Micro Suelo 1

Microbiología
del suelo
El suelo:
Un biotopo,
prácticamente
ignorado
María Cecilia Arango Jaramillo

EL SUELO
 Es el principal medio en el que
crecen las plantas.
 Es el soporte físico que
continuamente les proporciona:
– Los nutrientes inorgánicos
– El agua
– El entorno gaseoso adecuado
para los sistemas radicales.
Los nutrientes inorgánicos
que utilizan las plantas
provienen de la atmósfera y
de la meteorización de las
rocas de la corteza terrestre.

Meteorización de la corteza terrestre
 Los minerales son compuestos

inorgánicos que normalmente están
formados por dos o más elementos en
proporciones de peso determinadas
 Ejemplo:
– El cuarzo( SiO2 )
– La calcita (CaCO3).
 Las rocas se dividen en tres grupos
según su origen y formación:
– Ígneas
• Granito, basalto, cuarzo, feldespato
– Sedimentarias
• esquistos, areniscas, piedra caliza
– Metamórficas
• Areniscascuarcita,
• Esquisto  pizarra
• Piedra caliza  mármol
Procesos de meteorización

desintegración física y descomposición
química de los minerales y las rocas
superficiales

producen los materiales inorgánicos que
formarán los suelos

 Los suelos tienen
diferente origen y
composición
 Por lo tanto la
microfauna
asociada a ellos
también

La meteorización implica procesos:
 Mecánicos
– congelamiento y descongelación
– calentamiento y enfriamiento,
 Químicos
– El agua se introduce entre las
partículas, y los materiales solubles
se disuelven en ella.
 Biológicos
– CO2 de la respiración y otras
sustanciasMaría
descomponen
Cecilia Arango Jaramillo las rocas
Meteorización mecánica
El agua y el viento transportan fragmentos

de roca a grandes distancias desgaste que
las fracciona enMaría
partículas
Cecilia Arangomás pequeñas
Jaramillo
Meteorización químia (corrosión)
H2O + SO2  Disuelven

Ácidos  materiales
H2O + NO2 (NO3)  menos solubles
Meteorización orgánica-biológica
 Los ácidos producidos por

plantas y las bacterias pueden
afectar las rocas.

La formación del suelo puede ocurrir en:
 El mismo sitio donde la roca es
meteorizada
 Pueden ser transportados a otros sitios
por :
– La gravedad
– El viento
– El agua
– Los glaciares.
Materia orgánica del suelo
Origen de la materia orgánica del suelo:

– Bacterias, hongos, algas, líquenes,
musgos y plantas que crecen sobre o
entre los minerales y las rocas
erosionadas
– Plantas y animales muertos

Los microbios en el suelo
Contribuyen a la  Controlan la
formación de materia disponibilidad de
orgánica muchos
 nutrientes
la convierten en ácido importantes para
carbónico o ácidos las plantas
orgánicos

disuelven rocas.
 La actividad  La actividad
microbiana es microbiana es clave
limitada por el agua en la productividad
(sequía,humedad ) y de los suelos.
estado de los
nutrientes

 Los microbios pueden existir varios
cientos de metros por debajo de la
superficie de la Tierra
 Los mecanismos de sobrevivencia

aún no se conocen

 Sección vertical del suelo:
– Variaciones en el color
– Cantidad de materia orgánica viva o
muerta (incluye microorganismos)
– Porosidad
– Estructura
– Grado de meteorización.
Horizontes del suelo
 Horizonte A
 Horizonte B
 Horizonte C

Horizonte A:  Contiene la mayor
parte del material
orgánico del suelo,
 Capa superior del vivo o muerto:
suelo – Grandes cantidades
 La región más de partes de plantas
superficial y de y hojas muertas
mayor actividad – Insectos y otros
física química y artrópodos pequeños
biológica. – Lombrices de tierra
– Organismos
descomponedores
– Nemátodos
O2, N2, CO2
•Inorgánicos
Desechos Lluvia O2, NH3, granulados
orgánicos CH4, H2S
•Residuos
orgánicos, humus
Suelo: Horizonte A •Agua (inundado,
Rocas, silicatos mojado)
•Gases (disueltos y
difusos)
•Sistemas
Capa de agua biológicos (raíces,
insectos,
microobios)
En un gramo de suelo del horizante A
pueden haber:
2500 millones de bacterias
+
medio millón de hongos
+
50 000 algas
+
30 000 protozoos
Horizonte B:
Región de
acumulación

