Estructura Primaria De

Las Proteinas

Estructuras de las protenas

Estructura primaria
Estructura secundaria
Estructura terciaria
Estructura cuaternaria

La funcin de una protena

depende de su secuencia de
aminocidos?

Estructura tridimensional nica que le confiere una

funcin nica.
1. Protenas con funciones diferentes siempre tienen
secuencias de aminocidos diferentes.

La funcin de una protena

depende de su secuencia de
aminocidos?

2. Se han correlacionado miles de enfermedades

genticas humanas con la produccin de protenas
defectuosas.

La funcin de una protena

depende de su secuencia de
aminocidos?

3. Al comparar protenas con funciones similares de

diferentes especies encontramos que estas protenas
tienen a menudo secuencias de aminocidos similares.

La funcin de una protena depende

de su secuencia de aminocidos
Entonces, la secuencia de aminocidos est fijada
absolutamente?
No, se calcula que entre el 20% y 30% de las protenas
humanas son polimrficas, habiendo secuencias de
aminocidos que varan dentro de la poblacin humana.

La funcin de una protena depende

de su secuencia de aminocidos
Las protenas tienen renglones cruciales para su funcin
que no permiten variaciones (por ejemplo, el caso de la
anemia falciforme).
Dicha fraccin crtica vara de protena en protena.

Determinacin de la secuencia de
aminocidos de protenas
En 1953:
James Watson y Francis Crick dedujeron la estructura de
doble hlice del ADN y propusieron el mecanismos de
su replicacin.
Frederick Sanger resolvi la secuencia de aminocidos
de las cadenas peptdicas de la hormona insulina.

Determinacin de la secuencia de
aminocidos de protenas
En 1963:
Se determin el cdigo gentico que relaciona la secuencia
nucleotdica del ADN con la secuencia de aminocidos de las
molculas protecas.
Hay dos mtodos
Mediante secuencias de ADN.
Mtodos tradicionales (degradacin de Edman)
La ventaja del ltimo respecto al primero, es que nos permite ver las
modificaciones que tienen lugar despus de la sntesis de la protena.

FUERZAS DE LA
ESTRUCTURA PROTEICA

La estructura de las protenas esta estabilizada por diferentes

tipos de enlaces como:
enlaces covalentes (enlace peptdico, enlace por puentes
disulfuro)
enlaces por puentes de hidrgeno (interacciones dipolodipolo)
interacciones hidrofbicas,
enlaces salinos (interacciones electrostticas)
fuerzas de los contactos de Van der Waals.

 Estos enlaces juegan un importante papel en la

estabilizacin de la estructura tridimensional de las
protenas.
La energa que debe suministrarse para romper el enlace es:

Tipo de enlace

Fuerza(kcal/mol)

Covalente

-50 a 100

Inico o salino

-1 a 80

Puentes de
Hidrgeno
Van der 1Waals

-0,5 a 1

Hidrofbico

-0,5 a 3

-3 a 6

Enlaces por puente disulfuro

Este tipo de enlaces se establece al
oxidarse dos cistenas para formar una
cistina, unin de los dos azufres. Este tipo
de uniones se conocen con el nombre de
puentes disulfuro.
Ejemplo el puente disulfuro entre
laCys201y laCys136 -CH2-S-S-CH2-.

Enlaces salinos
hay distintas regiones de las protenas con carga opuesta
que se atraen por fuerzas electrostticas, interacciones
que se conoce con el nombre de enlace salino.
Sucede cuando aminocidos cidos (GluyAsp) que
presentan carga negativa; y aminocidos bsicos
(His,Lys,Arg) que presentan carga positiva se encuentran
en el esqueleto polipeptidico.

Aunque es raro encontrar aminocidos cargados en el

interior de la protena, si estn, juegan un papel
importante ya que la distancia y fuerza de este tipo
de enlace se aproxima a los valores del enlace
covalente (2,8 ).
Estos enlaces determinan el correcto plegamiento de
la protena al poder interaccionar con el agua de
solvatacin.

Puentes de hidrgeno
En la estructura de las protenas hay diferentes tipos de
enlaces por puentes de hidrgeno, dependiendo de los
tomos que intervienen en el mismo:
Las cadenas laterales de dos aminocidos de la
cadena polipeptdica
LaSer195en el modelo peptdico est situado de tal
manera que interacciona con laHis57a travs de un puente
de hidrgeno, el grupo-OHde laSercomparte el hidrgeno
con unNde la cadena lateral del anillo de laHis57.
Los tomos de la cadena lateral de los aminocidos y
las molculas de agua de solvatacin
ElAsn204contiene en la cadena lateral un grupo carboxilo,
grupo que puede formar un puente de hidrgeno con el
agua de disolucin en la superficie de la protena.

