Bagian I – Antibiotik dan Mikrobioma Manusia

1. Lihat saja gambar yang Amelia temukan di Wired terkait antibiotik dan mikrobiota.
Kesimpulan apa yang dapat Anda ambil dari gambar ini?
JAWABAN: Berdasarkan grafik dari Wired, dapat disimpulkan bahwa Antibiotik
membunuh mikrobioma ( baik "baik" maupun "buruk" tanpa pandang bulu jika
disalahgunakan dan hal ini dapat menyebabkan penyakit. Hal ini juga dapat
mengganggu keanekaragaman hayati Mikrobiota dalam tubuh seseorang dan
memerlukan waktu bertahun-tahun untuk memperbaikinya.

2. Mengingat fakta bahwa Amelia menemukan artikel ini di majalah sains budaya pop
online, apakah Anda percaya dengan data yang disajikan? Lakukan penelitian tentang
dampak antibiotik pada mikrobioma manusia menggunakan literatur yang ditinjau oleh
rekan sejawat. Ringkaslah temuan Anda dari setidaknya tiga artikel dalam satu paragraf
pendek.
JAWABAN: Mengingat angka-angka yang digunakan dalam wired adalah bersumber,
maka dapat disimpulkan bahwa data yang disajikan memang sah. Artikel serupa dan
penelitian lain juga telah membahas dampak antibiotik pada mikrobioma manusia, dan
semua referensi tersebut memiliki kesimpulan umum yang menyatakan bahwa Antibiotik
pada akhirnya mengganggu mikrobioma normal (usus) dalam tubuh yang penting untuk
melawan penyakit dan menjaga homeostatis.

Referensi: https://www.taconic.com/taconic-insights/microbiome-and-germ-free/antibiotics-
affect-microbiome.html

https://www.annualreviews.org/doi/abs/10.1146/annurev-micro-091313-103456

https://www.technologynetworks.com/biopharma/news/how-antibiotics-change-human-
microbiome-diversity-long-term-317454

3. Berdasarkan gambaran dari Wired dan penelitian Anda, apakah menurut Anda antibiotik
menyebabkan penyakit Amelia's Crohn? Mengapa atau mengapa tidak?
JAWABAN: Tidak, kecil kemungkinannya antibiotik menyebabkan penyakit Amelia's
Crohn. Telah dinyatakan dalam penelitian bahwa penyakit Crohn terutama disebabkan
oleh sistem kekebalan yang menyerang bakteri di saluran pencernaan manusia, dan
penggunaan Antibiotik akan membunuh bakteri yang pada awalnya akan memicu sistem
kekebalan untuk merespons dengan cara tersebut. Perlu diketahui bahwa Antibiotik
merupakan pengobatan atau obat pertama yang direkomendasikan oleh dokter kepada
pasien yang menderita penyakit Crohn. Namun jika disalahgunakan atau pasien
menggunakan jenis antibiotik yang salah, hal ini dapat memicu kekambuhan pada
penderita penyakit Crohn dan juga dapat menyebabkan diare pada orang yang bahkan
tidak memiliki kondisi tersebut.

4. Jika mikrobioma usus yang beragam penting untuk kesehatan yang optimal, langkah
apa yang dapat Anda pikirkan untuk melindungi dan/atau memulihkan flora usus setelah
penyakit seperti keracunan makanan?
JAWABAN: Langkah terbaik dan paling sederhana untuk melindungi flora usus adalah
dengan menghindari asupan antibiotik yang tidak perlu. Selain itu, masyarakat juga
 harus menyeimbangkannya dengan mengonsumsi Probiotik (ragi hidup dan bakteri yang
mengganggu sistem pencernaan).

Bagian II – Penyakit di Negara Maju

1. Apa saja kemungkinan alasan Amelia mendapatkan Crohn sedangkan kakaknya tidak?
JAWABAN: Hal ini karena sistem kekebalan tubuh manusia sangat bervariasi dalam
cara mereka bereaksi terhadap patogen. Mereka yang memiliki sistem kekebalan tubuh
yang terlalu aktif lebih rentan terhadap penyakit autoimun. Faktor lainnya mungkin
adalah fakta bahwa penyakit Crohn lebih sering terjadi pada wanita dibandingkan pada
pria.

Referensi: https://www.healthline.com/health/crohns-disease/facts-statistics-infographic#1
https://www.umcg.nl/EN/corporate/News/Paginas/why-every-immune-system-is-different.aspx

Pola kejadian penyakit apa yang dapat Anda amati dari tabel di atas dan makalah yang
dirujuk?
JAWABAN : Berdasarkan tabel dan makalah yang menjadi referensi , dapat diamati
atau disimpulkan bahwa penyakit Crohn lebih sering terjadi di negara maju/industri
dibandingkan dengan negara terbelakang.

2. Sebutkan tiga hipotesis yang mungkin menjelaskan pola-pola ini.

MENJAWAB:
1. Prevalensi Penyakit Autoimun di negara maju tergolong tinggi dan rendah di negara
berkembang.
2. Sering Mengonsumsi Antibiotik dapat menyebabkan melonjaknya frekuensi Penyakit
Autoimun.
3. Negara-negara terbelakang umumnya mengobati penyakit dengan pengobatan alami
dan menggunakan lebih sedikit antibiotik.