El horizonte B:  Algunos materiales
 Contiene mucho del horizonte A,
menos material llegan al B por
orgánico y está filtración del agua a
menos través del suelo:
meteorizado que el – Óxido de hierro
horizonte superior. – Partículas arcillosas
– Pequeñas cantidades
 Hay pocos
de material orgánico
microorganismos
Horizonte C:
 Compuesto por rocas y

minerales fragmentados y
meteorizados de los cuales se ha
formado el suelo verdadero de
los horizontes superiores.
 Los microorganismos son
escasos.

Composición del suelo
 Los suelos están Poro Película de Agua
formados de
materia sólida y Materia orgánica
espacio poroso O2 Arena
CO2,
 El espacio poroso H2S,
CH4
es ocupado por
Arcilla
diferentes
proporciones de
aire y agua,
dependiendo de Hifa
Bacterias
las condiciones de
humedad.
 Los fragmentos de roca y minerales en el
suelo varían en tamaño:
Partícula Diámetro
en micrómetros
Arena gruesa >200 - 2000
Arena fina >20 - 200
Limo 2 - 20
Arcilla <2

 Los suelos están divididos según su
textura:
 Arenoso arcillosos: 35% o más de

arcilla y 45% o más de arena
 Limo-arcillosos: 40% de arcilla y 40%
o más de limo
 Margosos o francos: contienen igual
proporción de arena, limo y arcilla.
Ideales para la agricultura.

 La textura del
suelo influye en las
comunidades de
microorganismos
porque de ella
depende la
aireación y la
disponibilidad de
agua
Intercambio de catiónico
 Los nutrientes
inorgánicos para Cl Cl
microorganismos HCO3 --
-
-
+ K
+ NO
y plantas están Na Na + 3
SO4-2 -
presentes en la OH
Ca+ + Arcilla - Na+
solución del
OH -
suelo como -2
SO4 Na+ Ca+ +
iones. K+ H+
HCO3- OH-
NO3- HCO3-
Intercambio catiónico:
Los cationes apresados por
las partículas de arcilla
pueden:  Partículas de
– Ser reemplazados por arcilla:
otros cationes componentes
esenciales de
– Ser liberados a la
los suelos
solución del suelo para
productivos.
ser tomados por plantas
y microorganismos.
 El fosfato, no puede
 Los aniones (NO3-, ser arrastrado, ya
SO4-2, HCO3-, y OH-) que:
son lixiviados del – Forma precipitados
suelo más insolubles
rápidamente que
– Es absorbido o
los cationes ya que adsorbidoen la
no pueden fijarse a superficie de
las partículas de compuestos que
arcilla. contienen hierro,
aluminio y calcio.
 La acidez o  Los suelos varían
basicidad del mucho en su pH,
suelo está y muchos
relacionada con la microorganismos
disponibilidad de tienen un
nutrientes estrecho margen
inorgánicos para el de tolerancia.
crecimiento de
plantas y
microbios.
 La gente
desconoce que
cuando tiene un
gramo de tierra en
el hueco de la
mano, tiene entre
un millón y mil
millones de seres
vivos en esa mano.
Una muestra de
suelo contiene:
 Insectos ápteros
 Arácnidos
 Sobretodo
filamentos de
hongos y de
bacterias.

 La cuenta de  La riqueza de
gérmenes por especies y la
suspensión- complejidad de la
dilución muestra delgada capa
más de un millón cultivable
de gérmenes por condicionan la
gramo de tierra vida sobre la tierra,
arable del mismo modo
que la fotosíntesis.
Ciclo de la materia orgánica
CO2
Restos vegetales
Fotosíntesis desaparecen bajo
la acción de la
microfauna y la
Caída de ramas, microflora del
hojas, frutos..
suelo
Microfauna del suelo

Microorganismos del suelo
Mineralización Humificación
CO2  Amontonamiento de
Fotosíntesis
acículas de varios
centímetros.
Caída de ramas,
hojas, frutos..
Acidez frena actividad
microbiana
Acumulación Microfauna del suelo

Descomponedores casi ausentes:
hongos y bacterias
Mineralización Humificación
Papel de la microfauna del suelo:
 Disgregación de la materia orgánica

