BIOQUMICA I

Profesor. JOS A. SNCHEZ A. Docente UDELAS

BIOQUMICA
Donde quiera que hay vida, ocurren procesos
bioqumicos

CONCEPTO
Clula = unidad estructural de los sistemas vivientes. Ciencia que estudia las diversas molculas que se presentan en las clulas, as como las reacciones qumicas que ocurren en los mismos.

Objetivo

Importancia

La bioqumica busca Los estudios bioqumicos describir y explicar en contribuyen al diagnostico, trminos moleculares pronostico y tratamiento todos los procesos de la enfermedad. qumicos de las clulas vivas.

Historia de la Bioqumica
Antigedad clsica - Edad Media
Elementos de Empdocles: Los humores de Galeno Los Temperamentos

Agua Aire Fuego Tierra

Flema Bilis Sangre Bilis Negra

Flemtico Colrico Sanguneo Melanclico

La enfermedad es diskrasia (discrasia), esto es: una mezcla inadecuada de los humores

Historia de la Bioqumica El Renacimiento

Paracelso: Unin de Medicina y Alquimia

Van Helmont: la Yatroqumica

Historia de la Bioqumica La Ilustracin

- Scheele: los Productos Naturales: cido rico, cido ctrico, cido mlico, etc. - Lavoisier: Equivalencia entre respiracin y combustin

- Spallanzani: La digestin como proceso qumico

Historia de la Bioqumica El siglo XIX

- Teora atmica (Dalton) - Catlisis (Berzelius) - Las Fermentaciones: Liebig, Schwann, Pasteur

Historia de la Bioqumica Siglo XX, 1900-1950

- Bchner y la fermentacin acelular

- Harden y los sistemas acelulares

- Enzimologa: Northrop, Knitz, Sumner

- Metabolismo: Embden, Meyerhof, Krebs, Warburg, Lipmann

Historia de la Bioqumica El siglo XX, 1950-2000

La Biologa Molecular:

- Estructura tridimensional del DNA

- Estructura tridimensional de las protenas

- Genmica
- Protemica

INTERRELACION DE LA BIOQUMICA
Medicina Muchos estudios bioqumicas aclaran mecanismos patolgicos y su vez las enfermedades inspiran estudios en reas especificas de la bioqumica. Las investigaciones bioqumicas en relacin con las enfermedades pueden resumirse en cinco categoras: Demostracin de sus causas. Sugerir tratamientos racionales y eficaces. Poner a disposicin pruebas selectivas para el diagnostico temprano. Colaborar en la vigilancia del progreso. Ayuda a valorar la respuesta al tratamiento.

INTERRELACION DE LA BIOQUMICA
Otras ciencias La vida depende de reacciones y procesos biolgicos, la bioqumica es el lenguaje bsico de todas las ciencias biolgicas. Gentica : se apoya en al bioqumica de los cidos nucleicos. Fisiologa : funciones celulares (reacciones) Inmunologa: emplea tcnicas bioqumicas. Farmacologa: metabolizacin de frmacos y su interaccin. Nutricin: estudio de compuestos orgnicos

Capitulo I:
Lgica Molecular de los seres vivos. De las molculas a los organismos

Los anlisis qumicos demuestran que la materia viva est constituida por los mismos tomos y molculas orgnicas inanimadas y que su comportamiento se rige por las mismas leyes fsicas y qumicas de toda la materia del Universo Sin embargo, un organismo no est vivo a menos que se le puedan atribuir las diversas propiedades dinmicas incluidas en el termino fisiologa. Las caractersticas de funcionales propias de la materia viva son:

Lgica Molecular de los seres vivos. De las molculas a los organismos

Metabolismo. Crecimiento y renovacin constitucional de tipo permanente, relacionada con actividades complejas de sntesis y degradacin. Capacidad de reaccin y excitabilidad. Se detecta a todos los niveles desde molculas hasta organismos.

Capacidad reproductiva. Y aunque parezca mentira, la posibilidad de que el material gentico que constituye el soporte fsico de esta propiedad se modifique y evolucione.

1.1 Caractersticas que identifican a los seres vivos

Composicin qumica elemental de la materia viva.

