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UNIVERSIDAD DE SONORA

DEPARTAMENTO DE CIENCIAS BIOLGICAS Y DE


LA SALUD
PROGRAMA DE MAESTRA EN CIENCIAS DE LA
SALUD
Bioenergtica Y
Enzimas
Asignatura:
Bioqumica
Acadmico:
Dra. Maria del Carmen Candia Plata

Hermosillo, Sonora, Septiembre de 2014

BIOENERGTICA

Fuentesdeenerga

RutasMetablicas

TERMODINMICA
Lastransformaciones
biolgicasdeenerga
obedecenlasleyesdela
termodinmica

EnergalibredeGibbsG

Entalpa,H

Entropa,S

Equilibrio Qumico
Lasreaccionesqumicastambintiendenal
equilibrio,steseestablececuandolas
velocidadesdelasreaccionesdirectaeinversa
soniguales
A+BC+D

Reaccindirecta
Reaccininversa
Lasclulasprecisanunafuentedeenergalibre

Keq[C][D]
[A][B]

Lavariacindeenergalibrerealdependedelas
concentracionesdereactivosyproductos

Constante de equilibrio Keq

Eslaraznqueseestableceentrela
concentracindelosreactivosydelos
productosenelequilibrio
Keq=K1/K2=[C][D]/[A][B]
Lasdosreaccionesocurrenaigual
velocidad
K1[A][B]=K2[C][D]

C6H12O6+6O2

6CO2+6H2O

Mecanismos para el
intercambio de Energa en los
Sistemas Vivos
Reaccionesdeoxidoreduccin
Reaccionesqueformanorompenenlacescarbonocarbono
Reordenamientointernos,isomerizacionesyeliminaciones
Reaccionesdetransferenciadegrupo
Reaccionesderadicaleslibres

El metabolismo es una red de rutas con reacciones acopladas


El catabolismo obtiene energa, el anabolismo la usa

Reaccionesdeoxidoreduccin

LasoxidacionesadicindeO,prdidadeHo
porotrareaccinqueresulteenlaprdidade
electrones.

ReaccionesRedOx

Reaccionesdeoxidacinreduccinbiolgicas

OxidoReduccindeNAD+

OxidoReduccindelFAD

Reaccionesqueformanorompenenlacescarbonocarbono

Propiedadesqumicas
degruposcarbonilo

Reaccionesdetransferenciadegrupo
Degruposacilo,glucosiloyfosforilodesdeunnucleofilo.

Ortofosfatoinorgnico

Transferenciadegruposfosforilo
yATP

Transferencia de
grupo Fosfato
Fosfato de alta
energa
ATP
Adenosn Trifosfato
libera energa

ADP
Adenosn Difosfato

HidrolisisdeenlacesFosfoanhdrido

Hidrolisisdel1,3bifosfoglicerato

TransferenciadeGruposAcilo

ReaccionesdeSustitucinNucleoflica

TautomerizacinyResonancia

Luciferasa

Hidrolisisdecompuestosfosforilados

HidrolisisdeATP

Reaccionesde
desplazamiento
Nucleoflicodel
ATP

Reaccionesderadicaleslibres

ENZIMAS

Informacin
Informacin
Gentica
Gentica

Vida
Vida
Catlisis
Catlisis
eficiente
eficiente
y
y
selectiva
selectiva

Lossistemasbiolgicosconsumenunagrancantidaddeenergadelmedio
ambiente.Sonsistemasconunflujoconstantedemateriayenerga.

Lasenzimasnoafectanelequilibriodelareaccin,
Lasenzimasnoafectanelequilibriodelareaccin,
solaaumentanlavelocidaddelamisma.
solaaumentanlavelocidaddelamisma.
Extremadamenteselectivasdebidoala
Extremadamenteselectivasdebidoala
estereoqumicaylasinteraccionesnocovalentes.
estereoqumicaylasinteraccionesnocovalentes.
Centrodelosprocesosbioqumicos.
Centrodelosprocesosbioqumicos.
Catalizanladegradacindelosnutrientes.
Catalizanladegradacindelosnutrientes.
Conservanytransformanlaenergaqumica.
Conservanytransformanlaenergaqumica.

