Enlace peptídico. Péptidos.

 Niveles de organización estructural de las proteínas.

 Estructura y propiedades del enlace peptídico.
 Concepto, nomenclatura y propiedades de los péptidos.
 Ruptura enlace peptídico.
 Péptidos con actividad biológica.
 Niveles estructurales de proteínas

Estruct. cuaternaria

Estructura primaria: Secuencia de una cadena de aminoácidos. Enlaces

covalentes peptídicos.

Estructura secundaria: Conformación regular local. No incluye las cadenas

laterales.

Estructura terciaria: Plegamiento o conformación global. Ordenamiento

estructura secundaria.

Estructura cuaternaria: Disposición espacial adoptada por proteínas formadas

por más de una cadena polipeptídica.
 Péptidos y proteínas

Los péptidos se forman por la unión de los aminoácidos mediante enlaces

covalentes de tipo amida llamados enlaces peptídicos

 Péptido: hasta 50 aminoácidos

 Oligopéptido: péptido pequeño < 20 aminoácidos

 Polipéptido: péptido grande entre 20-50 aminoácidos

 Proteínas: péptido > 50 aminoácidos

 Proteínas oligoméricas: formadas por subunidades idénticas

llamadas protómeros
 Proteínas sencillas y conjugadas (grupo prostético)
Enlace peptídico

Enlace peptídico
 Enlace peptídico

Enlace no favorecido termodinámicamente

G = 10 KJ/mol

La reacción sin catalizar es muy lenta

En la célula la formación del enlace peptídico está acoplado a la hidrólisis

de ATP

Aminoacil tRNA
sintetasa
aa + tRNA aminoacil-tRNA

ATP AMP + PPi

 Péptidos

Residuo Residuo
Amino terminal carboxilo terminal
 Características del enlace peptídico

El enlace peptídico tiene algunas propiedades muy importantes para la

estructura de las proteínas

Es más corto y rígido que un enlace C-N simple

Geometría esencialmente plana. Los átomos que participan en el

enlace (C, O, N, H) están en el mismo plano
 Características del enlace peptídico

Carácter parcial de doble enlace:

 Puede considerarse un híbrido de resonancia
 No se permite giro alrededor del enlace -C-N-

Estruturas resonantes del enlace peptídico

 Características del enlace peptídico

El grupo de átomos alrededor del enlace peptídico puede darse en dos

configuraciones posibles: Trans y Cis

Prolina
 Estructura peptídica

 El enlace peptídico es plano y

rígido

 Hay libre rotación alrededor de

los enlaces C-C y C-N

Ángulo C-C  = -180º a +180º

Ángulo C-N  = -180º a +180º
 Estructura peptídica

 Un oligopéptido tiene muchas conformaciones según enlaces  y 

 Adopta más favorable:

 Energéticamente

 Menor impedimento estérico

 Menor repulsión electrostática

 Estructura peptídica

Residuo Residuo
Amino terminal carboxilo terminal
 Ruptura de los enlaces peptídicos

 Ebullición

• Calentando a (110ºC) en medio ácido (HCl 6M) o base fuerte

 Hidrólisis específica
• Química:
• BrC=N (  lado carboxilo residuos de Metionina)

• Hidroxilamina (  enlaces asparragina-glicina)

• Enzimática (Proteasas):
• Tripsina (  Arginina y Lisina)
• Quimotripsina (  lado carboxilo residuos Tyr, Trp,Phe, Leu y M e
t)
• Trombina (  lado carboxilo residuo de Arginina)
• Carboxipeptidasa A (libera el aa C-terminal, excepto Arg, Lis y Pro )
 Polipéptidos como polianfolitos

Punto
isoeléctrico

pH < pI carga +

pH = pI sin carga

pH > pI carga -
 Péptidos con actividad biológica

 Hormonas:
Insulina
 Oxitocina (9 aa) Cadena A

 Bradikinina (9 aa)
 Insulina (30 aa + 21 aa) Cadena B

 Glucagón (29 aa)

 Antibióticos: Gramidicina S
 Gramidicina S (9 aa cíclico) L- Leu D-Phe

O. rn L-Pro

 Venenos: P. ro L-Val
 -amanitina (8 aa cíclico) Glutation (red)
D-Phe D-Orn

 Antioxidantes: L- Leu

 Glutation (-glutamil-cisteinil-glicina) -Glutamato

 NAC (N-acetil-L-cisteína)

 Proteínas: Cisteína

 Citocromo c (109 aa)

 Quimiotripsinógeno (245 aa) Glicina

 Tiroglobulina (5460 aa)

 Como se nombran los polipeptidos
El orden de los aminoácidos en la proteína.

