MICROBIOLOGIE

Morfologie
Microbiology
Organizarea celulei procariote
Prokaryotic cell organization
Fototrofie
Morphology
Chemotrofie
Phototrophy and chemotrophy

 trei domenii ale lumii vii:

Eukaria

Bacteria

Archaea

Procariote
caracteristica definitorie: lipsa membranei nucleare
rspndirea: peste tot

MORFOLOGIA BACTERIILOR
studiaz forma i dimensiunile bacteriilor

n general, recunoscute 3 forme bacteriene majore:

1 - sferice

2 - cilindrice

3 - spiralate

1. Bacteriile sferice = cocii

micrococ

diplococ

streptococ
tetrada

stafilococ

sarcina

2. Bacteriile cilindrice = bacilii = bastonaele

streptobacili

diplobacili

3. Bacteriile spiralate
vibrionul

spirilul: perete celular rigid

spirocheta: perete celular flexibil

Alte forme:

Pedunculate

Filamentoase

Trihoame

= structuri pluricelulare

stelate
aranjamente celulare rare

Dimensiunile bacteriilor
de ordinul micrometrilor

vizibile doar la microscop

trihom de
Oscillatoria
(cianobacterie)

 cele mai mici: micoplasmele:

~0,250 m
cele mai mari: 10-20 m
specii uriae:

Epulopiscium fishelsoni:
~50/500 m

 cea mai mare bacterie: Thiomargarita namibiensis

Diametrul:

100-300 m

750 m

EUCARIOTE

ORGANIZAREA CELULEI PROCARIOTE

Pil de
sex (F)
Fim
brii

Celul
receptoare de
material genetic
n conjugare (F)

Celul donatoare
de material
genetic n
conjugare (F+)

PROCARIOTE

 membran
citoplasm nvelit de:

perete celular
capsul

la exterior se pot ntni:

flageli
pili

n citoplasm se ntlnesc:
elemente genetice
rhapidosomi
magnetosomi

ribosomi
incluzii

mezosomi
vacuole
vacuole cu gaz

sisteme membranare fotosintetice

(la bacteriile fototrofe)

 procariotele nu au:
mitocondrii
cloroplaste
reticul endoplasmic
aparat Golgi
lizosomi

GENOMUL BACTERIAN
este reprezentat de:
cromosom: conine toate genele eseniale
elemente genetice accesorii = extracromosomale
1 - plasmide
2 - elemente genetice transpozabile
3 - gene ale bacteriofagilor integrate n cromosom

 la marea majoritate a speciilor procariote

cromosomul este unic, constituit dintr-o molecul
dublucatenar de ADN circular nchis covalent:
CCC (circular covalently closed)

pn recent era considerat o dogm

 n ultimii ani aceast dogm a fost infirmat

Specia

Dimensiunea (Mb)

Numrul

Forma

Halobacterium sp. NRC1

2,57

circular

Nanoarchaeum equitans

0,5

circular

Mycoplasma genitalium

0,58

circular

Borrelia burgdorferi

0,91

liniar

circular

Escherichia coli

4,64

circular

Streptomyces coelicolor

8,66

liniar

Agrobacterium
tumefaciens

4,91

1 circular +
1 liniar

ARCHAEA

BACTERIA

Rhodobacter sphaeroides

RIBOSOMII
= organite la nivelul crora are loc sinteza proteinelor
un ribosom procariot are constanta
de sedimentare 70 S
la eucariote 80 S
fiecare particul ribosomal este
compus din dou subuniti:
subunitatea mic: 30 S
la eucariote 40 S
subunitatea mare: 50 S
la eucariote 60 S

 Schema unui ribosom procariot complet (70 S)

PERETELE CELULAR
peptidoglicanul
pc are dou structuri:
matrixul
n funcie de comportamentul bacteriilor fa
de coloraia dubl Gram:
bacterii Gram pozitive (Gr+): se coloreaz n violet
bacterii Gram negative (Gr): se coloreaz n rou

PEPTIDOGLICANUL
= componentul major al peretelui celular
= echivalentul celulozei din peretele celular vegetal
este o structur continu ce nvelete membrana
se ntlnete numai la bacterii
este compus dintr-un polizaharid i un peptid

 la Gr, de regul, peptidoglicanul se

prezint ntr-un singur strat, ca o plas
5-20% din greutatea peretelui celular; ~2-3 nm

 la Gr+ are structur tridimensional

mai multe straturi suprapuse
structur ca o reea, sac

rezisten
mai mare a
pc la Gr+

MATRIXUL = MATRICEA
la Gr+, componente caracteristice: acizii teichoici
Acizi
lipoteicoici

