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CÓDIGO GENÉTICO.

TRADUCCIÓN E INHIBIDORES
DE LA TRADUCCIÓN

Gisella Orjeda, PhD


Los cuatro procesos moleculares básicos:
• REPLICACIÓN
• TRANSCRIPCIÓN
• PROCESAMIENTO DEL ARN
• TRADUCCIÓN
El código genético
El mensaje del código
genético: Codificar
aminoácidos
El código genético es usado
por las células como un
código en triplete:

• Cada secuencia de 3
nucleótidos, o codón, es
leído desde un punto de
inicio específico en el
ARNm.

• De los 64 posibles codones


presentes en el código
genético, 61 codifican
aminoácidos individuales y 3
son codones de stop.
El código genético es el
“diccionario” que permite
traducir ácidos nucleicos a
aminoácidos.

• La tercera base de cada codón tiene


menos importancia que la primera y
segunda, al especificar un aa.
• Hay 3 codones de terminación.
• Hay 1 codón de inicio.
• Todos los aa, excepto la Met y el Trp,
tienen más de un codón.
• En la mayoría de casos: los codones
que especifican el mismo aa difieren
solo en la 3a base.
• Los codones son escritos de 5’  3’.

Lehninger Principles of Biochemistry. Sixth Edition. Copyright © 2013 by


W. H. Freeman & Company. David L. Nelson and Michael M. Cox.
Hipótesis del adaptador de Crick

… “the amino acid is carried to the template by an ‘adaptor’ molecule, and that the adaptor is the part which
actually fits on to the RNA”…

…”An outline picture of the early stages of protein synthesis might be as follows: the template would
consist of perhaps a single chain of RNA. (As far as we know a single isolated RNA backbone has no regular
configuration (Crick, 1957) and one has to assume that the backbone is supported in a helix of the usual
type by the structural protein of the microsomal particles.) Alternatively the template might consist of a pair
of chains. Each adaptor molecule containing, say, a di- or trinucleotide would each be joined to its own
amino acid by a special enzyme. These molecules would then diffuse to the microsomal particles and attach
to the proper place on the bases of the RNA by base-pairing, so that they would then be in a position for
polymerization to take place”.
The Symposia of the Society for Experimental Biology 12, (1958): 138-163.
Hipótesis del adaptador de Crick

Un pequeño ácido nucleico (quizás un ARN)


podría cumplir la función de un adaptador. Una
parte de la molécula adaptadora que se uniría
a un aminoácido específico y la otra parte que
reconocería la secuencia de nucleótidos que
codifica ese aminoácido en un ARNm.

Esta idea fue verificada pronto. El adaptador de


tRNA "traduce" la secuencia de nucleótidos de
un mRNA en la secuencia de aminoácidos de
un polipéptido.

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Adaptador = ARN de transferencia (ARNt)

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El aminoácido Met marca el inicio de la
traducción en eucariotas y procariotas.

• En la mayoría de los ARNm, el codón de inicio (iniciador)


especificando la metionina aminoterminal es AUG.
• En unos pocos ARNm bacterianos, se usa GUG como el codón
iniciador, y CUG se utiliza de vez en cuando como un codón iniciador
para metionina en eucariotas.
Marcos de lectura en el código genético
Esta precisa matriz lineal de
ribonucleótidos, en grupos de tres en el
La secuencia de codones que va ARNm, especifica la secuencia lineal
desde el codón de inicio al stop precisa de aminoácidos en una cadena
se llama reading frame. polipeptídica, y también señala el lugar
donde la síntesis de la cadena
comienza y termina.
ORF
• Open Reading Frame (ORF): es un marco de lectura sin un
codón de terminación entre los 50 a más codones.
• Los marcos de lectura abiertos largos generalmente
corresponden a genes que codifican proteínas.
• Un gen ininterrumpido que codifica una proteína típica con un
peso molecular de 60,000 Da requeriría un marco de lectura
abierto con 500 o más codones.
Debido a que el código genético no tiene comas,
contiene tripletes no sobrelapados y mayormente
se traduce en un solo marco de lectura.

