TRANSCRIPCION Y REGULACION DE LA EXPRESION GENICA

DRA NORA RIVEROS ICBM . Facultad Medicina . U Chile

[Procesos de transcripcin y traduccin en la clula]

Bases moleculares de la transcripcin

Complemetariedad de bases

Direccionalidad

COMPONENTES BASICOS Transcripcin

DNA molde RNA polimerasa NTP

Direccin 5-3

Bases moleculares de la transcripcin

What is the molecular basis of transcription?

3 5GATTACAGTACAGTGATCAGTACAGTACGTACATGTA 33.... 3CTAATGTCATGT CACTAGTCATGTCATGCAT GTACAT 5...5 2

5GATTACAGTACAGTGATCAGTACAGTACGTACATGTACGGG

3CTAATGTCATGTCACTAGTCATGTCATGCATGTACATCCC 5
SEPARACION DE LAS HEBRAS DE DNA

SINTESIS de RNA en DIRECCION 5- 3

HEBRA CODIFICANTE

5GATTACAGTACAGTGATCAGTACAGTACGTAACGGG 3 3

5GAUUACA 3CTAATGTCATGTCACTAGTCATGTCATGCATTCCC 5
HEBRA MOLDE o TEMPLADO

SINTESIS EN DIRECCION 5- 3
HEBRA CODIFICANTE

5GATTACAGTACAGTGATCAGTACAGTACGTAACGGG 3

5GAUUACAGUACAGUGAUCAGUACAGUACGUAACGGG 3 3CTAATGTCATGTCACTAGTCATGTCATGCATTCCC 5
HEBRA MOLDE

RNA

ADN Hebra codificante

ETAPAS DE LA TRANSCRIPCION

EN TERMINOS MOLECULARES

GEN
Secuencia completa de nucletidos necesaria para la sntesis de un producto funcional ( polipptido o RNA )

How is a ESTRUCTURA DEL GENOMA .Secuencias GEN: RNA polymerase directed to a gene?
Lets define a gene as a transcription unit
reguladoras y secuencias codificantes

inicio

promotor

rio arriba

rio abajo

NO TODO EL GENOMA SE TRANSCRIBE

DONDE SE INICIA LA TRANSCRIPCION GENICA ? DONDE TERMINA?

DNA
Seales de inicio

Sitio de inicio

+1
Seales de termino

promotor
Regin reguladora Regin codificante

RNA

Protenas reconocen secuencias de nucletidos que indican a la RNA polimerasa el inicio y el termino de la sntesis ( secuencias de consenso )

+1
Ej. Promotor bacteriano

TRANSCRIPCION EN PROCARIONTES

Protenas reconocen secuencias de nucletidos que indican el inicio de la transcripcin

+1
Promotor bacteriano

RNA Polimerasa en procariontes

FACTOR SIGMA JUEGA PAPEL CLAVE

_ RECONOCIMIENTO SECUENCIA PROMOTORA ESPECIFICA _ POSICIONA RNA POLIMERASA EN EL PROMOTOR _ FACILITA LA APERTURA DEL DNA EN CERCANIAS DEL +1

INICIACION

pppPu

NTP

ELONGACION Salida de

PPP

TERMINACION

Seal de termino

RNA transcrito

Seal de termino

Inicio de elongacin

Disociacin de sigma

Transcription And Translation In Prokaryotes

5 3

RNA Pol.
Ribosome

mRNA
5

Ribosome

REGULACION DE LA EXPRESION GENICA EN PROCARIONTES

ORGANIZACIN DE GENOMA BACTERIANO : OPERON

RNA policistrnico

OPERON LAC

O = operador

AUSENCIA DE LACTOSA

PRESENCIA DE LACTOSA

TRANSCRIPCION EN EUCARIONTES

Eukaryotic Transcription
Cytoplasm
DNA

Transcription
RNA

RNA Processing
mRNA G
AAAAAA

AAAAAA

Nucleus

Export

ORGANIZACIN DEL GENOMA EUCARIONTES GENES INDIVIDUALES (ORGANIZACION MONOCISTRONICA) P

Gen 1 1

T P

2 Gen 2

T P

3 Gen 3

mRNAs mono cistrnicos

PROTEINAS
Promotor Terminacin

ORGANIZACIN DEL GENOMA EUCARIONTES

+1

Promotor

Intrn

Exn

GENES INDIVIDUALES .