Acizi teicoici
parietali

Proteine asociate
peretelui celular
Acizi teicuronici

Peptidoglican

Membrana
plasmatic

 bacteriile Gr au la exteriorul peptidoglicanului o

membran parietal extern = strat
lipopolizaharidic (lipopolysaccharide layer) (LPS)
LPS

MEMBRANA CELULAR
Modelul mozaicului fluid

Mediu extracelular

Glicoprotein

Protein
transmembranar
globular

Glicolipid

Protein
globular
periferic

Mediu intracelular

Hopanoide

Protein
transmembranar
helical

Funciile membranei citoplasmatice

= barier de permeabilitate: nu permite trecerea

liber a substanelor ntr-o direcie sau alta

asigur metabolismul energetic al bacteriilor

lipsa mitocondriilor i cloroplastelor

 energia folosit de sistemele vii pentru

desfurarea activitilor vitale este
asigurat de reaciile de oxidoreducere
H2 2 e + 2 H+

O2 + 2e O2

Oxidarea H2

Reducerea O2

H2 + 1/2O2 H2O
Reacia complet de oxidoreducere

 datorit rolului important al dehidrogenrilor n reaciile

de oxidoreducere din toate sistemele biologice, donor,
respectiv acceptor de electroni sunt folosite ca
sinonime cu cele de donor, respectiv acceptor de H

se mai folosete termenul de echivalent reductor = H+/e

secvena de substane rspunztoare de transferul

echivalenilor reductori (H+/e) de la un substrat
mai redus la unul mai oxidat = lanul respirator =
sistemul transportor de electroni (ETS)

 ntr-un lan de reacii de oxidoreducere:

3 categorii de substane:
A donorul primar de electroni:

H2

compui
anorganici redui

compui
organici redui

B transportorii intermediari (ETS): i pot

schimba reversibil starea de oxidare/reducere

C acceptorul final de electroni:

O2 n respiraia aerob

un compus anorganic oxidat n respiraia anaerob

un compus organic n fermentaie

Potenialul de oxidoreducere (redox) Eh

= tendina unui compus chimic de a accepta sau
de a ceda electroni n reaciile de oxidoreducere
se exprim n voli
Turnul electronilor
= o ax pe care diferitele cupluri redox sunt aezate
n ordinea cresctoare a potenialului lor redox (Eh)

 forma redus a cuplului redox din vrful turnului

are cea mai mare tendin de a ceda electroni (H)
forma oxidat a cuplului de la baz are cea
mai mare tendin de a accepta electroni (H)
cuplurile redox situate la mijlocul turnului
electronilor pot accepta sau ceda electroni

cu ct este mai mare diferena de Eh (Eh) ntre dou

cupluri implicate, cu att mai mare este cantitatea de
energie eliberat n urma reaciei de oxidoreducere

 n mediile lor de via, diferite grupe

ecofiziologice de bacterii efectueaz reaciile
de oxidoreducere conform potenialelor redox:
Desulfovibrio: oxideaz H2 cu ajutorul SO42 (Eh = 0,2 V):
4H2 + H2SO4 H2S + 4H2O + 38 KJ/mol
Beggiatoa: oxideaz H2S cu ajutorul O2 (Eh = 1,04 V):
H2S + 2O2 H2SO4 + 200 KJ/mol

Fora protonmotrice (PMF Proton Motive Force)

n timpul transportului H+/e de-a lungul ETS, are
loc o acumularea H+ pe partea extern i a OH pe
partea intern a membranei
membrana devine energizat, ca o baterie
starea energizat a membranei
= fora protonmotrice (PMF)

ADP + PO4

PMF
ATP sintaz

ATP

ATP sintaza

NUTRIIA BACTERIILOR
= totalitatea proceselor prin care bacteriile ii asigur
din mediu necesitile energetice i plastice
Tipurile nutritive

Fototrofe

Chemotrofe

Donatori
exogeni de
electroni (H)

Sursa de
carbon

anorganici

CO2

organici

CO2

chemolitoautotrofe

anorganice

CO2

chemoorganoautotrofe

organice

CO2

anorganice

substane
organice

organice

substane
organice

fotolitoautotrofe
fotoorganoautotrofe

chemolitoheterotrofe
chemoorganoheterotrofe

Sursa de
energie

lumina

oxidarea
unor
substane

FOTOAUTOTROFIA
fotosinteza = procesul prin care organismele
care au clorofil transform energia radiaiei
luminoase n energie chimic
se desfoar n dou etape:
Etapa 1 se desfoar la lumin: energia
luminoas este captat i transformat n
energie chimic, stocat sub forma
legturilor macroergice (sinteza ATP)
Etapa 2 se poate desfura i la ntuneric:
are loc fixarea CO2 n molecule organice

Diferene ntre fotosinteza la plante i la procariote

1 ntre moleculele de clorofil
2 spectrul de absorbie a luminii: procariotele
absorb inclusiv n infrarou IR