Los tomos de la cadena lateral de los aminocidos y

los tomos del esqueleto polipeptdico
LaGly193forma un enlace de hidrgeno a travs del
grupocarboxilocon un grupoNHde la cadena lateral de
laHis40.
Los tomos del esqueleto polipeptdico
En el modelo polipeptdico (residuos 193-204) es una
lmina que est formando puentes de hidrgeno con un
lmina antiparalela (residuos 205-214). As se establecen
dos puentes de hidrgeno entre los tomos de la cadena
polipeptdica en laLeu199y laGly211.

Interacciones hidrofbicas
se dan entre las cadenas laterales de los aminocidos
hidrofbico
estos aminocidos suelen disponerse en el interior de la
protena, evitando de esta manera las interacciones con el
agua.
Este tipo de fuerzas hidrofbicas intervienen en el correcto
plegamiento de la protena.
laPro198y laVal200son dos de los seis aminocidos
hidrofbicos del modelo polipeptdico. Estos dos
aminocidos se asociacin de manera estrecha con las
cadenas hidrocarbonadas deLeu209,Val121yTrp207.
Este tipo de interacciones ayudan a mantener la estructura
tridimensional de las protena.

Fuerzas de Van der Waals

Las fuerzas de Van der Waals, son atracciones elctricas
dbiles entre diferentes tomos.
Estas fuerzas se deben a que cada tomo posee una nube
electrnica que puede fluctuar, creando de esta manera
dipolos temporales.
El dipolo transitorio en un enlace puede inducir un dipolo
complementario en otro enlace, provocando que dos tomos
de los diferentes enlaces se mantengan juntos.
Estos dipolos transitorios provocan una atraccin
electrosttica dbil: las fuerzas de Van der Waals.
Estas atracciones de Van der Waals son un componente
importante en la estructura de las protenas porque su
nmero es importante.
La mayora de los tomos de una protena estn
empaquetados lo suficientemente prximos unos de otros
para involucrar estas fuerzas transitorias.

El enlace peptdico es plano y rgido

Los enlaces covalentes tambin imponen limitaciones
importantes en la conformacin de un polipptido.
Linus Pauling y Robert Corey comenzaron con un anlisis
cuidadoso del enlace peptdico.
The carbonos de residuos de aminocidos adyacentes estan
separados por tres enlaces covalentes: C C-- N--C
Los estudios de difraccin de X-ray demonstrated that el enlace
peptdico C-N bond is ligeramente ms corto than the enlace CN de una amina simple y que los tomos asociados al enlace
son coplanares
the atoms associated with the peptide bond are coplanar.

El enlace peptdico es plano y rgido

This indicated la existencia de una resonance: el oxygen
carbonlico and the amide nitrogen compartan
parcialmente dos pares de electrons.

The oxygen has a partial negative charge and the

nitrogen a partial positive charge, formando a small
electric dipole

El enlace peptdico es plano y rgido

The six atoms of the peptide group lie in a single plane.
Pauling and Corey dedujeron que el enlace peptdico C-N bonds
no pueden rotate freelya causa de su carcter de parcial de doble
enlace.
Rotation es possible alrededor de los enlaces N--C y C C.
El esqueleto polipeptdico de una protena puede visualizarse
como una serie de planos rgidos en la que los planos
consecutivos comparten un punto comn de diro alrededor de C

El enlace peptdico es plano y rgido

By convention, the bond angles resulting
from rotations at C are labeled (phi) for
the NOC bond and (psi) for the COC
bond. Again by convention, both and
are defined as 180 when the polypeptide is
in its fully extended conformation and all
peptide groups are in the same plane (Fig.
42b). In principle, and can have any
value between 180 and 180, but many
values are prohibited by steric interference
between atoms in the polypeptide
backbone and amino acid side chains. The
conformation in which both and are 0
is prohibited for this reason; this
conformation is used merely as a reference
point for describing the angles of rotation.

El enlace peptdico es plano y rgido

Allowed values for and are graphically revealed
when is plotted versus in a Ramachandran plot,
introduced by G. N. Ramachandran