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Deep Learning · Anwendungsentwicklung · Medical Imaging

Ab sofort (bis Ende SoSe 2023)

Für die intraoperative Navigation ist die Objekterkennung mit Neuronalen Netzen (z.B. YOLO) ein hilfreiches Tool zur
Erkennung von Instrumenten und Markern auf Kamerabildern. In der Gruppe Medical Computing (MECLab) nutzen wir YOLO
beispielsweise, um Marker in Biopsienadeln und Thoraxphantomen zu erkennen. Die gewonnenen Markerpositionen werden
zur Validierung chirurgischer Navigationssysteme genutzt, die wir im MECLab entwickeln.

Um die Systeme unter möglichst realistischen Bedingungen zu evaluieren, führen wir unsere Experimente auch im echten OP
durch. Unter diesen Bedingungen müssen die im Labor trainierten Netze noch einmal auf neuen Daten trainiert werden.
Meist ist die Zeit für Experimente im OP begrenzt, weshalb die Aufnahme und Annotation der Bilddaten sehr schnell gehen
muss. In solchen Fällen eignet sich eine Active Learning Strategie, bei der die annotierende Person direkt in den Lernprozess
eingebunden wird. Dieses Vorgehen ermöglicht eine sehr effiziente Auswahl der Bilder, die noch zu annotieren sind.

Für die Entwicklung der Active Learning Pipeline und einer zugehörigen grafischen Oberfläche (GUI) suchen wir eine
motivierte und engagierte wissenschaftliche Hilfskraft.

Deine Aufgaben
• Entwicklung einer Active Learning Pipeline zur effizienten Annotation medizinischer Bilddaten
• Konzeption und Programmierung einer grafischen Oberfläche zur Annotation der Bilder

Deine Voraussetzungen
• Gute Programmierkenntnisse in Python
• Grundlegende Kenntnisse in PyTorch, OpenCV, numpy sind wünschenswert
• Grundlegende Kenntnisse der objektorientierten Softwareentwicklung
• Kreativität und Interesse an der Gestaltung von grafischen Anwendungen
• Abgeschlossenes Bachelorstudium Informatik, iST, CE, CogSci, MedTech oder vergleichbar
• Gute Englischkenntnisse für die Zusammenarbeit mit unserem internationalen Team

Kontakt
Findest du dich in dieser Stellenbeschreibung wieder? Dann schreib mir einfach eine E-Mail:
henry.john.krumb@gris.tu-darmstadt.de