Beruflich Dokumente
Kultur Dokumente
La urea es un ejemplo de compuesto orgánico que forma parte de la orina Urea cristalizada.
http://commons.wikimedia.org/wiki/File:Sample
y que se produce en el riñón. En 1828 el químico alemán Friedrich Wöhler _of_Urea.jpg#mediaviewer/File:Sample_of_Ure
a.jpg
sintetizó urea artificialmente a partir de compuestos inorgánicos
(isocianato de plata y cloruro de amonio). Fue el primer compuesto
orgánico que se sintetizó artificialmente, sin que ningún principio vital
hubiese estado involucrado. El logro de Wöhler es que fue la primera
prueba en contra de la teoría del vitalismo. Ayudó a falsar la teoría, pero
esto no hizo que todos los biólogos la abandonaran de inmediato. Los cuatro humores: colérico, melancólico,
Generalmente se requieren varias pruebas en contra de una teoría para sanguíneo y flemático.
http://commons.wikimedia.org/wiki/File:Alletemp.jpg
que la mayoría de los biólogos acepten la falsación y, a veces, las #mediaviewer/File:Alletemp.jpg
artificialmente.
• Las reacciones químicas que se utilizan son Enzima 3 Enzima 4
diferentes a las del hígado y no hay enzimas arginosuccinato
involucradas, pero el producto final, la urea, es el Ciclo de la urea que tiene lugar en las células del
mismo. hígado (hepatocitos)
Desechos nitrogenados. Aminoácidos y ácidos nucleicos
∙ Bioelementos secundarios.
Forman parte de todos los
organismos vivos, aunque en
menor proporción que los
anteriores (3,9%). Son: Na, K, Ca,
Mg , Cl y Fe.
∙ Oligoelementos. Aunque se encuentran en trazas, en proporciones inferiores al 0,1 % (en cantidades
superiores son tóxicos), estos elementos son imprescindibles, pues desempeñan funciones esenciales en
diferentes procesos bioquímicos y fisiológicos. Algunos oligoelementos, como Cu, Zn, Mn, I, Ni y Co, aparecen
en la mayoría de los organismos y otros, como Si, F, Cr, Li, B, Mo y Al, solo están presentes en grupos
Los bioelementos suelen enlazarse entre sí mediante enlaces covalentes, el tipo de
enlace más fuerte que origina moléculas estables (una molécula es un conjunto de dos
o más átomos enlazados entre sí covalentemente; las moléculas se representan
mediante fórmulas químicas). El enlace covalente se forma cuando dos átomos
adyacentes comparten al menos un par de electrones, siendo uno aportado por cada
átomo.
La fuerza de un enlace enlace covalente
covalente depende del Enlace covalente simple
gas hidrógeno
número de electrones
compartidos:
Fórmula desarrollada Fórmula molecular
1 par: enlace simple
2 pares: enlace doble
3 pares: enlace triple Enlace covalente doble
gas oxígeno
Los electrones que se
comparten en un enlace
covalente se encuentran
siempre en la última capa y
se denominan electrones de Enlace covalente triple
valencia. El número de gas nitrógeno
Los enlaces carbono-carbono pueden originar una gran variedad de moléculas complejas, con forma
de cadena lineal o cíclica, ramificada o sin ramificar.
Metano CH4
CH4
Ácido palmítico
(un ácido graso) CH3 − (CH2)14 −COOH
Los compuestos químicos se clasifican en dos grupos: orgánicos e inorgánicos. Los compuestos orgánicos
incluyen todos los compuestos complejos de carbono encontrados en los seres vivos, pero no los
compuestos simples que contienen carbono tales como los óxidos de carbono, los carbonatos y los
bicarbonatos. Estos y el resto de compuestos químicos son inorgánicos.
Isomería, ciclación y disociación reversible de moléculas y grupos funcionales:
• En presencia de agua las moléculas pueden adoptar formas cíclicas tridimensionales más
estables:
Ciclación de la molécula
de glucosa en agua
Amino
−NH2 Alanina
Electronegatividades relativas
de algunos átomos Sulfhidril
o −SH Cisteína
Átomo Electronegatividad
O 3.5 Fosfato
N 3.0 −PO42- Glicerol fosfato
C 2.5
Metilo
H 2.1
−CH3 Alanina
Algunos compuestos inorgánicos contienen carbono.
Prueba tu mismo:
Carbonatos
• Agua
Compuestos inorgánicos • Sales minerales (carbonatos,
(no sintetizados por los seres vivos fosfatos, cloruro sódico, amonio,
pero imprescindibles para ellos) etc.)
• Gases (oxígeno, dióxido de carbono,
etc.)
Biomoléculas
• Los lípidos son una amplia clase de moléculas que son insolubles en agua,
incluyendo esteroides, ceras, ácidos grasos y triglicéridos. En el lenguaje
común, los triglicéridos se denominan grasas si son sólidos a temperatura
ambiente o aceites si son líquidos.
