METABOLISMO

O del orden del desorden.

Metabolismo es simplemente la suma de todas las reacciones que ocurren en un organismo. En el caso de organismos multicelulares, tambin puede hablarse del metabolismo celular, la suma de todas las reacciones que ocurren en una clula. Recordemos que toda reaccin en un organismo est catalizada por una enzima.

Estas reacciones ocurren en una serie de secuencias cada una de las cuales se llama ruta metablica. Una ruta metablica queda delimitada al principio por un paso generador de flujo, y al final por:

Otro paso generador de flujo (otra ruta) Un producto final que se usa, excreta o almacena.

Un paso generador de flujo es una reaccin que:

Est muy alejada del equilibrio (muy exergnica) Est catalizada por una enzima con un KM usualmente por debajo de la concentracin intracelular.

Adems del paso generador de flujo, una ruta metablica puede contener otras reacciones muy alejadas del equilibrio.

El resto de reacciones de una ruta metablica son cercanas al equilibrio (ligeramente exergnicas). Una reaccin cercana al equilibrio, a diferencia de las primeras, puede cambiar de direccin y/o velocidad fcilmente a partir de cambios en la concentracin (POR QU?).

Para cambiar la velocidad de una reaccin alejada del equilibrio es necesario regular a la enzima correspondiente, tpicamente a todo nivel:

Actividad enzimtica por modificacin covalente Actividad enzimtica por alostera Concentracin enzimtica

La direccin de estos procesos no se puede modificar porque exigira cambios muy drsticos en las concentraciones.

Esto representa un problema para la clula porque, dependiendo de las condiciones de cada momento, ser algo deseable. La manera como se resuelve dicho problema es haciendo uso de una reaccin alterna que tenga el mismo efecto que la reaccin inversa pero que sea exergnica. Esta reaccin alterna se da gracias al acoplamiento termodinmico.

El acoplamiento termodinmico se basa en el principio de adicin de G de reacciones secuenciales. Dicho principio establece que el valor de G de una serie de n reacciones en secuencia es igual a la suma de los valores individuales de G. De esta manera, en principio, es posible combinar reacciones exergnicas con endergnicas sin comprometer toda una secuencia.

Sin embargo, en una ruta metablica inversa esto NO es posible porque el aporte de las reacciones exergnicas es muy pequeo. La solucin consiste en acoplar la reaccin endergnica con otra reaccin que sea tan exergnica que la suma siga siendo negativa (tpicamente tambin alejada del equilibrio), en uno o varios pasos novedosos. Cuando el acoplamiento se da en varios pasos, al primero se le llama activacin.

La reaccin muy exergnica que suele usarse en estos casos es la hidrlisis de Trifosfato de Adenosina (ATP por sus siglas en ingls). Se emplea casi siempre esta reaccin porque, aunque no es la ms exergnica, es de las ms exergnicas, lo cual garantiza que se pueda usar como moneda en las transacciones energticas de la clula.

El uso de ATP como fuente de energa libre de Gibbs para que se de acoplamiento termodinmico es la razn por la cual la produccin de ATP es tan necesaria e importante para los seres vivos; explica el cambio de entalpa y el de entropa propios de un sistema vivo.

ste es el origen de la definicin (equivocada) de reaccin endergnica: aqulla que necesita de energa para que ocurra. Como la energa no se crea ni se destruye, tiene que venir de algn lado. La energa viene en molculas que participan en la reaccin. Si estas molculas participan en la reaccin, sta ya no es simplemente la inversa sin una reaccin completamente novedosa.

Puesto que la reaccin acoplada es novedosa, se encuentra catalizada por una enzima diferente. Es esta enzima la que media la interaccin qumica entre ella y sus sustratos para hacer efectiva la suma energtica. La secuencia cclica formada por las reacciones de ida y vuelta se llama ciclo de sustrato.

Los ciclos de sustrato pueden dar la impresin de ser futiles pero en la prctica no lo son. La futilidad se evita regulando al mismo tiempo las enzimas que catalizan las reacciones contrarias, manteniendo activa una e inhibida la otra, y/o modificando su concentracin. Recordemos que activado e inhibido son trminos relativos, y que por lo tanto una ruta nunca est absolutamente inhibida.

As que esta regulacin simultnea permite algo de ahorro de ATP pero no todo. Hay cierto gasto de ms de ATP que es inevitable, debido a que se tienen ambas rutas funcionando. Esto se promueve porque es ms rpido y eficiente regular a 2 enzimas con diferentes estados de actividad relativa.

Los ciclos de sustrato permiten habilitar rutas metablicas contrarias, que pueden representarse equivalentemente tambin como ciclos de sustrato. Esta equivalencia se da gracias a que son las reacciones alejadas del equilibrio quienes marcan la pauta para que las cercanas al equilibrio se ajusten en el mismo sentido y velocidad.

Se dice, entonces, que el metabolismo est organizado en ciclos de sustrato. En cada ciclo de sustrato de rutas metablicas es posible distinguir:

La ruta que genera molculas ms simples sin gasto energtico: ruta catablica. La ruta que produce molculas ms complejas pero consumiendo ATP: ruta anablica.

Al conjunto de rutas catablicas se le llama catabolismo y al conjunto de las anablicas, anabolismo.

A continuacin se muestra un mapa metablico bsico y simplificado, en el que cada par de flechas contrarias es un ciclo de sustrato (no todas las rutas metablicas forman parte de uno).

En el mapa anterior se pueden distinguir:

Rutas anablicas: flechas para arriba, indicando un aumento de complejidad y necesidad de acoplamiento termodinmico Rutas catablicas: flechas para abajo, indicando disminucin de complejidad y exergonia sin acoplamiento, Metabolismo energtico (produccin de combustibles y energa metablica/almacenamiento de combustible y energa metablica: lo enmarcado en verde. Metabolismo de nitrgeno: lo enmarcado en anaranjado. Metabolismo oxidativo (produccin de energa metablica; no todo catabolismo es oxidativo): la parte del enmarcado por debajo de la lnea azul. Es el tema que se discute en las presentaciones siguientes.