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PRINCIPIOS QUÍMICOS Y
FÍSICOS
factores factores
BIÓTICOS ABIÓTICOS
Compuestos inorgánicos
Agua, sales, ácidos, bases
Compuestos orgánicos
Química del carbono
BIODIVERSIDAD
COMPOSICIÓN QUÍMICA
PROCESOS METABÓLICOS
SIMILARES
Elementos
Sustancias
más simples 96%
Átomo
Pequeña
Propiedades
químicas
(compuestos)
Partículas subatómicas
Partículas de
materia
Átomo neutro
#protones = # electrones
Núcleo atómico
IDENTIDAD DEL TABLA PERIÓDICA
ELEMENTO CORRELACIÓN DE ELEMENTOS
1/1800
Número de protones
(Z) Modelos
de Bohr
Configuración
electrónica
Facilidad e
imprecisión
Peso atómico
Masa atómica
ó DALTON (1800)
UMA
1/12
12C
1.66 x 10-24 g
reactivos productos
Covalente
H-O-H
MOLÉCULAS ORGÁNICAS
• Átomos comparten e
ENLACES • Estabilidad
COVALENTES • Simples y dobles
• Atracción o repulsión
FUERZAS DE
• Desequilibrios enlaces covalentes
VAN DER WAALS • Acercamiento con distancia (equilibrio)
BIOELEMENTOS
97% 99%
O N
H Ca
C 98% P
PROPIEDADES PROTOPLASMA
FISICOQUÍMICAS
PROTOPLASMA CELULAR
CHON
PROPIEDADES FISICOQUÍMICAS
CHON
• Enlaces covalentes
• C, N y O (dobles y triples) VERSATILIDAD
• Elementos más ligeros (como el C)
• Conformación espacial = actividad biológica
• Estructuras tridimensionales variadas
https://www.youtube.com/watch?v=yJu_p-OoZv8
BIOELEMENTOS
Deficiencia de oxígeno
https://youtu.be/WnVxXWrt4wE
BIOELEMENTOS
Principales oligoelementos (sales) del ser humano
Oligos = reducido
Bomba sodio y potasio
https://youtu.be/GMB4LC4Kvb4
GRUPOS FUNCIONALES
https://www.youtube.com/watch?v=U6OwBwcL9A8
Tan solo el 3,5% del agua de nuestro planeta es dulce. Y
de este porcentaje hay que aclarar que el 70% se
encuentra en los casquetes polares en forma de hielo, y
el otro 30% bajo la superficie terrestre en pozos
subterráneos: tan solo el 0,025 del agua potable es
accesible.
• Somos agua
• El agua es de gran importancia para todos los seres vivos; en
algunos organismos, hasta el 90% de su peso corporal proviene
del agua. Los seres humanos poseemos hasta un 78% de agua al
nacer, y aunque vamos perdiendo agua según vamos
madurando, el cuerpo de un adulto alberga hasta un 60% del
precioso líquido.
• El cerebro y el corazón están compuestos de un 73% de agua, y
los pulmones tienen aproximadamente un 83%. La piel contiene
64% de agua, los músculos y los riñones un 79%, e incluso los
huesos son acuosos: poseen un 31% de agua.
EL AGUA
La molécula de agua está compuesta por dos átomos
de hidrógeno y uno de oxígeno unidos por un enlace
covalente. Es decir, los dos átomos de hidrógeno y el
de oxígeno se unen compartiendo electrones. Su
fórmula es H2O.
Cuando dos moléculas de agua están muy cerca entre sí se establece una
atracción entre el oxígeno de una de las moléculas, que tiene carga
parcial negativa, y uno de los hidrógenos de la otra molécula, que tiene
carga parcial positiva. Una interacción de este tipo se denomina enlace o
puente de hidrógeno, y las moléculas de agua se ordenan de tal modo que
cada molécula puede asociarse con otras cuatro. Esta interacción es la
que se da con el hielo.
Los enlaces por puentes de hidrógeno son enlaces
por fuerzas de van der Waals de gran magnitud,
aunque son unas 20 veces más débiles que
los enlaces covalentes; son responsables de
la dilatación del agua al solidificarse, es decir, su
disminución de densidad cuando se congela. En
estado sólido, las moléculas de agua se ordenan
formando tetraedros, situándose en el centro de
cada tetraedro un átomo de oxígeno y en los
vértices dos átomos de hidrógeno de la misma
molécula y otros dos átomos de hidrógeno de otras
moléculas que se enlazan electrostáticamente por
puentes de hidrógeno con el átomo de oxígeno.
La estructura cristalina resultante es muy abierta y
poco compacta, menos densa que
en estado líquido.
El agua tiene una densidad máxima de 1 g/cm³ cuando está a una temperatura de 4 °C,11 característica
especialmente importante en la naturaleza que hace posible el mantenimiento de la vida en medios
acuáticos sometidos a condiciones exteriores de bajas temperaturas.
La dilatación del agua al solidificarse también tiene efectos de importancia en los procesos geológicos de erosión.
Al introducirse agua en grietas del suelo y congelarse posteriormente, se originan tensiones que rompen las rocas.
• El disolvente universal
• Al agua se le conoce como el "disolvente universal" porque
es capaz de disolver más sustancias que cualquier otro
líquido. Esto es importante para todo ser vivo en la tierra ya
que donde quiera que vaya el agua, ya sea a través del aire,
la tierra o a través de nuestros cuerpos, se lleva consigo
sustancias químicas, minerales y nutrientes valiosos. Pese a
lo necesaria que es para la vida, el agua siempre se cobra un
precio: solo has de pensar en la corrosión de los buques que
se encuentran en el mar, o en el Gran Cañon del Colorado.