-

Todos los tomos que constituyen los seres vivos, tambin se encuentran en la corteza terrestre, aunque la constitucin de la lista es en abundancia diferente entre los seres vivos y la bisfera. Los seres vivos poseen slo de 20 a 25 elementos y esta relacin depende de ciertos tomos raros no representados en todas las especies: Estos elementos pueden ser clasificados como elementos abundantes (4), medianamente abundantes (7), y trazas (15). La materia viva est constituida por cantidades considerables de ciertos elementos del entorno N, C, H, S, P. El oxgeno es el elemento ms abundante en ambos reinos ya que participa en la formacin del agua, es tambin el elemento mas pesado de los que abundan en los seres vivos y el ms ligero de los presentes en la corteza terrestre.

1.1 Caractersticas que identifican a los seres vivos

1.2 Organizacin macroscpica y microscpica.

Los seres vivos ms susceptibles de ser observados de manera directa (macroscpicos) se caracterizan por 1 morfologa y organizacin generalmente diversa y compleja.

La complejidad en la organizacin interna se hace patente en las clulas, unidades vivas ms pequeas. En 1 organismo superior existen mas de 200 tipos de clulas distintas formando supraestructuras como tejidos, rganos y organelos, etc.
Cuando existen organismos unicelulares es necesario recurrir a la microscopia y a tcnicas citolgicas para efectuar anlisis necesarios. (Organizacin microscpica)

1.3 Metabolismo

El metabolismo constituye un conjunto altamente integrado de reacciones qumicas con 3 funciones precisas: Extraccin y almacenamiento de la energa Transformacin de molculas exgenas en material constitutivo de la clula (precursores) gracias a esta energa. Ensamblaje de precursores para formar macromolculas con funciones catalticas y de informacin.

1)

2)

3)

As, el metabolismo se divide en metabolismo energtico, metabolismo intermediario y metabolismo relativo a las macromolculas. Los dos primeros se encuentran estrechamente ligados a travs de 1 compleja red de reacciones que presenta notable unidad en los seres vivos

1.3 Metabolismo

El metabolismo puede subdividirse en 2 fases: catabolismo y anabolismo. Catabolismo. Incluye todas las etapas de la degradacin mediante las cuales molculas complejas tipo glcidos, lpidos y prtidos se descomponen en los elementos orgnicos sencillos y tambin en compuestos minerales (CO2, H2O y NH3). En el curso de estas etapas la energa potencial contenida en los enlaces qumicos se almacena en una molcula universal ATP, el cual contiene enlaces de alta energa. Anabolismo. Las cadenas de carbono no degradas en su totalidad se emplean en la fase de sntesis , en la cual, la energa acumulada, se utiliza a partir de los precursores simples para transformarlos en macromolculas especficas polisacridos, protenas y cidos nucleicos. En general en el metabolismo las reacciones son catalizadas por enzimas especficas que pueden actuar a lo largo de ciclos de degradacin o sntesis.

1.4 Capacidad de reaccin

Las reacciones de los organismos animales se llevan a cabo por estmulos externos de tipo fsico o qumico son bien conocidas y en ellas participan diversos sistemas o aparatos como el sensorial, el nervioso o el muscular, de una gran complejidad estructural y que inducen a respuestas de comportamiento elaboradas. Los mecanismos internos de regulacin en los organismos y las clulas tienen por objeto mantener el equilibrio fsico-qumico en su interior o del contenido celular a corto o largo plazo (homeostasis) y tambin permiten que los seres vivos reaccionen ante los factores externos. En esta forma es necesario comprender que todo lo que se manifiesta a escala visible o macroscpica se relaciona con el concepto de excitabilidad en el sentido amplio

1.5 Reproduccin y Evolucin

Reproduccin puede definirse como la capacidad de reproducirse, es decir, perpetuarse a travs de generaciones. Esta produccin de copias idnticas se efecta a travs de modalidades diferentes de mayor o menor complejidad. Sea por multiplicacin sexual o asexual y dependiendo de que se efecte en seres unicelulares o pluricelulares. A escala celular, la divisin constituye un medio de aumentar la poblacin efectiva de manera clonal (unicelulares) y en los pluricelulares, aumentar su nmero aunque existan ciertas diferencias.

De cualquier manera, tras un periodo corto de generacin, la reproduccin se caracteriza por una fidelidad aparentemente perfecta, lo cual constituye una ventaja para la supervivencia de la especie bien adaptada a un medio.

