Virus

Bibliografa:
Brock. Biologa de los Microorganismos (10ma. Edicin) Cap. 9 Donoghue M. 2004. Assembling the Tree of Life. Cap. 8.

Estructura de la clase
Clasificacin y taxonoma de los virus.
Clasificacin de Baltimore: forma de replicacin y transcripcin Ciclo de vida de virus Virus animales Origen y evolucin de los virus: 3 hiptesis Priones Viroides Ejercicio 6

Virus

Definicin: (del latn veneno) Elemento gentico que contiene RNA o DNA y se replica dentro de las clulas hospedadoras (pero independientemente de los cromosomas de la clula) y tambin posee un estado extracelular. No est formado por clulas.

Agente patgeno que mide entre 30-300 nm (0.03-0.3 um).

Son parsitos intracelulares: necesitan una clula hospedadora para replicarse, ya que se aprovechan de la maquinaria metablica. Infectan a todo tipo de organismos celulares.

Los virus son los organismos ms numerosos de la Tierra

Estado extracelular del virus

La partcula vrica en el estado extracelular se llama virin. Es la estructura mediante la cual el genoma del virus se transporta de una a otra clula.

El virin (partcula del virus completa) est compuesta de:

Una cpside de protenas. Material gentico (DNA o RNA). Es metablicamente inerte, sin funciones catablicas y biosintticas. Algunos viriones contienen enzimas que colaboran en el proceso infeccioso. - Ejemplo 1: algunos fagos contienen lisozima que perfora la pared

celular de la bacteria y permite la entrada.

- Ejemplo 2: retrovirus contienen la enzima transcriptasa reversa.

 Estado intracelular del virus

Infeccin: introduccin de un genoma vrico en una clula hospedadora y su reproduccin en la misma. Replicacin del virus: produccin de nuevas copias del genoma vrico y sntesis de los componentes de la cubierta o cpside. Los genomas de los virus son pequeos (5.000-500.000 bp) y codifican funciones que no pueden utilizar en sus hospedadores. Genoma circular o linear (pueden tener menos de 5 genes!) El material gentico puede ser DNA o RNA, de cadena sencilla o doble. Algunos virus tienen DNA y RNA como material gentico en distintos estadios de su ciclo reproductivo.

Preguntas

Considera que los virus son seres vivos? Por qu?

Cmo diferenciara un virus de un plsmido?

Cmo se diferencia un virus de una clula?

Estructura de los viriones

Estructuras diversas en forma, tamao y composicin qumica. Cubierta proteica formada por protenas individuales: subunidades

estructurales, que siguen un modelo preciso y repetitivo.

Puede estar compuesta por uno o varios tipos de protenas. Distintas protenas se asocian en estructuras especficas: capsmero, que se autoensamblan. Tiene estructura simtrica: cilndrica o esfrica. Dentro del virin existen enzimas especficas.

Material gentico Nucleocpside capsmero

Estructuras de los virus

Cabeza icosadrica Cola helicoidal

Cilndrica o helicoidal TMV

Icosadrica IBDV

Compleja bacterifago (o fagos)

 Virus del mosaico del tabaco

Virus cilndrico, simetria helicoidal.

Virus envueltos
Algunos virus poseen una membrana rodeando la nucleocpsida. La mayora son virus animales; e. g Influenza virus. Consiste en una bicapa lipdica con glicoprotenas embebidas, derivada de

la membrana de la clula hospedadora.

Funcin: Da especificidad y colabora en la penetracin.

Virus desnudos

Virus envueltos

Replicacin de los virus - generalizada

Ver video del Brock

Cultivo de virus
Slo se replican en clulas. Se requiere la clula hospedadora para su cultivo. Los virus ms fciles de crecer en el laboratorio son los fagos. Se los cultiva en medios lquidos o semislidos. Para algunos virus de plantas o animales, se usan cultivos celulares para su investigacin. Cuantificacin de fagos:

- Diluciones seriales de virus en un cultivo de clulas. -Tincin: Clulas muertas se ven blancas. - Cada placa blanca es el rdo de la infeccin por 1 virus.

