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Síntesis de RNA en

procariotes
Trascripción en Procariotes

Trascripción

mRNA

Descubierta de RNA polimerasa

Regulación de la expresión génica

Modelo de estudio de transcripción en


eucariotes

Modelo: E. coli
Historia del descubrimiento
• Descubrimiento de la RNA polimerasa de E. coli: Severo
Ochoa de Albornoz (1905-1993) español.

• Síntesis del ácido ribonucleico (ARN) y del ácido


desoxirribonucleico (ADN): Severo Ochoa y Kornberg
(1918-2007)

• 1959: Premio Nobel de Fisiología y Medicina.

• Roger Kornberg (Universidad de Stanford) elucidación


de la estructura tridimensional de la RNApol II y DNA pol.
• 2006: Premio Nobel de Química
TRANSCRIPCIÓN DE ADN EN ARN

• Transcripción: la secuencia de
desoxirribonucleótidos en el ADN
constituye la plantilla para la
síntesis de una secuencia
complementaria de
ribonucleótidos en el ARN.

• Tres tipos funcionales de ARN se


transcriben de los genes:
ARNm, ARNr, ARNt.
Tipos y funciones de RNA

• Mensajero: mRNA es el que lleva el mensaje, es decir


el que codifica la secuencia de los aminoácidos (AA)
en las proteínas.

• Ribosomal: rRNA forma parte de lo ribosomas.

• Transferencia: tRNA activa a los aminoácidos y los


transporta hasta los ribosomas, para la síntesis de las
proteínas.
Gene (Unidad Transcripcional)
CADENAS DE UN GEN
RNA polimerasa en
procariotes
En procariotes solo hay un tipo

Enzima que cataliza la polimerización


de ribonucleótidos trifosfato (NTPs) a
partir de un molde.

Síntesis
Dirección 5´-3´

No requiere primer RNA (de novo)


La transcripción inicia en un sitio en el
comienzo de un gen
RNA Pol E. Coli
• Crab Claw
RNApol en E. coli
Holoenzima (enzima completa)

Separación
bioquímica

Núcleo de la enzima Factor sigma (Mr 70.000)

Adición de NTPs 2 1
1
Unión de la
polimerasa al ADN 1 ´
plantilla
Reconoce el sitio de inicio
W: omega de la transcripción en la
cadena codificadora

Dirigir la síntesis del polímero Factor sigma para promotores de


de ARN proteínas Hsp (Mr 32.000)
Acción de RNA polimerasas

• Síntesis de ARN: dirección 5´- 3´.


• Los ribonucleótidos solo pueden añadirse a un grupo 3´OH.
• El punto de partida para la síntesis de ARN debe estar en el extremo
5´ del gen.
• La ARN polimerasa se une a una región del ADN que incluye la
primera base que debe ser copiada.
Etapas de la transcripción
• Initiation
• Elongation
• Termination
The sigma Factor Mediates Binding of
Polymerase to the Promoter
• Factor sigma
Bacteria contain a variety
of sigma factors that
specifically recognize
different promoter
sequences. It is therefore
the particular sigma factor
utilized by a given RNA
polymerase that
determines which genes
will be transcribed by that
polymerase
holoenzyme.
Caja TATA o Pribnow box
Sigma factors bind to specific sequences that
define bacterial promoters
Subunidad 
se une aqui

Complejo cerrado : Unión inicial entre polimerasa y promotor  DNA no


desenrrollado

Complejo abierto: RNA pol abre 14 nt DNA -12 hasta +2


Después de 10 nt adicionados la subunidad  se libera de RNA pol dejando el
promotor y moviéndose a lo largo del molde de DNA
The sigma Factor Mediates Binding of
Polymerase to the Promoter
• No primer
Initial transcription

• Transcription Is
Initiated by RNA
Polymerase
without the Need
for a Primer.
• Initial runs of 10 nt
Elongación

• RNA pol unida a molde para


síntesis de mRNA
• RNA pol encargada de
mantener 15 bp separados
(unidades  y ´funcionan
como pinzas y unen DNA)
Transcription bubble.

The transcription bubble consists of 14 base pairs of unpaired DNA, with the nine most
recently added RNA nucleotides base-paired with the template strand.
Transcript cleavage factors rescue a
backtracked polymerase

(a) GreB, a bacterial transcription cleavage factor,


extends into the active site of bacterial RNA polymerase
and positions a second metal ion (green). (b) TFIIS, the
eukaryotic transcript cleavage factor, similarly extends
into the active site of RNA polymerase II, where it
positions a second metal ion (green).
RNA Polymerase Can Become Arrested and
Need Removing
• TRCF pushes polymerase
• Uvr(A)BC repairs
Transcription Is Terminated by Signals within
the RNA Sequence

Terminators:
• Rho-dependent
• Rho-independent
Terminación por factores intrínsecos
independiente de proteína Rho
Señal:
Secuencia rica en GC
Seguida de AAAA

Formación de
estructura en giro por
complementariedad
de bases

Uniones entre A-U son


mas débiles que G-C
y se rompen uniones
Terminación dependiente de
Proteína  (Rho)

Proteína rho se une a la región terminadora en el extremo 5´del gen y promueve


la disociación de la ARNpol del ADN plantilla.
Colinealidad (procariotes)

• En estudios genéticos de bacterias y fagos se demostró que el gen y sus


productos proteínicos son moléculas colineales.

• Que la secuencia de codones contiguos en el gen corresponde a la localización de


la secuencia de aminoácidos contiguos en la cadena polipeptídica.
Conceptos clave
• Operón: grupo de genes adyacentes transcritos como un solo ARNm.
• Operador: Secuencia reguladora de ADN que controla la
transcripción de un operón.
• Promotor: secuencia de ADN a la que se une la ARNpol para iniciar la
transcripción.
• Represor: molécula reguladora que bloquea la transcripción.

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