH

CH3 H3C H3C H H CH2 HO CH3 CH3

Vitamin C

Vitamin D2

02) Cole as trs molculas no Microsoft Word, diminua o tamanho do desenho at aproximadamente o tamanho da figura da apostila. 03) Procure as seguintes figuras no Windows Template do ChemSketch e adicione-as na rea de trabalho.
0 1 0 2 0 3 0 4 0 5 0

Bico de Bunsen

Bureta

Fulereno

04) Adicione no documento anterior, abaixo das molculas, os desenhos solicitados cuidando para que eles fiquem em uma folha somente e, aps isso, imprima o documento.

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Desenhando figuras
Iremos a partir de agora ver as ferramentas de desenho que o ChemSketch proporciona mo mdulo Draw.

Barra de Desenhos
A barra de desenhos trs consigo uma srie de ferramentas para criarmos os desenhos mais variados. Abaixo, a descrio de cada uma dessas ferramentas: 1 Line: Permite criar uma linha reta:

Obs: Clique duplo sobre a linha permite definir sua formatao.

Guia Pen

Style: Escolhe o tipo de linha Width: Densidade da linha Color: Cor da linha

: Aplica as alteraes no objeto selecionado : Permite aplicar no objeto selecionado uma configurao pr-existente no ChemSketch ou uma feita pelo usurio. : Salva as configuraes feitas para serem usadas posteriormente
Obs: para selecionar a configurao, usa-se o boto Load...

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Guia Arrow

: Permite escolher o tipo de linha (simples, dupla, tripla, etc). : Permite definir as configuraes de cada ponta da linha, transformando-as em flechas por exemplo. : Permite definirmos a densidade das linhas e/ou flechas.

2 3

Arc: Permite criar uma linha em curva, na forma de arco. Curve: Permite criar uma linha utilizando curvas.

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Curso de Informtica Aplicada a Aprendizagem de Qumica Mdulo 01 Desenho Molecular 4 Polyline: Permite criar uma forma de linha personalizada.
que ser descrita mais adiante.

Obs: usada em conjunto com a ferramenta

Draw Arrow: Permite desenharmos flechas com diversas configuraes: para mostrar todas as opes da caixa Arrow. : Permite escolhermos o estilo de seta que desejamos usar.

Obs: Ao clicar na ferramenta Draw Arrow, abre-se automaticamente a caixa de opes Arrow.

Dica: Use o boto

Esta ferramenta permite definirmos a largura (Width) e a altura (Height) da fecha. Estes parmetros podem ser especificados em pontos pela simples alterao nas caixas de formulrio correspondentes ou ento manualmente. : Permite escolher o estilho da linha da flecha (simples, dupla, tripla, etc...) permitindo definir tipos de setas diferentes para cada extremidade da fecha. 6 Retngulo: Permite desenhar formar retangulares.

Obs: Para desenhar um quadrado, ao desenhar o objeto deixe pressionada a tecla shift do seu teclado.

7 8

Retngulo arredondado: Permite o desenho de retngulo com os cantos arredondados. Elipse: Permite desenharmos uma elipse na rea de trabalho.

Obs: Para desenhar um crculo, ao desenhar o objeto, deixe pressionada a tecla shift do seu teclado.

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Polygono: Permite desenharmos formas geomtricas diversas. Text: Permite a adio de texto na rea de trabalho.

Obs: Para formatao do texto, observe os seguintes botes adicionados a barra de edio quando a ferramenta selecionada.

: permite a alterao do tipo de fonte usada. : Permite alterarmos o tamanho da fonte. : Permite adicionarmos o carter negrito ao texto. : Permite adicionarmos o carter itlico ao texto. : Permite adicionarmos o carter sublinhado ao texto. : Permite adicionarmos o carter texto riscado ao texto. : Permite adicionarmos o carter sobscrito ao texto. NAEQ - Ncleo de Apoio ao Ensino da Qumica Pgina 30

Curso de Informtica Aplicada a Aprendizagem de Qumica Mdulo 01 Desenho Molecular : Permite adicionarmos o carter subscrito ao texto. : Permite configurarmos o alinhamento do texto. Da esquerda para a direita, temos os seguintes tipos de alinhamento: esquerdo, central, direito e justificado. : Este boto permite restaurarmos o estilo padro definido. : Este boto permite definirmos o estilo padro de texto (default). 11 colchetes. : Permite escolhermos os seguintes smbolos, da esquerda para direita: Chaves, parnteses,

Obs: Para mostrar as vrias opes da ferramenta, clique no tringulo localizado no canto inferior direito do boto.

12 -

: Estes botes so utilizados para alguma descrio estilo bales de texto.

Barra de Edio
A barra de edio permite manipularmos os objetos j desenhados na rea de desenho. Abaixo, veremos as funes de cada boto.

1 Select/Move/Resize: Este boto permite ao usurio selecionar, mover e dimensionar um objeto na rea de trabalho. 2 Select/Move/Rotate: Este boto, alm das funes de seleo e movimentao dos objetos, tem como outra funo a rotao em 2D. 3 Edit Nodes: Este boto permite a edio dos ns de um objeto. Exemplo de ferramentas que criam , .

objetos com ns so: 4 5

Edit Text: Habilita a opo de editarmos alguma caixa de texto presente na rea de trabalho.. Bring to de front: Faz com que o objeto selecionado fique na frente dos demais objetos.
A B est na frente do quadrado A B est atrs quadrado A do A

antes

depois

Send to back: Faz com que o objeto selecionado fique atrs dos demais objetos.