3 plantele au dou fotosisteme I i II

fotosinteza se desfoar n prezena O2, donor

de H fiind apa, care este fotolizat, rezultnd O 2

4 cianobacteriile au ambele fotosisteme,

fotosintetizeaz i n prezena O2, dar pot
fotosintetiza i anaerob

5 celelalte procariote (fotobacterii tipice)

fotosintetizeaz numai n absena O2
nu folosesc apa drept donator de H, ci n
special compui redui ai sulfului (H2S)
n fotosintez nu produc O2
6 la plante clorofila se gsete n cloroplaste
bacterioclorofila i pigmenii accesori sunt
legai de sisteme membranare fotosintetice

 din punct de vedere funcional, sistemul

membranar fotosintetic cuprinde:
antena complex de pigmeni care
capteaz i dirijeaz fotonii spre
centrul de reacie locul unde energia
radiant este convertit n ATP, prin
intermediul forei protonmotrice
componentul cel mai important
al centrului de reacie
bacterioclorofila a

 Chromatium efectueaz fotosintez anaerob tipic:

Etapa I a fotosintezei:
Centrul de reacie = P870
n stare neexcitat are Eh = +0,5 V
slab donator de electroni
n stare excitat, ca urmare a captrii
fotonilor Eh = 1 V foarte puternic
donator de electroni

 electronii sunt transferai pe lanul transportor:

bacterioclorofila a
bacteriofeofitina
quinone
citocromul bc1
proteine Fe-S
citocromul c2

 bacterioclorofila a revine la stadiul iniial, Eh = +0,5 V

i este capabil s absoarb din nou cuante de
energie luminoas i s repete procesul
pe parcursul lanului transportor de electroni,
se genereaz for protonmotrice (PMF)
PMF genereaz ATP sub aciunea ATP sintazei
sinteza ATP pe aceast cale = fotofosforilare ciclic,
deoarece electronii se deplaseaz de-a lungul unui
circuit nchis

P870*
Bacteriofeofitin

ADP + PO4
Quinon A
ATP
sintaz

Schema transferului
de electroni n
timpul primei etape
a fotosintezei la
Chromatium

H+
H+
H+

For
protonmotrice
Quinon B

ATP
Citocrom bc1

Proteine Fe/S
Citocrom c2

P870
Radiaia
luminoas

Plantele i
cianobacteriile
(care au dou
fotosisteme)
realizeaz
fotofosforilare
neciclic

Schema Z

 Etapa II a fotosintezei fixarea CO2

exist mai multe ci biochimice pentru
fixarea CO2 n substane organice celulare
cea mai cunoscut cale:
Ciclul Calvin
enzima cheie: RubisCO face
legtura ntre organic i anorganic

OH
H C O P O
H
H
OHOH
C O

H C OH
H HC COHO P O+ CO2
OH
H C COHO OH C O
H HC CO OH
P H
O C OH
H OH
C OH
HH C OHOH

OH
H
OH
H C O P O
H OH OH H C OH P O OH
C OH
RubisCO
HOOC C OH OH
H C O P O
C O P O
CH OH
C O

C O
C OH OH
H C OH
OH
H C OH OH
H C OH
C POH
H C O
O
H C O P O
compus
OH
OH OH
C OH
OH
HH instabil
HH C OH

H C O H
P C
O O P O
acid
ribulozoOH
OH
H
H
1,5-bifosforic

H C O P O
OH
H

OH
H C O P O
OH
H

+H2O

OH
H C O P O
H C HOH OH

OH

COO

OH
O
P
OH

OH
OH
H C OH H
COOH
H C O P O
O P O
H C OH PC OH
O
acid 3-fosfogliceric (PGA)
H H OH
H + C OH OH H
C OH OH
OH
COOH
COOH H C O P O
COOH
OH

H C O P O
HOOC C OH OH
H
3-fosfogliceroC OOH
H C O P O
kinaza
H C OH OH
H C OH OH
H C O P O
+ATP
COOH
OH
H

PGA
+

COOH
H C OH

COOH
OH
+
O
acid 1,3COO COOH
P
OH
difosfoH C OH
H C OH OH
gliceric
H C O P OH
H C O
O P O
H
OH

Fosfoglicerinaldehiddehidrogenaza

OH

+ NADPH2

OH
H C O P O
OH
OH
OH
H H
OOH
O
O
H C O P
COOC P
H
PO
OH
3
4
OH
H C OH
H OH
C OH OH
H C
H C O P OH
H O
C PO OH
P O
H C
O
O
OH
H
OH
H HOH
OH
OH
O
O
H
H C O P
C 1,3-difosfo-glicerin-aldehid
3-fosfo-glicerin-aldehid
(GAP)
OH

