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Introduo
Genes: Constitutivamente ativos:
Codificam produtos necessrios para os processos basais das clulas So transcritos em uma taxa relativamente constante.
Genes induzveis:
Produo de protenas em resposta a estmulos externos. Deve retornar ao estado basal aps retirada do estmulo. Altamente regulados e devem ser capazes de responder rapidamente e especificamente a estmulos externos.
No artigo em estudo discusso da regulao de genes induzveis durante a etapa de iniciao da transcrio.
Etapas da transcrio
Iniciao Alongamento: transcrio propriamente dita = sntese de RNAm a partir do molde de DNA. Terminao: sequncias terminators so traduzidas = finaliza sntese do RNAm.
A iniciao da transcrio
1.
Ativadores da transcrio se ligam a stios especficos do DNA (prximos ao gene-alvo). Recrutam co-ativadores e o complexo remodelador de nucleossomas (por interaes protena-protena). Formao do complexo basal de iniciao (PIC). = RNA Polimerase II + GTFs (fatores gerais da transcrio).
2.
3.
B) Recrutamento de vrios co-ativadores e complexos remodeladores de nucleossomos. C) Recrutamento da RNA Pol II e dos GTFs
Formao do PIC.
Removem ou deslocam histonas de regies do DNA para outra regio do DNA ou para protenas chaperonas (transporte) Utilizam energia da hidrlise de ATPs para remover as histonas acetiladas pelos co-ativadores.
Importncia maior parte do DNA em clulas eucariticas est condensada como cromatina e no est acessvel para a maquinaria da transcrio.
A remoo das histonas feita mesmo na sua ausncia e a transcrio ainda iniciada.
Contudo, crucial para a induo da expresso gnica facilita a rpida ativao da transcrio.
Importante para resposta rpida aos estmulos externos.
2. Ativao do PIC
CDK7 (domnio de um GTF) fosforila a serina na posio 5 da extremidade carboxi-terminal da RNA Pol II.
Outros processos ocorrem (outras fosforilaes, etc). Resultam na introduo da fita simples de DNA molde no stio ativo da Pol II.
3. Escape do promotor
3. Escape do promotor
OBS:
No suficiente para que a Pol II continue a transcrio do resto da fita de DNA s transcreve 20-40 nucleotdeos. O alongamento efetivo necessita de uma segunda fosforilao (na serina 2) cria stios de ligao para outras protenas necessrias para a transcrio ao longo da cromatina.
Exemplos
Foram usados trs exemplos para ilustrar a regulao da expresso gnica nas 3 diferentes etapas da iniciao do processo de transcrio:
Exemplo I
Induo do Gene Gal em resposta galactose em leveduras da espcie
Saccharomyces cerevisiae
Gal4 ativador SAGA e Mediador co-ativadores SWI/SNF complexo remodelador de nucleossomas Regulao da transcrio feita pela regulao do ativador Gal4:
Exemplo II
Induo do gene do choque trmico na
Drosophila melanogaster
Estmulo externo = choque trmico (aumento da temperatura) ou outras condies ambientais estressantes (infeco, inflamao, toxinas, hipxia, etc). Genes do choque trmico codificam protenas relacionadas resposta ao choque trmico (como Hsp70, Hsp90, etc). Expresso regulada por fatores de choque trmico (HSF), que so ativadores da transcrio.
Drosophila melanogaster
Fator GAGA
RNA Pol II + GAGA: esto ligados regio promotora dos genes (na imagem, gene da Hsp70) antes do choque trmico.
Drosophila melanogaster
Choque trmico provoca ligao do HSF (ativador transcricional) ao GAGA, estimulando a perda de nucleossomas no gene.
OBS: a perda de nucleossomas no suficiente para induzir a transcrio, mas importante porque facilita o acesso da maquinaria ao DNA.
Drosophila melanogaster
Exemplo III
Regulao do estresse osmtico S. cerevisiae
Em resposta ao estresse osmtico dois diferentes sinais convergem para fosforilar e ativar a protena MAPK, que ento fosforila Hog1. Hog1 recrutado para os promotores dos genes de resposta ao estresse osmtico (como STL1) O Hog1 atua como um ativador de transcrio em STL1, interagindo diretamente com o Mediador e os componentes gerais da maquinaria de transcrio.
Hog1 tambm recruta o complexo RSC de remodelao de nucleossomas para a regio codificante do STL1 auxilia a passagem da RNA polimerase II (Pol II) durante o alongamento da transcrio. Hog1 fosforila ativadores transcricionais como SMP1
SMP1 fosforilada recruta co-ativadores adicionais e a maquinaria geral de transcrio de genes (incluindo CWP1 e STL1) para iniciar a transcrio Pol II-dependente.
Concluso
ser estimulados
formao do PIC deve ocorrer como passo inicial na ativao da transcrio (especifica local apropriado para comear ).
A regulao dos genes induzveis pode ser feita em vrios estgios do ciclo de transcrio.
Referncias bibliogrficas
Reviso: Weake, V.M., and Workman, J.L. Inducible gene expression: diverse regulatory mechanisms. Nat. Rev. Genet. 11, 426437. Prodabi Processamento de dados em bioqumica e imunologia. Sntese e processamento de RNA. Disponvel em: <http://www.icb.ufmg.br/biq/lbcd/prodabi3/grupos/gr upo1/index.htm> Acesso em 02/11/2010.