El agua es un disolvente polar, más polar, por ejemplo, que el etanol. Como tal, disuelve bien sustancias iónicas y
polares, como la sal de mesa (cloruro de sodio). No disuelve, de manera apreciable, sustancias fuertemente apolares,
como el azufre en la mayoría de sus formas alotrópicas, además, es inmiscible con disolventes apolares, como
el hexano. Esta cualidad es de gran importancia para la vida.
Esta selectividad en la disolución de distintas clases de sustancias se debe a su capacidad para formar puentes de
hidrógeno con otras sustancias que pueden presentar grupos polares, o con carga iónica, como: alcoholes, azúcares con
grupos R-OH, aminoácidos y proteínas con grupos que presentan cargas parciales + y − dentro de la molécula, lo que da
lugar a disoluciones moleculares. También, las moléculas de agua pueden disolver sustancias salinas que se disocian
formando disoluciones iónicas. En las disoluciones iónicas, los iones de las sales orientan, debido al campo eléctrico que
crean a su alrededor, a los dipolos del agua, quedando "atrapados" y recubiertos de moléculas de agua en forma de
iones hidratados o solvatados.
Algunas sustancias, sin embargo, no se mezclan bien con el agua, incluyendo aceites y otras
sustancias hidrofóbicas. Membranas celulares, compuestas de lípidos y proteínas, aprovechan esta propiedad para
controlar las interacciones entre sus contenidos químicos y los externos, lo que se facilita, en parte, por la tensión
superficial del agua. La superficie del líquido se comporta como una película capaz de alargarse y al mismo tiempo
ofrecer cierta resistencia al intentar romperla.
La capacidad disolvente es responsable de:
•Las funciones metabólicas.
•Los sistemas de transporte de sustancias en los organismos.
La cohesión es la propiedad por la que las
moléculas de agua se atraen entre sí.
Debido a esta interacción se forman cuerpos de
agua por adhesión de moléculas de agua, las
gotas. Los puentes de hidrógeno mantienen las
moléculas de agua fuertemente unidas, formando
una estructura compacta que la convierte en un
líquido casi incompresible.
Al no poder comprimirse puede funcionar en
algunos animales como un esqueleto hidrostático,
como ocurre en algunos gusanos perforadores
capaces de agujerear la roca mediante la presión
generada por sus líquidos internos. Estos puentes
se pueden romper fácilmente con la llegada de
otra molécula con un polo negativo o positivo
dependiendo de la molécula, o, con el calor.
La fuerza de cohesión permite que el agua se
mantenga líquida a temperaturas no extremas.
El agua cuenta con la propiedad
de la capilaridad, que es la
propiedad de ascenso, o descenso,
de un líquido dentro de un tubo
capilar. Esto se debe a sus
propiedades de adhesión y
cohesión.
Cuando se introduce un capilar en
un recipiente con agua, ésta
asciende espontáneamente por el
capilar como si trepase
"agarrándose" por las paredes,
hasta alcanzar un nivel superior al
del recipiente, donde la presión
que ejerce la columna de agua se
equilibra con la presión capilar. A
este fenómeno se debe, en parte,
la ascensión de la savia bruta,
desde las raíces hasta las hojas, a
través de los vasos leñosos.
El agua puede absorber grandes cantidades de calor que es
utilizado para romper los puentes de hidrógeno, por lo que la
temperatura se eleva muy lentamente.
El calor específico del agua se define como la cantidad de
energía necesaria para elevar la temperatura, en un grado
Celsius, a un gramo de agua en condiciones estándar y es de
1 cal/°C•g, que es igual a 4,1840 J/K•g.
Estado sólido: Todas Estado líquido: Aumenta la energía Estado Gaseoso: La energía
las moléculas se encuentran unidas cinética de las moléculas, por lo tanto, cinética es tal que se
mediante un enlace de hidrógeno el movimiento de las moléculas es rompen todos los enlaces de
mayor produciendo rotura en los hidrógeno quedando todas
enlaces de hidrógeno quedando las moléculas libres.
algunas moléculas sueltas y la mayoría
unidas.
• El agua se expande
• El hielo flota en el agua. Es la única sustancia en la Tierra
que se aumenta de volumen al congelarse. En la
naturaleza todos los demás fluidos se comportan al
contrario con el frío: se tornan más pesados y pequeños.
Esta es una de las razones por la que la que existe vida en
nuestro planeta. Al estar los océanos formados de agua,
esta permitió que durante las glaciaciones solo la parte
superficial del mar se convirtiera en hielo, evitando que
se congelara todo el océano y permitiendo que la vida
pudiera seguir su extraño curso en las profundidades.
• El agua es líquida
• Puede parecer, a priori, algo evidente. Sin
embargo, que el agua sea líquida es una
propiedad que fascina a químicos y físicos por
igual. El agua es líquida a temperatura
ambiente, pero si tuviéramos que predecir el
estado del agua en condiciones normales en
base a su peso molecular, su punto de
ebullición debería estar bastante más por
debajo de los 100 ºC.
Otras propiedades
•pH neutro, en presencia
de CO2 se vuelve
ligeramente ácido.
•Con ciertas sales
forma hidratos.
•Reacciona con los óxidos
de metales
formando bases.
