Interaccin Genotipo X Ambiente

importancia en el mejoramiento gentico y en la evaluacin y eleccin de cultivares

Fitotecnia

17/8/2010 Facultad de Agronoma, UDELAR

Mejoramiento Gentico
Diversidad Gentica Seleccin

Recombinacin Individuo: P = G + E Poblacin: P = G + E + GxE

Obtencin de cultivares Evaluacin de cultivares Comercializacin de cultivares

Algunos conceptos previos

Es posible que dos cultivares y/o genotipos tengan diferentes rendimientos en un solo ambiente?
R

G2

Genotipo 1

Genotipo 2

G1

AMBIENTE 1

Se llama efecto genotipo (G)

E1

Algunos conceptos previos

Es posible que un cultivar y/o genotipo tenga diferente rendimiento en dos ambientes?
R G1

Genotipo 1

Genotipo 1

AMBIENTE 1

AMBIENTE 2

Se llama efecto ambiente (E)

E1

E2

Qu es la Interaccin GxE?
Es un cambio en la respuesta de los genotipos a los diferentes ambientes.
R G2

Genotipo 1

Genotipo 2

Genotipo 1

Genotipo 2

G1

AMBIENTE 1

AMBIENTE 2 E1 E2

Tipos de respuesta
R G1 G2
G1 G2 G1 G2

NO hay GxE
AMBIENTE 1 AMBIENTE 2 R E1 E2

GxE cambio ranking

G1 G2 G1 G2

G2 G1

AMBIENTE 1

AMBIENTE 2

E1

E2 G1 G2

GxE No cambio ranking

G1 G2 G1 G2

AMBIENTE 1

AMBIENTE 2

E1

E2

Relacin entre rendimiento e ndice ambiental

Rend.

Genotipo 1 Genotipo 2 Genotipo 3 Genotipo 4

Indice ambiental

Adaptado de Satorre et al., 2003

Ejemplos de GxE
Ejemplo 1. Rendimiento en grano (Kg ha-1) de cultivares de Cebada en el Uruguay.
5500 5000 4500 4000

) a h / g k ( . d n e R

3500 3000 2500 2007 2008 CLE247 MP 1 01 0 2009 Clipper

Fuente: convenio inia-inase (www.inia.org.uy)

Ejemplos de GxE
Ejemplo 2. Calidad de grano (% granos > 2.5 mm.) de cultivares de Cebada evaluados en el 2009.
1 00 95 90 85

1 2 % a+ a

80 75 70 65 60 55 50 Estanzuela Ambev 42 Young Dolores CLE233 Valdense Musa 936 Ombes Paysand

CLE259

Ambev 42 CLE 233 M usa 936 CLE 259

Estanzuela Young Dolores Valdense Ombes 2 3 1 2 2 4 2 3 4 3 3 4 4 3 4 1 1 1 1 1

Paysand 2 3 4 1

Ejemplos de GxE
Ejemplo 3. Protena en grano (%) de cultivares de Cebada evaluados en el 2009.
1 2.5 12 1 1 .5 11 1 0.5 10 9.5 9 8.5 8 Estanzuela Young Musa 936 Dolores Valdense Ombes CLE240 Paysand

) % ( g a n e t o r P

Daymn

MAZ
Young 1 08 LE 1 08 LE 1 07 LE 2 08 Young 1 07 LE 2 07 1496.63636 2813.81818 7331.54545 7368.54545 8810.09091 10870.2727 1 348 2059 8038 5821 9505 1 2539 81 5 2852 7686 6561 8258 1 1 577 2256 2643 3590 6397 9083 1 1 374 1119 2647 7543 8506 941 0 1 1 31 8 1 01 8 251 1 7770 6963 7079 1 0989 1 034 2650 7483 9963 8848 1 0972 1 775 1 889 8003 7728 9064 1 0508 1 926 3205 8559 6460 9444 1 0507 1 1 54 3383 7882 7434 8407 1 0407 21 41 361 3 6780 8004 8493 9781 1 877 3500 731 3 721 7 9320 9601 1 01 9 3307 7729 7407 7865 6025 21 56 2361 5095 6465 8383 7098

IPB 860 M G CL IPB 880 M G CL AX 852 M G AX 886 M G SPS 7 M 31 M G P2053Y AX 744 M G AX 878 M G ROG 2790 M G AW 1 90 M G ( TRC) NX 9435 TD M AX LT 625 EST 1 969

1 4000 1 2000 1 0000 8000 6000 R = 0.8527 R = 0.8966

) h / k ( o a r g . d n e R

4000 2000 0 Young 1 08 LE1 08 LE1 07 LE2 08 Young 1 07 LE2 07

IPB 880 M G CL EST 1 969

Ambientes

Qu es un Ambiente?
Variables predecibles: -Tipo de suelo -poca de siembra -Espaciado entre plantas -Densidad de siembra -Aplicacin de nutrientes Efecto AO Efecto AOxLOCALIDAD Variables impredecibles: -Precipitaciones -Temperatura -Humedad relativa -Plagas y enfermedades

Efecto LOCALIDAD Efecto MANEJO

Implicancias de GxE para el MEJORAMIENTO

Ambientes de seleccin: -Ambientes de seleccin similares a los ambientes de produccin? -Seleccin para ambientes especficos/adaptaciones especficas? -Seleccin para adaptaciones generales? -Nmero y tipo de ambientes a utilizar en la evaluacin de las lneas -Manejo a realizar en el ambiente de seleccin

FITOTECNIA: Luca Gutirrez

Implicancias de GxE para la EVALUACIN

Ambientes de evaluacin de cultivares: -Ambientes de evaluacin similares a los ambientes de produccin? -Nmero y tipo de ambientes a utilizar en la evaluacin de los cultivares. -Manejo a realizar en el ambiente de evaluacin.

