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DE LOS NCLEOS ATMICOS A LAS

PROTENAS
RICARDO A. BROGLIA
REVISTA: INVESTIGACIN Y CIENCIA, JUNIO 2002

EXPOSITORES:
- AGUIRRE SISNIEGAS, JULIANA - COLUGNA ESPINALES, ZOILA
- CAICEDO BALTODANO, MIGUEL - CORREA BALAREZO, VANESSA
- CASTRO ALVILDO, ELSA - CRTEZ FLORES, ELVIS
- CERNA CHIHUALA, IRINA - CRESPO MORENO, JAN PIER
QU ES UN AMINOCIDO?
Es una molcula orgnica que estn
integrados por un tomo central de
carbono, denominado C alfa, cuyas cuatro
valencias estn ligadas a un grupo amino
(2 ), un grupo cido o grupo carboxilo
(COOH), un tomo de hidrgeno (H) y un
grupo R llamado residuo, el cual es distinto
para cada aminocido
CLASIFICACIN DE LOS AMINOCIDOS
* La Cistena y Tirosina solo se sintetiza en adulto
Sntesis Proteica
Qu es una protena?
Las protenas son biomolculas orgnicas de
elevado peso molecular (macromolculas)
formadas por carbono, hidrgeno, oxgeno,
nitrgeno y en menor medida fsforo, azufre y
otros elementos (hierro, cobre, magnesio).

Las protenas son largas cadenas de


aminocidos unidas por enlaces peptdicos
entre el grupo carboxilo () y el grupo
amino ( NH2 ) de residuos de aminocido
adyacentes.
PROTENAS RELACIN ESTRUCTURA Y FUNCIN
Las protenas son cadenas de
aminocidos con una forma definida, en
donde la forma determinara la funcin .
Por ejemplo la hemoglobina protena
que esta en la sangre transportadora de
2 y recoge el 2 .
Tambin las responsables de la
inmunidad o los receptores celulares
ESTRUCTURA PRIMARIA
Es la secuencia ordenada y nica de los
aminocidos en la cadena polipptica lineal, la
cual est determinada genticamente.
El enlace implicado en la estructura primaria es
el enlace peptdico.
La cadena lineal puede estar formada por
cualquier de los 20 aminocidos (10
esenciales- 10 no esenciales)
ESTRUCTURA SECUNDARIA -hlice
A medida que la cadena de aminocidos se va ensamblando, empiezan
a tener lugar interacciones entre los diversos aminocidos de la cadena.
Pueden formar puentes de hidrgeno entre el hidrgeno del amino de un
aminocido y el oxgeno del carboxilo del otro. A causa de estas uniones
de la cadena polipeptdica se pliega, adoptando configuraciones
espaciales (hlices alfa o laminas beta)que constituyen lo que se conoce
como estructura secundaria de las protenas.

-hoja plegada
ESTRUCTURA TERCIARIA

Es la forma que puede realizar la 1. Dbiles (no covalentes)


funcin para la cual fue diseada. Fuerzas electrostticas
La forma global de la cadena Fuerzas hidrofbicas
polipeptdica de una protena se Puentes de Hidrgeno
conoce como estructura terciaria. Atracciones polares
Algunas protenas que se encuentran 2. Fuertes(covalentes)
en un entorno hidrofbico, en Puentes disulfuro
membranas, poseen una distribucin
inversa de los aminocidos
hidrofbicos e hidroflicos.
Tienen funcionalidad enzimtica y de
antigenicidad.
ESTRUCTURA CUATERNARIA
Se refiere a la distribucin de las subunidades que
integran ciertas protenas, formado por mas de una
cadena polipeptdicas que se adaptan o empaquetan
conjuntamente en la conformacin nativa.

Enlazados a travs de puentes disulfuro.

La estructura cuaternaria es caracterstico de las


protenas oligomricas, que estn formadas por varias
cadenas polipeptdicas.