Virtualmente un
mRNA puede ser
traducido en tres
marcos de lectura.
Se ha demostrado que algunos ARNm contienen información
superpuesta que se puede traducir en diferentes lecturas marcos,
produciendo diferentes polipéptidos.
Los microorganismos aprovechan al máximo sus genomas,
estableciendo numerosos marcos de lectura.
El código genético es casi “universal”

• El significado de cada codón es


Igual en la mayoría de especies lo
cual es un fuerte argumento de que
la vida evolucionó de un mismo
origen.

• Sin embargo, se ha encontrado que


el código genético difiere por unos
pocos codones en bacterias,
mitocondrias, en protozoos ciliados,
en Acetabularia, una alga verde
unicelular.
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El código genético es degenerado

Mas de un codón
pude traducir al
mismo aa.

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Complejo de síntesis de proteínas
Complejo de síntesis de proteínas
La síntesis de proteínas en la escala de
tiempo:
• Si los componentes que participan en la traducción tienen que
interactuar en solución, la probabilidad de colisiones simultáneas Sería
tan bajo que la velocidad de polimerización de aa sería muy lenta.
• Proteínas pequeñas (100-200aa) son sintetizadas < 1 min.
• La eficiencia de la traducción es lograda por la unión del ARNm y el
aminoacyl-tRNA individual a los ribosomas que dirigen la elongación de
un polipéptido.
• Tasa de elongación: 3 -5 aa añadidos por segundo.
• Se estima que la proteína más larga, titina: 2 – 3 horas (30,000 aa).
 Ribosomas
• La síntesis de polipéptidos
se da en los ribosomas.

• Tanto en procariotas como


en eucariotas, los
ribosomas constan de dos
subunidades de tamaño
desigual, las subunidades
ribosomales grandes y
pequeñas, cada una de las
cuales consiste de un
complejo formado entre
moléculas de ARN y
proteínas.
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ARNr Lehninger Principles of Biochemistry. Sixth
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Cox.
Una vez trascrito, pasa al nucléolo
donde se une a proteínas. De esta
manera se forman las subunidades
de los ribosomas.

E. Coli
16S rRNA.
 ARNt
• Su longitud está en el rango de 73 a 93
nucleótidos, además se pliega adquiriendo lo
que se conoce con forma de hoja de trébol
plegada.
• ARNt se encarga de transportar los
aminoácidos libres del citoplasma al lugar de
síntesis proteica.
• En su estructura presenta un triplete de
bases complementario de un codón
determinado, lo que permitirá al ARNt
reconocerlo con exactitud y dejar el
aminoácido en el sitio correcto.
• A este triplete lo llamamos ANTICODÓN.
Anticodones

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Wooble (bamboleo): Una sola molécula de ARNt
puede reconocer como máximo tres codones
diferentes.
De acuerdo con la hipótesis del
bamboleo propuesto por Francis Crick,
el conjunto completo de 61 codones
sentido puede ser leído por menos de
61 ARNt distintos.

Se puede producir un emparejamiento


de bases menos exacto: la base en el
extremo 5 'de el anticodón se puede
emparejar con más de un tipo de base
en el extremo 3 'del codón; en otras
palabras, la base 5’ del anticodón
puede tambalearse.
Bamboleo de los pares de bases
Agregando un aminoácido al ARNt
El aminoácido correcto es unido al ARNt por una enzima llamada
aminoacil-tRNA sintetasa. Este proceso se llama aminoacilación y
produce un aminoacil-ARNt. La aminoacilación usa energía de la
hidrólisis de ATP.

Hay 20 diferentes aminoacil-ARNt sintetasas, una para cada uno


de los 20 aminoácidos diferentes. Cada enzima reconoce
características estructurales particulares del ARNt o ARNt que
aminoacila.
Aminoacilación
Aminoacilación del
ARNt por el aminoacyl-
tRNA syntetasa.

Para participar en la traducción,


un tRNA debe estar
químicamente ligado a un aa,
mediante un enlace de alta
energía formando así el
aminoacyl-tRNA.