H
H C
C
H C
H C

H
OH H
OH
OH H C OH
H C O P O
H C O P OH C
OH C O
O
C O
OH
C
C O fosforibulokinaza
OH H C OH
H C OH
C
H C OH
+ATP H C OH OHH C OH
OH HOHC OH
H C
H

OH
H C O P O
H C O P O
OH
H
OH
H

OH
H C O P O
H C O P OH C
OH
H
H
OH
H

acid ribulozo5-fosforic

acid ribulozo1,5-bifosforic
H

OH
H
OH
H C O P O
H C O P O
H C OH OH

OH
H C O P OH

OH

COOH

H C OH

OH

ecuaia general a fixrii CO2:

acid ribulozo-5-fosforic

CO2

2 molecule de 3-fosfo-glicerin-aldehid

Bacterii fotoautotrofe
cel mai bine studiate: bacteriile sulfuroase
folosesc donatori de H compui redui ai sulfului
fixeaz CO2 numai n condiii anaerobe

triesc la suprafaa sedimentelor la care ptrunde

lumina, bogate n compui redui ai sulfului (H2S)

 dou grupe:

verzi
purpurii

genul tip: Chlorobium

genul tip: Chromatium

CHEMOAUTOTROFIA
bacteriile chemoautotrofe obin energia
necesar sintezei propriilor substane
organice (din CO2, H2O i sruri anorganice)
n urma reaciilor chimice de oxidare a unor
substraturi anorganice sau organice
oxidri

PMF

energie E

ATP

CO2 + H2O + sruri minerale substane organice celulare

 n funcie de natura substanelor anorganice din

oxidarea crora se obine energia necesar fixrii
CO2, se ntlnesc mai multe grupe ecofiziologice:
cele mai importante:
nitrificatoare

sulfooxidante

ferooxidante

hidrogenbacterii

1. Bacteriile nitrificatoare
obin energia necesar fixrii CO2 prin
oxidarea amoniacului la nitrai, n dou etape:
n prima etap este oxidat amoniacul (NH3)
la nitrit (NO2)
n etapa a doua este oxidat nitritul (NO2) la
nitrat (NO3)
nitritbacterii
Nitrosomonas

nitratbacterii
Nitrobacter

exist dou categorii de bacterii nitrificatoare:

2. Bacteriile sulfuroase nepigmentate

oxideaz sulful elementar sau compuii redui
ai sulfului (H2S, Na2S2O3)
nefilamentoase
(Thiobacillus)

filamentoase (Beggiatoa)

3. Ferobacteriile (bacteriile feruginoase)

oxideaz compuii redui ai fierului:

corodeaz
conductele
metalice

colmateaz conductele,
prin depunerea Fe(OH)3
insolubil

4. Hidrogenbacteriile (bacteriile hidrogenice)

oxideaz H2
n funcie de acceptorul final de electroni (H),
se ntlnesc 4 grupe ecofiziologice:
a. Bacteriile hidrogen-oxidante
acceptorul final de electroni este O2
sunt singurele aerobe dintre bacteriile hidrogenice

b. Bacteriile denitrificatoare = nitrat reductoare

acceptorul final de electroni (H): NO3
5H2 + 2HNO3 N2 + 6H2O + E
fazele reaciei:
NO3 (nitrat)

NO2 (nitrit)

N2

NO (oxid azotic)

N2O (oxid azotos)

ntregul proces = denitrificare

Ciclul biologic al azotului n natur

N2
Denitrificare

NO3

Fixare

N organic

Nitrificare

Amonificare

NH3

c. Bacteriile desulfoficatoare = sulfat-reductoare

acceptorul final de electroni este sulfatul (SO 42)

specia desulfoficatoare tipic:

Desulfovibrio desulfuricans:

4H2 + H2SO4 H2S + 4H2O + E

Ciclul biologic al sulfului n natur

S organic
ncorporare
de ctre
plante

SO4

Desulfoficare

Sulfoficare

Descompunere
anaerob

H2S

d. Archaea metanogene
acceptorul final de electroni este CO2
rezult metan: CH4

procesul = metanogenez

procesul este realizat de ctre un grup

ecofiziologic divers de Archaea = metanogene

 archaea metanogene sunt strict anaerobe

majoritatea archaea produc metan
prin reducerea CO2 cu ajutorul H2:

4H2 + CO2 CH4 + 2H2O + E

metanogenele pot produce CH4 pornind de
la substraturi organice (acetat: CH3COO)

CHEMOHETEROTROFIA
bacteriile chemoorganoheterotrofe se hrnesc
cu substane organice gata sintetizate
1. Saprofite folosesc pentru nutriie
materie organic moart
descompuntorii
2. Parazite folosesc substanele organice
produse de organismul pe care l paraziteaz
toate bacteriile patogene, care cauzeaz
bolile contagioase = infecioase