•Es catalizador en muchas
reacciones químicas.
•Presenta un equilibrio de
autoionización, en el cual
hay iones H3O+ y OH−.
•Puede asociarse
transitoriamente con otras
4 moléculas, a esto se
llama “agrupación
oscilante”.
Funciones del agua.
1. Disuelve muchas sustancias. Las sales al disolverse se ionizan y se vuelven químicamente activas.
2. Mantiene la temperatura corporal.
3. Sirve de lubricante del cuerpo (huesos, ligamentos, tendones).
4. El agua presenta también una elevada cohesión y adhesión. Esta propiedad del agua es explotada por las plantas
superiores para el transporte de los elementos nutritivos en disolución desde las raíces hasta las hojas.
5. El agua interviene entre otras en reacciones de hidrólisis, características de la proteína en los procesos digestivos
como la rotura del enlace peptídico entre aminoácidos:
6. Es un reactivo que interviene en procesos químicos. (partición de moléculas)
7. Participa en la síntesis de moléculas complejas a partir de simples moléculas.
8. Función estructural. El volumen y forma de las células que carecen de membrana rígida se mantienen gracias a la
presión que ejerce el agua interna.
9. Función mecánica amortiguadora.
10. Función termorreguladora. Se debe a su elevado calor específico y a su elevado calo de vaporización.
https://www.youtube.com/watch?v=iqeaKpAEbyA
Así afecta el cambio climático al agua del planeta
El deshielo de los casquetes polares y los glaciares, el
aumento del nivel del mar, la sequía, las lluvias
torrenciales... El calentamiento global cambiará también
nuestra relación con el agua, tanto dulce como salada y la
pregunta es, ¿estamos preparados para afrontar el
cambio?
1
• Equilibrio químico
• Los mares, que cubren el 71 % de nuestro
planeta azul, absorben actualmente tanto
CO2 generado por actividades humanas y
tanta energía del Sol que la química y las
temperaturas de las aguas marinas están
poniendo en peligro a muchos organismos.
2
• Ecosistemas en peligro
• Los cambios en el medio
marino afectan a los seres que
viven en el agua, como los
corales y a las especies de
dependen de ellos.
3
• Reservas subterráneas
• Las interacciones dinámicas entre el cambio
climático y los recursos de agua dulce en
tierra están estrechamente vinculadas a la
disponibilidad de agua de buena calidad
para el consumo humano. Actualmente, al
menos la mitad de la población mundial
depende del agua subterránea para un
consumo de agua seguro.
4
• Superpoblación
• A partir de la actual previsión de crecimiento
urbano se espera que hacia 2050 la
demanda haya aumentado un 55 %, de
modo que deberemos gestionar con
prudencia el consumo futuro.
5
• El deshielo
• El agua dulce congelada en el Ártico, en
Groenlandia, en la Antártida y en todas las
regiones alpinas del mundo se está
derritiendo y yendo a parar a los océanos,
ríos y suelos de todo el planeta.
6
A medida que cambia el clima, cambiarán también los recursos de agua dulce y salada
sobre los que se basan nuestras sociedades y economías. Y a medida que cambia el clima,
cambiará también –o debería— nuestra relación con el agua.
Sea como fuere tendremos que aprender a lidiar con un futuro complicado donde el agua,
la tierra, la atmósfera y todos los seres vivos que en ella habitamos cambiarán para
siempre.
CLASIFICACIÓN DE LAS
MOLÉCULAS BIOLÓGICAS
SEGÚN SU FUNCIÓN
PROPIEDADES MOLÉCULAS
CÉLULAS
• ORGÁNICAS
• INORGÁNICAS
Cuatro categorías principales:
• Proteínas
• Carbohidratos
• Lípidos
• Ácidos nucleicos
FUENTES DE ENERGÍA
(ROMPIMIENTO)
2. ELEMENTOS UNITARIOS PARA CONSTRUIR
MACROMOLÉCULAS
PRECURSORES DE:
Azúcares Monosacáridos,
disacáridos y
polisacáridos
https://www.youtube.com/watch?v=Jvd9txq-Qw0
Monosacáridos
Monosacáridos: Azúcares mononucleares,
cristalinos, muy solubles en agua e insolubles en
disolventes polares.
Cn(H2O)n
El principal monosacárido es la glucosa, fuente de
energía de las células.
Poseen de tres a
siete átomos de carbono y su fórmula
empírica es (CH2O)n, donde n ≥ 3. Se
nombran haciendo referencia al
número de carbonos (3-7) y terminan
con el sufijo -osa.
-OH hemiacetálico (la unión de cetona y alcohol) libre, por lo que dan positivo a la reacción con reactivo
de Fehling, a la reacción con reactivo de Tollens, a la Reacción de Maillard y la Reacción de Benedict.
Existen dos formas en las cuales los azúcares
se polimerizan: enlaces alfa o beta:
Para distinguir entre enlaces alfa y beta, examine la posición
del hidrógeno en el primer carbono de la molécula . En el
enlace alfa se representa hacia arriba, y en el beta hacia
abajo.
