Nucleozide

Bazele azotate se leag prin azotul din poziia 1 a inelului pirimidinic,

sau cel din poziia 9 a inelului purinic, de carbonul C1 al pentozei
(riboza n cazul ribonucleozidelor, ribonucleotidelor i acizilor
ribonucleici , sau dezoxiriboza n cazul dezoxiribonucleozidelor,
dezoxiribonucleotidelor i acizilor dezoxiribonucleici).

1
 Dezoxiribonucleozide
Principalele dezoxiribonucleozide sunt:
2' dezoxiadenozina
2' dezoxiguanozina
2' dezoxicitidina
2'dezoxitimidina (timidina)
 Ribonucleozide
Principalele ribonucleozide sunt:
adenozina
guanozina
citidina
uridina
 Formarea nucleotidelor

Prin reacia de esterificare a uneia dintre gruprile

alcoolice libere ale ribozei sau dezoxiribozei cu o
molecul de acid fosforic, rezult
(dezoxi)nucleozidmonofosfai (mononucleotide, sau mai
simplu nucleotide).
Prin esterificarea gruparilor OH de la C5 ai pentozelor
din structura nucleozidelor rezult nucleozid5'
monofosfaii = Nucleotidele ce intr n structura
acizilor nucleici.
Unitile repetitive din structura acizilor nucleici sunt,
deci, nucleozid5'monofosfaii
 Caracteristicile nucleotidelor

Dup tipul de nucleobaz:

nucleotidele purinice si pirimidinice.

Toi aceti esteri monofosforici ai nucleozidelor sunt acizi puternici,

datorit prezenei restului de acid fosforic.

Nucleozidmonofosfaii pot alctui lanuri polinucleotidice n

structura acizilor nucleici dar se pot gsi i n stare liber n celul
ca nucleotide libere, sau pot intra n structura unor coenzime,
ndeplinind funcii de efectori enzimatici.
 Dezoxiribonucleotide

Dezoxiribonucleotide (dezoxiribonucleozid-5'-monofosfai, dNMP):

Dezoxiadenozin-5'-monofosfat (dAMP, acid dezoxiadenilic,
dezoxiadenilat);
Dezoxiguanozin-5'-monofosfat (dGMP, acid
dezoxiguanilic,dezoxiguanilat);
Dezoxicitidin-5'-monofosfat (dCMP, acid dezoxicitidilic,
dezoxicitidilat);
(Dezoxi) timidin-5'-monofosfat (dTMP, acid (dezoxi)timidilic, timidilat).
 Baze azotate rare din nucleotidele aflate
in structura ADN-ului
NH2 NH2

N CH3 N CH2 OH

O N O N

P O CH2 O P O CH2 O
, ,

OH OH
Acid 5-metil-dezoxicitidilic Acid 5-hidroximetilcitidilic

Nucleotidele modificate ce apar n structura ADN se

formeaz postsintetic (post-replicaional) din
nucleotidele de baz, n urma unor modificri
chimice, ca reacii de metilare, de hidroxilare etc.
 Ribonucleotide

Ribonucleotide (ribonucleozid5'monofosfai, prescurtat

rNMP):
Adenozin-5'-monofosfat (AMP, numit acid adenilic sau adenilat);
Guanozin-5'-monofosfat (GMP, acid guanilic sau guanilat);
Citidin-5'-monofosfat (CMP, acid citidilic sau citidilat);
Uridin-5'-monofosfat (UMP, acid uridilic sau uridilat).
Baze azotate rare din nucleotidele aflate n
structura ARN-ului
n structura ARN intr nucleotide care contin alturi de adenin,
guanin, citozin i uracil i o serie de derivai ai acestor baze
azotate numite baze azotate rare.

In structura ARN de
transfer (ARNt),
ARN ribozomal (ARNr),
cu excepia ARN-5S

In structura ARN de
transfer (ARNt)
 Alte tipuri de nucleotide
Fosforilarea nucleozidmonofosfailor sub aciunea biocatalitic a
unor fosfotransferaze (kinaze) duce la formarea
nucleoziddifosfailor i nucleozidtrifosfailor.
ntre resturile de acid fosforic ataate la nucleozidmonofosfai se
realizeaz legturi chimice de tip anhidrid. Asemenea legturi
poart numele de legturi macroergice i se caracterizeaz printr-o
labilitate deosebit, degajnd prin hidroliz cantiti mari de energie
(7-9 kcal/mol, respectiv 29,3-37,6 kJ/mol).