RuBisCo

Sntesisdemacromolculasapartirde
Sntesisdemacromolculasapartirde
precursoressimples.
precursoressimples.
Actividadcoordinadayagrupadaenvasmetablicas.
Actividadcoordinadayagrupadaenvasmetablicas.

EnzimasenlaEnfermedad
Actividad
Actividad
deficiente
deficiente

Enfermedad
Enfermedad
Exceso
Exceso
de
de
actividad
actividad

Actividad
Actividad
ausente
ausente

Lamedicindelaactivadenzimticaesdeutilidadeneldiagnsticoymonitoreodeciertasenfermedades.

SigloXIX
Hidrlisisde
almidnhasta
azcarporla
SigloXVIII saliva.
Sereconoce
laactividad
enzimtica.

En1850Pasteur
azucaren
alcoholmediante
losfermentos.

En1897E.
Buchnerlos
fermentos
conservanla
actividadalser
removidosdela
clula.

Northropy
Kunitz
agregaron
pesoala
1926J.
teoras,
Sumnersaisl cristalizando
ycaracteriz otrasalgunas
laUreasa,
enzimas
todaslas

FrederickW.
Khnedioel
trminode
ENZIMAS.

Haldane,
proponeque
las
interacciones
entreSyE
son
responsables
dela
actividad.

MayoradelasEnzimassonProtenas
ACTIVIDADCATALTICA
Conformacinnativa,sepierdealser
desnaturalizado.
SUSTENTODELAACTIVIDAD
Estructuraprimaria,secundaria,terciariay
cuaternaria.

Algunasenzimasrequierengruposqumicos
adicionales.

Cofactores

Coenzimas

Enzimacompleta
Enzimacompleta
HOLOENZIMA Catalticamenteactiva.
HOLOENZIMA
Catalticamenteactiva.
Grupoprosttico
Grupoprosttico

APOENZIMA
APOENZIMA

Cadenapolipetdicadela
Cadenapolipetdicadela
enzima
enzima
Diversassubunidades
Diversassubunidades

ClasificacindelasEnzimas

CmoTrabajanlasEnzimas?
Encondicionesbiolgicas:
Lasreaccionestiendenaserlentas.
Nosonfavorablesdesdeelpuntodevista
energtico.

CmoTrabajanlasEnzimas?
Lainteraccinentrelaenzimayelsustratosedaen
unpocketllamadositioactivo.
Enelsitioactivo,elsustratoseencuentraaisladodel
medio.
Lascondicionesqumicadelsitioactivo(GruposR,
gruposprostticos)promuevenlareaccin.

DiagramadeReaccin

ReaccinCatalizadaynoCatalizada

RelacinEntreelEquilibrioyelG

EnergadeEnlaceenlaCatlisis

Entropa

Vel.Derx.

CinticaEnzimtica
Conocerlaestructuratridimensional.
Conocerlaestructuratridimensional.
Efectodelamutacinenlafuncin.
Efectodelamutacinenlafuncin.

Bioqumicos

Determinarvelocidaddereaccin.
Determinarvelocidaddereaccin.
CinticaEnzimtica.
CinticaEnzimtica.
Entendimientodelmecanismodeaccin.
Entendimientodelmecanismodeaccin.

VelocidaddeReaccin
Enfuncindelaconcentracindesustrato[S].
LaformacindelcomplejoESesrpido.
k1

E+SES
k-1

LadescomposicindeESenE+Pesmaslento.
k2

ESE+P

ClculodeV0
V0esdeterminadaporelrompimientodeESparaformarE+P.

EfectodelaConcentracindel
SustratoenlaVdeRx

Ecuacinde
MichaelisMenten

DeterminacindeyV

max

ConstantedeAfinidad

Cuando es limitante de la velocidad de reaccin, se convierte en la


constantededisociacinconvirtindoseenunamedidadelaafinidad
delaenzimaporsusustrato.