No está ramificada y todos los átomos
de carbono menos uno contienen un
grupo alcohol (-OH). El átomo de
carbono restante tiene unido un
grupo carbonilo (C=O). Si este grupo
carbonilo está en el extremo de la
cadena se trata de un
grupo aldehido (-CHO) y el
monosacárido recibe el nombre
de aldosa. Si el carbono carbonílico
está en cualquier otra posición, se
trata de una cetona (-CO-) y el
monosacárido recibe el nombre
de cetosa. ALDOSAS CETOSA
Son reductores es decir que presentan Anómeros α y β de la fructosa, un ejemplo de cetosa. El
equilibrio con la forma abierta, grupo cetona lo forma el carbono que establece un doble
presentan mutarrotación (cambio enlace con el oxígeno.
espontáneo entre las dos formas
cicladas α (alfa) y β (beta)
Estos azúcares constituyen las unidades monómeras de
los hidratos de carbono para formar los polisacáridos.
Ciclación
En disolución, los monosacáridos pequeños se
encuentran en forma lineal, mientras que las
moléculas más grandes ciclan su estructura. La
estructura lineal recibe el nombre de Proyección
de Fischer; la estructura ciclada de Proyección
de Haworth. En la representación de Haworth la
cadena carbonada se cicla situada sobre un
plano. Los radicales de la cadena se encuentran
por encima o por debajo de ese plano.
La estructura ciclada se consigue en
aldopentosas y hexosas. El enlace de ciclación se
genera entre el carbono que posee el grupo
funcional y el carbono asimétrico más alejado
del grupo funcional. Cuando el carbono tiene un
grupo aldehído, como grupo funcional, el enlace
recibe el nombre de hemiacetálico. Cuando el
carbono tiene un grupo cetona, como grupo
funcional, el enlace recibe el nombre
de hemicetálico.
La molécula ciclada puede adquirir el aspecto de un pentágono
o de un hexágono. Los monosacáridos ciclados con aspecto de
pentágono reciben el nombre de Furanosas. Los
monosacáridos ciclados con aspecto de hexágono reciben el
nombre de Piranosas.
Isomería
La isomería es una característica que aparece
en aquellas moléculas que tienen la misma
fórmula empírica, pero presentan
características físicas o químicas que las hacen
diferentes. A estas moléculas se las
denomina isómeros.
•Isomería de función
Los isómeros se distinguen por tener distintos
grupos funcionales. Las aldosas son isómeros
de las cetosas.
• Isomería espacial
•Triosa: gliceraldehído.
•Tetrosas: eritrosa, treosa.
•Pentosas: ribosa, arabinosa, xilosa, lixosa.
•Hexosas: alosa, altrosa, glucosa, manosa, gulosa, idosa, galactosa, talosa.
CETOSAS
•Triosas: dihidroxiacetona.
•Treosas: eritrulosa.
•Pentosas: ribulosa, xilulosa.
•Hexosas: fructosa, psicosa, sorbosa, tagatosa.
•Heptosas: sedoheptulosa.
Propiedades químicas
1. Poder reductor.
• El poder reductor se debe a las características reductoras del grupo carbonilo. La reacción frente a los
reactivos Tollens, Benedict o Fehling, da como primer producto ácido glucónico. Esta propiedad química es utilizada en
azúcares reductoras en orina.
2. Formación de glicósidos.
• La formación de glicósidos ocurre cuando reacciona un monosacárido con un alcohol. Este tipo de reacción puede ocurrir
también entre dos monosacáridos dando lugar a un disacárido.
• Este enlace que es capaz de unir largas cadenas de monosacáridos, se denomina enlace glicosídico.
• Un fenómeno interesante de los monosacáridos es el llamado mutarrotación, el cual se debe a libre rotación del hidroxilo (OH)
e hidrógeno del grupo carbonilo, de forma que surgen dos compuestos isómeros α y β, los cuales se encuentran en equilibrio
en solución y solo se diferencian en la posición del OH del grupo carbonilo.
• Todos los monosacáridos son reductores, es decir, su grupo carbonilo es capaz de reaccionar como tal. Esto es importante en la
industria alimentaria, porque el poder reductor está relacionado directamente con la capacidad de formar colores y aromas de
tostado por reacción con la proteínas.
Disacáridos
Disacáridos: Azúcares mononucleares, cristalinos, C12H22O11
muy solubles en agua e insolubles en disolventes
polares.
Formados por la condensación (unión) de
dos monosacáridos mediante un enlace O-glucosídico (con
pérdida de una molécula de agua) pues se establece en forma
de éter siendo un átomo de oxígeno el que une cada pareja de
monosacáridos, mono o dicarbonílico, que además puede ser α
o β en función del –OH.
El carácter reductor se da en un
disacárido si uno de los
monosacáridos que lo forman tiene
su carbono anomérico (o carbonílico)
libre, es decir, si este carbono no
forma parte del enlace O-glucosídico.
Dicho de otra forma, si el enlace O-
glucosídico es monocarbonílico el
disacárido resultante será reductor
(maltosa, celobiosa, etc.), mientras
que si el enlace O-glicosídico es
dicarbónílico el disacárido resultante
será no reductor (sacarosa,
trehalosa).
•Lactosa: formada por la unión de una glucosa y una galactosa. Es el azúcar de la leche. Tiene poder
reductor .
•Maltosa, isomaltosa, trehalosa y celobiosa: formadas todas por la unión de dos glucosas, son
diferentes dependiendo de la unión entre las glucosas. Todas ellas tienen poder reductor, salvo la
trehalosa.
(C8H13O5N)n
Son polímeros cuyos constituyentes (sus
monómeros) son monosacáridos, los cuales se
unen repetitivamente mediante enlaces
glucosídicos.