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A A B est atrs quadrado A B do est na frente do quadrado A

antes

depois

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Group: Permite agruparmos dois ou mais objetos selecionados fazendo-os serem um s objeto. Flip left to right: Permite girar o objeto na horizontal, girando da esquerda para a direita. Flip top to bottom: permite girar o objeto no sentido vertical, girando do topo para o rodap. Rotate 90: Permite rotacionar o objeto em ngulos fixos de 90. Alinhamento Horizontal: Permite alinhar o objeto a esquerda, centro ou direita

11 respectivamente. 12

Alinhamento vertical: Permite alinhar o objeto na parte superior, central ou inferior.

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Exerccios
Reproduzir os esquemas mostrados abaixo:

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Molculas em 3D
Alm da estrutura plana, o ChemSketch possui um mdulo de gerao e visualizao de molculas em 3D. Para criar uma visualizao 3D a partir de uma estrutura plana criada na rea de trabalho, siga os passos abaixo: 1) Desenhe a estrutura plana da molcula a qual deseja-se obter a visualizao 3D. 2) Otimize as ligaes na conformao 3D clicando no boto . 3) Agora voc deve selecionar a molcula e clicar no menu ACD/Labs e aps na opo 3D Viewer. Obs: Para alternar entre o modo 3D e a tela principal do ChemSketch, utilize os botes localizados na parte inferior da tela.

Barra de manipulao 3D
Abaixo traremos uma viso geral das ferramentas de manipulao 3D

Open File: Este boto permite abrirmos um arquivo 3D criado no ChemSketch (extenso .s3d).

2 Save File: Este boto permite salvarmos o documento ativo no formato de visualizao 3D do ChemSkech (extenso .s3d). 3 Wireframe: Tipo de representao 3D que mostra a molcula na forma de linhas. Exemplo:

OH H3C

CH3

Estrutura plana 4

Estrutura 3D modo linhas

Sticks: Tipo de representao 3D que mostra a molcula na forma de varas.

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Curso de Informtica Aplicada a Aprendizagem de Qumica Mdulo 01 Desenho Molecular Exemplo:

OH H3C

CH3

Estrutura plana

Estrutura 3D modo varas

Balls & Sticks: Tipo de representao 3D que mostra a molcula na forma bolas e varas. 5 Exemplo:

OH H3C

CH3

Estrutura plana

Estrutura 3D modo bolas e varas

Spacefill: Tipo de representao 3D que mostra a os espaos vazios da molcula preenchidos 6 (semelhante ao modelo Stuart) Exemplo:

OH H3C

CH3

Estrutura plana NAEQ - Ncleo de Apoio ao Ensino da Qumica

Estrutura 3D modo de Stuart Pgina 36

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7 Dots only: Tipo de representao 3D que mostra somente pontos representando os tomos e ligaes da molcula. Disks: Tipo de representao 3D que mostra os tomos na forma de discos, muito semelhante a 8 forma Spacefill, porm sem o efeito 3D. 9 With Dots: Marcado mostra os pontos da representao 3D em qualquer forma de visualizao. Exemplo:

OH H3C

CH3

Estrutura plana 10 11 12

Estrutura 3D Bolas e varetas com pontos

Increase Radii by 5%: Aumenta o tamanho dos tomos da molcula a uma taxa fixa de 5%. Decrease Radii by 5%: Diminui o tamanho dos tomos da molcula a uma taxa fixa de 5%. Measure Distance: Permite determinarmos a distncia entre dois tomos em (angstron).

Obs: Para determinar a distncia entre dois tomos, clique primeiramente na ferramenta e aps isso selecione dois tomos. Os tomos selecionados para a avaliao ficam, por padro, de colorao verde. A distncia informada na barra de status da tela.

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Curso de Informtica Aplicada a Aprendizagem de Qumica Mdulo 01 Desenho Molecular Exemplo:

13 Measure Bond Angle: Permite determinarmos o ngulo entre trs tomos (valor dado em deg). Exemplo:

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Curso de Informtica Aplicada a Aprendizagem de Qumica Mdulo 01 Desenho Molecular Measure Torsion Angle: Pemite determinarmos o ngulo de toro entre os tomos. 14 Exemplo:

15 3D Optimization: Permite otimizar a estrutura no formato 3D. Colors... Este boto permite definirmos as cores tanto dos tomos e ligaes como tambm do 16 plano de fundo. 17 Auto Rotate: Permite a molcula adquirir auto-rotao.

Auto Rotate and Change Style: Alm da auto-rotao, a opo permite que o programa troque 18 automaticamente entre as visualizaes disponveis.

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Exerccios
Desenhe as estrutura plana e 3D conforme as figuras abaixo: a)

Estrutura Plana (com otimizao 3D) b)

Estrutura 3D

Estrutura Plana (com otimizao 3D)

Estrutura 3D

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