3. Perhatikan bahwa tabel di atas menunjukkan tingkat penyakit dalam hal prevalensi,
sedangkan makalah Economou dan Pappas (2008) menunjukkan kejadian penyakit.
Apa perbedaan antara insiden dan prevalensi?
JAWABAN: Kata “insiden” digunakan untuk mengidentifikasi kemungkinan tertular atau
tertular suatu penyakit. Sedangkan kata “prevalensi” digunakan untuk menunjukkan
seberapa lazim atau merajalelanya suatu penyakit.

Bagian III –Menjelajahi Hipotesis Kebersihan

1. Apakah menurut Anda hipotesis kebersihan dapat diterapkan pada kasus penyakit
Crohn yang dialami Amelia? Mengapa atau mengapa atau mengapa tidak?
1. JAWABAN: Ya, hipotesis kebersihan dapat diterapkan pada Amelia karena ia memiliki
sedikit paparan terhadap bakteri mengingat ia tinggal di negara maju dan higienis. Perlu
dicatat bahwa penyakit Crohn Amelia baru mulai kambuh setelah dia melakukan perjalanan ke
negara kurang berkembang. Ada kemungkinan bahwa Amelia memiliki paparan bakteri yang rendah
di Amerika yang kemudian menurunkan toleransinya terhadap bakteri (baru) atau penyakit lainnya.
2. Mengembangkan penelitian yang dapat menguji hipotesis kebersihan sebagai pemicu
penyakit alergi dan autoimun. (Perhatikan bahwa mungkin lebih mudah untuk memilih
satu penyakit, seperti asma atau penyakit Crohn.) Gambarlah grafik data hipotetis yang
akan mendukung hipotesis kebersihan.
MENJAWAB:

Topik: Mengungkap Hipotesis Kebersihan dan Autoimunitas: Kajian Paparan Kuman

Dini dan Kaitannya dengan Asma

Permasalahan: Adakah hubungan yang signifikan antara paparan kuman dini dengan
Asma?

Hipotesis: Terdapat hubungan berbanding terbalik antara paparan kuman dini dengan
kemungkinan tertular Asma.

Grafik (Hipotesis) dengan data Hipotetis:

3.5

3
Possibility of Contracting Asthma

2.5

1.5 Asthma
Linear (Asthma)
1

0.5

0
0 5 10 15 20 25 30 35
Early Germ Exposure

3. Pikirkan tentang semua cara yang dapat dilakukan ilmuwan untuk menguji hipotesis
kebersihan. Jika Anda melakukan studi korelasional pada manusia, variabel independen
apa yang perlu Anda pertimbangkan? Jika Anda melakukan penelitian manipulatif pada
tikus, variabel apa yang perlu Anda kendalikan? Variabel terikat apa yang akan Anda
ukur?

JAWABAN: Hipotesis Kebersihan dapat diuji dengan menetapkan tingkat kebersihan

lingkungan suatu negara sebagai variabel, dan (probabilitas tertular) Asma sebagai variabel
independen lain dalam penelitian ini. Penelitian korelasional kemudian dapat dilakukan
untuk menguji hubungan antara kedua variabel.
 Sedangkan untuk penelitian manipulatif dengan menggunakan tikus, variabel tertentu
seperti variasi lingkungannya (dari tidak sehat, steril, dan tidak diobati) dapat dimanipulasi
untuk menguji kejadian asma pada tikus.

Bagian IV– Menjelajahi Pilihan

1. Steroid, transplantasi tinja, dan terapi cacing adalah tiga pendekatan yang sangat
berbeda terhadap penyakit yang sama. Jika Anda memutuskan rencana pengobatan,
informasi tambahan apa yang Anda perlukan untuk membuat pilihan?
JAWABAN : Meskipun pengobatan ini memiliki kesamaan dalam menyelesaikan
penyakit yang sama, pasien yang berbeda mungkin menerima pengobatan yang
berbeda tergantung pada pengobatan dan tubuh mereka. Pertama dan terpenting, harus
diverifikasi terlebih dahulu apakah perawatan ini diverifikasi oleh FDA untuk
penerapannya. Sebaiknya identifikasi terlebih dahulu apakah pasien mempunyai alergi
terhadap komponen atau zat tertentu yang akan digunakan dalam setiap rencana
pengobatan. Ketiga, akan lebih baik untuk mengidentifikasi jenis bakteri yang ada pada
pasien. Dan yang terakhir, akan lebih baik jika mengumpulkan informasi apakah pasien
mempunyai kondisi medis lain yang dapat terkena dampak negatif setelah
menggunakan perawatan tersebut.