Principales polisacáridos
•Almidón
•Glucógeno
•Celulosa
•Quitina
Polisacárido - Quitina
N-acetilglucosamina
La lignina presente en sulfitos residuales de celulosa, por ejemplo, de la industria de papel. Los jugos
concentrados matrices (licor negro) son químicamente tratados con álcali a temperatura y presión elevadas en la
presencia de oxidantes. La vainillina formada es separada de los derivados, particularmente acetovanillone, por
extracción, destilación y cristalización.
Biosíntesis
Polinización: https://www.youtube.com/watch?v=1RdoTcDD2EU
Cultivo: https://www.youtube.com/watch?v=g2bkm3ff5As
Polisacárido - Celulosa
moléculas de β-glucosa
(C6H10O5)n
La celulosa es un hidrato de carbono complejo, que tiene ciertas características especiales como rigidez e insolubilidad en el agua, las
cuales se relacionan directamente con las funciones que este carbohidrato tiene sobre el organismo.
Importancia: La celulosa sirve como sostén de las plantas,
además de la rigidez y la insolubilidad. La celulosa no puede
ser digerida por el sistema digestivo ya que no hay enzimas
que lo puedan realizar, por lo tanto actúa directamente
estimulando las paredes intestinales.
Por otra parte la celulosa de los alimentos vegetales puede
serte útil para eliminar toxinas,
arrastra sustancias como grasas e hidratos de carbono
simple y las elimina del cuerpo, reduciendo así el colesterol,
los triglicéridos y la glucosa en sangre. Esta acción sobre el
intestino también ayuda a reducir de peso, ya que evita que
un porcentaje de las grasas de los alimentos se absorban. Anselme Payen descubre la celulosa y Hyatt Manufacturing
Company produce el primer polímero termoplástico con éxito
Origen, preferentemente vegetales de hojas verdes, en 1870, el celuloide.
zanahoria, brócoli, legumbres (lentejas, garbanzos, La "seda artificial" a partir de la celulosa comenzó su
guisantes), habas, frutos secos, frutos desecados, frutas con producción en la década de 1890.
cáscara o piel.
El algodón: Contiene las fibras más largas, por lo que se emplea para fabricar ropa. Su
capacidad de absorber agua se debe a que no todos sus átomos de oxígeno están
contenidos en enlaces por puentes de hidrógeno, por lo que algunos de sus grupos -OH
pueden interaccionar con moléculas de agua.
https://www.youtube.com/watch?v=nyua4mO5KSg
Polisacárido – Almidón
(C6H10O5)n
https://www.youtube.com/watch?v=NfANvrrRl4Q
Polisacárido - Glucógeno
C24H42O21
VIDEO: https://youtu.be/JAjZv41iUJU
https://www.youtube.com/watch?v=XfyGv-xwjlI
Importancia de los carbohidratos
No olvidar que:
Otras funciones
La mayoría de las células de cualquier ser vivo suelen disponer este tipo de
moléculas en su superficie celular. Por ello están involucrados en fenómenos de
reconocimiento celular (ejemplo: Complejo Mayor de Histocompatibilidad),
protección frente a condiciones adversas (Ejemplo: Cápsulas polisacarídicas en
microorganismos) o adhesión a superficies (ejemplo: la formación de biofilmes
o biopelículas, al actuar como una especie de pegamento).
Fin de los Según la composición
https://www.youtube.com/watch?v=4Pb486AmYfI
https://www.youtube.com/watch?v=s-wi_lBHMOo
https://www.youtube.com/watch?v=2gB71K63_qs
https://www.youtube.com/watch?v=0AuiVh2phgc
PRECURSORES DE:
Aminoácidos proteínas
Los aminoácidos son sustancias orgánicas que contiene al
menos un grupo amino (-NH2) y al menos un grupo ácido,
que siempre es el grupo carboxilo (-COOH) excepto en el
caso de la taurina (que es -SO3H). De esta manera se puede
establecer una fórmula estructural general para todos los
aminoácidos, que es la que podemos ver en la figura. En ella
R es la cadena lateral que es distintiva para cada
aminoácido.
H2O
Los aminoácidos:
•Apolares o hidrófobos
• Alifáticos: Alanina, valina, prolina, metionina, leucina e
isoleucina
• Aromáticos: Fenilalanina y triptófano
Neurotransmisores, antioxidantes
Agentes vasoactivos. Regulan la presión arterial. Un ejemplo es
la angiotensina II, un octapéptido que se origina mediante la
hidrólisis de una proteína precursora la angiotensinógen.
Hormonas.
Oxitocina: nonapéptido segregado por la hipófisis. Provoca la
contracción uterina y la secreción de leche por la glándula
mamaria, facilitando el parto y la alimentación del recién nacido.
Vasopresina: nonapéptido que aumenta la reabsorción de agua en
el riñón (hormona antidiurética).
Somatostatina: 14 aminoácidos. Inhibe la liberación de la hormona
del crecimiento.
Las proteínas son macromoléculas formadas por cadenas
lineales de aminoácidos y compuestas por carbono (C),
hidrógeno (H), oxígeno (O) y nitrógeno (N). Además suelen tener
pequeñas cantidades de fósforo (P) y azufre (S).
Insulina: 51 aminoácidos. Estimula la absorción de glucosa por
parte de las células (disminuye la presencia de glucosa en
sangre).
Proteínas “en primer lugar”
Las interacciones carga-carga se dan entre
grupos polares y cargados de las cadenas
laterales de los aminoácidos componentes
del polipéptido, puesto que los
grupos carboxilo y amino del carbono alfa
están implicados en el enlace peptídico.
