UNIVERSIDAD DEL QUINDO FACULTAD DE CIENCIAS BSICAS Y TECNOLOGAS PROGRAMA DE QUMICA

LOS VIRUS
trocitos de herencia buscando un cromosoma

CLARA MARA MEJA DORIA. QCA; M.SC.

I-2014

A BRIEF HISTORY OF VIROLOGY

1898 1880 Germ Theory 100BC China Robert Koch & Louis Pasteur Pasteur identified rabies to be cause by an agent he termed virus from the Latin for poison. Martinus Beijerinick work on TMV Freidrich Loeffler & Paul Frosch work on foot-and-mouth disease in cattle 1915-1917 Bacteriophages (eaters of bacteria)Frederick Twort & Felix dHerelle discovered viruses which infect bacteria.

Protection from smallpox using variolation practice

~1400BC First written record of virus infections in heiroglyphics found in Memphis, Eygpt

1796 - Vaccination Edward Jenner vaccinated a boy with cowpox-infected material

1892 beginning of virology Dmitri Iwanowski showed that ceramic filtered extracts from diseased plants could transmit disease to other plants.

1909 Landsteiner & Popper Poliomyelitis (Yellow Fever) was the first human disease to be recognized as a viral disease

1950-2003 Discoveries of Ebola, West Nile, HIV, SARS

DEFINICIN

Son agentes subcelulares (elemento gentico) parsitos obligados, que poseen una informacin gentica compuesta de ADN o ARN encerrado en una cubierta proteica, los cuales utilizan la maquinaria de la clula hospedero para replicarse y producir mas partculas virales.
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GENERALIDADES
Acelulares. Parsitos intracelulares obligados. No poseen organelos. No producen ATP. Son agentes infecciosos.

TAMAO
Solo pueden ser observados a travs de microscopios electrnicos por ser partculas submicroscpicas. Su tamao es de m (0.03-0.3 m).
atom proteins bacteria animal cells

viruses

0m
10-6 m 10-7 m 10-8 m 10-9 m 10-10 m

10-5 m

Go five more feet!

THE SIZE AND MORPHOLOGY OF SELECTED VIRUSES

CLASIFICACIN DE LOS VIRUS

- Por la clula que parasitan: Virus animales, vegetales o bacterifagos. - Por su forma: Helicoidales, polidricos o complejos. - Por tener o no envolturas: Virus envueltos o desnudos. - Por su cido nucleico: ADNmc; ADNbc; ARNmc o ARNbc.

ESTRUCTURA

Cpside Cubierta Envoltura (algunos virus) Partcula viral cido nucleico (ADN or ARN)

Ncleo Varias protenas (enzimas)

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ENVOLTURA VIRAL
Capa de fosfolpidos y protenas. Externa a la cpside. Lpidos: tomados de la membrana de la clula hospedero. Protenas: provenientes del virus y algunas de la clula hospedero.

No todos los virus poseen envoltura.

Virus sin envoltura = virus desnudos.
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CPSIDE
Cubierta proteica que protege el genoma. Se encuentra en todos los virus. Formada por mltiples repeticiones de polipptidos llamados capsmeros. Reduce la necesidad de informacin gentica. No requiere ATP para el ensamblaje. Adquiere diferentes formas geomtricas: helicoidal e icosadrica.

Cpside + cido nucleico = nucleocpside.