En estas la protena completa (oligmero) esta formada


por un numero variable de subunidades o de
protmeros.
GLOBULINAS

ALBMINAS. HISTONAS

PROTENAS
SIMPLES
PROTAMINAS. ESCLEROPROTEN
AS.
GLUTELINAS Y
GLIADINAS.
CROMOPROTENAS.
Estn formadas por una protena
simple asociada a un grupo
prosttico coloreado.
NUCLEOPROTENAS. GLICOPROTENAS.
La porcin protenica est Son protenas unidas a hidratos de
representada por una protena carbono. Estos pueden ser mono,
simple, fuertemente bsica, del tipo oligo, o polisacridos, fijados a uno
de histonas, unida al grupo o muchos sitios de la cadena
prosttico por enlaces tipo salino. polipeptdica por enlaces tipo N-
glicosdico, o tipo O-glicosdico.
PROTENAS
CONJUGADAS
FOSFOPROTENAS. METALOPROTENAS.
La unin covalente reversible de Hay un conjunto numeroso de
grupos fosforilo al hidroxilo de protenas conjugadas con elementos
restos de serina, treonina o tirosina, metlicos como grupo prosttico
constituye un mecanismo de (Fe, Cu, Zn, Mg, Mn), esenciales
regulacin de la funcin de muchas para su estructura y funcin.
protenas. LIPOPROTENAS.
En ellas el grupo prosttico est
representado por lpidos de diverso
tipo.
PROPIEDADES
Las protenas son polmeros lineales construidos a partir de monmeros
llamados aminocidos empalmados uno tras otro.
Las protenas contienen un amplio surtido de grupos funcionales.
Las protenas pueden interaccionar entre si y con otras macromolculas
biolgicas para formar asociaciones complejas.
Algunas protenas son muy rgidas, mientras que otras manifiestan una
considerable flexibilidad.
Desnaturalizacin
Cambios en el entorno de la protena pueden acarrear cambios estructurares y
funcionales.
Condiciones diferentes a las de la clula pueden provocar cambios en la estructura
tridimensional.
Elevamos suficiente la temperatura, o pH sea fuertemente cido o alcalino, o se aade al
disolvente algunos tipos de molculas orgnicas, como alcoholes o rea, se despliega la
estructura nativa de la protena.
Perdida la estructura natural de la protena, junto con la mayora de sus
propiedades especficas por factores externo.
La cadena desplegada es un ovillo aleatorio
Flucta continuamente entre un gran nmero de conformaciones extendidas.
Dominios de las Protenas
Los dominios son regiones olipeptdicas plegadas en forma compacta.
Por ejemplo el ncleo de la mioglobina estaba constituido en su enorme
mayora por aminocidos hidrofbicos, en tanto que la superficie
expuesta al solvente estaba integrada por aminocidos polares. Esta
caracterstica, observada posteriormente para un nmero considerable
de estructuras terciarias, indujo a extraer una idea sobre los
mecanismos que utiliza la protena para generar estructuras
termodinmicamente estables.
Dominios de las Protenas
PLEGAMIENTO DE LAS PROTENAS
Es el proceso por el que
una protena alcanza su estructura
tridimensional.

La funcin biolgica de una protena


depende de su correcto plegamiento.

La mayora de las modificaciones y el


plegamiento de las protenas suelen tener lugar
en retculo endoplasmtico y en la mitocondria
Protena estructura tridimensional
Si una protena no se pliega correctamente ser
no funcional y, por lo tanto, no ser capaz de
cumplir su funcin biolgica.

El plegamiento comienza durante la


traduccin

El conocimiento de los mecanismos en


que se basa el plegamiento permitira
predecir la estructura nativa de una
protena a partir de la secuencia de sus
20 tipos de aminocidos
La energa proporcionada a los nucleones es proveniente de las
chaperonas, las cuales son las encargadas de ensamblar las
protenas en estructuras mas complejas.
Los chaperones moleculares colaboran junto con otras protenas en el
plegamiento de las protenas recin sintetizadas, evitando que se plieguen de
forma incorrecta

(HSP60 & HSP70)

Chaperonas(HSP) Heat Shock Proteins


PRION
Son protenas infecciosas que existen en
ms de un estado conformacional, es
decir, pueden adoptar distintas
conformaciones en distintas condiciones,
por lo cual, son excepciones a la teora
clsica del plegamiento de las protenas,
que afirma que la secuencia de
aminocidos determina un nico
plegamiento de la protena, es decir, su
conformacin o estructura terciaria . Uno
de los ejemplos ms notables y recientes
de patologas inducidas por priones, es el
caso de la encefalopata espongiforme
bovina (enfermedad de las vacas locas).
Ubiquitinizacin
La ubiquitinizacin es un
proceso enzimtico de
modificacin proteica post-
traduccional (PTM) en el cual la
Ubiquitina marca a las
protenas mal plegadas para su
posterior reciclaje en el
Proteosoma.
El tomo
TOMO: es la parte ms
pequea de un elemento
qumico pero que posee todas
sus propiedades fsicas. Estn
constituidos tambin por
partculas ms pequeas:
protones, neutrones y
electrones. Al unirse dos o ms
tomos constituyen una
molcula. (Dolores, 2001)
MODELOS NUCLEARES
Existen varios modelos, aunque ninguno es definitivo, son
complementarios; aqu presentamos el utilizado:
Modelo de la gota lquida
Este modelo fue propuesto por Bohr
Considera el ncleo formado por protones y neutrones
mezclados al azar como las molculas en una gota de agua
La presencia de orbitales calientes, debido a la polarizacin de los
nucleones, permite la deformacin del ncleo atmico y debido a esto se
generan nuevos enlaces para la formacin de estructuras mas complejas de
las protenas.
DE LOS NUCLEOS ATMICOS A LAS
PROTENAS

Un modelo basado en las interacciones entre los nucleones


permite acotar las fases a travs de las cuales una cadena
lineal de aminocidos se va plegando hasta adoptar la
estructura tridimensional caracterstica de las protenas.
Tomando como modelo referencial al tomo, una teora hipottica donde los movimientos
de los nucleones darn origen a la polarizacin de los nucleones ( en el ncleo atmico)
que se traducir en orbitales calientes que deformara el campo medio del tomo,
fenmeno similar al movimiento de las mareas por efecto del campo gravitatorio de la
Luna.