Tipos de virus segn el hospedador

Virus de bacterias = bacteriofagos = fagos

Virus de plantas
Virus de animales Virus de algas Virus de arqueas Virus de protistas

Virus de Bacterias o Bacteriofagos (fagos)

La mayora con dsDNA (tambin hay fagos con ssRNA, dsRNA) Con estructuras complejas (cabeza y cola), pocos con envoltura. Virus virulentos o atemperados. Hay fagos especficos de Bacteria y de Archaea.

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Replicacin vrica: ciclo ltico

Etapas de proceso de replicacin de un bacterifago:
5 Liberacin de viriones
Lisozima codificada por virus

1 Fijacin/adsorcin

Especificidad: interaccin con receptores

2 Penetracin
Rendimiento vrico eclipse - Lisozima

4 Ensamblaje y empaquetamiento Maduracin

3 Sntesis de c. Nucleicos y prot.

Prot. Tempranas Prot Tardias

Duracin: 20-60 fagos vs. 1-2 d virus animales

Movie 1: replicacion de un virus mediante ciclo litico

Movies in chapter 16, 17 y 18 de MacGraw hill

Ciclo ltico vs. ciclo lisognico

Ciclo de vida virulento: ciclo replicativo resulta en la destruccin celular o lisis Ciclo de vida temperado: ciclo replicativo conjunto con el del hospedador, sin destruirlo.

Fago virulento
Induccin por luz uV o qcos

Fago atemperado

Movie 2 - Fago Lambda: ciclo lisogenico

Resistencia
No todas las clulas son susceptibles al ataque del virus. Formas de resistencia en bacterias: no existe un receptor de membrana indicado. destruccin del dsDNA viral por enzimas de restriccin (proteccin de su propio DNA mediante modificaciones: metilacin).

Algunos virus desarrollan nuevas estrategias: Inhibicin de sistemas de restriccin del hospedador. Modificacin de su DNA (metilacin, glucosilacin).

Fago T4
Cabeza icosadrica + cola de 110nm dsDNA lineal, 168.000 bp, 250 protenas Citosinas modificadas por glucosilacin Infeccin: - sntesis de enzima para que la RNA polimerasa del hospedador reconozca los promotores - sntesis de enzimas virales para glucosilar las citosinas - ciclo ltico en 25, 100 partculas vricas.

Fago Lambda
Infecta a E. coli dsDNA lineal, 48.000bp. Virus virulentos o atemperados. Ciclo lisognico: se expresan genes para la integracin del DNA del fago. En estado de lisogenia: no expresan sus genes, excepto un represor viral. Si se inactiva el represor, el profago es inducido y se desencadena el ciclo ltico. Causas: condiciones ambientales, luz uV, rayos X, compuestos qumicos. Se usa en ingeniera gentica para transportar DNA recombinante.

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SEM (Microscopa electrnica de barrido)

TEM (Microscopa electrnica de transmisin)

Preguntas
Por qu la curva de crecimiento de una poblacin viral es escalonada (distinto a la curva bacteriana)?

En qu se diferencia el genoma viral de aquel de las clulas? Y en qu es similar?

Clasificacin de los virus

Taxonoma formal: clasifica a los virus en rdenes, familias, gneros y especies. El nivel taxonmico ms til es el de familia. Miembros de una familia

poseen una determinada morfologa, genoma y estrategias de replicacin.

Las familias de virus terminan en -viridae. Ej. Poxviridae. Se han clasificado basndose en caractersticas diversas:

en funcin de los hospedadores que pueden infectar: animales,

plantas, bacterias. presencia de transcriptasa reversa en funcin del tipo de cido nucleico de los viriones: Sistema de clasificacin de Baltimore.