Las cadenas laterales de muchos
aminoácidos se comportan como
donadores o como aceptores de enlaces
de hidrógeno. Si bien los enlaces de
hidrógeno son débiles en disolución
acuosa. Su gran número puede estabilizar,
y lo hace la estructura terciaria proteica.
https://youtu.be/I3_tHT1bhMA
Estructura primaria
Las proteínas tiene múltiple niveles de estructura.
La básica es la estructura primaria, está determinado por el
orden de sus aminoácidos . Por convención el orden de
escritura es siempre desde el grupo amino-terminal hasta el
carboxilo final.
El establecimiento de enlaces peptídicos entre
los distintos AA que forman la proteína se origina
una cadena principal o "esqueleto" a partir del
cual emergen las cadenas laterales de los
aminoácidos.
La función de una proteína depende de su
secuencia y de la forma que ésta adopte.
El 25% de las
proteínas
solubles tienen
hélices alfa.
Los AA alanina,
glutamina,
leucina y
metionina se
encuentran
formando parte
de hélices alfa.
β-queratina y alfa-queratina
VIDEO: https://www.youtube.com/watch?v=HN4NqHFXNA0
Anchiornis huxleyi
Muchas proteínas contienen tanto hélices α como láminas β,
aunque algunas presentan solo un tipo de estructura
secundaria (o no forman ninguna). aminoácido prolina
Dominio
Motivo o supersecundaria
Los motivos
hélice-vuelta-hélice están presentes en factores de transcripción homeóticos. Los genes homeóticos son genes que
participan en el desarrollo de los organismos y que mediante el control de la transcripción los genes activan del
crecimiento y desarrollo de las células.
Dominios de unión al ADN
Dominio hélice-vuelta-hélice.
4 hélices alfa.
Las hélices 2 y 3 están separadas por un giro B de tal manera
que se queda en ángulo recto.
Una o dos hélices se unen al surco mayor del ADN.
La estructura terciaria se estabiliza mediante enlaces que se establecen entre determinados grupos de las cadenas
laterales:
Los enlaces propios de la estructura terciaria pueden ser de dos tipos: covalentes y no covalentes.
La distribución de residuos
polares y no polares pone en
claro una faceta clave de la
arquitectura proteica, función y
regulación.
El emparejamiento de los grupos carboxilos y amino mediante puentes de hidrógeno se da debido a que
la punta de la cadena principal se encuentra hacia el interior que es hidrofóbico, con respecto al exterior
que es más polar. Las interacciones de Van der Waals entre las cadenas laterales fuertemente
empaquetadas también contribuyen a la estabilidad de la proteína.
Las interacciones del grupo R que contribuyen a la estructura terciaria
conforman toda la gama de enlaces no covalentes.
Por ejemplo, los grupos R con cargas similares se repelen entre sí,
mientras que aquellos con cargas opuestas pueden formar un enlace
iónico.
EXCEPCIÓN DE LA REGLA
La porina presenta distribución invertida, el exterior es hidrofóbico,
mientras que el centro contiene un conducto acuoso lineal con
aminoácidos polares (hidrófilo) y cargados
Las porinas son proteínas con
estructura barril β formadas por láminas
β.Pertenecen a las proteínas integrales de
membrana, que son las que se ubican a
través de una membrana celular y
funcionan como poros a través de los
cuales las moléculas se pueden difundir. A
diferencia de otras proteínas de
transporte de membranas, las porinas son
lo suficientemente grandes para permitir
procesos de difusión pasiva, por tanto
actúan como canales que son específicos
para diferentes tipos de moléculas. Están
presentes en la membrana exterior de las
bacterias gram-negativas y
algunas bacterias gram-positivas del
grupo Mycolata,
las mitocondrias y cloroplastos.
Hay dos tipos de proteínas, según su estructura
terciaria:
En algunas proteínas, la desnaturalización puede revertirse (renaturalización): dado que la estructura primaria
del polipéptido sigue intacta (los aminoácidos no se han separado), es posible que recupere su funcionalidad si
regresa a su entorno normal, esto es posible a proteínas chaperonas. No obstante, en otras ocasiones la
desnaturalización es permanente. Un ejemplo de desnaturalización irreversible de la proteína ocurre al freír un
huevo.
Estructura cuaternaria
• Proteínas desplegadas o
parcialmente desplegadas • Unen directamente
• DEGRADADAS • Más estudiadas
• 60 Kda (Hsp60)
Citosol y
mitocondria PROCARIOTAS
ORGANELOS
RE
EUCARIOTAS
ARQUEOBACTERIAS
Bacterias
Chaperonas y chaperoninas
(1) Chaperonas de diversos tipos se
unen a los polipéptidos recién
2 sintetizados en los ribosomas, a
proteínas que atraviesan las
3 membranas de diversos orgánulos (2)
o a proteínas que se han
desnaturalizado debido a cualquier
tipo de estrés (3).
Esta unión de control permite evitar
que las proteínas alcancen un estado
de agregación irreversible.
Las chaperonas en general pueden
tener un papel activo en el
1 plegamiento de las proteínas aunque
en la mayor parte de los casos parecen
transportar los polipéptidos
desnaturalizados hasta las
chaperoninas, donde son plegados.