Llevemos este modelo a la manera en como se pliegan las protenas desde que son
aminocidos hasta su forma tridimensional, el fenmeno ocurre de manera similar.
Plegamiento de protenas
Todo comienza en los genes, es decir, esa molcula de
ADN, encontrar significado cuando se puedan expresar
en secuencias y estructuras de protenas.
Desde que se dio la traduccin de ARNm en el ribosoma y
se formo una cadena de aminocidos (cadena
polipeptdicas), es necesario el plegamiento de las
secuencias polipeptdicas para formar estructuras
globulares dotadas de propiedades especficas para las
cuales fueron diseadas (protenas). Se pone de manifiesto
que este proceso es independiente del medio celular, es
decir, puede ser reproducido en el laboratorio.
Kendrew para la molcula de mioglobina en 1958,
establece simultneamente la relacin existente entre
funcin y estructura. En la cual una protena adquiere una
configuracin tridimensional unvoca y termodinmicamente
estable.
A su vez las protenas pueden interactuar con otras protenas o con otros
constituyentes y dar origen a organelos celulares y posteriormente la interaccin entre
clulas para constituir tejidos y rganos. O la formacin de enzimas importantes para
llevar acabo el proceso de catlisis.
En este tipo de molculas biolgicas (protenas) se intenta descifrar el nivel de organizacin
qumica, en particular en la relacin existente entre la estructura lineal unidimensional
desnaturalizada (D) de la protena y la estructura nativa tridimensional (N)
biolgicamente activa, en la que la secuencia lineal, una vez fabricada en el ribosoma, se
pliega en un tiempo comprendido entre el microsegundo y el segundo.
El conocimiento de los mecanismos en que se basa el plegamiento permitira predecir la
estructura nativa (N) de una protena a partir de la secuencia de aminocidos.
An no se ha descubierto a ciencia cierta la manera en como se da el plegamiento de las
protenas. Pero si se ha encontrado que desde una estructura nativa (protenas con estructura
terciaria) podemos averiguar la secuencia lineal de los aminocidos que la componen
(estructura primaria).
LECCIONES DEL PROBLEMA INVERSO
El principal resultado experimental del plegamiento de
protenas monoglobulares se encuentra en el carcter de
la transicin entre el estado desnaturalizado y el nativo.
Este carcter parece sorprendente,
debido a que las protenas son
sistemas muy poco homogneos,
estructuralmente ms parecidos a un
slido desordenado.

As como describa Schrdinger, en


1944, en su libro Qu es la vida?, a
una biomolcula como un cristal
aperidico.
Para entender las propiedades de las protenas
diseadas segn el modelo del plegamiento inverso, se
deben identificar los sitios calientes.
SITIO
FRO SITIO
CALIENTE

Primero, se introducen Si la mutacin impide la Si la secuencia resultante se pliega


transicin del estado sobre la propia estructura nativa
mutaciones en cada sitio, empleada para disear la
sustituyendo el aminocido de desnaturalizado al nativo*, se ha
protena**, la mutacin (neutra) ha
la secuencia por uno de los realizado en un sitio caliente
(mayormente ocupado por Aa ocurrido en un sitio templado o
otros 19 Aa.
apolares). fro.

MUTACIN
* 8 % de los casos
** 92 % de los casos
La estabilidad de la protena, en definitiva, viene determinada por los aminocidos
presentes en los sitios calientes.
De hecho, siguiendo la evolucin de una secuencia de aminocidos , de la configuracin
lineal desnaturalizada (D)a la estructura nativa (N), se observa una sucesin de pasos
perfectamente determinada. En primer lugar se asiste a la formacin, casi instantnea, de
estructuras que son estabilizadas por la interaccin entre aminocidos calientes.
Un mecano molecular
En otras palabras, el plegamiento de las protenas no est
controlado por cada aminocido, sino por las estructuras locales
elementales que funcionan como diminutas piezas de un mecano
molecular.
Es como si fuera un juguete formado por piezas que se pueden
unir con otros objetos articulados formando mecanismos y
construcciones.
Si se combinan de la forma correcta, originan el ncleo de
plegamiento y, por tanto, el mnimo nmero de contactos nativos
que aseguran el plegamiento llevndolo del estado
desnaturalizado al estado nativo.
La simplicidad y la economa con las que el modelo de los sitios
calientes y de las estructuras explica el plegamiento de las
protenas. Para su aplicacin es preciso conocer, adems de la
secuencia de aminocidos, su interaccin.
Asociado tambin a un plegamiento incorrecto, se encuentra toda una categora de
disfunciones celulares conocidas con el nombre genrico de amiloidosis, en las que los
plegamientos incorrectos conducen a la formacin irreversible de agregados fibrilares
insolubles llamados amiloides, los cuales interfieren con el desarrollo de las diversas
funciones celulares. Dentro de este grupo de patologas se encuentran las diversas variantes
de la enfermedad de Alzheimer y Creutz-Jakob.
MUCHAS GRACIAS!