EficienciasCataltica
Cuandounareaccincatalizadaconsisteenvariospasos,lavelocidad
dereaccineslimitadaporlaconstantedeestaetapa().
serefierealacantidaddemolculasdeSconvertidasenPporuna
solamolculadeenzimaenuntiempodeterminado.

ConstantedeEspecificidad
EslaconstantedevelocidadparalaconversindeE+SenE+P
cuandola[S]<<.

MecanismodeunaRxCatalizadapor
EnzimascondosSustratos

FormacindeComplejosTernarios

VadeDobleDesplazamiento

InhibicinEnzimtica
Inhibidor: agente qumico que interfiere con la actividad
Inhibidor: agente qumico que interfiere con la actividad
cataltica, realentndola o incluso destruyndola. Son los mas
cataltica, realentndola o incluso destruyndola. Son los mas
importantesfrmacos.
importantesfrmacos.
Representanunodelosmayoresavancesenfarmacutica.
Hanpermitidodefinirnumerosasvasmetablicas.
Inhibicinreversibleeirreversible.ereconocimientode:

InhibicinReversible

FormacindelcomplejoESbloqueadaporunindelinhibidoralsitio
activo.

InhibicinReversible

ElinhibidorseunealcomplejoESenunsitiodistintoalsitioactivo,
impidiendolacatlisis.

InhibicinReversible

Lainhibicinpuededarseporcualquieradelosdosmecanismos
anteriores.

InhibicinIrreversible

Diisopropilfluorofosfato
Inhibicinirreversibledelaquimotripsina.ElDIFPseunealresiduo
deSer195queseencuentraenelsitioactivodelaenzima.

LaActividaddeunaEnzimaDepende
delpH

ReaccionesEnzimticas
La comprensin del mecanismo de accin de una enzima requiere
La comprensin del mecanismo de accin de una enzima requiere
conocimientode:
conocimientode:
La secuencia temporal en la que se producen los intermedios de
reaccinunidosalenzima.
Laestructuradecadaintermedioydecadaestadodetransicin.
Lasvelocidadesdeinterconversinentrelosintermedios.
Larelacinestructuraldelenzimaconcadaintermedio.
Las contribuciones energticas de todos los grupos reactivos e
interaccionantes con respecto a los complejos intermedios y a los
estadosdetransicin.

MecanismodelaQuimotripsina
Esunaproteasa.
Acta especficamente sobre los enlaces
peptdicos adyacentes a residuos de
aminocidosaromticos(Trp,Phe,Tyr).

MecanismodelaHexoquinasa

MecanismodelaEnolasa
Cataliza la deshidratacin reversible del 2fosfoglicerato a
fosfoenolpiruvato.

MecanismodelaLisozima

Mecanismosenzimticosy
lamedicina

Reaccindela
Transpeptidasa

Inhibicindela
transpeptidasapor
antibiticoslactmicos

Lactamasaeinhibicindela
lactamasa

Mecanismosenzimticosylamedicina

MecanismodeaccindelaproteasadelVIH

Inhibidoresdelaproteasade
VIH

Enzimasreguladoras

Enzimasreguladoras

LasEnzimasAlostricasExperimentan
CambiosdeConformacin

Inhibicinpor
retroalimentacin

Regulacinpormodificacincovalente
reversible

Losgruposfosforiloafectanlaestructuraylaactividad
catalticadelasenzimas

Zimgenos

Bibliografa
Bioqumica,ChristopherK.Mathews,3
ed.,EditorialPearsonEducation,2002.
PrincipiosdeBioqumica,DavidL.
NelsonyMichaelM.Cox,3ery4taed.,
EditorialOmega,2006.
http://laguna.fmedic.unam.mx/evazquez/04
03/bioenergetica.html
http://pslc.ws/spanish/radical.htm

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