Por convención, el extremo amino terminal (NH3+) de la cadena polipeptídica

denominado simplemente N-terminal, se escribe a la izquierda de la secuencia, por
ende, el grupo carboxilo o C-terminal, se escribe a la derecha de la secuencia.
Todas las secuencias se leen desde el N-terminal hasta el C-terminal. Esta
convención se debe a que en el ribosoma, que es la enzima que hace los enlaces
peptídicos en la naturaleza, la cadena crece agregando un nuevo aminoácido al
carboxilo terminal, por lo tanto el extremo que emerge primero del ribosoma, es el
N-terminal. En la siguiente figura el dipéptido se lee valina, alanina y no al revés

Tomando en cuenta lo anterior, debe quedar claro una proteína o péptido tendrá
diferentes características dependiendo de la cantidad y cualidad de los grupos
ionizables presentes en la molécula. De manera que la proteína o péptido tendrá, al
igual que los aminoácidos libres, curvas de titulación y pH isoeléctrico (pI)
específicos, en los cuales el pH no sufre variaciones en un campo eléctrico.
 Nombrando a los polipéptidos

La unión de muchos aminoácidos a través de enlaces peptídicos se

denomina poliéptido, que es una cadena sin ramificaciones de residuos de
aminoácidos; así se denominan una vez que están unidos unos con otros. Al
nombrar al polipéptido, los residuos que derivan de los aminoácidos terminados en
-ina, como la glicina, los terminados en –ano, como triptofano y los terminados
en ico, como aspártico, cambian estos sufijos por –il, con la excepción del carboxilo
terminal. Así por ejemplo la valina y la alanina pueden formar al
dipéptido valilalanina, a través de un enlace peptídico (ver figura), o
el tripéptido compuesto por una valina en posición N-terminal, una glicina y en el C-
terminal una leucina, se denomina valilglicilleucina:
 Oligopéptidos
La condensación del grupo a-carboxilo de un aminoácido con el grupo a-amino de
otro, con pérdida de una molécula de agua, hace que los dos aminoácidos queden
unidos por un Enlace peptídico o Enlace amida (en Bioquímica preferimos la
primera de estas dos denominaciones). Los compuestos resultantes reciben el
nombre de Péptidos, con un prefijo indicativo del número de aminoácidos que
entran en su composición. Así, hablamos de dipéptidos (2 aminoácidos), tripéptidos
(3 aminoácidos), tetrapéptidos (4 aminoácidos), etc. En general, denominamos
oligopéptidos cuando se trata de un número relativamente pequeño (en la práctica,
hasta unos 40 aminoácidos) y de polipéptidos cuando el grado de polimerización es
mucho mayor (que puede llegar hasta 1000 aminoácidos).

Todas las proteínas tienen una estructura polipeptídica, es decir, todas están
compuestas por uno o varios polipéptidos. Pero conviene no confundir el término
polipéptido con proteína. Éstas, como veremos, pueden estar formadas por uno o
varios polipéptidos.
El enlace peptídico establecido tiene una serie de propiedades interesantes. Para
ilustrarlas veamos el tripéptido Alanil-alanil-alanina. La unión peptídica tiene
polaridad, dado que se establece entre grupos distintos (un amino y un carboxilo).
Por lo tanto, en un extremo del péptido queda un grupo amino (-NH2) libre; es el N-
término o término amino: Mientras que en el extremo opuesto del péptido queda
un grupo carboxilo (-COOH) libre; es el C-término o término carboxilo:

Convencionalmente, las cadenas polipeptídicas se numeran desde el N-término,

dando el número 1 al aminoácido que lo ocupa, y así sucesivamente hasta llegar al
C-término.