Taxonoma
En el ao 2000, se estimaron: 6 grupos de virus 62 familias 233 gneros 3600 especies 30.000 cepas y subtipos. Se examinaron animales y plantas principalmente. Pocos estudios de virus de archaea, hongos, protistas, algas, etc. Muchos de las familias parecen ser monofilticas. Pero los virus son polifilticos.

Problemas: - difcil encontrar caracteres homlogos; pocos genes en virus. - rpida tasa de evolucin en virus. - gran extincin de virus. - transferencia horizontal de genes con los hospedadores.

Clasificacin de Baltimore
Basada en la relacin entre su genoma viral y su mRNA

Ejemplos: I: herpes II: parvovirus III: IBDV (pollos) IV: SARS, TMV, hepatitis C V: sarampin, gripe, dengue VI: Retrovirus VII: Hepatitis B

Transcriptasa reversa (viral) para Replicacin, mediante RNA

Retrovirus

Transcriptasa reversa (viral) Proteasa, Integrasa dentro del virus

RNA polimerasa (hospedador)

RNA polimerasa (hospedador)

DNA polimerasa (hospedador)

RNA polimerasa (hospedador)

RNA polimerasa (hospedador)

RNA polimerasa dependiente de RNA (viral) - dentro del virus

RNA polimerasa dependiente de RNA (virus)

RNA polimerasa dependiente de RNA (viral) - dentro del virus

RNA polimerasa dependiente de RNA (virus)

(Acta como mRNA)

RNA polimerasas del hospedador slo usan dsDNA para formar mRNA (ni ssDNA ni RNA)

Virus del Group I dsDNA: Adenoviridae

Movie: http://www.mcb.uct.ac.za/tutorial/calgary_files/

Virus del Group II ssDNA: Parvoviridae

Movie: http://www.mcb.uct.ac.za/tutorial/calgary_files/

Virus del Group III dsRNA: Reoviridae

Movie: http://www.mcb.uct.ac.za/tutorial/calgary_files/

Virus del Group IV: ssRNA (+)

Ciclo de infeccin y replicacin de un Fago ssRNA (+): video

Virus del Group V: ssRNA (-): Rhabdoviridae

Movie: http://www.mcb.uct.ac.za/tutorial/calgary_files/

Virus del Group VI: ssRNA (+): Retrovirus

Retrovirus
Genoma ssRNA pero se replican mediante DNA intermediario. usan enzima transcriptasa reversa. Semejantes a elementos transponibles escapados de clulas.

Son virus envueltos.

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Movie: retrovirus replication McGrawHill

Replicacin de Retrovirus
gemacin

Ejemplo: HIV

Entrada

encapsidacin Decapsidacin
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RT integracin

Movie: HIV replication

Virus animales
Los virus de eucariotas, en gral, se encuentran con una clula muy distinta
Caractersticas generales de virus animales:
- El virin entero entra (por endocitosis o
por fusin con la membrana) o solo se inyecta el material genetico - Los cidos nucleicos se dirigen al ncleo para replicacin y transcripcin. - Liberacin de virus por lisis o exocitosis - Hay de todas las clases de virus: DNA, RNA.
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- Virus de RNA + con modificaciones como

cola poli-A.

Video Brock

Varias formas de virus animales

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Polio virus

Herpes virus

Influenza virus

Infecciones persistentes: viriones son liberados sin lisar la clula. Infecciones latentes: la aparicin de sntomas (por lisis celular) ocurre un tiempo despues de la infeccin.

Preguntas

Si encontramos a un virus que lleva dentro de su cpside la enzima RNA polimersa dependiente de RNA, que tipo de genoma es probable que posea?

Un virus que contiene como genoma mRNA (+), cmo predecira que va a replicarse? Qu clases de virus poseen transcriptasa reversa?