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Implicancias de GxE para ELECCIN de cultivares

Eleccin de cultivares: -Adaptaciones especficas/generales -Performance en el ambiente objetivo

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Utilizacin de GxE
1. Estimacin de GxE a travs de Anlisis de Varianza:
Fuente de Variacin Ambiente: Localidad Ao Genotipo Interaccin GxE: Genotipo x Localidad Genotipo x Ao Genotipo x Localidad x Ao Error
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SC

CM Varianza

Utilizacin de GxE
Componentes de varianza de cultivares de Cebada en Uruguay.
Componente de varianza Ambiente Cultivar Cultivar x Ao Cultivar x Localidad Cultivar x Ao x Localidad Cultivar x Fecha de siembra x Ao Error experimental Varianza 0.984 0.101 0.039 0.023 0.023 0.109 0.179 % 67 7 3 2 2 7 12

Fuente: Ceretta and van Eeuwijk, 2008

El componente ms importante de la interaccin GxE es Cultivar x Fecha de siembra x Ao

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Utilizacin de GxE
2. Agrupamiento de ambientes similares: -Correlaciones -Cluster anlisis -Biplots
Genotipo G1 G2 G3 E1 10 15 20 E2 20 30 40 E3 15 10 20

Mega-Ambientes

La utilizacin del ambiente E1 y E2 es redundante, no provee informacin adicional

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Utilizacin de GxE
3. Aprovechamiento del anlisis de GxE para el mejoramiento:
R

ESTABILIDAD -Adaptaciones especficas -Adaptaciones generales

b1=0
R

b1=1
R

ij=chico
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Evaluacin de Cultivares
Responsabilidad de INASE Realizada en convenio con INASE (INIA) Anualmente se evalan ms de 700 cultivares pertenecientes a 43 especies Siembra de ms de 70 ensayos por ao distribuidos en 11 localidades diferentes

Evaluacin de Cultivares
Se realiza de acuerdo a protocolos elaborados por grupos de trabajo (GTTE), integrados por representantes de: INIA Productores de semillas:
Asociacin de Productores de Semillas Cmara Uruguaya de Semillas

Usuarios de Semillas Direccin General de Servicios Agrcolas del MGAP Facultad de Agronoma Otras instituciones segn la especie : LATU, Gremial de Molinos Arroceros, Consorcio de Semilleristas de Arroz, etc.

Evaluacin de Cultivares
Diseo experimental Anlisis estadstico Nmero de aos Nmero de localidades Variables medidas Manejo de experimentos Sin continuidad una vez cumplidos los requerimientos (algunas excepciones como arroz y cebada)

Evaluacin de Cultivares
Cultivos agrcolas de secano de invierno Cultivos agrcolas de secano de verano Arroz Forrajeras Especies hortcolas

Cebada
LE, Young (SD), Dolores (SD), Valdense (SD), O. de Lavalle, Paysand Incluye todos los cultivares sembrados ms los cultivares en evaluacin Rendimiento, Clasificacin, Fenologa, Protena, Caractersticas morfolgicas Comportamiento sanitario (+ colecciones inoculadas) Evaluacin de calidad maltera (LATU 15 cvs. 3 o ms aos 5 cvs. 2 aos 23 cvs. en primer ao

Soja
Separacin en ciclos cortos y medios LE(2 pocas), Young (SD) Solo cultivares en evaluacin Rendimiento, Porcentaje de aceite, Das a floracin, Caractersticas morfolgicas 31 cvs. Ciclo corto 55 cvs. Ciclo medio

Lotus corniculatus
LE Produccin total y estacional de materia seca (corte copn maquina) 19 cvs.

Unica especie sin interaccin localidad x cultivar significativa (FPTA222)

Sntesis
La interaccin Genotipo x Ambiente es un fenmeno extremadamente comn. Entender los componentes de la interaccin Genotipo x Ambiente es fundamental a todo nivel: Mejoradores: elegir los ambientes de seleccin y evaluacin. Criaderos: elegir los cultivares a producir. Tcnicos y Productores: elegir los cultivares apropiados.

FITOTECNIA: Luca Gutirrez

Examen
Lotus corniculatus (2006) CRUZ DEL SUR GE EXPO501 GU 200506 GU 200603 GU 200604 INIA DRACO SAN GABRIEL MDS 5% LE C olonia S ALTO 6360 6777 4814 7124 7001 6113 6046 1601 * 5547 6386 3371 6137 6070 6383 5959 1037 ** PL TyTres 1352 1843 113 1375 1083 1461 1740 615 ** PP TyTres 310 808 414 1324 327 961 1357 603 **

1. Usted es un mejorador de Lotus corniculatus. En base a estos datos del sistema de Evaluacin de Cultivares a) determine si existe interaccin genotipo por ambiente. b) identifique el mejor cultivar. 2. Usted est asesorando un productor ganadero en Paysand. Qu cultivar elije sembrar?
FITOTECNIA: Luca Gutirrez