2. Berdasarkan pemahaman Anda tentang Crohn sejauh ini, menurut Anda apa perbedaan
utama dalam ketiga pendekatan berbeda ini? Misalnya, pikirkan target dan tujuan
mendasar dari setiap pengobatan.
MENJAWAB:
1.) Steroid: Mengobati gejala tetapi bukan penyebab atau sumber gejala tersebut.
2. Transplantasi tinja: Upaya untuk mengobati penyebabnya, namun tanpa disengaja
dapat memperburuk respons imun terhadap peningkatan bakteri
3.) Transplantasi Cacing: Di sisi lain, ini adalah satu-satunya pengobatan yang secara
khusus mengobati penyakit autoimun. Namun obat ini belum disetujui oleh FDA dan
masih ada ruang untuk penelitian lebih lanjut.

3. Bagaimana persetujuan FDA memengaruhi keputusan Anda mengenai pilihan

pengobatan? Haruskah itu menjadi pertimbangan? (Berikut ini tautan ke situs web FDA
untuk informasi lebih lanjut mengenai proses persetujuan obat:
http://www.fda.gov/Drugs/ DevelopmentApprovalProcess/.)
JAWABAN: Persetujuan FDA mempunyai pengaruh yang signifikan dalam menentukan
pilihan pengobatan. Hal ini karena FDA menetapkan protokol keamanan untuk
memastikan keandalan dan mengurangi faktor risiko dalam perawatan tersebut.

4. Jika Anda menderita kelainan autoimun yang parah, apakah Anda akan
mempertimbangkan terapi cacing sebagai pengobatan yang memungkinkan? Mengapa
atau mengapa tidak?
JAWABAN: Siswa hanya akan mempertimbangkannya sebagai pengobatan pilihan
terakhir ketika tidak ada pengobatan lain yang disetujui FDA yang akan berhasil.
Masuknya parasit dalam pengobatan bukanlah hal yang lazim dalam pengobatan dan
bisa berbahaya. Harus ada jaminan terlebih dahulu bahwa hal ini tidak akan
menimbulkan dampak negatif jangka panjang.
 5. Basis data uji klinis terkini dapat ditemukan di sini: https://clinicaltrials.gov/. Carilah
contoh uji klinis untuk Crohn. Adakah uji coba transplantasi feses atau terapi cacing
yang mungkin bisa Amelia pertimbangkan? Apakah ada pengobatan alternatif yang tidak
ada dalam daftar di atas yang dapat ia tambahkan ke tabelnya?
JAWABAN: Saat ini, belum banyak uji klinis atau penelitian yang menggunakan
pengobatan cacing dan transplantasi tinja. Padahal Transplantasi Stem Cell, Uji Obat,
dan Terapi Radiasi juga merupakan terapi yang sedang diuji oleh dokter yang dapat
memberikan solusi pengobatan alternatif terhadap kondisi Amelia.

Bagian V –Tubuh Manusia sebagai Ekosistem

1. Menurut Anda, apa dampak faktor-faktor yang disebutkan di atas terhadap
keanekaragaman hayati manusia?
JAWABAN: Mereka lebih banyak berhubungan dengan Bakteri dan hidup di lingkungan
yang kurang steril, yang berarti mereka berhubungan dan belajar menangani lebih
banyak penyakit. Selain itu, keanekaragaman hayati manusia terus menghadapi
tantangan akibat penggunaan antibiotik, serta rendahnya paparan mikroorganisme
tertentu.

2. Jika kita menganggap tubuh manusia sebagai sebuah ekosistem, persamaan ekologi
apa yang dapat Anda tarik antara konsekuensi berkurangnya keanekaragaman hayati di
alam dan tubuh Anda? Misalnya, jika Anda mengingat kembali grafik awal dari artikel
Wired di Bagian I, bayangkan Anda sedang melihat spesies ikan di terumbu karang atau
spesies burung di hutan tropis, bukan spesies bakteri di usus seseorang.
JAWABAN: Antibiotik itu seperti penggundulan hutan. Hal ini membuka pintu bagi
tanaman invasif dan kepunahan massal hewan, sama halnya dengan penyalahgunaan
antibiotik yang dapat membuka pintu bagi kematian bakteri yang dibutuhkan tubuh kita
untuk melawan penyakit. Penyakit autoimun seolah-olah sistem kekebalan tubuh sendiri
adalah spesies invasif yang menghancurkan segalanya karena tidak ada lagi yang bisa
dimangsa (bakteri sebenarnya).

3. Apa saja kemungkinan dampak penurunan keanekaragaman hayati terhadap kesehatan

manusia?
JAWABAN: Kemungkinan implikasinya adalah frekuensi reaksi terhadap bakteri baru
akan lebih parah. Hilangnya keragaman dapat menimbulkan beban yang tidak perlu
pada respon imun normal.

4. Haruskah informasi ini mengubah sikap kita terhadap mikroba?

JAWABAN: Paling tidak, masyarakat harus menyadari bahwa mikroba dalam beberapa
kasus sangat penting bagi kehidupan kita dan tidak selalu bersifat patogen.

5. Menurut Anda mengapa tahun 1950 merupakan periode waktu dimana kejadian
penyakit autoimun mulai meningkat?
JAWABAN: Hal ini mungkin terjadi karena penggunaan antibiotik menjadi umum pada
tahun 1950 dan populasinya berkembang pesat.