En resumen, los resultados obtenidos hasta la fecha nos
muestran a las chaperoninas como unas máquinas moleculares
con una arquitectura ideada por la naturaleza para tratar un
problema general, el del plegamiento de proteínas, utilizando
para ello un mecanismo que aunque ineficiente desde el punto
de vista energético se adapta a un gran número de proteínas.
Durante la evolución natural de los organismos, esa misma
arquitectura ha sido utilizada por otra chaperonina para tratar
de forma específica y muy eficiente el problema del
plegamiento de dos proteínas citoesqueléticas vitales para la
célula como son la actina y la tubulina.
Enzimas
El centro activo es una cavidad existente en la
superficie de la enzima que está forrada
interiormente por una serie de restos de
aminoácidos.
• Aminoácidos catalíticos.- Son uno o más
aminoácidos cuyas cadenas laterales R
poseen unas peculiaridades químicas tales
que los facultan para desarrollar una
función catalítica. Constituyen el verdadero
centro catalítico del enzima.
• Aminoácidos de unión.- Son una serie de
aminoácidos cuyas cadenas laterales R
poseen grupos funcionales que pueden
establecer interacciones débiles (puentes
de hidrógeno, interacciones iónicas, etc.)
con grupos funcionales complementarios
de la molécula de sustrato. Su función
consiste en fijar la molécula de sustrato al
centro activo en la posición adecuada para
que los aminoácidos catalíticos puedan
actuar.
• Los aminoácidos de la cadena
polipeptídica del enzima, los que no
forman parte del centro activo, tienen la
importante misión de mantener la
conformación tridimensional
catalíticamente activa del enzima; sin ella
no existiría centro activo y el enzima no
podría interactuar con su sustrato.
Proteína que cataliza las reacciones bioquímicas del
metabolismo. Las enzimas actúan sobre las moléculas
conocidas como sustratos y permiten el desarrollo de los
diversos procesos celulares. Tienen 2.500 aminoácidos
hasta las que, sin embargo, rondan los 50.
Es importante destacar que las enzimas no modifican el
balance energético ni el equilibrio de aquellas reacciones en
las que intervienen: su función se limita a ayudar a acelerar
el proceso. Esto quiere decir que la reacción bajo el control
de una enzima alcanza su equilibrio de manera mucho más
rápida que una reacción no catalizada.
Se estima que las enzimas catalizan cerca de 4.000
reacciones bioquímicas diferentes. Existen distintas
moléculas que afectan la actividad de las enzimas. Se
conoce como inhibidor enzimático.
Ejercicio en clase.
Ejercicio:
Las funciones de los lípidos también son variadas. Diversas clases de moléculas lipídicas son componentes
estructurales importantes de las membranas celulares. Otro tipo, las grasas y los aceites son almacenes de
energía eficientes. Otras clases de moléculas lipídicas son utilizadas como señales químicas, vitaminas o
pigmentos. Por último, algunas moléculas lipídicas que se encuentran en las cubiertas externas de varios
organismos tienen funciones protectoras o impermeables.
Por esta diversidad de estructura se clasifican en:
1. Ácidos grasos
2. Triacilgliceroles
3. Ésteres de ceras
4. Fosfolípidos (fosfoglicéridos y esfingomielinas)
5. Esfingolípidos (moléculas que contienen el aminoalcohol esfingosina)
6. Isoprenoides (moléculas formadas por unidades repetidas de isopreno, un hidrocarburo ramificado de
cinco carbonos)
Tipos de lípidos por su bioquímica
Los lípidos son un grupo muy heterogéneo que usualmente se
subdivide en dos, atendiendo a que posean en su
composición ácidos grasos (lípidos saponificables) o no los
posean (lípidos insaponificables):
Funciones diversas
Las grasas juegan un papel vital en el mantenimiento de piel y cabello saludables, en el aislamiento de los órganos corporales
contra el shock, en el mantenimiento de la temperatura corporal y promoviendo la función celular saludable. Además, sirven
como reserva energética para el organismo. Las grasas son degradadas en el organismo para liberar glicerol y ácidos grasos
libres.
https://www.youtube.com/watch?v=bQREuNMBk2k
Propiedades
Densidad: existe una relación lineal entre el contenido en G+C y la densidad del
ADN determinada en un gradiente de densidad. A mayor contenido en G+C mayor
densidad posee el ADN.
Basándose en múltiples estudios de la densidad de los ADNs de diferentes
organismos y de su composición en bases nitrogenadas, se ha establecido una
fórmula empírica que relaciona la densidad de flotación (ρ) con el contenido en
G+C expresado en moles por ciento. Está fórmula es la siguiente: ρ = 1,660 +
0,00098(G+C).
Desnaturalización: la proporción A+T/C+G está relacionada en primer lugar con la
estabilidad de la molécula de ADN de doble hélice. Cuanto mayor es el contenido
en G+C de una molécula, mayor cantidad de pares G-C presentará, como
consecuencia tendrá una mayor cantidad de triples enlaces y, por consiguiente,
será necesario suministrar una mayor cantidad de energía a esa doble hélice para
separar sus dos hebras (desnaturalización o fusión del ADN). Cuanto mayor es el
contenido en G+C mayor cantidad de calor que hay que suministrar a un ADN de
doble hélice para desnaturalizarlo. La temperatura de fusión (Tm) necesaria para
desnaturalizar la mitad del ADN de una mezcla (punto medio de la reacción ADN
doble hélice ® ADN hélice sencilla) esta directamente relacionada con el
contenido en G+C, a mayor contenido en G+C mayor temperatura de fusión (Tm).