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CPSIDES

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CPSIDE HELICOIDE O CILNDRICA

Tobacco mosaic virus structure. Y Tambe, 2005

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CPSIDE ICOSADRICA

Adenovirus structure. Y Tambe, 2006; Milan Nermut (NIBSC), 2007

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CPSIDE COMPLEJA
Parasitan bacterias: bacterifagos (o fagos)

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Bacterifago T4. C Gonzales, 2012

CPSIDES
RNA Capsomere DNA Membranous envelope RNA Head DNA Tail sheath Tail fiber Glycoproteins 80200 nm (diameter) 80 225 nm 7090 nm (diameter) Capsid

Capsomere of capsid Glycoprotein 18 250 nm

20 nm (a) Tobacco mosaic virus

50 nm (b) Adenoviruses

50 nm (c) Influenza viruses

50 nm (d) Bacteriophage T4

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Formas de la cpside. Campbell & Reece, 2007

NCLEO O CORE
Posee el cido nucleico + algunas protenas (nucleoprotenas).
Double stranded DNA Single stranded DNA Double stranded RNA Single stranded RNA

CIDO NUCLEICO

ADN o ARN, No ambos. Puede ser lineal o circular. Genoma de pequeo tamao: de 4Kb a 200 Kb. Genoma viral: informacin bsica, envoltura, cpside y core y algunas enzimas. Lo dems lo utilizan de la clula hospedera. 16

TIPOS DE GENOMA VIRAL

Los virus pueden poseer como genoma:
1. Doble cadena de ADN. 2. Cadena sencilla de ADN. 3. Doble cadena de ARN. 4. Cadena sencilla de ARN: polaridad + y Los virus de ARN producen mayor tasa de mutacin debido a que el ARN es menos estable que el ADN y la ARN polimerasa produce mas errores en la duplicacin.
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CLASIFICACIN DE LOS VIRUS DE ACUERDO CON SU GENOMA

ADN CADENA SENCILLA Genoma Parvovirus Circovirus

ADN CADENA DOBLE Herpes virus Varicellovirus o culebrilla

ARN DOBLE CADENA

ARN CADENA SENCILLA +

ARN CADENA SENCILLA Filovirus (bola) Pneumovirus: (neumona viral)

ARN TRANSCRIPTA SA REVERSA

Aquavirna Virus (peces)

Avibirna Virus (aves)

Flavivirus (dengue)
Rhinovirus (resfriado)

Lentivirus ( HIV)

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NUCLEOPROTENAS
Funcin: Estabilizan el cido nucleico durante la replicacin. Enzimas: Ej. la transcriptasa reversa o ARN polimerasa, lisozimas y neuraminidasas.

Crystal structure of BNP. Andy Ka-Leung Ng, et al. 2012

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Asfarviridae. Cornelia Bchen-Osmond ICTVdB, 2010

REPLICACIN VIRAL
1. Adherencia de los virus a la clula hospedero.
2. Penetracin dentro de la clula. 3. Desnudamiento: liberacin del material gentico. 4. Expresin de genes virales. 5. Produccin de componentes del virus: protenas y material gentico.

6. Ensamblaje de los nuevos virus.

7. Liberacin de los nuevos virus al exterior de la clula.
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CICLO REPRODUCTIVO DE LOS VIRU

Adsorcin: Es la unin entre la cpside viral de protenas y los receptores especficos en la superficie celular del husped. Penetracin: La forma en la que el virus entra en la clula husped vara dependiendo de la especie: La endocitosis, fusin de la membrana plasmtica con la envoltura del virus. La penetracin directa se observa slo en los virus sin envoltura. Inyectar directamente el genoma en la clula husped. Liberacin: Los virus sin envoltura se acumulan por algn tiempo en la clula hasta que sta se rompe (lisis). Los virus con envoltura suelen ser liberados por gemacin, proceso durante el cual el virus adquiere su envoltura de fosfolpidos en la que se insertan las glicoprotenas virales. Ensamblaje: En esta etapa se forma la cpside viral y se asocia con el genoma viral.

Desnudamiento: Es el proceso por el cual el cido nucleico del virus es liberado dentro de la clula. Puede ocurrir simultneamente o poco despus de la penetracin.