 Diseminación de la microflora

http://www.aecientificos.es/ElSuelo.html
Diseminación activa
Reincorporación de microorganismos al suelo

ELECCIÓN
con las heces de la Reutilización
TRÓFICA:
microflora por otros
Disgregación de la materia orgánica Régimen
alimentario intestinal organimos
microfauna
 Multiplicación
Seleccionan de la
los alimentos microflora
para los de las heces
microbios
Heces
Aumentar
las Diseminación
superficies pasiva Transporte Invasión por
de ataque accidental en la los microbios
para los superficie del del suelo
microbios.
cuerpo
 Plantas y  Los residuos
microflora: orgánicos no
organismos consumidos van a
complementarios, ser degradados por
en la la microflora. Son los
mineralización de hongos, en primer
la materia lugar, los que van a
orgánica atacar a la materia
orgánica fresca, y en
el siguiente orden
Mineralización de la materia orgánica
Descomposición de hojas (Sucesión)
Tiempo (las fases pueden ser simultáneas)
Hongos: Hongos Hongos

glucófilos celulolíticos: lignolíticos :
utilización de metabolismo degradación
las de la celulosa de la lignina
sustancias
hidrosolubles
Bacterias: transforman residuos fúngicos y

productos noMaría
consumidos por las hifas.
Cecilia Arango Jaramillo
 Plantas y microorganismos
son complementarios:
unos fabrica materias
carbonadas, otros libera
minerales

CAPA VEGETAL DEL SUELO
Materia inorgánica
Materia orgánica
Microorganismos
Material mineral
CO2
no utilizado por los
 microorganismos
H 2O
Hojas de las 
plantas
Raíces de las
 plantas
Fotosíntesis
Protección de los microorganismos ante
desequilibrios ambientales
 Cuando se añade materia orgánica a

los suelos agrícolas, las bacterias
consumen todo el carbono
disponible.
 Consecuencia: rarefacción, e
incluso desaparición, de los
microorganismos.
 Para estos casos, la naturaleza ha
creado sistemas de protección para
que los microorganismos
María Cecilia Arango Jaramillo sobrevivan
Estructuras de protección de los hongos
 Clamidospora: célula latente, con

pared gruesa y cuyo contenido es rico
en reservas
 Esclerote: esfera cuyo envoltorio
externo está constituido de hifas
muertas de pared gruesa, y el centro
de filamentos vivos ricos en reservas,
en estado latente.

Estructuras de protección delas bacterias
 Las (Gram+)  Las Gram- están

forman desprovistas de
endosporas. mecanismos de resistencia
 Susceptibles  Forman agregados
de sobrevivir biológicos cuando las
muchos años condiciones son
en condiciones desfavorables
desfavorables. La actividad celular y las
divisiones, se hacen más
lentas.
 Numerosos
 Se forman cuando
procariotas para
las condiciones
protegerse exudan
ambientales llegan a
en su superficie
ser desfavorables
polisacáridos que se
adhieren a láminas
de arcilla.  Desaparecen cuando
 Son estructuras las condiciones
que permiten la pedológicas vuelven
supervivencia de las a ser adecuadas
bacterias
 Estas formaciones
tienen un diámetro
que varía de 10 a
1000 mm y pueden
contener varios
miles de gérmenes.

Los polisacáridos tienen varias funciones:
 La superficie de bacterias y arcillas tienen

cargas eléctricas negativas, mientras que los
azúcares son neutros, tienen por tanto un
papel aislante.
 Los azúcares tienen tendencia a retener
agua, evitan evaporación en períodos
secos.
 Constituyen reservas. En ausencia de
alimentos, las bacterias toman el carbono
necesario para el mantenimiento de las
funciones vitales esenciales.
 Para los microorganismos del
suelo vivir en el espacio
interagregado (poros) y el
agregado mismo (granos)
tiene implicaciones
importantes