Origen de los virus

Se originaron en forma independiente, mltiples veces. Grupo polifiltico. Tres hiptesis de mecanismos del origen de los virus:

1. Hiptesis Primordial 2. Hiptesis de la fuga de transcriptos 3. Hiptesis Regresiva

1. Hiptesis Primordial: algunos RNA virus existen desde los principios de la vida en la Tierra hace 3800 millones de aos. Pequeas molculas de RNA surgieron independientemente.

Evidencia: hay virus en todas las formas de vida.

2. Hiptesis de la fuga de transcriptos: los virus se originan de mRNA (u otras molculas de RNA o DNA) de las clulas hospedadoras que adquirieron la capacidad de replicarse y ser empaquetadas en una cubierta proteica, permitiendo el escape de la clula. Esta hiptesis es sugestiva pero no hay ejemplos claros.

3. Hiptesis Regresiva: los virus han descendido de bacterias libres (no parsitas) que perdieron sus funciones, DNA y las estructuras asociadas. Esta hiptesis no explica los virus con caractersticas no bacterianas.

Bacteria

Virus

Es probable que las tres hiptesis expliquen el origen de algn virus.

Origen de algunos virus y anlisis filogenticos

Virus de RNA: - origen primordial?

- grupo monofiltico?
- analisis con RNA polimerasa

Virus de DNA: - grupo heterogneo - dsDNA o ssDNA - mltiples orgenes - hiptesis del escape de transcriptos?

Origen de algunos virus y anlisis filogenticos

RT virus: - nico origen? - escape de elementos genmicos con RT de una clula? - analisis con transcriptasa reversa de virus + telomerasas + transposones: nico origen.

Viroides
Descubiertos en 1960, en papas infectadas. Pequeas molculas de ssRNA circular. Genoma: 246-375 nt. No codifica para protenas. Secuencias muy similares: ancestro comn. Estado extracelular: RNA desnudo, estable. Penetra la planta por heridas o mediante insectos. Se replica en el ncleo o cloroplasto de la clula utilizando su maquinaria, ya que forma estructura ~dsDNA. La clula forma estructuras multimricas y el mismo RNA actuando como ribozima, corta el RNA liberando mltiples viroides. Responsables de enfermedades en plantas nicamente. Pueden interferir en la regulacin por RNA pequeos de la planta.

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Viroides afectando a papas (alargadas)

TEM de un viroide de papa.

Priones
Forma extracelular: protenas.

(proteinaceous-infective particle)

Constituido nicamente por protena, sin cidos nucleicos. Responsable de la enfermedad de la vaca loca.
Enfermedad de Kuru o de la risa: - transmitida en una tribu de Nueva Guinea. - Consumian los cerebros de personas fallecidas.

Se propaga transmitiendo una alteracin en el plegamiento de la protena. El contacto prion-protena, induce alteracin del plegamiento y cambio en la funcin. Las protenas alteradas son altamente estables.

No se desnaturalizan - dificil eliminarlas.

Priones son resistentes a radiacin, temperatura y proteasas. Se pueden destruir con lavandina (hidrolisis)

Priones
Quin las codifica? Protenas similares estn codificadas en el cromosoma del hospedador pero con distinto plegamiento. Se conocen enfermedades por priones en animales nicamente.

Las enfermedades por priones se las llaman encefalopatas

espongiformes transmisibles. Las enfermedades por priones ocurren de 3 formas:

- enfermedad infecciosa por priones: por infeccin, ya que los priones se transmiten entre animales, ej. Ingestin
- enfermedad por priones espordicos: plegamiento anormal al azar en moleculas de un individuo sano y normal. - enfermedad hereditaria por priones: una mutacin en un gen de una protena induce a la protena a plegamietos anormales de forma frecuente. Microbiologyplace: movies

Preguntas:
1- Cree que los priones son organismos vivos? Por qu no? Por qu si? 2- Y los viroides? 3- Si los virus son polifilticos, por qu todos poseen una cpside para sobrevivir extracelularmente?

Varicela = chicken pox Measles = sarampion Mumps = paperas Rubiola = rubella

Cronograma

Segundo Parcial 16 de noviembre