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Arbeitsanleitung
genRESLS500ROX Lngenstandard
zur Grenbestimmung von DNA-Fragmenten
LS01 ca. 700 (ABI 377, mit Probenauftragspuffer) LS02 ca. 840 (ABI PRISM 310, 3100 [-Avant] Genetic Analyzer) LS03 ca. 1200 (ABI PRISM 310, 3100 [-Avant] Genetic Analyzer)
LS500ROX/dt/1201/4
1. Einleitung
genRES LS500ROX ist ein Interner Lngenstandard fr Lngenbestimmungen von DNA-Fragmenten. genRES LS500ROX ist fr die Anwendung auf (DNA-) Elektrophorese-Systemen geeignet, die NHS-Esterfluoreszenzfarbstoffe wie "ROX detektieren knnen (z.B.: ABI PRISM 310/3100/3100-Avant Genetic Analyzer oder ABI PRISM 377 DNA Sequencer, Fa. AB Applied Biosystems). Mit genRESLS500ROX knnen DNA-Fragmentlngen zwischen 90 und 500 Basenpaare (bp) bestimmt werden. genRES LS500ROX besteht aus 18 DNA-Fragmenten (s. Abb. Seite 5), die mit dem NHS-Esterfluoreszenzfarbstoff ROX markiert sind. Die Empfindlichkeit des Fluoreszenz-Farbstoffes ROX ist verglichen mit dem Fluoreszenz-Farbstoff FAM nur ca. 12%. Auf Grund dieser niedrigen Empfindlichkeit wird ROX blicherweise nicht fr die Markierung von DNA-Fragmenten z.B. in der genetischen Analyse verwendet. genRES LS500ROX kann deshalb zusammen mit anders markierten Proben in der gleichen Gelspur aufgetragen bzw. zusammen injiziert werden. genRES LS500ROX ist auch Bestandteil der genRES MPX und DYSplex Kits (serac).
Anmerkung:
Achtung! Die Fluoreszenzmarkierung der Standardfragmente ist lichtempfindlich. genRES LS500ROX sollte deshalb nur wenn unbedingt ntig dem Licht exponiert werden.
Wird genRES LS500ROX ber einen lngeren Zeitraum verwendet, sollte der Standard bei -15 bis -25C eingefroren werden. Um mehrmaliges Auftauen und Einfrieren zu vermeiden, sollte genRES LS500ROX vor dem Einfrieren aliquotiert werden. Die Haltbarkeit der Reagenzien betrgt ungeffnet 1 Jahr nach Herstellung.
LS500/dt/1201/4
5 x 70 L 500 L
6 x 70 L
Kat.-Nr.: LS03 violett* genRES LS500ROX Interner Lngenstandard * Farbe des Gefdeckels
5 x 100 L
LS500/dt/1201/4
Anwendungsbeispiele von genRES LS500ROX auf verschiedenen Elektrophoresegerten: ABI PRISM 310 Genetic Analyzer
ABI 373 DNA Sequencer/ ABI PRISM 377 DNA Sequencer 2.1 L deionisiertes Formamid 0.4 L Probenauftragspuffer 0.5 L genRES LS500ROX max. mgliches Volumen in die Geltasche einbringen (je nach Kammgre unterschiedlich !)
LS500/dt/1201/4
Elektropherogramm des genRESLS500ROX Lngenstandards nach Auftrennung mit ABI PRISM 310 Genetic Analyzer. Laufbedingungen: Polymer POP4, Genetic Analyzer Capillary [grn markiert], Standard Modul GS STR POP4 (1mL) A Laufzeit abgendert auf 28 min.
LS500/dt/1201/4