El anticodón se aparea con el


codón tal que
el aa activo puede añadirse al
polipéptido creciente
.
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Existen más ARNt que aminoácidos
• Varios ARNt pueden unirse a más de un codón, lo cual explica que
existan más codones que ARNt.
Traducción de proteínas
Etapas de la traducción
 Activación de
aminoácidos

iGenetics : a molecular approach / Peter


J. Russell. -- 3rd ed.
 Iniciación

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Iniciación en bacteria
• Se da en 3 pasos

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Secuencias de ARNm que sirven como señales
para el inicio de la síntesis de proteínas en
bacterias

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Iniciación en
eucariote
Se da en 5 pasos.

El inicio de la traducción es similar


en eucariotas, aunque el proceso es
más complejo e involucra muchos
más factores de iniciación, llamados
factores de iniciación eucarióticos
(eIF).

Las principales diferencias son:


(1) el iniciador metionina no está
modificado.
(2) Las secuencias Shine-Dalgarno
no se encuentran en los ARNm
eucariotas. El ribosoma
eucariótico utiliza otra forma de
encontrar el codón de iniciación
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 Elongación
En células bacterianas: La elongación requiere:
1. El complejo de iniciación descrito anteriormente
2. El aminoacil-ARNt
3. Un conjunto de tres proteínas citosólicas solubles llamadas
factores de elongación (EF-Tu, EF-Ts y EF-G en bacterias)
4. GTP.

Se da en tres pasos:
 Paso 1: Unión al aminoacil-ARNt
 Paso 2: Formación del enlace peptídico
 Paso 3: Translocación
• Paso 1: Unión al aminoacil-ARNt

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• Paso 2: Formación del enlace peptídico

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• Paso 3: Translocación

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En células eucariotas: El ciclo de
elongación en eucariotas es bastante
similar al de las bacterias. Tres
factores de elongación eucarióticos
(eEF1α , eEF1βγ y eEF2) tienen
funciones análogas a los de los
factores de elongación bacteriana
(EF-Tu, EF-Ts y EF-G,
respectivamente).
Los ribosomas eucarióticos no tiene
un sitio E; los ARNt no cargados son
expulsados directamente desde el
sitio P.

TRENDS in Biochemical Sciences Vol.29 No.1 January 2004


 Terminación
• La elongación continúa hasta que el ribosoma agrega el último
aminoácido codificado por el ARNm. La terminación, la cuarta etapa de la
síntesis de polipéptidos, es señalada por la presencia de uno de los tres
codones de terminación en el ARNm (UAA, UAG, UGA).

• En bacterias, una vez que un codón de terminación ocupa el sitio


ribosómico A, tres factores de terminación, o factores de liberación -las
proteínas RF-1, RF-2 y RF-3- contribuyen a (1) la hidrólisis del enlace
peptidil-ARNt terminal, (2) la liberación del polipéptido libre y del último
ARNt, ahora sin carga, del sitio P, y (3) la disociación del ribosoma 70S en
sus subunidades 30S y 50S, listo para comenzar un nuevo ciclo de
síntesis de polipéptidos
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En bacterias, la transcripción y la traducción
están estrechamente ligadas. Los ARN
mensajeros son sintetizados y traducidos en
la misma dirección 5’. Los ribosomas
comienzan traduciendo el extremo 5’ del
ARNm antes de que la traducción esté
completada. La situación es diferente en las
células eucariotas, donde los ARNm recién
transcritos deben abandonar el núcleo antes
de que sean traducidos.

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La nueva cadena de péptido sintetizada es
plegada y procesada a su forma
biológicamente activa.
Modificaciones postraduccionales:

• Modificaciones amino-terminal y carboxiterminal.


• Pérdida de la secuencia señal (péptido señal).
• Modificaciones individuales de aminoácidos.
• Uniones con cadenas de carbohidratos.
• Adición de grupos isoprenil y prostético.
• Procesos proteolíticos.
• Formación de enlaces cruzados de disulfuro.
Algunos aminoácidos tienen
modificaciones post- traducción

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David L. Nelson and Michael M. Cox.
Inhibidores de la traducción

La síntesis de las proteínas es una función


central en la fisiología celular y es el blanco
principal de muchos antibióticos y toxinas
naturales.

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