GENDATENBANKEN

* o

a. Swiss institute of Bioinformatik SIB

* Sequenzen liegen
•
gehört zu NIH national
institute of health
darin mische
; geno ,

Proteine . . .

G Strukturen -

her über
sage
der
Faltung
Proteine

GENSEQUENZEN & GENOME

TI
qq.gr#pyjfvesis
.

\ ,
 -

SEQUENZANALSE / BLAST

wenn 2 Sequenzen ähnlich

sind , dann haben Sie auch
eine :

aber Vorsicht Das stimmt

:

nicht immer !

- |
/
÷:ü
✓ nicht auf
•
liegt

da 6
6×2 & 3×0 =
6 , gleiche AS
& 3
ungleiche Score = 6
 ODDS in Wahrscheinlichkeitstheorie
& Statistik

|
Ga
JIE good
-

§:3 ios
ös 9.36
{ d Es
• of

ö: +
83

{ Es

Raw Bewertung paarweise

a. ist nur Score > es
vergleicht &
-

fehlt noch
,
da
größelnnzahl der summiert dann auf
AS auch wichtig ist

logarithmus
Wahrsch werten
-
von

LOGCA B) - = (A) + log ( B) ,

werden Sie
deswegen
addiert

i
<

-
L -
2 -
3 -

4 5 -6
Berechnung
-

Bei der :

größter der 3 Werte -

I O -
L -
2 -3 -4 -5

Der der links steht , n -2 2 2 0 - d -

2 -3
der der oben drüber ist .

obgleich ,
diagonal add . J -3 L 5 4 3 2 1

MAEHTE 0-4
0 4 8 7 6 5
!
r
• AEH EN

5 -1 3 7 8 7 6
/
33303 20
-

I →
-
-

0333030 > 22 -

G -

2 2 6 7 22 20
 haben evtl .
schon
2 Wärter getroffen

>

Sequenzlänge wird berücksichtigt

:
• GOR wurde immer weiterentwickelt aktuelle Version :

GORV
es
genauigkeit 73.5%

Voraussagen über Trans

membran
helicesin Proteinen

-
DOMÄNEN & STRUKTUR/MULTIPLES ALINGNMENT

|
Ende : wenn stabiler Zustand

erreicht wird .

Freie
Energie des Moleküls minimal
 1-

6 von 7 sind
gleich

In

2
3

>
 INTERKTIONEN

: Ein:&::*:::*

yin
:: : .am . -

e. aus Probe werden alle vorhanden

Proteine extrahiert $ evtl aufgetrennt
.

a. lösen aus Matrix (Spots) ¢ nach dem

Trypsin -
Verdon analysiert

•
Infos über kleine
medizinisch aktive Moleküle
?
•
Pathway . . .

kleine Moleküle > NCBI : Pub Chem EBI : ChEMBL

.

Pathway > KEGG :

Kyoto encyclopedia of Genes &

genaues
 -

Reaktionsschnittstellen an den Enden

können durch PCR werden
hinzugefügt .