Multiplicacin: oLa transcripcin es la sntesis de ARN mensajero (ARNm) a partir del genoma del virus. oLa traduccin es la sntesis, en los ribosomas del husped, de las protenas virales. oDurante la replicacin se obtienen las copias del genoma viral.
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BACTERIFAGOS

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1. En el ciclo ltico el ADN bacteriano fabrica las protenas vricas y copias de cidos nucleicos vricos. Cuando hay suficiente cantidad de estas molculas, se produce el ensamblaje de la protena y el A.N. vrico y se liberan al medio, produciendo la muerte de la clula.

2. En el ciclo lisognico se produce cuando el genoma del virus queda integrado en el genoma de la bacteria, no expresa sus genes y se replica junto al de la bacteria. El virus queda en forma de profago.
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Figure 19.5-5

1 Attachment

2 Entry of phage DNA and degradation of host DNA

5 Release Phage assembly

4 Assembly Head

Tail

Tail fibers

3 Synthesis of viral genomes and proteins

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Figure 19.6

Phage DNA

The phage injects its DNA.

Daughter cell with prophage Cell divisions produce a population of bacteria infected with the prophage. Occasionally, a prophage exits the bacterial chromosome, initiating a lytic cycle.

Phage Bacterial chromosome

Phage DNA circularizes.

Lytic cycle

Lysogenic cycle Certain factors determine whether The bacterium reproduces, copying the prophage and transmitting it to daughter cells.

The cell lyses, releasing phages.

lytic cycle is induced

or

lysogenic cycle is entered

Prophage

New phage DNA and proteins are synthesized and assembled into phages.

Phage DNA integrates into the bacterial chromosome, becoming a prophage.

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Figure 19.6a

Phage DNA

The phage injects its DNA.

Phage Bacterial chromosome

Phage DNA circularizes.

Lytic cycle The cell lyses, releasing phages. Certain factors determine whether lytic cycle or lysogenic cycle is entered is induced

New phage DNA and proteins are synthesized and assembled into phages.

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Figure 19.6b

Daughter cell with prophage Cell divisions produce a population of bacteria infected with the prophage.
Occasionally, a prophage exits the bacterial chromosome, initiating a lytic cycle.

Phage DNA circularizes.

Lysogenic cycle Certain factors determine whether lytic cycle or lysogenic cycle Prophage is entered is induced The bacterium reproduces, copying the prophage and transmitting it to daughter cells.

Phage DNA integrates into the bacterial chromosome, becoming a prophage.

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TIPOS DE VIRUS SEGN LA CLULA QUE INFECTEN

Virus que infectan clulas animales Con envoltura lipoproteca: o ARN monocatenario como la rabia, el sarampin, la gripe y la rubola. o Los retrovirus contienen ARN monocatenario y la enzima transcriptasa inversa. Pertenecen a este grupo el virus del SIDA y algunos virus oncognicos. o Virus con ADN bicatenario como los herpesvridos: herpes, y de la hepatitis. Icosadricos sin envoltura lipoproteca: o El virus de la polio humana tiene monocatenario.

ARN

o ADN bicatenario como los adenovirus (causantes de enfermedades respiratorias) y los papilomavirus (de verrugas).

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Virus que infectan bacterias

1915 y 1917; pertenecen al grupo de los Caudovirales. Hay tambin bacterifagos que no responden al tipo comn, como los Corticoviridae, icosadricos, o los Leviviridae, con ARN monocatenario, o los bacterifagos con envoltura lipoproteca.

Virus que infectan clulas vegetales La mayor parte de ellos contienen ARN monocatenario y cpside helicoidal, y carecen de envoltura lipoproteca. En este grupo hay tambin virus con ADN y cpside icosadrica, como el del estriado del maz o el del mosaico de la coliflor.