NH2 NH2 Baza

azotata
,

N N N
N P ~ P ~ P O CH2 O
O O
,

N N N N
O
HO P ~ O P~O P O CH2 O P~ P ~ P CH2 O
OH OH OH OH OH
,
`1 (d)NMP
OH OH OH OH (d)NDP
AMP (d)NTP
ADP ATP
 Nucleozidtrifosfaii- precursori ai acizilor
nucleici
Biosinteza acizilor nucleici utilizeaz ca precursori nucleozid-5'-trifosfai
din care, dup scindarea cte unui rest pirofosfat (PPi), rezult
nucleozid-5'-monofosfai ce se leag ntre ei prin legturi 3'-5'-
fosfodiesterice.
 Ribonucleozidtrifosfaii cu rol de compusi
macroergici

Ribonucleozidtrifosfaii pot fi liberi n celul, jucnd rol de

compui macroergici, donori de energie.
ATP este donorul universal de energie
GTP pentru biosinteza proteinelor,
CTP pentru biosinteza lipidelor,
UTP pentru biosinteza polizaharidelor.
 Nucleotide ciclice

Un tip particular de nucleozidmonofosfai l constituie compuii cu

structur ciclic: adenozin-3'-5'-monofosfatul ciclic (cAMP, numit
i acidul 3'-5'-cicloadenilic) i guanozin-3'-5'-monofosfatul ciclic
(cGMP, acidul 3'-5'-cicloguanilic).
NH2 OH

N N N
N Cele dou nucleotide ciclice se formeaz
N N
din adenozintrifosfat (ATP) i respectiv din
,

H2N N
,

N
O CH2 O
O CH2 O
guanozintrifosfat (GTP) sub aciunea
O P O OH
enzimatic a adenilat-ciclazei i respectiv
O P O OH

OH OH
guanilat-ciclazei.
c AMP c GMP

AMP-ciclic are rol reglator n numeroase procese biochimice, ndeplinind

rolul celui de al doilea mesager n mecanismul de aciune hormonal,
rol n stimularea transcrierii, n reglarea modificrilor post-sintetice ale
unor proteine, n stimularea activitii unor protein-kinaze etc.
GMP-ciclic are n general efecte contrarii AMP-ciclic.
ACIZII NUCLEICI
 ACIZII NUCLEICI - Generaliti
Sunt substane chimice macromoleculare polinucleotide cu structur liniar, a cror mas
molecular este cuprins ntre 25 x 103 i 16 x 106 Da.

Acizii nucleici sunt rezultatul 5fosfat

policondensrii baza

mononucleotidelor. Legtura baza

dintre nucleotide este pentoza

asigurat de restul fosforic din pentoza

poziia 5' a pentozei unui Formarea unei

nucleotid ce esterific legaturi

fosfodiesterice
gruparea OH din poziia 3' a baza

pentozei nucleotidului baza Legatura

fosfodiesterica
anterior. pentoza

pentoza

Polinucleotidul liniar are dou

extremiti: 5'-terminal i 3'- 3hidroxil
terminal.
Caracteristici generale ale acizilor nucleici

n funcie de natura pentozei, acizii nucleici se clasific n acizi

ribonucleici (ARN) ce conin -D-ribofuranoz, i acizi
dezoxiribonucleici (ADN) ce conin -2'-dezoxi-D-ribofuranoza.

ADN conine: adenina, guanina, citozina i timina,

ARN conine: adenina, guanina, citozina i uracilul.
Adenina, guanina i citozina sunt baze azotate comune celor dou
tipuri de acizi nucleici. Timina poate fi uneori prezent n unii acizi
ribonucleici ribozomali, cu excepia ARNr-5S i n unii ARNt.

Resturile nucleozidice din constituia ADN sunt: dezoxiadenozina

(dA), dezoxiguanozina (dG), dezoxicitidina (dC) i (dezoxi)timidina
[(d)T].
Resturile nucleozidice din constitua ARN sunt: adenozina (A),
guanozina (G), citidina (C) i uridina (U).
 Fluxul informatiei genetice
Informatia genetic este stocat in secventa de baze azotate din catenele
nucleotidice ale acizilor nucleici. Fiecare baza azotata formeaza legaturi de
hidrogen cu o baz azotat din catena complementar a dublului helix de
ADN.
Formarea perechilor de baze azotate pe baza de complementaritate serveste la
copierea informatiei genetice de pe o catena preexistenta urmata de formarea
unei catene nucleotidice noi. Replicarea ADN-ului este realizata sub actiunea
enzimelor ADN polimeraze.
Sinteza proteica propriu-zisa este realizata prin intermediul transcrierii
informatiei genetice de pe ADN in molecula de ARN mesager (ARNm). Alte tipuri
de molecule de ARN (ARN de transfer sau de transport (ARNt), ARN ribozomali
(ARNr) participa la realizarea sintezei proteice.
Fluxul informatiei genetice poate fi sistematizat astfel:
transcriere traducere
ADN ARN proteine