 Este es el
microhabitat
colonizado por las
En el espacio bacterias Gram+,
interagregado las que poseen la
condiciones son facultad de
drásticas: producir
La humedad y la endosporas.
aireación varían  Las esporas de los
muy rápidamente. hongos y las de los
actinomicetos, son
muy resistentes a
la desecación.
 Por el  Aparecerán rápidamente
contrario, el condiciones de
agregado anaerobiosis.
mismo es  En este medio tan
recorrido sólo estable viven o
por finos sobreviven las bacterias
capilares de Gram-.
alrededor 2  Aunque sensibles a las
mm de modificaciones
diámetro, que ambientales, permanecen
sólo permiten vivas en suelos secos
una circulación durante más de un año
lenta de aire y gracias a la protección de
de agua. los agregados
La composición química y física de los
agregados es variable.
 El suelo es un medio muy

heterogéneo
 Está constituido de un
mosaico de microhabitats
cuya composición biológica
varía cualitativa y
cuantitativamente en función
del tiempo, y de la fuente
trófica disponible.
 Unos agregados  Los microorganismos
pueden formarse que colonizan estos
alrededor de citina, microhabitats
desarrrollándose en
difieren igualmente
su seno los llamados
citinolíticos.
tanto por su
morfología, como por
 Otros encerrarán
sus requerimientos
residuos de lignina
permitiendo el ecologicos.
crecimiento de los
ligninolíticos. María Cecilia Arango Jaramillo
Influencia del ambiente
del suelo en las
poblaciones de
microorganismos

Nunca se dan
condiciones
 Aunque los ambientales idénticas:
microorganismos  Las que favorecen la
son ubicuos, en reproducción de un
pocas situaciones microorganismo, o
existen poblaciones permiten la
iguales. sobrevivencia de otro,
pueden ser
desfavorables para la
existencia continuada
de un tercero.
 El suelo de un pinar
suele ser muy ácido y
 Los suelos su contenido en
cultivados y de principios nutritivos es
jardín tienen bajo
abundancia de  Los terrenos
oxígeno y agua y pantanosos están
son ricos en inundados, tienen
nutrientes poco oxígeno y
aportados por contienen abundante
las fertilizaciones materia orgánica en
descomposición.
Estas diferencias se
María reflejan
Cecilia en la microflora
Arango Jaramillo
 Para comprender la influencia de
los factores que afectan la
microflora del suelo es necesario:
– Conocer las condiciones
normales de crecimiento de los
microorganismos
– Los efectos que las condiciones
extremas ejercen sobre los
distintos grupos.
Factores que afectan en mayor grado a las
poblaciones de microorganismos
pH DEL SUELO
Acidez- TEMPERATURA
Alcalinidad
POBLACIONES DE MICROORGANISMOS
DISPONIBILIDAD DE
OXÍGENO, AGUA Y
TÉCNICAS DE
SUSTANCIAS MANEJO DEL
NUTRITIVAS SUELO
Consideremos estos
factores
separadamente,
pero deberemos tener
en cuenta que de
ordinario son
interdependientes.

Temperatura (Psicrófilos, Mesófilos y
Termófilos).
TEMPERATURA DE CRECIMIENTO DE LOS
MICROORGANISMOS
Tipo de Temperatura Temperatura Ejemplo de
micro- óptima s límite microorganismo
organismo
Psicrófilas Alrededor 5a30o C Achromobacter
20o C
Mesófilas 25 a 37o C 5 a 45o C Staphylococcus ,

Mayoría de los
hongos.
Termófilas Superior a 40 a 80o C Desulfovibrio,

45o C Thermoactinomyce
s, Algunas algas
María Cecilia Arango Jaramillo verdes azules
Fermentación del estiércol:
 La temperatura puede elevarse
hasta 65 o C, destruyendo todos
los microorganismos, excepto a
los termófilos, como el Bacillus
calfactor , Thermoactinomyces
spp y los hongos termófilos.

 En suelos del piso térmico tropical y
premontano son más frecuentes:
Fusarium, Aspergillus y Rhizopus
 Penicillium crece mejor en suelos más

fríos.

REQUERIMIENTOS
NUTRITIVOS
 Utilización de energía lumínica

 Oxidación quimioautotrófica de
materias inorgánicas
 Respiración heterótrofa de materia
orgánica
 Fermentación de materia orgánica

 Existe competencia entre
los microorganismos por
utilización de los
nutrientes orgánicos e
inorgánicos.

 En el suelo la
materia orgánica
fácilmente
utilizable por los
microorganismos
es ordinariamente
reducida, lo que
limita su
velocidad de
multiplicación.

