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Wo finde ich die Daten zum Human-Genomprojekt?

Unter folgenden links kann man Zugang zu den Human-Genomdaten


erhalten:
- http://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/guide
- http://www.ensembl.org
- http://genome.ucsc.edu
Unter http://www.nature.com knnen die beiden Artikel zum Humangenom
eingesehen und auch als PDF gespeichert werden.
Nhere Informationen:
http://www.ornl.gov/sci/techresources/Human_Genome/project/info.shtml
Kapitel How is genome sequencing done
und
http://www.ornl.gov/sci/techresources/Human_Genome/faq/seqfacts.shtml

Patentrecht
Human Genome Project Information Webseite:
http://www.ornl.gov/sci/techresources/Human_Genome/elsi/patents.shtml

Wo finde ich Informationen zu anderen Genomprojekten?


Unter http://www.genomesonline.org findet man eine aktuelle Auflistung aller
ffentlich zugnglichen Genomprojekte.

Glossar Gentechnik
http://www.ornl.gov/sci/techresources/Human_Genome/glossary

Tutorial Human Genom Project

http://www.ornl.gov/sci/techresources/Human_Genome/publicat/tko/04_exploring.html

Abkrzungen und Symbole


Fr Nucleotide und AS verwendet man die einbuchstabigen Codes, die von der International Union of
Biochemistry und der Internationalen Union of Pure and Applied Chemistry (IUB/IUPAC) festgelegt
wurden.

Abkrzungen und Symbole fr Nucleinsuren, Polynucleotide und ihre


Bestandteile
http://www.chem.qmul.ac.uk/iupac/misc/naabb.html

Nomenklatur und Symbole fr Aminosuren und Peptide


http://www.chem.qmul.ac.uk/iupac/AminoAcid

IUPAC-Code

IUPAC-Code fr Nukleotide

IUPAC-Code

IUPAC-Code fr Proteinsequenzen

FASTA Format

textbasiertes Format zur Darstellung und Speicherung der Primrstruktur


(Nukleinsuresequenz) und Proteinen (Proteinsequenz)
Nukleinbasen bzw. Aminosuren werden durch den Ein-Buchstaben-Code
dargestellt.
den Sequenzen ist ein Name und Kommentar vorangestellt.
Schreibweise:
- header beginnt mit einem > und wird durch einen Zeilenumbruch beendet.
- die Sequenz beginnt direkt in der nchsten Zeile und endet mit einem
Zeilenumbruch.
- Gro- und Kleinschreibung, wie auch weitere Zeilenumbrche in der
Sequenz sind erlaubt.

Beispiel:
>12345 dies ist eine Beispielsequenz
AATGTTGggCCTAGATCTATATAGAATTCCCATGATGNTTY

Verffentlichungen

Suchen Sie in der Pubmed-Datenbank nach einer Verffentlichung eines


Autors Ihres Nachnamens.
- Wie viele Verffentlichungen konnten Sie finden?
- Gibt es mehrere Autoren Ihres Namens?
- Sollten Sie nicht fndig werden, versuchen Sie es beispielsweise unter
dem Namen Blobel.
- Wie knnen Sie die Ergebnisse weiter einschrnken, wenn Sie z.B. nach
dem Autor Gunter Blobel suchen?

bungen - Datenbanken

bung: Suche nach Informationen ber Krankheit

NCBI-Datenbank Genes and disease


http://www.ncbi.nlm.nih.gov/disease/
- Informationen ber die Phenylketonurie
- Auf welchem Chromosom befindet sich das humane Gen der
Phenylalanin-Hydroxylase?

bung: Suche nach SNPs

NCBI-Datenbank dbSNP
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/SNP
- Suche nach Reference Cluster mit der ID rs334
- In welchem Organismus wurde dieser SNP gefunden?
- Welchen Nukleotid-Austausch gibt es im Vergleich zur Referenzsequenz
(contig reference)?
- Fhrt dies zu einem AS-Austausch und wenn ja zu welchem?
- Welches Gen ist von diesem SNP betroffen?
- Welche Krankheit wird durch die Mutation ausgelst?