C5 O H C O H
C O
C4 C1 C OH C C OH H C
C3 C2 C C C C
OH OH OH OH
OH H OH
a. Esqueleto carbonado de la glucosa b. Añadir los grupos alcohol OH c. Completar con H d. Compactar parcialmente
(anillo hexagonal; contamos los C a
partir del más próximo al O y en el
sentido de las agujas del reloj)
La ribosa es también un azúcar sencillo (C5 H10 O5) los
pasos serían:
H
C5 HO C HO C H
O O H
O
C4 C1 C OH C C OH H C
C3 C2 C C C C
OH OH OH OH
OH H OH
a. Esqueleto carbonado de la ribosa b. Añadir los grupos alcohol OH c. Completar con H d. Compactar parcialmente
(anillo pentagonal; contamos los C
a partir del más próximo al O y en
el sentido de las agujas del reloj) La fórmula general de un aminoácido es (R es un grupo
que varía según el aminoácido de que se trate; hay 20
aminoácidos distintos):
La fórmula general de un ácido graso es:
▪ Las proteínas contienen C, H, O y N, mientras que los hidratos de carbono y lípidos contienen C, H y O,
pero no N.
▪ Muchas proteínas contienen azufre (S) pero los hidratos de carbono y lípidos no.
▪ Los hidratos de carbono contienen átomos de C, H y O en una proporción de 1:2:1. Por ejemplo,
glucosa (C6H12O6) o sacarosa (C12H22O11).
▪ Los lípidos contienen relativamente bastante menos oxígeno que los hidratos de carbono. Por
ejemplo, ácido oleico (C18H14O2).
Construye moléculas con Avogadro
“Construcción de biomoléculas”
http://avogadro.openmolecules.net/wiki/Main_Page
1. Dibuje glicina, el aminoácido más sencillo
2. Utilice la herramienta optimizar para crear la molécula en 3D
Actividad:
aminoácido
(elige uno cualquiera)
glucosa ribosa
Descárgate el software
aquí:
http://www.acdlabs.com/resources/freeware/chemsketch/
Y un tutorial aquí:
http://difusion.df.uba.ar/ConectarIgualdad/tutorial_de_
acdchemsketch_freeware.pdf
7. Metabolismo.
El metabolismo es el conjunto de todas las reacciones catalizadas por enzimas en
una célula o un organismo.
La mayoría de las reacciones del metabolismo ocurren en el interior de la célula, aunque algunas
son extracelulares. El metabolismo consta de numerosas vías o rutas metabólicas en las que un
sustrato inicial es transformado paso a paso, mediante pequeñas transformaciones químicas, en
uno o varios productos finales. La mayor parte son cadenas de reacciones, aunque también hay
ciclos. E E E E E
1 2 3 4 5
A B C D E F
Sustrato Producto
inicial metabolitos final
Frecuentemente las rutas metabólicas están interconectadas y tienen metabolitos intermedios
comunes.
http://www.sabiduria.com/turismo/images/metro-londres.gif http://visual.ly/metabolism-map
KEGG: Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes
http://www.genome.jp/kegg-bin/show_pathway?map01100
Desafío: cambiar una letra cada vez, vaya de “Tread” a “Blink”.
Todas las palabras intermedias han de tener sentido … en inglés.
Vías o rutas metabólicas: son cadenas o ciclos de reacciones secuenciales enzimáticas.
El producto de una reacción es el sustrato de la siguiente.
Sustrato inicial
Metabolitos
intermedios
http://highered.mcgraw-hill.com/olc/dl/120070/bio09.swf
Producto final
La inhibición por el producto final detiene la ruta metabólica e impide que se produzca
un exceso de producto final. Es un mecanismo habitual de control del metabolismo.
ADP + P ATP
Macromoléculas Moléculas
de la célula precursoras
Proteínas Anabolismo: Aminoácidos
Polisacáridos Monosacáridos
Reacciones en las que se requiere energía
Lípidos Ácidos grasos
Ácidos nucleicos Nucleótidos
http://laguna.fmedic.unam.mx/lenpres/
8. Anabolismo.
El anabolismo es la síntesis de moléculas complejas a partir de moléculas más
simples, incluida la formación de macromoléculas a partir de monómeros, por
reacciones de condensación.
B CDA
A D A C DA B B
D
C
B C BA
A D A B DC A D
D
C
En todos los grupos de compuestos orgánicos (glúcidos, lípidos, proteínas y ácidos nucleicos)
hay moléculas más pequeñas (unidades o monómeros) y macromoléculas (polímeros).
Monómeros y polímeros en biomoléculas
Grupo Monómeros Polímeros
Triglicéridos y otros
Lípidos Ácidos grasos
lípidos
Glúcidos Monosacáridos Polisacáridos
Polipéptidos y
Proteínas Aminoácidos
Proteínas
Ácidos nucleicos Nucleótidos ADN y ARN
Glúcidos
El catabolismo es la parte del metabolismo en la cual las moléculas más grandes se descomponen en
otras más pequeñas. Las reacciones catabólicas liberan energía y en algunos casos esta energía se
captura en forma de ATP, que luego puede ser utilizado por la célula. El catabolismo incluye, por
ejemplo: