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Leer capítulos Nº3, Nº4 y Nº5 de
³Lehninger: Principios de Bioquímica´
Nelson, Cox.
Cuarta Edición.

http://bcs.whfreeman.com/lehninger/

No está demás leer capítulos Nº1 y Nº2

Š Ecuación de Henderson-Hasselbach
 „ohn C. Kendrew

Max F. Perutz

Descifraron la estructura de la mioglobina y la hemoglobina.

Recibieron el Premio Nobel en 1962.
 Aminoácidos

Estructura general de un aminoácido:

R C COOH

NH2
R= cadena lateral
R
En los sistemas vivos el isómero más abundante es el =.
El
sólo existe en pequeñas cantidades, por ejemplo en
bacterias.
Oormación de un puente disulfuro por la oxidación del
grupo sulfidrilo de do moléculas de cisteína.
Los aminoácidos se comportan como ácidos y bases

momo ácido:

momo base:
Las moléculas que poseen esta característica dual
(se comportan como ácidos o bases) se llaman
.
El °   es el valor de °
al que el
aminoácido presenta una carga neta igual al cero.
 Glicina

pI = ½ (pK1 + pK2)
 °") !

Los péptidos y las proteínas se forman por la unión de

aminoácidos, mediante un enlace llamado 
°°!".

°°!"

Este enlace se establece entre el # °$%

&'
 del primer aminoácido y el # °(
&'
del segundo aminoácido. La característica
principal de este enlace es que no permite el giro de
los elementos unidos por él, por lo que es un 
!#". Además es muy $.
=° °"

Los péptidos son moléculas formadas por aminoácidos

unidos por enlace peptídico. El número de aminoácidos
puede oscilar entre "y ; más de cien
aminoácidos se considera una proteína. Incluso, si el
número de aminoácidos es menor que cien, pero el
peso molecular es mayor que 5.000 Daltons, la
molécula sería una proteína.
Por ejemplo, la   es un péptido
metabólicamente importante.

Oligopéptido: Pocos residuos de aminoácidos

Polipéptido: Muchos residuos de aminoácidos
 a

 


Extremo amino terminal Extremo carboxilo terminal

(N-terminal) (m-terminal)

›eril-glicil-tirosil-alanil-leucina
=os péptidos tienen curvas de
titulación características y
 característicos.

=os pKa de los grupos R de

los aminoácidos

cuando éstos
forman parte de una cadena
peptídica.
=os péptidos de diferentes tamaños pueden cumplir diversas funciones.

Ej. Aspartame (Nutrasweet)

Algunas hormonas como la

oxitocina (9 residuos de
aminoácidos). Es secretada
por la glándula pituitaria y estimula
las contracciones uterinas.

Bradiquinina (9 residuos), inhibe la inflamación de los tejidos.

Oactor liberador de tirotropina (3 residuos), se forma en el hipotálamo
y estimula la liberación de tirotropina de la pituitaria.
Insulina: dos cadenas polipeptídicas, una de 30 residuos de aminoácidos
y la otra de 21 residuos.
Glucagón: tiene 29 residuos.
Õ e qué tamaño son las cadenas polipeptídicas en las proteínas?

En humanos, el citocromo c tiene 104 residuos de aminoácidos,

mientras que titin, una proteína de músculo presente en los vertebrados,
tiene 27.000 residuos. En promedio tienen 2.000 residuos de
aminoácidos.
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 .

: Hemoglobina; tiene 4 cadenas polipeptídicas (o subunidades).

os cadenas llamadas alfa y dos llamadas beta. Por lo tanto es un
heterotetrámero. ›i todas las subunidades fuesen idénticas (por
ejemplo, todas alfa, o todas beta) hablaríamos de un homotetrámero.

=as cadenas polipeptídicas se pueden hidrolizar (romper los enlaces

peptídicos) para estudiar la composición aminoacídica.
Proteínas conjugadas: Además de los aminoácidos, contienen otros
grupos químicos. =a parte no aminoacídica de una proteína
conjugada se llama grupo prostético.

Ej: =ipoproteínas, contienen lípidos

Glicoproteínas, contienen azúcares
Metaloproteínas, contienen un metal.

El grupo prostético es importante para la función biológica de la

proteína.
 ? 
  


 


Estructura Estructura Estructura Estructura

primaria secundaria terciaria cuaternaria

Residuos de Hélice  madena polipeptídica ›ubunidades ensambladas

aminoácidos
  






a 


=a estructura tridimensional de una proteína está determinada por

su secuencia de aminoácidos

=a función de una proteína depende de su estructura

mada proteína tiene una estructura única

Mayoritariamente, las fuerzas que estabilizan la estructura

terciaria de las proteínas son


 .

El arreglo espacial de átomos en una proteína se llama 
 
.

monformación nativa: es la más estable, y es en la que se encuentran
las proteínas en su entorno fisiológico.

epende de:

Interacciones hidrofóbicas
Interacciones electroestáticas
Puentes de hidrógeno
Puentes disulfuro

³Reglas de oro´ en relación a la estructura de proteínas:

=os residuos de aminoácidos hidrofóbicos se orientan hacia el

interior de la proteína, lejos del agua.
El número de puentes de hidrógeno ³dentro´ de la proteína aumenta.