Absorbancia a 2.600 Å: El estado físico de los ácidos nucleicos está relacionado con su capacidad de absorción
de la luz ultravioleta (UV) a 2.600 Å. El menor grado de absorción se produce en estado de doble hélice, la
absorción aumenta cuando se produce la desnaturalización pasando a estado de hélice sencilla (efecto
hipercrómico, aumento de la absorbancia) y, por último, si degradamos este ADN de hélice sencilla a nivel de
nucleótidos libres, de nuevo aumenta la absorbancia.
El ADN de los virus y las bacterias en su mayoría sólo tiene secuencias que están una sola vez en el genoma (secuencias
únicas).
Los organismo más complejos, como los eucariontes, presentan distintos tipos de secuencias en su genoma. Los
eucariontes tienen secuencias únicas (SU), secuencias de bajo número de copias (SBNC, 2-10 copias), secuencias repetidas
(SR, alrededor de 102 copias) y altamente repetidas (SAR, 103 a 106copias).
Las curvas Cot de organismos eucariontes con diferentes tipos de secuencias, poseen varios puntos de inflexión. Cada
uno de ellos correspondiente a un tipo de secuencias (únicas, moderadamente repetidas, y altamente repetidas).
El Cot ½ es directamente proporcional a la complejidad del ADN del organismo. Valores de Cot ½ bajos (10-4 a 10-1)
corresponden a secuencias altamente repetidas, valores de Cot ½ comprendidos entre 10 y 102 corresponden a
secuencias moderadamente repetidas y las secuencias únicas o de bajo número de copias dan lugar a valores de Cot ½
altos (mayores de 103) .
Sin embargo, la proporción entre (A+T) y (G+C) era característica de cada organismo, pudiendo tomar por tanto, diferentes
valores según la especie estudiada. Este resultado indicaba que los ácidos nucleicos no eran la repetición monótona de un
tetranucleótido. Existía variabilidad en la composición de bases nitrogenadas debido a la relación con la densidad y la
temperatura de fusión.
En la siguiente tabla se observan las proporciones de las bases nitrogenadas en algunos organismos.
Procedencia del ADN A G C T 5-Me-C
Timo de Bovino 28,2 21,5 21,2 27,8 1,3
Esperma de bovino 28,7 22,2 20,7 27,3 1,3
Germen de trigo 27,3 22,7 16,8 27,1 6,0
Igualmente, en la siguiente tabla puede observarse como la proporción A+T/G+C varia de un organismo a otro.
•Las dos hélices por razones de complementariedad de las bases nitrogenadas son antiparalelas, teniendo
secuencias de átomos inversas. Una hélice lleva la secuencia 5’P → 3’ OH , mientras que la hélice
complementaria sigue la secuencia de átomos 3’OH → 5’P.
Watson y Crick (1953) sugería varías propiedades importantes del material hereditario:
•Las reglas de complementariedad de las bases nitrogenadas A-T y G-C sugieren un forma sencilla de
replicación del material hereditario. Esta forma sencilla de replicación se denomina método
Semiconservativo (Cuando el ADN se replica sus dos hélices se separan y cada una de ellas sirve de molde
para sintetizar una nueva hélice siguiendo las reglas de apareamiento de las bases nitrogenadas).
•La mutación a nivel molecular consistiría en un cambio en la secuencia de bases nitrogenadas del ADN.
•Al no existir ninguna restricción en la secuencia de bases nitrogenadas, el ADN poseía la suficiente
variabilidad como para ser el material hereditario.
El ADN funciona como el almacén de la información genética y
se localiza en los cromosomas del núcleo, las mitocondrias y los
cloroplastos de las células eucariotas. En las células procariotas
el ADN se encuentra en su único cromosoma y, de manera
extracromosómica, en forma de plásmidos.
Superenrollamiento del DNA
Arrollamiento del DNA sobre sí mismo como
consecuencia del desenrollamiento o
sobreenrollamiento de la hélice de DNA. En DNAs
circulares o con lazos cerrados, al retorcer el DNA
alrededor de su propio eje, cambia el número de
vueltas de la doble hélice, de modo que para
recuperar la estabilidad, la molécula se arrolla
sobre sí misma (superenrollamiento) formando
una superhélice de sentido opuesto al giro inicial.
El giro se produce en sentido de superhélice
levógira (superenrollamiento positivo), y si es en
sentido contrario, se forma una superhélice
dextrógira (superenrollamiento negativo).
En la naturaleza, el DNA circular normalmente se
encuentra superenrollado negativamente.
El DNA eucariótico también se encuentra
superenrollado como consecuencia de su
asociación con los nucleosomas.
El modelo de la Doble Hélice propuesto por Watson y Crick está basado en estudios del ADN en disolución (hidratado).
https://www.youtube.com/watch?v=0wOf2Fgi3DE
Según la función biológica que desempeñan podemos
distinguir los siguientes tipos de ARN:
Plantas carnívoras
https://www.agenciasinc.es/Noticias/Las-plantas-carnivoras-utilizan-las-matematicas-para-cazar-
a-sus-presas
LIBRO DE BIOQUÍMICA:
https://books.google.com.ec/books?id=HRr4MNH2YssC&pg=PA48&lpg=PA48&dq=residuos+hidro
f%C3%B3bicos&source=bl&ots=LVtEJ0xr8z&sig=GQH17tXiXwjNvF5XTqnlAW7qPac&hl=es&sa=X&
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