Relatia dintre secventa de baze azotate din structura ADN, respectiv ARN si
secventa de aminoacizi din structura proteinelor este realizata de codul
genetic. Codul genetic este aproape universal pentru toate organismele.
O secventa de trei baze azotate numita codon, va codifica un anumit
aminoacid. Codonii transcrisi in ARNm sunt cititi de ARNt determinand
asamblarea aminoacizilor la nivelul ribozomilor (formati din ARNr si peste 50
de proteine diferite), si in final, sinteza proteinelor.
 Acizi dezoxiribonucleici (ADN)

ADN este purttorul informaiei ereditare i reprezint

structura chimic cu cea mai mare capacitate de stocare
a informaiei biologice.
Principalele mononucleotide ce intr n structura ADN
sunt: dAMP, dGMP, dCMP i dTMP.
n structura ADN intr ca pentoz 2'-dezoxiriboza (-2'-
dezoxi-D-ribofuranoza).
ADN alctuiete materialul genetic al tuturor
organismelor procariote i eucariote, precum i al multor
virusuri (dezoxivirusuri sau adenovirusuri).
 Caracteristicile ADN-ului

Polaritatea macromoleculei de ADN: are 2 extremitati 5'-Fosfat

terminal i 3'-OH terminal.

Cantitatea de ADN. Cu ct organismele sunt mai evoluate, cu att

cantitatea de ADN este mai mare. La virusurile tumorigene cantitatea de
ADN este de 5 x 10-6 pg ADN, la psri exist 2 pg ADN per celul, iar n
celula de mamifere , 6 pg ADN. n celula vegetal se gsesc 2,5 pg
ADN per celul.
Lungimea total a ADN n stare extins (relaxat) este: 1,5 m la
virusurile tumorigene, 22 m la fagul T2, 1,2 mm la E. coli, 0,6 m la
psri i de 2 m la mamifere; la vegetale lungimea ADN este de 0,8 m.
Masa molecular a ADN uman este de 4,32 x 1012 Da, 1,1 x 108 Da la
fagul T2, 2,4 x 109 Da la Escherichia coli, 1,5-2,0 x 1012 Da la plantele
superioare i de 2-4 x 1012 Da la mamifere.
 Structura spaial a ADN

ADN este dublu catenar la toate procariotele i eucariotele, precum i la

majoritatea dezoxivirusurilor (exceptie unele dezoxivirusuri care au ADN
monocatenar).

Nivele de organizare structurala a ADN:

1. Structura primara
2. Structura dublu-helicoidala
3. Conformatii cu grad superior de impachetare a ADN-ului eucariot.
 1. Structura primara a ADN

Cele patru nucleozide (dA, dG, dC i T) ce

intr n structura ADN sunt legate prin
legturi 3', 5'-fosfodiesterice, n care restul
fosforic din poziia 5' a dezoxiribozei unui
mononucleotid esterific hidroxilul din
poziia 3' a dezoxiribozei
mononucleotidului urmtor.

Axul moleculei este deci constituit din

fosforiboz, pe care se grefeaz bazele
purinice i pirimidinice. La un capt al
lanului polinucleotidic se afl o molecul
de acid fosforic neangajat ntr-o punte
diesteric (captul 5'-fosfat liber). La
cealalt extremitate a lanului
polinucleotidic hidroxilul de la carbonul 3' a
dezoxiribozei este liber (captul 3'-OH
liber).
 1. Structura primar a ADN-ului

NH 2 OH NH2 OH

N N N
N N N CH 3
,

N H2 N N
,
N O N
OH N O N
5`
O P O CH2 O CH 2 O O CH 2 O CH2
O O O ,

OH
3` 2`
,

O P OH O P OH O P OH OH
O O O
 2. Structura dublu-helicoidal a ADN-ului

Structura tridimensionala a ADN este dat de structura

dublu-helicoidal (dublu helix sau duplexul de ADN).
Conceptul antiparalel se refer la faptul c cele dou
lanuri (catene) polinucleotidice sunt orientate n sens
opus; la extremitatea 3'-terminal a unui lan se afl
extremitatea 5'-terminal a lanului complementar. Astfel,
din punct de vedere al legturii dintre nucleotide, cele
dou lanuri alearg n direcii opuse.
 Modelul dublu-helicoidal Watson i Crick

Modelul dublu-helicoidal al moleculei de ADN a

fost postulat n 1953 de ctre Watson i Crick,
moment considerat crucial n biologie, nu numai
pentru elucidarea structurii celei mai mari
biomolecule din lumea vie, dar i pentru
fundamentarea a ceea ce a constituit la un
moment dat dogma central a biologiei
moleculare.