Excepciones: proteínas de membrana y proteínas insolubles.

 
 
: conformación local de alguna parte del
polipéptido. morresponde al ³esqueleto´ del polipéptido.

=a hélice  es la estructura secundaria más común.

=a hélice  está estabilizada por puentes de hidrógeno

Ôipos de factores que afectan la estabilidad de la hélice :

Repulsión electroestática (o atracción) entre residuo de aminoácidos

sucesivos con grupos R cargados.

Residuo adyacentes con grupos R voluminosos

Presencia de residuos de prolina o glicina

 m
 

O
El esqueleto polipeptídico forma un zig-zag. ›i se encuentran
varias cadenas en zig-zag, una al lado de la otra, se forman ³plisados´
y la estructura se llama lámina O. =as láminas pueden ser paralelas
o antiparalelas.

Vista de arriba

=ámina O antiparalela.
Vista lateral
Vista de arriba

Vista lateral

=ámina O paralela

=os grupos R de los residuos de aminoácidos de las láminas O

deben ser relativamente pequeños.
  
  

 



 


Estructura terciaria: es la distribución total, tridimensional, de los

átomos presentes en una proteína. =a estructura terciaria involucra
aminoácidos distribuidos a todo lo largo de una cadena polipeptídica.

Estructura cuaternaria: Interacción entre dos o más cadenas

polipeptídicas o subunidades para formar complejos tridimensionales.

En general, las proteínas se pueden clasificar según su forma en:

Proteínas fibrosas: predomina un tipo de estructura secundaria.

Proteínas globulares: presentan varios tipos de estructuras secundarias.

Proteínas fibrosas: abundan en estructuras que dan soporte, forma y
protección externa a los vertebrados.

Proteínas globulares: Presente en la mayoría de las enzimas y proteínas

reguladoras de metabolismo.
-queratina: presente en al piel, pelo, uñas.
=a estructura cuaternaria (dos cadenas)
está estabilizada por puentes disulfuro.
molágeno: compone el tejido
conectivo como tendones, cartílago,
la matriz orgánica de los huesos y
la córnea del ojo. =a estructura
secundaria del colágeno es diferente
de la hélice , por eso se llama
cadena .

Aminoácidos presentes en el colágeno:

Glicina 35%
Alanina 11%
Prolina 21%

=a gelatina (verdadera, no sucedáneo)

deriva del colágeno y tiene poco valor
nutricional porque no contiene aminoácidos
esenciales para la dieta humana.
Oibroína de la seda: Es producida por insectos y arañas. En su
estructura predomina la conformación O. Es rica en residuos de alanina
y glicina (grupos R pequeños) lo que permite la formación de láminas O.
=a estructura es flexible a raíz de que no hay interacciones covalentes
como puentes disulfuro.
 Estructuras secundarias y propiedades de proteínas fibrosas

 
m      

 


 hélice, entrecruzada Rígido, estructuras  queratina del pelo, plumas

por puentes diulfuro protectoras insolubles uñas
de dureza y flexibilidad
variables

monformación O Oilamentos suaves y Oibroína de la seda

flexibles

molégeno hélice Resistencia a la alta molágeno de los tendones,

triple tensión, sin estiramiento matriz de los huesos.

=as proteínas fibrosas son insolubles en agua.

 a 


  

Presentan diversidad estructural y funcional. Proteínas de este

tipo son: enzimas, proteínas de transporte, proteínas motoras,
proteínas reguladoras, inmunoglobulinas, entre otras.

monformación O,
2000 x 5 Amstrong

hélice , 900 x 11 Amstrong

albúmina humana, 130 x 30 Amstrong

Mioglobina: Oue la primera proteína globular cuya estructura fue
dilucidada en los años 50. Es una pequeña proteína que une oxígeno
en las células musculares. Es una única cadena polipeptídica que
tiene un grupo prostético heme (hierro más protoporfirina).
citocromo c lisozima ribonucleasa

Métodos para estudiar la estructura tridimensional de una proteína:

 ifracción de rayos X
 Resonancia magnética nuclear
Algunas proteínas adquieren su configuración terciaria gracias
a otras proteínas llamadas  
 y  

.
Estas proteínas se encuentran desde bacterias a humanos.
=os defectos en el plegamiento de proteínas pueden ser fatales.

Ej: =a enfermedad de los 
 (Enfermedad de las vacas locas en

bovinos y mreutzfeldt-Jakob en humanos). En general, se trata de
encefalopatías enpongiformes.

›on causadas por la proteína prion.

  
 


 


una proteína con muchas subunidades se llama   .

una proteína multimérica puede tener entre dos hasta cien subunidades.

un multímero con pocas subunidades se llama  

 .

=a primera proteína oligomérica que su estructura fue dilucidada fue

la  

. montiene 4 cadenas polipeptídicas y 4 grupos prosté-
ticos heme.
 os subunidades
 y dos O.
( y O no se refiere a
la estructura
secundaria).
  






 

Ounción de la hemoglobina: transporte de oxígeno