Al añadir al suelo materiales
frescos, estiércol o desechos
vegetales

el número de microorganismos aumenta
rápidamente

los nutrientes se agotan

población de microorganismos vuelva
nivel anterior.
Como un microorganismo
determinado no puede
utilizar igualmente todos los
substratos

su incidencia y proporción
varían de acuerdo con las
situaciones

 Opionibacterium
actúa como  En el rumen utiliza
barrendero de ácido láctico y
medios nutritivos glucosa producidos
parcialmente por las bacterias
degradados por celulíticas y las del
microorganismos. ácido láctico.

 Lactobacillus
compite eficazmente
cuando existen
carbohidratos  Crece bien en la
simples pero es leche y en el rumen
incapaz de pero no en el suelo.
metabolizar
sustancias como
lignina.
Otros
microorganismos
degradan lignina y
celulosa  Pero no en leche,
donde compiten con

microorganismos
sobrevivien en el suelo como Bacillus y
y en el manto en Lactobacillus
descomposición de
los bosques
 En una población mixta solo unos
pocos microorganismos son
capaces de metabolizar una
sustancia determinada, como
insecticidas y herbicidas, estos
microbios se ven libres de
competencia.

 Los autótrofos no
 Desarrollo de
compiten por
Nitrosomonas y
nutrientes
Nitrosobacter es
orgánicos con otros
limitado por
microorganismos.
compuestos
 Sólo compiten por nitrogenados
luz. apropiados.

OXÍGENO
Los requerimientos de oxígeno de los
microorganismos varían:
 Aerobios
 Anaerobios
 Microanaerobios
 Anaerobios
facultativos

 El oxígeno
determina el
desarrollo de
poblaciones de
microorganismos
en detrimento de
otras.

 En el ensilado, los forrajes son
comprimidos y recubiertos para:
– Establecer condiciones de
anaerobiosis con el fin de promover
el crecimiento de microorganismos
anaerobios útiles o microaerófilos
como Lactobacillus
– Mientras se impide el desarrollo de
los que tienden a descomponer el
forraje (pudrición).
 En suelos poco aireados
hay competencia por el
 El oxígeno es uso del oxígeno
esencial para disponible y ello puede
muchos llevar a un descenso en la
microorganismos proporción de
fijadores de microorganismos aerobios
nitrógeno.  En consecuencia
disminuye la fijación de
nitrógeno y también de la
velocidad de degradación
de la materia orgánica.
 El nivel de aporte de oxígeno
también determina la forma de
metabolización de los nutrientes.
 Los anaerobios facultativos metabolizan los

polisacáridos aerobicamente en presencia
de oxígeno, descomponiendolos hasta
dióxido de carbono y agua con alta
liberación de energía.
 Cuando no hay oxígeno lo hacen
anaerobicamente, mediante el proceso de
fermentación, en el cual la degradación sólo
es parcial y con poca liberación de energía.
pH
 Con pocas
 El pH óptimo para la
mayoría de las excepciones estos
bacterias, algas y microorganismos no
protozoos está crecen por debajo
alrededor de 7. de un pH de 4 o por
encima de un pH 9.

 Los  Thiobacillus,
actinomicetos Acetobacter y la
y las algas son bacteria fijadora de
sensibles a los nitrógeno
ácidos y su pH Beijerinckia, son
óptimo está capaces de crecer y
entre 7.5 y 8. multiplicarse a pH
entre 2.5 y 3.5.

 El pH óptimo para  Ños hongos son
las levaduras y los resistentes a los
hongos varía entre ácidos
3.1 y 6.0, mientras  Algunas especies
sus pH extremos de hongos crecen a
de crecimiento son pH entre 1.6 y 2.0
1.6 y 9.5.

 En suelos con pH
mayores a 7
predominan las
bacterias, en
especial los
actinomicetos, y en
menor proporción
los hongos.
micorrizas.
El efecto del pH afecta el desarrollo de
los microorganismos:
 Cuando el pH baja:
 Declina el número de bacterias
 Mientras sube el de levaduras, hongos y
bacterias resistentes a la acidez.
 A pH extremadamente bajos la
proporción de bacterias puede disminuir
hasta el 60%.