Modelul dublu helix a fost realizat pe baza datelor

acumulate anterior, dintre care menionm n mod
deosebit pe cele ale lui Chargaff i colaboratorii
privind studiul compoziiei n baze azotate a ADN
La elucidarea structurii dublului helix au contribuit
i studiile de difracie cu raze X a moleculelor de
ADN ale lui Franklin i Wilkins.
 Modelul dublu-helicoidal Watson i Crick

Molecula de ADN este alctuit din dou

lanuri polinucleotidice antiparalele,
rsucite n form de helix spre dreapta, n Diametru
jurul unei axe imaginare. 2nm

Unghiul format de planul fiecrei perechi

de nucleotide care stau fa n fa, n Incizura mica
raport cu perechea nvecinat, este de Perioada de
identitate
36, ceea ce face ca la 10 perechi de de 3.4nm
nucleotide lanul dublu catenar s se
roteasc cu 360 Scheletul pentozo-
fosforic
Perioada de identitate este de 3,4 nm,
ceea ce corespunde la 10 perechi de Incizura mare
nucleotide, lungimea unei perechi de baze
Perechi de
fiind de 0,34 nm baze azotate
Diametrul celor dou catene este de 2 nm
De-a lungul ntregului helix, diametrul este
constant, ca o consecin a legturilor prin Axul central
puni de hidrogen stabilite ntre cele dou
catene complementare.
 Modelul dublu-helicoidal al lui Watson i Crick

Bazele purinice i
pirimidinice sunt
orientate spre interiorul
helixului, avnd planurile
ciclurilor paralele ntre
ele i perpendiculare pe
axul helixului.
 Concluziile rezultatelor lui Chargaff

Compoziia n baze azotate a ADN prezint variabilitate

de la specie la specie, n cadrul aceleiai specii
compoziia fiind aceeai, indiferent de esut.

Compoziia, secvena dezoxinucleozid-monofosfailor

(dezoxinucleotidelor) i masa lor molecular este
constant la acelai organism indiferent de vrst, organ,
esut sau stare fiziologic.

Raportul A+G/C+T = 1 indiferent de natura ADN.

De asemenea, A+T/C+G = constant, fiind o caracteristic
de specie.
A=T i G=C, ceea ce nseamn c numrul de molecule
de adenin este egal cu numrul moleculelor de timin i
respectiv cele de guanin cu cele de citozin.

Regula lui Chargaff: numrul total de baze purinice

este egal cu numrul de baze pirimidinice.
 Principiul complementaritatii bazelor azotate

Bazele purinice ale unui lan sunt legate prin puni de

hidrogen de bazele pirimidinice ale lanului adiacent. Cele
dou lanuri au deci structur complementar; adenina
dintr-un lan este complementar cu timina din lanul
pereche, iar guanina dintr-un lan este complementar cu
citozina din lanul pereche.

Prin formarea perechilor de baze azotate (purinice-

pirimidinice) se realizeaz meninerea n contact a celor
dou lanuri de ADN prin intermediul punilor de hidrogen,
iar n acelai timp, fiecare din bazele azotate ale unuia
din lanuri determin congenerul corespunztor din lanul
opus.
Factorii care dicteaz principiul complementaritii
bazelor azotate
2 factori: steric i electronic.

Factorul steric este legat de volumul bazelor. Bazele purinice au un volum mai
mare dect bazele pirimidinice. Prin mperecherea unei baze purinice cu una
pirimidinic, diametrul lanului dublu helix de ADN este constant (2 nm). Dac
acest principiu nu ar fi respectat i s-ar mperechea bazele purinice ntre ele i
respectiv cele pirimidinice ntre ele, ar nsemna ca structura ADN s prezinte
zone mai largi sau mai nguste, cu alte cuvinte ar aprea neregulariti.

Factorul electronic este dictat de numrul maxim de legturi (sau puni) de

hidrogen care se pot stabili ntre baze. ntre adenina unui lan i timina lanului
antiparalel se stabilesc dou legturi de hidrogen, iar ntre citozina unui lan i
guanina lanului antiparalel se stabilesc trei legturi de hidrogen. Prin prezena
acestor legturi, molecula de ADN este stabilizat.
Orientarea bazelor azotate spre interiorul helixului dublu este n acord cu
caracterul lor hidrofob. Bazele azotate se gsesc ntr-un mediu practic apolar,
lipsit de ap, iar resturile fosfat (cu sarcini negative) sau moleculele de
dezoxiriboz puternic polare sunt situate spre exteriorul dublului helix, n
contact cu moleculele de ap.
Legturile de hidrogen dintre cele dou catene
complementare ale ADN-ului

timina

adenina

citozina

guanina