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Comit Internacional de Taxonoma de los Virus (ICTV en ingls) ha ido perfeccionando progresivamente. En 1966 se form dicho comit, que desarrollo un sistema taxonmico universal para unificar la nomenclatura y clasificacin de los virus.
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FAMILIA

CLASIFICACIN TAXONMICA DEL (ICTV)

ORDEN

SUBFAMILIA

GNERO

ESPECIE

96 EJEMPLO: Caudovirales Herpesviridae Alphaherpesvirina e Simplexvirus Human herpesvirus 1 22 420 2618

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CLASIFICACIN DE BALTIMORE
David Baltimore ganador del premio Nobel

Sistema para clasificar a los virus de acuerdo con

Descubrimiento de una enzima muy importante en los virus tumorales: la transcriptasa reversa

Tipo de cido nucleico

Mecanismo de replicacin
Los virus deben generar ssmRNA+ a partir de sus genomas con el fin de generar protenas y replicarse.

Este mecanismo difiere para cada familia de virus

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Baltimore dividi a los genomas en 7 grupos o clases.

VIRUS CLASSIFICATION

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TRANSMISIN VIRAL
Aerosoles (aergena). Contacto directo o indirecto (fomites).

Vectores: artrpodos.
Sangre. Contacto sexual: fluidos.
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ACCIN DE LOS AGENTES FSICO Y QUMICOS

Agentes qumicos 1. Solventes de lpidos: afectan slo a los virus envueltos. Compuestos orgnicos (ter, cloroformo) Detergentes inicos y no inicos 2. Desinfectantes Formaldehdo, cido clorhdrico e hipoclorito sdico se usan para descontaminar materiales. 3. Colorantes vitales Rojo neutro y naranja de acridina se unen al cido nucleico y el virus.
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ACCIN DE LOS AGENTES FSICOS Y QUMICOS

Agentes fsicos
1. Temperatura: 55-60C 37C 20C 4C -70C segundos minutos horas das meses o aos

2. Radiaciones: virus monocatenarios ms sensibles que los bicatenarios.

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TIPOS DE INFECCIN VIRAL

1. Localizada 2. Diseminada 3. Inaparente

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TIPOS DE INFECCIN VIRAL

Localizada: multiplicacin viral y dao celular en la puerta de entrada.

Ej. Influenza; infeccin respiratoria Ej: Rotavirus; infeccin gastrointestinal

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TIPOS DE INFECCIN VIRAL

Diseminada: Entrada y multiplicacin local Multiplicacin en ganglios linfticos regionales Viremia primaria Diseminacin a hgado y bazo (con multiplicacin y necrosis) Viremia secundaria

rgano blanco (Ej: Varicela zoster)

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TIPOS DE INFECCIN VIRAL

Inaparente Sin sintomatologa Muy comn y epdemiolgicamente muy importante (fuente de infeccin) Confiere inmunidad. Ej: dengue.

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Los virus pueden ser eliminados o no tras infecciones aguda. Las interacciones prologadas virus-husped toman varias formas:

Infeccin latente Infeccin crnica

Infeccin lenta

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DIAGNSTICO DE LAS INFECCIONES VRICAS

1. Deteccin de las partculas vricas o alguno de sus componentes.

2. Cultivo de muestras en medios con clulas vivas.

3. Serologa.

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PREVENCIN Y TRATAMIENTO

1. Inmunizacin activa 2. Inmunizacin pasiva 3. Inmunomoduladores 4. Antivricos

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TECHNIQUES TO STUDY VIRUSES

X-ray Crytallography

X-rays are directed at a sample. How those rays scatter can be used to determine the structure of that sample

Atomic Force Microscope A tiny tip

probes a surface, from which the shape of the surface can be determined
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Sedimentary Centrifugation A sample

is spun so fast, different elements in it are separated by density.

Filters Very small

holes in material filter only viruses through.

Electron Microscope
Electrons are smaller than light wavelengths, so viruses can be seen by reflecting electrons off of them

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VIRUSES CAN HELP CELLS, TOO

- Since viruses can transport DNA and RNA into cells, scientists are exploring Gene Therapy. - In Gene Therapy, viral genetic material is replaced with new DNA. - In time, this could be used to cure genetic diseases. Currently we have no cure for these types of illnesses.
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