 En suelos ácidos suele
 La acidez del
envolverse la semilla en
suelo
una capa de cal, que
influencia las
neutraliza la acidez
bacterias de
circundante, promueve la
los nódulos
multiplicación de
de la raíz de
Rhizobium y permite
las
buena nodulación de la
leguminosas
leguminosa huésped.

AGUA
 Todos los
microorganismos
necesitan agua,
aunque sus
requerimientos
varían.

 Las formas  Las endosporas
vegetativas de las termoestables
bacterias son producidas por las
menos resistentes a bacterias, como
la desecación que Bacillus y
los hongos o los Clostridium, son
actinomicetos. resistentes a la
desecación.

 Las bacterias
esporuladas, los
actinomicetos y
los hongos son los
contaminantes más
frecuentes del aire
porque son
resistentes a la
desecación.
 En los materiales de  Los suelos
potencial osmótico salinizados suelen
alto el agua es poco tener presiones
asequible a los osmóticas altas que
microorganismos. inhiben el
crecimiento de la
mayoría de los
microorganismos y
raíces, exceptuando
los halófilos.
 El exceso de agua en el suelo
suele causar encharcamiento y
pérdida de oxígeno en los
capilares del suelo lo cual hace
que disminuyan los
microorganismos aerobios y
aumenten los anaerobios.

Técnicas de manejo del suelo
Las poblaciones de microorganismos del

suelo, se pueden:
 Disminuir o erradicar por perturbaciones
importantes del suelo
 Favorecer con prácticas adecuadas.

 FACTORES LIMITANTES DE LA
MICROBIOTA DEL SUELO
 Erosión y baja disponibilidad de nutrientes

 Fertilización mineral y correctivos
 Presencia de antagonistas, parásitos y
depredadores
 Temperatura y pH extremos
 Extremos en los contenidos de aire y
humedad

 Textura del suelo y concentraciones
tóxicas de metales pesados
 Uso de plaguicidas, especialmente los
de amplio espectro. Desinfección,
fumigación y esterilización del suelo
 Inundaciones y malos drenajes

 Aradas profundas, volteo del suelo y
solarización.
 Sistemas de producción y explotación
del suelo (monocultivo, cultivos
intesivos sin manejo adecuado, minería
a cielo abierto).

PRÁCTICAS QUE FAVORECEN LA
DENSIDAD Y LA ACTIVIDAD DE LOS
MICROORGANISMOS
 Mantenimiento de la biodiversidad
dentro de los cultivos y en las
fincas.
 Coberturas vegetales, abonos
verdes y alcolchados
 Inoculación de suelos y semillas
con microorganismos y eliminación
de competidores.
 Incorporación de compost,
fracciones líquidas y sólidas de
biodigestores, humos, excretas,
restos de cosechas y otros
residuos vegetales
 Agentes naturales de control:
control biológico, plaguicidas
botánicos, control cultural.

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Microbiología

María Cecilia Arango Jaramillo

María Cecilia Arango Jaramillo

 Los minerales son compuestos

María Cecilia Arango Jaramillo

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El agua y el viento transportan fragmentos

H2O + SO2  Disuelven

 Los ácidos producidos por

María Cecilia Arango Jaramillo

Origen de la materia orgánica del suelo:

María Cecilia Arango Jaramillo

María Cecilia Arango Jaramillo

 Los mecanismos de sobrevivencia

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 Compuesto por rocas y

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 Arenoso arcillosos: 35% o más de

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Microfauna del suelo

Acumulación Microfauna del suelo

 Disgregación de la materia orgánica

María Cecilia Arango Jaramillo

Reincorporación de microorganismos al suelo

Hongos: Hongos Hongos

Bacterias: transforman residuos fúngicos y

María Cecilia Arango Jaramillo

 Cuando se añade materia orgánica a

 Clamidospora: célula latente, con

María Cecilia Arango Jaramillo

 Las (Gram+)  Las Gram- están

María Cecilia Arango Jaramillo

 La superficie de bacterias y arcillas tienen

María Cecilia Arango Jaramillo

 El suelo es un medio muy

María Cecilia Arango Jaramillo

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Mesófilas 25 a 37o C 5 a 45o C Staphylococcus ,

Termófilas Superior a 40 a 80o C Desulfovibrio,

María Cecilia Arango Jaramillo

 Penicillium crece mejor en suelos más

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 Utilización de energía lumínica

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 Los anaerobios facultativos metabolizan los

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