PRESENCIA DE INTRONES

TRES RNA POLIMERASAS EN EUCARIONTE - RNA POLIMERASA I: - nuclolo - RNA ribosomal - RNA POLIMERASA II: - nucleoplasma - mRNA - RNA POLIMERASA III: - nucleoplasma - tRNA

CMO LA RNA pol II RECONOCE EL SITIO DE INICIO DE LA TRANSCRIPCION ?

Secuencias en el DNA son reconocidas por protenas especficas ( FT) FACTORES DE TRANSCRIPCION BASALES : TFII TBP , componente de TFII D , reconoce la caja TATA

INICIO DE LA TRANSCRIPCION : Secuencia TATA

Secuencia de consenso : Homologa en el alineamiento de secuencia nucleotdica en 900 genes eucarionticos analizados

FACTORES DE TRANSCRIPCION BASALES : GTF - TFII

TBP-

+1

Reconocimiento del sitio de inicio de la transcripcin TBP= TATA binding protein

FACTORES DE TRANSCRIPCION BASALES : GTF - TFII

CTD

+1

FACTORES DE TRANSCRIPCION BASALES : GTF - TFII

+1

TERMINO DE LA TRANSCRIPCION

Seales AAUAAA Secuencia rica en U o GU

CPSF y CstF reconocen seales de poliadenilacin PAP : PoliA polymerasa CF : factores de corte

Eukaryotic Transcription
Cytoplasm
DNA

Transcription
RNA

RNA Processing
mRNA G
AAAAAA

AAAAAA

Nucleus

Export

Modificaciones Post-transcripcionales. Procesamiento del transcrito primario

CAPPING en 5

Estabilidad Eficiencia Traduccin

Procesamiento postranscripcional del transcrito primario de ovoalbmina

SEALES DE SPLICING

Sitio de splicing 5 Punto de ramificacin

Sitio de splicing 3

A
Frecuencia %

GU...................................A.................. ......AG Intron

SPLICING ALTERNATIVO TEJIDO ESPECIFICO

La enorme diversidad de tipos celulares contiene el mismo genoma

250 tipos celulares especializados

Diferentes tejidos y organos

Regulacin a nivel transcripcional

1. Seleccin del gen que se transcribe 2. Cuanto se transcribe

Diferentes tipos celulares contienen el mismo DNA, pero expresan distintos genes.
Expresin constitutiva : Todos los tejidos

: genes Housekeeping .

Expresin inducible: Cambios de expresin frente a seales moleculares

- Durante el desarrollo cambian los patrones de

etapa de diferenciacin, etapa del ciclo celular

expresin gnica:

- Seales externas : Hormonas, neurotrasmisores , nutrientes ejercicio,factores de crecimiento ......

Como se logra la Regulacin de la Transcripcin Gnica en Eucariontes?

- Cada gen posee secuencias reguladoras diversas, variables en nmero y localizacin - Presencia de mltiples factores de transcripcin

Secuencias regulatorias de la expresin gnica en el DNA

Secuencias reguladoras

A cada secuencia de nucletidos caracterstica , se une un UN FACTOR DE TRANSCRIPCION especfico que se activa en diferentes condiciones

PROMOTOR de EUCARIONTES
INICIO DE LA TRANSCRIPCION

anywhere
Genespecific

-80 to -100
CCAAT
Genespecific

-25 to -30
TATA

+1

Up to -100
Genespecific

GGGCGG

TATA

-40 to -80
Genespecific

CCAAT

GGGCGG

TATA

POTENCIADORES o ENHANCER

Cada gen posee varios elementos de promotor What Binds Where?

Cada elemento de promotor interacta con un un factor de transcripcion especfico

anywhere
Genespecific

-80 to -100
CCAAT

-40 to -80
GGGCGG

-25 to -30
TATA

Too Many to Name

CTF

SP1

TFIID (TBP +TAFIIs

Secuencias potenciadoras Enhancer

Distancia Orientacin Localizacin

FT unido a secuencia potenciadora acta a la distancia

Enhancers act at a distance

+1

FACTORES DE TRANSCRIPCION
A.- BASALES O GENERALES .
INICIO DE LA TRANSCRIPCION

B.- ACTIVADORES. SE UNEN A DNA EN SECUENCIAS

REGULADORAS

SECUENCIAS RIO ARRIBA

SECUENCIAS POTENCIADORES (ENHANCER)

C.- COACTIVADORES. COMUNICAN A LOS ACTIVADORES

CON LA RNA POLIMERASA II

ACTIVADORES Y COACTIVADORES: Mediador TF II D TAF

+1

HORMONAS CON RECEPTORES INTRACELULARES

MODELO ACTUAL DE TRANSCRIPCION GENICA