Structures tridimensionnelles des

protines
1. Les protines globulaires
2. Les protines fibreuses
A. La kratine - Une hlice d'hlices
B. Le collagne - Un cble trois hlices

Les protines globulaires peuvent avoir un rle structural

(par exemple la tubuline constituant les microtubules, ou
l'actine G dans les microfilaments d'actine).
Cependant, l'oppos des protines fibreuses dont le rle
se limite une fonction structurelle, les protines globulaires
peuvent se comporter comme :
Enzymes, par catalyse de ractions organiques se droulant
dans l'organisme
par transmission de messages pour rgler des processus
biologiques. Cette fonction est assume par des hormones,
par exemple l'insuline etc.

L'hmoglobine, un membre de la famille des globines.

Les immunoglobulines (IgA, IgD, IgE, IgG and IgM) et les
alpha-, beta- et gamma-globulines.
Quasi toutes les enzymes aux fonctions
mtaboliques majeures ont une forme globulaire
.

2 LES PROTEINES FIBREUSES

Les protines fibreuses sont des molcules insolubles,
trs allonges dont les structures secondaires sont
les motifs structuraux dominants
Beaucoup de protines fibreuses, comme celles de la
peau, des tendons et des os servent de matriel
structural jouant un rle de protection, de connexion
ou de soutien
D'autres, les protines musculaires et ciliaires, ont
des fonctions motrices, par exemple la myosine des
muscles squelettiques, muscles lisses et muscles
cardiaques

A. La kratine - une hlice d'hlices

On distingue les kratines , que l'on trouve chez les
mammifres, et les kratines chez les oiseaux et les
reptiles. Les kratines (> 30 gnes chez les mammifres)
appartiennent des familles de protines relativement acides
(Types I) ou relativement basiques (Type II)

Protine fibreuse : kratine (cheveux, ongles, cornes)

Sous-units = hlices presque de bout en bout ( 310 acides amins)
Dimres = 2 sous-units enroules en super-hlice de pas gauche
Protofilaments
Microfibrille
Macrofibrille
Liaisons disulfure linterface des protofilaments et microfibrilles
(rigidit)
Maladies hrditaires - par exemple anomalies de squence dans la
kratine 14 ou dans la kratine 5 qui altrent l'intgrit de la peau

Dimreprotofilamentmicrofibrillemacrofibrille cheveu

B. Le collagne- un cable trois hlices

On trouve du collagne chez tous les animaux pluricellulaires.
C'est une protine extracellulaire organise en fibres
insolubles trs rsistantes la tension
De nombreux types diffrents (une vingtaine)
Prsentes dans les os, le tissu conjonctif, les membranes
basales, les dents, les cartilages, les tendons, les ligaments,
les matrices fibreuses de la peau et des vaisseaux sanguins
I : peau, os tendon, corne, vaisseaux sanguins
2 sous-units 1 (type I)
1 sous-unit 2 (type I)
II : cartilage, disques intervertbraux
3 sous-units 1 (type II)
III: vaisseaux sanguins, peau ftale
3 sous-units 1 (type III)

a. Le collagne a une structure en triple hlice

Molcule de collagne :
Btonnet de 300 nm x 1,5 nm
Trois chanes = "chanes " hlice ;
- hlices pas gauche
- 3 rsidus par tour de spire
- pas = 0,94 nm; incrment = 0,31 nm
- comportant un motif rptitif Gly-X-Y
X = souvent Pro; Y = souvent Pro ou 4- ou 3-hydroxyproline
ou 5-hydroxylysine

Torsades en une "superhlice" pas droit

trois chanes dcales d1/3 tour de spire
Gly occupant le centre
liaisons hydrogne entre chanes
Aux extrmits = lments non hlicodaux intervenant
pour guider lassemblage

Le collagne a une composition en acides amins particulire.

Prs d'un tiers des rsidus sont des Gly; en outre entre 15 et
30% des rsidus sont Pro et Hyp (4-hydroxyproline). On
trouve galement la 3-hydroxyproline et la 5-hydroxylysine
(Hyl).

Les rsidus hydroxyls sont

sont forms aprs la
synthse du collagne quand
certains rsidus Pro sont
transforms en Hyp par la
prolyl hydroxylase.
L'Hyp stabilise le collagne
par intermdiare de liaisons
hydrogne
intramolculaires.
La prolyl hydroxylase
ncessite de l'acide
ascorbique (vitamine C)

Dans le scorbut, maladie due une

dficience en vitamine C, le collagne ne
peut former des fibres correctement ce
qui entrane des lsions de la peau, une
fragilit des vaisseaux sanguins, et des
cicatrisations laborieuses

. Le collagne a une
structure en triple hlice
La squence est une rptition
de triplets Gly-X-Y sur une
longueur de 1011 rsidus sur
1042 rsidus. X est souvent
Pro et Y est souvent Hyp.

Dans la structure, chaque 3me rsidu de chaque chane

polypeptidique passe au centre de la triple hlice, qui se
trouve si encombr que seule la Gly peut occuper cette
position:

Le N-H de chaque Gly tablit une liaison hydrogne forte avec l'oxygne
du carbonyl de d'un rsidu X (pro) d'une chane voisine. Ces liaisons
hydrogne intercatnaires contribuent la stabilisation de la structure

b. Le collagne est organis

en fibrilles
L'aspect stri en microscopie
lectronique provient de
l'arrangement dcal des
molcules de collagne:

Modifications post-traductionnelles du collagne

-

Hydroxylation
- de rsidus proline en 3 et 4 hydroxyprolines (prolyl hydroxylase)
- de rsidus lysine en 5 hydroxylysine
stabilisent le collagne
= ractions se droulant dans le rticulum endoplasmique
dpendantes de la vitamine C
Dficience en vitamine C = scorbutisme
Fragilit capillaire, gingivite, hmorragies sous-priostes

Conversion de lysine en allysine et pontage entre molcules

Glycosylation de rsidus hydroxylysine (glucose, galactose)

c. Les fibrilles de collagne

sont rticules par liaisons
covalentes
La lysyl oxydase transforme
les rsidus Lys en allysine.
Deux aldhydes subissent une
condensation aldolique pour
donner l'aldol allysine. Ce
produit peut ragir avec l'His
d'une autre chane
polypeptidique pour donner
l'aldol His qui son tour peut
rgir avec la 5-OHLys d'une
autre chane et ainsi, par
ractions croises, runir 4
chane latrales

Collagne
Stabilisation
- abondance de Pro et de Hydroxyproline
(polyproline forme spontanment hlice de pas gauche avec
incrment de 0,31 nm et pas de 0,94 nm)
- pont hydrogne (entre gly et pro ou hydroxyproline)
- pontage intermolculaire
- glycosylation

Biosynthse du collagne.

Chanes polypeptidique
Procollagne
- Peptides d'extension
- Tlopeptides
Tropocollagne

Pont pyridinoline

Fibrille de collagne

d. Des anomalies du collagne sont l'origine

de plusieurs maladies chez l'homme
- ostogense imparfaite (mutations dans une des
chanes du collagne de type I ou de type III). Par
exemple, le remplacement de la Gly centrale par Ala
entrane une distortion de la triple hlice et diminue sa
temprature de dnaturation de 62C 29C