2. De las molculas a los organismos 2.1 Anlisis de la constitucin de la materia viva a

nivel molecular
-

El agua representa aproximadamente el 75% de la masa de los seres vivos. Las sales minerales son menos abundantes pero funcionalmente importantes Desde el punto de vista de tamao, las molculas de los seres vivos se pueden dividir en sales minerales de bajo peso molecular, pequeas molculas orgnicas con masas moleculares de 100 a 75 Da y macromolculas con masas moleculares de aproximadamente 104 a 1011 Da. Las 2 ltimas categoras son denominadas biomolculas Las molculas orgnicas son representadas fundamentalmente por protenas y ARN, tambin denominadas macromolculas. En general molculas pequeas de baja masa suelen ser muy abundantes, mientras que las macromolculas estn presentes en un nmero menor, por ejemplo el ADN, en ciertos casos se encuentran en 1 sola copia por clula (cromosoma)

2.1 Anlisis de la constitucin de la materia viva a

nivel molecular

2.2 Jerarqua de las biomolculas

2.3 Autoensamblaje y estructuras supramoleculares.

- El autoensamblaje es un fenmeno definido como la asociacin espontnea de molculas para formar estructuras de gran tamao llamadas supramolculas, que constituyen un puente entre el mundo de las molculas y el de las estructuras celulares. - Las supramolculas son estructuras organizadas formadas por un gran nmero de subunidades idnticas o distintas, de igual o diversa naturaleza molecular, y pueden obtenerse in vitro a partir de sus constituyentes celulares

3. Transformacin de la materia y de la energa en el mundo de los seres vivos.

Los seres vivos se caracterizan por tener actividad qumica que les permite crecer y renovar de manera permanente sus constituyentes (metabolismo), as adems del agua son necesarios:

Una fuente de carbono (mineral u orgnico) Una fuente de energa (fsica o qumica) Una fuente de potencia reductora (mineral u orgnica) Diversas fuentes de elementos minerales (N, P, S, etc) Nota: Tipo trfico se denomina al conjunto de seres vivos que utilizan los mismos procedimientos para obtener y transformar sus alimentos con el fin de fabricar su propio material constitutivo.

3.1 Auttrofos y Hetertrofos.

Auttrofos: Son seres que se nutren de manera autnoma y utilizan CO2 atmosfrico disuelto en agua. Los auttrofos son fundamentalmente representados por los organismos que realizan la fotosntesis y fijan CO2 y fijan el CO2 directamente de la energa luminosa a travs de pigmentos especializados ( conocidos con el nombre de fotolittrofos )

Otros organismos bacterianos no fotosintticos fijan el CO2 libre y se conocen como quimiolittrofos (subgrupo de los quimiotrofos)

3.1 Auttrofos y Hetertrofos.

Hetertrofos, son seres cuya nutricin depende de otros y requieren del carbono en forma orgnica ya elaborada por los auttrofos quienes son los productores primarios de la bisfera.

Los hetertrofos estn representados principalmente por los animales, hongos y gran nmero de bacterias que se nutren de pequeas molculas y se dividen en fagotrofos y osmotrofos.
Fagotrofos. Se alimentan del entrono en forma de partculas grandes gracias al fenmeno de la fagocitosis. Osmotrofos. Se alimentan del entorno en forma de solucin gracias a sistemas de transporte especficos ubicados en la membrana plasmtica.

3.2 Fototrofa y quimiotrofa

Fottrofos. Utilizan la luz solar capturndola a travs de sus pigmentos de clorofila. (fotosintticos) y pueden ser: Fotolittrofos. Fototrofos que utilizan donadores de electrones de tipo mineral (agua y SH2 ) Fotoorganotrofos. Fototrofos que emplean molculas orgnicas como donadoras de electrones.

Quimiotrofos. Utilizan reacciones de xido-reduccin espontneas para generar energa, y pueden ser:

Quimiolitotrofos. Oxidan molculas minerales

Quimioorganotrofos. Oxidan molculas orgnicas.

3.3 Organismos aerobios y anaerobios

Aerobios: son aquellos que utilizan al oxgeno como aceptor final de electrones en reacciones de oxido reduccin. Anaerobios: Son aquellos que utilizan otras molculas o compuestos orgnicos como aceptores. Anaerobios estrictos: No toleran el oxgeno, el cual constituye un veneno para ellos. Anaerobios facultativos: Se adaptan a la presencia de oxgeno.